Al sudoeste, entre las montañas Virunga y el lago Victoria, hay una zona montañosa del Rift, con serranías que discurren de sur a norte, de más de 2.000 m de altitud, en la que se encuentran el lago Mutanda, a 1.800 m, y el lago Bunyonyi, a 1962 m de altitud, en una falla volcánica.