Tras tener lugar la destitución del presidente Rolandas Paksas debido a graves casos de corrupción, el 6 de abril de 2004, Paulauskas es nombrado, siguiendo los preceptos constitucionales lituanos, presidente interino de Lituania, cargo que ocupará hasta la elección de Valdas Adamkus, su antiguo adversario, el 12 de julio de 2004.