A continuación, el programa Heritrix se complementa con NutchWax, o bien la combinación de Haddoop y Wayback, que llevan a cabo unos procesos de indexación de la información compilada que permiten, ulteriormente, utilizar estos índices para localizar los recursos dentro de la colección mediante sus respectivas interfaces de consulta: Wera, que permite la búsqueda por palabras clave a través de los índices generados por NutchWax; y Wayback, que permite la consulta directa por URL en los índices generados por Hadoop y el mismo Wayback.