El Municipio de San Juan Bautista Tuxtepec, se encuentra ubicada en la parte Norte del Estado de Oaxaca, a una Latitud de 18º19´ norte y 17º48´ sur; y a una Longitud de 95º51´ al este y 96º19´ al oeste, en los límites del Estado de Veracruz en la llamada Cuenca del Papaloapan, se localiza en la vertiente del Golfo de México a una altura aproximadamente de 11 metros sobre el nivel del mar, condiciones que determina un clima Cálido-Húmedo con temperatura alrededor de los 24.6ºC y un promedio de precipitación anual de 2307.7 mililitros.