Pinto reasumió la presidencia el 19 de octubre para el período constitucional 1829-1834, pero los ánimos estaban caldeados por la elección de vicepresidente, que estalló la guerra civil de 1829-1830: las provincias de Concepción y Maule, además del ejército del sur, liderado por José Joaquín Prieto, desconocieron la legalidad de las proclamaciones de presidente y vicepresidente que realizó el Congreso Nacional.