Esta situación se vio alterada cuando se nombraron gobernadores a personajes con fuerte carga ideológica falangista como Junquera Fernández (1945) o Valero Bermejo (1949) que pretendieron intervenir en las cuestiones navarras y recibieron un frontal rechazo de las instituciones en lo que se denominó "“Los Contrafueros de Junquera y Valero Bermejo”".