Además, en ese año, la «U» disputó la última versión de la Copa Mercosur, enfrentando en el grupo 5 a Grêmio, a Palmeiras y a River Plate, cumpliendo una discreta campaña: venció en Santiago por 2-1 y cayó en Brasil por 0-4 ante Palmeiras; cayó como visitante por 0-2 y empató como local por 1-1 ante Grêmio; y perdió sus dos partidos tanto en casa como afuera por 0-3 ante River Plate.