Paralelamente a sus primeros ejercicios como ministro, Fillon había sido presidente del Consejo General de Sarthe, entre abril de 1992 y marzo de 1998; y el 20 de marzo de 1998 fue elegido presidente del Consejo Regional de los Países del Loira, cargo que ejercería hasta el 16 de mayo del 2002 cuando renunció para convertirse una vez más en ministro.