En marzo de 1989, el entonces gobernador de Jalisco, Guillermo Cosío Vidaurri, presentó un nuevo proyecto que contemplaba la construcción de cuatro líneas: Periférico Norte - Periférico Sur (Línea 1); Periférico Oriente - Periférico Poniente (recorrido de la Línea 2 extendido al poniente por la avenida Vallarta y su prolongación); Mexicaltzingo - Central Vieja - Nueva Central Camionera (Línea 3); y Normal - Zapopan (Línea 4, a través de la Avenida Ávila Camacho).