En la temporada 2000-01, con la llegada de Fabio Capello a la dirección técnica del club, Francesco fue alineado como segundo delantero logrando anotar trece goles, consiguiendo de esta forma su primer título de Serie A, y el 17 de junio de 2001, en la Supercopa de Italia, anotó un gol en la victoria de su club por 3:0 ante la Fiorentina.