Existen dos núcleos del museo: el "Núcleo Museológico da Igreja Românica de São Pedro de Rates", que se dedica a la divulgación de la historia, leyenda y arte alrededor de la Iglesia Románica de San Pedro de Rates, y el "Núcleo Arqueológico da Cividade de Terroso", que sirve de presentación del espacio de la Cividade de Terroso.