En el Apertura 2016 el club tendría uno de los mejores refuerzos de jugadores nacionales en la liga mayor contando con Álex Larín, Óscar Elías Cerén, Juan Carlos Portillo, y Christhoper Ramírez, y los extranjeros Óscar Darío Guerrero, y Fabricio Silva; sin embargo el pobre desempeño del equipo en las primeras jornadas desembocó en la salida del técnico Rubén Alonso a casi a mediados del torneo siendo el nuevo timonel su director deportivo, el ex-seleccionado salvadoreño Milton "Tigana" Meléndez .