Graduado por la Academia Naval de Estados Unidos y piloto de la Fuerza Aérea, Eisele entró a la NASA en 1963 y en diciembre de 1968, junto con los astronautas Walter Schirra y Walter Cunningham, participó de la misión Apollo 7, quedando en órbita terrestre durante once días, realizando intensos entrenamientos y pruebas con el nuevo equipamiento y visando la futuras misiones lunares del Programa Apollo.