Aunque en un primer momento Valverde fue designado como ganador de la etapa y de la general (siendo Rogers cuarto, tras el segundo Spilak y el tercero Menchov), la UCI excluyó posteriormente a Valverde en cumplimiento de la sentencia del TAS que ordenaba su sanción al considerarse probada su implicación en la red de dopaje liderada por el doctor Eufemiano Fuentes en la conocida como Operación Puerto, por lo que Spilak fue el ganador oficial de la prueba (con Antón como vencedor de la etapa final) y Rogers figuraría como el tercer clasificado.