Dado que los requisitos de los aviones navales soviéticos no cambiaron rápidamente, el confiable Be-6 permaneció en servicio hasta finales de los años sesenta.Con un alcance máximo de 4.800 km, y un techo normal de vuelo de 6.100 m operaron en patrullas, reconocimiento marítimo y misiones antisubmarinas hasta principios de la década setenta y algunos permanecieron en servicio hasta finales de la misma en funciones de trasporte y vigilancia de zonas pesqueras, así como transportes civiles desarmados en las regiones árticas.