Por buena parte del término municipal de Miño discurre el llamado Valle de Ambrona, cuyas aguas vierten a las tres más importantes cuencas hidrográficas de España: al Duero (en el valle nace el río Bordecorex, también denominado Torete, que vierte al río Escalote, afluente del Duero), al Tajo (en la sierra Ministra que encaja el valle nace el río Henares, a través del Barranco de la Cueva y arroyo de Alboreca) y al Ebro, y del Barranco de Valdemino, al pie del Alto del Rasero (mediante el río Masegar también llamado arroyo Madre o arroyo de la Mentirosa, que corre por el fondo del valle en dirección sur y vierte al Jalón, afluente del Ebro).