En la siguiente temporada (1990-91) descendió y no se logró el ascenso hasta la temporada 2007-08 gracias a la Unión Balompédica Conquense que subió a 2ª División B y dejó la plaza libre que le hacía falta al Criptanense para subir a Tercera División, permaneciendo en esta categoría las 4 temporadas siguientes.