Antes de su matrimonio, don Juan Fernando tuvo dos hijas a las cuales reconoció: con doña Pilar Castillo tuvo a Adelina Castillo Echeverría, nacida hacia 1841, quien casó con don José María Ugalde, abogado, y con Cristina Corrales tuvo a Jacoba Corrales Echeverría, nacida hacia 1842, quien casó con don José de Jesús Brenes.