Se le añadió un Modo de Misiones y un Modo de Galería, así como también un Modo Historia en la cual se cuenta la aventura de cada uno de los protagonistas del juego en tres caminos para cada uno (igual al modo historia de GGXX), esto explica algunas confusiones por parte de los jugadores occidentales cuando en el modo historia de GGXX se hacen referencias a cosas que sucedieron en el modo historia de GGX Plus.