Luego de su regreso a la máxima categoría en el año 2007, se ha visto en idas y vueltas, entre Segunda y Primera División, siendo el año 2012 el peor momento de su historia al ser desafileado por la Federación Uruguaya de Basquetbol, tras incidentes de hinchas con su eterno rival el Club Atlético Welcome, que terminó con la muerte de una mujer y dos hinchas heridos de bala, fue una de las peores tragedias en la historia del basquetbol Uruguayo que dejó a Cordón 18 meses sin poder competir en ningún torneo oficial a nivel mayor como de sus formativas siendo la pena máxima que se le otorgó a un equipo de basquetbol uruguayo.