Los núcleos más importantes en cuanto a flora son sierras de la Cordillera Penibética como Sierra Nevada, las sierras del Cabo de Gata, Alhamilla, Filabres, Baza, Gádor, Almijara, Tejeda, Antequera, Serranía de Ronda; de la Cordillera Prebética como las sierras de María, La Sagra; de la Cordillera Subbética como las Sierras de Huétor, Loja, etc; así como las depresiones del Surco Intrabético, también muy ricas en plantas singulares como las de Antequera, Granada, Baza, Guadix, Huéscar, etc.