Nombrado canónigo penitenciario en 1788, su precario estado de salud motivaría que durante mucho tiempo residiera en la localidad granadina de Lanjarón con el fin de tomar las aguas, y tan sólo a partir de 1797 su actividad vuelve a adquirir el ritmo de antaño, encomendándole el cabildo algunas misiones de gran relevancia, yendo a Sevilla a presentar ante la Audiencia las cuentas de los patronatos de obras pías; acaudillando las protestas de los prebendados con motivo de la Desamortización de 1798; y realizando una serie de visitas pastorales por la diócesis, cuyos informes constituyen una fuente de primera mano para conocer la vida espiritual de la misma en las postrimerías del siglo XVIII.