Si bien en la legislatura 1999-2003, el entendimiento con el PSE-EE fue importante, en la legislatura 2003-2007 no fue así y el gobierno foral de Rabanera, en minoría, tuvo que hacer frente a varias mociones de censura promovidas por los grupos del tripartito (PNV-EA-EB) que ostentaba el Gobierno Vasco; una de las cuales se saldó con la destitución del diputado de Bienestar Social, Enrique Aguirrezábal; las mociones dirigidas contra él no prosperaron al no contar con el aval del PSE.