En 2005 se proclamó por segunda vez campeón de Europa "indoor", en Madrid, pero luego Šebrle ha visto como su hegemonía de los últimos años se ha visto desplazada precisamente por el subcampeón olímpico en Atenas, Brian Clay, que se proclamó campeón del mundo en Helsinki relegando a Šebrle a la segunda posición, y lideró también el ranking mundial del año.