En 2005 solicitó licencia al Senado y fue precandidato a Gobernador de Nayarit, compitiendo por la candidatura del PRI con el Presidente Municipal de Tepic, Ney González Sánchez, oficialmente perdió la elección interna, sin embargo denunció que su derrota fue debido a un fraude electoral y demandó la anulación del proceso, ante la negativa del partido a su solicitud, el 10 de marzo de 2005 renunció al PRI; posteriormente aceptó ser candidato de la Alianza por Nayarit, formada por el PRD, el PT y el Partido de la Revolución Socialista a gobernador del estado, tras la declinación del candidato ya postulado por esa Alianza, Francisco Javier Castellón Fonseca.