Tras ser aplastada la República Riograndense y nuevamente ocupada la región por Brasil, el presidente uruguayo Manuel Oribe reclamó los territorios como parte noroeste de la República Oriental del Uruguay, sin embargo en 1851 el Partido Colorado, aliado a Brasil, cedió todos los territorios al norte del Cuareim y el control brasileño se efectivizó al ser derrotadas las fuerzas de Oribe en 1851, de modo que por ley brasileña del 6 de diciembre de 1858, cuando Itaquí poseía una población de aproximadamente 4000 personas, fue segregada del municipio de São Borja y de Uruguayana.