La autoridad suprema de la universidad reside en el Consejo Universitario, el cual ejerce las funciones de gobierno y se halla conformado por el Rector, quién lo preside, el Vicerrector Académico, el Vicerrector Administrativo y el Secretario, además de los Decanos de las Facultades, cinco representantes de los profesores, tres representantes de los estudiantes, un representante de los egresados y un delegado del Ministerio de Educación.