Juan Bustamante Arenas es dirigente del Partido Popular Cristiano, desde el año 1978, inscribiéndose en abril de 1980, y desempeña cargos nacionales como Subsecretario Nacional de Comandos Estudiantiles, dirigente Nacional de Juventudes, miembro de la secretaría nacional de Doctrina, Subsecretario Nacional de Gobiernos Locales, Subsecretario Nacional de Prensa y Propaganda, miembro del Comando Nacional de Campaña los años 1984 y 1985, asesor de la Secretaría Nacional de Plan de Gobierno en el Sector , viaja intensamente por el Perú para ayudar a la Secretaría Nacional de Organización a conformar una estructura partidaria en todo el Perú.