En 1880, Bográn fue nombrado Ministro de Gobernación durante el gobierno del Doctor Marco Aurelio Soto, ya en 1883 Soto renuncia de su cargo de Presidente, es así que un Consejo de Ministros toma las riendas del país; el general Luis Bográn fue elegido para que se convirtiera en el nuevo presidente de la república, tomando posesión el 30 de noviembre de ese mismo año.