Honiara es predominantemente cristiana y en ella se encuentran las sedes de la Iglesia de la provincia de Melanesia (anglicana), la Arquidiócesis de Honiara (católica), la South Seas Evangelical Church, la Iglesia Unida en Papúa Nueva Guinea y las Islas Salomón, la Iglesia Adventista del Séptimo Día y otras iglesias cristianas.