De acuerdo con los resultados de la Encuesta Intercensal 2015 del Instituto Nacional de Estadística y Geografía (INEGI), el municipio de Empalme cuenta con 56 177 habitantes, cuando el Censo de Población 2010 había 1 469 en Santa María de Guaymas, 2 098 en La Atravezada y 42 516 en Empalme (cuya edad mediana era de 27 años), lo que la convierte en el duodécimo municipio más poblado de Sonora.