El territorio de Zubieta se puede dividir en tres sectores: la parte norte, que es llana y de vega del río y donde se encuentra el pequeño núcleo urbano de Zubieta y la mayor parte de los caseríos; la parte este, también llana y de vega, queda frente al núcleo urbano de Lasarte-Oria y ha sido aprovechada para la construcción de varias infraestructuras (hipódromo, autovía A-1, mercado de mayorista de frutas, etc.); y el resto de Zubieta, que es montañoso y boscoso, y recibe el nombre genérico de Zubietamendi.