En 1998 en la primera edición de este evento, el club logró clasificar a la final de la Copa Merconorte, y en aquella oportunidad disputó el título con el Atlético Nacional de Medellín, en la primera final perdió 3 goles a 1 en el estadio Atanasio Girardot de Medellín, y luego en el partido de vuelta disputado en el estadio Olímpico Pascual Guerrero de Cali, Atlético Nacional volvió a ganar 1 a 0.