La etimología más aceptada para el vocablo "Zapopan" deriva del náhuatl "Tzapopan", y sugiere que el significado es "lugar de zapotes", "lugar entre zapotes" o, en su defecto, "el zapotal"; formado por los vocablos "Tzapotl", "zapote", y "pan", "sobre", representado por "tzápotl", zapote, y "pantli", bandera.