En la década de 2000 el club contó con una generación de destacados futbolistas tanto mexicanos como extranjeros: Rodrigo Ruiz, Oswaldo Sánchez, Juan Pablo Rodríguez, Oribe Peralta, Iván Estrada, Daniel Ludueña, Matías Vuoso, Héctor López, Fernando Arce, Christian Benítez, Darwin Quintero, Luis Romero, Carlos Cariño, Denis Caniza, Walter Jiménez y Felipe Baloy, quienes fueron elementos importantes en el crecimiento de la historia del club.