Autobuses, ferrocarriles metropolitanos y ferrocarriles regionales operados por la Autoridad de Tránsito de la Ciudad de Nueva York ("New York City Transit Authority") controlada por la MTA (Autoridad de Transporte Metropolitano), además de autobuses, ferrocarriles regionales y ferrocarriles livianos operados por New Jersey Transit también funcionan independientemente de PANYNJ.