El martes 22 de julio de 2014 el Santo Padre Francisco nombró Monseñor Carlos José Ñáñez, miembro del Pontificio Consejo para la Promoción de la Unidad de los Cristianos, junto a los obispos Rodolfo Valenzuela Núñez, de Vera Paz, Presidente de la Conferencia Episcopal de Guatemala y Gerhard Feige, de Magdeburgo Alemania.