Tras Méndez Álvaro llega a Atocha-Cercanías (correspondencia con todas las líneas de Cercanías Madrid excepto la C-9 y la línea 1 de Metro de Madrid), la cual atraviesa de sur a norte situándose en las vías situadas al oeste de la estación de cercanías (8 y 9) y entra por un túnel subterráneo bajo la Ronda de Atocha y la Ronda de Valencia para enfilar hacia el suroeste de Madrid.