El mayor complejo hospitalario de Andalucía lo gestiona el SAS y se trata de la "Ciudad Sanitaria Universitaria Virgen del Rocío de Sevilla." Asimismo, destacan los complejos hospitalarios regionales de Jaén, Granada, Huelva y Reina Sofía de Córdoba, así como los hospitales universitarios Virgen Macarena de Sevilla y Regional de Málaga.