En la Pro12, Munster ha acabado todos los años en la parte alta de la clasificación, destacando las temporadas 2002/03 y 2008/09 en las cuales logró el título, las temporadas 2001/02 y 2004/05 en las que acabó como subcampeón, y las temporadas 2005/06 y 2007/08 en las que terminó siendo 3º.