En su reforma del 4 de diciembre de 1812, en la cual reducen los ejércitos de España de seis a cuatro de operaciones y dos de reserva, el Consejo de Regencia distribuye los mandos de los respectivos generales en jefe y capitanías generales, Elio fue nombrado general en jefe del Ejército Segundo, de Valencia, Murcia y Castilla la Nueva, y, a partir del 6 de enero de 1813, capitán general de los Reinos de Valencia y de Murcia.