Sin embargo, en medio de la controversia entre los mandos locales y Walker, se encontraba el acecho de los "legitimistas" cuyas tropas se aproximaban a León al mando del general Ponciano Corral Acosta junto a los refuerzos del presidente hondureño José Santos Guardiola, también conocido como «el carnicero de Honduras».Una situación importante en este escenario era la propagación de la enfermedad del cólera en la región.Finalmente, Walker decidió tomar Bahía de la Virgen en el Lago Nicaragua con 50 filibusteros y 120 nicaragüenses,pero fueron enfrentados el 3 de septiembre de 1855 por 600 hombres de Guardiola.