Islamofascismo es empleado con frecuencia en algunos medios occidentales dentro del contexto de la llamada Guerra contra el terrorismo, como sinónimo de «terrorismo islamista» y, con este fin, se ha empleado para calificar a organizaciones como Al Qaeda, los talibán, los Hermanos Musulmanes, Hamás y Hezbolá en sus primeros tiempos (antes de su posterior giro a la izquierda en los 2000, plasmado en el "Nuevo Manifiesto de Hizbullah", en que elimina su vieja retórica islamista e introduce conceptos propios del marxismo, bajo la influencia de los movimientos antiimperialistas latinoamericanos y dada la propia evolución de la sociedad libanesa tras el término de la última Guerra Civil en una sociedad cada vez más pluriconfesional y laica), pero también para criticar la naturaleza de ciertos regímenes como el instaurado desde la Revolución iraní.