De acuerdo con René Drucker Colín, coordinador de la investigación en ciencias básicas para la UNAM, "ningún otro gobierno en la historia reciente ha descuidado la investigación en las ciencias básicas como en la administración de Fox." El plan de Fox para el presupuesto otorgado al Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (Conacyt), que fue del 1% del PIB, se redujo al 0,33% del PIB.