Viganò acusó a otros funcionarios de las instituciones vaticanas como el director de los Museos Vaticanos, Paolo Nicolini, de propiciar difamación y desfalco de fondos por falsificación de facturas mientras estaba al frente de Pontificia Universidad Lateranense y participaciones en SRI Group, sociedad que acumuló incumplimientos a la Secretaria de Gobernación (por 200 mil euros), al diario "L'Osservatore Romano" (por € 97 mil) y a la Administración del Patrimonio de la Sede Apostólica (por € 85 mil).