Aunque el paisaje de la cabecera municipal sea predominantemente urbano, no obstante en algunas agencias municipales como San Pedro el Alto, Santiago Clavellinas y San Pedro Totomachiapam es posible encontrar fauna silvestre como el venado, el gato montés, la liebre, la tuza, el coyote, el tejón, el tlacuache, y la gallina montés.