En las pozas y charcas salinas, que alcanzan mayor temperatura en verano, destacan las algas rojas, sin embargo las plantas o algas acuáticas más importantes en este ecosistema son las de agua dulce, entre las plantas pluricelulares subacuáticas destacan las ceratofiláceas, las milenramas, las potamogetonáceas (sobre todo Potamogeton crispus) y las algas filamentosas Chlorophytas y Charophytas que forman el "Pan de Rana" Las algas filamentosas clorofitas forman también grandes colonias en forma de barba verde en aguas corrientes y acequias y las algas rodófitas (algas marrones-rojas y algas pincel), que son de color verde, verde muy oscuro, marrón oscuro y a veces negras, forman matas con forma de pincel o hierba, generalmente de unos pocos milímetros de largo.