Pedro Gumiel dirigió también la construcción del retablo mayor de la Catedral de Toledo (1497-1504), coordinando el trabajo pictórico de Juan de Borgoña y el escultórico de Petijuan ("Petit Joan"), Rodrigo Alemán, Felipe Bigarny y Copin de Holanda, artistas de la órbita estilística hispanoflamenca, además de Enrique Egas y Sebastián de Almonacid.