Junto con el 14º Shamarpa, Ole Nydahl es uno de los lamas que apoyan al Karmapa Thaye Dorje en la sobre la identidad del 17º Karmapa, quien asegura que el Dalái Lama no está calificado para reconocer (e, históricamente, nunca antes lo había reconocido) al líder de la escuela Karma Kagyu del budismo tibetano, que es un linaje totalmente independiente y 300 años más antiguo que el Gelugpa.