En 1962 el jardín entró a formar parte del "Lembaga Biologi Nasional" (LBN) (Instituto Biológico Nacional), siendo designado su director, "Otto Soemarwoto" en 1964, durante su mandato pomovió la investigación pura, y enfocó al jardín como una institución de investigaciones biológicas tropicales, lo que en definitiva trajo una amplia gama de beneficios para la agricultura, la industria farmacéutica y el cuidado de la salud.