El sistema fluvial es propio de la alta montaña, con numerosos arroyos permanentes que en diferentes puntos se unen a las dos corrientes principales: hacia el norte de la cabecera municipal corre, de oriente a poniente, el río de Ayutla y hacia el sur, con la misma dirección de oriente pontiente, el río Chintete, ambos de corriente veloz que forma cascadas de regular dimensión, debido a los rugoso y empinado del relieve.