El convento fue abandonado a raíz de la Desamortización de Mendizábal a pesar de la solicitud de los vecinos que escribieron al gobernador civil de Logroño en 1868 «para que no lo suprimiera y les concediese su conservación como una especial gracia» debido a la labor de las religiosas que se dedicaban a la enseñanza gratuita de las niñas.