El "Campeonísimo" Guadalajara no pudo reflejar en el torneo de Copa su dominio y éxito de la Liga, ya que en esa época dorada solo pudo obtener en dos ocasiones el campeonato, en las temporadas 1962-63 y 1969-70, en esta última conquisto los dos títulos y se proclamó Campeonísimo derrotando en la final al Torreón FC el segundo equipo recién ascendido en llegar al final de Copa (Tampico FC lo logró en 1959/60 y la perdió frente a Necaxa).