Asimismo, sus playas fueron decretadas, el 16 de julio de 2002 por el Gobierno Federal, como "Área Natural Protegida" con categoría de "Santuario", establecido para la protección, conservación, repoblación, desarrollo y control de las diversas especies de tortugas marinas, ya que Ría Lagartos se reconoce como una de las principales zonas de arribo de la "tortuga carey" (Eretmochelys imbricata) y la única en el estado de Yucatán para la "tortuga blanca" (Chelonia mydas).