Holguín también era pariente cercano de los conquistadores Hernán Cortés, Francisco Pizarro, Francisco de Orellana, Ñuflo de Chaves y el adelantado Juan de Sanabria que estaba casado en segundas nupcias con Mencia Calderón Ocampo ""la Adelantada"" quien luego de enviudar llevara las primeras mujeres hidalgas al Nuevo Mundo.