José Zalaquett cuenta con una dilatada trayectoria académica como profesor de Derecho Internacional de los Derechos Humanos en la Facultad de Derecho de la Universidad de Chile, Doctor en Derecho, Honoris Causa, por las Universidades de Notre Dame y City University of New York, y Profesor de Ética y Gobierno en el Magíster de Gestión y Políticas Públicas del Departamento de Ingeniería Industrial de la Universidad de Chile.