En la bahía de Samborombón se encuentran 4 áreas protegidas: la reserva natural provincial integral con acceso restringido, la reserva natural provincial integral Rincón de Ajó, el parque nacional Campos del Tuyú —creado por la Fundación Vida Silvestre Argentina y donado al estado nacional— y la estación biológica estación biológica Punta Rasa, creada mediante un convenio entre el Servicio de Hidrografía Naval (Armada Argentina) y la Fundación Vida Silvestre Argentina.