Con la elección en 1988 de Carlos Salinas de Gortari como Presidente de México, Hugo Andrés Araujo fue designado Secretario General de la Confederación Nacional Campesina, el sector campesino del Partido Revolucionario Institucional, y en 1994 fue electo Senador por Tamaulipas a las LVI y LVII Legislaturas cuyo periodo culminó en 2000.