En 1812 Bagratión comandó el Segundo Ejército del Oeste y, aunque derrotado en Moguiliov (23 de julio de 1812), se reincorporó al ejército principal comandado por Barclay de Tolly, y dirigió su ala izquierda en la batalla de Borodinó (7 de septiembre de 1812), durante la cual rechazó en cinco ocasiones las embestidas francesas, y en la que fue mortalmente herido.