El Síndrome de Sjögren puede aparecer asociado con diversos trastornos, la mayoría de los cuales son enfermedades autoinmunes o reumáticas, tales como la enfermedad celíaca (que suele cursar con síntomas digestivos leves o completamente asintomática), la fibromialgia, las tiroiditis autoinmunes, la esclerosis múltiple y las espondiloartropatías, y ciertos procesos malignos, principalmente el linfoma no-Hodgkin.