Sus trabajos más importantes incluyen la comedia negra de 1999 "Being John Malkovich" ("Cómo ser John Malkovich" o "¿Quieres ser John Malkovich?"), por la que fue nominado al Óscar al mejor director, y el filme de 2002 "Adaptation" ("El ladrón de orquídeas"), ambas escritas por Charlie Kaufman.