El Torneo no se jugaba desde entonces, pero para la temporada 2012-13, el torneo de Copa es resucitado bajo un nuevo formato y el nombre de Copa MX, jugándose un torneo durante el Torneo Apertura 2012 y otro durante el Torneo Clausura 2013, durante el Apertura participando 28 equipos (14 de Primera División y 14 de la Liga de Ascenso), y durante el Clausura 24 equipos (11 de Primera División y 13 de la Liga de Ascenso ).