En la temporada 2013-14, tras una gran campaña de 50 puntos, logró la clasificación a la Copa Sudamericana 2014, pero un error de la AFA lo privó de disputar dicho torneo internacional por primera vez en su historia, luego de que, insólitamente, Boca Juniors ocupara la plaza que le correspondía a Olimpo a pesar de derrotar en un partido de desempate a Vélez y clasificar a la Copa Libertadores 2015, debiendo haber cedido su lugar en la Copa Sudamericana citada.