El primer juego, "Johnny Test: Zapper Clone", encuentra Johnny Test y Duke comprometido a luchar contra un ejército de clones Johnny accidentalmente creadas de ellos de una máquina de copia, con la ayuda de dos armas especiales zapper láser ya que sus únicas armas para derrotar a los clones y destruirlos personly, y el segundo juego, "Johnny Test: Bot Drop", ve a Johnny, Duke, Susan y Mary que van en persecución de rescate, con Johnny y Duke tanto pilotando un avión para utilizar los clones robot de Johnnies (primero visto en ) para el titular "Bot Drops" para expulsar a safery en un vehículo de rescate en movimiento conducido por Susan y Mary.