Un análisis cladístico de 2008 realizado por Carrano y Sampson colocó a "Genusaurus" en Noasauridae junto con "Laevisuchus" , "Masiakasaurus" , "Noasaurus" y "Velocisaurus", a su vez, los noasáuridos forman parte del grupo Abelisauroidea, que forma parte del grupo de los Ceratosauria, confirmadolo en 2011 donde clasificó a "Genusaurus" entre los noasáuridos.