La sede de Santo Domingo funciona desde 1980 y cuenta con más de 2000 estudiantes en un área de treinta hectáreas, dotada de laboratorios de química, talleres de electromecánica y automotriz, centro de computo, aulas virtuales, biblioteca y un centro histórico-arqueológico en el que se exponen más de 400 objetos de diferentes culturas del país, preferentemente de la cultura Tolita, Jama-Coaque, Bahía, Atacames, Milagro Manteña y Negativa del Carchi.