Después de algunos partidos amistosos y de clasificación, la primera aparición de Schortsanitis tuvo lugar en una gran competición, el Campeonato Mundial de Baloncesto de 2006 en Japón, cuando Grecia obtuvo la medalla de plata al perder con España la final, a la cual había accedido tras derrotar en semifinales a la selección de EE.UU.