No obstante, el gobierno debió soportar de protestas sociales en diversas localidades como el conflicto de Bagua, siendo el episodio más sombrío la llamada masacre de Bagua, el 5 de junio del 2009, esto debido a un decreto que favorecería a las grandes empresas transnacionales y mineras a usar zonas protegidas con el fin explotar yacimientos de petróleo, gas y otros minerales.