El baloncesto es el deporte que más convocatoria tiene en la ciudad ha sido representado por Club de Deportes Provincial Llanquihue hasta su desaparición siendo dos veces campeón de DIMAYOR y actualmente el Club deportivo social y cultural Puerto Varas representa a la ciudad en diferentes competencias a nivel nacional en series menores y a nivel profesional en la Liga Saesa y para disputar sus partidos de local utiliza el gimnasio fiscal de calle San Francisco con capacidad para 1.200 espectadores y en otras opurtunidades se ha utilizado el coliseo municipal en Puerto Chico que tiene capacidad para 1000 personas, además del club deportivo colegio alemán de Puerto Varas que milita en la segunda división de Liga saesa y disputa sus partidos en el gimnasio del colegio alemán ubicado en camino a Ensenada.