La principal obra de Martín Fernández de Navarrete es ""Colección de los viages y descubrimientos que hicieron por mar los españoles desde fines del siglo XV: con varios documentos inéditos concernientes á la historia de la marina castellana y de los establecimientos españoles en Indias"." Consta de cinco extensos volúmenes y fue impreso por la Imprenta Real entre 1825 y 1837.