Sin embargo, hoy en día cobra actualidad la validez de este grupo debido al análisis filogenómico, el cual ha encontrado que los mesozoos Orthonectida y Rhombozoa son grupos hermanos dentro de la filogenia de Spiralia, y que a su vez estos estarían relacionados con los platelmintos y probablemente más cercanos aún con los gastrotricos dentro del grupo Rouphozoa.