Ocupa la amplia manzana que se encuentra frente al lado oeste de la Plaza San Martín (antigua "Plaza Mayor"), por su costado norte la gran iglesia se halla separada del Cabildo por un antiguo callejón llamado "Santa Catalina", la parte posterior del templo da a la calle Rivera Indarte, su fachada principal está orientada hacia el este-sur-este, lo cual es singular en las iglesias de su época ya que debían tener el altar mayor orientado hacia Jerusalén (en este caso, debería estar hacia el noreste, aunque se encuentra hacia el noroeste).