Luego del Shinra Tensei masivo, éste y su padre sobreviven, aunque Shikamaru sale malherido con una pierna rota, minutos después se entera por parte de Katsuyu que Naruto se estaba enfrentando solo con Pain y trata de ir a ayudarlo pero debido a su herida no puede moverse y también por que su padre Shikaku le menciona que Naruto ahora a dominado el Senjutsu esta en un nivel superior y que de ir solo estorbaria en la batalla por lo que decidió dejar todo en manos de Naruto y dejar de insistir.