Históricamente, este pueblo perteneció a la jurisdicción de Huete hasta que en 1553, por orden real se eximió de esta dependencia otorgándole a la localidad la autonomía con el nombre de "Barajas de Suso", pasando a formar parte dos siglos más tarde del Condado de Francisco de Melo, que fue quien, al ceder el dominio del pueblo, le puso el sobrenombre a la villa.