En junio de 2008 la aerolínea AeroCóndor fue prohibida de operar su flota Boeing por la Dirección General de Aeronáutica Civil(DGAC) del Ministerio de Transportes y Comunicaciones (MTC); sin embargo la aerolínea está autorizada a hacer vuelos turísticos teniendo permiso de operación de aviación comercial para transporte aéreo no regular nacional de pasajeros y carga por un plazo de cuatro años a partir de diciembre de 2008.