Tiene cuatro tradiciones principales: nyingma, kagyu, sakia y gelug, cada una con sus monasterios y sus linajes menores; por ejemplo, kagyu tiene cuatro escuelas mayores y ocho subescuelas; nyingma tiene seis monasterios madre donde se enseñan los seis niveles del tantra; sakia se diferencia porque ofrece enseñanzas tántricas privadas a las cuales acuden los maestros de las demás escuelas, y geluk se centra en los monasterios Ganden y Drepung.