Ese año fue elegido rector de la Universidad de Concepción para el período 1998-2002, precedido por el ex-senador Augusto Parra Muñoz, siendo reelecto en cuatro períodos más: 2002-2006, 2006-2010, 2010-2014 y 2014-2018, extendiendo su gestión a la cabeza de la institución por 20 años.