Existe una controversia en torno a su pensamiento filosófico pues no sigue la tradición en muchos aspectos y no acepta la autoridad religiosa de la mayoría de maestros budistas actuales (como la del Dalái Lama), ha elevado el estatus del gyalpo Dorje Shugden declarando que su apariencia es iluminada contradiciendo la tradición centenaria del budismo tibetano.