Los principales cantorales que se conservan de esta segunda época son el "Cancionero del Duque de Calabria" o de Upsala (así llamado debido a que la única copia que se conserva está en la biblioteca universitaria de esta ciudad sueca), el "Cancionero de Medinaceli" y las "Canciones" y "Villanescas espirituales" de Francisco Guerrero.