Desde la invasión estadounidense de Afganistán, se desconoce el paradero de Al Zawahirí; según notas de prensa del año 2002, habría sido abatido por fuerzas desconocidas, pero a principios de septiembre de 2003 se envió tanto un vídeo de Al Zawahirí y Bin Laden como una cinta de audio a la cadena de televisión al-Yazira, de Catar, con la que se pretendía dejar constancia de que ambos seguían con vida.