Fue el primer club del interior en participar en la Copa Libertadores de América en el 2006, donde tuvo una buena actuación al ganarle en el Campus de Maldonado 3 a 2 a Liga de Quito, base de la selección ecuatoriana, y dos empates ante Universitario, terminando tercero detrás de Vélez Sarfield de Argentina, Liga de Quito.