Por el contrario, fue la resistencia y presión popular, principalmente de parte de los afectados (familiares, allegados, pacientes, etc.) y también de parte de algunos círculos religiosos, tanto católicos como protestantes, lo que condujo a que oficialmente se declarara suspendido el programa en 1941, pero eso no implicó el desmontaje de la organización establecida para desarrollar estos planes ni tampoco el cese de los asesinatos en sus centros.