Durante estos, el PCM vivió los mismos conflictos ideológicos que enfrentó el movimiento comunista en el mundo, estos provocados por la división entre estalinismo y trotskismo que causó conflictos a su interior relacionados con sus militantes célebres como Diego Rivera quien luego fue expulsado del partido y Frida Kahlo (quienes ayudaron en el exilio a Trotsky), entre otros, por su respaldo a León Trotsky y a la llamada "Oposición de Izquierda" en la URSS; mientras otros como el muralista David Alfaro Siqueiros permanecían fieles al movimiento comunista; sin embargo el partido continuamente se va a desligar de los actos de sus simpatizantes estalinistas dando un giro hacia el revisionismo y posteriormente hacia el llamado eurocomunismo.