Sin embargo, en mayo de 2005 su candidatura a la presidencia en el 2006 sufrió un revés, al proclamar Renovación Nacional (el otro miembro de Alianza por Chile) a Sebastián Piñera como candidato a la presidencia y posteriormente negarse aquel a participar en una primaria propuesta por Joaquín Lavín para elegir un candidato único de la Alianza por Chile.