El Comando de Instrucción Aeronaval (COIA) controla las unidades instaladas en la Base Aeronaval Punta Indio, Fuerza Aeronaval N.º 2 (FAE2) hace lo propio con los residentes en Base Aeronaval Comandante Espora y la Fuerza Aeronaval N.º 3 (FAE3) opera desde la Estación Aeronaval de Ezeiza, la Estación Aeronaval de Río Grande (Tierra del Fuego) y la Base Aeronaval Almirante Zar en Trelew, Chubut, donde reside su Comandante.