Durante el Segundo Imperio Mexicano el bosque es seleccionado por los emperadores como ubicación de un palacio imperial, mismo que debía ser comunicado por una calzada de uso exclusivo para los Monarcas y la Corte con la ciudad de México la cual llevaría el nombre de Paseo de la Emperatriz (hoy Paseo de la Reforma) y que terminaba entonces en las faldas del cerro, por lo cual se modifican las construcciones en la cima del cerro, el cuerpo oriente es remodelado para dejar en la parte alta un jardín y algunas habitaciones, mientras en los pisos inferiores son construidas las habitaciones de los emperadores, las cuales les permiten tener una vista completa de todo el valle de México con todos sus lagos y el largo Paseo de la Emperatriz.