Con la excepción de una independencia "de facto" de cinco días en el invierno de 1906, cuando un levantamiento campesino declaró una república autónoma de Comrat, los gagaúzos han sido gobernados por el Imperio ruso (1812-1917), Rumania (1918-1940 y 1941-1944), la Unión Soviética (1940-1941 y 1944-1991) y Moldavia (1917-1918 y desde 1991 hasta la fecha).