En 1860, tras realizár una carena en Ferrol, se dirigió a Algeciras para concentrarse junto a una escuadra formada por el navío "Isabel II" las fragatas de hélice "Blanca" y "Princesa de Asturias" las goletas de hélice "Buenaventura", "Ceres", "Edetana" y "Santa Rosalía" las fragatas de vela "Bailen" y "Cortés" las corbetas de vela "Isabel II" y "Villa de Bilbao" el bergantín Gravina y los vapores de ruedas "Alerta", "Colón", "León", "Lepanto", "Liniers", "Isabel II", "Piles", "Santa Isabel", "Vasco Núñez de Balboa", "Vigilante" y "Vulcano", así como más de 70 buques menores y de transporte para participar en la guerra contra Marruecos, participando el Colón en los bombardeos de Larache y Arcila.