La Sociedad Deportiva Santoña Club de Remo se crea el 29 de agosto de 1979 a partir de la fusión de dos clubes de Santoña, la Sociedad Deportiva Santoña O.J.E, creada en el año 1971, y el Club Juan De La Cosa, fundado en 1977 y surgió del extinto Educación y Descanso.