Entre 1941 y 1946 orientó su investigación hacia Marruecos y el Sahara Occidental de acuerdo con los intereses imperialistas de la dictadura de Franco durante la Segunda Guerra Mundial, hasta que la victoria aliada aconsejó al Ministerio de Asuntos Exteriores retirarle su apoyo entre 1946 y 1949, aunque también por su mala relación con el marqués de Lozoya, director general de Bellas Artes, así como con otros arqueólogos españoles.