Después de haber cursado las escuelas de su patria con mucho éxito, como resulta de un certificado extendido por la "Direzzione Cantonale di pubblica Educazione" con fecha 7 de febrero de 1856 referente a un primer premio obtenido en la Escuela de Dibujo de Tesserete, Michele Trefogli se matriculó en la "Academia di Belle Arti" en Milán adonde estudió la arquitectura durante los años de 1855 a 1860.