Durante el profesionalismo, es decir, a partir del año 1921 al presente, una vez creada la Liga Mendocina de Fútbol, la "Lepra" se convirtió en el equipo más ganador de la misma, con un total de veinticinco títulos logrados a la fecha, siendo sus temporadas conquistadas las de 1924, 1925, 1926, 1927, 1928, 1929, 1932, 1935, 1936, 1938, 1940, 1945, 1960, 1961, 1962, 1965, 1967, 1970, 1972, 1976, 1978, 1992-93, 1993-94, 2007 (formativa) y 2010.