El 3 de septiembre de 1987, mientras Bagaza estaba en la cumbre de Francofonía en Quebec, Canadá, Buyoya aprovechó su ausencia en el país para encabezar un golpe de estado, y quedó en calidad de Presidente del Comité Nacional para la Salvación Nacional (CMNS), y el 9 de septiembre de ese año, fue nombrado Presidente de la República y Jefe de gobierno, al mismo tiempo que ostentaba el cargo de Ministro de Defensa.