Más tarde, al repoblarse volvieron a producirse enfrentamientos, hasta que las disputas fueron zanjadas tras la proclamación del Privilegio de la Unión por el rey Carlos III "el Noble" en 1423, unificando la ciudad y destruyendo las murallas que separaban a los burgos y dando nombre en euskera a la nueva ciudad surgida de la unión de los tres burgos: "Iruña" (de la contracción de Iru Ona, "tres buenos" en euskera).