En septiembre del mismo año se jugaron las fechas 7 y 8 donde en la séptima fecha los chilenos visitaron a en Asunción donde perdieron con un marcador de 2-1 y en la octava jornada recibieron en Santiago la visita de donde igualarían sin goles 0-0 pero en noviembre la federación chilena demando ante la FIFA la alineación indebida de un jugador boliviano al no tener los requerimientos de nacionalidad ante esto la FIFA decidió otorgarle la victoria a Chile por un marcador de 3-0 y en octubre llegaron las fechas 9 y 10 donde en la novena fecha visitaron a en Quito donde caerían goleados por 3-0 cerrando la primera ronda de eliminatorias con 13 puntos en la 6° posición y en la fecha 10 inicio la segunda ronda de las eliminatorias donde recibieron la visita de en Santiago saliendo victorioso por 2-1 y en noviembre del 2016 finalizaría el año con las fechas 11 y 12 donde en la undécima fecha los chilenos visitaron a en Barranquilla donde no se harían daño y empataron sin goles 0-0 y en la fecha 12 recibió la visita de en Santiago derrotando a los charruas por 3-1 quedando en la 4° posición con 20 puntos.