A partir del 9 de julio de 2008, con la apertura del segundo túnel ferroviario entre las estaciones de Atocha-Cercanías y Chamartín, la línea desaparece como tal de la red, siendo sus servicios transferidos a la línea C-2, que contará con trenes Madrid-Chamartín <> Guadalajara y Madrid-Chamartín <> Alcalá de Henares y el recorrido que realiza entre Chamartín y Alcobendas quedará cubierto por la línea C-4.