Además de ayudarnos a comprender el pasado, la zooarqueología nos da ideas para resolver los problemas ecológicos actuales, esto incluye específicamente los problemas relacionados con la gestión de la vida silvestre; por ejemplo, conociendo el modo en qué las sociedades antiguas convivían con especies que hoy se encuentran en peligro de extinción, pero que en la antigüedad eran incluso veneradas.