Dentro de la flora del municipio de San Andrés Itzapa se encuentran las siguientes especies: Álamo ("Alanus acuminata"), encino ("Quercus"), roble ("Quercus"), ciprés común ("Cupresus lusitánica"), pino ("Ceudoustrous"), eucalipto, canaque, casuarina, conacaste ("Enterolobium cyclocarpum"), hormigo ("platy-misium), grabilea, palo blanco.