En 1962 un golpe de Estado militar, dirigido por el jefe de la fuerza aérea Pedro Rodríguez Echavarría, lo obligó a exiliarse en Nueva York y Puerto Rico, y fue reemplazado por Juan Bosch, quien se rehusó a perseguir a la izquierda dominicana y fue depuesto por un golpe militar en septiembre de 1963.