Hay varios elementos de jugabilidad comparables: los plásmidos en "BioShock" cumplen la misma función que los "Poderes Psíquicos" en "System Shock 2"; el jugador tiene que lidiar con cámaras de seguridad, torretas ametralladoras, y robots zánganos hostiles, y tiene la capacidad de hackearlos en ambos juegos; la conservación de la munición está subrayada como una "característica clave de la jugabilidad"; y las grabaciones de audio desempeñan el mismo papel como narrador del argumento que los diarios de correo electrónico desempeñaban en la serie "System Shock".