Los principales sustratos de la gluconeogénesis son el lactato, producido fundamentalmente mediante la glucólisis en el musculo esquelético y los eritrocitos, los aminoácidos, generados a partir de las proteínas musculares durante la inanición, el aminoácido específico "alanina", producido en el músculo mediante el ciclo glucosa-alanina, el "propionato", procedente de la degradación de algunos ácidos grasos y aminoácidos, y el "glicerol", procedente del catabolismo de las grasas.