Houston se opuso al acto Kansas-Nebraska en 1854, y predijo acertadamente que causaría una grieta seccional en el país que lo conduciría eventualmente a la guerra: “… que campos cubiertos de sangre, que escenas de horror, que grandes ciudades en humo y ruinas - es el hermano asesinando al hermano… Veo a mi amado Sur hundirse en una competencia desigual, en un mar de sangre y humeantes ruinas.”