Finalmente, el 25 de marzo de 1911, el Internado Football Club resolvió bifurcarse en dos ramas: mantuvo la de carácter escolar, que continuó participando en la AAP, pero fundó otra de carácter universitario, desvinculada del Internado Nacional Barros Arana, que se inscribió el 30 de marzo de 1912 en la AFS.