No habiendo logrado sus objetivos, en 1848 acompaña a José Antonio Páez en el alzamiento que éste promueve contra José Tadeo Monagas, adversario político de Páez (y en consecuencia de Codazzi), quien se había declarado dictador; pero debido a que la protesta armada no tuvo éxito y su propia familia se vio involucrada en el conflicto, Codazzi no tuvo más remedio que renunciar a la gobernación de Barinas, salir huyendo a Maracaibo, enviar a su esposa e hijos a Aruba y salir al exilio hacia la Nueva Granada en 1849.