En los primeros compases de este nuevo conflicto las tropas francesas del virrey Luis de Armagnac, más numerosas, hicieron retroceder a las españolas, cercándolas en unas pocas plazas del sur de Italia, pero en abril de 1503 el curso de la guerra cambió: reforzado con la llegada de 2000 mercenarios alemanes, Fernández de Córdoba derrotó a Armagnac en la batalla de Ceriñola, mientras Fernando de Andrade, llegando desde España, venció al ejército de Aubigny en la batalla de Seminara.