Gracias al poder de la Iglesia en el siglo XIII, el papa influyó en los portugueses para que eligieran a un nuevo rey para que remplazara al que denominó «"hereje»: en el Concilio Ecuménico latino de Lyon I, (convocado en 1245 y presidido por el papa Inocencio IV), además de deponer y excomulgar al emperador Federico II, se excomulgó a Sancho II de Portugal.