Dado que la estima era alta hacia Etō en el país, Sanjo Sanetomi le escribió a Ōkubo con el fin de recordarle que las motivaciones de Etō no eran malvadas, Kido Takayoshi también le escribió para sugerir que fuera reclutado en la nueva Expedición a Taiwán de 1874 pero Ōkubo se mantuvo firme en la postura de que se debía sentar un precedente por lo que Etō y Shima fueron sometidos a un tribunal militar el 8 de abril de 1874 y fueron ejecutados junto con los otros once líderes de la revuelta al día siguiente.