Para el torneo Clausura 2012, de nueva cuenta la jaiba clasificaría a la liguilla de milagro con 25 puntos siendo séptimo lugar de grupo, enfrentaría en los octavos de final a los Dorados de la Universidad Autónoma de Chihuahua perdiendo en casa 0-2 ante la mejor entrada de el torneo para ir a jugar a Chihuahua trayéndose a casa un fulminante 4-0 (global 0-6) que lo eliminaba de la liguilla.