En el municipio de Cosamaloapan prácticamente no existen vestigios significativos de ecosistemas naturales, encontrándose en este momento cubierto por agroecosistemas dominados por diversos pastos introducidos, cultivos de mango ("Mangifera indica"), plátano ("Musa paradisiaca") y sobre todo Caña de azúcar ("Saccharum officinarum"), entre otros.