Fue convocado por Javier Aguirre para disputar la Copa América 2001, anotó el 1-0 en la victoria sobre Brasil en fase de grupos, se empató 0-0 con Paraguay y se perdió 1-0 con Perú, finalmente la selección de México avanzó a la segunda fase y venció 2-0 a la Selección de Chile en cuartos de final y en semifinales Borgetti marcó el 1-0 para vencer 2-1 a la Selección de Uruguay, se avanzó a la final y se logró el subcampeonato perdiendo 1-0 frente a la Selección colombiana.