Alcázar es autor de dos aportaciones fundamentales a su especialidad: el estudio preciso de las heridas cefálicas, prestando atención no solo a la consideración externa de la herida sino también a los síntomas neurológicos, y el análisis de las condiciones que debían reunir los instrumentos operatorios, lo que le llevó a crear varios instrumentos quirúrgicos que renovaron el instrumental de la disciplina a principios del siglo XVI.