El Patriarca Cirilo VI le llamó al patriarcado, en donde le consagró como obispo para la educación Cristiana y Decano de la Universidad Teológica Copta Ortodoxa, momento en el que asumió el nombre de Shenouda, el cual era el nombre de un Santo Copto y de dos patriarcas anteriores: Shenouda I (859–880) y Shenouda II (1047–1077).