El All-Star ya no jugaría con Indiana Pacers, Stojakovic quedaba como agente libre y podía elegir destino, y después de un verano del 2006 muy movido, Pedja acabó firmando por los New Orleans Hornets, con un contrato de 12 millones $ hasta junio de 2011, convirtiéndose en el mejor pagado de la franquicia.