Entre 2009 y 2010 recibe una nueva intervención, la más destacada por ahora, que debido al mal estado de algunas partes de las cubiertas de madera por acción del comején, se sustituyeron los techos de la Capilla y sacristía del Carmen, la sacristía mayor y parte del de la nave de la Epístola, concretamente el área frente al altar del Santo Sepulcro, conservando el mismo estilo.