Como consecuencia del Concilio Vaticano, la Congregación Salesiana inicia su propio proceso de adaptación al mismo y en ello tendría un papel primordial la Universidad, especialmente en los capítulos generales XX (1971) y XXI (1977) en los cuales se dio una importante fundamentación de la presencia de la Universidad dentro de la estructura de la Congregación Salesiana, su importancia en la misión, especialmente por su componente de apostolado juvenil, catequesis y atención a las realidades sociales extremas.