Si bien es cierto que muchas de las medidas tomadas por parte de los gobiernos liberales, e incluso conservadores (es necesario recordar que el primer periodo de Tomás Cipriano de Mosquera lo hizo bajo las banderas de este partido), afectaban los intereses de la Iglesia Católica, la mayor parte de esas reformas se encaminaban a romper con lo que en su momento se entendían como los rezagos de la colonia.