El 9 de julio de 2016, Fernando Arce convocó una conferencia de prensa en Tijuana donde anunció su retiro de las canchas, tras casi 16 años de trayectoria futbolistica, así como vestir 8 camisetas entre ellas Irapuato, Veracruz, Atlante, Monarcas, Santos Laguna, Tijuana, Chivas y Dorados.