Mary hace varias apariciones en Xenosaga: borrando una flota de Gnosis rodeo del Barco de Catedral con su ataque de X-Buster, ahorro de Elsa de quemar encima de en el Segundo Militian atmósfera, y salvando a Shion y Allen de ser asesinados por Voyager, el Testamento Negro, permitiendo a E.S.s entrar en Rennes-le-Chateâu y al final de Episodio III.