Originalmente, la aerolínea se llamó Aerolíneas de Ponce, pues operaba desde la ciudad de Ponce, al sur de Puerto Rico; al cambiar sus operaciones centrales al Aeropuerto Internacional de Isla Verde en San Juan de Puerto Rico, se tomó la decisión financiera de cambiar el nombre a "Prinair", para así apelar a la mayoría de los puertorriqueños y no solo a los ponceños.