En materia de seguridad, se encargó principalmente de establecer las nuevas bases para la organización de la Secretaría de Gobernación, misma que absorbería a la Secretaría de Seguridad Pública para integrarse a una Subsecretaría del Interior que tuviera a su cargo todas las labores de inteligencia, así como de las corporaciones policiacas, incluyendo la nueva Gendarmería Nacional.