En enero de 2016 se aprobó el Presupuesto General de Ingresos y Egresos del país, que es de 204 mil millones de Lempiras (US$ 8 mil millones de dólares estadounidenses) de los cuales, le corresponderían 12 mill millones de Lempiras, pero debido a la creación de nuevas categorías en el presupuesto, a la universidad se le asigna el 6 % de este grupo y no de el presupeusto de la república, teniendo así en 2016 un presupuesto de 5 mil millones de Lempiras, el cual se espera sean utilizados entre otras cosas en lo siguiente: