En ese mismo congreso fue elegido como Secretario General de la Juventud Comunista de México, Rafael Castañeda, así como el Comité Nacional y el Secretariado del Comité Nacional, en agosto del año 2007 en la ciudad de Guadalajara se celebró su Segundo Congreso Nacional, con el lema Ruptura, Rebelión y Socialismo, en su tercer Congreso Nacional celebrado en abril del 2011 en la Ciudad de México fue elegido como Secretario General del Comité Nacional de la JCM el compañero José Martínez.