Por San Pedro Atzompa cruzan dos rutas de Transportes Urbanos y Suburbanos de Tecamac, las dos procedentes de la cabecera municipal, mientras que una se dirige al pueblo de Tonanitla pasando por Loma Bonita y Hacienda Ojo de Agua, la otra va hacia Calzada de la Hacienda en Jardines Ojo de Agua pasando por la calle 16 de Septiembre en San Pedro Atzompa y el mercado de Ojo de Agua .