El edificio terminal cuenta con 5,485 metros cuadrados en el cual se encuentran las oficinas administrativas del aeropuerto de Morelia, 24 módulos para atención a pasajeros y las oficinas de las seis aerolíneas comerciales que operan actualmente en el aeropuerto; también cuenta con una sala de última espera con cinco puertas de abordaje, dos salas de llegada, una nacional y una internacional.