El MNU fue cobrando paulatinamente una autonomía relativa frente a la OLP, ya que a pesar de existir una subordinación nominal ante esta organización, el MNU se permitió hacer un reclamo a la OLP para que ésta modificara sus políticas a fin de adoptar medidas más realistas que pudieran poner fin a la ocupación y se encaminasen a la creación de un Estado Palestino.