Los oficiales nazis del Protectorado iniciaron una minuciosa búsqueda de los dos hombres en los días siguientes y finalmente, el 18 de junio de 1942, una compañía de la SS los descubrió junto con sus milicianos de la Resistencia checoslovaca, en la iglesia de san Cirilo y san Metodio (una iglesia ortodoxa) en Praga.