Francisco de Montejo ejerció su nombramiento de ""Adelantado, Capitán General y Alguacil Mayor de Yucatán, Cozumel y Tabasco"" a partir de 1546 cuando llegó a reunirse con su hijo y sobrino en San Francisco de Campeche, sin embargo en 1550 fue acusado de irregularidades en su administración, por tal motivo fue destituido de su cargo y tuvo que viajar a Sevilla para presentar su defensa ante el Consejo de Indias, pero murió en 1553 cuando aún no había una resolución final del caso.