Igualmente, durante su gestión ha tenido que confrontar los escándalos derivados de la explosión de la torre de Petróleos Mexicanos en enero de 2013; la detención de la presidenta del Sindicato Nacional de Trabajadores de la Educación, Elba Esther Gordillo Morales a finales de febrero del mismo año y la segunda fuga de Joaquín "El Chapo" Guzmán Loera la noche del sábado 12 de julio de 2015, un año y medio después de que el narcotraficante hubiera sido detenido por segunda ocasión.