El 17 de enero de 1683 emprendió la expedición que lo llevaría a la historia, fue Almirante o jefe de escuadra de los navíos que llevaron a los padres misioneros fundadores de Las Californias, además de jefe militar de la expedición destinada a colonizar la california con el padre Matías Goñi a bordo de la nave capitana "La Concepción", al mando de Blas de Guzmán, iba también a bordo del navío "San José" el Padre Kino, la expedición a la península duró hasta octubre de 1685 y regresaron al continente porque no lograron establecer una Misión sustentable.