El equipo nace en 2006 como Club Deportivo Pedro Sellares, funcionando inicialmente como fuerzas básicas del América y llevando a cabo la representación del equipo en las categorías inferiores de los torneos organizados por la liga Vallecaucana de fútbol; desde 2008 América acabó con las divisiones menores coacervando solo las categorías Primera C y Juveniles en convenio con la escuela Pedro Sellares participando bajo ese nombre en los torneos nacionales Juvenil y Prejuvenil además de la Copa El País.