Tres años más tarde disputó la Copa México de 1963-64 por primera vez en su historia, sin embargo, quedaría eliminado en la Primera Ronda por el Club Deportivo Nacional, con marcador de 3 goles a 1 a favor de los jaliscienses el 23 de febrero de 1964 en Guadalajara, y un empate a dos el 27 de febrero en Zamora de Hidalgo.