En 2006, el MAS decidió apoyar a Manuel Rosales como candidato de una buena parte de partidos de oposición a las presidenciales del 3 de diciembre obteniendo 71.600 votos (0,61 %) el porcentaje más bajo registrado en una elección nacional para este partido, motivado en parte a que su escisión el partido Podemos captaron parte del voto tradicional del MAS.