Le sucedió una junta capitalina que intentó ejercer un mandato centralista, pero no contaba con el apoyo militar suficiente como para oponerse a Freire y el Ejército del Sur -inicialmente, intento reunir tropas en Valparaíso con el pretexto de enviarlas a Perú-, la oposición de las provincias le obligó a nombrar al general Freire como nuevo director supremo el 4 de abril.