De vuelta al ámbito nacional, Universidad de Chile disputó dos amistosos en la ciudad de La Serena el mes de febrero, correspondiente a la Copa Ciudad de La Serena 2017, lo que dejó como resultado una victoria y un empate; sin embargo, en el Torneo de Clausura 2017 el inicio de los "azules" dejó muchas dudas, esto ya que en el debut serían derrotados como visitantes ante Deportes Iquique por 2-0 y con dos jugadores expulsados en cancha.