A partir de 1867 fue objeto de modificaciones y mejoras considerables: la supresión del coro bajo, la modificación de las arcadas que separan las naves, instalación de un retablo mayor artísticamente tallado, la reedificación de cinco de los diez altares laterales, el reemplazo de las antiguas pilas de madera por otras de mármol blanco, y el cambio por baldosas de mármol de su antiguo pavimento de ladrillos, que se concluyó el 20 de marzo de 1882.