Fue el séptimo y último hijo del emperador Fernando II de Habsburgo y de María Ana de Baviera, y hermano del emperador Fernando III de Habsburgo: en 1625 fue ordenado obispo, ocupando las sedes de Halberstadt (1628–1648), Magdeburgo, Olomouc (1637–1662), Passau (1625–1662), Breslavia (1656–1662) y Estrasburgo (1626–1662); desde 1641 fue además Gran Maestre de la Orden Teutónica.