En la parte norte de esta zona se encuentran parte de las cordilleras Isabelia y Dariense y, hacia el sur, un ramal de la Cordillera Chontaleña; en la región central y Caribe meridional el río San Juan, con 192 km de largo, es el más caudaloso de Centroamérica y su ribera sur en parte de su recorrido hace frontera con Costa Rica.