Los pueblos de Nopaltepec pasaron a formar parte de la alcaldía de Otompan durante la colonia, los conquistadores españoles nombraron al pueblo como Santa María de Nopaltepeque, dentro de lo que fue el periodo colonial, destaca en la historia del municipio la construcción de un Acueducto para llevar agua a hasta el pueblo de Otumba; este acueducto aun existe siendo uno de los atractivos turísticos del municipio y son llamados los Arcos del Padre Tembleque.