Sus recursos hidrológicos son proporcionados por los arroyos: Zarco, Colorado, La Compuerta y El Corral Falso; por la laguna de Atotonilco y los manantiales de aguas termales de Chimulco, Agua Caliente, El Tular, Las Delicias, Las Brisas, Las Termas y los Veleros; además de encontrarse las presas de Estipac, La Cañada, La Ciénega, Las Tuzas y El Tecuán.