Zamora Pico de Oro está localizado en el extremo oriente de Chiapas y en lo profundo de la Selva Lacandona, una de las zonas más aisladas de México al iniciar su poblamiento, y en la margen derecha del río Lacantún, uno de los principales ríos de la zona, afluente del río Usumacinta, su localización es las coordenadas y a 200 metros sobre el nivel del mar.