Cabe citar, además de las ya señaladas anteriormente, Azuqueca de Henares, Carrascosa de Henares, Castejón de Henares, Castilblanco de Henares, Espinosa de Henares, Moratilla de Henares, Tórtola de Henares, Villaseca de Henares y Yunquera de Henares, todas ellas en Guadalajara, además de Alcalá de Henares y San Fernando de Henares en Madrid, pese a que el río que bordea el núcleo urbano es el Jarama, atravesando el Henares parte de su término municipal.