El año 2012 inició con la incertidumbre de un nuevo técnico, el uruguayo-argentino Gustavo Matosas (Buenos Aires, Argentina, 25 de mayo de 1967), quien comenzó a dirigir en el Torneo Clausura 2012 en el mes de enero, aunque había sido contratado desde septiembre de 2011, cuando aún se disputaba el Apertura 2011 y que por cuestiones de reglamento no podía tener presencia el banquillo ni ser registrado como entrenador del equipo ya que había sido entrenador del Querétaro FC ese mismo torneo y despedido cuando los Gallos, cambiaron de administración para poner a José Cardozo.