En el curso de la Independencia de Colombia, el Hospital aunque en condiciones de penuria económica y aún bajo la dictadura de Juan de Sámano, atendió a los numerosos enfermos y heridos y sirvió de cárcel para los médicos patriotas, en el Convento Hospital Santa Inés, los médicos tuvieron la oportunidad de ofrecerle a los soldados el alivio a la salud corporal.