Sin embargo, durante el Siglo XVIII el sistema español y las misiones generaron descontento entre la población indígena debido a la expulsión de muchos de ellos de sus tierras, en especial las cercanas a las minas que eran de principal interés para la corona española; esto generó ataques esporádicos en su contra y a pesar de que los españoles habían construido [[Presidio|presidios]] para resguardarse, los asentamientos españoles estuvieron en desarreglo.