Era Martín Fernández de Navarrete nieto del Caballero de la Orden de Calatrava Francisco Fernández de Navarrete y de Zárate (Nacido en Navarrete en 1684) e hijo de los nobles Francisco Antonio Fernández de Navarrete y Ramírez de la Piscina, natural de Ábalos, descendiente del rey de Navarra y de el Cid, y de la navarra Catalina Ximénez de Tejada y Argáiz, nacida en Funes.