En 1843 debido a que estaba enfrentado con el general Francisco Malespín, este aprovechó la oportunidad para derrocarlo mientras Guzmán se encontraba en una visita oficial en la ciudad de San Miguel, el 10 de diciembre de ese año Malespín declaró depuesto a Guzmán, debido a ello el 20 de diciembre de ese mismo año Guzmán se presentó ante la asamblea legislativa desde donde presentó su renuncia al cargo dejando en la presidencia en manos del senador designado Cayetano Antonio Molina y Lara (este ejerció la presidencia desde el 10 al 20 de diciembre de ese año, después lo ejerció el vicepresidente Pedro José Arce del 20 al 29 de diciembre cuando se lo entregó nuevamente a Cayetano Molina quién lo ocupó hasta el 1 de enero de 1844 cuando nuevamente se lo dio al vicepresidente Pedro José Arce quién terminó el período para el que fue electo Guzmán el 1 de febrero de ese año).