Entre las provincias de la Región Interandina Loja es la que posee los climas más cálidos y tropicales de la región, influenciable por las brisas marinas del desierto costero del Perú que secan el terreno desde la zona de sabana hasta la parte pre montana y que abarca tres cuartas partes del territorio provincial; dicha aridez afecta mayormente a la zona suroccidental, los llanos, la depresión central; aproximadamente el 88% de la línea de frontera con Perú, con las cuencas de los ríos Puyango, Jubones y Macará.