Además tenía mucho interés en las cerámica japonesa, por lo que en el año 1882 volvió a realizar su tercer viaje a la tierra japonesa para recoger ejemplares que luego llevó a Estados Unidos, donde forman parte de la llamada Colección Morse del Museo de Bellas Artes de Boston, cuyo catálogo oriental se ocupó en formar su amigo y compañero en la Universidad Imperial de Tokio, el orientalista Ernest Francisco Fenollosa.