Sus infraestructuras son utilizadas principalmente por Eusko Trenbideak (Euskotren Trena, Euskotren Tranbia y Euskotren Kargo), Renfe Feve (para transporte de mercancías) y Metro Bilbao, aunque en el caso de las utilizadas por esta última, se mantiene una titularidad compartida con el Consorcio de Transportes de Bizkaia, cediendo a dicho consorcio la gestión completa de la red.