La importancia y peso de ese gran paso a nivel deportivo viene dada por acontecimientos que se siguen derivando de ese status en la Segunda División B, y como consecuencia de ello, el Amurrio disputa, en las temporadas 2000/2001, 2001/2002 y 2003/2004, la Copa del Rey, cayendo eliminado contra los equipos de Primera División: Athletic Club (dos años consecutivos por 1-3 y 1-2) y Racing de Santander.