Durante la dictadura de Rafael Leónidas Trujillo Molina la situación existente entre ambas naciones se agudizó por el genocidio cometido hacia los haitianos en 1937, por la ocupación de los haitianos en las tierras fronterizas, lo cual según Trujillo no debía continuar, ordenando luego que todos los haitianos que hubiese en el país fueran exterminados.