Nuevamente lo asignaron en forma interina en el cargo de gobernador el 26 de octubre de 1600, por fallecimiento repentino de su hermano que ocupaba el puesto gubernativo, y sería confirmado por el rey en este mandato y también como presidente de la real audiencia desde el 19 de septiembre de 1601, con un sueldo anual de 5.000 ducados, y como tal, fue el ejecutor de una real orden de Felipe III que despoblaría el occidente insular en 1605, para erradicar el contrabando.