Uno de los problemas que experimentan los usuarios al momento de utilizar este programa emulador, es la compatibilidad de las ROMs (archivos que contienen los juegos) que existe en cada versión de MAME: una ROM que funciona en una versión más antigua de MAME no siempre funciona en una versión más reciente de MAME; ello ya que por ejemplo pueden crearse nuevas copias de mejor calidad del archivo ROM, con lo cual queda obsoleta la versión antigua.