En la década de los noventa, y siempre desde la perspectiva del comunismo ecologista, Fernández Buey prestó particular atención a la vena libertaria del marxismo de la subjetividad y publicó una serie de ensayos dedicados a la historia y análisis de los principales movimientos sociales críticos y alternativos contemporáneos, en su mayor parte en colaboración con el poeta y también filósofo político Jorge Riechmann.