Canela tiene un clima estepárico o semiárido, con precipitaciones importantes, las cuales se concentran entre los meses de mayo a septiembre, siendos éstas bastantes escasas debido a la fuerte sequía que afectó a la comuna desde 1998 a 2011, lo que ha llevado a declarar por las autoridades a la comuna como zona de escasez hídrica y zona de emergencia agrícola.