El equipo de Liniers se mediría en los Octavos de Final de la Copa Libertadores 2012 contra Atlético Nacional de Colombia que en la ida jugada en el Estadio Atanasio Girardot de Medellín obtendría la victoria por la mínima 1-0 y en el partido de vuelta jugado en el Estadio José Amalfitani sería un empate 1-1 que de esa forma le daría el pase de ronda, finalmente, se quedaría eliminado por penales en Cuartos de Final ante el Santos de Brasil.