Aunque fue clasifica en principio como un titanosaurio, dicha clasificación de "Amargatitanis" fue puesta en duda posteriormente por otros autores, quienes señalaron que una escápula (MACM PV N34) y seis vértebras de la cola (MACN PV N51), consideradas como sintipos de "Amargatitanis" fueron halladas en localidades diferentes a MACN PV N53 y que las supuestas características de titanosaurio del género no eran válidas.