El municipio cuenta con 53 localidades, siendo las más importantes: Hostotipaquillo (cabecera municipal), Estación Barrancas, Las Ciénegas, Cinco Minas, Las Conocas, Copala, La Estanzuela, Huajacatlán, Jocotlán y Trinillo, Labor de Guadalupe, El Llano de los Vela, El Llano de Michel, Mesa de Flores, La Mesa de Tecomatán, Michel, Moselo, La Montaña, El Monte del Favor y Paso de la Yesca, Plan de Barrancas.