En 2001, el equipo "Chuchequero", como se le conoce, descendió definitivamente a Segunda División, en la que militó hasta el 23 de enero del 2009 cuando, debido a irregularidades con la inscripción de jugadores, fue descendido a la Liga amateur del fútbol costarricense o Primera División de LINAFA, en la que militó desde entonces, hasta su desaparición definitiva en 2014.