En la Era Terciaria o Cenozoico (vida moderna), desde hace quizá 65 millones de años, se registraron grandes y notables transformaciones que tuvieron su origen en una intensa actividad orogénica, en la presencia de una señalada actividad volcánica, en la realización de enormes dislocaciones que dieron lugar a la formación de fosas tectónicas y, finalmente, en el levantamiento de extensas áreas del relieve que determinaron, entre otras circunstancias, el retiro de las aguas de sus antiguos lechos; el Volcán de Colima cubrió de rocas grandes porciones de terrenos y llenó algunas profundidades (Cervantes, 1977).