A la muerte del adelantado Pedro Fernández de Lugo, la Real Audiencia de Santo Domingo lo nombró gobernador interino de Santa Marta, quien tomó posesión del territorio en 1539, cuando Gonzalo Jiménez de Quesada se había ausentado a España para dilucidar la gobernación de Bogotá con Nicolás Federman y Sebastián de Belalcázar.