Uxue Barkos fue nombrada, a finales de 2006, candidata de Nafarroa Bai a la alcaldía de Pamplona en las , obteniendo 28.581 votos (26,26%), que se tradujeron en 8 concejales en un ayuntamiento de 27 (con 13 para UPN, 4 para el PSN-PSOE, y 2 para ANV).