En cuanto a la hidrología superficial, el Cerro del Muerto presenta 15 cuerpos de agua, los cuales consisten en pequeños bordos de abrevadero, así como escurrimientos temporales principales, ya que las características orográficas y edafológicas de la zona no permiten la existencia de cuerpos de agua lóticos permanentes, sino únicamente arroyos en época de lluvias.