A comienzos de la década de 1780 comenzó a escribir su "Descripción histórico-geográfica del Reino de Chile", para lo que recurrió a material que se conservaba en los cabildos y algunos cronistas de períodos anteriores, tarea que no fue fácil debido a su enemistad con O'Higgins, quien le negó repetidas veces el permiso para viajar con el fin de investigar en los archivos.