Un año después, en 1999, es contratado como asistente técnico del portugués Guillerme Fariña, técnico de la Liga Deportiva Alajuelense, cuadro con el que participa en varios torneos, entre ellos, la Copa Merconorte 2000, UNCAF y el Campeonato Nacional, donde logra su primer y único título en la temporada 1999 – 2000.