En la Liga Premier, Irapuato pasó por 2 semestres intentando llegar a la liguilla sin éxito alguno, pero en el Apertura 2016 consiguió llegar a la gran final enfrentándose al club Coyotes de Tlaxcala, donde la ida se jugó en el Estadio Sergio Leon Chavez que registró una gran entrada, recordando los tiempos de oro del Irapuato.