Actualmente el Rector de la UNAN-León es el ex alcalde leonés Rigoberto Sampson desde el [[2006]] y el de la UNAN-Managua, desde [[1994]], el Máster Francisco Guzmán Pasos, el mismo que fue liberado junto con otros 49 presos políticos por la toma del Palacio Nacional (actual [[Palacio de la Cultura (Managua)|Palacio de la Cultura]]) – encabezada por [[Edén Pastora]] y otros 24 guerrilleros – del [[22 de agosto|22]] al [[24 de agosto]] de [[1978]], quien ha durado más tiempo en el cargo desde hace 14 años.