Se cree que el ágora, los almacenes y la cripta forman un conjunto cuya funcionalidad no está clara: una hipótesis, defendida por Henri Van Effenterre, apunta a que fuese la sede de un poder diferente al real que residiría en el palacio, tal vez un consejo de sabios mientras la explanada podría acoger a la asamblea del pueblo; otra, sugerida por Alexiou, atribuye al ágora una función comercial; otra, señalada por Nikolaos Platon, opina que el conjunto podría tener una función atlética.