Aprilia se fijó en él para que pasara a ser su piloto de pruebas de 250cc y Debón abandonó temporalmente la competición para centrarse en el desarrollo de las nuevas motos de competición de Aprilia aunque eso no le impidió que Aprilia le permitiera competir en 5 carreras de la temporada 2006 en el equipo oficial de Aprilia, el Fortuna Aprilia con Jorge Lorenzo como compañero de equipo consiguiendo 50 puntos lo que le valió para finalizar en 13º posición el campeonato.