Durante el periodo que fue desde el final de la Primera Guerra Mundial a la Segunda sufre lo que se llamó los «años del yoyo», pues suma promociones y descensos continuos, aunque eso no le impide que se consolide la estructura administrativa.En la temporada 1923/24 es elegido Henry Rehder como presidente, se desvincula definitivamente del Hamburg St.Pauli Turnverein y se convierte en un club de fútbol independiente.