En el torneo local consiguió el subcamponato del Torneo Apertura, gracias a lo cual volvió a clasificar a la Copa Merconorte 1999, inscribiendo además a dos de sus goleadores en el Top 10, Berthy Suárez con 22 goles y José Luis Ortiz con 13, siendo ese año el equipo más goleador de la temporada con 73 goles marcados.