Durante la Guerra de Abjasia, el Gobierno de la República Autónoma de Abjasia se llamaba "Consejo de Ministros de Abjasia" y dejó Abjasia después de que las fuerzas separatistas tomaran el control de Sujumi y su región el 27 de septiembre de 1993, después de fieros combates, ocurriendo la Masacre de Sujumi, en la que numerosos miembros del Gobierno abjasio de esos momentos, incluido a su presidente Zhiuli Shartava, fueron ejecutados por los paramilitares independentistas prorrusos.