El otro ramal principal, llamado Atajo Cimarrón o Travesía del Cimarrón o Travesía Media (en inglés : "Cimarron Cutoff" o "Cimarron Crossing" o "Middle Crossing") cortaba al suroeste a través del desierto Cimarrón (también conocido como el Waterscrape o "La Jornada") hasta el valle del río Cimarrón cerca de la ciudad de Ulysses y Elkhart luego continuaba hacia Boise City (Oklahoma), hasta Clayton, Nuevo México, uniéndose con el ramal del norte en Fort Union.