En el año 2002 volvió a jugar en el Bochum hasta 2004, y en enero de 2005 fichó por el Stoke City, un club inglés con historia de jugadores y entrenadores islandeses, entre los que se encontraban el hermano más joven de Guðjónsson, Bjarni Guðjónsson, y su padre, Guðjón Þórðarsson.