En tanto, en su primera participación por la Copa Sudamericana, Universidad de Chile jugó la edición de 2005 ubicándose en la sección 3 correspondiente a equipos chilenos y peruanos: la «U» tuvo que eliminarse con Universidad Católica, perdiendo por 1-2 como local, y aunque ganó 1-0 como visitante, quedó fuera de la competencia debido a la regla del gol de visitante.