La Universidad Javeriana tiene 179 grupos de investigación registrados en Colciencias de los cuales 99 han sido escalafonados de acuerdo con su productividad, lo que convierte a esta institution en una de las cinco universidades del país con el mayor número de grupos de investigación reconocidos por Colciencias y la más destacada de las privadas en este campo junto a la Universidad de los Andes.