Los asuntos de competencias conquistadoras no marchaban bien entre Almagro y los Pizarro; las reclamaciones y los enfrentamientos verbales entre ambos caudillos eran frecuentes, y a esto ahora se sumaba que estando Francisco Pizarro en la tarea de organizar la recién fundada ciudad de Lima, el 6 de mayo de 1536, miles de indígenas a los órdenes de Manco Inca rodeaban el Cuzco, lo atacaban e incendiaban la ciudad, aprovechando las disensiones entre almagristas y pizarristas..