La Subdelegación de Pisagua se dividía a su vez en tres distritos: "Mar" (1.º), que correspondía al sector urbano y la zona norte; "Pichalo" (2.º), la parte sur de la ciudad y el sector de la península del mismo nombre; y, "Junín" (3.º), todo la zona sur de la Subdelegación, incluyendo Caleta Junín.