La futura Variante sur ferroviaria de mercancías de Bilbao implicará la supresión de la mayoría de trenes de mercancías por esta línea pudiendo mejorar frecuencias, aunque no se prevé que la línea se adapte completamente a trenes de pasajeros ya que la línea se seguirá utilizando para algunos trenes de mercancías con origen/destino ArcelorMittal Sestao y como trazado alternativo en caso de problemas en la mencionada variante.