Otro presidente destacado en la historia de Botafogo fue Emil Pinheiro, quien asumió el manejo del fútbol de la institución a fines de los años 1980, período en el que se encontraba en una fuerte decadencia, y bajo cuya administración conquistó el Campeonato Carioca en 1989 y 1990, además de alcanzar la final del Campeonato Brasileño en 1992, mismo año en el que renunció al cargo.