El debut de Marco Fabián en la Bundesliga se dio el 24 de enero de 2016, en un juego contra el VfL Wolfsburgo en la Jornada 18, entró de cambio al iniciar la segunda parte, ya que después de 45 minutos el Eintracht Frankfurt perdía 0-1, en el último minuto Fabián genero le jugada que derivo en un gol de Alexander Meier dándole la victoria de 3-2 al Eintracht Frankfurt.