Desde el Gobierno, Eguzquiza propugnó la pacificación política del país, con la participación en el gobierno de hombres de las diversas corrientes políticas; se crearon varias localidades (Ayolas, Irala y Hernandarias); se creó la Escuela Normal de Maestros y de Maestras; se creó la Caja de Conversión; la Guardia Nacional; se reabrió la Facultad de Medicina; etc.