El 26 de octubre, diez años después de su primera participación, Santos aseguró su lugar en la Copa Libertadores 2014, en donde en fase de grupos tuvo uno de los mejores rendimientos, ganando 4 partidos, empatando 1 y perdiendo 1; entre ellos una victoria histórica en el Estadio Centenario por 0-2 jugando contra Peñarol, más tarde fue eliminado en octavos de final por el Club Atlético Lanús de Argentina.