Revvió su interés en una estrategia de negociación más amplia y esto ocasionó diferencias con McTavish; él pensaba que el comercio debía de gestionarse a través de la Bahía de Hudson y la costa del Pacífico y eso no beneficiaría a Montreal, donde se centraban los intereses de McTavish.Tras expirar el 30 de noviembre de 1799 su asociación, Mackenzie partió repentinamente para Inglaterra.