Tomayate sobresale entre la mayoría de yacimientos pleistocénicos centroamericanos por ser más antiguo y mucho más rico, por lo cual brinda información valiosa sobre el gran intercambio faunístico americano, en el cual el istmo centroamericano jugó el papel principal.A la vez, es considerado el sitio paleontológico de vertebrados más rico de Centroamérica y una de las mayores acumulaciones de proboscidios en América.Otros yacimientos de proboscidios en el continente comparables en riqueza al Tomayate son Águas do Araxá en Brasil, Tarija en Bolivia y el Parque Nacional de Mammoth Cave en Estados Unidos.