Posteriormente, el "Informe Gerstein" se utilizó sin problemas como prueba de cargo en el llamado "Juicio de los doctores" de Nüremberg (1946-1947), en el que el antiguo jefe de Gerstein en el Instituto de Higiene de las SS, Joachim Mrugowsky fue condenado a muerte; en el juicio contra los directivos de la IG Farben (1947-1948), seguido, como el anterior, por las autoridades de ocupación estadounidenses en Nüremberg; en el juicio contra los dirigentes del campo de exterminio de Belzec (Múnich, 1963) y en el juicio a Adolf Eichmann(Jerusalén, 1961).,