Tras tres años en el orfanato Kabuto aprende a usar Ninjutsu Médico gracias a Nono; teniendo estas habilidades la uso para curar varios ninjas de Konoha y obtener dinero para el orfanato, entre los shinobi estaba Orochimaru, quien le ofrece ser un ninja, Kabuto, rechaza su oferta diciendo que no está interesado.