Tiene que enfrentarse en el cargo tanto a los problemas de moral y motines de la soldadesca como a sucesivos ataques de indios y franceses, contra los que libra combates en el Fuerte de San Mateo, que termina siendo saqueado por los franceses con gran facilidad, ya que fueron ayudados por los amerindios y solo se encontraron con la resistencia del capitán y siete soldados españoles (de los 120 que había en el fuerte), lo que produce una queja de Alas contra sus soldados.