Por medio de un golpe militar en la noche del 2 y la madrugada del 3 de febrero de 1989, el general de división y consuegro de Stroessner, Andrés Rodríguez, derrocó a aquel obligándolo a renunciar y a partir del país en carácter de exiliado al Brasil, donde vivió el resto de su vida hasta su fallecimiento ocurrido el 16 de agosto de 2006.