El cadáver de Fernando de la Cerda recibió sepultura en el desaparecido convento de San Pablo de Burgos, de la Orden de los dominicos, según constaba en el libro becerro de dicho cenobio, y en el mismo convento recibieron sepultura su hijo mayor y heredero, Juan Núñez III de Lara, y casi con toda seguridad su suegro Juan Núñez I de Lara, que falleció en la ciudad de Córdoba en el año 1294.