A diferencias de aviones militares biplazas anteriores, como el F-14 Tomcat y las variantes navales del F-4 Phantom II, en los que el tripulante trasero carecía de controles de vuelo, el asiento trasero de la cabina del "F-15E" está equipada con su propia palanca de control y mando de aceleración para que el WSO puede realizar la labor de pilotaje, aunque con visibilidad reducida.