El istmo se caracterizó por una fuerte tendencia al autonomismo, como antecedente temprano se tiene la oposición tenaz por parte de su clase política, frente la adopción de la constitución boliviana que se pretendía implantar en la Gran Colombia, a pesar de todas las gestiones del enviado especial por Simón Bolívar y de la presión que ejercieron el intendente y jefe militar en el istmo.