El 19 de julio de 1972, cuando fue ocupada por el ejército la Universidad de El Salvador, Arias Gómez fue exiliado a Costa Rica junto con otras importantes figuras, como Rafael Menjívar Larín, rector de la UES; Miguel Sáenz Varela, secretario general; Luis Arévalo, fiscal, e intelectuales y académicos como Gabriel Gallegos Valdés, Melitón Barba, Ivo Príamo Alvarenga, Mario Flores Macall, el ex rector Fabio Castillo Figueroa, José Alfredo Pineda Dubón y el antropólogo David Luna, entre otros.