Los seis principales institutos de la UAEH están ubicados en los municipios de: Pachuca de Soto, Tulancingo de Bravo, Mineral del Monte, San Agustín Tlaxiaca y Mineral de la Reforma; cuenta con nueve Escuelas Superiores en Actopan, Apan, Atotonilco de Tula, Ciudad Sahagún, Huejutla de Reyes, Tepeji del Rio, Tizayuca, Tlahuelilpan, y Zimapán; y dos campus en Tlaxcoapan e Ixtlahuaco en Lolotla.