En humanos se han descrito tres variantes alélicas principales: CYP2C9*1 correspondiente al alelo wild type con una actividad enzimática del 100%, CYP2C9*2: Arg144Cys, 430 C>T, localizado en el exón 3, con una frecuencia del 17% en población caucásica y produciendo una disminución de la actividad del citocromo P450 oxidorreductasa debido a una menor interacción con el cofactor y CYP2C9*3: Ile359Leu,1075 A>C localizado en el exón 7, con una frecuencia del 6% en población caucásica y produciendo una disminución de la actividad enzimática por variaciones en el sitio de unión al sustrato.