Lo que hoy es el pueblo de Santa Catarina fue fundado como una misión destinada a evengalizar a los indígenas pames sin embargo la fecha de su fundación es difícil de precisar históricamente, se considera que en realidad fue fundada en tres ocasiones diferentes y trasladada de un lugar hacia otro, estas fundaciones fueron las siguientes, la primera ocurrió el 2 de enero de 1606 cuando el capitán Gabriel Ortiz de Fuenmayor concedió a los indígenas de Santa Catarina el establecimiento de su población y derechos como andar a caballo o portar armas, la segunda fundación ocurrió en 1607 por fray Juan de Cárdenas y finalmente la actual en el lugar que permanece hasta el día de hoy realizada en 1617 por fray Juan Bautista de Mollinedo.