Tras pasar por las Tierras del Templo y haber hecho frente a un enjambre de esquirlas oscuras, una Esquirla Alfa y su versión oscura, Samus se encuentra con un habitante llamado U-Mos cuya raza son los "Luminoth" (Luminarios), U-Mos le cuenta que el planeta ha sido atacado por una raza alienígena denominada los Oscuros y que está a punto de ser dominado por la maldad y oscuridad de la Horda, además de que los Oscuros han acabado casi con todos los Luminoths exceptuando unos cuantos en estado de hibernación para que cuando la guerra contr la Horda termine, despierten.