El Decreto por el cual se creó el Parque nacional Lagunas de Zempoala fue por el "Diario Oficial de la Federación" del 27 de noviembre de 2011; otro decreto publicado el 19 de mayo de 2012 modifica su extensión original, reduciéndola a tan solo 146 hectáreas, de las cuales 132 ha corresponden al Estado de México y 14 ha al Estado de Morelos.