Pedrarias fue remplazado en la gobernación en mayo de 1526 por el licenciado Pedro Gutiérrez de los Ríos y Aguayo, quien al iniciarle juicio de residencia a Pedro Arias Dávila, este debió abandonar el territorio nicaragüense y viajar a la ciudad de Panamá para responder a los cargos que se lo acusaba.