La gran mayoría de los juegos de Super Robot Wars aprovechan la inserción de personajes originales, los cuales pueden ser nombrados a placer por el jugador, además de un robot que ha de pilotar, luego este personaje y su robot hacen las veces de hilo conductor con respecto a los eventos de los anime que aparecen en los juegos, todo mientras se modifica la historia y las fuerzas enemigas, conectadas de alguna manera con los personajes originales, enlazándolo todo perfectamente.