Tras 16 días de travesía de los emigrados a bordo de la Goleta Izalco, tocan el Puerto de Puntarenas; la mayoría de exiliados buscó el asilo en Costa Rica; Morazán tenía por destino la ciudad de David, Panamá donde se encontraba su esposa; con objeto de facilitar la obtención del asilo de estos, Morazán le envía un comunicado al Gobierno costarricense en el cual solicitaba el asilo para los exiliados que le acompañaban, o el simple permiso para cruzar y tomar otro barco en el Mar Caribe, el día 24 de abril de 1840 el gobierno de Costa Rica concede de manera discrecional el asilo; entre los que se quedan en Costa Rica figura Gerardo Barrios, quien se separa así de su maestro por corto tiempo, para luego volverse a encontrar.