A partir de 2002, se conformaron órganos consultivos para avanzar en el proceso de normalización (Consejos Consultivos en las Facultades y Consejo Superior Provisorio), cuya actividad finalizó en diciembre de 2012, ocasión en la que se constituyó la primera Asamblea Universitaria de la Universidad con motivo de la elección del Rector y Vicerrector mediante el voto de los Decanos y de los representantes de los claustros, quienes previamente habían sido elegidos en cada Facultad.