Sin embargo, la sucesión no fue pacífica, pues Juan I de Castilla asumió el título de rey de Portugal por derecho de sus esposa y emprendió una intervención militar en Portugal, a lo que se añadía una oposición a la regencia y el temor de la integración de Portugal en Castilla, pues se generó una rebelión popular que dio lugar a una guerra civil, en la que el gran maestre de la Orden de Avís y hermano bastardo de Fernando, Juan, fue aclamado como "defensor del reino", y en 1385, el primer rey de la Dinastía de Avís.