En el año 2015, Francisco Santos fue candidato a la Alcaldía Mayor de Bogotá por el Partido Centro Democrático, aunque no ganó, logró consolidar a su partido en la ciudad de Bogotá al obtener una bancada de 6 Concejales elegidos para el periodo 2016-2019, convirtiendo al Centro Democrático en la segunda fuerza política en Bogotá y cuya bancada apoya a su aliado político el alcalde Enrique Peñalosa, teniendo así gran influencia sobre la política capitalina donde busca el apoyo del electorado para su hijo Gabriel Santos García quien aspira a ocupar un escaño en la Camara de Representantes de Colombia representanto la ciudad de Bogotá.