Durante la decena trágica, como coronel maderista recibió la orden de repartir víveres entre la población ante la caótica situación y cuando Madero fue finalmente asesinado, Huerta ordenó la aprehensión de diputados maderistas y Jara tuvo que esconderse en la casa del zapatista Antonio Sala y posteriormente se dirigió a Xalapa para organizar la lucha contra Huerta.