Entre los elaboradores de este plato existe una polémica acerca de la colocación del bacalao en la bandeja para su cocción, existen aquellos que dicen primero el bacalao con la "piel para arriba" (cinco minutos) y luego se da la vuelta y se hace el pil pil, otros por el contrario mencionan que el bacalao debe estar con la "piel para abajo" en las primeras fases y el ‘pil pil’ se hace posteriormente con la piel hacia arriba.