Miembro de una familia de artistas de ascendencia flamenca, probablemente de la ciudad de Bois-le-Duc, dedicada a la talla y el ensamblaje, fue hijo del maestro Mateo de Bolduque, fundador de la dinastía, y de Juana Muñoz, y recibió el bautismo en la iglesia de Santa Cruz de su villa natal el 13 de julio.