De nuevo en Segunda División, el Celaya participó con poca fortuna en los torneos del circuito de ascenso durante la década de los 60´s hasta desaparecer en 1970, pocos años después la ciudad de las cajetas volvió a tener fútbol y por partida doble con el Celaya (campeón de Tercera División en 1973-74) y el Tecnológico de Celaya, los inolvidables "Linces" pero mientras este fue subcampeón en 1975-76 perdiendo con San Luis Potosí, el otro descendió a Tercera División en 1976-77.