Hacia 1544 se había erigido la parroquia de Nicoya —siendo la más antigua establecida por los españoles en el actual territorio costarricense— dedicada a san Blas, y finalmente en 1554, el territorio fue separado y convertido en la alcaldía mayor de Nicoya que al ser restauradas las gobernaciones pasó a la provincia de Costa Rica en 1573 hasta que en el año 1786 se la reincorporaría a la provincia de Nicaragua.