En un origen, la operadora ferroviaria heredó el modelo de gestión de las Unidades de Negocio (UN) de la antigua RENFE, haciéndose cargo de aquellas que puramente afectaban a la explotación de los servicios de transporte, es decir: "Cercanías", "Regionales", "Grandes Líneas", "Alta Velocidad", "Mercancías" y "Mantenimiento Integral de Trenes".