A lo largo de la historia el lago Budi se fue esculpiendo por constantes aumentos de mar y de las mareas; como consecuencia del terremoto de Valdivia de 1960, amplias zonas de baja altitud que eran usadas para la agricultura cercanas a la isla Huapi (que no es propiamente una isla, sino el frente de tierra que separa al lago del mar) se vieron inundadas y desde entonces se encuentran a 3 metros de profundidad.