También en Sevilla proyecta la Iglesia de Santa Isabel, cuyas obras comienzan bajo su dirección en 1602, siendo suya su bella portada en piedra que presenta la puerta de entrada flanqueada entre dos parejas de columnas acanaladas con hornacinas en dos alturas entre ellas, cuyo claro sentido manierista se reafirma en las altas pirámides que rematan el cuerpo superior.