El municipio se encuentra en el Eje Neovolcánico Transversal, en la subprovincia Lagos y volcanes de Anáhuac, dentro de tres regiones morfológicas: planicie lacustre en la zona poniente del municipio, lomeríos y piedemontes de colinas redondeadas en los cerros Chimalhuache y El Pino y la Sierra de Santa Catarina en el volcán La Caldera.