Alentado por su joven esposa María Antonia de Nápoles, con quien había contraído matrimonio en 1802 cuando contaba dieciocho años de edad, el príncipe Fernando se enfrentó a Manuel Godoy y a su madre, la reina María Luisa, con quien la princesa María Antonia mantenía una mala relación personal —la animadversión era mutua; María Luisa le escribió a Godoy: «¿Qué haremos con esa diabólica sierpe de mi nuera y marrajo cobarde de mi hijo?»—.