En 1998 la compañía sufrió graves polémicas que hicieron peligrar su estabilidad, a consecuencia de las cuales su directora, Arancha Argüelles, presentó la dimisión, siendo relevada por Patsy Kuppe-Matt, que apostó por que la compañía contara con un repertorio propio y rechazando los costosos montajes clásicos.