Durante la guerra de Bosnia (1992-1995), Žepa se convirtió en uno de los tres enclaves bosnios en Bosnia Oriental, rodeados por la República Serbia, junto con Srebrenica a poca distancia aguas abajo, y Goražde más lejos río arriba, después de que otras ciudades como Foča, Bratunac y Zvornik sufrieran la limpieza étnica.