La vegetación del municipio de Coneto de Comonfort es diversa, existen hacia el centro y noroeste del territorio importantes extensiones de bosque en donde abundan coníferas y encino, ubicado en las zonas altas de la serranía, en las zonas más bajas del centro y sur se encuentra pastizal, y en pequeñas zonas del norte y el este se puede localizar matorral, en las zonas donde se inicia el Bolsón de Mapimí.