Banderas se incorporó al Cuerpo de Ejército del Norte, a las órdenes del general Villa, porque concebía una estrategia nacional para el desarrollo de la guerra contra los carrancistas,a diferencia de la visión localista del zapatismo; por su desacuerdo con la forma zapatista de hacer la guerra, relativo al carácter miliciano, no profesional y a la disciplina en el ejército; por los problemas personales que tuvo con el general Antonio Barona; pero fue determinante en su decisión de separarse del Ejército Libertador, que Zapata y sus generales no hicieran su mayor esfuerzo por concentrar al grueso de sus fuerzas, para cortar las líneas ferroviarias que abastecían a Obregón, de los hombres y pertrechos militares, enviados de Veracruz, con los que el sonorense logró vencer a Villa en las Batallas del Bajío.