Para las elecciones generales de noviembre de 2004, Rubén obtuvo poco más de 54,000 votos para el cargo de gobernador de Puerto Rico, debido en parte a la campaña de grupos como el Movimiento Independentista Nacional Hostosiano que aunque llevan el nombre "independentista" hicieron campaña a favor de Aníbal Acevedo Vilá del Partido Popular Democrático, defensor del actual estatus.