A través de un acuerdo del 17 de mayo de 1991 entre las autoridades de la Provincia Franciscana del Santo Evangelio de México y la UDLAP comienza el proyecto de esta biblioteca y del Centro de Documentación Franciscana con el objetivo inicial de reunir, catalogar, conservar y poner al alcance de los investigadores los acervos bibliográficos de seis conventos franciscanos de la zona centro–sur de México: Santa Úrsula Coapa y San Juan Bautista Coyoacán en el DF; San Andrés Calpan, San Francisco y San Gabriel Cholula, de Puebla; y San José de Gracia de Orizaba, Veracruz.