En este juego es posible ver secciones ya aparecidas en otros juegos de la trama, aunque de forma diferente: las catacumbas de la Sub 2 están semiderruidas; reaparece el bucle de la Sub 3, pero en esta ocasión no es posible pasar de nivel y solo permite moversa a derecha e izquierda; en la sala del trasportador del labo de la Sub 4 se puede ver que hay detrás de la segunda verja, como quizás más secciones del barco; muestra que la Sub 5 se encuentra al lado de la Sub Zero, y que el cielo azul de esta última era un decorado; todas las entradas a las cañerías de la Sub 6 y el transportador están en perfecto estado; una ubicación con ruinas griegas que será el punto de partida de la Sub 7; y una sala acolchada en reminiscencia a la Sub FLF.