Aunque la clasificación más aceptada de los grandes grupos de mamíferos es la tradicional, que apoya la teoría de la proximidad entre los mamíferos placentarios (Eutheria) y los marsupiales (Metatheria), existen algunos estudios basados en la secuencia molecular del ADN de distintas especies de mamíferos, que sugieren que los monotremas (Prototheria)) y los marsupiales puedan estar más próximos entre ellos, formando un macro-grupo que divergió de los placentarios hace aproximadamente 130 millones de años.