Primero firmado por los Bravos de Boston, antes de la temporada de 1940, Spahn hizo su debut en las Grandes Ligas con los "Boston Braves" en 1942, pero sólo vio acción en cuatro ocasiones por decisión técnica, permitiendo quince carreras (diez limpias) en 15 innings y dos tercios, cuando a la edad de 20 años, se enfrentó con el mánager Casey Stengel, quién lo envío a las Ligas Menores, después de que se negó a lanzar al bateador de los Dodgers de Brooklyn Pee Wee Reese en un juego de exhibición.