Al final del juego, un Link, recuperado por su descanso de 100 años y fortalecido con sus recuerdos y la Espada Maestra, decide enfrentar a Ganon, quien se libera del huevo donde permaneció luchando contra Zelda todo este tiempo, a lo cual la princesa por medio de sus poderes telequinéticos, le entrega al Héroe de Hyrule, el arco de la Luz, con el cual debe vencer al Cataclismo, ahora transformado en una bestia gigantesca, conformada por maldad pura y euforia de destrucción.