Tras la Independencia de Centroamérica según el Decreto del 11 de octubre de 1825 del Estado de Guatemala, el poblado fue designado como sede del Circuito del mismo nombre, en el Distrito N.º 11 (Suchitepéquez) para la impartición de justicia; junto a Atitlán estaban en ese distrito Tolimán, San Marcos, San Pedro La Laguna, Santa Clara, la Visitación, San Pablo, San Miguelito, San Juan de los Leprosos y Santa Bárbara de La Costilla y La Grande.