La CIA ha sido y es objeto de muchas críticas en relación a sus fallos en seguridad y contrainteligencia, sus errores en los análisis de datos, "problemas" de derechos humanos, investigaciones externas y desclasificación de documentos comprometedores, intentar influir en la opinión pública mediante la propaganda y los medios de comunicación, el tráfico de drogas y mentir al Congreso.