Louis Rams, donde para la temporada 1999 se convirtió en quarterback titular al lesionarse Trent Green, ese año Warner pasó para 41 touchdowns y 4,353 yardas, lo que le valió que lo distinguieran como el jugador más valioso de la NFL (NFL MVP), también ganó el jugador más valioso del Super Bowl XXXIV, al derrotar a los Tennessee Titans 23-16, en ese juego rompió el record de más yardas en un Super Bowl con 414 y 2 touchdowns.