Sin embargo, la aplicación de la PAC exhacerbó el conflicto político con Francia que se negó a aceptar que la economía de su país quedara en manos de un Consejo, que a partir de enero de 1966, se manejaría a través de la regla de las mayorías, en lugar del sistema de unanimidad, lo que imponía un límite a la soberanía del poder político francés sobre ciertas decisiones económicas nacionales.