Los pingüinos juanito tienen una alimentación oportunista, y alrededor de las islas Malvinas se sabe que han ingerido aproximadamente igual proporción de peces ("Patagonotothen" sp., "Thysanopsetta naresi", "Micromesistius australis"), crustáceos, ("Munida gregaria") y calamares ("Loligo gahi", "Gonatus antarcticus", "Moroteuthis ingens").