Las elecciones fueron muy controvertidas, pues aunque se declaró oficialmente ganador a Roberto Madrazo, Andrés Manuel López Obrador no aceptó los resultados, denunció un fraude electoral y sobre todo el uso de recursos millonarios que superaban los topes de gastos de campaña por Roberto Madrazo, encabezó protestas y una marcha a la Ciudad de México, sin poder cambiar los resultados electorales.