En respuesta a este desafío, a partir de 1996, la FIMPES desarrolló su propio proceso de acreditación institucional que, de manera similar al existente en el sistema de educación superior de países como Estados Unidos, se basa en una serie de criterios de calidad, el desarrollo de un auto-estudio institucional que evalúa el grado de cumplimiento de tales criterios y, finalmente, la visita de un grupo de pares de otras instituciones miembros que elaboran un Reporte con recomendaciones las cuales, una vez atendidas por la institución, le hacen merecedora de obtener la Acreditación por un periodo definido de tiempo.