A pesar de que el parque en su mayor parte es marítimo, la parte terrestre alberga anfibios, reptiles, aves y mamíferos para un total de 136 especies, de las cuales destacan las tortugas dulceacuícolas ("geomyda areolata"), el cocodrilo ("crocodylus acutus"), pelícanos ("pelecanus occidentalis"), fragatas ("fregata magnificens"), murciélago ("mycronycteris megalotis mexicana"), zorra gris ("urocyon cinereoargenteus"), mapache enano ("procyon pygmaeus"), etc.