La posición geográfica de Yonán determina su clima cuya altitud influye en la cantidad de energía solar, en la inclinación de los rayos solares que inciden sobre el lugar durante el día y la noche e diferentes épocas del año dando lugar a que éste sea cálido, temblado con diferenciales de temperatura cuyo promedio puede establecerse en 24°C oscilando entre 35°C durante la noche; observa ausencia de lluvias salvo en períodos ocasionales por el fenómeno de El Niño, presentándose chaparrones que causan daños por falta de previsión.