En el tramo navegable, durante la época de sequía, aparecen algunas dificultades para la navegación, como los bancos de arena de Xingu-Açu (km 155), Mouro (km 163) o Juncal (km 170), la barrera de Vermelha (km 192), y algunas rocas como la Canazedo y Rendenção, cerca de Vitoria do Xingu.