En 1997 el FrePaSo integra el frente electoral “Alianza”, encabezado por la UCR, que llevaría a Álvarez a la vicepresidencia del país tras las elecciones de 1999, acompañando la postulación presidencial de Fernando De La Rúa, fórmula que triunfó con más del 48% de los votos frente al binomio justicialista Duhalde-Ortega.