En cuanto a la enseñanza secundaria, existen en el departamento 12 liceos públicos (5 en la ciudad de Artigas y 2 en Bella Unión) y un liceo privado ubicado en la capital departamental; atienden a algo más de 6.600 estudiantes, 3.800 a ciclo básico, 2.800 a bachillerato y 130 a liceos rurales.