En 1999 Moscoso se postuló nuevamente, y sale victoriosa con el 42% de los votos para presidente, a pesar de la división entre las facciones panameñistas conservadores (Arnulfista y Molirena) y facciones panameñistas no alineadas ("saltamontes"), neo-civilistas (Renovación Civilista) y los demócratas cristianos cuyo candidato era el panameñista Alberto Vallarino.