La conquista española del nuevo mundo también dejó su marca indeleble en ésta región con el establecimiento de una Congregación de nativos que habitaron en la zona, de esta manera la Congregación de Nativos de San Miguel Uriangato fue fundada en 1549 con el objetivo de mejorar la calidad de vida de los indígenas por Fray Diego de Chávez, un informe de 1571 menciona que Uriangato tenía 45 habitantes.