Una de la reformas más importantes fue la de 1999, ya que se elevó el techo competencial al nivel de las Comunidades Autónomas conocidas como "históricas", entre las que destaca la gestión de la Sanidad y la Enseñanza, se otorgó al presidente de la Junta de Extremadura la facultad de disolver la Asamblea de Extremadura y la posibilidad de crear órganos como del Defensor del Pueblo Extremeño y un Tribunal de Cuentas Extremeño.