No obstante, el sistema político se mantuvo estable hasta fines de 1954, cuando estalló un inesperado enfrentamiento con la Iglesia Católica, durante el cual Perón y sus partidarios se lanzaron a romper todas las relaciones del Estado con ésta y limitaron los derechos civiles de clérigos y feligreses; se sancionó una ley de divorcio, se habilitaron los prostíbulos y se prohibió la enseñanza de la materia "religión" en las escuelas públicas, que hasta entonces había sido obligatoria.