Entre sus reconocimientos internacionales están el haber sido elegido por la Federación Internacional de Historia y Estadística de Fútbol como el "Club Mundial del Mes" (junio de 2002) y como el mejor equipo peruano del siglo XX.Asimismo, la encuesta de fútbol de América y Europa del Diario El País de Uruguay, catalogó a la «U» como el mejor equipo del Perú de las temporadas 2005 y 2007.