Los orígenes de lo que hoy es el pueblo de Santa Cruz se remontan a 1637 cuando el conquistador Pedro de Perea entró en la región, acompañándolo se encontraba el también conquistador Juan Munguía Villela, quien descubrió varias vetas minerales en la zona y dedicado a la explotación de las mismas y la agricultura se convirtió en el primer poblador de la zona; sin embargo, el verdadera asentamiento poblacional se dio hasta el año de 1775 cuando el inspector general de presidios militares de la corona española, el capitán Hugo de O'Connor, ordenó que se estableciera en ese punto el presidio militar de Terrenate de donde se desarrolló la actual población.