Coliqueo y Baigorria entraron en negociaciones con el federal Justo José de Urquiza ―presidente de la Confederación Argentina― y se sumaron a su ejército de la confederación, combatiendo y venciendo en la Batalla de Cepeda el 23 de octubre de 1859, en el sur de la provincia de Santa Fe (cerca del límite con la provincia de Buenos Aires), a cambio de que el nuevo gobierno diera tierras para la tribu de Coliqueo.