Cabe mencionar, no obstante, que en el terremoto de Valparaíso de 1906 resultó destruida la por entonces sede de Wanderers, perdiéndose gran parte de la documentación del club, así como varios trofeos ganados por la institución Entre los que pudieron ser salvados se encuentra la Challenger Cup de la Football Association of Chile de 1899, galardón que aún se conserva en la sede del club.