Ya desde la jefatura suprema del Guayas reorganizó la administración pública del departamento, rebajó los derechos portuarios y de anclaje para favorecer el comercio, abolió el tributo de los indígenas en el Guayas y suprimió las doctrinas parroquiales, pues so pretexto de catequesis se perpetuaban como medios ideológicos la servidumbre indígena y la obediencia ciega a clérigos y hacendados.