A consecuencia de las muchas quejas y reclamos de los vecinos de Costa Rica, la Real Audiencia de Guatemala abrió un proceso en su contra por cargos de robo, estafa, cohecho, maltrato a los indígenas, rapto de mujeres y violación de correspondencia, y hubo de marchar a esa ciudad a defenderse, pero el juicio no parece haber dado resultado alguno, ya que se le reintegró a su cargo.