Para el torneo Verano 2001, Atlas inició derrotando a las Chivas en un muy entretenido Clásico Tapatio por 2-3, Atlas tuvo un torneo muy irregular en el cual gracias a sus 2 victorias en las últimas 2 fechas el equipo consiguió entrar al repechaje, era la primera vez que el Atlas no ingresaba a la liguilla de forma directa desde que eran dirigidos por Ricardo La Volpe.