Se postuló a la candidatura para las elecciones presidenciales bolivianas del 2002, quedando atrás de los candidatos Gonzalo Sánchez de Lozada y Evo Morales, este último también indígena y de la misma nacionalidad aymara que Quispe, que junto a él, además de los sectores de la ciudad satélite de El Alto, la Central Obrera Boliviana, indígenas, campesinos y mineros en general conformaron una insurreccción para derribar al gobierno de Sánchez de Lozada que pretendía exportar gas natural utilizando los puertos del vecino Chile a Estados Unidos (dos países a los que consideraba enemigos).