Además de contar con un extenso trabajo de investigación sobre la historia del pensamiento político y de los movimientos sociales en España, patente en obras como "La ideología liberal en la Ilustración española" o "Pensamiento político en España, siglos XIX y XX", Elorza ha pasado en los últimos años a centrarse en el estudio de los nacionalismos y los integrismos, plasmado, entre otras, en las siguientes obras: "Tras la huella de Sabino Arana: los orígenes totalitarios del nacionalismo vasco", "Umma: el integrismo en el islam" y "El nuevo terrorismo islamista".