En Coquimbo atraviesan dos rutas de importancia: la ruta 43 (que une La Serena y Ovalle) que dentro de la comuna se inicia en el sector de Tierras Blancas y termina en el sector de Las Cardas (límite sur de la Provincia de Elqui); y la ruta 5 Norte, la cual recorre de norte a sur la comuna, desde el límite con La Serena, en el sector de Peñuelas hasta el límite con la comuna de Ovalle por el sur, continuando luego su trayecto hacia Santiago (véase Ruta 5 Panamericana La Serena-Coquimbo y Autopista del Elqui).