De los 5.911 habitantes, Prairie du Chien estaba compuesto por el 93.55% blancos, el 4.53% eran afroamericanos, el 0.42% eran amerindios, el 0.34% eran asiáticos, el 0% eran isleños del Pacífico, el 0.27% eran de otras razas y el 0.88% pertenecían a dos o más razas.