En 2006 fue postulado candidato a Senador por la Alianza por México, que formaron su partido y el Partido Verde Ecologista de México, su compañera de fórmula, Ludivina Menchaca Castellanos fue postulada por este último partido, resultaron electos para el periodo de 2006 a 2012 obteniendo 143,389 votos, el 37.88% del total.