Cuando se conoció en 1987 que Estados Unidos vendió armas a Irán para financiar y entrenar a la Contra nicaragüense, pese a la prohibición del Congreso estadounidense, en lo que se conoce como el escándalo Irán-Contra, Weinberger fue acusado de esconder de los fiscales e investigadores del Congreso miles de páginas de sus notas manuscritas relacionadas con el escándalo.