De enérgico carácter, Juana supo rodearse de personas de confianza, muchas de ellas de origen portugués, que habían partido a Castilla en el séquito de su madre, la emperatriz Isabel, (como el futuro príncipe de Éboli, Ruy Gómez de Silva, el cual sería una de las figuras punteras del llamado "partido ebolista", junto a la infanta, una de las dos facciones dentro de la corte de Felipe II —por oposición al "partido albista" ligados a Fernando Álvarez de Toledo, duque de Alba— caracterizado por su tolerancia y conciliación, sobre todo en temas religiosos).