Por otra parte desde fines del diversas corrientes políticas e historiográficas han cuestionado su papel, asociándolo entre otras valoraciones con lo que algunas de esas corrientes y posturas denominan el Estado oligárquico previo a 1916 —año de elección del primer presidente por medio del voto secreto— y al aniquilamiento de miles de indígenas en la Patagonia, calificándolo de genocida.