La construcción está compuesta de un templo católico de estilo basílica, uno de los primeros templos cristianos construidos en América, y de unos claustros anexos, en los que actualmente se encuentra la biblioteca pública del municipio y junto a ella el museo de Zacatlán, que entre sus objetos están algunas pertenencias de Venustiano Carranza, quién falleció cerca de Zacatlán.