La ciudad de San Fernando de Apure cuenta con gran número universidades y escuelas, una de las primeras universidades fue la Universidad Simón Rodríguez, así como también la Universidad Experimental de los Llanos Occidentales Ezequiel Zamora (UNELLEZ), la Universidad Experimental de las Fuerzas Armadas (Unefa) en el Antiguo Centros de compras Pacheco, Núcleo Apure de la Universidad Bicentenaria de Aragua (UBA) y Centros de Extensión de la Universidad Santa María (USM) y Universidad José Antonio Páez (UJAP).