El Club Deportivo Marathón ha jugado 15 finales (Sin incluirse 1966, 1967, 1973 Subcampeón en Campeonato Regular y 1985 Campeón, no hubo final) De estas 15 finales, Marathón ha jugado 12 en el siglo XXI, ha ganado 6 y perdido 6: Ocho contra Olimpia de las cuales ha perdido cinco y ha ganado tres.