Pero fue posiblemente gracias a su condición de primo político de Manuel Godoy como llegó a ser Primer Secretario de Estado y del Despacho entre el 13 de diciembre de 1800 y el 19 de abril de 1808, y presidió por tanto el último gobierno del reinado de Carlos IV, y el primero del hijo de éste, Fernando VII, en quien su padre había abdicado en marzo del último año.