nglaura/hal-summarization huggingface dataset:
Face à la montée des enjeux environnementaux en élevage, les rejets des équins ont été évalués par l'INRA à partir d‟études de digestion et de métabolisme. Ainsi, l‟émission journalière de méthane entérique a été calculée pour les différentes catégories d‟équins, stades physiologiques et types d‟alimentation. Globalement, la part des équins dans les émissions totales de méthane entérique des animaux de ferme en France est seulement de 1,5% (en moyenne 20,7kg/al/an), contre 97% pour les ruminants. Les modèles de prévision des rejets azotés dans les fèces et l‟urine, établis chez le cheval de selle de 500kg à l‟entretien, utilisent l‟azote ingéré ou la matière sèche ingérée et la teneur en azote du régime comme variables prédictives (R²>0,80). L‟excrétion azotée totale est estimée à 38 unités d‟N/al/an. Enfin, les restitutions minérales varient de 30 à 70% des quantités ingérées selon l‟élément considéré, le type d‟animal, son état physiologique et les équilibres entre minéraux de la ration. Elles ne peuvent être prédites actuellement avec une précision satisfaisante. Environ 600 000 équins en France produisent du fumier, avec une moyenne de 12t/an pour un cheval de 500kg. Les procédés de valorisation de ce fumier doivent être mis en place rapidement, notamment en zones périurbaines où le nombre d‟équins augmente.

Faced with the rise of environmental issues in livestock farming, equine emissions were evaluated by INRA from studies of digestion and metabolism. Emissions of enteric methane were calculated for the different categories of equines in respect of their physiological status and for the main types of diets. Overall, equines contribute only to 1.5% of total emission of enteric methane in France (on average 20.7kg/al/yr) while ruminants contribute to 97%. Models of prediction of N excretion in feces and urine, established for a 500kg BW adult horse at maintenance, used N intake or DM intake and N content of diets as predictors (R²>0.80). Annual total N excretion would reach 38 N units/al. Mineral excretion varies from 30% to 70% of voluntary intake depending on the mineral considered, the type of animal, its physiological state and the balance between minerals in the diet. To date, excretion of the different types of minerals cannot be predicted accurately. About 600 000 horses produce manure in France, with an average of 12t/yr for a 500kg BW horse. Sustainable manure management needs to be implemented, especially in suburban areas where the number of horses is increasing
Une sélection divergente pour les troubles digestifs, R pour les animaux résistants et S pour les animaux sensibles, a été réalisée dans les lignées AGP39 et AGP59 du sélectionneur Hypharm. Un index de résistance aux troubles digestifs a été calculé à partir des mesures de fréquence de troubles digestifs réalisés en routine. Deux bandes successives (B1 et B2) de 178 animaux croisés, 89 R et 89 S, ont été produites respectivement par l’accouplement de mâles AGP39 R avec des femelles AGP59 R et l’accouplement de mâles AGP39 S avec des femelles AGP59 S. Dans chaque bande 62 animaux R (RI) et 62 animaux S (SI) ont été choisis pour une inoculation avec la souche LY265, E. Coli O103:H2:K-, rhamnose négative. Dans chaque bande, un lot RRI (très résistant n=31) a été constitué en retenant 31 animaux avec les valeurs d’index les plus fortes dans le lot RI, et un lot SSI très sensible, n=31) a été constitué en retenant 31 animaux avec les valeurs d’index les plus faibles dans le lot SI. La croissance et l'état sanitaire ont été suivis pendant 13 jours suivant l'inoculation. Bien que la mortalité tend à être plus forte chez les animaux sensibles (SI) que chez les animaux résistants, la différence n’est pas significative. La croissance ou le développement caecal sont similaires entre ces 2 groupes. Par rapport aux lapins "très sensibles" (SSI), les lapins "très résistants" (RRI) présentent toutefois une mortalité significativement plus faible (p=0.04) à j11, j12 et j13 après l’inoculation (-18 %).
L’élevage des animaux de rente implique une utilisation croissante d’équipements électriques et électroniques ainsi que le recours à du matériel et à des structures métalliques qui sont autant de facteurs favorisant l’apparition des courants électriques parasites. Les tensions à l’origine de ces courants, généralement inférieures à 10 volts, sont dues principalement à un défaut de mise à la terre et à une mauvaise équipotentialité des masses métalliques. Les animaux, en raison d’une faible résistance électrique, sont sensibles à ces faibles tensions électriques. Le contact direct du nez (mufle, groin) et des pattes avec le milieu humide diminue leur résistance au courant électrique alors que, chez l’homme, le port d’équipements de protection comme les bottes en caoutchouc augmente cette résistance. En élevage, les tensions électriques parasites sont parfois mises en cause lorsque des modifications comportementales, une dégradation de l’état sanitaire ou des baisses de production sont observées chez les animaux. Cependant, les expérimentations menées en milieu contrôlé montrent rarement un effet direct des tensions électriques parasites sur les paramètres zootechniques bien que des modifications comportementales et physiologiques, probablement liées à la présence d’un stress, soient parfois mises en évidence. La grande variabilité de réponse des animaux et le caractère imprévisible des tensions électriques parasites expliquent les difficultés à les diagnostiquer et à caractériser leurs effets sur les animaux en élevage.

Modern farming techniques involve an increasing use of electrical and electronic equipment together with metallic features which can be responsible for stray-voltage. Stray-voltage, less than 10 volts, is often due to a faulty connection between the electrical circuit and the earth. Animals, due to a lower electrical resistance than humans, are more sensitive to these low voltages. Moreover, direct contact of the muzzle and hooves with often wet surroundings reduces their resistance to electric current, whereas in man, the fact of wearing protective gloves and rubber boots increases this resistance. In farms, when animal behaviour modifications, deterioration of health status or reductions in production are observed, stray-voltage is sometimes implicated. However, experiments conducted under controlled conditions rarely show the effects of stray-voltage on production parameters. Nevertheless, some behavioural and physiological changes, probably related to the presence of stress, are often observed. The unpredictability of stray-voltage and the great variability in the response to stray-voltage exposure make diagnosis and characterisation of its effects in farm animals difficult.
En cuniculture, la restriction alimentaire transitoire après le sevrage est une stratégie efficace pour réduire les risques de troubles digestifs, en particulier liés à l’entérocolite epizootique du lapin. Ces stratégies, utilisées depuis plus de 10 ans dans la quasi-totalité des élevages cunicoles commerciaux en France, permettent d’améliorer l’efficacité alimentaire, réduisant ainsi les coûts alimentaires. L’objectif de cette synthèse est de présenter les mécanismes physiologiques, potentiels ou avérés, permettant d’expliquer les effets bénéfiques d'une ingestion restreinte sur la santé digestive et l’efficacité alimentaire. L’amélioration de la santé sera abordée par le biais du triptyque : aliment – microbiote digestif – immunité de l’hôte. Les pistes explorées concerneront la modulation de l’immunité digestive, via notamment la physiologie digestive, la réponse spécifique et les phénomènes inflammatoires, et la modulation de la composition et de l’activité du microbiote digestif. Pour expliquer l’amélioration de l’efficacité alimentaire, la digestibilité globale des aliments, l’assimilation des nutriments par l’hôte et leur prise en charge par le microbiote digestif seront discutés. Il s'agit également d'évaluer les impacts économiques, environnementaux et sur le bien-être animal des stratégies de restriction post-sevrage.

In rabbit breeding, post-weaning short term feed restriction is an efficient strategy to reduce digestive disorders, mainly associated with REE (Rabbit Epizootic Enteropathy). These strategies, used for over 10 years in the vast majority of French rabbit farms, also enable to improve feed efficiency, resulting in reduced feed costs. The aim of this review is to present the physiological mechanisms that could explain the beneficial effects of feed restriction upon digestive health and feed efficiency. The improvement of health will be addressed through the study of the interactions between the diet, the digestive microbiota and the host’s immune system. This will be done through an exploration of the digestive physiology, the specific and inflammatory response and the modulation of the activity and composition of the digestive microbiota. To explain the beneficial effects upon feed efficiency, global digestibility, the absorption of the nutrients by the host and their uptake by the microbiota will be discussed. This paper also aims to evaluate the impacts of post-weaning restriction strategies upon economic and environmental variables and upon animal welfare.
Des stress vécus par une femelle pendant la gestation peuvent entraîner une modification du comportement de la progéniture comme une plus grande réactivité émotionnelle, des capacités d’apprentissage perturbées, une coordination motrice moins développée dans le jeune âge ainsi qu’un comportement sexuel féminisé pour les mâles. Ces modifications comportementales sont souvent accompagnées d’une modification du fonctionnement de l’axe corticotrope, avec en particulier un taux de base de glucocorticoïdes plus élevé ou des sécrétions plus importantes après un événement stressant. D’autres conséquences non négligeables sont mises en évidence comme une modification de la réponse immunitaire humorale et cellulaire de la portée, ainsi qu’une diminution du poids à la naissance. Cependant, une forte variabilité des effets est observée qui serait en partie liée à la nature de l’agent stressant, à son intensité, ainsi qu’à sa période d’application et au sexe de la progéniture, les femelles semblant plus sensibles que les mâles. Le stress prénatal serait expliqué par les hormones surrénaliennes sécrétées par la mère et traversant la barrière placentaire qui influenceraient le développement neuroendocrinien de la progéniture. La modification du comportement maternel induite par les stress répétés pourrait être un autre mécanisme expliquant les effets ob-servés chez le jeune. Même si l’essentiel des études a été réalisé chez les rongeurs et les primates, les rares expérimentations chez les animaux d’élevage montrent que les effets seraient loin d’être négligeables.

Stress that occurs during pregnancy can have consequences on the behaviour of offspring such as increased emotional reactivity, impaired learning ability and feminisation of male sexual behaviour. A modification of the hypothalamo-pituitary axis is often observed, for example, an increase in basal glucocorticoid concentrations and a higher secretion rate after a stressful event. Immune responses can also be modified, and birth-weight reduced. However, there is a high level of variability in the effects of prenatal stress. This may be due to the type of stressor, its intensity and period of application during pregnancy. The effect may also differ according to the gender of the offspring, with females appearing to be more affected than males. Stress experienced by a dam during pregnancy could have consequences on neuroendocrine development in the foetus. Maternal hormones secreted during stress, which can cross the placental barrier, could be one of the mechanisms explaining these effects. Modification of maternal behaviour due to chronic stress may also be involved in the effect on the behaviour of the offspring. Most studies have been performed on rodents and primates but the few experiments involving farm animals tend to show that the consequences can be important.
En France, la filière ‘petits ruminants’ se caractérise par une très grande diversité de ses systèmes de production fortement liée à la diversité des territoires. L’élevage biologique y est particulièrement dynamique. Les systèmes mixtes, avec plusieurs ateliers, y sont très représentés et la présence d’un atelier ovin allaitant dans les exploitations de polyculture-élevage ou de poly-élevage a été considérée comme un facteur de résilience face aux aléas économiques et climatiques de 2016. Cependant, l’appui technique y est plus complexe que pour les systèmes d’élevage spécialisés et il peut y avoir des concurrences plutôt que des synergies entre ateliers. On manque également d’outils pour évaluer et objectiver les services que peuvent se rendre les différents ateliers. Un effort important autour des démarches ‘qualité’ a permis une bonne démarcation des produits (viande et fromages) vis-à-vis des produits importés. On observe une diversification croissante des produits à base de lait, considérée comme une source de résilience pour les deux filières laitières ovine et caprine. A l’inverse, en viande ovine, l’offre produit reste peu variée et l’enjeu pour le maintien, voire la reprise de la consommation, notamment par les jeunes, est le développement de nouveaux produits faciles à cuisiner.

In France, the small ruminant sector is characterized by a great diversity of farming systems strongly linked to the diversity of territories. Organic farming is particularly dynamic. Mixed systems, with several productions, are frequent, and the presence of sheep in crop-livestock or multi-livestock farms was considered as a factor of resilience to the economic and climatic hazards of 2016. However, technical support is more complex than for specialized livestock systems, and there may be competitions rather than synergies between productions. There is also a lack of tools to evaluate and objectify synergies between productions. A major effort around 'quality' approaches has allowed for a good demarcation of products (meat and dairy products) with regard to imported products. There is increasing diversification of milk-based products, which is considered as a source of resilience for both sheep and goat dairy sectors. On the contrary, in lamb meat sector, the product offer remains little varied and the challenge for the maintenance, or even the recovery of consumption, especially by young people, is the development of new products easy to cook.
L’évolution de la valeur nutritive de 12 espèces de graminées natives de prairies permanentes de moyenne montagne a été caractérisée au cours de 6 stades de leur 1er cycle de développement. Elles ont été réparties en 3 groupes de précocité. Chez les espèces les plus précoces, la digestibilité est la plus élevée au stade végétatif mais chute le plus rapidement. Les espèces tardives ont une digestibilité plus faible en début de cycle mais plus constante et sont moins riches en matières azotées totales. Chez les graminées, le stade de développement est le principal facteur de variation ; la variabilité interspécifique affecte la composition chimique et la valeur nutritive. Ces résultats concordent bien avec les valeurs de référence des Tables INRA 2007 obtenues sur des variétés sélectionnées

Plant nutritive value was assessed over the course of the phenological development (at 6 stages of the first development cycle) for 12 perennial grasses found in semi-natural upland grasslands. Three groups of species could be identified on the basis of the date at which unopened flower buds were observed. The earliest group (Alopecurus pratensis, Anthoxanthum odoratum, Festuca rubra, Poa pratensis) showed high dry matter digestibility at the vegetative stage but then a rapid decline (- 0,4 g/kg/º.day). The latest group (Elytrigia repens, Lolium perenne and Phleum pratense) showed a lower but more constant dry matter digestibility, along with low values of crude protein concentration. A third group (Arrhenatherum elatius, Dactylis glomerata, Festuca arundinacea, Holcus lanatus and Trisetum flavescens) showed intermediate characteristics.
Une expérimentation franco-polonaise a testé la faisabilité de mise en place, en Europe, d’un système de prédiction de la qualité de la viande bovine en bouche s’inspirant du système australien MSA. Six muscles de 30 vaches françaises et de 30 jeunes bovins polonais ont été dégustés, en France et en Pologne. Les 960 consommateurs français et 600 consommateurs polonais ont évalué selon 4 critères la qualité de steaks grillés et leur ont affecté l’une des 4 classes de qualité proposées. La prédiction de cette classe de qualité à partir d’un index global de satisfaction combinant ces 4 critères est en moyenne excellente (> 70%) pour les viandes dégustées par le consommateur francais, moins bonne pour celles évaluées en Pologne. Deuxièmement, la prédiction de l’index global par le modèle australien à partir des caractéristiques des animaux et de leurs carcasses tend à sous-estimer la qualité des viandes, surtout lorsqu’elles sont dégustées par le consommateur français. La qualité des viandes françaises est assez bien prédite par le modèle, mais celle des viandes polonaises est sous-estimée. Globalement, la grande cohérence des résultats montre qu’il serait possible de mettre en place un classement qualitatif des viandes en France avec le système MSA, même si certains ajustements sont nécessaires.

A French and Polish experiment tested if a grading scheme similar to the Australian MSA system could be implemented in Europe to predict beef eating quality. Six muscles from 30 French cows and 30 Polish young bulls were tasted in France and in Poland. 960 French and 600 Polish consumers assessed the quality of grilled steaks according to 4 criteria and assigned one of the 4 proposed quality ratings to each steak. The prediction of this quality rating using a global quality index combining the 4 criteria was judged on average excellent (> 70%) for meats tasted in France and less good for those assessed in Poland. The global index predicted through the Australian model from animals and their carcasses’ characteristics seemed to underestimate meat quality, especially when tasted in France. The French meat quality was quite well predicted by the model, while the Polish one was undervalued. Overall, the great consistency of the results showed that a qualitative meat grading system based on the Australian MSA model might be set up in France even though it should be a bit adjusted.
Le concept de service écosystémique permet de mettre en valeur les services rendus par les activités d’élevage à la société. Il constitue une passerelle entre les écosystèmes (qui les produisent) et la société (qui en bénéficie). Pour en accroître l’appropriation par les acteurs et ainsi permettre une meilleure valorisation des systèmes herbagers en production fromagère AOP, nous avons développé, dans le cadre du projet ATOUS, une démarche basée sur des enquêtes et de l’expertise collective, permettant la quantification et la représentation de ces services à l’échelle d’un territoire. Dans cet article nous détaillons la démarche et présentons des exemples de cartes obtenues sur un territoire du Massif central en zone AOP saint-nectaire. Ces cartes constituent les premiers supports de la démarche d’accompagnement des collectifs de producteurs.

The concept of ecosystem service valorizes the services provided by agricultural activities, and provides a bridge between ecosystems (who produce) and the society (who benefits). To increase its appropriation by stakeholders and thus allow better use of grassland livestock systems, we developed, as part of the ATOUS project, an approach based on surveys and collective expertise, enabling the quantification and representation of these services at the territory scale. We present examples of mediation supports obtained in a territory in the Massif Central Saint-Nectaire PDO area.
Des premières références nationales ont été établies en matière de production ovine biologique, viande et lait : performances techniques et économiques, impacts environnementaux et temps de travail. Un réseau de 60 fermes (50 en viande, 10 en lait) a été suivi pendant 2 années (campagnes 2012 et 2013). Par rapport à leurs homologues conventionnels, la moindre intensification des systèmes biologiques étudiés se traduit par moins de productivité des brebis, ainsi qu’une moindre consommation de concentrés. Les résultats économiques sont, pour les élevages allaitants, légèrement inférieurs à ceux des systèmes conventionnels, alors qu’ils sont comparables pour les élevages laitiers. Les impacts environnementaux évalués (changement climatique, consommations d’énergie, qualité de l’eau), exprimés /ha ou par kg produit, sont généralement équivalents ou plus faibles pour les systèmes ovins biologiques allaitants, comparativement aux conventionnels, malgré la moindre productivité. Les systèmes pastoraux biologiques compensent en totalité leurs émissions de gaz à effet de serre grâce au stockage de carbone des sols. En élevage ovin allaitant biologique, malgré un temps de travail d’astreinte par brebis plus élevé, les éleveurs disposent globalement de plus de temps libre qu’en élevage conventionnel.

First national benchmarks have been made on organic sheep meat and milk production: technical and economic performance, environmental impacts and working time. A network of 60 farms (50 in meat and 10 in milk) was surveyed for two years (2012 and 2013). Compared to their conventional counterparts, lower intensification of organic systems means less ewe productivity, as well as reduced concentrates consumption. Economic results are slightly lower in meat organic farming systems than in conventional systems, when they are comparable in dairy systems. The environmental impacts (climate change, energy consumption, water quality) of organic meat sheep farming systems are generally equivalent or lower, compared to conventional ones, when expressed per hectare and also per kg produced, despite their lower productivity. The rangeland-based systems completely compensate their greenhouse gases emissions, thanks to the carbon stored within pastures and rangelands. In meat sheep farms, despite more routine work per ewe than conventional, organic farmers have a little more time available.
Le projet de recherche Européen Q‐Porkchains (2007‐2012), coordonné par l’Université de Copenhague, a obtenu un financement de 14,5 millions d'Euros de la Communauté Européenne sur cinq ans pour conduire des recherches contribuant au développement de filières de production porcine innovantes, intégrées et durables, capables de fournir des produits qui correspondent aux demandes des consommateurs et aux attentes de la société. Ce projet a mobilisé l'équivalent de 200 années de travail à temps plein au sein de 62 institutions de 20 pays. Six partenaires français ont participé aux travaux: l'Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), l'Institut de la Filière Porcine (IFIP), l'institut Polytechnique La Salle de Beauvais, la Chambre Régionale d'Agriculture de Bretagne (CRAB), Hypor France et le Groupe Glon. Compte-tenu du nombre de projets menés dans le cadre de Q-Porkchains, la session spéciale des dernières Journées de la Recherche Porcine (JRP), qui est résumée ici, s’est concentrée sur quelques résultats particulièrement significatifs. Pour une vue plus exhaustive, on se reportera au site des JRP (www.journees-recherche-porcine.com) qui recense les travaux cités ou au rapport synthétique final du projet Q‐Porkchains (Heimann et al., 2012) téléchargeable sur www.q-porkchains.org.

The EU‐funded research project Q‐Porkchains (Quality Porkchains; www.q‐porkchains.org) was carried out from January 2007 to June 2012. It was coordinated by the University of Copenhagen and a total of 200 full time equivalents were mobilised by 62 partners in 20 countries. French participants included the French National Institute for Agricultural Research (INRA), the French Pork and Pig Institute (IFIP), the Polytechnic Institute La Salle Beauvais, the Regional Chamber of Agriculture in Brittany (CRAB), Hypor France and the Glon Group. The general objective of Q‐Porkchains was to contribute to the development of innovative, integrated and sustainable chains for the production of high quality pork and pork products matching consumer demands and citizen expectations. Q‐Porkchains produced and disseminated new knowledge on consumer demands and citizen attitudes and expectations, sustainability of pig husbandry systems, processing of pork products, chain management and governance, quality measurement and management. It also endeavoured to integrate knowledge through modelling (www.qpc‐models.dk), to disseminate it, particularly via the development of on line teaching modules (www.qporkchains. org/e-learning.aspx), and to put it into practice through demonstration and pilot chains (www.q‐porkchains‐industry.org) and the development of tools (www.tgxnet.no/qpc-cpdt). Key results from Q‐Porkchains are presented along the three main integrated themes: exploiting and enhancing the diversity of consumer and societal demands, production chains and products; Enhancing overall sustainability for the planet, people and profit; and managing quality through quality assessment and quality assurance.
Quantitativement, dans l’alimentation des poissons, le phosphore est l’élément minéral le plus important. Les données actuelles montrent que, chez les différentes espèces de téléostéens et de crustacés, le besoin en phosphore disponible se situe entre 0,4 et 0,9 % de l’aliment. La disponibilité du phosphore issu de différents ingrédients varie beaucoup entre espèces. Une fois le besoin couvert, l’excès de phosphore semble s’éliminer par voie urinaire. Nos connaissances sur le flux de phosphore chez les poissons sont cependant assez limitées. Il y a lieu aussi d’acquérir des données sur le rôle du phosphore d’origine alimentaire dans la régulation de l’état dynamique des structures osseuses et dans la prévention des déformations squelettiques. Du point de vue du maintien de la qualité du milieu, l’excès de phosphore se traduit souvent par une eutrophisation accrue des milieux aquatiques récepteurs. Même si l’impact environnemental de l’aquaculture demeure faible en termes de phosphore comparé aux autres activités humaines et qu’une forte teneur en phosphates ne soit pas nuisible aux poissons, il y a lieu d’éviter un apport en excès et d’assurer la meilleure utilisation des apports. Compte tenu du développement de l’aquaculture, de la diversité des espèces rencontrées et des enjeux liés à la diminution de la farine de poissons dans leur alimentation, l’étude du besoin nutritionnel en P et sa disponibilité retiennent une attention particulière des nutritionnistes.

Quantitatively, phosphorous is the major mineral in fish nutrition, Available data for different species of teleosts or crustaceans show that dietary P supply should be between 0.4 and 0.9% of the diet. The availability of phosphorus from feed ingredients varies between species, depending upon the presence or absence of gastric digestion. Once the requirements are satisfied, a major portion of absorbed P is released through urinary excretion. Our current knowledge on phosphorus flow in fish is rather limited. There is also a need for a greater understanding of the role of dietary phosphorus in the regulation of formation and resorption of skeletal tissues. From the environmental point of view, given the potential adverse effects of excess P in promoting eutrophication of water bodies, there is more than ever, a serious need for optimising dietary supply, improving availability and decreasing excess effluent discharge into the aquatic environment.
L’identification de régions génomiques homologues, c’est à dire possédant une origine ancestrale commune, est centrale à l’étude des génomes. La difficulté résulte de l’érosion des traces de cette relation d’homologie. Le principe est alors de rechercher des signatures d’homologie parmi un ensemble de courtes régions similaires. Nous présentons un formalisme modélisant toutes les solutions dans un graphe. Dans ce graphe, un chemin est une représentation de deux régions potentiellement homologues et notre but est de retrouver un ensemble cohérent de chemins, c’est à dire de régions homologues. Cet ensemble est reconstruit à l’aide d’une méthode d’optimisation globale basée sur la théorie des flots.
Dans le contexte de l’abattage, sauf dérogation, la saignée des animaux est précédée d’une étape d’étourdissement. La technique majoritairement employée en France pour étourdir les poulets est l’immersion dans un bain d’eau électrifiée. Selon les paramètres électriques employés, l’efficacité de cette étape et la prévalence des défauts de présentation des carcasses varient. Cette synthèse des données scientifiques existantes permet d’identifier des combinaisons de paramètres pouvant être optimales à la fois en termes de bien-être animal et de qualité des carcasses. Celles-ci devront toutefois faire l’objet d’expérimentations complémentaires pour être validées et précisées. Afin d’optimiser cette technique d’étourdissement, d’autres obstacles sont à surmonter, notamment la variabilité entre les animaux dans le courant reçu.
Avec la démocratisation des outils de la génomique et plus particulièrement du séquençage à haut débit, la séquence du génome du canard commun a été réalisée et va bientôt être publiée. Cependant, bien que ce soit une étape importante et un tournant dans les connaissances de la biologie de cette espèce, des projets complémentaires sont nécessaires et pour beaucoup déjà initiés : recherche de SNP (Single Nucleotide Polymorphism) pour les études et gestion de populations ; cartes d’hybrides irradiés pour ordonner la séquence le long des chromosomes ; carte génétique pour la détection des QTL (Quantitative Trait Locus) ; séquençage de transcrits pour l’annotation structurelle et fonctionnelle du génome. La première détection de QTL influençant les performances du mulard, réalisée à l’aide de marqueurs microsatellites chez la cane commune, sera complétée par une seconde étude utilisant des marqueurs SNP développés spécifiquement et permettant une bien meilleure couverture du génome. Les modèles de transcrits et de protéines construits grâce à la séquence faciliteront les études en protéomique et transcriptomique : identification de protéines, mise au point de marqueurs pour la qRT-PCR ou tout simplement existence d’un génome de référence pour l’approche par RNASeq. Le canard mulard, d’intérêt agronomique, étant le produit du croisement du canard commun avec le canard de Barbarie, devra également être étudié.

As the genomics becomes commonplace and sequencing throughputs increase, the duck genome sequence will be soon published. However, although this is an important step and will increase drastically knowledge on the biology of this species, complementary projects are needed, some of which initiated: SNP (Single Nucleotide Polymorphism) detection for population studies and management; radiation hybrid maps for orderingthe sequence along chromosomes; genetic maps for QTL (Quantitative Trait Locus) detection; transcript sequencing for structural and functional annotation. The first QTL detection for traits influencing the performances of the mule duck, performed using microsatellite markers in the common duck, will be completed by a second study using specifically designed SNP, allowing for an improved coverage of the genome. Transcript and protein models constructed from the sequences will facilitate proteomics and transcriptomics studies: protein identification, primer design for qRT-PCR ou using a reference genome for RNA-Seq approaches. The mule duck, of agronomic interest, the product of a cross between the common duck and the Muskovy duck will also have to be studied.
La majorité des cas de salmonellose humaine dans les pays industrialisés est liée à la consommation d’oeufs et de viande de volaille mais aussi de charcuteries contaminées. Pour réduire ce risque alimentaire, la stratégie développée à l’INRA, en collaboration avec l’AFSSA, vise principalement à réduire la contamination des matières premières alimentaires d’origine animale, en particulier celles issues des volailles et du porc. Cela implique d’améliorer l’état sanitaire des animaux et de lutter contre le portage asymptomatique de cette bactérie par des animaux qui abritent, voire excrètent de grande quantité de pathogènes sans signe de maladie. Une telle démarche implique une meilleure compréhension des mécanismes qui permettent à la bactérie de coloniser l’animal, mais aussi des réponses immunitaires mises en place par l’hôte pour résister à ce pathogène. Ces études débouchent sur le développement de vaccins ou de moyens thérapeutiques et sur la sélection d’animaux plus résistants à ce portage asymptomatique. Enfin, une approche intégrative complémentaire des études expérimentales et observationnelles de terrain permet de modéliser la contamination des animaux ou des industries agroalimentaires pour analyser les risques de transmission et l’impact des mesures prophylactiques.

Most human cases of salmonellosis in developed countries are related to the consumption of contaminated eggs, poultry and pig meat. To improve food safety, INRA aims, in collaboration with AFSSA, at decreasing the prevalence of contamination of raw animal material, especially those originating from poultry or pigs. This implies improving animal health and reducing asymptomatic carrier-state (Le animals carrying or shedding bacteria without any clinical signs). This involves increasing the knowledge of mechanisms of animal colonisation by bacteria and also the immune response allowing the host to resist the pathogen. These studies will result in the development of vaccines and drugs but also in the selection of animals more resistant to the Salmonella carrier state. Finally, an integrative approach, using results from experiments and field studies, allows modelising the contamination of animals and food industries and in turn evaluating the risk of transmission and the impact of prophylactic means.
L’adoption de l’alimentation de précision en production porcine passe par une évaluation précise de ses avantages potentiels. L’objectif de cette étude était d’évaluer en milieu commercial et dans un mode de gestion des truies en groupe l’impact d’une alimentation de précision sur les performances, la productivité et le coût d’alimentation en gestation. Une alimentation conventionnelle (C ; 0,53 % lysine digestible) et une alimentation de précision (AP ; teneur en lysine digestible variant en fonction du jour de gestation et du rang de portée) ont été comparées. Quatre bandes consécutives ont été étudiées dans un élevage commercial sur deux cycles complets, de la saillie jusqu’au sevrage, correspondant à 295 truies et 523 portées. Sur l’ensemble des truies, le gain d'épaisseur de muscle pendant la gestation était significativement supérieur chez les truies AP. Chez les truies multipares, aucun autre impact n’a été observé alors que chez les truies nullipares, le taux de survie des porcelets à la mise bas tendait à être meilleur pour les truies du traitement AP (P = 0,08). Considérant que ce traitement permet une meilleure couverture des besoins en acides aminés des truies nullipares en fin de gestation, ce résultat semble logique. Il reste toutefois à le confirmer sur un nombre plus élevé d'animaux. Les résultats de cette étude montrent que l’AP chez la truie en gestation permet de réduire les apports totaux de protéines et d'acides aminés sans affecter négativement les performances permettant ainsi de réduire de près de 2 € le coût d’alimentation par truie et par année.

Adoption of precision feeding in pork production requires precise assessment of its potential benefits. The objective of this study was to evaluate, in a commercial setting and under group sow management, impacts of precision feeding on growth performance, productivity and feeding costs in gestating sows. Conventional feeding (C; 0.53% digestible lysine) and precision feeding (PF; digestible lysine content varied by gestation day and litter rank) were compared. Four consecutive batches in a commercial farm were studied over two complete cycles, from breeding to weaning, corresponding to 295 sows and 523 litters. For all sows, gestational muscle gain was significantly greater for PF sows. For multiparous sows, no other impact was observed, while for gilts the survival rate of piglets at birth tended to be higher for PF treatment sows (P = 0.08). Since PF covers amino acid requirements of gilts at the end of gestation better, this result seems logical. However, future studies on more animals will be needed to confirm its benefits. The results show that PF of gestating sows can reduce protein and amino acid supplies without negatively affecting the performance of sows, thus reducing the feeding cost per sow per year by €2.
Le terme fibres alimentaires regroupe l’ensemble des polysaccharides non amylacés qui résistent à l’hydrolyse par les enzymes digestives des animaux monogastriques. Elles correspondent principalement aux constituants des parois cellulaires des végétaux associés ou non à la lignine. L’introduction de fibres dans les aliments des porcs diminue leur valeur nutritive mais peut aussi avoir des conséquences non-nutritives intéressantes dans le contexte actuel de la production porcine. Ainsi, les fibres interagissent avec le bon fonctionnement du tube digestif et donc sa santé, le bien-être de l’animal en situation de restriction alimentaire. Cette revue présente les mécanismes associés, fournissant ainsi des bases de réflexion pour l’introduction de fibres dans les formules pour porcelets, truie et porc charcutier.

Dietary fibre is defined as a heterogeneous mixture of structural and non-structural polysaccharides together or not with lignin, which are resistant to hydrolysis by endogenous digestive enzymes. Dietary fibre introduction in pig feeds decreases their nutritional values but could also be potentially interesting for non-nutritive aspects in the current context of pig production. Thus, dietary fibre introduction may interact with gut health and welfare in feed-restricted sows. This text reviews the physiological mechanisms of dietary fibre digestion and their consequences on metabolism. Impacts on gut health and welfare are illustrated for piglets and sows, respectively.
La tension croissante entre la demande alimentaire mondiale, la préservation des ressources ainsi que de l’emploi dans les zones rurales remet en question l’intensification et la spécialisation qui ont prévalu pour la production de lait ou de viande avec un troupeau bovin de plus en plus granivore aux Etats-Unis, mais aussi en France et en Europe, voire en Asie. Il faudra désormais concevoir les systèmes de façon plus cohérente entre les ressources fourragères locales et les types de vaches, en valorisant en priorité les surfaces prairiales, non concurrentes pour l’alimentation humaine, qui fournissent des produits plus typés et de nombreux biens publics associés. L’agroécologie offre une nouvelle grille de lecture pour redéfinir les enjeux du couple vache - prairie et des systèmes d’élevage bovin porteurs d’avenir.

In a fast changing global context, intensive cattle farming systems are reaching their limits (environmental, economic, societal...). The increasing tension between global food demand, the preservation of resources and job opportunities in rural areas calls into question intensive beef and dairy farming, and the fact that cattle is increasingly fed on grains. This is particularly true in the US, but also in France, Europe and Asia. From now on, new farming systems will have to be developed in a more coherent way, one that takes into consideration local forage resources and cattle type, makes the most of available grassland not needed for feeding humans, and promotes additional ecosystem services and local produce with a more typical flavour. Agroecology lays down new benchmarks and defines new challenges for cattle-grassland management and for tomorrow’s cattle farming systems.
Une évaluation du système PDI a été entreprise en préalable d'une révision des systèmes d'unités d'alimentation des ruminants dans le cadre du projet INRA-Phase "Systali ". Ainsi, des rations pour différents types de ruminants, issues d'un grand nombre d'expériences de digestion publiées, ont été systématiquement caractérisées à l'aide du système PDI actuel et des " valeurs tables " des aliments. Les écarts entre les valeurs prédites et les valeurs observées ont été explorés en fonction de différents facteurs pratiques. Certains aspects du système PDI actuel sont satisfaisants. Il s'agit en particulier de la dégradation de l'azote alimentaire prédite à partir des mesures en sachet de nylon des aliments. Il conviendra cependant d'y apporter une correction pour tenir compte de l'azote endogène et du transit, lui même lié au niveau d'ingestion. Par contre, la prévision de la matière organique fermentescible (MOF) est peu précise, elle pourra être améliorée en tenant mieux compte des interactions digestives et de la digestion ruminale de l'amidon. Par ailleurs, l'efficacité moyenne de la synthèse de matières azotées microbienne (145 gMAM/kgMOF) correctement estimée dans le système PDI actuel, est supposée être constante alors qu'elle varie notamment en fonction du transit, des apports de MOF et de protéines. Enfin, le bilan azoté du rumen, qui résulte de l'équilibre [énergie vs azote] et des flux de [recyclage d'urée vs absorption d'NH3], semble constituer une variable pertinente pour étendre l'application des PDI aux régimes pauvres et pour mieux le comparer aux systèmes concurrents des autres pays. Les modifications envisagées seront intégrées dans un modèle simple de la digestion ruminale et permettront d'obtenir un système plus précis et évolutif.
Dans un contexte dans lequel le coût élevé des matières premières et l’utilisation de sources non renouvelables de phosphates sont des enjeux majeurs pour les productions animales, l’alimentation de précision est proposée comme une démarche essentielle à l’accroissement de l’efficacité d’utilisation de l’azote et du phosphore alimentaire, et par conséquent, une réduction de leur excrétion. Une alimentation de précision requiert de bien caractériser le potentiel nutritif des aliments, de déterminer avec précision les besoins nutritionnels des animaux, de prédire la réponse animale aux apports nutritionnels, de formuler d’aliments avec des contraintes environnementales, et d’ajuster progressivement les apports aux besoins décroissants des animaux. La mise en place d’une telle stratégie d’alimentation demande cependant d’accroître nos connaissances et d’améliorer nos méthodes de calcul afin de s’assurer que les formules alimentaires proposées soient celles qui optimiseront nos systèmes de production tant d’un point de vue animal, économique qu’environnemental.

Precision feeding is proposed as an essential approach to improve the utilisation of dietary nitrogen and phosphorous, and thus reduce nutrient excretion in a context in which the high cost of feed ingredients and the use of non-renewable sources of phosphate are major challenges for the livestock industry. Precision feeding requires accurate knowledge of the nutritional value of feedstuffs and nutrient requirements, formulating diets with environmental constraints, and the gradual adjustment of nutrient supply in order to follow the decreasing requirements of animals during growth. Nevertheless, it is necessary to increase our knowledge and improve current calculation methods to ensure that the proposed feed formulas are those that optimize the production system from different perspectives (i.e., the animal, economy and environment).
La présente étude traite des réactions des bovins aux procédures d’abattage d’un abattoir industriel français, depuis l’arrivée des animaux jusqu’à leur abattage. Elle met en évidence des relations directes entre le fonctionnement de l’abattoir, les caractéristiques des bovins et leurs réactions de stress, y compris leur métabolisme post-mortem . Cette étude permet également d’envisager des évolutions concrètes et relativement simples liées aux aménagements et à la gestion des animaux visant à améliorer leurs conditions d’abattage.
La composition en Acides Gras (AG) du lait et de la viande est une composante importante de leur qualité nutritionnelle pour l’Homme, qui est fortement modulable à court terme par l’alimentation des animaux d’élevage. Cet article résume les grands axes de recherche et les principaux résultats obtenus à l’INRA sur ce sujet au cours des 10 dernières années. Chez le porc, le poulet et le lapin, les recherches ont principalement porté sur le transfert des AG polyinsaturés, en particulier le 18:3 n-3 du lin, de l’aliment à la viande (muscle et tissu adipeux) et ses conséquences sur la qualité des carcasses. Chez les ruminants, on a étudié les effets des principaux types de fourrages (herbe pâturée, foins, ensilages d’herbe ou de maïs) et de concentrés (céréales, oléagineux), et leurs interactions, sur les AG du lait et de la viande bovine, notamment les AG saturés et insaturés (oléique, trans, conjugués et 18:3 n-3). Des différences marquées existent entre les réponses des AG du lait de la vache et de la chèvre laitière. Des études en cours évaluent les éventuels effets secondaires des pratiques alimentaires sur la qualité sensorielle des produits et la santé des animaux, et sur une possible utilisation du profil en AG pour tracer l’origine des produits. Les études futures devront aussi intégrer l’avancée attendue des connaissances en nutrition humaine sur les effets potentiels des différents AG majeurs et mineurs des produits animaux standards ou enrichis.

Milk and meat fatty acid (FA) composition is an important component of their nutritional quality for human consumption. This composition can be markedly and rapidly modulated by feeding factors in farm animals. This paper summarizes the main research directions and results obtained by INRA on these topics during the last 10 years. In the pig, chicken and rabbit, research was focused mainly on the transfer of polyunsaturated FA, particularly 18:3 n-3 from linseed, from feed to meat (muscle and adipose tissue) and its consequences on carcass quality. In ruminants, studies were on the effects of the main forage types (pasture, hays, grass or maize silages) and concentrates (cereals, oilseeds), and their interactions, on bovine milk and meat FA, particularly saturated and unsaturated FA (oleic, trans, conjugated and 18:3 n-3). Marked differences were observed between the dairy cow and goat milk FA responses. Current studies are being done to assess putative secondary effects of feeding practices on product sensory quality and animal health, as well as the potential of using FA profile to trace animal product origin. Future studies should also take into account expected progress in human nutrition knowledge on putative effects of major and minor FA, which are present in standard or enriched animal products.
L’objectif de cet article est de rechercher les composés phénoliques des plantes qui pourraient avoir une action sur les microbes du rumen et limiter la production de méthane. Comme il y a une très grande diversité de structures chimiques, nous avons eu recours à la fouille de données pour faire émerger des composés susceptibles d’avoir un effet significatif. La pertinence des règles d’association a été améliorée grâce à une nouvelle mesure d’intensité qui a permis de sélectionner quelques composés qui seront à identifier. Ainsi, parmi les 1075 composés inconnus présents dans le jeu de plantes, 26 ont émergé desquels 7 ont un effet seuil.