nglaura/hal-summarization huggingface dataset:
La méthode des comptes de surplus permet d’évaluer l’évolution de la productivité de l’ensemble des facteurs d’une entreprise et la répartition des gains de productivité entre les différents agents économiques. Nous avons appliqué cette méthode sur une base de données de 168 exploitations bovin allaitant du bassin Charolais de 1980 à 2014. Sur la période de 35 ans, le surplus global de productivité (SPG) cumulé s’accroit faiblement à un rythme de +0,16 %/an. Ce faible accroissement du SPG est lié à la constante augmentation de la productivité du travail, alors que la productivité des autres facteurs régresse. Nous observons une baisse du revenu des exploitants, une très légère baisse du prix des consommations intermédiaires, des fermages et des frais financiers auxquels s’ajoutent une très forte augmentation des soutiens publics directs. L’ensemble de surplus économique cumulé a été captée à 61 % par l’aval de la filière bovine sous forme de baisse de prix. Il apparait que les bénéficiaires des gains de productivité en élevage bovin viande sont majoritairement les acteurs de l’aval de la filière, tandis que l’Etat est le principal financeur de cette baisse de prix des produits agricoles. La baisse du revenu des exploitants indique clairement qu’ils sont perdants dans cette répartition des gains de productivité.

Thanks to the surplus accounting method, we measured the productivity gains and the combined effects of output and input price variation on Charolais beef cattle farmers’ income between 1980 and 2014. During this period, the total factor productivity has grown slightly at an average annual rate of 0.16% mainly due to a huge increase in labor productivity, while the productivity of all other factors decreased. We observed a decrease in farmers’ income, a slight drop in intermediate consumption prices, land rent and financial costs, and a high increase in public aids. Over the 35 years, with a share of nearly 60% of the global surplus, the downstream of the beef sector appears as the main beneficiary of these productivity gains through a decrease in agricultural product prices. The state was the main funder of this drop in prices and farmers were the losers in the surplus distribution via a significant decrease of their income.
La reconnaissance sociale tient une grande place dans les interactions entre individus et donc dans l’organisation en société. La reconnaissance des individus apparentés ou non a suscité depuis les années 80 de nombreuses études portant sur les avantages adaptatifs ainsi que sur les mécanismes et bases sensorielles sur lesquels elle est basée. Ces travaux ont révélé que la reconnaissance sociale est un processus complexe et non rigide très largement répandu chez les Vertébrés. Elle peut en effet reposer sur différents mécanismes et bases sensorielles non mutuellement exclusifs et être influencée par divers facteurs. La familiarisation est le mécanisme fondamental de la reconnaissance. Elle permet l’apprentissage d’indices phénotypiques provenant des congénères ou de soi. Les apparentés de ces individus familiers peuvent également être reconnus du fait de leurs ressemblances avec ces derniers. Les indices phénotypiques qui servent de base à la reconnaissance peuvent appartenir à différentes modalités sensorielles comme l’olfaction, la vision ou l’audition et être modelés par le génome et l’environnement. De façon générale l’étude de la reconnaissance sociale permet d’avoir une meilleure connaissance du monde cognitif des animaux.

Social recognition plays a major role in the mediation of interactions between individuals and the organisation of societies. During the last 20 years, numerous studies have investigated the adaptive significance, underlying mechanisms and sensory basis of individual recognition of kin as well as non-kin. The results indicate that the recognition of conspecifics involves complex, flexible processes that are widespread throughout the vertebrate kingdom. Such recognition can be based upon different mechanisms and sensory modalities, and influenced by diverse factors. Learned phenotypic traits of conspecifics through familiarisation, including oneself, is the fundamental mechanism implicated in recognition. Animals become directly familiar with others with which they interact. Moreover, kin of familiar conspecifics may be discriminated because of their resemblance to the known individuals. An animal's genotype and environmental variables may both contribute to its recognisable individual signatures (e.g. distinctive olfactory, visual, or auditory characteristics). In general, the study of social recognition enhances our understanding of the cognitive world of animals.
L’omission d’une traite par jour entraîne, chez la vache laitière, une importante perte de production suivie d’un effet rémanent négatif lors du retour à 2 traites par jour, après 3 semaines de monotraite. La perte de production lors du passage à 1 traite/j est très variable entre animaux (Rémond et Pomiès, 2005), rendant difficile une prévision. L’identification, et plus encore la sélection d’animaux aptes à supporter la monotraite nécessite de mesurer un phénotype corrélé aux 2 aspects de cette aptitude (perte, effet rémanent), facilement mesurable en ferme et assez tôt dans la lactation. La présente étude a pour objet de décrire la variabilité entre individus des 2 aspects de l’aptitude à la monotraite, et aussi d’identifier des premiers phénotypes prédicteurs
Les connaissances scientifiques récentes apportent-elles de nouveaux arguments rationnels ou des raisons objectives supplémentaires en faveur ou en défaveur de la consommation de viande ? Voilà la question à laquelle il faut répondre objectivement avant d’affirmer qu’ « Il faut manger de la viande » ou « qu’il ne faut pas manger de la viande ». Or sur ce point, les corpus scientifiques qui étayent les discours apposés à l’élevage et à la consommation de viande font la part belle à des généralisations abusives, aux simplifications et aux autres fausses bonnes idées. Les généralisations abusives concernent le plus souvent l’absence de référence à l’espèce (oubliant ainsi les différences entre monogastriques et ruminants) ou au système d’élevage (oubliant les grandes différences entre les systèmes intensifs et les systèmes extensifs). Les simplifications consistent à ne pas mentionner les méthodes et les conditions des études scientifiques induisant ainsi facilement des extrapolations ou des conclusions erronées. Ces approximations dans le raisonnement conduisent à proposer des fausses bonnes idées qui sont des alternatives à la viande ou aux produits carnés dont les fondements ne sont pas étayés ou très discutables.

Has recent scientific knowledge provided rational arguments of additional objective reasons in favor or not of eating meat? This is a question that we must objectively answer before affirming “we must eat meat” or “we must not eat meat”. The scientific community against breeding and meat consumption often refer to misleading generalizations, simplifications and other false ideas. The misleading generalizations often concern species (they forget to discuss the differences between monogastrics and ruminants) or the farming system (they ignore the differences between intensive and extensive breeding systems). By simplifying they forget to mention the methods and conditions of scientific studies therefore facilitating the extrapolation of erroneous conclusions. These approximations in reasoning lead to the spread of false good ideas that are alternatives to meat and meat products for which the bases have little or no scientific evidence.
En raison de préoccupations en matière de santé, de bien-être animal ou plus largement pour la durabilité de notre planète, nombre de nos contemporains s’interrogent sur notre mode de vie occidental, et en particulier sur notre consommation de viande. L’élevage a des impacts mais rend aussi des services pour l’environnement et les territoires. Le bien-être animal est par ailleurs un enjeu majeur. Ce dossier de l’Inra publié sur le site de l’Institut et enrichi d’infographies vient éclairer les bénéfices et les limites de la consommation de viande.

Due to concerns about health, animal welfare or, more broadly, about the sustainability of our planet, many of our contemporaries are wondering about our Western lifestyle, and especially about our meat consumption. Livestock has impacts but also provides services for the environment and territories. Animal welfare is a major issue. This report of INRA published on the website of the Institute clarifies the benefits and limits of meat consumption. It is enriched with figures and infographics available on the INRA website to better understand these issues.
Quatre poulains issus d’une collaboration de recherche entre l’Inra de Nouzilly et la Jumenterie du Pin sont nés ce printemps. L’originalité de ces poulains réside dans le fait que les embryons ont été au préalable génotypés et cryoconservés. Les objectifs de ces travaux de recherche sont multiples pour la filière équine.
Cette étude décrit la variabilité entre élevages de l’évolution du microbiote au moment du sevrage, et évalue la relation entre cette dernière et la robustesse des porcelets. Des échantillons fécaux et des enregistrements de croissance ont été collectés juste avant et sept jours après le sevrage pour 288 porcelets issus de 16 élevages commerciaux, caractérisés pour leur statut sanitaire et leur usage d’antibiotiques. Nous avons observé dans toutes les fermes la présence de quatre entérotypes bactériens (E1 à E4), différant notamment par leur abondance de Prevotella, Faecalibacterium, Roseburia, et Lachnospira, et correspondant à des stades de maturation graduelle pré- vers post-sevrage de la flore. Après le sevrage, des 1 177 unités taxonomiques (OTU) contenues dans le jeu de données, 462 et 340 voyaient leur abondance respectivement influencée par l’utilisation d’antibiotiques et par le statut sanitaire de l’élevage. Les animaux ont ensuite été classés selon leur gain de poids relatif (GMQr) calculé entre 26 et 48 jours d’âge. Les porcelets à haut GMQr avaient moins d’Oscillospira (P < 0,05) et Campylobacter (P < 0,01), et plus de Prevotella (P < 0,01), Coprococcus (P < 0,01) et Lachnospira (P < 0,05) après le sevrage, ce qui s’apparentait à l’entérotype E4. Ainsi, en utilisant des animaux provenant de 16 fermes, nous avons pu identifier quatre entérotypes maturationnels ubiquitaires, et supposé que les porcelets ayant atteint l’entérotype E4 juste après le sevrage pourraient être plus robustes. Hormis l’usage d’antibiotiques, le statut sanitaire global de l’élevage a une influence importante sur l’évolution précoce du microbiote après le sevrage.

This study describes variability among farms of the response of microbiota to weaning and evaluates its relation to the robustness of piglets. Faecal samples and growth data were collected just before and seven days after weaning in 288 piglets from 16 commercial farms characterised by their pathogenic status and antimicrobial use. We observed in all farms the presence of four bacterial enterotypes (E1 to E4), differing notably in their abundance of Prevotella, Faecalibacterium, Roseburia, and Lachnospira, and corresponding to a gradual maturational shift from pre- to post-weaning microbiota. After weaning, of the 1 177 operational taxonomic units (OTU) contained in the dataset, 462 and 340 had their abundance affected (P < 0.05) by the use of antimicrobials and by the health status of the herd, respectively. Animals were then classified according to their relative average daily gain (rADG) from 26 to 48 days of age. The high rADG piglets had less Oscillospira (P < 0.05) and Campylobacter (P < 0.01), and more Prevotella (P < 0.01), Coprococcus (P < 0.01) and Lachnospira (P < 0.05) after weaning, which resembled the E4 enterotype. Thus, using animals from 16 farms, we identified four ubiquitous maturation enterotypes and found that piglets that reached enterotype E4 just after weaning might be more robust. Besides antimicrobial use, the general health status of the farm has a strong influence on the early post-weaning evolution of piglet microbiota.
Cette étude vise à développer une méthode d’enregistrement et d’analyse des vocalisations émises par les poussins lors des 3 premiers jours de vie (J0 à J3). Dans un premier temps, une analyse de la bibliographie a permis d'identifier les différentes catégories de vocalisations émises par les poussins (confort, détresse, blottissement, trille de peur ou de plaisir) et d'identifier leurs caractéristiques sonores. Ensuite, deux programmes développés sous Matlab, ont permis (1) d’automatiser les séquences d’enregistrement et (2) de détecter et d'identifier les vocalisations de confort et de détresse. L’étude a permis de définir des conditions optimales de prise de son permettant une analyse optimale des signaux : groupe d'une dizaine de poussins, des microphones omni-directionnels, des séquences de 2 minutes d’enregistrement. Entre J0 et J3, les poussins émettent des sons courts dont la bande de fréquence est limitée (2000 - 5000 Hz). Le programme développé est fonctionnel pour caractériser les indicateurs sonores suivants : le centre de gravité fréquentiel, l’étalement spectral ainsi que la fréquence instantanée. Il permet également par une analyse temps-fréquence de leur signature, de dénombrer les vocalisations de confort et de détresse des poussins.

This study aims to develop a method for recording and analysing chicks vocalisations emitted during the first 3 days of life (D0 to D3). First, a bibliographic review identified vocalizations categories emitted by chicks (comfort, distress, snuggle, fear or pleasure trills) and identified their sound characteristics. Then, two programs developed under Matlab, made it possible (1) to automate the recording of sound sequences and (2) to detect and identify comfort and distress vocalizations. The study defined optimal sound recording conditions allowing an optimal analysis of sound signals: a group of ten chicks, omni-directional microphones, 2-minute recording sequences. Between D0 and D3, chicks emit short sounds with a limited frequency range (2000 - 5000 Hz). The program developed is functional to characterize the following sound indicators: the frequencial gravity center, spectral spreading and instantaneous frequency. It also allows, through a time-frequency analysis of their signature, to count the chicks' comfort and distress vocalizations.
L’abattage démarre dès la préparation de l’animal en élevage pour le départ à l’abattoir et s’achève avec la mort de l’animal. C’est une période complexe : au cours des différentes étapes de l’abattage, des sources de stress d’origine physique, émotionnelle, sociale et cognitive interviennent. Alors que celles d’origine physique sont bien connues, les autres le sont moins. Elles ont pourtant un impact significatif sur l’état de stress des bovins. En effet, les perturbations sociales, l’exposition à des évé- nements nouveaux et/ou soudains, les manipulations par l’homme ainsi que l’environnement visuel, sonore et olfactif sont autant de facteurs potentiellement stressants qui s’ajoutent et interagissent avec les contraintes physiques. Un certain nombre de conseils pratiques relatifs aux équipements et à la gestion des bovins permettent de limiter ces sources de stress. Associés à des observations du comportement des animaux au cours des différentes procédures de la période d’abattage, ils peuvent permettre de réduire considérablement le stress des bovins.

The slaughter period starts with the preparation of the animal for transport to the abattoir and ends with the death of the animal. It is a complex period, and the different stages may present different causes of stress which may be of physical and emotional, cognitive and social origin. The latter categories are less well described although they have a significant impact on the stress status of cattle at slaughter. Social disturbances, exposure to novel or sudden events, handling by humans and the visual, olfactory and audible context may all be causes of stress, in interaction with the physical constraints. We propose several practical recommendations relative the equipment used and the management of the animals to reduce causes of stress. If behavioural observations at the different slaughter stages indicate difficulties, these recommendations may help to reduce considerably the stress of the cattle at slaughter.
La production de porcs biologiques en France est marginale par rapport à celle des porcs conventionnels (moins de 1% en tonnage) mais en progression constante. La production porcine biologique est fortement encadrée par la réglementation qui impose des contraintes fortes en termes de logement, d’alimentation et de conduite d’élevage. Ces contraintes peuvent influencer les performances, la santé et le bien-être des animaux ainsi que la qualité des carcasses et des viandes. Les données existantes suggèrent une grande diversité des types d’élevages de porcs biologiques et in fine des conséquences du mode de production biologique sur le bien-être et la santé des animaux vivants ainsi que sur la qualité des produits. D’une façon générale, le mode de production biologique offre des atouts pour répondre à l’attente des consommateurs concernant le bien-être animal et la qualité des produits, mais les éleveurs doivent être vigilants en matière de santé des animaux, d’équilibre des rations alimentaires, surtout pour les porcelets et les truies allaitantes, et de qualité des carcasses.

The importance of organic pig production is very low in France compared to that of conventional pigs (less than 1% of pork production) but increases regularly. Organic pig production is organised by the legislation that imposes numerous constraints in terms of housing, feeding and husbandry. These constraints are likely to influence performances, health and welfare of the pigs as well as the quality of carcasses and meat. Existing knowledge suggests a high diversity in the types of organic pig farms and hence on the consequences of the organic farming on pig welfare and health as well as on the quality of the products. Overall, organic farming offers good opportunities to respond to consumers' wishes regarding animal welfare and quality of food products provided that pig producers pay attention to animal health, nutritional balance of the diets, especially for piglets and lactating sows, and quality of carcasses.
La problématique globale de ce texte introductif concerne l'adaptation des systèmes aux perturbations. L'étude des modalités de cette adaptation engendre différents termes, notions et définitions. Ainsi, ces notions de rigidité, d'élas- ticité, de flexibilité et de plasticité…se retrouvent dans de nombreuses disciplines scientifiques, qu'il s'agisse de la physique, de la sociologie, de l'économie, de la biologie animale et des systèmes d'élevage. L'approche systémique permet de situer les facettes de l'adaptation des systèmes dans un cadre générique largement partagé et la modélisation de cette adaptation constitue un vrai défi aux chercheurs.

The global topic of this introduction deals with the adaptation of systems to pertur- bations. The study of the modalities of this adaptation implicates various terms, notions and definitions. Thus, the notions of rigidity, elasticity, flexibility and plasticity… are known in numerous sciences: physics, sociology, economy, animal biology and farming systems. The systemic approach allows considering the various aspects of the adaptation of systems into a generic frame largely admitted and modelling this adaptation constitutes a current challenge to researchers.
Pendant l'allaitement la lapine émet des fèces dures dans le nid, qui sont en partie ingérées par les lapereaux. L'objectif de notre étude est i) d'évaluer l'effet de l’ingestion de fèces maternelles au nid sur l'implantation du microbiote cæcal par séquençage 454 de la région V3-V4 des gènes codant pour l’ARN 16S, la croissance et la survie des lapereaux et ii) d’orienter le processus d'implantation du microbiote en substituant les fèces aternelles par des fèces issues d’autres femelles sous antibiothérapie ou non. Dans le lot témoin, les fèces maternelles sont dénombrées et laissées à disposition des lapereaux dans le nid (lot T, n=24 portées), dans le lot R (n=28 portées) les fèces sont comptées puis retirées. Dans les deux derniers lots les fèces maternelles sont comptées, retirées et remplacées par des fèces issues de femelles étrangères non traitées (E, n=28 portées) ou traitées aux antibiotiques (Eab, n=29 portées). L’apport de fèces de lapines étrangères multiplie par 3 le comportement de coprophagie du lapereau (p <0,001 période 2-20j d'âge) mais il est plus faible dans le lot Eab que dans le lot E (29±10, vs 36±9 fèces consommées, respectivement, p <0,05). Entre 36-49 jours d’âge et sur l’ensemble de la période (2-80j), la mortalité est plus élevée dans le groupe R (9,5% et 22,8%, respectivement) et plus faible dans le groupe E (2,8% et 9,3%) que dans les groupes T (5,8% et 15,5%) ou Eab (4,7% et 13,2% ; p<0,05 et p<0,01, respectivement). La prévention de l’ingestion de fèces (lot R), entraîne un retard d'implantation du microbiote, avec une abondance relative supérieure de Bacteroidaceae et inférieure de Ruminococcaceae à 35 jours d'âge, comparativement aux 3 autres groupes (p<0,1). En conclusion le comportement de coprophagie du lapereau au nid jouerait un rôle important dans la transmission du microbiote de la mère vers sa portée et contribuerait à garantir une meilleure survie.
L'activité anti-androgénique et l'évaluation de la compétitivité entre les extraits aqueux de Leptadenia hastata et le propionate de testostérone (PT) ont été étudiés sur des rats Wistar impubères castrés. Il a été, dans un premier groupe, administré uniquement aux rats 0,04 ; 0,4 ; 4 ; 40 ; 400 et 1 000 µg.kg-1 de PT, puis dans un second groupe, il a été administré aux rats ces mêmes doses de PT simultanément avec la dose de 200 mg.kg-1 de L. hastata. Les différents traitements ont montré une augmentation significative (p < 0,05) du poids des organes androgéno-dépendants et du niveau de la testostérone plasmatique. À faibles doses de PT, la dose de 200 mg.kg-1 de L. hastata inhibe l'effet de la PT et à fortes doses, cet effet est potentialisé. En conclusion, l'effet anti-androgénique de l'extrait de L. hastata s'exprime lorsque les doses de PT sont faibles.

Anti-androgenic activity of Leptadenia hastata (Pers.) Decne: competitive effect of the aqueous extracts of the plant and the testosterone propionate on castrated immature rats. The anti-androgenic activity and the evaluation of competitiveness between the extracts of Leptadenia hastata and the testosterone propionate (TP) were studied on Wistar immature castrated rats. The first group received only 0.04; 0.4; 4; 40; 400 and 1,000 µg.kg-1 of TP and the second group received simultaneously these different doses of TP and 200 mg.kg-1 of L. hastata. The various treatments showed a significant increase (p < 0.05) of the weight of androgeno-dependent organs and the level of plasmatic testosterone. At low dosis of TP, the dosis of 200 mg.kg-1 of L. hastata inhibited TP effects, whereas at high doses of TP L. hastata extracts potentiated TP effects. In conclusion, the anti-androgenic effect of the extract of L. hastata is expressed when the TP amounts are weak.
Les objectifs de cet essai étaient d’évaluer les conséquences d’une augmentation de la mobilisation osseuse de vache laitière en début de lactation sur les teneurs en Ca et en P du lait et la dynamique de reconstitution osseuse en fin de lactation. Quinze vaches laitières Holstein multipares ont été réparties en trois lots différents 5 semaines avant la date planifiée de vêlage. Chaque lot recevait un traitement différent, consistant à différentier l’alimentation des vaches entre 5 jours et 10 semaines de lactation. Le traitement témoin (TEM) consistait en une ration couvrant 100 % des besoins en Ca, les traitements BCa et BCaBE consistaient en des rations couvrant 70% des besoins en Ca, le bilan alimentaire cation-anion étant de 200 mEq/Kg MS pour TEM et BCa, et 0 pour BCaBE. Les traitements BCa et BCaBE ont eu tendance à diminuer légèrement la rétention corporelle de Ca à 3 semaines de lactation (P< 0.09) par rapport au traitement TEM mais n’ont eu d’effet ni sur la dynamique des teneurs en biomarqueurs d’accrétion et de résorption osseuse au cours des 32 semaines de lactation, ni sur la rétention corporelle du Ca à 17 semaines de lactation. Les vaches ont presque entièrement compensé la baisse des apports en Ca par une élévation de l’absorption apparente du Ca à 3 semaines de lactation (P = 0.03). Les traitements n’ont pas eu d’effet sur la composition du lait. Par contre la production laitière a eu tendance (P = 0.09) à être plus faible sur l’ensemble de la lactation avec les régimes BCa et BCaBE par rapport à TEM, avec une différence moyenne de 2 kg/j.

The objective of this experiment was to evaluate the consequences of an increase of bone mobilization in early lactation, on the milk contents of Ca and P and the bone reconstitution dynamics in late lactation. Fifteen multiparous Holstein cows have been spread between three treatments 5 weeks before the expected calving date. Those treatments consisted in differentiating the cow’s diets between 5 days and 10 weeks of lactation. The control treatment (TEM) consisted in a diet covering 100% of the Ca requirements, the treatments BCa and BCaBE consisted in a diet covering 70% of the Ca requirements, the dietary anion-cation difference was 200 mEq/Kg DM for TEM and BCa and 0 for BCaBE. The treatments BCa and BCaBE induced a small decrease of the body retention of Ca at 3 weeks of lactation compared with the treatment TEM (P< 0.09) but did not affect either the dynamics of blood biomarkers of bone accretion and resorption during the 32 weeks of lactation or the body retention of Ca at 17 weeks of lactation. Cows almost entirely compensated the decrease of Ca supply in BCa and BCaBE treatments by an increase of the apparent absorption of Ca at 3 weeks of lactation (P = 0.03). Treatments did not clearly affect either the milk composition. Nevertheless, milk yield tended (P = 0.09) to be lower throughout the lactation with treatments BCa and BCaBE compared with TEM with a mean difference of 2 kg/d between TEM treatment and BCa and BCaBE treatments.
L’objectif du présent travail est de dégager, par méta-analyses, les principales lois de réponse du bilan carbone des ruminants aux variations dues au régime alimentaire. Les données de base utilisées concernent des animaux placés en cages calorimétriques. Des régressions intra-expérience prés entent les réponses des différentes composantes du bilan C (fèces, urine, CH 4 , CO 2 et produit animal et/ou bilan net de C) aux variations de la proportion de concentré, de la teneur en azote du régime et du niveau des apports alimentaires à ration égale. Ces facteurs présentent presque toujours des influences significatives, linéaires ou non, sur les composantes du bilan C. Les flux de C rapportés au poids vif, ou exprimés en % de l’ingéré, montrent le rôle prépondérant du flux fécal dans l’efficacité de l’utilisation de C. D'un point de vue pratique, ces équations peuvent être utiles pour, par exemple, prédire les flux de C au niveau de simulateurs de troupeaux, ou à un niveau d’approche plus global.

A meta-analysis was conducted to examine the main relationships between dietary factors and the response of ruminants for the C balance. The database consisted of measurements obtained in animals housed in calorimetric crates. Intra-experiment regressions pointed out the responses of the C balance components (faeces, urine, CH4, CO2,animal product and/or C net balance) linked to the following dietary variations: concentrate proportion, nitrogen content and intake level for a given potential. These factors almost always exerted significant relationships, either linear or not, on the components of the C balance. C fluxes, expressed on a live-weight basis or in % of C intake, pointed out the dominant role of the C faecal flux for the efficiency in C utilisation. From a practical point of view, these equations could be useful to predict the C fluxes with herd simulators or in a more global approach.
L’amélioration de l’efficacité alimentaire est un enjeu majeur pour la compétitivité de la filière porcine. Elle est classiquement mesurée en élevage par l’indice de consommation, indicateur économique de l’efficacité d’utilisation des aliments pour la croissance. Un critère alternatif indépendant des performances des animaux, la Consommation Moyenne Journalière Résiduelle (CMJR), a été proposé dans les années 1960. Cet article synthétise les résultats obtenus à partir de la sélection divergente de deux lignées à l’INRA, une lignée à CMJR faible, animaux consommant moins que prédit pour leurs besoins de production et d’entretien, et donc plus efficaces, et une lignée à CMJR élevée, animaux consommant plus que prédit pour leurs besoins, moins efficaces. Ces recherches montrent qu’il est possible de sélectionner pour la CMJR chez le porc en croissance avec un impact limité sur les caractères de production et de reproduction femelle, permettant ainsi de diminuer les quantités d’aliments utilisées en élevage. La dégradation des paramètres de qualité technologique de la viande en réponse à l’amélioration génétique de l’efficacité alimentaire est un point de vigilance dans les stratégies de sélection, de même que la composition nutritionnelle de la ration alimentaire. Finalement, la capacité de réponse à des stress ou à des changements de conditions d’élevage ne semble pas affectée par la sélection, contrairement à ce qui est suggéré dans la littérature en réponse à la sélection pour une CMJR réduite. Les défis qui résultent de ces résultats pour poursuivre l’amélioration de ce caractère en production tout en répondant à l’évolution des contraintes de l’élevage sont discutés.

Improving feed efficiency remains a challenge for pork production. The usual measure in herds is feed conversion ratio that quantifies the economic efficiency of feed use for animal growth. Residual Feed Intake (RFI) has been proposed as an alternative measure, independent of production traits, in the 1960's. This paper reviews the research in two divergent lines selected for RFI at INRA, the low RFI line with pigs eating less than predicted from the production and maintenance requirements, i.e. more efficient, and the high RFI line eating more than predicted for its less efficient requirements,. These studies show that selection for RFI in growing pigs is possible with a limited impact on production and sow reproduction. However, technological meat quality is unfavourably affected by selection and a control of the impacts of selection for feed efficiency on this trait is necessary, as well as for nutritional requirements of most efficient pigs. Finally, the pig's ability to respond to stressors or various breeding conditions was not affected by selection, unlike that hypothesized by the resources allocation theory applied to livestock species. The challenges for pig production to continue improving feed efficiency in a changing context for livestock production are discussed.
Une des façons d’améliorer l’efficacité de l’effet bélier est de se placer dans de bonnes conditions d’élevage. Ainsi, la proportion de brebis dont l’ovulation est induite augmente lorsque la date d’introduction des mâles est plus tardive (55% en avril vs 81% fin mai, p<0,05) et avec l’allongement de l’intervalle entre le tarissement et la mise en lutte : de 29% à 84% (p<0,001) pour des intervalles respectifs de 22 et 86 jours. La fertilité de ces brebis est également meilleure fin mai qu’en avril (86% vs 39%, p<0,01) et lorsque l’intervalle écoulé depuis le tarissement est accru : respectivement 55% et 81% (p=0,09). Enfin, le moment d’apparition des premières ovulations fertiles est retardé chez les brebis en état corporel faible car elles présentent davantage de cycles courts (67%) que les brebis en bon état (41%, p<0,05).

The ram effect, which is a natural method for the control of reproduction in sheep, is an alternative to hormone treatments that are banned on organic farms. The ram effect induces a combination of ovulation and oestrus in ewes that is acyclic and conducive to artificial insemination. The proportion of acyclic females with induced ovulation and their subsequent fertility at the first oestrus is variable. The control of some breeding factors that have been studied here may help to reduce this variability. The proportion of ewes induced to ovulate by rams increased as the season advanced (54% in April vs. 84% at the end of May, p<0.05) and with a longer time period between drying-off and mating: from 29% to 84% (p<0.001) for 22 and 86 days elapsed, respectively. The fertility of these ewes at the first oestrus was also higher at the end of May than in April (86% vs. 39%, p<0.01) and increased with the amount of time elapsed since drying-off (55% and 81% for 22 and 86 days, respectively; p=0.09). The time that the first oestrus occurs is later for lean ewes because they have a higher proportion of short cycles (67%) than fat ewes (41%, p<0.05).
Cet article présente les premiers résultats d'un biocapteur radiofréquence développé pour la détection de la prolifération bactérienne dans le cadre d'une analyse d'antibiorésistance. Le capteur développé comporte une coupure capacitive dans une ligne micro-ruban, dans laquelle est placé un capillaire contenant les bactéries ou leur milieu seul. Les résultats obtenus valident la capacité de mesure RF à détecter la présence de bactéries dans leur milieu.
Certaines réactions émotionnelles, telles que les réactions de peur, peuvent être inadaptées en élevage, sources d’atteintes au bien-être des animaux. Chez la caille, l’obtention de lignées génétiques divergentes sélectionnées d’une part sur un comportement de peur, d’autre part sur la motivation sociale, a démontré la faisabilité de sélections sur des composantes de la réactivité émotionnelle. Les cailles sélectionnées sur un comportement de peur diffèrent non seulement par leur propension générale à exprimer des comportements de peur, mais aussi en termes de qualité de la viande, de réactivité de l’axe corticotrope, d’activité du système nerveux autonome et au niveau neurobiologique. Une région du génome a été identifiée comme potentiellement impliquée dans les différences observées entre les lignées. Par ailleurs, les cailles sélectionnées pour leur faible motivation sociale se sont montrées plus indifférentes à leur environnement social que les cailles sélectionnées pour leur forte motivation sociale. Ces lignées de cailles se sont révélées comme de puissants modèles d’étude des mécanismes sous-tendant la réactivité émotionnelle chez les oiseaux. Les travaux pluridisciplinaires engagés sur ces cailles ont pour buts d’évaluer les conséquences de ces sélections, non seulement pour le bien-être animal mais aussi en termes de production, et d’identifier des indicateurs de bien-être qui pourront servir à comparer différents systèmes d’élevage des volailles.

In farm animals, emotional reactions such as fear behaviour may be inadequate and may compromise animal welfare. Two programmes of divergent genetic selection in the Japanese quail have demonstrated the feasibility of selection on components of emotional reactivity: fear behaviour on the one hand and social reinstatement behaviour on the other hand. Divergent selection of the quail on a fear behaviour trait has been accompanied by differences in general fearfulness, meat quality, hypothalamo-pituitary-adrenal axis reactivity, autonomic nervous system activity and central nervous system characteristics. A region of the genome has been identified as being potentially involved in the observed differences. The second selection programme has shown that the quail selected for low social reinstatement behaviour is more indifferent to their social environment than the quail selected for high social reinstatement behaviour. These quail lines constitute a powerful tool to study the mechanisms of emotional reactivity in birds. The aims of the multidisciplinary work being currently carried out on these quail are to assess the consequences of these selection programmes, not only in terms of animal welfare but also in terms of animal production, and to identify welfare indicators that may be used to compare different farming practices in poultry production.
Pour une utilisation optimale des applications et outils développés au sein du Cati Sicpa, l’aide aux utilisateurs est essentielle. Pour alimenter cette aide, les responsables de projet et les agents pivots multiplient les interven‑ tions comme les séminaires et les supports d’aides aux utilisateurs.
La valeur alimentaire d’une prairie diversifiée dépend en premier lieu de la composition du mélange d’espèces et de la valeur de ces espèces. Pour les associations, la part de légumineuses est souvent déterminante pour l’ingestibilité et la valeur azotée du fourrage. Pour les prairies permanentes, la valeur alimentaire dépend des types et proportions de graminées (à stratégie de capture ou de conservation) et de dicotylédones, en rapport avec le milieu et le mode de conduite. La valeur des graminées natives et des dicotylédones non légumineuses est peu connue, de même que les interactions entre plantes sur la digestion et l’ingestion des animaux. L’intérêt des prairies diversifiées réside dans une plus grande souplesse d’utilisation avec une valeur alimentaire qui peut être plus stable dans le temps.

About two thirds of the forages used by herbivorous livestock comes from diversified (i.e. multi-specific) pastures; these have both agronomical and ecological advantages. An optimal management of such pastures requires a good knowledge of their feeding value. The feeding value of a diversified pasture depends in the first place on the composition of the mixture of species and on the species' feeding value. In grass-legume associations, the proportion of legumes is often determinant for the voluntary intake and the nitrogen value of the herbage. In permanent pastures, the environmental conditions and the type of management determine the botanical composition (especially the types and proportions of grasses with a capture or a conservation strategy, and those of legumes); they thus determine, in a large measure, the feeding value. The value of the voluntary grasses and of the dicotyledons other than the legumes is little known, nor are the interactions among plants on the digestion and intake by the animals. At the scales of the grazing season and of the forage system, the advantage of diversified pastures lies in their greater flexibility of management.
Le système bovin laitier agroécologique OasYs est expérimenté grandeur nature (91 ha SAU, 72 vaches laitières) depuis juin 2013 à Lusignan (Vienne). Son adaptation au changement climatique repose sur une diversification des fourrages (y compris les arbres) et la mise en place d'une nouvelle stratégie d'élevage (2 périodes de vêlage, lactation allongée à 16 mois, croisement de 3 races). Son analyse technico-économique a été réalisée de 2014 à 2018. Sur cette période, les charges ont été divisées par 2 sur les concentrés et par 3 sur les frais de reproduction. Les semences et plants représentent 20% des charges opérationnelles. L'augmentation des taux de matières grasse et protéique a permis de compenser la diminution de production moyenne par vache laitière entre 2014 (6795 l) et 2018 (6147 l). A partir de 2018, le système a permis de rétribuer 1,5 UMO à un salaire correspondant à 2 SMIC. Les résultats technico-économiques de ce système laitier agroécologique encore en transition sont donc très encourageants.

The agroecological dairy system OasYs is experimented at full scale (91 ha UAA, 72 dairy cows) since June 2013 in Lusignan (Vienne, France). Its adaptation to climate change rests on the diversification of forage (including trees) and a new livestock management (2 calving periods, 16-month lactation, 3-way cross-breeding). Its techno-economicanalysis wasperformedfrom2014to 2018. On this period, expenses were divided by 2 for concentrates and by 3 for reproduction. Seeds and seedlings represented 20% of operational expenses.The increase of fat and protein contents allowed to offset the decrease of mean milk production per cow observed between 2014 (6795 l) and 2018 (6147 l). Since 2018the system allowed to pay out 1.5 unitsof labour with 2 minimum wages. The techno-economicresults of this agroecological dairy system still in transition are thus encouraging.
Existe-t-il des bons et des mauvais élèves à l’école des chevaux ? Comment améliorer les performances d’apprentissage de son cheval ? Les travaux présentés ici sont les principaux résultats d’une thèse dont l’objectif était de déterminer quels sont les atouts de chaque animal en fonction de son tempérament.
L’obtention des filiations complètes dans les filières de petits ruminants est très contraignante. Cela constitue un obstacle majeur à l’engagement des éleveurs en sélection et induit, pour certaines races, des généalogies incomplètes qui affectent l’efficacité de leurs schémas. Les marqueurs moléculaires sont de bons outils pour permettre d’assigner a posteriori les parentés des animaux. Des enquêtes menées auprès des éleveurs et gestionnaires de schémas de sélection ont confirmé l’intérêt certain pour cette technique qui pourrait être déployée sur le terrain si le coût proposé reste raisonnable. Trente populations ovines françaises ont ainsi été génotypées sur des puces à haute densité de marqueurs (800 000 ou 60 000 SNP) afin de ne retenir que les marqueurs les plus informatifs dans les races françaises. Un panel de 249 SNP a été retenu, ces SNP ayant correspondu aux critères stringents établis sur le pourcentage de typages présents, la fréquence allélique, le respect de l’équilibre de Hardy-Weinberg, les compatibilités mendéliennes ainsi que leur répartition sur le génome. La sélection d’un groupe de marqueurs pour l’espèce caprine est en cours.

Complete and accurate pedigree information is difficult to get in small ruminants. This results in less and less farms involved in selection schemes and in a loss of efficiency of those selection schemes. Molecular DNA markers are tools of choice for assigning parentage after animal birth. A questionnaire has been submitted to breeders and selection scheme managers and results point out their interest in such a technique which could spread out if it is proposed at a reasonable cost. Thirty French sheep populations have been genotyped with high density SNP chips (800,000 or 60,000 markers) in order to only select informative markers in these breeds. A 249 SNP panel was retained, those SNP having passed through stringent filters on call-freq, minor allele frequency, Hardy-Weinberg equilibrium, Mendelian compatibilities and their position on the genome. The SNP panel for goat assignment is under construction.
La production cunicole française s’élève à 57 000 tonnes de carcasse en 2015. Elle est assurée à 80% par environ 1000 ateliers spécialisés, situés à 70% dans le grand ouest (Bretagne, Pays de la Loire, Poitou-Charentes). Elle se situe au 3 e rang mondial, après la Chine (450 000 t), l’Espagne (60 000 t) et devant l'Italie (30000t). La rationalisation de la filière cunicole conduit à augmenter la taille moyenne des élevages (environ 600 lapines = 1 employé). La production d’aliments composés est d’environ 450 000 t pour 840000 lapines en production et 43 millions de lapins vendus par an. La consommation française de viande de lapin est environ d'1 kg par habitant et par an. Comme pour les autres viandes, cette consommation tend à se réduire, sachant que la vente de viande de lapin est assurée à 74 % dans les GMS. La cuniculture conventionnelle (80% de la production) est peu diversifiée, car basée sur un système standardisé (hors-sol) "naisseur-engraisseur" avec conduite en bande et insémination artificielle. La production "fermière" subsiste sous forme de petits élevages (<100 lapines) avec vente en circuits courts, et notamment la production cunicole sous certification AB est en train d'émerger (50 éleveurs).

The French rabbit production amounted to 57 000 tons of carcass in 2015. It is 80% insured by about 1000 specialized farms, located at 70% in the great west (Brittany, Pays de la Loire, Poitou-Charentes). French rabbit breeding ranks third in the world, after China (450,000 t), Spain (60,000 t) and ahead of Italy (300,000 t). Rationalization of the rabbit industry led to an increase in the average size of farms (about 600 rabbits = 1 person). The production of compound feed is about 450 000 t for 840000 productive does and 43 million rabbits sold per year. French consumption of rabbit meat is about 1 kg per inhabitant per year. As for other meats, this consumption tends to reduced, knowing that the sale of rabbit meat is ensured to 74% in supermarkets. Conventional rabbit systems (80% of production) are not very diversified and based on a standardised system (sol-free) "breeder-fattener" with batch management and artificial insemination. The "farm" production remains in the form of small units (<100 does) with sale in short circuits, and in particular rabbit production under organic certification is emerging (50 breeders).
La sub-acidose ruminale, souvent définie à partir d'une valeur moyenne de pH ruminal inférieure à 6,0, est une maladie métabolique de plus en plus répandue dans les élevages à haut niveau de production où les animaux reçoivent des rations riches en concentrés (Owens et al. , 1998). Son diagnostic est difficile, car elle n’affecte pas tous les animaux en même temps, ni avec la même intensité. Disposer d'un indicateur non invasif du risque de sub-acidose est donc un challenge important économiquement.