English: Species 1 (1) Acholeplasma oculi@ 2 (2) Acinetobacter (a) baumannii (b) calcoaceticus (c) Iwoffii (d) spp 3 (3) Actinobacillus (a) actinomycetemcomitans (b) capsulatus@ (c) equuli@ (d) lignieresii@ (e) pleuropneumoniae@ (f) seminis@ (g) spp (h) suis@ (i) ureae@ 4 (4) Actinomadura (a) madurae (b) pelletieri 5 (5) Actinomyces (a) bovis@ (b) gerencseriae (c) hordeovulneris@ (d) israelii (e) naeslundii (f) pyogenes (g) spp (h) suis@ (i) viscosus@ 6 (6) Aeromonas (a) hydrophila (b) punctata (c) spp 7 (7) Afipia spp 8 (8) Agrobacterium radiobacter 9 (9) Alcaligenes spp 10 (10) Amycolata autotrophica 11 (11) Anaplasma (a) caudatum@ (b) centrale@ (c) marginale@ (d) ovis@ 12 (12) Arcanobacterium (a) haemolyticum (b) pyogenes 13 (13) Arcobacter (a) butzeri (b) cryoaerophilus (c) spp 14 (14) Arizona spp 15 (15) Bacillus cereus 16 (16) Bacteroides (a) fragilis (b) heparinolyticus (c) levii@ (d) salivosus@ (e) spp 17 (17) Bartonella (a) bacilliformis (b) elizabethae (c) henselae (d) quintana (e) spp 18 (18) Bordetella (a) avium@ (b) bronchiseptica (c) parapertussis (d) pertussis (e) spp 19 (19) Borrelia (a) burgdorferi (b) duttonii (c) recurrentis (d) spp (e) vincenti 20 (20) Brachyspira (a) hyodysenteriae (b) innocens 21 (21) Brucella (a) canis (b) ovis (c) spp, excluding abortus, melitensis and suis 22 (22) Burkholderia (a) cepacia genomovars I (b) cepacia genomovars III (c) gladioli (d) multivorans (e) spp, excluding mallei and pseudomallei (f) stabilis (g) vietnamensis 23 (23) Campylobacter (a) coli (b) fetus, subspecies fetus (intestinalis) (c) fetus, subspecies venerealis (d) hyointestinalis (e) jejuni (f) lari (g) mucosalis@ (h) spp (i) sputorum 24 (24) Capnocytophaga spp 25 (25) Cardiobacterium hominis 26 (26) Chlamydia (a) pneumoniae (b) psittaci (non-avian strains) (c) trachomatis 27 (27) Chryseobacterium meningosepticum 28 (28) Citrobacter (a) diversus (b) freundii (c) spp 29 (29) Clostridium (a) chauvoei (b) colinum@ (c) difficile (d) haemolyticum@ (e) histolycum (f) novyi (g) perfringens (h) septicum (i) sordellii (j) spiriforme@ (k) spp, excluding botulinum (l) tetani (m) villosum@ 30 (30) Corynebacterium (a) amycolatum (b) cystitidis@ (c) diphtheriae (d) jeikeium (e) kutscheri@ (f) minutissimum (g) pilosum@ (h) pseudotuberculosis (i) renale (j) spp (k) ulcerans 31 (31) Dietzia maris 32 (32) Dermabacter hominis 33 (33) Dermatophilus congolensis 34 (34) Dichelobacter nodosus 35 (35) Edwardsiella tarda 36 (36) Eikenella corrodens 37 (37) Enterobacter (a) aerogenes/cloacae (b) spp 38 (38) Enterococcus (a) faecalis (b) faecium (c) spp 39 (39) Ehrlichia (a) sennetsu (b) spp 40 (40) Erysipelothrix tonsillarum 41 (41) Escherichia (a) coli (b) coli enterohemorrhagic VTEC (EHEC) (c) coli enteroinvasive — EIEC (d) coli enteropathogenic — EPEC 42 (42) Eubacterium suis@ 43 (43) Fluoribacter bozemaniae 44 (44) Francisella (a) novicida (b) philomiragia 45 (45) Fusobacterium (a) necrophorum (b) spp 46 (46) Gardnerella vaginalis 47 (47) Gordonia spp 48 (48) Haemophilus (a) ducreyi (b) influenzae (c) influenzaemurium@ (d) paragallinarum@ (e) parainfluenzae (f) parasuis@ (g) piscium@ (h) somnus@ (i) spp 49 (49) Helicobacter (a) cinaedi (b) felis@ (c) fennelliae (d) mustelae@ (e) nemestrinae@ (f) pullorum (g) pylori 50 (50) Hemobartonella felis@ 51 (51) Kingella kingae 52 (52) Klebsiella (a) granulomatis (b) oxytoca (c) pneumoniae (d) spp 53 (53) Lactococcus garvieae 54 (54) Lawsonia intracellularis@ 55 (55) Legionella (a) micdadei (b) pneumophilia (c) spp 56 (56) Leptospira (a) bratislava (b) canicola/copenhageni (c) grippotyphosa (d) hardjo (e) icterohaemorrhagiae (f) interrogans (g) pomona (h) sejroe (i) var ballum 57 (57) Listeria (a) ivanovii@ (b) monocytogenes (c) spp 58 (58) Mannheimia haemolytica 59 (59) Moraxella (a) bovis@ (b) caprae (c) catarrhalis (d) lacunata (e) phenylpyruvica (f) spp 60 (60) Morganella morganii 61 (61) Mycobacterium (a) africanum (b) asiaticum (c) avium complex (d) avium/intracellulare (e) bovis (f) bovis (BCG) (g) chelonae (h) fortuitum (i) kansasii (j) leprae (k) malmoense (l) marinum (m) microti (n) paratuberculosis (o) scrofulaceum (p) simiae (q) szulgai (r) ulcerans (s) xenopi 62 (62) Mycoplasma (a) caviae (b) hominis (c) pneumoniae (d) spp, excluding mycoides 63 (63) Neisseria (a) elongata (b) gonorrhoeae (c) meningitidis (d) spp 64 (64) Neorickettsia helminthoeca@ 65 (65) Nocardia (a) asteroides (b) brasiliensis (c) caviae (d) farcinica (e) nova (f) otitidis-caviarum (g) pseudobrasiliensis (h) spp (i) transvalensis 66 (66) Ochrobactrum spp 67 (67) Oligella spp 68 (68) Ornithobacterium rhinotracheale@ 69 (69) Pandoraea spp 70 (70) Pantoea agglomerans 71 (71) Pasteurella (a) aerogenes (b) anatipestifer@ (c) caballi@ (d) canis (e) dagmatis (f) granulomatis@ (g) haemolytica (h) multocida (serotypes B:2 and E:2) (i) multocida, except serotypes B:2 and E:2 (j) multocida, subspecies gallicida (k) multocida, subspecies multocida (l) multocida, subspecies septica (m) pneumotropica (n) spp 72 (72) Peptostreptococcus (a) anaerobius (b) indolicus@ (c) spp 73 (73) Plesiomonas shigelloides 74 (74) Porphyromonas spp 75 (75) Prevotella (a) melaninogenica (b) spp 76 (76) Propionibacterium propionicum 77 (77) Proteus (a) mirabilis (b) penneri (c) spp (d) vulgaris 78 (78) Providencia (a) alcalifaciens (b) rettgeri (c) spp 79 (79) Psychrobacter (a) immobilis (b) phenylpyruvicus 80 (80) Pseudomonas (a) aeruginosa (b) spp 81 (81) Ralstonia spp 82 (82) Rhodococcus (a) equi (b) spp 83 (83) Rickettsia (a) akari (b) australis (c) canadensis (d) conorii (e) helvetica (f) montanensis (g) parkeri (h) rhipicephali (i) spp, excluding prowazekii and rickettsii (j) tsutsugamuchi (k) typhi (mooseri) 84 (84) Rothia (a) dentocarosia (b) mucilagenous 85 (85) Salmonella (a) abortus equi (b) abortus ovis (c) agona (d) anatum (e) arizonae (f) choleraesuis (g) derby (h) dublin (i) enteritidis (j) gallinarum@ (k) heidelberg (l) montevideo (m) newport (n) (other serovars) (o) paratyphi A, B and C (p) pullorum@ (q) spp (r) typhi (s) typhimurium (t) typhisuis@ 86 (86) Serpulina spp 87 (87) Serratia (a) liquefaciens (b) marcescens 88 (88) Shigella (a) boydii (b) dysenteriae (other than Type 1) (c) flexneri (d) sonnei 89 (89) Staphylococcus (a) aureus (b) aureus (MRSA) (c) epidermidis (d) intermedius@ 90 (90) Stenotrophomonas maltophilia 91 (91) Streptobacillus (a) moniliformis (b) spp 92 (92) Streptococcus (a) agalactiae@ (b) bovis@ (c) dysgalactiae@ (d) equi@ (e) pneumoniae (f) pyogenes (g) spp (h) suis (i) uberis@ 93 (93) Taylorella equigenitalis@ 94 (94) Treponema (a) carateum (b) pallidum (c) pertenue (d) spp (e) vincentii 95 (95) Tsukamurella spp 96 (96) Ureaplasma urealyticum 97 (97) Vagococcus salmoninarum@ 98 (98) Vibrio (a) cholerae (b) parahaemolyticus (c) spp (d) vulnificus 99 (99) Yersinia (a) enterocolitica (b) pseudotuberculosis (c) ruckeri@ Fungi
French: Espèce 1 (1) Acholeplasma oculi@ 2 (2) Acinetobacter a) baumannii b) calcoaceticus c) Iwoffii d) spp 3 (3) Actinobacillus a) actinomycetemcomitans b) capsulatus@ c) equuli@ d) lignieresii@ e) pleuropneumoniae@ f) seminis@ g) spp h) suis@ i) ureae@ 4 (4) Actinomadura a) madurae b) pelletieri 5 (5) Actinomyces a) bovis@ b) gerencseriae c) hordeovulneris@ d) israelii e) naeslundii f) pyogenes g) spp h) suis@ i) viscosus@ 6 (6) Aeromonas a) hydrophila b) punctata c) spp 7 (7) Afipia spp 8 (8) Agrobacterium radiobacter 9 (9) Alcaligenes spp 10 (10) Amycolata autotrophica 11 (11) Anaplasma a) caudatum@ b) centrale@ c) marginale@ d) ovis@ 12 (12) Arcanobacterium a) haemolyticum b) pyogenes 13 (13) Arcobacter a) butzeri b) cryoaerophilus c) spp 14 (14) Arizona spp 15 (15) Bacillus cereus 16 (16) Bacteroïdes a) fragilis b) heparinolyticus c) levii@ d) salivosus@ e) spp 17 (17) Bartonella a) bacilliformis b) elizabethae c) henselae d) quintana e) spp 18 (18) Bordetella a) avium@ b) bronchiseptica c) parapertussis d) pertussis e) spp 19 (19) Borrelia a) burgdorferi b) duttonii c) reccurentis d) spp e) vincenti 20 (20) Brachyspira a) hyodysenteriae b) innocens 21 (21) Brucella a) canis b) ovis c) spp, sauf abortus, melitesis et suis 22 (22) Burkholderia a) cepacia genomovars I b) cepacia genomovars III c) gladioli d) multivorans e) spp, sauf mallei et pseudomallei f) stabilis g) vietnamensis 23 (23) Campylobacter a) coli b) fœtus, sous-espèce fœtus (intestinalis) c) fœtus, sous-espèce venerealis d) hyointestinalis e) jejuni f) lari g) mucosalis@ h) spp i) sputorum 24 (24) Capnocytophaga spp 25 (25) Cardiobacterium hominis 26 (26) Chlamydia a) pneumoniae b) psittaci (souches non aviaires) c) trachomatis 27 (27) Chryseobacterium meningosepticum 28 (28) Citrobacter a) diversus b) freundii c) spp 29 (29) Clostridium a) chauvoei b) colinum@ c) difficile d) haemolyticum@ e) histolycum f) novyi g) perfringens h) septicum i) sordellii j) spiriforme@ k) spp, sauf botulinum l) tetani m) villosum@ 30 (30) Corynebacterium a) amycolatum b) cystitidis@ c) diphteriae d) jeikeium e) kutscheri@ f) minutissimum g) pilosum@ h) pseudotuberculosis i) renale j) spp k) ulcerans 31 (31) Dietzia maris 32 (32) Dermatobacter hominis 33 (33) Dermatophilus congolensis 34 (34) Dichelobacter nodosus 35 (35) Edwardsiella tarda 36 (36) Eikenella corrodens 37 (37) Enterobacter a) aerogenes/cloacae b) spp 38 (38) Enterococcus a) faecalis b) faecium c) spp 39 (39) Ehrlichia a) sennetsu b) spp 40 (40) Erysipelothrix tonsillarum 41 (41) Escherichia a) coli b) coli entérohémorragique ECPV (EHEC) c) coli entéroinvasif — EIEC d) coli entéropathogène — ETEC 42 (42) Eubacterium suis@ 43 (43) Fluoribacter bozemaniae 44 (44) Francisella a) novicida b) philomiragia 45 (45) Fusobacterium a) necrophorum b) spp 46 (46) Gardnerella vaginalis 47 (47) Gordonia spp 48 (48) Haemophilus a) ducreyi b) influenzae c) influenzaemurium@ d) paragallinarum@ e) parainfluenzae f) parasuis@ g) piscium@ h) somnus@ i) spp 49 (49) Helicobacter a) cinaedi b) felis@ c) fennelliae d) mustelae@ e) nemestrinae@ f) pullorum g) pylori 50 (50) Hemobartonella felis@ 51 (51) Kingella kingae 52 (52) Klebsiella a) granulomatis b) oxytoca c) pneumoniae d) spp 53 (53) Lactococcus garvieae 54 (54) Lawsonia intracellularis@ 55 (55) Legionella a) micdadei b) pneumophilia c) spp 56 (56) Leptospira a) bratislava b) canicola/copenhageni c) grippotyphosa d) hardjo e) icterohaemorrhagiae f) interrogans g) pomona h) sejroe i) var ballum 57 (57) Listeria a) ivanovii@ b) monocytogenes c) spp 58 (58) Mannheimia haemolytica 59 (59) Moraxella a) bovis@ b) caprae c) catarrhalis d) lacunata e) phenylpyruvica f) spp 60 (60) Morganella morganii 61 (61) Mycobacterium a) africanum b) asiaticum c) avium complexe d) avium/intracellulare e) bovis f) bovis (BCG) g) chelonae h) fortuitum i) kansasii j) leprae k) malmoense l) marinum m) microti n) paratuberculosis o) scrofulaceum p) simiae q) szulgai r) ulcerans s) xenopi 62 (62) Mycoplasma a) caviae b) hominis c) pneumoniae d) spp, sauf mycoides 63 (63) Neisseria a) elongata b) gonorrhoeae c) meningitidis d) spp 64 (64) Neorickettsia helminthoeca@ 65 (65) Nocardia a) asteroides b) brasiliensis c) caviae d) farcinica e) nova f) otitidis-caviarum g) pseudobrasiliensis h) spp i) transvalensis 66 (66) Ochrobactrum spp 67 (67) Oligella spp 68 (68) Ornithobacterium rhinotracheale@ 69 (69) Pandoracea spp 70 (70) Pantoea agglomerans 71 (71) Pasteurella a) aerogenes b) anatipestifer@ c) caballi@ d) canis e) dagmatis f) granulomatis@ g) haemolytica h) multocida (sérotypes B:2 et E:2) i) multocida, sauf les sérotypes B:2 et E:2 j) multocida, sous-espèce gallicida k) multocida, sous-espèce multocida l) multocida, sous-espèce septica m) pneumotropica n) spp 72 (72) Peptostreptococcus a) anaerobius b) indolicus@ c) spp 73 (73) Plesiomonas shigelloides 74 (74) Porphyromonas spp 75 (75) Prevotella a) melaninogenica b) spp 76 (76) Propionibacterium proprionicum 77 (77) Proteus a) mirabilis b) penneri c) spp d) vulgaris 78 (78) Providencia a) alcalifaciens b) rettgeri c) spp 79 (79) Psychrobacter a) immobilis b) phenylpyruvicus 80 (80) Pseudomonas a) aeruginosa b) spp 81 (81) Ralstonia spp 82 (82) Rhodococcus a) equi b) spp 83 (83) Rickettsia a) akari b) australis c) canadensis d) conorii e) helvetica f) montanensis g) parkeri h) rhipicephali i) spp, sauf prowazekii et rickettsii j) tsutsugamuchi k) typhi (mooseri) 84 (84) Rothia a) dentocarosia b) mucilagenous 85 (85) Salmonella a) abortus equi b) abortus ovis c) agona d) anatum e) arizonae f) choleraesuis g) derby h) dublin i) enteritidis j) gallinarum@ k) heidelberg l) montevideo m) newport n) (autres sérovars) o) paratyphi A, B et C p) pullorum@ q) spp r) typhi s) typhimurium t) typhisuis@ 86 (86) Serpulina spp 87 (87) Serratia a) liquefaciens b) marcescens 88 (88) Shigella a) boydii b) dysenteriae (autres que le Type 1) c) flexneri d) sonnei 89 (89) Staphylococcus a) aureus b) aureus (MRSA) c) epidermidis d) intermedius@ 90 (90) Stenotrophomonas maltophilia 91 (91) Streptobacillus a) moniliformis b) spp 92 (92) Streptococcus a) agalactiae@ b) bovis@ c) dysgalactiae@ d) equi@ e) pneumoniae f) pyogenes g) spp h) suis i) uberis@ 93 (93) Taylorella equigenitalis@ 94 (94) Treponema a) carateum b) pallidum c) pertenue d) spp e) vincentii 95 (95) Tsukamurella spp 96 (96) Ureaplasma urealyticum 97 (97) Vagococcus salmoninarum@ 98 (98) Vibrio a) cholerae b) parahaemolyticus c) spp d) vulnificus 99 (99) Yersinia a) enterocolitica b) pseudotuberculosis c) ruckeri@ Champignons