第1憲兵隊管区:近衛師管、第1師管
第2憲兵隊管区:第2師管
第3憲兵隊管区:第3師管
第4憲兵隊管区:第4師管
第5憲兵隊管区:第5師管
第6憲兵隊管区:第6師管
第7憲兵隊管区:第7師管
第8憲兵隊管区:第8師管
第9憲兵隊管区:第9師管
第10憲兵隊管区:第10師管
第11憲兵隊管区:第11師管
第12憲兵隊管区:第12師管
第13憲兵隊管区:台湾守備混成第一旅団守備管区
第14憲兵隊管区:台湾守備混成第二旅団守備管区
第15憲兵隊管区:台湾守備混成第三旅団守備管区

憲兵司令部
憲兵司令官:少将若しくは憲兵大佐
憲兵副官:憲兵少佐、憲兵大尉、中尉
軍吏
書記:憲兵下士、軍吏部下士若しくは判任文官

憲兵隊第1乃至第12
本部
憲兵隊長:憲兵中、少佐、大尉
憲兵副官:憲兵中尉
軍吏
書記:憲兵下士、軍吏部下士

分隊
本部
憲兵分隊長:憲兵大、中尉
憲兵分隊副官:憲兵中、少尉
書記:憲兵下士
伍
憲兵伍長:憲兵曹長、一等軍曹
憲兵上等兵

憲兵隊第13乃至第15
本部
憲兵隊長:憲兵大、中佐
憲兵副官:憲兵大、中尉
軍医
獣医
軍吏
書記:憲兵下士、軍吏部下士
看護長
蹄鉄工長(下)長

分隊
憲兵分隊長:憲兵大尉
憲兵分隊副長:憲兵中尉
軍医
書記:憲兵下士
看護長
伍
憲兵伍長:憲兵下士
憲兵上等兵

明治32年(1899年) 
明治32年(1899年)9月11日勅令381号憲兵条令改正によって憲兵管区が15となる。

第1憲兵隊管区:第1師管
第2憲兵隊管区:第2師管
第3憲兵隊管区:第3師管
第4憲兵隊管区:第4師管
第5憲兵隊管区:第5師管(徳島県板野郡鳴門村、瀬戸村、撫養村、里浦村、大津村、北灘村を追加)
第6憲兵隊管区:第6師管
第7憲兵隊管区:第7師管
第8憲兵隊管区:第8師管
第9憲兵隊管区:第9師管
第10憲兵隊管区:第10師管
第11憲兵隊管区:第11師管(愛媛県越智郡西伯方村、盛口村、瀬戸崎村、大山村、宮窪村、津倉村、亀山村、鏡村、宮浦村、岡山村、関前村、波方村、波止濱村、近見村、今治村、日吉村、立花村、冨田村、櫻井村、下朝倉村、清水村、鴨部村、九和村、日高村、乃万村、大井村、小西村を追加)(徳島県板野郡鳴門村、瀬戸村、撫養町、里浦村、大津村、北灘村、愛媛県越智郡西伯方村、盛口村、瀬戸崎村、大山村、宮窪村、津倉村、亀山村、鏡村、宮浦村、岡山村、関前村、波方村、波止濱村、近見村、今治町、日吉村、立花村、冨田村、櫻井村、下朝倉村、清水村、鴨部村、九和村、日高村、乃万村、大井村、小西村を除く)
第12憲兵隊管区:第12師管
第13憲兵隊管区:台湾守備混成第一旅団守備管区
第14憲兵隊管区:台湾守備混成第二旅団守備管区
第15憲兵隊管区:台湾守備混成第三旅団守備管区

憲兵司令部
憲兵司令官:少将若しくは憲兵大佐
憲兵副官:憲兵少佐、憲兵大尉、中尉
軍吏
書記:憲兵下士、軍吏部下士若しくは判任文官

憲兵隊第1乃至第12
本部
憲兵隊長:憲兵中、少佐、大尉
憲兵副官:憲兵中尉
軍吏
書記:憲兵下士、軍吏部下士

分隊
本部
憲兵分隊長:憲兵大、中尉
憲兵分隊副官:憲兵中、少尉
書記:憲兵下士
班
憲兵班長:憲兵曹長、一等軍曹
憲兵上等兵

憲兵隊第13乃至第15
本部
憲兵隊長:憲兵大、中佐
憲兵副官:憲兵大、中尉
軍医
獣医
軍吏
書記:憲兵下士、軍吏部下士
看護長
蹄鉄工長(下)長

分隊
憲兵分隊長:憲兵大尉
憲兵分隊副長:憲兵中尉
軍医
書記:憲兵下士
看護長
班
憲兵班長:憲兵下士
憲兵上等兵

憲兵隊長は第1第5第12乃至第15憲兵隊を通して二名限り憲兵大佐を以て之に充つることを得。

明治33年(1900年)当時 
明治33年(1900年)5月30日勅令第250号憲兵条令改正

第1憲兵隊管区:第1師管
第2憲兵隊管区:第2師管
第3憲兵隊管区:第3師管
第4憲兵隊管区:第4師管
第5憲兵隊管区:第5師管(徳島県板野郡鳴門村、瀬戸村、撫養村、里浦村、大津村、北灘村を追加)
第6憲兵隊管区:第6師管(佐賀県西松浦郡曲川村、大山村、二里村、東山代村、有田村を追加)
第7憲兵隊管区:第7師管
第8憲兵隊管区:第8師管
第9憲兵隊管区:第9師管
第10憲兵隊管区:第10師管
第11憲兵隊管区:第11師管(愛媛県越智郡西伯方村、盛口村、瀬戸崎村、大山村、宮窪村、津倉村、亀山村、鏡村、宮浦村、岡山村、関前村、波方村、波止濱村、近見村、今治村、日吉村、立花村、冨田村、櫻井村、下朝倉村、清水村、鴨部村、九和村、日高村、乃万村、大井村、小西村を追加)(徳島県板野郡鳴門村、瀬戸村、撫養町、里浦村、大津村、北灘村、愛媛県越智郡西伯方村、盛口村、瀬戸崎村、大山村、宮窪村、津倉村、亀山村、鏡村、宮浦村、岡山村、関前村、波方村、波止濱村、近見村、今治町、日吉村、立花村、冨田村、櫻井村、下朝倉村、清水村、鴨部村、九和村、日高村、乃万村、大井村、小西村を除く)
第12憲兵隊管区:第12師管(佐賀県西松浦郡曲川村、大山村、二里村、東山代村、有田村を除く)
第13憲兵隊管区:台湾守備混成第一旅団守備管区
第14憲兵隊管区:台湾守備混成第二旅団守備管区
第15憲兵隊管区:台湾守備混成第三旅団守備管区

憲兵司令部
憲兵司令官:少将若しくは憲兵大佐
憲兵副官:憲兵少佐、憲兵大尉、中尉
軍吏
書記:憲兵下士、計手若しくは判任文官

憲兵隊第1乃至第12
本部
憲兵隊長:憲兵中、少佐、大尉
憲兵副官:憲兵中尉
軍吏
書記:憲兵下士、計手

分隊
本部
憲兵分隊長:憲兵大、中尉
憲兵分隊副官:憲兵中、少尉
書記:憲兵下士
班
憲兵班長:憲兵曹長、軍曹
憲兵上等兵

憲兵隊第13乃至第15
本部
憲兵隊長:憲兵大、中佐
憲兵副官:憲兵大、中尉
軍医
獣医
軍吏
書記:憲兵下士、計手
看護長
蹄鉄工長

分隊
憲兵分隊長:憲兵大尉
憲兵分隊副長:憲兵中尉
軍医
書記:憲兵下士
看護長

班
憲兵班長:憲兵下士
憲兵上等兵

憲兵隊長は第1第5第12乃至第15憲兵隊を通して二名限り憲兵大佐を以て之に充つることを得。

明治34年(1901年)当時 
明治34年(1901年)4月8日勅令第29号憲兵条令改正

憲兵隊第1乃至第12
本部
憲兵隊長:憲兵中、少佐、大尉
憲兵隊副官:憲兵中尉
憲兵隊附:憲兵中、少尉
軍吏
書記:憲兵下士、計手
分隊
本部
憲兵分隊長:憲兵大、中尉
書記:憲兵下士
班
憲兵班長:憲兵曹長、軍曹
憲兵下士、上等兵

憲兵隊第13乃至第15
本部
憲兵隊長:憲兵中、少佐
憲兵隊副官:憲兵大、中尉
憲兵隊附:憲兵隊、中尉
軍医
獣医
軍吏
書記:憲兵下士、計手
看護長
蹄鉄工長

分隊
憲兵分隊長:憲兵、中大尉
書記:憲兵下士

班
憲兵班長:憲兵曹長、軍曹
憲兵下士、上等兵

明治35年(1902年)当時 
明治35年(1902年)10月13日勅令第223号憲兵条令改正

憲兵司令部
憲兵司令官:少将若しくは憲兵大佐
憲兵副官:憲兵少佐、憲兵大尉、中尉
副監督
書記:憲兵下士、計手若しくは判任文官

憲兵隊第1乃至第12
本部
憲兵隊長:憲兵中、少佐、大尉
憲兵隊副官:憲兵中尉
憲兵隊附:憲兵中、少尉
副監督
書記:憲兵下士、計手

分隊
本部
憲兵分隊長:憲兵大、中尉
書記:憲兵下士
班
憲兵班長:憲兵特務曹長、曹長、軍曹
憲兵下士、上等兵

憲兵隊第13乃至第15
本部
憲兵隊長:憲兵中、少佐
憲兵隊副官:憲兵大、中尉
憲兵隊附:憲兵隊、中尉
軍医
獣医
上等計手
書記:憲兵下士、計手
看護長
蹄鉄工長

分隊
憲兵分隊長:憲兵、中大尉
書記:憲兵下士
班
憲兵班長:憲兵曹長、軍曹
憲兵下士、上等兵

明治36年(1903年)当時 
明治36年(1903年)3月26日勅令第58号憲兵条令改正

憲兵司令部
憲兵司令官
憲兵副官
憲兵下士

憲兵隊
憲兵隊長
憲兵副官
憲兵分隊長
憲兵隊附士官
憲兵准士官、下士、上等兵
※憲兵司令部及憲兵隊には経理部、衛生部及獣医部士官、准士官、下士、判任文官竝蹄鉄工長を附することを得。

第1憲兵隊管区:第1師管
第2憲兵隊管区:第2師管
第3憲兵隊管区:第3師管
第4憲兵隊管区:第4師管及第11師管内徳島県板野郡
第5憲兵隊管区:第5師管及第11師管内愛媛県越智郡
第6憲兵隊管区:第6師管
第7憲兵隊管区:第7師管
第8憲兵隊管区:第8師管
第9憲兵隊管区:第9師管
第10憲兵隊管区:第10師管
第11憲兵隊管区:第11師管
第12憲兵隊管区:第12師管

明治38年(1905年)当時 
明治38年(1905年)9月6日勅令208号「乘馬兵科ノ者ヲシテ憲兵ノ勤務ヲ補助セシムルノ件」(『法令全書』)
第一條 衞戍總督又ハ衞戍司令官ハ乘馬兵科ノ者ヲ憲兵司令官、憲兵隊長若ハ憲兵分隊長ノ指揮ニ屬シ憲兵ノ勤務ヲ補助セシムルコトヲ得
第二條 憲兵ノ勤務ヲ補助スル者ニ付テハ憲兵條例ヲ準用ス
第三條 憲兵ノ勤務ヲ補助スル者ノ服裝ハ當該兵科ノ者ニ異ルコトナシ但シ腕ニ赤布ヲ纏フ

明治39年(1906年)当時 
明治39年(1906年)2月8日勅令第18号により、韓国に駐箚する憲兵は軍事警察の外行政警察及司法警察を掌る但し行政警察及司法警察に付いては統監の指揮を受く。

明治40年(1907年)当時 
東京憲兵隊管区:第1師管
仙台憲兵隊管区:第2師管
名古屋憲兵隊管区:第3師管
大阪憲兵隊管区:第4師管及第11師管内徳島県板野郡
広島憲兵隊管区:第5師管及第11師管内愛媛県越智郡
熊本憲兵隊管区:第6師管
旭川憲兵隊管区:第7師管
弘前憲兵隊管区:第8師管
金沢憲兵隊管区:第9師管
姫路憲兵隊管区:第10師管
善通寺憲兵隊管区:第11師管
小倉憲兵隊管区:第12師管
高田憲兵隊管区:第13師管
宇都宮憲兵隊管区:第14師管
豊橋憲兵隊管区:第15師管
京都憲兵隊管区:第16師管
岡山憲兵隊管区:第17師管
久留米憲兵隊管区:第18師管
台湾憲兵隊管区:台湾
韓国駐剳憲兵隊管区:韓国
関東憲兵隊管区:南満州

明治40年(1907年)10月7日勅令323号により、韓国駐剳憲兵隊令が出る。
第一條 韓国に駐箚する憲兵は主として治安維持に関する警察を掌り其の職務の執行に付統監に隷し又韓国駐剳司令官の指揮を承け兼ねて軍警察を掌る
第二條 憲兵隊本部の位置並分隊の配置及其の管区は統監之を定む
第三條 統監は必要に際し一時憲兵隊の一部を其の管区外に派遣することを得
第四條 憲兵の服務に関する規定は統監之を定む但し其の軍事警察に係るものは韓国駐剳軍司令官之を定む
第五條 前諸條の規定の外韓国に駐箚する憲兵に付いては憲兵条令による

明治43年(1910年)以降 
「朝鮮駐箚憲兵条例」(明治43年勅令第343号)が制定され、朝鮮駐箚憲兵に関する配置等が定まった。