2014年(平成26年)4月に募集停止、2017年(平成29年)3月末に廃止)
 スポーツ健康科学コース
 消費生活科学コース

医学部
医学科
学科目:解剖学、生化学、生理学、病理学、薬理学、分子病態学、微生物学、免疫学、医動物学、衛生学、公衆衛生学、法医学、医学医療教育学、内科学、神経内科学、家庭医療学、精神神経科学、小児科学、皮膚科学、放射線医学、検査医学 、薬剤学、外科学、産科婦人科学、脳神経外科学、整形外科学、泌尿器科学、眼科学、耳鼻咽喉科学、口腔外科学、麻酔科学、救急災害医学
看護学科
講座:基礎看護学、成人・精神看護学、母性・小児看護学、地域・老年看護学

工学部
機械工学科
講座:量子・電子機械、機能加工、環境エネルギー
電気電子工学科
講座:電気システム工学、情報・通信システム工学、電子物性工学
分子素材工学科
講座:分子設計化学、生物機能工学、素材化学
建築学科
講座:建築デザイン、建築マネジメント
情報工学科
講座:コンピュータサイエンス、知能工学
物理工学科
講座:量子工学、ナノ工学

生物資源学部
資源循環学科
2015年度入学生以降
農林生物学教育コース
農業生物学講座
森林資源環境学講座
国際開発資源学教育コース
国際・地域資源学講座
共生環境学科
2015年度入学生以降
地球環境システム学教育コース
地球システム学講座
環境情報システム工学講座
地球環境デザイン学教育コース
農業農村工学講座
生物圏生命科学科
2015-16年度入学生
応用生命化学教育コース
海洋生物科学教育コース
2017年入学生以降
生命機能化学教育コース
生命機能化学講座
海洋分子生命化学教育コース
海洋生命分子化学講座
海洋生物資源学科(2017年度設置)
海洋生物科学教育コース

研究科 
修士(博士前期)課程
人文社会科学研究科
地域文化論専攻
地域社会文化論専修
地域言語文化専修
社会科学専攻
地域行政政策専修
地域経営法務専修
教育学研究科
教育科学専攻
学校教育領域
分野:学校教育
特別支援教育領域
分野:特別支援教育
人文・社会系教育領域
分野:国語教育学、国語学、国文学、社会科教育、歴史・思想学、地域科学、英語科教育、英語学、英米文学
理数・生活系教育領域
分野:数学科教育、代数学、幾何学、解析学、応用数学、理科教育、物理学、化学、生物学、地学、技術科教育、技術学、家庭科教育、家政学
芸術・スポーツ系教育領域
分野:音楽科教育、器楽、声楽、作曲・指揮法、美術科教育、美術、保健体育科教育、体育・スポーツ学、運動学、学校保健
教職実践高度化専攻(教職大学院、2017年度に設置)
学校経営力開発コース
教育実践力開発コース
医学系研究科
医科学専攻(2年制)
看護学専攻(2年制)
基盤看護学領域
教育研究分野:看護教育学、実践基礎看護学
実践看護学領域
教育研究分野:がん看護学、成人看護学、母性看護・助産学、小児看護学、老年看護学
広域看護学領域
教育研究分野:精神看護学、ストレス健康科学、地域看護学
工学研究科
機械工学専攻
量子・電子機械講座
教育研究分野:量子物性工学、メカトロニクス、システム設計、生体システム工学
機能加工講座
教育研究分野:材料機能設計、集積加工システム、プロセス解析
環境エネルギー講座
エネルギー環境工学、エネルギーシステム設計、流動現象学
電気電子工学専攻
電気システム工学講座
教育研究分野:電機システム、制御システム、エネルギーシステム
情報・通信システム工学講座
教育研究分野:情報処理、通信工学、計算機工学
電子物性工学講座
教育研究分野:オプトエレクトロニクス、有機エレクトロニクス、量子エレクトロニクス
分子素材工学専攻
分子設計化学講座
教育研究分野:高分子設計化学、有機精密化学、有機機能化学、計算化学
生物機能工学講座
教育研究分野:エネルギー変換化学、レーザー光化学、分析環境化学、分子生物工学
素材化学講座
教育研究分野:有機素材化学、無機素材化学、生体材料化学
建築学専攻
建築デザイン講座
教育研究分野:建築・地域デザイン、環境・設備デザイン
建築マネジメント講座
教育研究分野:建築・地域マネジメント、構造マネジメント
情報工学専攻
コンピュータサイエンス講座
教育研究分野:コンピュータソフトウェア、コンピュータアーキテクチャ、コンピュータネットワーク
知能工学講座
教育研究分野:パターン情報処理、人間情報学、ヒューマンインタフェース
物理工学専攻
量子工学講座
教育研究分野:量子物理学、物性物理学
ナノ工学講座
教育研究分野:ナノデザイン、ナノセンシング、ナノエレクトロニクス、ナノプロセッシング
生物資源学研究科
資源循環学専攻
農業生物学講座
教育研究分野:分子遺伝育種学、資源作物学、園芸植物機能学、動物生産学、草地・飼料生産学、植物医科学、昆虫生態学、野菜ゲノム育種学
森林資源環境学講座
教育研究分野:森林保全生態学、森林微生物学、土壌圏生物機能学、森林環境砂防学、森林利用学、木質資源工学、木質分子素材制御学
国際・地域資源学講座
教育研究分野:生物資源経済学、循環経営社会学、資源経済システム学、国際資源植物学、国際資源利用学
共生環境学専攻
地球システム学
教育研究分野:気象・気候ダイナミクス、気象解析予測学、海洋気候学、未来海洋予測学、地球システム進化学、土壌圏システム学、フードシステム学、水環境・自然災害科学、緑環境計画学、環境解析学、自然共生学
環境情報システム工学
教育研究分野:応用環境情報学、生産環境システム学、生物環境制御学、エネルギー利用工学
農業農村工学
教育研究分野:応用地形学、土資源工学、水資源工学、農地工学、環境施設工学、国際環境保全学、土壌圏循環学、フューチャー・アース学
生物圏生命科学専攻
生命機能化学講座
教育研究分野:分子細胞生物学、分子生物情報学、生理活性化学、創薬化学、生物機能化学、生物制御生化学、食品生物情報工学、食品化学、応用微生物学、微生物遺伝学、栄養化学、食品発酵学
海洋生命分子化学講座
教育研究分野:海洋生物化学、水圏生物利用学、水圏材料分子化学、生物物性学、生体高分子化学、海洋微生物学、水産物品質学、海洋食糧化学
海洋生物学講座
教育研究分野:生物海洋学、水族生理学、藻類学、浅海増殖学、先端養殖管理学、魚類増殖学、海洋生態学、水圏資源生物学、水圏分子生態学、海洋個体群動態学、応用行動学、発生・代謝機能解析学
地域イノベーション学研究科
地域イノベーション学専攻
先端融合工学ユニット
総合バイオサイエンスユニット

博士(後期)課程
医学系研究科
生命医科学専攻(4年制)
基礎医学系講座(20教育研究分野)
基礎医学系講座(32教育研究分野)
産学連携講座
遺伝子・免疫細胞治療学、臨床創薬研究学、先進的脳血管内治療学、システムズ薬理学
寄附講座
認知症医療学、先進医療外科学、スポーツ整形外科学、脊椎外科・医用工学、先進画像診断学、先進がん治療学
未来医療研究人材養成拠点形成事業
地域医療学講座
工学研究科
専攻
材料科学専攻
システム工学専攻
講座
材料物性講座
教育研究分野:力学物性、機能加工、材料機能設計、電子物性、電子材料、電子デバイス
材料化学講座
教育研究分野:有機精密化学、機能変換化学、機能システム計測、生体機能化学、機能高分子化学、先端素材化学
電気情報システム講座
教育研究分野:情報処理、知能情報システム、情報通信システム、電気制御システム
設計システム講座
教育研究分野:環境エネルギー機械、エネルギーシステム設計、知能化・電子機械、建築都市計画システム、建築環境設備システム、建築構造システム
循環システム設計講座
教育研究分野:循環システム
生物資源学研究科
専攻
資源循環学専攻
資源循環システム科学講座
教育研究分野:食料生産科学、森林資源環境学
国際資源循環科学講座
教育研究分野:国際資源循環科学
共生環境学専攻
気象・地球システム学講座
教育研究分野:大気海洋地球学、流域環境創成学、地球環境解析学
環境・生産科学講座
教育研究分野:環境情報システム工学、地域保全工学、生態系循環システム学
生物圏生命科学専攻
応用生命化学講座
教育研究分野:生命機能化学、海洋生命分子化学
海洋生物科学講座
教育研究分野:海洋生物学
地域イノベーション学研究科
地域イノベーション学専攻
先端融合工学ユニット
総合バイオサイエンスユニット

専攻科 
特殊教育特別専攻科

別科 
農業別科(2009年3月末廃止)

短期大学部 
医療短期大学部(2000年廃止)

附属機関 

教養教育機構
教養基盤科目部門
教養統合科目部門
医学部附属病院
生物資源学研究科附属紀伊・黒潮生命地域フィールドサイエンスセンター
付帯施設農場(津市高野尾町)
付帯施設演習林(津市美杉町)
付帯施設水産実験所(三重県志摩市志摩町和具座賀島)
生物資源学研究科附属練習船「勢水丸」(三重県松阪市松阪港)
教育学部附属教育実践総合センター
地域イノベーション学研究科 地域イノベーション・コアラボ
附属図書館
保健管理センター
学内共同教育研究施設
社会連携研究センター
社会連携研究室
キャンパス・インキュベータ
四日市フロント
地域戦略センター
地域圏防災・減災研究センター
知的財産統括室
新産業創成研究拠点
研究展開支援拠点
機器分析部門
地域研究支援部門
伊賀研究拠点
生命科学研究支援センター
機能ゲノミクス分野
ナノ・バイオイメージング分野
総合アイソトープ分野
国際交流センター
総合情報処理センター
高等教育創造開発センター
学生総合支援センター
学生生活支援室
障害学生支援室
学生なんでも相談室
キャリア支援センター
ピアサポーター学生委員会
国際環境教育研究センター

教育 
現代的教育ニーズ取組支援プログラム
平成18年度) 教育実践力の育成と学校・地域の活性化
平成16年度 全学的な知的財産創出プログラムの展開
特色ある大学教育支援プログラム
平成16年度 社会のニーズに即した人間性豊かな医師養成-地域社会を学びの場にして-
派遣型高度人材育成協同プラン
平成17年度 地域圏バイオ・メディカル創業人材の育成

研究 
21世紀COEプログラムの採択はない。