Mogi, K. (2014) Free will and paranormal beliefs. Frontiers in Psychology 5, 00281. doi: 10.3389/fpsyg.2014.00281 PDF
 Mogi, K. (2013) Cognitive factors correlating with the metacognition of the phenomenal properties of experience. Scientific Reports 3, Article number: 3354 Full Text

学会報告

単著 
 『脳とクオリア―なぜ脳に心が生まれるのか』日経サイエンス社、1997年、講談社学術文庫、2019年 ISBN 4065176654
 『生きて死ぬ私―脳科学者が見つめた『人間存在』のミステリー』徳間書店、1998年、ちくま文庫、2006年 ISBN 978-4480422187
 『心が脳を感じるとき』講談社、1999年、新版「クオリア入門」ちくま学芸文庫、2006年3月 ISBN 978-4062092449
 『心を生みだす脳のシステム―「私」というミステリー』日本放送出版協会、2001年 ISBN 978-4480089830
 『意識とはなにか―「私」を生成する脳』ちくま新書、2003年 ISBN 4480061347
 『脳と仮想』新潮社 2004年、新潮文庫、2007年 ISBN 978-4101299525
 『脳内現象 - 〈私〉はいかに創られるか』NHK出版、2004年 ISBN 978-4140910023
 『脳の中の小さな神々』柏書房、2004年 ISBN 978-4760125722
 『脳と創造性 「この私」というクオリアへ』PHP研究所、2005年 ISBN 978-4569633534
 『クオリア降臨』文藝春秋、2005年 「脳のなかの文学」文庫 ISBN 978-4163677309
 『脳の中の人生』中公新書ラクレ、2005年 ISBN 978-4121502001
 『「脳」整理法』ちくま新書、2005年 ISBN 978-4121502001
 『クオリア入門―心が脳を感じるとき』筑摩書房、2006年 ISBN 978-4480089830
 『脳を鍛える!ケータイでできるみんなの脳力トレーニング』ローカス、2006年 ISBN 978-4898146897
 『プロセス・アイ』徳間書店、2006年 のち文庫 ISBN 978-4198621032
 『ひらめき脳』新潮新書、2006年 ISBN 978-4106101625
 『生きて死ぬ私』筑摩書房、2006年 ISBN 978-4480422187
 『食のクオリア』青土社、2006年 ISBN 978-4791762767
 『やわらか脳―茂木健一郎「クオリア日記」』徳間書店、2006年
「脳がひらめく生き方 窮地をチャンスに変える」5次元文庫marginal ISBN 978-4198622589
 『すべては脳からはじまる』中公新書ラクレ、2006年 ISBN 978-4121502339
 『天才論 -ダ・ヴィンチに学ぶ「総合力」の秘訣』朝日選書、2007年 ISBN 978-4022599186
 『芸術の神様が降りてくる瞬間』光文社、2007年 ISBN 978-4334975265
 『欲望する脳』集英社新書、2007年 ISBN 978-4087204186
 『感動する脳』PHP研究所 2007 のち文庫
 『芸術脳』新潮社 2007 のち文庫
 『それでも脳はたくらむ』中公新書ラクレ、2007年 ISBN 978-4121502643
 『脳を活かす勉強法 - 奇跡の「強化学習」』PHP研究所、2007年 のち文庫 ISBN 978-4569696799
 『すべては音楽から生まれる - 脳とシューベルト』PHP新書、2007年 ISBN 978-4569696249
 『思考の補助線』ちくま新書、2008年 ISBN 978-4480064158
 『トゥープゥートゥーのすむエリー星』井上智陽絵 毎日新聞社、2008年 ISBN 978-4620107240
 「トゥープゥートゥーに会える星」小学館文庫
 『ひらめきの導火線 -トヨタとノーベル賞』PHP新書、2008年 ISBN 978-4569701127
 『脳を活かす仕事術 - 「わかる」を「できる」に変える』PHP研究所、2008年 「ひらめきをカタチに変える58の方法」文庫 ISBN 978-4569701936
 『クオリア立国論』ウェッジ、2008
 『「赤毛のアン」に学ぶ幸福になる方法』講談社文庫、2008年 ISBN 978-4062762328
 『セレンディピティの時代 偶然の幸運に出会う方法』講談社文庫、2009年 ISBN 978-4062763912
 『脳はもっとあそんでくれる』中公新書ラクレ 2008
 『あなたにもわかる相対性理論』PHPサイエンス・ワールド新書 2009
 『あるとき脳は羽ばたく』中公新書ラクレ 2009
 『偉人たちの脳 文明の星時間』毎日新聞社 2009
 『今、ここからすべての場所へ』筑摩書房 2009
 『音楽の捧げもの ルターからバッハへ』PHP新書 2009
 『カラヤン 音楽が脳を育てる』世界文化社 2009
 『クオリア・テクニカの世界』ネイチャーインタフェイス 2009
 『化粧する脳』集英社新書 2009
 『疾走する精神 「今、ここ」から始まる思想』中公新書 2009
 『脳を活かす生活術 希望の道具箱』PHP研究所 2009
 『脳を鍛える読書のしかた。 文章を読んで、聴いて、書けば、脳は成長する! 45分でわかる!』マガジンハウス 2009
 『脳が変わる生き方 人はどこまでも成長できる』PHPエディターズ・グループ 2009 のち文庫
 『脳で旅する日本のクオリア』小学館 2009
 『脳の饗宴』青土社 2009
 『脳は0.1秒で恋をする 「赤い糸」の科学』PHP研究所 2009
 『笑う脳』アスキー新書 2009
 『mogidas 茂木健一郎の頭の中身、ぜんぶ。』マガジンハウス 2010
 『アタマがよくなる勉強会』2時間でいまがわかる! アスコム 2010
 『人生が驚くほど変わる龍馬脳のススメ』主婦と生活社 2010
 『生命と偶有性』新潮社 2010
 『世界一自由な脳のつくり方 右脳と左脳のサイクルが回り出す脳の強化学習』かんき出版 2010
 『脳を活かす勉強法 奇跡の強化学習 マンガでやる気アップ!』PHP研究所 2010
 『脳をやる気にさせるたった1つの習慣 なぜやりたいことを書き出すと実現するのか?』ビジネス社 2010
 『脳が変わる考え方 もっと自由に生きる54のヒント』PHPエディターズ・グループ 2010
 『脳がヨロコブ生き方 楽しめばすべてがうまく行く』ヒカルランド 超☆サプライズ 2010
 『脳がよろこぶ話 幸せを見つける五つの対話』朝日新聞出版 2010
 『ひとり遊びのススメ』講談社 15歳の寺子屋 2010
 『ピンチに勝てる脳』集英社 2010 のち文庫
 『文明の星時間』毎日新聞社 2010
 『未来を変える議論をしよう』ポプラ社 2010
 『茂木健一郎の脳力のヒミツ!』中経出版 2010
 『モギケンの英語シャワーBOX 実践版』STEP1~3 朝日出版社 2010
 『「読む、書く、話す」脳活用術 日本語・英語学習法』PHP研究所 2010
 『アウェー脳を磨け! 一歩踏み出せば脳は目覚める』廣済堂あかつき出版事業部 2011
 『奇跡の脳の物語 キング・オブ・サヴァンと驚異の復活脳』廣済堂新書 2011
 『どうすれば頭がよくなりますか? 13歳からの進路脳』世界文化社 2011
 『脳に奇跡を起こすネットアスリートの時間術』PHP研究所 2011
 『脳の王国』小学館 2011
 『僕たちは美しく生きていけるのだろうか。』幻冬舎 2011
 『モギケンの音楽を聴くように英語を楽しもう!』朝日出版社 2011
 『国がダメでも「脳」がある 自分を"高度成長"させる55のヒント』朝日新聞出版 2011
 『心と脳に効く名言 言葉と測りあうために』PHP研究所 2011
 『島国日本の脳をきたえる 島からの思索』東京書籍 2011
 『青春の翻訳法 文明の星時間 3』毎日新聞社 2011
 『漱石に学ぶ心の平安を得る方法』講談社文庫 2011
 『挑戦する脳』集英社新書 2012
 『人づきあいの流儀 脳は「見た目」で選ばない』成美文庫 2012
 『脳と心の整理術 忘れるだけでうまくいく』PHP研究所 2012 のち文庫
 『『モナ・リザ』に並んだ少年 西洋絵画の巨匠たち』小学館101ビジュアル新書 2012
 『「赤毛のアン」が教えてくれた大切なこと』PHP研究所 心の友だち 2013
 『新しい日本の愛し方』新潮新書 2013
 『金持ち脳と貧乏脳 脳とお金のただならぬ関係』総合法令出版 2013
 『考える脳 偶然を幸福に変えるヒント150』PHP研究所 2013
 『幸福になる「脳の使い方」』PHP新書 2013
 『図解脳を活かす勉強法』PHP研究所 2013
 『創造する脳』PHPエディターズ・グループ 2013
 『脳を活かす伝え方、聞き方』PHP新書 2013
 『脳を最高に活かせる人の朝時間 頭も心もポジティブに!!』すばる舎 2013 のち河出文庫
 『脳が冴える快眠法 人生がうまくいく「質の高い睡眠習慣」のつくり方』日本能率協会マネジメントセンター 2013
 『「赤毛のアン」で英語づけ』夜間飛行 2014
 『男脳と女脳 人間関係がうまくいく脳の活用術』総合法令出版 2014
 『加賀屋さんに教わったおもてなし脳』PHP研究所 2014
 『この法則でゾーンに入れる! 集中「脳」のつくり方』朝日出版社 2014
 『入社1年目から伸びる脳(やつ)、伸びない脳(やつ)』きこ書房 2014
 『「超」東大脳 偏差値にとらわれない生き方』PHP研究所 2014
 『本番に強い脳をつくる』成美文庫 2014
 『脳科学者茂木健一郎の人生相談』第三文明社 2014
 『茂木健一郎の脳がときめく言葉の魔法』かんき出版 2014
 『頭は「本の読み方」で磨かれる』三笠書房 2015
 『結果を出せる人になる! 「すぐやる脳」のつくり方』学研パブリッシング 2015 ISBN 978-4054062597
 『生命と偶有性』新潮選書 2015
 『東京藝大物語』講談社 2015 のち文庫
 『もぎ塾実況ライブ! できる脳の育て方』東京書籍 2015
 『〈図解〉幸福になるすごい脳の使い方 不安、ストレスがプラスに変わる40の習慣』PHP研究所 2016
 『走り方で脳が変わる!』講談社 2016
 『もっと結果を出せる人になる!「ポジティブ脳」のつかい方』学研プラス 2016
 『最強英語脳を作る』ベスト新書 2016
 『最高の結果を引き出す質問力 その問い方が、脳を変える!』河出書房新社 2016
 『いつもパフォーマンスが高い人の脳を自在に操る習慣』日本実業出版社 2016
 『アインシュタインと相対性理論がよくわかる本』PHP文庫 2016
 『すべての悩みは脳がつくり出す』ワニブックス|PLUS|新書 2017
 『ありったけの春』夜間飛行 2017
 『IKIGAI』Astral Cultural 2018
 『ペンチメント』講談社 2018
 『これからの未来を生きる君たちへ』PHP研究所 2018
 『クオリアと人工意識』講談社現代新書 2020

共著 
 共著者:竹内薫 『トンデモ科学の世界』 徳間書店 1995 ISBN 4198604088
 『脳+心+遺伝子VS.サムシンググレート―ミレニアムサイエンス 人間とは何か』養老孟司,村上和雄,竹内薫共著 徳間書店 2000年 のち文庫 ISBN 4198611564
 共著者:天外伺朗『意識は科学で解き明かせるか―脳・意志・心に挑む物理学』講談社 2000 ISBN 4062572850
 共著者:竹内薫『脳のからくり―わくわくドキドキする脳の話』中経出版 2003 ISBN 4806118745
 共著者:養老孟司『スルメを見てイカがわかるか!』角川書店 2003 ISBN 4047041548
 共著者:田谷文彦『脳とコンピュータはどう違うか―究極のコンピュータは意識をもつか』講談社 2003 ISBN 4062574128
 2006年
 共著者:富永裕久 『目からウロコの脳科学―心と脳はここまで分かった!』 PHPエディターズグループ ISBN 4569648614
 共著者:ラケータ 『脳を鍛える!パソコンでできるみんなの脳力トレーニング』ローカス
 共著者:竹内薫『脳のからくり』新潮社 ISBN 978-4101299518
 共著者:竹内薫『異端の脳がホンモノ! 』大和書房 ISBN 978-4479300595
 『養老孟司&茂木健一郎の「天才脳」の育て方』 アスコム ISBN 4776203499
 共著者:田中洋, 電通ニューロマーケティング研究会編『欲望解剖』幻冬舎 2006 のち文庫 ISBN 4344012631
 共著者:松岡正剛『脳と日本人』文藝春秋 2007 のち文庫 ISBN 4163697101
 共著者:波頭亮『日本人の精神と資本主義の倫理』幻冬舎 2007
 共著者:江村哲二『音楽を「考える」』筑摩書房 2007年
 共著者:河合隼雄『こころと脳の対話』潮出版社 2008年 のち新潮文庫
 共著者:黛まどか『俳句脳―発想、ひらめき、美意識』角川書店 2008年 ISBN 978-4047101470
 共著者:江原啓之『偶有性幸福論(エンジン01選書)』ぴあ 2008年 ISBN 978-4835617220
 『響きあう脳と身体(からだ)』甲野善紀共著 バジリコ・木星叢書、2008 のち新潮文庫
 『涙の理由』重松清共著 宝島社 2009 のち文庫
 『女脳 ひらめきと勝負強さの秘密』矢内理絵子共著 講談社 2009
 『教養脳を磨く!』林望共著 NTT出版 2009
 『クオリア再構築 常識の壁を突き抜け、遡る5つの対論』島田雅彦共著 集英社 2009
 『熱帯の夢』中野義樹写真 集英社新書ヴィジュアル版 2009
 『脳の中にいる天才』所眞理雄共編 竹内薫訳 日経BP社 2009
 『人は死ぬから生きられる 脳科学者と禅僧の問答』南直哉共著 新潮新書 2009
 『プロフェッショナルたちの脳活用法』NHK「プロフェッショナル」制作班共編著 日本放送出版協会 生活人新書 2009
 『妄想力』関根勤共著 宝島社新書 2009
 『茂木健一郎の脳を幸せにするレシピ』海豪うるる共著 PHP研究所 2009
 『裏切りの流儀 あらゆることはバランスで成り立っている』高田純次共著 青山出版社 2010
 『言葉で世界を変えよう 万葉集から現代俳句へ』黛まどか共著 東京書籍 2010
 『幸せはすべて脳の中にある』酒井雄哉共著 朝日新書 2010
 『自分の頭で考えるということ』羽生善治共著 大和書房 2010
 『ジャパニーズウイスキー』土屋守,輿水精一共著 新潮社 とんぼの本 2010
 『茂木先生が石田純一の「幸福脳」を解剖したら』石田純一共著 講談社 2010
 『3.11以後』竹内薫共著 中公選書 2011
 『嫌われ者の流儀』堀江貴文共著 小学館 2011
 『脳を活かす子育て術 0歳からの宝探し』須藤珠水共著 PHP研究所 2010
 『脳と心 クオリアをめぐる脳科学者と精神科医の対話』斎藤環共著 双風舎 2010
 『空の智慧、科学のこころ』ダライ・ラマ十四世共著 マリア・リンチェン 訳 集英社新書 2011
 『東洋脳×西洋脳 多極化する世界で生きるヒント』加藤徹共著 中公新書ラクレ 2011
 『脳と即興性 不確実性をいかに楽しむか』山下洋輔共著 PHP新書 2011
 『まっくらな中での対話』ダイアログ・イン・ザ・ダーク共著 講談社文庫 2011
 『茂木健一郎の科学の興奮』日経サイエンス編集部共編著 日経サイエンス社 2011
 『わたしの3・11 あの日から始まる今日』編 毎日新聞社 2011
 『「すべてを引き受ける」という思想』吉本隆明共著 光文社 2012
 『突き抜ける人材』波頭亮共著 PHPビジネス新書 2012
 『貧困についてとことん考えてみた』湯浅誠共著 NHK出版新書 2012
 『「個」育て論 おぎ・もぎ対談』尾木直樹共著 青灯社 2013
 『「助けて」と言える国へ 人と社会をつなぐ』奥田知志共著 集英社新書 2013
 『メンタリズムを脳科学で解剖したらカリスマリーダーの作り方がわかった!』DaiGo共著 ヒカルランド 2013
 『お風呂と脳のいい話』山崎まゆみ共著 東京書籍 2014
 『発想の種IMAGINE』川崎健二共編著 講談社 2014
 『マネーと国家と僕らの未来』堀江貴文,金杉肇共著 廣済堂出版 2014
 『何のために「学ぶ」のか』外山滋比古,前田英樹,今福龍太,本川達雄,小林康夫,鷲田清一共著 ちくまプリマー新書 中学生からの大学講義 2015

翻訳 
 ロジャー・ペンローズ, 共訳者:竹内薫『ペンローズの量子脳理論―21世紀を動かす心とコンピュータのサイエンス』徳間書店 1997年 ISBN 4198607036 のちちくま学芸文庫 ISBN 4480090061
 ブライアン・D・ジョセフソン 共訳者:竹内薫『ノーベル賞科学者ブライアン・ジョセフソンの科学は心霊現象をいかにとらえるか』 徳間書店 1997年 ISBN 4198607028
編:ネイチャー「姉妹誌」 『生命の冒険―最先端のライフサイエンス』徳間書店 2000年 ISBN 4198611971
 ロビン・ウィルソン『四色問題』新潮社 2004年 のち文庫 ISBN 4105452010
 『オバマから子どもたちへ 対訳』監訳 『CNN English Express』編集部編 朝日出版社 2009
 ジェフ・ブラウン, マーク・フェンスク『IQより大切な「頭の使いかた』三笠書房 2010
 シンシア・グリーン編著『頭が突然鋭くなる「全脳」刺激法 頭がよくなる!すぐできる! 1健脳「食」2健脳「運動」3健脳「メントレ」 今日から、"脳にいいことづくめ"を始めよう!』イースト・プレス 2010
 『トッド・カシュダン『頭のいい人が「脳のため」に毎日していること』三笠書房 2010
 フレッド・ホイル,チャンドラ・ウィクラマシンゲ『生命・DNAは宇宙からやって来た』監訳 徳間書店 5次元文庫marginal 2010
 シャロン・ベグリー『「脳」を変える「心」 ダライ・ラマと脳学者たちによる心と脳についての対話』バジリコ 2010
 マデリン・ヴァンヘック,ケン・パラー,リサ・キャラハン,ブラッド・コラー『脳がよろこぶ仕事術』ベストセラーズ 2010
 ジョナサン・コール『顔の科学 自己と他者をつなぐもの』 監訳 恩蔵絢子訳 PHP研究所 2011
 マーシー・シャイモフ『もっと「脳にいいこと」だけをやりなさい!確実に自分を変えていく法』 三笠書房 2011 のち知的生きかた文庫
 トーマス・M・スターナー『今ここに集中すれば、人生はうまくいく!』PHPエディターズ・グループ 2013
 リチャード・デビッドソン, シャロン・ベグリー『脳には、自分を変える「6つの力」がある。