natgillin/translations-raw huggingface dataset:
Number of cells scored, number of cells with chromosomal aberrations and type of chromosomal aberrations given separately for each treated and control culture, including and excluding gaps;
För cellinjer, uppgifter om cellcykelns längd, fördubblingstid eller proliferationsindex.
changes in ploidy (polyploid cells and cells with endoreduplicated chromosomes, given separately) if seen;
Tecken på utfällning och tid för bestämningen.
concentration-response relationship, where possible;
Definition av avvikelser, inklusive luckor i DNA-strängen.
concurrent negative (solvent) and positive control data (concentrations and solvents);
Antal klassificerade celler, antal celler med kromosomavvikelser och typ av sådana avvikelser, angivna separat för varje behandlad kultur samt kontrollodling, inklusive och exklusive luckor.
historical negative (solvent) and positive control data, with ranges, means and standard deviations and 95 % control limits for the distribution, as well as the number of data;
Förändringar i ploiditet (polyploida celler och celler med endoreduplicerade kromosomer registreras separat) om sådana påvisas.
statistical analyses, p-values if any.
Koncentration-responsförhållande, där det är möjligt.
Discussion of the results.
Data om parallella negativa (lösningsmedel) och positiva kontroller (koncentrationer och lösningsmedel).
Conclusions.
Historiska negativa (lösningsmedel) och positiva kontrolldata med intervall, medelvärden, standardavvikelser och 95 %-kontrollgränser för distribution samt antalet uppgifter.
Overview of the set of OECD Genetic Toxicology Test Guidelines and updates performed in 2014-2015.
statistiska analyser, p-värden om sådana finns.
ENV Publications.
Diskussion av resultaten.
, “Cytological Methods for Detecting Chemical Mutagens”, in Chemical Mutagens, Principles and Methods for their Detection, Vol.
Overview of the set of OECD Genetic Toxicology Test Guidelines and updates performed in 2014-2015.
Ishidate, M. Jr., T. Sofuni (1985), “The in vitro Chromosomal Aberration Test Using Chinese Hamster Lung (CHL) Fibroblast Cells in Culture” in Progress in Mutation Research, Vol.
Series on Testing and Assessment, No.
5, Ashby, J. et al.
234, OECD, Paris.
(eds.), Elsevier Science Publishers, Amsterdam-New York- Oxford, pp. 427-432.
, ”Cytological Methods for Detecting Chemical Mutagens”, in Chemical Mutagens, Principles and Methods for their Detection, vol.
, “Improving dose selection and identification of aneugens in the in vitro chromosome aberration test by integration of flow cytometry-based methods”, Environmental and Molecular Mutagenesis, Vol.
4, Hollaender, A. (ed.), Plenum Press, New York and London, s.
49/4, pp. 318-327.
1–29
Chapter B.49 of this Annex: In Vitro Mammalian Cell Micronucleus Test.
Ishidate, M. Jr., T. Sofuni (1985), ”The in vitro Chromosomal Aberration Test Using Chinese Hamster Lung (CHL) Fibroblast Cells in Culture” in Progress in Mutation Research, vol.
, “A Safe Substitute for Polychlorinated Biphenyls as an Inducer of Metabolic Activation Systems”, in In Vitro Metabolic Activation in Mutagenesis Testing, de Serres, F.J. et al.
5, Ashby, J. et al.
(eds.), Elsevier, North-Holland, pp. 85-88.
(eds.), Elsevier Science Publishers, Amsterdam-New York-Oxford, s.
Available at: http://www.pops.int/.
427–432.
McCooey (1982), “CHO/HGPRT Mutation Assay: Evaluation of Gases and Volatile Liquids”, in Genotoxic Effects of Airborne Agents, Tice, R.R., D.L.
, ”Improving dose selection and identification of aneugens in the in vitro chromosome aberration test by integration of flow cytometry-based methods, Environmental and Molecular Mutagenesis”, vol.
Costa, K.M.
49/4, s.
Schaich (eds.), Plenum, New York, pp. 91-103.
318–327.
In: Statistical Evaluation of Mutagenicity Test Data, Kirkland, D.J.
Kapitel B.49 i denna bilaga: Mikronukleustest av däggdjursceller in vitro.
(ed.)
, ”A Safe Substitute for Polychlorinated Biphenyls as an Inducer of Metabolic Activation Systems”, in In Vitro Metabolic Activation in Mutagenesis Testing, de Serres, F.J. et al. (eds.), Elsevier, North-Holland, pp.
Cambridge University Press, Cambridge, pp. 141-154.
85–88.
Available upon request.
Finns på http://www.pops.int/.
Available at: https://federalregister.gov/a/2012-13774.
McCooey (1982), ”CHO/HGPRT Mutation Assay: Evaluation of Gases and Volatile Liquids”, in Genotoxic Effects of Airborne Agents, Tice, R.R., D.L.
OECD (2014), “Statistical analysis supporting the revision of the genotoxicity Test Guidelines, OECD Environment, Health and Safety Publications (EHS)”, Series on Testing and Assessment, No. 198, OECD Publishing, Paris.
Schaich (eds.), Plenum, New York, s.
, “Metaphase chromosome aberration assays in vitro”, in Basic Mutagenicity Tests: UKEMS Recommended Procedures, Kirkland, D.J.
91–103.
(ed.), Cambridge University Press, Cambridge, pp. 62-86.
(ed.)
, “Analysis of Data from In Vitro Cytogenetic Assays”, in Statistical Evaluation of Mutagenicity Test Data, Kirkland, D.J.
Cambridge University Press, Cambridge, s. 141–154.
(ed.), Cambridge University Press, Cambridge, pp. 141-154.
Tillgänglig på begäran.
Appendix 1
Finns på https://federalregister.gov/a/2012-13774.
DEFINITIONS
OECD (2014), Statistical analysis supporting the revision of the genotoxicity Test Guidelines, OECD Environment, Health and Safety Publications (EHS), Series on Testing and Assessment, No.
Aneuploidy
198, OECD Publishing, Paris.
any deviation from the normal diploid (or haploid) number of chromosomes by a single chromosome or more than one, but not by entire set(s) of chromosomes (polyploidy).
, ”Metaphase chromosome aberration assays in vitro”, in Basic Mutagenicity Tests: UKEMS Recommended Procedures, Kirkland, D.J. (ed.), Cambridge University Press, Cambridge, pp.
Apoptosis
62–86.
programmed cell death characterised by a series of steps leading to a disintegration of cells into membrane-bound particles that are then eliminated by phagocytosis or by shedding.
, ”Analysis of Data from In Vitro Cytogenetic Assays”, in Statistical Evaluation of Mutagenicity Test Data, Kirkland, D.J. (ed.), Cambridge University Press, Cambridge, pp.
Cell proliferation
141–154.
increase in cell number as a result of mitotic cell division.
Tillägg 1
Chromatid break
Aneuploidi
discontinuity of a single chromatid in which there is a clear misalignment of one of the chromatids.
alla avvikelser från det normala antalet diploida (eller haploida) kromosomer med en eller flera kromosomer, men inte med hela uppsättningar kromosomer (polyploidi).
Chromatid gap
Apoptos
non-staining region (achromatic lesion) of a single chromatid in which there is minimal misalignment of the chromatid.
programmerad celldöd som karakteriseras av en serie steg som leder till sönderfall av celler till membranbundna partiklar som därefter elimineras genom fagocytos eller avstötning.
Chromatid-type aberration
Cellproliferation
structural chromosome damage expressed as breakage of single chromatids or breakage and reunion between chromatids.
ökning av antalet celler som resultat av mitotisk celldelning.
Chromosome-type aberration
ett ämne eller en blandning.
structural chromosome damage expressed as breakage, or breakage and reunion, of both chromatids at an identical site.
Kromatidbrott
Clastogen
diskontinuitet i en enstaka kromatid där det finns en tydlig missanpassning hos en av kromatiderna.
any chemical which causes structural chromosomal aberrations in populations of cells or eukaryotic organisms.
Kromatidlucka
Concentrations
ej färgat område (akromatisk skada) hos en enstaka kromatid där det finns en minimal missanpassning hos kromatiden.
refer to final concentrations of the test chemical in the culture medium.
Avvikelse av kromatidtyp
Cytotoxicity
strukturell kromosomskada uttryckt som brott på enstaka kromatider eller brott och återförening mellan kromatider.
For the assays covered in this test method using cell lines, cytotoxicity is identified as a reduction in relative population doubling (RPD) or relative increase in cell count (RICC) of the treated cells as compared to the negative control (see paragraph 17 and Appendix 2).
Avvikelse av kromosomtyp
For the assays covered in this test method using primary cultures of lymphocytes, cytotoxicity is identified as a reduction in mitotic index (MI) of the treated cells as compared to the negative control (see paragraph 18 and Appendix 2).
strukturell kromosomskada uttryckt som brott och återförening, på båda kromatiderna på samma ställe.
Endoreduplication
Klastogen
a process in which after an S period of DNA replication, the nucleus does not go into mitosis but starts another S period.
alla kemikalier som orsakar strukturella kromosomavvikelser i populationer av celler eller organismer.
The result is chromosomes with 4, 8, 16…, chromatids.
Koncentrationer
Genotoxic
slutliga koncentrationer av testkemikalien i odlingsmediet.
a general term encompassing all types of DNA or chromosome damage, including breaks, deletions, adducts, nucleotides modifications and linkages, rearrangements, gene mutations, chromosome aberrations, and aneuploidy.
Cytotoxicitet
Not all types of genotoxic effects result in mutations or stable chromosome damage.
Endoreduplikation
Mitotic index (MI)
en process där kärnan efter en S-fas under DNA-replikationen inte övergår i mitos utan inleder ännu en S-fas.
the ratio of cells in metaphase divided by the total number of cells observed in a population of cells; an indication of the degree of proliferation of that population.
Resultatet är kromosomer med 4, 8, 16, ... kromatider.
Mitosis
Gentoxisk
division of the cell nucleus usually divided into prophase, prometaphase, metaphase, anaphase and telophase.
allmän term som omfattar alla typer av DNA- eller kromosomskador, inklusive brott, deletioner, addukter, modifieringar av och kopplingar mellan nukleotider, omlagringar, genmutationer, kromosomavvikelser och aneuploidi.
Mutagenic
Inte alla typer av genotoxiska effekter leder till mutationer eller stabila kromosomskador.
produces a heritable change of DNA base-pair sequences(s) in genes or of the structure of chromosomes (chromosome aberrations).
Mitotiskt index (MI)
Numerical aberration
den andel celler som är i metafas delat med det totala antalet celler som kan observeras i en cellpopulation; en indikation på graden av tillväxt hos den populationen.
a change in the number of chromosomes from the normal number characteristic of the cells utilised.
Mitos
Polyploidy
delning av cellkärnan, i regel bestående av profas, prometafas, metafas, anafas och telofas.
numerical chromosomal aberrations in cells or organisms involving entire set(s) of chromosomes, as opposed to an individual chromosome or chromosomes (aneuploidy).
Mutagent ämne
p53 status
ämne som producerar en ärftlig ändring av DNA-basparssekvensen (-sekvenserna) i gener eller i kromosomstrukturen (kromosomavvikelser).
p53 protein is involved in cell cycle regulation, apoptosis and DNA repair.
Numerisk avvikelse
Cells deficient in functional p53 protein, unable to arrest cell cycle or to eliminate damaged cells via apoptosis or other mechanisms (e.g. induction of DNA repair) related to p53 functions in response to DNA damage, should be theoretically more prone to gene mutations or chromosomal aberrations.
en förändring av antalet kromosomer jämfört med det normala antalet karakteristika hos de celler som används.
Relative Increase in Cell Counts (RICC)
Polyploidi
the increase in the number of cells in chemically-exposed cultures versus increase in non-treated cultures, a ratio expressed as a percentage.
numeriska kromosomavvikelser i celler eller organismer som inbegriper en eller flera hela kromosomuppsättningar, i motsats till en enskild kromosom eller kromosomer (aneuploidi).
Relative Population Doubling (RPD)
p53-status
the increase in the number of population doublings in chemically-exposed cultures versus increase in non-treated cultures, a ratio expressed as a percentage.
p53-proteinet är involverat i cellcykelreglering, apoptos och DNA-reparation.
S9 liver fraction
Celler som lider brist på funktionellt p53-protein och är oförmögna att stoppa cellcykeln eller eliminera skadade celler via apoptos eller andra mekanismer (t.ex. induktion av DNA-reparation) i samband med p53-funktioner till svar på en DNA-skada, bör teoretiskt sett vara mer benägna till genmutationer eller kromosomavvikelser.
supernatant of liver homogenate after 9000 g centrifugation, i.e. raw liver extract.
Relativ ökning i celltal (RICC)
S9 mix
ökning av antalet celler i kemiskt exponerade kulturer jämfört med ökningar i icke-behandlade kulturer, ett förhållande uttryckt i procent.
mix of the S9 liver fraction and cofactors necessary for metabolic enzymes activity.
Relativ populationsfördubbling (RPD)
Solvent control
ökning av antalet populationsfördubblingar i kemiskt exponerade kulturer jämfört med ökningen i icke-behandlade kulturer, ett förhållande uttryckt i procent.
General term to define the control cultures receiving the solvent alone used to dissolve the test chemical.
S9-leverfraktion
Structural aberration
supernatant av leverhomogenat efter 9000 g centrifugering, dvs. råleverextrakt.
a change in chromosome structure detectable by microscopic examination of the metaphase stage of cell division, observed as deletions and fragments, intrachanges or interchanges.
S9-blandning
Test chemical
blandning av S9-leverfraktion och kofaktorer som krävs för metaboliska enzymers aktivitet.
Untreated controls
Lösningsmedelskontroll
cultures that receive no treatment (i.e. no test chemical nor solvent) but are processed concurrently in the same way as the cultures receiving the test chemical.
Allmän term för att definiera kontrollodlingar där endast lösningsmedel används för att lösa upp testkemikalien.
Appendix 2
Strukturell avvikelse
FORMULAS FOR CYTOTOXICITY ASSESSMENT
en förändring i kromosomstrukturen som kan detekteras genom en mikroskopisk undersökning av celldelningens metafasstadium, och som uppträder i form av deletioner och fragment, interna eller externa utbyten.
Mitotic index (MI):
Testkemikalie
Number of mitotic cells
Obehandlade kontroller
Total number of Cells scored
odlingar som inte behandlas (dvs. varken testkemikalie eller lösningsmedel tillsätts), men som behandlas parallellt på samma sätt som de odlingar där testkemikalien tillsätts.
Relative Increase in Cell Counts (RICC) or Relative Population Doubling (RPD) is recommended, as both take into account the proportion of the cell population which has divided.
Tillägg 2
Increase in number of cells in treated culturesfinal-starting
FORMLER FÖR BESTÄMNING AV CYTOTOXICITET
Increase in numbers of cells in control culturesfinal-starting
Mitotiskt index (MI):
No.of Population doublings in treated cultures
antal mitotiska celler
No.of population doublings in control cultures
totalt antal räknade celler
where:
Relativ ökning av celltal (RICC) eller relativ populationsfördubbling (RPD) rekommenderas, eftersom den andel av cellpopulationen som har delat sig beaktas i båda metoderna.
Population Doubling = [log (Post-treatment cell number ÷ Initial cell number)] ÷ log 2
ökning av antalet celler i behandlade kulturerslutligt–initialt
For example, a RICC, or a RPD of 53 % indicates 47 % cytotoxicity/cytostasis and 55 % cytotoxicity/cytostasis measured by MI means that the actual MI is 45 % of control.
ökning av antalet celler i kontrollkulturerslutligt–initialt
In any case, the number of cells before treatment should be measured and the same for treated and negative control cultures.
antal populationsfördubblingar i behandlade kulturer
While RCC (i.e. Number of cells in treated cultures/Number of cells in control cultures) had been used as cytotoxicity parameter in the past, is no longer recommended because it can underestimate cytotoxicity
antal populationsfördubblingar i behandlade kulturer
In the negative control cultures, population doubling should be compatible with the requirement to sample cells after treatment at a time equivalent to about 1,5 normal cell cycle length and mitotic index should be higher enough to get a sufficient number of cells in mitosis and to reliably calculate a 50 % reduction.
där
In Part B, Chapter B.11 is replaced by the following:
Populationsfördubbling: [log (Cellantal efter behandling ÷ Ursprungligt cellantal)] ÷ log 2
Mammalian Bone Marrow Chromosomal Aberration Test
En RICC eller en RPD på 53 % indikerar t.ex.
This test method is equivalent to OECD test guideline 475 (2016).
47 % cytotoxicitet/cytostas, och 55 % cytotoxicitet/cytostas mätt med MI innebär att det faktiska MI är 45 % av kontrollen.
The mammalian in vivo bone marrow chromosomal aberration test is especially relevant for assessing genotoxicity because, although they may vary among species, factors of in vivo metabolism, pharmacokinetics and DNA-repair processes are active and contribute to the responses.
I alla händelser bör antalet celler före behandling mätas, vilket även gäller behandlade och negativa kontrollodlingar.
An in vivo assay is also useful for further investigation of genotoxicity detected by an in vitro system.
Tidigare användes RCC (dvs. antalet celler i behandlade kulturer/antalet celler i kontrollkulturer) som cytotoxicitetsparameter, men rekommenderas inte längre eftersom cytotoxiciteten kan underskattas enligt detta mått.
The mammalian in vivo chromosomal aberration test is used for the detection of structural chromosome aberrations induced by test chemicals in bone marrow cells of animals, usually rodents (2) (3) (4) (5).
I negativa kontrollkulturer bör populationsfördubblingstiden överensstämma med kravet på provtagning av celler efter behandling vid en tidpunkt som motsvarar cirka 1,5 gånger den normala cellcykelns längd.
Structural chromosomal aberrations may be of two types, chromosome or chromatid.
Det mitotiska indexet bör vara tillräckligt högt för att få ett tillräckligt antal celler i mitos och tillförlitligt beräkna en minskning med 50 %.
While the majority of genotoxic chemical-induced aberrations are of the chromatid-type, chromosome-type aberrations also occur.
I del B ska kapitel B.11 ersättas med följande:
Chromosomal damage and related events are the cause of many human genetic diseases and there is substantial evidence that, when these lesions and related events cause alterations in oncogenes and tumour suppressor genes, they are involved in cancer in humans and experimental systems.
Test av kromosomavvikelser i benmärg hos däggdjur
An in vivo mammalian erythrocyte micronucleus test (Chapter B.12 of this Annex) or the in vitro mammalian cell micronucleus test (Chapter B.49 of this Annex) would be the in vivo and in vitro tests, respectively, recommended for the detection of aneuploidy.
Ett test in vivo är även användbart för fortsatta undersökningar av gentoxicitet, med detektion i ett in vitro-system.
Definitions of terminology used are set out in Appendix 1.
Testet in vivo av kromosomavvikelser hos däggdjur används för att detektera strukturella kromosomavvikelser inducerade av testkemikalier i benmärgsceller hos djur, vanligen hos gnagare (2) (3) (4) (5).
Rodents are routinely used in this test, but other species may in some cases be appropriate if scientifically justified.
Strukturella kromosomavvikelser kan vara av två typer, kromosomala eller kromatida.
Bone marrow is the target tissue in this test since it is a highly vascularised tissue and it contains a population of rapidly cycling cells that can be readily isolated and processed.
Huvuddelen av de gentoxiska kemikalieinducerade avvikelserna är av kromatidtyp, men även avvikelser av kromosomtyp förekommer.
The scientific justification for using species other than rats and mice should be provided in the report.
Kromosomskada och liknande händelser är orsaken till många genetiska sjukdomar hos människa och det finns omfattande bevis för att sådana skador och liknande händelser, när de ger upphov till förändringar i onkogener och tumörsuppressorgener, är inblandade i cancer hos människa och i experimentella system.
If species other than rodents are used, it is recommended that the measurement of bone marrow chromosomal aberration be integrated into another appropriate toxicity test.
Polyploidi (inklusive endoreduplicering) kan uppstå vid tester av kromosomavvikelser in vivo.
If there is evidence that the test chemical(s), or its metabolite(s), will not reach the target tissue, it may not be appropriate to use this test.
En ökning av polyploidi tyder inte i sig på aneugener, och kan helt enkelt tyda på störningar i cellcykeln eller cytotoxicitet.
PRINCIPLE OF THE TEST METHOD
Mikrokärntest in vivo av erytrocyter hos däggdjur (kapitel B.12 i denna bilaga) och däggdjurmikrokärntest in vivo av erytrocyter (kapitel B.49) i denna bilaga är det in vivo- respektive in vitro-test som rekommenderas för detektion av aneuploidi.
Animals are exposed to the test chemical by an appropriate route of exposure and are humanely euthanised at an appropriate time after treatment.
Definitioner av använd terminologi anges i tillägg 1.
Prior to euthanasia, animals are treated with a metaphase-arresting agent (e.g. colchicine or colcemid).
Gnagare används rutinmässigt i detta test, men även andra arter kan vara lämpliga i vissa fall om det är vetenskapligt motiverat.
Chromosome preparations are then made from the bone marrow cells and stained, and metaphase cells are analysed for chromosomal aberrations.
Benmärg är målvävnaden i detta test, eftersom det är en mycket kärlrik vävnad som innehåller en cellpopulation med en snabb cellcykel, och där cellerna enkelt kan isoleras och bearbetas.
VERIFICATION OF LABORATORY PROFICIENCY
Om andra arter än råttor och möss används bör en vetenskaplig motivering lämnas i rapporten.
Proficiency Investigations
Om andra arter än gnagare används bör mätningen av kromosomavvikelser i benmärg integreras i ett annat lämpligt toxicitetstest.
In order to establish sufficient experience with the conduct of the assay prior to using it for routine testing, the laboratory should have demonstrated the ability to reproduce expected results from published data (e.g. (6)) for chromosomal aberration frequencies with a minimum of two positive control chemicals (including weak responses induced by low doses of positive controls), such as those listed in Table 1 and with compatible vehicle/solvent controls (see paragraph 22).
Om det finns bevis för att testkemikalien eller dessa metaboliter inte kommer att nå målvävnaden kan detta test vara olämpligt att använda.
These experiments should use doses that give reproducible and dose related increases and demonstrate the sensitivity and dynamic range of the test system in the tissue of interest (bone marrow) and using the scoring method to be employed within the laboratory.
TESTMETODENS PRINCIP
This requirement is not applicable to laboratories that have experience, i.e. that have a historical database available as defined in paragraphs 10-14.
Försöksdjuren exponeras för testkemikalien genom en lämplig exponeringsväg och avlivas sedan humant vid en lämplig tid efter behandlingen.
Historical Control Data
Innan de avlivas behandlas djuren med ett ämne som gör att celler stannar upp i metafas (t.ex. colchicin eller colcemid).
During the course of the proficiency investigations, the laboratory should establish:
Kromosomberedningar görs sedan från benmärgscellerna och färgas in, varpå celler i metafas analyseras med avseende på kromosomavvikelser.
A historical positive control range and distribution, and
KVALIFIKATIONSPRÖVNING AV LABORATORIET
A historical negative control range and distribution.
Kvalifikationsprövning
When first acquiring data for a historical negative control distribution, concurrent negative controls should be consistent with published control data, where they exist.
Historiska kontrolldata Laboratoriet bör fastställa följande i kompetenundersökningarna:
As more experimental data are added to the historical control distribution, concurrent negative controls should ideally be within the 95 % control limits of that distribution.
Historiska kontrolldata
The laboratory's historical negative control database should be statistically robust to ensure the ability of the laboratory to assess the distribution of their negative control data.
Laboratoriet bör fastställa följande i kvalifikationsprövningen: