natgillin/translations-raw huggingface dataset:
details of the administration of the test chemical;
En ökning av antalet polyploida/endoreduplicerade celler kan utgöra en indikation på att testkemikalierna har potential att inhibera mitotiska processer eller cellcykelns förlopp (se punkt 3).
rationale for route and duration of administration;
Testrapport
methods for verifying that the test chemical(s) reached the general circulation or bone marrow;
Sammanfattning
actual dose (mg/kg body weight/day) calculated from diet/drinking water test chemical concentration (ppm) and consumption, if applicable;
Källa, satsnummer, sista förbrukningsdag om detta anges.
details of food and water quality;
Testkemikaliens stabilitet, om den är känd.
method of euthanasia;
Beredning av testkemikalien:
method of analgesia (where used);
motivering för val av vehikel,
detailed description of treatment and sampling schedules and justifications for the choices;
Löslighet och stabilitet av testkemikalien i lösningsmedlet/vehikeln, om detta är känt.
methods of slide preparation;
beredning av foder-, dricksvatten- eller inandningsberedningar,
methods for measurement of toxicity;
analytiska bestämningar av beredningar (t.ex. stabilitet, homogenitet, nominella koncentrationer) om sådana görs,
identity of metaphase arresting chemical, its concentration, dose and time of administration before sampling;
Art/stam som används och motivering av valet.
procedures for isolating and preserving samples;
Djurens antal, ålder och kön.
number of metaphase cells analysed per animal and the number of cells analysed for mitotic index determination;
Ursprung, inhysning, foder osv.
criteria for acceptability of the study;
Metod för unik identifiering av djuren.
criteria for considering studies as positive, negative or inconclusive.
Positiva och negativa kontroller (vehikel/lösningsmedel).
animal condition prior to and throughout the test period, including signs of toxicity;
Data från en preliminär undersökning, om en sådan har utförts.
mitotic index, given separately for each animal;
Grund för valet av dosnivå.
type and number of aberrations and of aberrant cells, given separately for each animal;
Uppgifter om beredning av testkemikalien.
total number of aberrations per group with means and standard deviations;
Uppgifter om administreringen av testkemikalien.
number of cells with aberrations per group with means and standard deviations;
Grund för administreringsväg och varaktighet.
changes in ploidy, if seen, including frequencies of polyploid and/or endoreduplicated cells;
Metoder för att verifiera att testkemikalien nådde det stora kretsloppet eller benmärgen.
dose-response relationship, where possible;
Faktisk dos (mg/kg kroppsvikt/dag) som beräknats genom dietens/dricksvattnets testkemikaliekoncentration (ppm) och konsumtion, i tillämpliga fall.
statistical analyses and method applied;
Uppgifter om foder- och vattenkvalitet.
data supporting that exposure of the bone marrow occurred;
Metod för avlivning.
concurrent negative control and positive control data with ranges, means and standard deviations;
Smärtlindringsmetod (i förekommande fall).
historical negative and positive control data with ranges, means, standard deviations, and 95 % control limits for the distribution, as well as the time period covered and number of observations;
Detaljerad beskrivning av behandlings- och provtagningsscheman samt motivering av valen.
criteria met for a positive or negative response.
Metoder för preparation av utstryksglas.
Conclusion.
Metoder för mätningar av toxicitet.
References.
Identitet för den metafashämmande kemikalien, koncentration, dos och tidpunkt för tillförsel före provtagning.
, “Cytogenetic Tests in Mammals”, in Mutagenicity Testing: A Practical Approach, Venittand, S., J.M.
Förfaranden för att isolera och bevara prover.
Parry (eds.), IRL Press, Washington, DC, pp. 275-306.
Antal analyserade metafasceller per djur och antal analyserade celler för bestämning av mitotiskt index.
, “In Vivo Cytogenetics Assays”, in Basic Mutagenicity Tests, UKEMS Recommended Procedures.
Acceptanskriterier för undersökningen.
Part I revised, Kirkland, D.J.
Kriterier för att bedöma om undersökningarna är positiva, negativa eller ofullständiga.
(ed.), Cambridge University Press, Cambridge, pp. 115-141.
Djurens skick före och under hela testperioden, inklusive tecken på toxicitet.
OECD (2000), “Guidance Document on the Recognition, Assessment and Use of Clinical Signs as Humane Endpoints for Experimental Animals Used in Safety Evaluation”, OECD Environment, Health and Safety Publications (EHS), Series on Testing and Assessment, No19, OECD Publishing, Paris.
Mitotiskt index, angivet separat för varje djur.
, “Statistical Analysis of in vivo Cytogenetic Assays”, in Statistical Evaluation of Mutagenicity Test Data.
Typ och antal avvikelser och avvikande celler, angivna separat för varje djur.
UKEMS SubCommittee on Guidelines for Mutagenicity Testing, Report, Part III, Kirkland, D.J.
Totalt antal avvikelser per grupp med medelvärden och standardavvikelser.
(ed.), Cambridge University Press, Cambridge, pp. 184-232.
Antal celler med avvikelser per grupp med medelvärden och standardavvikelser.
Any deviation from the normal diploid (or haploid) number of chromosomes by one or more chromosomes, but not by multiples of entire set(s) of chromosomes (cf. polyploidy).
Förändringar i ploiditet om sådana påvisas, inklusive frekvenser för polyploida och/eller endoreduplicerade celler.
Centromere
Dos/respons-förhållandet, där detta är möjligt.
Region(s) of a chromosome with which spindle fibers are associated during cell division, allowing orderly movement of daughter chromosomes to the poles of the daughter cells.
De statistiska analyser och metoder som använts.
Structural chromosome damage expressed as breakage of single chromatids or breakage and reunion between chromatids.
Uppgifter som styrker att exponering av benmärgen inträffade.
Structural chromosome damage expressed as breakage, or breakage and reunion, of both chromatids at an identical site.
Parallella negativa och positiva kontrolldata, med omfattning, medelvärden och standardavvikelser.
A process in which after an S period of DNA replication, the nucleus does not go into mitosis but starts another S period.
Historiska negativa och positiva kontrolldata med intervall, medelvärden, standardavvikelser och 95 % kontrollgränser för distribution, den tidsperiod som omfattas och antalet observationer.
The result is chromosomes with 4,8,16…chromatids.
Kriterier som uppfyllts för positiv eller negativ respons.
Gap
Slutsatser
An achromatic lesion smaller than the width of one chromatid, and with minimum misalignment of the chromatids.
Litteraturhänvisningar
Mitotic index
, ”Cytogenetic Tests in Mammals”, in Mutagenicity Testing: A Practical Approach, Venittand, S., J.M. Parry (eds.), IRL Press, Washington, DC, pp.
The ratio between the number of cells in mitosis and the total number of cells in a population, which is a measure of the proliferation status of that cell population.
275–306.
A change in the number of chromosomes from the normal number characteristic of the animals utilised (aneuploidy).
, ”In Vivo Cytogenetics Assays”, in Basic Mutagenicity Tests, UKEMS Recommended Procedures.
A numerical chromosomal aberration involving a change in the number of the entire set of chromosomes, as opposed to a numerical change in part of the chromosome set (cf. aneuploidy).
Part I revised, Kirkland, D.J. (ed.), Cambridge University Press, Cambridge, pp.
Structural chromosomal aberration
115–141.
A change in chromosome structure detectable by microscopic examination of the metaphase stage of cell division, observed as deletions and fragments, intrachanges or interchanges.
OECD (2000), ”Guidance Document on the Recognition, Assessment and Use of Clinical Signs as Humane Endpoints for Experimental Animals Used in Safety Evaluation”, OECD Environment, Health and Safety Publications (EHS), Series on Testing and Assessment, No19, OECD Publishing, Paris.
THE FACTORIAL DESIGN FOR IDENTIFYING SEX DIFFERENCES IN THE IN VIVO CHROMOSOMAL ABERRATION ASSAY
, ”Statistical Analysis of in vivo Cytogenetic Assays”, in Statistical Evaluation of Mutagenicity Test Data.
The factorial design and its analysis
UKEMS SubCommittee on Guidelines for Mutagenicity Testing, Report, Part III, Kirkland, D.J. (ed.), Cambridge University Press, Cambridge, pp.
The data can be analysed using many standard statistical software packages such as SPSS, SAS, STATA, Genstat as well as using R.
Centromer
The analysis partitions the variability in the dataset into that between the sexes, that between the concentrations and that related to the interaction between the sexes and the concentrations.
region(er) på en kromosom där kärnspolefibrer är fästa under celldelning, vilket möjliggör en ordnad rörelse av dotterkromosomerna mot dottercellernas poler.
Each of the terms is tested against an estimate of the variability between the replicate animals within the groups of animals of the same sex given the same concentration.
strukturell kromosomskada uttryckt som brott på enstaka kromatider eller brott och återförening mellan kromatider.
Full details of the underlying methodology are available in many standard statistical textbooks (see references) and in the ‘help’ facilities provided with statistical packages.
strukturell kromosomskada uttryckt som brott och återförening, på båda kromatiderna på samma ställe.
The analysis proceeds by inspecting the sex x concentration interaction term in the ANOVA table [1].
en process där kärnan efter en S-fas under DNA-replikationen inte övergår i mitos utan inleder ännu en S-fas.
In the absence of a significant interaction term the combined values across sexes or across concentration levels provide valid statistical tests between the levels based upon the pooled within group variability term of the ANOVA.
Resultatet är kromosomer med 4,8,16,… kromatider.
The analysis continues by partitioning the estimate of the between concentrations variability into contrasts which provide for a test for linear and quadratic contrasts of the responses across the concentration levels.
Lucka
When there is a significant sex x concentration interaction this term can also be partitioned into linear x sex and quadratic x sex interaction contrasts.
en akromatisk skada som är mindre än bredden på en kromatid, och med ett minimum av missanpassning hos kromatiderna.
These terms provide tests of whether the concentration responses are parallel for the two sexes or whether there is a differential response between the two sexes.
Mitotiskt index
The estimate of the pooled within group variability can be used to provide pair-wise tests of the difference between means.
förhållandet mellan antalet celler i mitos och det totala antalet celler i en population, vilket är ett mått på cellpopulationens proliferationsstatus.
These comparisons could be made between the means for the two sexes and between the means for the different concentration level such as for comparisons with the negative control levels.
en förändring av antalet kromosomer från det normala antalet karakteristiskt för det försöksdjur som används (aneuploidi).
In those cases where there is a significant interaction comparisons can be made between the means of different concentrations within a sex or between the means of the sexes at the same concentration.
en numerisk kromosomavvikelse med en ändring av kromosomuppsättningens antal, jämfört med en numerisk ändring i en del av kromosomuppsättningen (jfr aneuploidi).
References
Strukturell kromosomavvikelse
There are many statistical textbooks which discuss the theory, design, methodology, analysis and interpretation of factorial designs ranging from the simplest two factor analyses to the more complex forms used in Design of Experiment methodology.
en förändring i kromosomstrukturen som kan detekteras genom en mikroskopisk undersökning av celldelningens metafasstadium, och som uppträder i form av deletioner och fragment, interna eller externa utbyten.
The following is a non-exhaustive list.
UTFORMNING AV FAKTORFÖRSÖK FÖR IDENTIFIERING AV SKILLNADER MELLAN KÖNEN I IN VIVO-TEST MED AVSEENDE PÅ KROMOSOMAVVIKELSER
Some books provide worked examples of comparable designs, in some cases with code for running the analyses using various software packages.
Utformning och analys av faktorförsök
Statisticians who take a modelling approach such as using General Linear Models (GLMs) may approach the analysis in a different but comparable way but will not necessarily derive the traditional anova table, which dates back to algorithmic approaches to calculating the statistics developed in a pre-computer age.
I denna utformning testas minst fem hanar och fem honor vid varje koncentrationsnivå, vilket innebär att minst 40 djur måste användas (20 hanar och 20 honor plus relevanta positiva kontroller).
In Part B, Chapter B.12 is replaced by the following:
Detta är ett av de enklaste faktorförsöken och det motsvarar en tvåvägs-variansanalys med kön och koncentrationsnivå som huvudsakliga effekter.
Mammalian Erythrocyte Micronucleus Test
Data kan analyseras med hjälp av många vanliga statistiska programvarupaket såsom SPSS, SAS, STATA, Genstat samt med hjälp av R.
This test method is equivalent to OECD test guideline 474 (2016).
Analysen delar upp variationen i datauppsättningen mellan kön, koncentrationer och interaktionen mellan kön och koncentrationer.
The mammalian in vivo micronucleus test is especially relevant for assessing genotoxicity because, although they may vary among species, factors of in vivo metabolism, pharmacokinetics and DNA repair processes are active and contribute to the responses.
Var och en av termerna testas mot en uppskattning av variationerna mellan replikatdjuren inom djurgrupper av samma kön som ges samma koncentration.
The mammalian in vivo micronucleus test is used for the detection of damage induced by the test chemical to the chromosomes or the mitotic apparatus of erythroblasts.
Fullständig information om den underliggande metoden finns i många statistiska läroböcker (se litteraturhänvisningar) och i hjälpavsnitt i statistiska paket.
The test evaluates micronucleus formation in erythrocytes sampled either in the bone marrow or peripheral blood cells of animals, usually rodents.
Nästa steg i analysen är att kontrollera interaktionstermen ”kön x koncentration” i ANOVA tabellen [1].
The purpose of the micronucleus test is to identify chemicals that cause cytogenetic damage which results in the formation of micronuclei containing either lagging chromosome fragments or whole chromosomes.
I avsaknad av en signifikant interaktionsterm ger de kombinerade värdena mellan könen eller koncentrationsnivåerna giltiga statistiska test mellan nivåerna, baserat på den sammanslagna inomgruppsvariationen enligt ANOVA.
When a bone marrow erythroblast develops into an immature erythrocyte (sometimes also referred to as a polychromatic erythrocyte or reticulocyte), the main nucleus is extruded; any micronucleus that has been formed may remain behind in the cytoplasm.
Nästa steg i analysen är att dela upp uppskattningen av variationen mellan koncentrationerna i kontraster, som möjliggör ett test avseende linjära och kvadratiska kontraster i responsen mellan koncentrationsnivåerna.
Visualisation or detection of micronuclei is facilitated in these cells because they lack a main nucleus.
Om en signifikant variation i kön x koncentration förekommer kan även denna term delas upp i interaktionskontraster enligt följande: linjära kontraster x kön och kvadratiska kontraster x kön.
An increase in the frequency of micronucleated immature erythrocytes in treated animals is an indication of induced structural or numerical chromosomal aberrations.
Med hjälp av dessa termer kan man testa om koncentrationsresponsen är parallell för de två könen eller om den skiljer sig åt.
Newly formed micronucleated erythrocytes are identified and quantitated by staining followed by either visual scoring using a microscope, or by automated analysis.
Uppskattningen av den sammanslagna inomgruppsvariationen kan användas för parvisa test av skillnaderna mellan medelvärdena.
Counting sufficient immature erythrocytes in the peripheral blood or bone marrow of adult animals is greatly facilitated by using an automated scoring platform.
Dessa jämförelser kan göras mellan medelvärdena för könen och medelvärdena för de olika koncentrationsnivåerna, t.ex. för jämförelser med de negativa kontrollnivåerna.
Such platforms are acceptable alternatives to manual evaluation (2).
Om det finns en signifikant interaktion kan man jämföra medelvärden för olika koncentrationer för samma kön eller medelvärden för båda könen vid samma koncentration.
Comparative studies have shown that such methods, using appropriate calibration standards, can provide better inter- and intra-laboratory reproducibility and sensitivity than manual microscopic scoring (3) (4).
Litteratur
Automated systems that can measure micronucleated erythrocyte frequencies include, but are not limited to, flow cytometers (5), image analysis platforms (6) (7), and laser scanning cytometers (8).
Teori, utformning, metod, analys och tolkning av faktorförsök diskuteras i många statistiska läroböcker, från den enklaste tvåfaktorsanalysen till mer komplexa former som används i försöksutformningsmetoder.
Although not normally done as part of the test, chromosome fragments can be distinguished from whole chromosomes by a number of criteria.
Statistiker som använder modelleringsmetoder som allmänna linjära modeller (GLM) kan använda analysen på ett annorlunda men jämförbart sätt.
These include identification of the presence or absence of a kinetochore or centromeric DNA, both of which are characteristic of intact chromosomes.
Det är inte nödvändigt att härleda den traditionella ANOVA-modellen, som bygger på algoritmiska metoder för statistisk beräkning som utvecklades före dataåldern..
The absence of kinetochore or centromeric DNA indicates that the micronucleus contains only fragments of chromosomes, while the presence is indicative of chromosome loss.
I del B ska kapitel B.12 ersättas med följande:
The bone marrow of young adult rodents is the target tissue for genetic damage in this test since erythrocytes are produced in this tissue.
Mikrokärntest av erytrocyter hos däggdjur
The measurement of micronuclei in immature erythrocytes in peripheral blood is acceptable in other mammalian species for which adequate sensitivity to detect chemicals that cause structural or numerical chromosomal aberrations in these cells has been demonstrated (by induction of micronuclei in immature erythrocytes) and scientific justification is provided.
Den här testmetoden motsvarar OECD:s testriktlinje 474 (2016).
The frequency of micronucleated immature erythrocytes is the principal endpoint.
Mikrokärntest in vivo hos däggdjur är särskilt relevanta för att bedöma gentoxicitet, eftersom faktorer rörande in vivo-metabolism, farmakokinetik och DNA-reparationsprocesser är aktiva och bidrar till responsen, även om de varierar mellan arterna.
The frequency of mature erythrocytes that contain micronuclei in the peripheral blood also can be used as an endpoint in species without strong splenic selection against micronucleated cells and when animals are treated continuously for a period that exceeds the lifespan of the erythrocyte in the species used (e.g. 4 weeks or more in the mouse).
Mikrokärntest in vivo hos däggdjur används för att detektera skador som testkemikalien inducerar på kromosomerna i den mitotiska funktionen hos erytroblaster.
Animals are exposed to the test chemical by an appropriate route.
Testet utvärderar bildning av mikrokärnor i erytrocyter som antingen tas från benmärgen eller perifera blodceller hos djur, vanligen gnagare.
If bone marrow is used, the animals are humanely euthanised at an appropriate time(s) after treatment, the bone marrow is extracted, and preparations are made and stained (9) (10) (11) (12) (13) (14) (15).
Avsikten med testet av mikrokärnor är att identifiera kemikalier som orsakar cytogen skada, vilket resulterar i bildning av mikrokärnor som antingen innehåller isolerade kromosomfragment eller hela kromosomer.
When peripheral blood is used, the blood is collected at an appropriate time(s) after treatment and preparations are made and stained (12) (16) (17) (18).
När en erytroblast från benmärg utvecklas till en omogen erytrocyt (ibland även kallad polykromatisk erytrocyt eller retikulocyt) stöts huvudkärnan ut.
When treatment is administered acutely, it is important to select bone marrow or blood harvest times at which the treatment-related induction of micronucleated immature erythrocytes can be detected.
Eventuella mikrokärnor som har bildats kan stanna kvar i cytoplasman.
In the case of peripheral blood sampling, enough time must also have elapsed for these events to appear in circulating blood.
Visualisering eller detektering av mikrokärnor underlättas i dessa celler eftersom de saknar en huvudkärna.
Preparations are analysed for the presence of micronuclei, either by visualisation using a microscope, image analysis, flow cytometry, or laser scanning cytometry.
En ökning av frekvensen av omogna erytrocyter med mikrokärnor hos behandlade försöksdjur utgör en indikation på inducerade strukturella eller numeriska kromosomavvikelser.
In order to establish sufficient experience with the conduct of the assay prior to using it for routine testing, the laboratory should have demonstrated the ability to reproduce expected results from published data (17) (19) (20) (21) (22) for micronucleus frequencies with a minimum of two positive control chemicals (including weak responses induced by low doses of positive controls), such as those listed in Table 1 and with compatible vehicle/solvent controls (see paragraph 26).
Nybildade erytrocyter med mikrokärnor identifieras och kvantifieras genom färgning, följt av antingen visuell klassificering med mikroskop eller genom automatisk analys.
These experiments should use doses that give reproducible and dose-related increases and demonstrate the sensitivity and dynamic range of the test system in the tissue of interest (bone marrow or peripheral blood) and using the scoring method to be employed within the laboratory.
Ett tillräckligt stort antal erytrocyter måste räknas i perifert blod eller benmärgen hos vuxna djur.
This requirement is not applicable to laboratories that have experience, i.e. that have a historical database available as defined in paragraphs 14-18.
Räkningen underlättas avsevärt om man använder en automatisk klassificeringsplattform.
Laboratories should use quality control methods, such as control charts (e.g. C-charts or X-bar charts (23)), to identify how variable their data are, and to show that the methodology is ‘under control’ in their laboratory.
Användningen av sådana plattformar är godtagbara alternativ till manuell utvärdering (2).
Further recommendations on how to build and use the historical data (i.e. criteria for inclusion and exclusion of data in historical data and the acceptability criteria for a given experiment) can be found in the literature (24).
Jämförande studier har visat att sådana metoder, med användning av lämpliga kalibreringsstandarder, kan ge bättre reproducerbarhet och sensitivitet inom laboratoriet än manuell klassificering med mikroskop (3) (4).
Where the laboratory does not complete a sufficient number of experiments to establish a statistically robust negative control distribution (see paragraph 15) during the proficiency investigations (described in paragraph 13), it is acceptable that the distribution can be built during the first routine tests.
Automatiska system som kan mäta frekvenser för erytrocyter med mikrokärnor är bland annat flödescytometrar (5), bildanalysplattformar (6) (7) och laserskanningcytometrar, även om det finns andra alternativ (8).
This approach should follow the recommendations set out in the literature (24) and the negative control results obtained in these experiments should remain consistent with published negative control data.
Även om det normalt inte görs under testet kan kromosomfragment särskiljas från hela kromosomer med hjälp av ett antal kriterier.