natgillin/translations-raw huggingface dataset:
Reliable identification of a pure culture of C. m. subsp. sepedonicus is achieved by using the tests listed in section 9.
En renkultur av C. m. subsp. sepedonicus kan identifieras tillförlitligt med hjälp av de tester som beskrivs i avsnitt 9.
The pathogenicity test is described in section 10.
Patogenitetstestet beskrivs i avsnitt 10.
Scheme for detection and identification of Clavibacter michiganensis ssp. sepedonicus in samples of asymptomatic potato tubers
Program för upptäckt och identifiering av Clavibacter michiganensis ssp. sepedonicus i prover av asymptomatiska potatisknölar
The testing procedure is intended for detection of latent infections in potato tubers.
Syftet med testförfarandet är att upptäcka latenta infektioner i potatisknölar.
A positive result from at least two screening tests, based on different biological principles, must be complemented by the isolation of the pathogen; followed by, in case of isolation of typical colonies, confirmation of a pure culture as C. m. subsp. sepedonicus.
Minst två positiva screeningtest baserade på olika biologiska principer skall verifieras genom isolering av patogenet, vid isolering av typiska kolonier följt av identifiering av en renkultur som C. m. subsp. sepedonicus.
A positive result from only one of the screening tests is not sufficient to consider the sample suspect.
Endast ett positivt screeningtest är inte tillräckligt för att provet skall kunna betraktas som misstänkt.
Screening tests and isolation tests must permit a detection threshold of 103 to 104 cells/ml resuspended pellet, included as positive controls in each series of tests.
Screening- och isoleringstesterna skall möjliggöra en bestämningsgräns på 103–104 celler/ml återsuspenderade pellet, som är medtagna som positiva kontroller i varje testserie.
sample of potato tubers (1)
Stickprov från potatisknölar (1)
extraction and concentration of the pathogen (2)
Extrahering och koncentrering av skadegöraren (2)
CORE SCREENING TESTS (3)
SCREENINGTEST AV NAVELÄNDAR (3)
first screening test (3)
Första screeningtestet (3)
subsp. sepedonicus not detected
subsp. sepedonicus ej påvisad
negative
negativt
positive
positivt
second screening test (3)
Andra screeningtestet (3)
selective isolation (7) and bioassay (8)
Selektiv isolering (7) och biotest (8)
colonies with typical morphology (9)
Kolonier med typisk morfologi (9)
purify by subculture
Renodla genom subkulturodling
IDENTIFICATION TESTS (11)
IDENTIFIERINGSTEST (11)
PATHOGENICITY TEST (12)
PATOGENITETSTEST (12)
both tests confirm pure culture as
Båda testerna bekräftar renkultur av
The standard sample size is 200 tubers although the procedure can be used with smaller samples if 200 tubers are not available.
Standardiserad provmängd är 200 knölar. Färre prover kan emellertid användas till detta förfarande om det inte finns 200 knölar.
Pathogen extraction and concentration methods are described in section 3.1.
Metoder för extrahering och koncentrering av patogen beskrivs i avsnitt 3.1.
If at least two tests based on different biological principles are positive, isolation and confirmation have to be done.
Om minst två tester baserade på olika biologiska principer är positiva, krävs isolering och bekräftelse.
Perform at least one screening test.
Utför minst ett screeningtest.
When this test is negative the sample is considered to be negative In case this test is positive a second or more screening tests based on different biological principles are required to verify the first positive result.
Om testet är negativt, betraktas provet som negativt. Om testet är positivt krävs ytterligare ett eller flera screeningtester baserade på olika biologiska principer för att verifiera det första positiva resultatet.
If the second or other tests are negative the sample is considered negative.
Om det andra testet eller övriga tester är negativa, betraktas provet som negativt.
Further tests are not necessary.
Det är inte nödvändigt att utföra ytterligare tester.
Immunofluorescence (IF) test.
Använd alltid en polyklonal antikropp vid IF-test.
Always use a polyclonal antibody for IF screening, additional monoclonal antibodies may provide more specifity (see section 4).
Ytterligare monoklonala antikroppar kan ge högre specificitet (se avsnitt 4).
Use appropriately validated PCR reagents and protocols (see section 6).
Använd korrekt validerade PCR-reagens och PCR-protokoll (se avsnitt 6).
Use validated reagents and protocols (see section 5).
Använd validerade reagens och protokoll (se avsnitt 5).
Selective isolation.
Selektiv isolering.
With the MTNA medium or NCP-88 medium and a 1/100 dilution of the resuspended pellet, this is in many cases a suitable method for direct isolation of C. m. subsp. sepedonicus.
Med substraten MTNA eller NCP-88, och med en utspädning på 1/100 av den återsuspenderade pelleten, är detta i många fall en godtagbar metod för direkt isolering av C. m. subsp. sepedonicus.
Typical colonies can be obtained 3 to10 days after planting.
Typiska kolonier kan erhållas 3–10 dagar efter odlingen.
The pathogen then can be purified and identified.
Patogenet kan sedan renas och identifieras.
For full exploitation of its potential, the test requires careful preparation of heel end cores to avoid secondary bacteria associated with the potato tuber which are competitors with C. m. subsp. sepedonicus on the medium and may overgrow the pathogen.
För fullt utnyttjande av testets potential krävs noggrann preparering av naveländarna för att undvika sekundära bakterier som följer med potatisknölen och som konkurrerar med C. m. subsp. sepedonicus på substratet och kan växa över patogenet.
If the plate test fails isolation must be done from plants used for the bio assay (see section 8).
Om odlingstestet misslyckas skall isolering ske från de plantor som använts för biotestet (se avsnitt 8).
The bioassay test is used for isolation of C. m. subsp. sepedonicus from potato extract pellets by selective enrichment in eggplants (Solanum melongena).
Biotestet används för isolering av C. m. subsp. sepedonicus från potatisextraktpellets genom selektiv anrikning i äggplantor (Solanum melongena).
The test requires optimal incubation conditions as specified in this method.
Testet kräver optimala inkubationsförhållanden enligt metodens specifikation.
Bacteria inhibitory to C. m. subsp. sepedonicus on the MTNA or NCP-88 medium will most likely not interfere in this test (see section 7).
Bakterier som hämmar C. m. subsp. sepedonicus på MTNA- eller NCP-88-substratet kommer sannolikt inte att interferera i detta test (se avsnitt 7).
Typical colony morphology is described in section 8.
Typisk kolonimorfologi beskrivs i avsnitt 8.
Culturing or bioassays can fail due to competition or inhibition by saprophytic bacteria.
Odling i kultur eller biotester kan misslyckas på grund av konkurrens eller inhibering från saprofytiska bakterier.
If positive results are obtained in screening tests, but the isolation tests are negative, then repeat the isolation tests from the same pellet or by taking additional vascular tissue near the heel end from cut tubers of the same sample and, if necessary, test additional samples.
Om positiva resultat erhålls vid screeningtester men isoleringstesterna är negativa, upprepa isoleringstesterna från samma pellet eller genom att ta ytterligare kärlringvävnad nära naveländan från genomskurna knölar från samma prov. Gör vid behov tester på ytterligare prover.
Reliable identification of pure presumptive C. m. subsp. sepedonicus cultures is achieved using the tests described in section 9.
En renkultur av förmodad C. m. subsp. sepedonicus kan identifieras tillförlitligt med hjälp av de tester som beskrivs i avsnitt 9.
Scheme for detection and identification of Clavibacter michiganensis ssp. sepedonicus in samples of asymptomatic potato plants
Program för upptäckt och identifiering av Clavibacter michiganensis ssp. sepedonicus i prover av asymptomatiska potatisplantor
sample of stem segments (1)
Stickprov från segment av stjälk (1)
selective isolation (4)/IF test (5)/PCR test (6)/FISH test (7)
Selektiv isolering (4)/IF-test (5)/PCR-test (6)/FISH-test (7)
optional auxiliary test: bioassay (8)
Frivilligt kompletterande test: biotest (8)
colonies with typical morphology (4) after isolation
Kolonier med typisk morfologi (4) efter isolering
all tests done negative
Alla utförda tester negativa
IDENTIFICATION TESTS (10)
IDENTIFIERINGSTEST (10)
PATHOGENICITY TEST (11)
PATOGENITETSTEST (11)
When this test is negative the sample is considered to be negative.
Om testet är negativt betraktas provet som negativt.
In case this test is positive a second or more screening tests based on different biological principles are required to verify the first positive result.
Om testet är positivt krävs ytterliga ett eller flera tester baserade på olika biologiska principer för att styrka det första positiva resultatet.
The selective isolation test and typical colony morphology are described in section 8.
Selektivt isoleringstest och typisk kolonimorfologi beskrivs i avsnitt 8.
The IF test is described in section 4.
IF test beskrivs i avsnitt 4.
PCR tests are described in section 6.
PCR test beskrivs i avsnitt 6.
The FISH test is described in section 5.
FISH test beskrivs i avsnitt 5.
The bioassay is described in section 7.
Biotest beskrivs i avsnitt 7.
If positive results are obtained in screening tests, but the isolation tests are negative, then repeat the isolation tests and, if necessary, test additional samples.
Om ett positivt resultat erhålls vid screeningtester men isoleringstesterna är negativa, upprepa isoleringstesterna och testa, vid behov, ytterligare prover.
VISUAL EXAMINATION FOR RING ROT SYMPTOMS
OKULÄR UNDERSÖKNING AVSEENDE SYMPTOM PÅ LJUS RINGRÖTA
Potato plants
Potatisplantor
Under European climatic conditions symptoms are rarely found in the field and often only at the end of the season.
På grund av de klimatförhållanden som råder i Europa påträffas symptom sällan på ute på fältet och ofta endast i slutet av säsongen.
Moreover the symptoms are frequently masked or confused by/with other diseases, senescence or mechanical damages.
Dessutom är symptomen ofta dolda eller förväxlas med andra sjukdomar, åldrande eller mekaniska skador.
Therefore it may be easy to miss symptoms in field inspections.
Därför kan symptom lätt förbigås vid fältinspektioner.
Wilting symptoms are very different from those of brown rot; wilting is usually slow and initially limited to the leaf margins.
Vissningssymptomen skiljer sig avsevärt från symptomen på mörk ringröta. Vissningen är vanligtvis långsam och begränsad till bladkanterna.
Young infected leaves often continue to expand although, less so in the infected zones.
Unga infekterade blad fortsätter ofta att utvecklas, om än i mindre utsträckning i infekterade områden.
This creates odd shaped leaves.
Detta ger upphov till blad med oregelbundna former.
Leaves affected by blocking of the vascular tissues further down the stem often develop chlorotic, yellow to orange, intercostal areas.
Blad vars kärlringvävnad blockerats längre ned på stjälken utvecklar ofta bleka områden på bladytan i olika nyanser av gul och orange.
Infected leaflets, leaves and even stems may eventually die.
Småblad och blad, och även stjälkar, kan till slut dö.
Often leaves and tubers are simply reduced in size.
Ofta krymper blad och knölar emellertid endast i storlek.
Occasionally plants are stunted.
Ibland försvagas plantornas tillväxt.
Coloured pictures of a range of symptoms can be found on the web site http://forum.europa.eu.int/Public/irc/sanco/Home/main
Färgbilder på en rad symptom finns på kommissionens webbplats (http://forum.europa.eu.int/Public/irc/sanco/Home/main).
Potato tubers
Potatisknölar
The earliest symptoms are a slight glassiness or translucence of the tissue without softening around the vascular system, particularly near the heel end.
De första symptomen är lätt glasaktighet eller genomskinlighet hos vävnaden, särskilt nära naveländan, utan att området runt kärlsystemet har mjukats upp.
The vascular ring at the heel end may be slightly darker in colour than normal.
Kärlringen vid naveländan kan vara en aning mörkare än normalt.
The first readily identifiable symptom is one whereby the vascular ring has a yellowish coloration and when the tuber is gently squeezed, pillars of cheese-like material emerge from the vessels.
Det första klart identifierbara symptomet är att kärlringen har en gulaktig färg, och då knölen pressas försiktigt tränger strängar av ostliknande material fram ur kärlringen.
This exudation contains millions of bacteria.
Denna utsöndring innehåller miljontals bakterier.
Browning of the vascular tissue may develop and tuber symptoms at this stage are similar to those of brown rot caused by Ralstonia solanacearum.
Kärlringsvävnaden kan bli brunaktig, och symptomen hos knölarna är på detta stadium snarlika dem på mörk ringröta orsakad av Ralstonia solanacearum.
At first, these symptoms may be restricted to one part of the ring, not necessarily close to the heel end and may gradually extend to the whole ring.
Först kan dessa symptom begränsas till en del av ringen, inte nödvändigtvis nära naveländan, och de kan gradvis breda ut sig till hela ringen.
As the infection progresses, destruction of the vascular tissue occurs; the outer cortex may become separated from the inner cortex.
Då infektionen fortsätter förstörs kärlringen, och yttre cortex kan skiljas från inre cortex.
In advanced stages of infection, cracks appear on the surface of the tuber, which are often reddish-brown at their margins.
I ett framskridet stadium av infektionen uppträder sprickor på ytan av knölen, som ofta är rödbrun vid kanterna.
Recently in Europe several cases have occurred where the central cortex rots at the same time as the vascular ring resulting in secondary invasion with internal hollowing and necrosis.
I Europa har nyligen ett flertal fall inträffat där inre cortex ruttnar på samma gång som kärlringen, vilket leder till ett sekundärt angrepp med inre urgröpning och nekros.
Secondary fungal or bacterial invasion may mask the symptoms and it may be difficult, if not impossible, to distinguish advanced ring rot symptoms from other tuber rots.
Sekundära svamp- eller bakterieangrepp kan dölja symptomen, och det kan vara svårt, till och med omöjligt, att skilja symptom på framskriden ljus ringröta från andra former av röta hos knölar.
Atypical symptoms may be possible.
Atypiska symptom kan förekomma.
SAMPLE PREPARATION
PREPARERING AV PROVER
The standard sample size is 200 tubers per test.
Den standardiserade provmängden är 200 knölar per test.
More intensive sampling requires more tests on samples of this size.
Vid intensivare provtagning krävs fler tester på prover av denna storlek.
Larger numbers of tubers in the sample will lead to inhibition or difficult interpretation of the results.
Ett större antal knölar i provet medför inhibering eller svårighet att tolka resultaten.
However, the procedure can be conveniently applied for samples with less than 200 tubers where fewer tubers are available.
Förfarandet kan emellertid användas för prover med färre än 200 knölar, om det endast finns färre knölar tillgängliga.
Validation of all detection methods described below is based on testing of samples of 200 tubers.
Valideringen av samtliga nedan behandlade metoder för upptäckt har skett på grundval av test av stickprover på 200 knölar.
The potato extract described below can also be used for detection of the potato brown rot bacterium, Ralstonia solanacearum.
Det nedan beskrivna potatisextraktet kan även användas för upptäckt av den bakterie som orsakar mörk ringröta hos potatis, Ralstonia solanacearum.
Optional pre-treatment in advance to sample preparation:
Frivillig förbehandling före provpreparering:
Wash the tubers.
Tvätta knölarna.
Use appropriate disinfectants (chlorine compounds when PCR-test is to be used in order to remove eventual pathogen DNA) and detergents between each sample.
Använd lämpliga desinfektionsmedel (vid PCR-test klorföreningar för att avlägsna eventuellt patogent DNA) och tvättmedel mellan varje stickprov.
Air dry the tubers.
Lufttorka knölarna.
This washing procedure is particularly useful (but not required) for samples with excess soil and if a PCR-test or direct isolation procedure is to be performed.
Detta rengöringsförfarande är användbart (men det inte är obligatoriskt) i synnerhet vid jordiga prover och om ett PCR-test eller ett direkt isoleringstest skall göras.
Remove with a clean and disinfected scalpel or vegetable knife the skin at the heel end of each tuber so that the vascular tissue becomes visible.
Avlägsna med en ren, desinficerad skalpell eller grönsakskniv epidermis från varje knöls navelända så att kärlvävnaden blir synlig.
Carefully cut out a small core of vascular tissue at the heel end and keep the amount of non-vascular tissue to a minimum (see web site: http://forum.europa.eu.int/Public/irc/sanco/Home/main)
Skär försiktigt ur en liten kärna av kärlringvävnad i naveländan och minimera mängden icke-kärlringvävnad (se kommissionens webbplats på adress http://forum.europa.eu.int/Public/irc/sanco/Home/main).
Set aside any tubers with suspected ring rot symptoms and test separately.
Lägg undan alla knölar med misstänkta symptom på brunröta och testa dem separat.
If during removal of the heel end core suspect symptoms of ring rot are observed, the tuber should be visually inspected after cutting near the heel end.
Om misstänkta symptom på ljus ringröta iakttas vid avlägsnandet av naveländan bör en okulär inspektion av denna knöl ske efter det att knölen skurits av nära naveländan.
Any cut tuber with suspected symptoms should be suberised at room temperature for two days and stored under quarantine (at 4 to 10 °C) until all tests have been completed.
Alla skurna knölar med misstänkta symptom bör förvaras i två dagar i rumstemperatur och lagras under karantänförhållanden (4–10 °C) tills alla tester slutförts.
All tubers in the sample (including those with suspicious symptoms) should be kept according to Annex II.
Alla knölar i provet, inklusive dem med misstänkta symptom, bör förvaras i enlighet med bilaga II.
If this is not possible, store them in the container, without addition of buffer, refrigerated for not longer than 72 hours or for not longer than 24 hours at room temperature.
Om detta inte är möjligt bör de förvaras i behållaren, utan tillsats av buffert, nedkylda under högst 72 timmar eller i rumstemperatur under högst 24 timmar.
Drying and suberisation of cores, and growth of saprophytes during storage may hinder detection of the ring rot bacterium.
Torkning och förkorkning av ändarna samt framväxt av saprofyter under förvaringen kan hindra att den bakterie som orsakar ljus ringröta upptäcks.
Process the heel end cores by one of the following procedures: either,
Behandla naveländarna enligt något av följande förfaranden: antingen
cover the cores with sufficient volume (approximately 40 ml) of extraction buffer (Appendix 3) and agitate on a rotary shaker (50 to 100 rpm) for four hours below 24 °C or for 16 to 24 hours refrigerated,
täck naveländarna genom att tillsätta en tillräcklig mängd (ungefär 40 ml) extraktionsbuffert (tillägg 3) och skaka på en rotationsskak (50–100 r/min) under 4 timmar vid en temperatur lägre än 24 °C eller under 16–24 timmar nedkylt,
homogenise the cores with sufficient volume (approximately 40 ml) of extraction buffer (Appendix 3), either in a blender (e.g. Waring or Ultra Thurax) or by crushing in a sealed disposable maceration bag (e.g. Stomacher or Bioreba strong guage polythene, 150 mm × 250 mm; radiation sterilised) using a rubber mallet or suitable grinding apparatus (e.g. Homex).
homogenisera naveländarna i en tillräcklig mängd (ungefär 40 ml) extraktionsbuffert (tillägg 3), antingen i en mixer (t.ex. Waring mixer eller Ultra Thurrax) eller genom att krossa dem i en förseglad engångspåse för finfördelning (t.ex. Stomacherpåse eller stark polyten från Bioreba, 150 × 250 mm, steriliserad genom strålning) med en gummihammare eller lämplig malapparat (t.ex. Homex).
The risk of cross-contamination of samples is high when samples are homogenized using a blender.
Risken för korskontaminering av proverna är hög när de homogeniseras med en mixer.
Take precautions to avoid aerosol generation or spillage during the extraction process.
Vidta försiktighetsåtgärder så att det inte alstras aerosoler eller uppkommer spill under extraheringen.
Ensure that freshly sterilised blender blades and vessels are used for each sample.
Se till att nyligen steriliserade mixerblad och behållare används för varje prov.
If the PCR test is to be used, avoid carry-over of DNA on containers or grinding apparatus.
Om PCR-test skall användas, undvik överföring av DNA till behållare eller malapparat.
Crushing in disposable bags and use of disposable tubes is recommended where PCR is to be used.
Krossning i engångspåsar och användning av engångsrör rekommenderas när PCR-test används.
Decant the supernatant.
Dekantera supernatanten.
If excessively cloudy, clarify either by slow speed centrifugation (at not more than 180 g for 10 minutes at a temperature between 4 to 10 °C) or by vacuum filtration (40 to 100 µm), washing the filter with additional (10 ml) extraction buffer (Appendix 3).
Om den är mycket grumlig, separera genom långsam centrifugering (högst 180 g under 10 minuter vid en temperatur på 4–10 °C) eller genom vakuumfiltrering (40–100 µm), varvid filtret tvättas med ytterligare (ca 10 ml) extraktionsbuffert (tillägg 3).
Concentrate the bacterial fraction by centrifugation at 7000 g for 15 minutes (or 10000 g for 10 minutes) at a temperature between 4 to 10 °C and discard the supernatant without disturbing the pellet.
Koncentrera bakteriedelen genom centrifugering vid 7000 g under 15 minuter (eller 10000 g under 10 minuter) vid en temperatur av 4–10 °C och häll bort supernatanten utan att störa pelleten.
Resuspend the pellet in 1,5 ml pellet buffer (Appendix 3).
Återsuspendera pelleten i 1,5 ml pelletbuffert (tillägg 3).
Use 500 µl to test for C. m. subsp. sepedonicus, 500 µl for Ralstonia solanacearum and 500 µl for reference purposes.
Använd 500 µl för att testa för C. m. subsp. sepedonicus, 500 µl för Ralstonia solanacearum och 500 µl i referenssyfte.
Add sterile glycerol to final concentration of 10 to 25 % (v/v) to the 500 µl of the reference aliquot and to the remaining test aliquot, vortex and store at –16 to –24 °C (weeks) or at 68 to –86 °C (months).
Tillsätt steril glycerol till en slutkoncentrationen av 10–25 volymprocent till 500 µl av referensdelprovet och till det återstående testdelprovet. Skaka och förvara vid –16 till –24 °C (veckor) eller vid –68 till –86 °C (månader).
Preserve the test aliquots at 4 to 10 °C during testing.
Förvara testdelproven vid 4–10 °C under testningen.
Repeated freezing and thawing is not advisable.
Upprepade nedfrysningar och upptiningar är inte tillrådliga.
If transport of the extract is required, ensure delivery in a cool box within 24 to 48 hours.
Om transport av extraktet krävs, se till att leveransen sker i en kall behållare inom 24–48 timmar.
It is imperative that all C. m. subsp. sepedonicus positive controls and samples are treated separately to avoid contamination.
Det är absolut nödvändigt att alla C. m. subsp. sepedonicus-positiva kontroller och prover hanteras separat för att undvika nedsmittning.
This applies to IF slides and to all tests.
Detta gäller även för IF-glas och samtliga test.
For detection of latent C. m. subsp. sepedonicus populations it is advised to test composite samples.
För upptäckt av latenta populationer av C. m. subsp. sepedonicus rekommenderas testning av blandprover.
The procedure can be conveniently applied for composite samples of up to 200 stem parts.
Förfarandet kan även lätt användas för blandprover bestående av upp till 200 stjälkdelar.
(Where surveys are performed they should be based on a statistically representative sample of the plant population under investigation.)
(Om undersökningar görs bör dessa grundas på ett statistiskt representativt prov av den plantpopulation som undersöks.)