natgillin/translations-raw huggingface dataset:
1999, Seber and Wild, 2003, Motulsky and Christopoulos 2004, Huet et al.
Odporúča sa, aby výsledky vychádzali z nameraných koncentrácií.
2003).
Ak bola koncentrácia testovanej chemikálie v roztoku uspokojivo udržiavaná v rozsahu ± 20 % nominálnej koncentrácie počas celého testu, výsledky môžu vychádzať buď z nominálnych, alebo z nameraných hodnôt.
Any transformation of responses prior to analysis should preserve the independence of the observations and ECx and its confidence bounds should be expressed in the original units of measurement, rather than in transformed units.
Vzorky je možno potrebné filtrovať (napr. cez filter s veľkosťou pórov 0,45 μm) alebo odstreďovať.
For example, a 20 % change in the logarithm of length is not equivalent to a 20 % change in length (Lyles et.al 2008, Draper and Smith 1999).
V prípade potreby je odstreďovanie odporúčaným postupom.
The flowchart in figure 4 gives an overview for ECx estimations.
Ak sa však testovaný materiál neadsorbuje na filtri, aj filtrácia je prijateľná.
The details are described in the text below.
Počas testu by sa najmenej raz za týždeň mala merať koncentrácia rozpusteného kyslíka, teplota a hodnota pH vo všetkých testovacích nádobách.
Figure 4
Najmenej raz za týždeň by sa mala merať celková tvrdosť vody a alkalita v kontrolných nádobách a v jednej nádobe s najvyššou koncentráciou.
Flow chart for ECx Estimation of Replicate Mean Length, Weight, or Proportion of Egg Hatch or Larval Mortality, see text for more details Select a larget value of x or a different model
V priebehu alebo na konci testu sa posudzujú viaceré všeobecné (napr. prežitie) a biologické reakcie (napr. úroveň VTG).
Is (a) predicted response at ECx within CI for control, or (b) predicted response within CI for predicted response at ECx or (c) CI for ECx too wide?
Vyžaduje sa denné kvantitatívne monitorovanie plodivosti.
Compute 95 % CI for predicted response at control and at Ecx, Compute 95 % CI for ECx.
Meranie a hodnotenie týchto ukazovateľov a ich využitie sú opísané v ďalších bodoch.
Compare models using AICc criteria or professional judgement and select best fit
Prežitie
Assess goodness of fit of models: (a) visually, (b) compare predicted % effect to observed % effect, (c) compare control mean response to predicted mean response, (d) compare regression residual SS to pure error SS using F-test.
Ryby by sa mali počas testovacieho obdobia denne prehliadnuť, každý úhyn by sa mal zaznamenať a uhynutá ryba čo najskôr odstrániť.
Reject poorly fitting models.
Mŕtve ryby by sa nemali nahrádzať ani v kontrolných nádobách, ani v nádobách s aplikovanou chemikáliou.
8 or more concentrations plus control 6 or 7 concentrations plus control 5 concentrations plus control
Pohlavie rýb, ktoré uhynuli počas testu, by sa malo určiť makroskopickým hodnotením gonád.
Report model, ECx and its CI If no model and acceptable x can be found, report NOEC No Yes
Správanie a vzhľad
If no indication of extra-binominal variance, probit model can be fit to proportion data Also fit Brain-Cousins Hormetic model
Akékoľvek abnormálne správanie (v porovnaní s kontrolnými skupinami) by sa malo zaznamenať; môže ísť o príznaky všeobecnej toxicity vrátane hyperventilácie, nekoordinovaného plávania, straty rovnováhy a atypickej nehybnosti alebo atypického kŕmenia.
Also fit OECD 4 & 5, Hill, Michaelis-Menton or other 3-5 parm model
Okrem toho by sa mali zaznamenať aj vonkajšie abnormality (ako napríklad krvácanie, strata farby).
For Bruce-Versteeg, simple exponential (OECD2), simple exponential w/shape parameter (OECD3) or other 2-3 parm model
Takéto príznaky toxicity by sa mali starostlivo zvážiť pri interpretácii údajov, lebo môžu naznačovať existenciu koncentrácií, pri ktorých biomarkery endokrinného pôsobenia nie sú spoľahlivé.
Considerations for Egg Hatch and Larval Mortality
Takéto pozorovania správania môžu poskytovať aj užitočné kvalitatívne informácie na vypracovanie potenciálnych budúcich požiadaviek na vykonávanie testov s rybami.
For egg hatch and larval mortality, it is generally best to fit a decreasing model unless one is fitting a probit model as described below.
Napríklad, v prípade normálnych samcov a maskulinizovaných samíc čereble potočnej vystavených androgénnemu pôsobeniu bola pozorovaná teritoriálna agresivita; v prípade dania pruhovaného sa po vystavení estrogénnemu alebo antiandrogénnemu pôsobeniu znižuje alebo brzdí charakteristická aktivita pri párení a neresení po navodení svetelných podmienok svitania.
That is, one should model the proportion of eggs that do not hatch or larvae that die.
Keďže niektoré aspekty vzhľadu (predovšetkým farba) sa môžu rýchlo zmeniť pri manipulácii, je dôležité, aby sa kvalitatívne pozorovania vykonávali pred vybratím živočíchov z testovacieho systému.
The reason for this is that ECx refers to a concentration at which there is a change equal to x % of the control mean response.
Doterajšie skúsenosti s druhom čereble potočnej naznačujú, že niektoré chemikálie s účinkom na endokrinný systém môžu najskôr vyvolať zmeny týchto vonkajších znakov: farba tela (svetlá alebo tmavá), vzorované sfarbenie (prítomnosť zvislých pruhov) a tvar tela (hlavová a prsná oblasť).
If there are 5 % control eggs that fail to hatch and one models failure to hatch, then EC20 refers to a concentration at which there is a change equal to 20 % of the 5 % control failure to hatch, and that is a change of 0,2 × 0,05 = 0,01 or 1 percentage point to 6 % failure to hatch.
Pozorovania fyzického vzhľadu rýb by sa preto mali vykonávať v priebehu celého testu a na záver štúdie.
Such a small change cannot be estimated in any meaningful way from the data available and is not biologically important.
Plodivosť
Whereas if one models the proportion of eggs that hatch, the control proportion would be 95 % in this example and a 20 % reduction from the control mean would be a change of 0,95 × 0,2 = 0,18, so from 95 % hatch success to 77 % (= 95 – 18) hatching success and that effects concentration can be estimated and is presumably of greater interest.
Denné kvantitatívne pozorovania neresenia by sa mali zaznamenávať podľa replikátov.
This is not an issue with size measurements, though adverse effects on size generally mean a decrease in size.
Produkcia vajíčok by sa mala zaznamenávať ako počet vajíčok/samicu, ktorá prežila/deň podľa replikátov.
Models for Size (length or weight) and Egg Hatch Success or Larval Survival.
Vajíčka sa budú z testovacích komôr odstraňovať denne.
Except for the Brain-Cousens hormetic model, all of these models are described and recommended in OECD (2006).
V prípade čereble potočnej a dania pruhovaného by sa mali substráty na neresenie umiestniť do testovacej komory, aby sa rybám umožnilo neresiť sa v normálnych podmienkach.
What are called OECD 2-5, are also discussed for ecotoxicity experiments in Slob (2002).
V dodatku 4 sa uvádzajú ďalšie podrobnosti o odporúčaných substrátoch na neresenie pre danio pruhované (dodatok 4A) a čerebľu potočnú (dodatok 4B).
There are, of course, many other models that might be useful.
Poskytnutie substrátu na neresenie pre ryžovníčku japonskú sa nepovažuje za nevyhnutné.
Simple Exponential (OECD 2)
Najmä chemikálie s určitými mechanizmami pôsobenia môžu vyvolávať abnormálny výskyt sekundárnych pohlavných znakov u zvierat opačného pohlavia; napríklad agonisty androgénových receptorov, ako sú trenbolón, metyltestosterón a dihydrotestosterón, môžu spôsobovať vyvinutie výrazných tuberkulov u samíc čereble potočnej alebo papilárnych výbežkov u samíc ryžovníčky japonskej (11, 20, 21).
Exponential with shape parameter (OECD 3)
Uvádza sa takisto, že agonisty estrogénových receptorov môžu znížiť počet tuberkulov a veľkosť záhlavnej časti chrbta u dospelých samcov čereble potočnej (26, 27).
Simple Exponential with Lower Bound (OECD 4)
Takéto celkové morfologické pozorovania môžu poskytovať užitočné kvalitatívne a kvantitatívne informácie na vypracovanie potenciálnych budúcich požiadaviek na vykonávanie testov s rybami.
With 6 or more test concentrations plus control
Počet a veľkosť tuberkulov u čereble potočnej a papilárnych výbežkov u ryžovníčky japonskej možno kvantifikovať priamo alebo praktickejšie na konzervovaných exemplároch.
Exponential with shape parameter and lower bound (OECD 5)
V dodatkoch 5A a 5B sú uvedené odporúčané postupy hodnotenie sekundárnych pohlavných znakov čereble potočnej a ryžovníčky japonskej v uvedenom poradí.
Where there is visual evidence of hormesis (unlikely with egg hatch success or larval survival, but sometimes observed in size observations)
Vitelogenín (VTG)
Brain-Cousens Hormetic; Brain and Cousens (1989)
Krv sa odoberá z chvostovej tepny/žily heparinizovanou mikrohematokritovou kapilárou alebo alternatívne srdcovou punkciou pomocou striekačky.
Alternative models for egg hatch failure and larval mortality
V závislosti od veľkosti rýb sa objem krvi, ktorú je možné odobrať, vo všeobecnosti pohybuje v rozsahu – 60 μl na jedinca čereble potočnej a 5 – 15 μl na jedinca dania pruhovaného.
Increasing models for these responses can be fit by probit (or logistic) models if there is no evidence of extra-binomial variance and control incidence is estimated in the model fit.
Plazma sa oddelí od krvi odstredením a uchová sa s inhibítorom proteázy pri teplote – 80 °C, pokým nebude analyzovaná na prítomnosť VTG.
This is not the preferred method, as it treats the individual, not the replicate, as the unit of analysis (Morgan 1992, O'Hara Hines and Lawless 1993, Collett 2002, 2003).
Alternatívne sa ako zdroj tkaniva na stanovenie VTG použije pečeň v prípade ryžovníčky japonskej a homogenát hlavy/chvosta v prípade dania pruhovaného (dodatok 6).
Goodness of fit of a single model
Meranie VTG by malo byť založené na validovanej homologickej metóde ELISA s použitím homologického štandardu VTG a homologických protilátok.
Visually compare observed and predicted percent decrease at each test concentration (Motulsky and Christopoulos 2004, Draper and Smith 1999).
Odporúča sa použiť metódu, ktorou možno zistiť množstvo VTG na úrovni niekoľkých ng/ml plazmy (alebo ng/mg tkaniva), čo je úroveň pozadia v tele samcov rýb, ktoré neboli vystavené chemikálii.
Compare regression error mean square against the pure error mean square using an F-test (Draper and Smith 1999).
Kontrola kvality analýzy VTG sa vykoná s použitím štandardov, slepých vzoriek a aspoň duplicitnej analýzy.
Check that every term in the model is significantly different from zero (i.e., determine whether all model terms are important), (Motulsky and Christopoulos 2004).
Pre každú metódu ELISA by sa mal na určenie minimálneho faktora riedenia vzorky vykonať test na matricový efekt (efekt zriedenia vzorky).
Plots of residuals from regression vs. test concentration, possibly on a log(conc) scale.
Analyzovať sa budú najmenej dve alikvotné časti (paralelné) každého zriedenia vzorky.
There should be no pattern to this plot; the points should be randomly scattered about a horizontal line at zero height.
Paralelné vzorky, ktoré sa líšia o viac ako 20 %, by sa mali opätovne analyzovať.
The data should be evaluated for normality and variance homogeneity in the same way as indicated in Appendix 5.
Korelačný koeficient (R2) pre kalibračné krivky by mal byť väčší ako 0,99.
In addition, normality of the residuals about the regression model should be assessed using the same methods indicated in Appendix 5 for the residuals from ANOVA
Vysoká korelácia však nie je dostatočná na to, aby sa zaručilo primerané predvídanie koncentrácie vo všetkých rozsahoch.
Compare models
Okrem dostatočne vysokej korelácie pre kalibračnú krivku by koncentrácia každého štandardu, ktorá sa vypočíta z kalibračnej krivky, mala ležať v rozsahu 70 – 120 % nominálnej koncentrácie.
Use Akiake's AICc criteria.
Ak sa nominálne koncentrácie odkláňajú od kalibračnej regresnej priamky (napr. pri nižších koncentráciách), môže byť nevyhnutné rozdeliť kalibračnú krivku na nízky a vysoký rozsah, alebo použiť nelineárny model, ktorý primerane zodpovedá údajom o absorbancii.
Smaller AICc values denote better fits and if AICc(B)-AICc(A)≥10, the model A is almost certainly better than model B (Motulsky and Christopoulos (2004).
Ak sa krivka rozdelí, obidve jej časti by mali mať R2 > 0,99.
Compare the two models visually by how well they meet the single model criteria above.
Detekčný limit (LOD) je definovaný ako koncentrácia najnižšieho analytického štandardu a kvantifikačný limit (LOQ) je definovaný ako súčin koncentrácie najnižšieho analytického štandardu a najnižšieho faktora riedenia.
The parsimony principal is advised, whereby the simplest model that fits the data reasonably well is used (Ratkowsky 1993, Lyles et.al 2008).
Každý deň, keď sa vykonávajú testy na zistenie VTG, sa bude analyzovať obohatená vzorka s použitím „inter-assay“ referenčného štandardu (dodatok 7).
Quality of ECx estimate
Spolu s výsledkami z každého súboru testov vykonaných v tento deň sa uvádza pomer očakávanej koncentrácie a nameranej koncentrácie.
The confidence interval (CI) for ECx should not be too wide.
Vyhodnotenie histopatológie gonád
Statistical judgment is needed in deciding how wide the confidence interval can be and ECx still be useful.
Vykonanie histopatológie gonád môžu vyžadovať regulačné orgány na preštudovanie cieľového orgánu na osi HHG po vystavení chemikálii.
Simulations for regression models fit to egg hatching and size data show that about 75 % of confidence intervals for ECx (x = 10, 20 or 30) span no more than two test concentrations.
V tomto zmysle sa gonády fixujú buď v celku alebo rozrezané.
This provides a general guide for what is acceptable and a practical guide for what is achievable.
Keď sa vyžaduje histopatológia, budú sa pri posudzovaní endokrinného pôsobenia testovanej chemikálie hľadať špecifické reakcie na gonádach súvisiace s endokrinným systémom.
Numerous authors assert the need to report confidence intervals for all model parameters and that wide confidence intervals for model parameters indicate unacceptable models (Ott and Longnecker 2008, Alvord and Rossio 1993, Motulsky and Christopoulos 2004, Lyles et al.
Tieto diagnostické reakcie v zásade zahŕňajú prítomnosť testikulárnych oocytov, Leydigovej bunkovej hyperplázie, zníženú tvorbu žĺtka, zvýšené množstvo spermatogónií a perifolikulárnu hyperpláziu.
2008, Seber and Wild 2003, Bunke et al.
Ďalšie lézie gonád, ako je atrézia oocytov, degenerácia semenníkov a zmeny v štádiách, môžu mať rôzne príčiny.
1999, Environment Canada 2005).
V pokynoch k histopatológii rybích gonád sa stanovujú postupy, ktoré sa budú používať pri rozrezaní, fixovaní, narezaní tenkých vrstiev a histopatologickom vyhodnotení gonád (22).
The CI for ECx (or any other model parameter) should not contain zero (Motulsky and Christopoulos 2004).
Vyhodnocovanie reakcií biomarkerov analýzou rozptylu (ANOVA)
This is the regression equivalent the minimum significant difference that is often cited in hypothesis testing approaches (e.g. Wang et al 2000).
Na zistenie potenciálneho pôsobenia chemikálie sa porovnávajú reakcie v skupinách s aplikovanou chemikáliou a reakcie v kontrolných skupinách pomocou analýzy rozptylu (ANOVA).
It also corresponds to the confidence interval for the mean responses at the LOEC not contain the control mean.
Ak sa použije kontrolná skupina s rozpúšťadlom, mali by sa pre každý sledovaný ukazovateľ vykonať vhodné štatistické testy na porovnanie kontrolných skupín s vodou na riedenie a kontrolných skupín s rozpúšťadlom.
One should wonder whether the parameter estimates are scientifically plausible.
Usmernenia k spôsobu spracovania údajov z kontrolných skupín s vodou na riedenie a kontrolných skupín s rozpúšťadlom v následnej štatistickej analýze možno nájsť v dokumente OECD 2006c (28).
E.g. if the confidence interval for y0 is ± 20 %, no EC10 estimate is plausible.
Všetky údaje o biologických reakciách by sa mali analyzovať a uvádzať osobitne podľa pohlavia.
If the model predicts a 20 % effect at a concentration C and the maximum observed effect at C and lower concentrations is 10 %, then the EC20 is not plausible (Motulsky and Christopoulos 2004, Wang et al.
Ak sa nesplnia požadované predpoklady parametrických metód – iné ako normálne rozdelenie (napr. Shapirov-Wilkov test) alebo heterogénny rozptyl (Barlettov alebo Levenov test), malo by sa zvážiť transformovanie údajov pred vykonaním analýzy ANOVA tak, aby sa dosiahli homogénne rozptyly, alebo vykonanie váženej ANOVA.
2000, Environment Canada 2005).
V prípade nemonotónnej závislosti reakcie od dávky možno použiť Dunnettov test (parametrický) na viacnásobné párové porovnávanie alebo Mannov-Whitneyho test s Bonferroniho úpravou (neparametrický).
ECx should not require extrapolation outside the range of positive concentrations (Draper and Smith 1999, OECD 2006).
Ak je závislosť reakcie od dávky približne monotónna, možno použiť iné štatistické testy (napr. Jonckheereho-Terpstrov test trendu alebo Williamsov test).
For example, a general guide might be for ECx to be no more than about 25 % below the lowest tested concentration or above the highest tested concentration.
V dodatku 8 je uvedený štatistický vývojový diagram, ktorý má pomôcť pri rozhodovaní o najvhodnejšom štatistickom teste, ktorý sa má použiť.
Brain P. and Cousens R. (1989); An equation to describe dose responses where there is stimulation of growth at low doses.
Doplnkové informácie možno získať aj z dokumentu OECD o súčasných prístupoch v štatistickej analýze údajov o ekotoxicite (28).
Weed res.
Popis výsledkov testu
29: 93-96.
Údaje zo štúdie by mali zahŕňať:
OECD (2006); Current approaches in the statistical analysis of ecotoxicity data: A guidance to application.
Testovacie zariadenie:
Series Testing and Assessment, No. 54, Organisation for Economic Co-operation and Development, OECD, Paris.
zodpovední pracovníci a ich úlohy v rámci štúdie,
C.48 Fish Short Term Reproduction Assay
každé laboratórium by malo preukázať odbornosť v používaní škály reprezentatívnych chemikálií.
This test method is equivalent to OECD test guideline (TG) 229 (2012).
charakteristika testovanej chemikálie,
The need to develop and validate a fish assay capable of detecting endocrine active chemicals originates from the concerns that environmental levels of chemicals may cause adverse effects in both humans and wildlife due to the interaction of these chemicals with the endocrine system.
fyzikálny charakter a dôležité fyzikálno-chemické vlastnosti,
In 1998, the OECD initiated a high-priority activity to revise existing guidelines and to develop new guidelines for the screening and testing of potential endocrine disruptors.
metóda a frekvencia prípravy testovacích koncentrácií,
One element of the activity was to develop a test guideline for the screening of chemicals active on the endocrine system of fish species.
informácie o stabilite a biodegradovateľnosti.
The Fish Short Term Reproduction Assay underwent an extensive validation programme consisting of inter-laboratory studies with selected chemicals to demonstrate the relevance and reliability of the assay for the detection of chemicals that impact reproduction in fish by various mechanisms including endocrine modalities (1, 2, 3, 4, 5).
charakteristika rozpúšťadla (povaha, použitá koncentrácia),
All endpoints of the OECD test guideline have been validated on the fathead minnow, and a subset of endpoints has been validated in the Japanese medaka (i.e. vitellogenin and secondary sex characteristics) and the zebrafish (i.e. vitellogenin).
odôvodnenie výberu rozpúšťadla (ak je iné ako voda).
The validation work has been peer-reviewed by a panel of experts nominated by the National Coordinators of the OECD Test Guideline Programme (6) in part, and by an independent panel of experts commissioned by the United States Environmental Protection Agency (29).
druh a kmeň,
The assay is not designed to identify specific mechanisms of hormonal disruption because the test animals possess an intact hypothalamic-pituitary-gonadal (HPG) axis, which may respond to chemicals that impact on the HPG axis at different levels.
dodávateľ a konkrétne zariadenie dodávateľa,
This test method describes an in vivo screening assay where sexually mature male and spawning female fish are held together and exposed to a chemical during a limited part of their life-cycle (21 days).
vek rýb na začiatku testu a stav reprodukcie/neresenia,
At termination of the 21-day exposure period, two biomarker endpoints are measured in males and females as indicators of endocrine activity of the test chemical; these endpoints are vitellogenin and secondary sexual characteristics.
údaje o postupe aklimatizácie zvierat,
Vitellogenin is measured in fathead minnow, Japanese medaka and zebrafish, whereas secondary sex characteristics are measured in fathead minnow and Japanese medaka.
telesná hmotnosť rýb na začiatku expozície (z podvzorky populácie rýb).
Additionally, quantitative fecundity is monitored daily throughout the test.
použitý postup testovania (druh testu, veľkosť násady, chovná hustota atď.),
Gonads are also preserved and histopathology may be evaluated to assess the reproductive fitness of the test animals and to add to the weight of evidence of other endpoints.
metóda prípravy zásobných roztokov a prietok,
This bioassay serves as an in vivo reproductive screening assay and its application should be seen in the context of the “OECD Conceptual Framework for the Testing and Assessment of Endocrine Disrupting Chemicals” (30).
nominálne testovacie koncentrácie, týždenne merané koncentrácie testovacích roztokov a použitá analytická metóda, stredné namerané hodnoty a štandardné odchýlky v testovacích nádobách a dôkaz o tom, že merania zodpovedajú koncentráciám testovanej chemikálie v skutočnom roztoku,
In this Conceptual Framework the Fish Short Term Reproduction Assay is proposed at Level 3 as an in vivo assay providing data about selected endocrine mechanism(s)/pathway(s).
vlastnosti vody na riedenie (vrátane pH, tvrdosti, alkality, teploty, koncentrácie rozpusteného kyslíka, úrovne zvyškového chlóru, celkového obsahu organického uhlíka, suspendovaných tuhých látok a výsledkov akýchkoľvek iných vykonaných meraní),
Vitellogenin (VTG) is normally produced by the liver of female oviparous vertebrates in response to circulating endogenous oestrogen.
kvalita vody v testovacích nádržiach: pH, tvrdosť, teplota a koncentrácia rozpustného kyslíka,
It is a precursor of egg yolk proteins and, once produced in the liver, travels in the bloodstream to the ovary, where it is taken up and modified by developing eggs.
podrobné informácie o kŕmení [napr. druh potravy, zdroj, dávkované množstvo a frekvencia a analýza príslušných kontaminantov (napr. polychlórované bifenyly, polycyklické aromatické uhľovodíky a organochlórové pesticídy), ak je k dispozícii].
Vitellogenin is almost undetectable in the plasma of immature female and male fish because they lack sufficient circulating oestrogen; however, the liver is capable of synthesising and secreting vitellogenin in response to exogenous oestrogen stimulation.
dôkaz, že kontrolné skupiny splnili akceptačné kritériá testu,
The measurement of vitellogenin serves for the detection of chemicals with various oestrogenic modes of action.
údaje o úmrtnosti vyskytujúcej sa pri každej z testovacích koncentrácií a v kontrolnej skupine,
The detection of oestrogenic chemicals is possible via the measurement of vitellogenin induction in male fish, and it has been abundantly documented in the scientific peer-reviewed literature (e.g. (7)).
používané štatistické analytické techniky, spracovanie údajov a odôvodnenie použitia daných techník,
Vitellogenin induction has also been demonstrated following exposure to aromatisable androgens (8, 9).
údaje o biologických pozorovaniach celkovej morfológie vrátane sekundárnych pohlavných znakov, tvorbe vajíčok a VTG,
A reduction in the circulating level of oestrogen in females, for instance through the inhibition of the aromatase converting the endogenous androgen to the natural oestrogen 17β-estradiol, causes a decrease in the VTG level which is used to detect chemicals having aromatase inhibiting properties (10, 11).
výsledky analýz údajov, najlepšie v tabuľkovej a grafickej forme,