natgillin/translations-raw huggingface dataset:
method of euthanasia;
štruktúrne chromozómové poškodenie prejavujúce sa ako zlom alebo zlom a opätovné spojenie oboch chromatíd na rovnakej strane.
method of analgesia (where used);
proces, v ktorom po S fáze replikácie DNA jadro neprechádza do mitózy, ale začína ďalšiu S fázu.
detailed description of treatment and sampling schedules and justifications for the choices;
Výsledkom sú chromozómy so 4, 8, 16... chromatídami.
methods of slide preparation;
achromatická lézia menšia ako šírka jednej chromatídy s minimálnym posunutím chromatíd.
methods for measurement of toxicity;
Mitotický index
identity of metaphase arresting chemical, its concentration, dose and time of administration before sampling;
pomer medzi počtom buniek v mitóze a celkovým počtom buniek v populácii, ktorý je meradlom stavu proliferácie tejto bunkovej populácie.
procedures for isolating and preserving samples;
zmena v počte chromozómov v porovnaní s bežným počtom charakteristickým pre použité zvieratá (aneuploidia).
number of metaphase cells analysed per animal and the number of cells analysed for mitotic index determination;
numerická chromozómová aberácia, ktorá zahŕňa zmenu počtu celých súborov chromozómov, na rozdiel od numerickej zmeny v časti súboru chromozómov (pozri aneuploidia).
criteria for acceptability of the study;
Štruktúrna chromozómová aberácia
criteria for considering studies as positive, negative or inconclusive.
zmena v chromozómovej štruktúre rozpoznateľná mikroskopickým skúmaním metafázového štádia delenia buniek, pozorovaná ako delécie a fragmenty, intrachromozomálne výmeny alebo interchromozomálne výmeny.
mitotic index, given separately for each animal;
Faktoriálny experiment a jeho analýza
type and number of aberrations and of aberrant cells, given separately for each animal;
V tomto návrhu sa testuje minimálne 5 samcov a 5 samíc na každej úrovni koncentrácie, čo vedie k použitiu minimálne 40 zvierat (20 samčekov a 20 samičiek, spolu s príslušnými pozitívnymi kontrolami).
total number of aberrations per group with means and standard deviations;
Tento model je jedným z jednoduchších faktoriálnych experimentov a zodpovedá dvojsmernej analýze rozptylu, ktorá má dva zásadné vplyvy, a to na pohlavie a úroveň koncentrácie.
changes in ploidy, if seen, including frequencies of polyploid and/or endoreduplicated cells;
Pomocou analýzy sa variabilita v súbore údajov rozdelí na variabilitu medzi pohlaviami, variabilitu medzi koncentráciami a variabilitu v súvislosti s interakciou medzi pohlaviami a koncentráciami.
dose-response relationship, where possible;
Každý z týchto znakov sa testuje v porovnaní s odhadom variability medzi paralelnými zvieratami (replikátmi) v rámci skupín zvierat rovnakého pohlavia pri rovnakej koncentrácii.
statistical analyses and method applied;
Podrobné informácie o použitej metodike sú dostupné v mnohých štandardných štatistických príručkách (pozri odkazy) a v rámci podpory poskytnutej v balíkoch pre štatistiku.
data supporting that exposure of the bone marrow occurred;
Analýza začína kontrolou znaku interakcie pohlavia a koncentrácie v tabuľke ANOVA [1].
concurrent negative control and positive control data with ranges, means and standard deviations;
Ak nenastane výrazná interakcia kombinovaných hodnôt (obe pohlavia a rôzne koncentrácie testovanej látky), platné štatistické testy ANOVA poskytnú informáciu o významnosti rozdielov medzi porovnávanými skupinami a parametrami na základe ich vnútornej variability.
historical negative and positive control data with ranges, means, standard deviations, and 95 % control limits for the distribution, as well as the time period covered and number of observations;
Analýza pokračuje rozdelením odhadovaných hodnôt pre variabilitu medzi koncentráciami na kontrasty, ktoré umožňujú testovanie na lineárne a kvadratické kontrasty reakcií pri všetkých úrovniach koncentrácií.
criteria met for a positive or negative response.
Ak dôjde k významnej interakcii pohlavia a koncentrácie, tento znak možno takisto ďalej rozdeliť na porovnanie interakcií lineárnosti a pohlavia, ako aj kvadratickej interakcie a pohlavia.
Conclusion.
Tieto znaky vedú k testom, ktoré preukážu, či sú odozvy na koncentrácie paralelné u oboch pohlaví, alebo či obe pohlavia vykazujú odlišné odozvy.
References.
Odhad kumulovanej variability v rámci skupiny možno použiť na párové testovanie rozdielov medzi priemernými hodnotami.
Parry (eds.), IRL Press, Washington, DC, pp. 275-306.
Ak existujú prípady významnej interakcie, je možné porovnávať priemery rozličných koncentrácií v rámci pohlavia alebo priemery za jednotlivé pohlavia pri rovnakej koncentrácii.
, “In Vivo Cytogenetics Assays”, in Basic Mutagenicity Tests, UKEMS Recommended Procedures.
Odkazy
Part I revised, Kirkland, D.J.
Existuje mnoho štatistických publikácií, ktoré rozoberajú teóriu, model, metodiku, analýzu a interpretáciu faktoriálnych experimentov, od tých najjednoduchších dvojfaktorových analýz k tým zložitejším, ktoré sú opísané v publikácii „Design of Experiment methodology“ (Model experimentálnej metodiky).
(ed.), Cambridge University Press, Cambridge, pp. 115-141.
Tento zoznam nie je úplný.
OECD (2000), “Guidance Document on the Recognition, Assessment and Use of Clinical Signs as Humane Endpoints for Experimental Animals Used in Safety Evaluation”, OECD Environment, Health and Safety Publications (EHS), Series on Testing and Assessment, No19, OECD Publishing, Paris.
V niektorých knihách sú uvedené vypracované príklady porovnateľných modelov, v niektorých prípadoch s kódom na vykonanie analýzy pomocou rozličných softvérových programov.
, “Statistical Analysis of in vivo Cytogenetic Assays”, in Statistical Evaluation of Mutagenicity Test Data.
Štatistici, ktorí si zvolia vzorový postup, ako napríklad použitie všeobecných lineárnych modelov (General Linear Models, GLM), môžu vykonať analýzu odlišným, no porovnateľným spôsobom, nemusia však nevyhnutne vychádzať z tabuľky ANOVA, ktorá pochádza z obdobia, kedy sa pri výpočte štatistík vypracúvaných v období pred počítačovou érou uplatňovali algoritmické postupy.
UKEMS SubCommittee on Guidelines for Mutagenicity Testing, Report, Part III, Kirkland, D.J.
V časti B sa kapitola B.12 nahrádza takto:
(ed.), Cambridge University Press, Cambridge, pp. 184-232.
Mikrojadrový (mikronukleový) test na erytrocytoch cicavcov
Any deviation from the normal diploid (or haploid) number of chromosomes by one or more chromosomes, but not by multiples of entire set(s) of chromosomes (cf. polyploidy).
Táto testovacia metóda je rovnocenná s usmernením OECD na vykonávanie testov 474 (2016).
Centromere
Tento in vivo mikrojadrový test na cicavcoch je osobitne relevantný pre hodnotenie genotoxicity, pretože faktory in vivo metabolizmu, farmakokinetiky a opravných procesov DNA sú aktívne a prispievajú k reakciám, hoci sú v prípade rôznych druhov odlišné.
Region(s) of a chromosome with which spindle fibers are associated during cell division, allowing orderly movement of daughter chromosomes to the poles of the daughter cells.
In vivo mikrojadrový test na cicavcoch sa používa na zisťovanie poškodenia vyvolaného testovanou chemikáliou na chromozómoch alebo mitotickom aparáte erytroblastov.
Structural chromosome damage expressed as breakage of single chromatids or breakage and reunion between chromatids.
Testom sa hodnotí tvorba mikrojadier v erytrocytoch odobratých buď z kostnej drene alebo z periférnych krvných buniek zvierat, zvyčajne hlodavcov.
Structural chromosome damage expressed as breakage, or breakage and reunion, of both chromatids at an identical site.
Účelom mikrojadrového testu je identifikovať chemikálie spôsobujúce cytogenetické poškodenie, ktorého výsledkom je tvorba mikrojadier obsahujúcich buď oneskorené chromozómové fragmenty alebo celé chromozómy.
A process in which after an S period of DNA replication, the nucleus does not go into mitosis but starts another S period.
Keď sa erytroblast kostnej drene vyvinie na nezrelý erytrocyt (niekedy sa uvádza aj ako polychromatický erytrocyt alebo retikulocyt), hlavné jadro sa vypudzuje; akékoľvek mikrojadro, ktoré sa vytvorilo, môže zostať v cytoplazme.
The result is chromosomes with 4,8,16…chromatids.
Vizualizácia alebo detekcia mikrojadier je v týchto bunkách jednoduchšia, pretože nemajú hlavné jadro.
Gap
Zvýšenie frekvencie nezrelých erytrocytov s mikrojadrami u ovplyvnených zvierat je indikáciou vyvolaných štruktúrnych alebo numerických chromozómových aberácií.
An achromatic lesion smaller than the width of one chromatid, and with minimum misalignment of the chromatids.
Novovytvorené erytrocyty s mikrojadrami sa identifikujú a ich počty sa stanovujú farbením, po ktorom nasleduje buď vizuálne hodnotenie pomocou mikroskopu alebo automatická analýza.
Mitotic index
Použitie automatizovanej hodnotiacej platformy značne uľahčuje počítanie dostatočného množstva nezrelých erytrocytov v periférnej krvi alebo v kostnej dreni dospelých zvierat.
The ratio between the number of cells in mitosis and the total number of cells in a population, which is a measure of the proliferation status of that cell population.
Takéto platformy sú prijateľnými alternatívami manuálneho hodnotenia (2).
A change in the number of chromosomes from the normal number characteristic of the animals utilised (aneuploidy).
Porovnávacie štúdie ukázali, že takéto metódy s použitím vhodných kalibračných štandardov môžu priniesť lepšiu vnútrolaboratórnu a medzilaboratórnu reprodukovateľnosť a citlivosť než manuálne mikroskopické hodnotenie (3) (4).
A numerical chromosomal aberration involving a change in the number of the entire set of chromosomes, as opposed to a numerical change in part of the chromosome set (cf. aneuploidy).
Automatizované systémy, ktoré dokážu merať frekvencie erytrocytov s mikrojadrami, zahŕňajú, nie sú však obmedzené na prietokové cytometre (5), platformy obrazovej analýzy (6) (7) a laserové skenovacie cytometre (8).
Structural chromosomal aberration
Hoci to nie je bežnou súčasťou testu, chromozómové fragmenty možno odlíšiť od celých chromozómov na základe niekoľkých kritérií.
A change in chromosome structure detectable by microscopic examination of the metaphase stage of cell division, observed as deletions and fragments, intrachanges or interchanges.
Tieto kritériá zahŕňajú identifikáciu prítomnosti alebo neprítomnosti kinetochoru alebo centromerickej DNA, ktoré sú charakteristické pre neporušené chromozómy.
THE FACTORIAL DESIGN FOR IDENTIFYING SEX DIFFERENCES IN THE IN VIVO CHROMOSOMAL ABERRATION ASSAY
Neprítomnosť kinetochoru alebo centromerickej DNA naznačuje, že mikrojadro obsahuje len fragmenty chromozómov, zatiaľ čo ich prítomnosť je príznačná pre stratu chromozómov.
The factorial design and its analysis
Cieľovým tkanivom pre genetické poškodenie v tomto teste je kostná dreň mladých dospelých hlodavcov, keďže erytrocyty sa tvoria v tomto tkanive.
In this design, a minimum of 5 males and 5 females are tested at each concentration level resulting in a design using a minimum of 40 animals (20 males and 20 females, plus relevant positive controls).
Meranie mikrojadier v nezrelých erytrocytoch v periférnej krvi je prijateľné aj u iných druhov cicavcov, v prípade ktorých bola preukázaná primeraná citlivosť na detekciu chemikálií spôsobujúcich štruktúrne alebo numerické chromozómové aberácie v týchto bunkách (indukciou vzniku mikrojadier v nezrelých erytrocytoch) a v prípade ktorých je poskytnuté vedecké zdôvodnenie.
The design, which is one of the simpler factorial designs, is equivalent to a two-way analysis of variance with sex and concentration level as the main effects.
Hlavným sledovaným parametrom je frekvencia nezrelých erytrocytov s mikrojadrami.
The data can be analysed using many standard statistical software packages such as SPSS, SAS, STATA, Genstat as well as using R.
Frekvenciu zrelých erytrocytov obsahujúcich mikrojadrá v periférnej krvi možno takisto použiť ako sledovaný parameter pri druhoch bez silného vychytávania buniek s mikrojadrami v slezine a v prípade, že sú zvieratá ovplyvňované nepretržite počas obdobia, ktoré presahuje životnosť erytrocytov u použitých druhov (napr. 4 alebo viac týždňov v prípade myší).
The analysis partitions the variability in the dataset into that between the sexes, that between the concentrations and that related to the interaction between the sexes and the concentrations.
Zvieratá sú vystavené účinkom testovanej chemikálie príslušným spôsobom (cestou).
Each of the terms is tested against an estimate of the variability between the replicate animals within the groups of animals of the same sex given the same concentration.
Ak sa používa kostná dreň, zvieratá sa vo vhodnom(-ých) čase(-och) po ovplyvnení humánnym spôsobom utratia, odoberie sa kostná dreň a pripravia a zafarbia sa preparáty (9) (10) (11) (12) (13) (14) (15)sa.
Full details of the underlying methodology are available in many standard statistical textbooks (see references) and in the ‘help’ facilities provided with statistical packages.
Ak sa používa periférna krv, odoberá sa vo vhodnom(-ých) čase(-och) po ovplyvnení a pripravia a zafarbia sa preparáty (12) (16) (17) (18).
The analysis proceeds by inspecting the sex x concentration interaction term in the ANOVA table [1].
Ak sa ovplyvnenie vykoná akútne, je dôležité zvoliť časy odberu kostnej drene alebo krvi, kedy možno zistiť indukciu nezrelých erytrocytov s mikrojadrami súvisiacu s ovplyvnením.
In the absence of a significant interaction term the combined values across sexes or across concentration levels provide valid statistical tests between the levels based upon the pooled within group variability term of the ANOVA.
V prípade odberu periférnej krvi musí takisto ubehnúť dostatočný čas na to, aby sa tieto javy objavili v krvnom obehu.
The analysis continues by partitioning the estimate of the between concentrations variability into contrasts which provide for a test for linear and quadratic contrasts of the responses across the concentration levels.
Preparáty sa analyzujú na prítomnosť mikrojadier buď vizualizáciou pod mikroskopom, obrazovou analýzou, prietokovou cytometriou alebo laserovou skenovacou cytometriou.
When there is a significant sex x concentration interaction this term can also be partitioned into linear x sex and quadratic x sex interaction contrasts.
S cieľom potvrdiť dostatočné skúsenosti s vykonávaním skúšky pred jej použitím na rutinné testovanie by laboratórium malo preukázať schopnosť reprodukovať predpokladané výsledky zo zverejnených údajov (17) (19) (20) (21) (22), pokiaľ ide o frekvenciu výskytu mikrojadier, s minimálne dvoma chemikáliami na pozitívnu kontrolu (vrátane slabých reakcií vyvolaných nízkymi dávkami pozitívnych kontrol), ako sú chemikálie uvedené v tabuľke 1, a s kompatibilnými kontrolami nosiča/rozpúšťadla (pozri bod 26).
These terms provide tests of whether the concentration responses are parallel for the two sexes or whether there is a differential response between the two sexes.
Pri týchto pokusoch by sa mali používať dávky, ktoré vyvolajú reprodukovateľný a od dávky závislý nárast účinku a preukážu citlivosť a dynamický rozsah testovacieho systému v predmetnom tkanive (kostná dreň alebo periférna krv), pričom sa použije metóda hodnotenia, ktorá sa má uplatňovať v laboratóriu.
The estimate of the pooled within group variability can be used to provide pair-wise tests of the difference between means.
Táto požiadavka sa nevzťahuje na laboratóriá, ktoré majú skúsenosti, t. j. majú dostupnú historickú databázu, ako sa vymedzuje v bodoch 14 – 18.
These comparisons could be made between the means for the two sexes and between the means for the different concentration level such as for comparisons with the negative control levels.
Laboratóriá by mali použiť metódy kontroly kvality, ako sú regulačné diagramy [napr. tzv. „C-charts“ alebo „X-bar charts“ (23)], s cieľom zistiť variabilitu svojich údajov a preukázať, že metodika je v laboratóriu „pod kontrolou“.
In those cases where there is a significant interaction comparisons can be made between the means of different concentrations within a sex or between the means of the sexes at the same concentration.
Ďalšie odporúčania ako vytvárať a využívať historické údaje (t. j. kritériá zaradenia údajov medzi historické údaje a ich vylúčenia z historických údajov a kritériá prijateľnosti v prípade daného pokusu) možno nájsť v literatúre (24).
References
Ak laboratórium nevykoná dostatočný počet pokusov na vytvorenie štatisticky solídneho rozdelenia negatívnych kontrol (pozri bod 15) počas zisťovania spôsobilosti (ako sa opisuje v bode 13), je prijateľné, aby sa rozdelenie mohlo vytvárať počas prvých rutinných testov.
There are many statistical textbooks which discuss the theory, design, methodology, analysis and interpretation of factorial designs ranging from the simplest two factor analyses to the more complex forms used in Design of Experiment methodology.
Tento postup by mal vychádzať z odporúčaní uvedených v literatúre (24) a výsledky negatívnych kontrol získané na základe týchto pokusov by mali zostať v súlade s uverejnenými údajmi o negatívnych kontrolách.
The following is a non-exhaustive list.
K vytvoreniu novej databázy historických kontrol by mali viesť len veľké rozdiely, ak sa na základe odborného posúdenia zistí, že sa líši od predchádzajúceho rozdelenia (pozri bod 15).
Some books provide worked examples of comparable designs, in some cases with code for running the analyses using various software packages.
Údaje o negatívnych kontrolách by mali zahŕňať údaje o výskyte nezrelých erytrocytov s mikrojadrami v každom zvierati.
Statisticians who take a modelling approach such as using General Linear Models (GLMs) may approach the analysis in a different but comparable way but will not necessarily derive the traditional anova table, which dates back to algorithmic approaches to calculating the statistics developed in a pre-computer age.
Ak údaje o súbežných negatívnych kontrolách nespadajú do 95 % regulačných medzí, môžu byť prijateľné na zaradenie do rozdelenia historických kontrol, pokiaľ tieto údaje nie sú extrémne mimo uvedených medzí a pokiaľ existujú dôkazy, že testovací systém je „pod kontrolou“ (pozri bod 15) a neexistujú žiadne dôkazy o technickom alebo ľudskom zlyhaní.
In Part B, Chapter B.12 is replaced by the following:
Použiť možno myši, potkany alebo iné vhodné druhy cicavcov.
Mammalian Erythrocyte Micronucleus Test
Ak sa používa periférna krv, musí byť preukázané, že odstránenie buniek s mikrojadrami z krvného obehu uskutočnené v slezine neovplyvní detekciu indukovaných mikrojadier vo vybraných druhoch.
This test method is equivalent to OECD test guideline 474 (2016).
Toto bolo jasne preukázané v prípade periférnej krvi myší a potkanov (2).
The mammalian in vivo micronucleus test is especially relevant for assessing genotoxicity because, although they may vary among species, factors of in vivo metabolism, pharmacokinetics and DNA repair processes are active and contribute to the responses.
Ak sa použijú iné druhy než hlodavce, odporúča sa, aby sa meranie indukovaných mikrojadier začlenilo do iného vhodného testu toxicity.
The mammalian in vivo micronucleus test is used for the detection of damage induced by the test chemical to the chromosomes or the mitotic apparatus of erythroblasts.
Podmienky testu
The test evaluates micronucleus formation in erythrocytes sampled either in the bone marrow or peripheral blood cells of animals, usually rodents.
Rozpúšťadlo/nosič by nemali vyvolávať toxické účinky pri používaných dávkach a nemali by mať schopnosť chemicky reagovať s testovanou chemikáliou.
The purpose of the micronucleus test is to identify chemicals that cause cytogenetic damage which results in the formation of micronuclei containing either lagging chromosome fragments or whole chromosomes.
Ak neexistujú historické alebo zverejnené údaje o kontrolách, z ktorých vyplýva, že zvolené atypické rozpúšťadlo/nosič neindukuje tvorbu mikrojadier ani iné škodlivé účinky, mala by sa vykonať východisková štúdia s cieľom stanoviť prijateľnosť kontroly rozpúšťadla/nosiča.
When a bone marrow erythroblast develops into an immature erythrocyte (sometimes also referred to as a polychromatic erythrocyte or reticulocyte), the main nucleus is extruded; any micronucleus that has been formed may remain behind in the cytoplasm.
Ak nie je zahrnutá súbežná pozitívna kontrolná skupina, do každého pokusu by sa mali zahrnúť kontroly hodnotenia (fixované a nezafarbené podložné sklíčka alebo vzorky bunkovej suspenzie, podľa toho, čo je pre danú metódu hodnotenia vhodné).
Visualisation or detection of micronuclei is facilitated in these cells because they lack a main nucleus.
Možno ich získať tak, že sa do hodnotenia štúdie zahrnú vhodné referenčné vzorky získané a uchované zo samostatného pokusu s pozitívnou kontrolou, ktorý sa vykonáva periodicky (napr. každých 6 až 18 mesiacov); napríklad počas testovania spôsobilosti a potom pravidelne, podľa potreby.
An increase in the frequency of micronucleated immature erythrocytes in treated animals is an indication of induced structural or numerical chromosomal aberrations.
Chemikálie na pozitívnu kontrolu by mali spoľahlivo vyvolať zistiteľný nárast frekvencie mikrojadier nad spontánnu úroveň.
Newly formed micronucleated erythrocytes are identified and quantitated by staining followed by either visual scoring using a microscope, or by automated analysis.
Pri manuálnom hodnotení pomocou mikroskopu by sa dávky pozitívnej kontroly mali zvoliť tak, aby boli účinky zjavné, ale aby hodnotiteľovi priamo neodhaľovali identitu kódovaných vzoriek.
Counting sufficient immature erythrocytes in the peripheral blood or bone marrow of adult animals is greatly facilitated by using an automated scoring platform.
Chemikálie a CAS čísla
Such platforms are acceptable alternatives to manual evaluation (2).
etyl-metánsulfonát [CAS číslo 62-50-0]
Comparative studies have shown that such methods, using appropriate calibration standards, can provide better inter- and intra-laboratory reproducibility and sensitivity than manual microscopic scoring (3) (4).
metyl-metánsulfonát [CAS číslo 66-27-3]
Automated systems that can measure micronucleated erythrocyte frequencies include, but are not limited to, flow cytometers (5), image analysis platforms (6) (7), and laser scanning cytometers (8).
N-etyl-N-nitrózomočovina [CAS číslo 759-73-9]
Although not normally done as part of the test, chromosome fragments can be distinguished from whole chromosomes by a number of criteria.
mitomycín C [CAS číslo 50-07-7]
These include identification of the presence or absence of a kinetochore or centromeric DNA, both of which are characteristic of intact chromosomes.
cyklofosfamid (monohydrát) [CAS číslo 50-18-0 (CAS číslo 6055-19-2)]
The absence of kinetochore or centromeric DNA indicates that the micronucleus contains only fragments of chromosomes, while the presence is indicative of chromosome loss.
tretamín [CAS číslo 51-18-3]
The bone marrow of young adult rodents is the target tissue for genetic damage in this test since erythrocytes are produced in this tissue.
kolchicín [CAS číslo 64-86-8] alebo vinblastín [CAS číslo 865-21-4] – ako aneugény
The measurement of micronuclei in immature erythrocytes in peripheral blood is acceptable in other mammalian species for which adequate sensitivity to detect chemicals that cause structural or numerical chromosomal aberrations in these cells has been demonstrated (by induction of micronuclei in immature erythrocytes) and scientific justification is provided.
Ak sa však na základe historických údajov negatívnych kontrol pri každom odbere vzoriek v danom skúšobnom laboratóriu preukážu konzistentné údaje o variabilite medzi zvieratami a o frekvenciách buniek s mikrojadrami, môže byť pre negatívnu kontrolu potrebný len jeden odber.
The frequency of micronucleated immature erythrocytes is the principal endpoint.
Ak sa použije periférna krv, je namiesto súbežnej negatívnej kontroly prijateľná vzorka pred ovplyvnením, a to v prípade krátkych štúdií, keď sú výsledné údaje v súlade s databázou historických kontrol skúšobného laboratória.