natgillin/translations-raw huggingface dataset:
While a lag phase can be minimised and practically eliminated in control cultures by proper propagation of the pre-culture, a lag phase in exposed cultures may indicate recovery after initial toxic stress or reduced exposure due to loss of test chemical (including sorption onto the algal biomass) after initial exposure.
Ak je však zostrojenie nelineárnej krivky zložité alebo nemožné pre príliš veľký rozptyl údajov, problému je možné sa vyhnúť vykonaním regresie na skupinovom základe ako praktický spôsob zníženia vplyvu podozrivých extrémnych hodnôt.
Hence the section-by-section growth rate may be assessed in order to evaluate effects of the test chemical occurring during the exposure period.
Použitie tejto možnosti by sa malo uviesť v protokole o skúške ako odchýlka od obvyklého postupu, keďže krivky zostrojené s jednotlivými replikátmi nepriniesli dobrý výsledok.
Substantial differences between the section-by-section growth rate and the average growth rate indicate deviation from constant exponential growth and that close examination of the growth curves is warranted.
Odhady hodnôt EC50 a hranice spoľahlivosti sa môžu získať aj použitím lineárnej interpolácie metódou ‚bootstrap‘ (13), ak sú dostupné regresné modely/metódy nevhodné pre dané údaje.
Calculate the percent inhibition of growth rate for each treatment replicate from equation [2]:
Pre odhad koncentrácií LOEC aj NOEC v prípade účinkov testovanej chemikálie na rýchlosť rastu je potrebné porovnať stredné hodnoty skupiny s aplikovanou chemikáliou pomocou techník na analýzu rozptylu (ANOVA).
%I r
Stredná hodnota pre každú koncentráciu sa musí potom porovnať s kontrolnou strednou hodnotou s použitím príslušného viacnásobného porovnania alebo testovacej metódy trendu.
percent inhibition in average specific growth rate;
Môže sa použiť Dunnettov alebo Williamsov test (12) (14) (15) (16) (17).
mean value for average specific growth rate (μ) in the control group;
Je potrebné posúdiť, či je dodržaný predpoklad homogenity rozptylu ANOVA.
average specific growth rate for the treatment replicate.
Toto posúdenie sa môže vykonať graficky alebo formálnym testom (17).
When solvents are used to prepare the test solutions, the solvent controls rather than the controls without solvents should be used in calculation of percent inhibition.
Vhodný je Levenov alebo Bartlettov test.
Yield is calculated as the biomass at the end of the test minus the starting biomass for each single vessel of controls and treatments.
Nesplnenie predpokladu homogenity rozptylov je niekedy možné korigovať logaritmickou transformáciou údajov.
For each test concentration and control, calculate a mean value for yield along with variance estimates.
Ak je heterogenita rozptylu extrémna a nie je možné ju korigovať transformáciou, je potrebné posúdiť analýzu metódami, ako sú napríklad ‚step-down Jonkheere‘ testy trendu.
The percent inhibition in yield ( %Iy) may be calculated for each treatment replicate as follows:
Ďalšie informácie o stanovení hodnoty NOEC je možné nájsť v literatúre pod číslom (11).
%I y
Najnovší vývoj vo vede vedie k odporúčaniu upustiť od koncepcie NOEC a nahradiť ju regresiou založenou na bodovom odhade ECx.
percent inhibition of yield;
Príslušná hodnota x pre tento test na riasach nebola stanovená.
Plotting concentration response curve
Niekedy sa pri nízkych koncentráciách pozoruje stimulácia rastu (negatívna inhibícia).
Plot the percentage of inhibition against the logarithm of the test chemical concentration and examine the plot closely, disregarding any such data point that was singled out as an outlier in the first phase.
Môže to byť dôsledok hormézy (‚toxickej stimulácie‘) alebo pridania stimulujúcich rastových faktorov s testovaným materiálom do použitého minimálneho média.
Fit a smooth line through the data points by eye or by computerised interpolation to get a first impression of the concentration-response relationship, and then proceed with a more detailed method, preferably a computerised statistical method.
Treba si uvedomiť, že pridanie anorganických živín by nemalo mať žiadny priamy účinok, kedže testovacie médium by si počas celého testu malo zachovávať nadbytok živín.
Depending on the intended usage of data;
Stimuláciu pri nízkych dávkach je možné pri výpočtoch EC50 zvyčajne ignorovať, pokiaľ nie je extrémna.
the quality (precision) and amount of data as well as the availability of data analysis tools, it may be decided (and sometimes well justified) to stop the data analysis at this stage and simply read the key figures EC50 and EC10 (and/or EC20) from the eye fitted curve (see also section below on stimulatory effects).
Ak je však stimulácia extrémna alebo sa má vypočítať hodnota ECx pre nízke x, môžu byť potrebné osobitné postupy.
Valid reasons for not using a statistical method may include:
Ak je to možné, malo by sa zabrániť vypusteniu stimulačných reakcií z analýzy údajov, a ak dostupný softvér na vytvorenie krivky nemôže prijať malú stimuláciu, môže sa použiť lineárna interpolácia metódou ‚bootstrap‘.
Data are not appropriate for computerised methods to produce any more reliable results than can be obtained by expert judgement — in such situations some computer programs may even fail to produce a reliable solution (iterations may not converge etc.)
Ak je stimulácia extrémna, môže sa zvážiť model hormézy (18).
Stimulatory growth responses cannot be handled adequately using available computer programs (see below).
Netoxická inhibícia rastu
Statistical procedures
Testovacie materiály absorbujúce svetlo môžu spôsobiť zníženie rýchlosti rastu, keďže tienenie znižuje množstvo dostupného svetla.
The aim is to obtain a quantitative concentration-response relationship by regression analysis.
Takéto fyzikálne typy účinkov je potrebné oddeliť od toxických účinkov modifikáciou podmienok testu, a to je potrebné osobitne uviesť v skúšobnom protokole.
It is possible to use a weighted linear regression after having performed a linearising transformation of the response data — for instance into probit or logit or Weibull units (8), but non-linear regression procedures are preferred techniques that better handle unavoidable data irregularities and deviations from smooth distributions.
Usmernenie je možné nájsť v literatúre pod číslami (2) a (3).
Approaching either zero or total inhibition, such irregularities may be magnified by the transformation, interfering with the analysis (8).
PROTOKOL O SKÚŠKE
It should be noted that standard methods of analysis using probit, logit, or Weibull transforms are intended for use on quantal (e.g. mortality or survival) data, and must be modified to accommodate growth or biomass data.
Skúšobný protokol musí obsahovať tieto informácie:
Specific procedures for determination of ECx values from continuous data can be found in (9) (10) and (11).
Testovaná chemikália:
The use of non-linear regression analysis is further detailed in Appendix 5.
fyzikálny charakter a príslušné fyzikálno-chemické vlastnosti vrátane limitu rozpustnosti vo vode,
For each response variable to be analysed, use the concentration-response relationship to calculate point estimates of ECx values.
identifikačné údaje chemikálie (napr. číslo CAS) vrátane čistoty (nečistôt).
When possible, the 95 % confidence limits for each estimate should be determined.
Testovacie druhy:
Goodness of fit of the response data to the regression model should be assessed either graphically or statistically.
kmeň, dodávateľ alebo zdroj a použité podmienky kultivácie.
Regression analysis should be performed using individual replicate responses, not treatment group means.
Podmienky testu:
If, however nonlinear curve fitting is difficult or fails because of too great scatter in the data, the problem may be circumvented by performing the regression on group means as a practical way of reducing the influence of suspected outliers.
dátum začiatku testu a jeho dĺžka,
Use of this option should be identified in the test report as a deviation from normal procedure because curve fits with individual replicates did not produce a good result.
opis koncepcie testu:
estimates and confidence limits may also be obtained using linear interpolation with bootstrapping (13), if available regression models/methods are unsuitable for the data.
testovacie nádoby, objemy kultúr, hustota biomasy na začiatku testu,
For estimation of the LOEC and hence the NOEC, for effects of the test chemical on growth rate, it is necessary to compare treatment means using analysis of variance (ANOVA) techniques.
zloženie média,
The mean for each concentration must then be compared with the control mean using an appropriate multiple comparison or trend test method.
testovacie koncentrácie a replikáty (napr. počet replikátov, počet testovacích koncentrácií a použitý geometrický rad),
Dunnett's or Williams' test may be useful (12)(14)(15)(16)(17).
opis prípravy testovacích roztokov vrátane použitia rozpúšťadiel atď.,
It is necessary to assess whether the ANOVA assumption of homogeneity of variance holds.
zariadenie na kultiváciu,
This assessment may be performed graphically or by a formal test (17).
intenzita svetla a kvalita (zdroj, homogenita),
Suitable tests are Levene's or Bartlett's.
teplota,
Failure to meet the assumption of homogeneity of variances can sometimes be corrected by logarithmic transformation of the data.
testované koncentrácie:
If heterogeneity of variance is extreme and cannot be corrected by transformation, analysis by methods such as step-down Jonkheere trend tests should be considered.
nominálne testované koncentrácie a všetky výsledky analýz na stanovenie koncentrácie testovanej chemikálie v testovacích nádobách.
Additional guidance on determining the NOEC can be found in (11).
V správe sa musí uviesť výťažnosť a kvantifikačný limit v testovacom matrixe,
Recent scientific developments have led to a recommendation of abandoning the concept of NOEC and replacing it with regression based point estimates ECx.
všetky odchýlky od tejto testovacej metódy,
An appropriate value for x has not been established for this algal test.
metóda na stanovenie množstva biomasy a dôkaz korelácie medzi meraným parametrom a sušinou.
A range of 10 to 20 % appears to be appropriate (depending on the response variable chosen), and preferably both the EC10 and EC20 should be reported.
Výsledky:
Growth stimulation
hodnoty pH na začiatku a na konci testu pri všetkých aplikáciách chemickej látky,
Growth stimulation (negative inhibition) at low concentrations is sometimes observed.
množstvo biomasy v každej banke v každom meranom bode a metóda merania množstva biomasy,
This can result from either hormesis (“toxic stimulation”) or from addition of stimulating growth factors with the test material to the minimal medium used.
rastové krivky (diagram závislosti množstva biomasy od času),
Note that the addition of inorganic nutrients should not have any direct effect because the test medium should maintain a surplus of nutrients throughout the test.
vypočítané hodnoty závisle premenných veličín reakcie pre každý replikát s aplikovanou chemikáliou, so strednými hodnotami a variačným koeficientom pre replikáty,
Low dose stimulation can usually be ignored in EC50 calculations unless it is extreme.
grafické znázornenie vzťahu koncentrácie a účinku,
However, if it is extreme, or an ECx value for low x is to be calculated, special procedures may be needed.
ak sa používa technika ANOVA, veľkosť účinku, ktorý je možné detegovať (napr. najmenej významný rozdiel),
Deletion of stimulatory responses from the data analysis should be avoided if possible, and if available curve fitting software cannot accept minor stimulation, linear interpolation with bootstrapping can be used.
každá stimulácia rastu zistená v ľubovoľnej vzorke s aplikovanou chemikáliou,
If stimulation is extreme, use of a hormesis model may be considered (18).
všetky iné pozorované účinky, napríklad morfologické zmeny rias,
Non toxic growth inhibition
rozbor výsledkov vrátane každého vplyvu na výsledok testu vyplývajúceho z odchýlok od tejto testovacej metódy.
Light absorbing test materials may give rise to a growth rate reduction because shading reduces the amount of available light.
OECD (2006).
Such physical types of effects should be separated from toxic effects by modifying the test conditions and the former should be reported separately.
Dodatok 1
Guidance may be found in (2) and (3).
Vymedzenie pojmov
TEST REPORT
Na účely tejto testovacej metódy sa používajú tieto pojmy a skratky:
The test report must include the following:
‚Biomasa‘ je zvyčajne vymedzená ako hmotnosť, ale v tomto teste sa uvedené slovo používa na vyjadrenie hmotnosti na objem.
Test chemical:
V tomto teste sa bežne merajú aj náhradné parametre biomasy ako napríklad počet buniek, fluorescencia atď., a teda používanie pojmu ‚biomasa‘ sa vzťahuje aj na tieto náhradné parametre.
physical nature and relevant physical-chemical properties, including water solubility limit;
Chemikália je látka alebo zmes.
chemical identification data (e.g., CAS Number), including purity (impurities).
Variačný koeficient (VK) je bezrozmerná hodnota premenlivosti parametra vymedzená ako pomer štandardnej odchýlky k strednej hodnote.
Test species:
Môže byť vyjadrená aj ako percentuálna hodnota.
the strain, supplier or source and the culture conditions used.
Stredný variačný koeficient priemernej špecifickej rýchlosti rastu sa v repilátoch kontrolných kultúr počíta takto:
Test conditions:
pre príslušné replikáty sa vypočíta percentuálna hodnota VK priemernej špecifickej rýchlosti rastu na základe denných/fázových rýchlostí rastu,
date of start of the test and its duration;
vypočíta sa stredná hodnotu zo všetkých hodnôt vypočítaných v bode 1, čím sa získa stredný variačný koeficient špecifickej dennej/fázovej rýchlosti rastu v replikátoch kontrolných kultúr.
description of test design:
ECx je koncentrácia testovanej chemikálie rozpustenej v testovacom médiu, ktorej dôsledkom je x % (napr. 50 %) zníženie rastu testovacieho organizmu v rámci stanoveného času expozície (je potrebné výslovne uviesť, ak sa odchyľuje od celkovej alebo bežnej dĺžky testu).
test vessels, culture volumes, biomass density at the beginning of the test;
Na jednoznačné označenie hodnoty EC odvodenej z rýchlosti rastu alebo výťažku sa používa symbol ‚ErC‘ pre rýchlosť rastu a symbol ‚EyC‘ pre výťažok.
composition of the medium;
Rastové médium je kompletné syntetické kultivačné médium, v ktorom rastie testovaná riasa vystavená pôsobeniu testovanej chemikálie.
test concentrations and replicates (e.g., number of replicates, number of test concentrations and geometric progression used);
Testovaná chemikália sa spravidla rozpustí v testovacom médiu.
description of the preparation of test solutions, including use of solvents etc.
Rýchlosť rastu (priemerná špecifická rýchlosť rastu) je logaritmickým nárastom množstva biomasy počas expozície.
culturing apparatus;
Najnižšia koncentrácia s pozorovaným účinkom (LOEC) je najnižšia testovacia koncentrácia, pri ktorej sa pozoruje, že chemikália má štatisticky významný účinok na zníženie rastu (pri p < 0,05) v porovnaní s kontrolnou kultúrou v rámci daného času expozície.
light intensity and quality (source, homogeneity);
Škodlivý účinok všetkých testovacích koncentrácií nad LOEC však musí byť vždy rovnaký alebo väčší ako účinky pozorované pri LOEC.
temperature;
Ak nie sú splnené tieto dve podmienky, je potrebné poskytnúť úplné vysvetlenie, akým spôsobom sa zvolila koncentrácia LOEC (a teda aj koncentrácia NOEC).
concentrations tested:
Koncentrácia bez pozorovaného účinku (NOEC) je testovacia koncentrácia bezprostredne pod koncentráciou LOEC.
the nominal test concentrations and any results of analyses to determine the concentration of the test chemical in the test vessels.
Závislé premenná veličina reakcie je premenná na odhad toxicity odvodená z akýchkoľvek meraných parametrov opisujúcich biomasu rôznymi metódami výpočtu.
The recovery efficiency of the method and the limit of quantification in the test matrix should be reported;
V prípade tejto testovacej metódy sú rýchlosti rastu a výťažok závisle premennými veličinami reakcie odvodenými priamo z merania množstva biomasy alebo uvedených náhradných parametrov.
all deviations from this test method;
Špecifická rýchlosť rastu je premenná hodnota reakcie vymedzená ako kvocient rozdielu prirodzených logaritmov parametra pozorovania (v rámci tejto testovacej metódy biomasy) a príslušného časového intervalu.
method for determination of biomass and evidence of correlation between the measured parameter and dry weight;
Testovaná chemikália je akákoľvek látka alebo zmes, ktorá sa testuje pomocou tejto testovacej metódy.
Results:
Výťažok je rozdiel hodnoty meranej premennej na konci expozície a hodnoty meranej premennej na jej začiatku, ktorý vyjadruje nárast množstva biomasy počas testu.
growth curves (plot of biomass versus time);
Zelené riasy
calculated response variables for each treatment replicate, with mean values and coefficient of variation for replicates;
Pseudokirchneriella subcapitata (predtým známa ako Selenastrum capricornutum), ATCC 22662, CCAP 278/4, SAG 61.81
graphical presentation of the concentration/effect relationship;
Desmodesmus subspicatus (predtým známa ako Scenedesmus subspicatus), SAG 86.81
estimates of toxicity for response variables e.g., EC50, EC10, EC20 and associated confidence intervals.
Rozsievky
If calculated, LOEC and NOEC and the statistical methods used for their determination;
Sinice
any stimulation of growth found in any treatment;
Odporúčané kmene sú dostupné z kultúr s jedným druhom rias z týchto zbierok (v abecednom poradí)
any other observed effects, e.g. morphological changes of the algae;
Vzhľad a charakteristika odporúčaných druhov
discussion of the results, including any influence on the outcome of the test resulting from deviations from this test method.
Vzhľad
Appendix 1
tyčinky
Definitions
reťazce oválnych buniek
The following definitions and abbreviations are used for the purposes of this test method:
Veľkosť (dĺžka × šírka) μm
Biomass is the dry weight of living matter present in a population expressed in terms of a given volume;
Objem buniek (v μm3 na bunku)
e.g., mg algae/litre test solution.
Sušina buniek (v mg na bunku)
Usually “biomass” is defined as a mass, but in this test this word is used to refer to mass per volume.
2 – 3 × 10– 8
Also in this test, surrogates for biomass, such as cell counts, fluorescence, etc. are typically measured and the use of the term “biomass” thus refers to these surrogate measures as well.
3 – 4 × 10– 8
Chemical means a substance or mixture
1 – 2 × 10– 8
Coefficient of variation is a dimensionless measure of the variability of a parameter, defined as the ratio of the standard deviation to the mean.
2 – 3 × 10– 9
This can also be expressed as a percent value.
Rýchlosť rastu [3] (deň– 1)
Mean coefficient of variation of average specific growth rate in replicate control cultures should be calculated as follows:
1,5 – 1,7
Calculate % CV of average specific growth rate out of the daily/section by section growth rates for the respective replicate;
Osobitné odporúčania pre kultiváciu a zaobchádzanie s odporúčanými testovacími druhmi
Calculate the mean value out of all values calculated under point 1 to get the mean coefficient of variation of the daily/section by section specific growth rate in replicate control cultures.
Pseudokirchneriella subcapitata a Desmodesmus subspicatus
ECx is the concentration of the test chemical dissolved in test medium that results in an x % (e.g. 50 %) reduction in growth of the test organism within a stated exposure period (to be mentioned explicitly if deviating from full or normal test duration).
Tieto zelené riasy sa spravidla ľahko uchovávajú v rôznych kultivačných médiách.
To unambiguously denote an EC value deriving from growth rate or yield the symbol “ErC” is used for growth rate and “EyC” is used for yield.
Informácie týkajúce sa vhodných médií sú dostupné zo zbierok kultúr.
Growth medium is the complete synthetic culture medium in which test algae grow when exposed to the test chemical.
Bunky sú spravidla samostatné, bunková hustota sa stanovuje jednoducho s použitím elektronického počítadla častíc alebo mikroskopu.
The test chemical will normally be dissolved in the test medium.
Na uchovávanie zásobnej kultúry sa môžu použiť rôzne rastové médiá.
Growth rate (average specific growth rate) is the logarithmic increase in biomass during the exposure period.
Je mimoriadne dôležité, aby sa pri obnovovaní zabránilo jednorazovej kultúre prekročiť log fázu rastu, v tomto bode je obnova zložitá.
Lowest Observed Effect Concentration (LOEC) is the lowest tested concentration at which the chemical is observed to have a statistically significant reducing effect on growth (at p < 0,05) when compared with the control, within a given exposure time.
Anabaena flos-aquae vytvára zhluky spletených reťazcov buniek.
However, all test concentrations above the LOEC must have a harmful effect equal to or greater than those observed at the LOEC.
Veľkosť týchto zhlukov sa môže meniť podľa podmienok kultivácie.
When these two conditions cannot be satisfied, a full explanation must be given for how the LOEC (and hence the NOEC) has been selected.
Môže byť potrebné rozdeliť tieto zhluky, ak sa na stanovenie množstva biomasy použije počítanie pomocou mikroskopu alebo elektronického počítadla častíc.
No Observed Effect Concentration (NOEC) is the test concentration immediately below the LOEC.
Môže sa použiť sonifikácia čiastkových vzoriek na rozbitie reťazcov, aby sa znížila variabilita počtu buniek.
Response variable is a variable for the estimation of toxicity derived from any measured parameters describing biomass by different methods of calculation.
Dlhšia sonifikácia, ako sa vyžaduje na rozbitie reťazcov na kratšie úseky, môže poškodiť bunky.
For this test method growth rates and yield are response variables derived from measuring biomass directly or any of the surrogates mentioned.
Intenzita sonifikácie a jej trvanie musia byť rovnaké pri každom spracovaní.
Specific growth rate is a response variable defined as quotient of the difference of the natural logarithms of a parameter of observation (in this test method, biomass) and the respective time period
Je potrebné spočítať dostatočné množstvo políčok na hemocytometri (minimálne 400 buniek) na elimináciu variability.
Test chemical means any substance or mixture tested using this test method.
Tým sa zlepší spoľahlivosť mikroskopického stanovenia hustoty.
Yield is the value of a measurement variable at the end of the exposure period minus the measurement variable's value at the start of the exposure period to express biomass increase during the test.
Elektronické počítadlo častíc sa môže použiť na stanovenie celkového objemu buniek rodu Anabaena po rozbití reťazcov buniek opatrnou sonifikáciou.
Appendix 2
Je potrebné prispôsobiť silu sonifikácie, aby sa zabránilo rozbitiu buniek.
Strains Shown to be Suitable for the Test
Použite vortexový mixér alebo podobnú vhodnú metódu na zabezpečenie toho, aby suspenzia rias, ktorá sa použije na inokuláciu testovacích nádob, bola dobre premiešaná a homogénna.
Green algae
Testovacie nádoby by sa mali umiestniť na orbitálnu trepačku s platformou približne pri 150 otáčkach za minútu.
Pseudokirchneriella subcapitata (formerly known as Selenastrum capricornutum), ATCC 22662, CCAP 278/4, 61.81 SAG
Alternatívne sa môže použiť občasné miešanie na zníženie tvorby zhlukov rodu Anabaena.
Diatoms
Môže byť potrebné prudké premiešanie pred odberom vzoriek, aby sa rozbili zhluky rias.
Cyanobacteria
Synechococcus leopoliensis rastie vo forme samostatných tyčinkovitých buniek.
Sources of Strains
Bunky sú veľmi malé, čo sťažuje použitie počítania pomocou mikroskopu pri meraniach množstva biomasy.
The strains recommended are available in unialgal cultures from the following collections (in alphabetical order):
Užitočné sú elektronické počítadlá častíc vybavené na počítanie menších častíc až veľkosti približne 1 μm.
37073 Göttingen
Vhodné sú tiež fluorometrické merania in vitro.
Appearance and characteristics of recommended species
Treba si uvedomiť, že do média je potrebné pridať kremičitan.
Appearance
Navicula pelliculosa môže v určitých rastových podmienkach vytvárať zhluky.