natgillin/translations-raw huggingface dataset:
Now, technology is available which allows us, using a small computer chip, to get the answers we are seeking in real-time.
Nå foreligger teknologien som gjør at man med en liten databrikke kan få de svarene man søker i sanntid.
In the future, we will probably be able to carry the sequencing equipment in our pocket when we visit food producers, instead of having to take samples of the bacterial flora back to the laboratory for further tests, says Annette Fagerlund.
I framtiden vil vi sannsynligvis ta med oss sekvenseringsutstyr i lommen når vi er ute i næringsmiddelbedriftene, i stedet for å ta med oss prøver av bakteriefloraen tilbake til laboratoriet for videre undersøkelser, sier Annette Fagerlund.
In Norway, we are just beginning to sequence genomes, i.e. an organism’s complete genetic material, as part of the management of infectious desease.
I Norge er vi helt i startfasen med å sekvensere genomene – som er organismers fullstendige arvemateriale – for å drive med sykdomsoppklaring.
In recent years, the sequencing technology has evolved and is now much faster and more cost-effective, and large amounts of data will be collected that will give a lot of relevant information about bacteria, which is of great importance both for public health and for the Norwegian food industry.
Sekvenseringsteknologien har de siste årene utviklet seg til å bli mye raskere og mer kostnadseffektiv, og det vil bli samlet store mengder data som vil kunne gi svært mye og relevant informasjon om bakterier, som er av stor betydning både for folkehelsa og for norsk matindustri.
The bigger picture
Det store bildet
The Nofima scientist believes that there are several reasons for this work being prioritised and intensified in Norway.
Nofima-forskeren mener det av flere grunner er viktig at dette arbeidet prioriteres og intensiveres i Norge:
– We still don’t have the bigger picture.
– Vi har ennå ikke det store bildet.
We are unable to accurately determine where a bacterium originated.
Vi klarer ikke å nøyaktig fastslå hvor en bakterie har sitt opphav.
With regards to listeriosis cases in Norway, 30 per cent of infections are caused by the same listeria type, when typing is performed using conventional typing methodology.
For sykdomstilfeller av listeriose i Norge, har 30 prosent av de syke den samme listeria-typen, når bakteriene blir undersøkt med konvensjonelle typingsmetoder.
When there are so many seemingly similar bacteria strains, it is difficult to know where we should start to combat the problem.
Når det er så mange tilsynelatende like bakteriestammer, er det vanskelig å vite hvor bekjempelsen skal settes inn.
But even when we use genome sequencing there is a danger of reaching erroneous conclusions.
Men selv med bruk av genomsekvensering er det en fare for at det kan bli gjort gale konklusjoner.
Or that the wrong “culprit” is pointed out in the case of an infectious disease outbreak, Annette Fagerlund explains.
At det blir pekt ut urettmessige «syndere» ved et eventuelt smitteutbrudd, forklarer Annette Fagerlund.
A study that the Nofima scientist has recently published in the internationally renowned scientific journal PlosONE, shows that virtually identical listeria bacteria are found in different production facilities.
I en studie Nofima-forskeren nylig har fått antatt i det internasjonalt anerkjente vitenskapelige tidsskriftet PlosONE, viser de til at de finner tilnærmet identiske listeriabakterier i forskjellige produksjonslokaler.
– Direct contamination between factory premises is possible through, for example, suppliers of raw material or as a result of contact between factories.
– Direkte smitte mellom fabrikklokaler er mulig for eksempel gjennom råvareleveranser eller som resultat av kontakt mellom fabrikker.
We need, therefore, an overview, at the genomic level, of the diversity of pathogens that is found in the different environments.
Vi trenger derfor oversikt, på genomnivå, over hvilket mangfold av patogener som finnes i forskjellige miljøer.
To best interpret the results, we also need to understand how quickly small changes in the bacterial development take place in these environments, says the scientist.
For best mulig å kunne tolke resultatene trenger vi dessuten kunnskap om hvor raskt små endringer i bakterienes utvikling foregår i disse miljøene, sier forskeren.
Collaboration – important and justified
Samarbeid – viktig og riktig
Annette Fagerlund is of the opinion that collaboration between a number of professional environments is important and justified.
Derfor mener Annette Fagerlund at samarbeid mellom flere fagmiljøer er viktig og riktig.
Nofima’s post-doctoral fellow points to the fact that genome data has a great potential as a tool to be used to better understand and to combat pathogenic bacteria practically.
Postdoktoren i Nofima viser til at genomdata har stort potensial som verktøy for økt forståelse og praktisk bekjempelse av sykdomsfremkallende bakterier.
Why do some survive in different environments whilst others succumb?
Hvorfor overlever noen der ute i forskjellige miljø, mens andre ikke gjøre det?
Why do only some cause diseases in humans?
Hvorfor er det bare noen som gir sykdom, hos mennesker?
Which of the listeria bacteria cause disease and which are harmless?
Hvilke av listeriabakteriene er det som gir sykdom og hvilke er ufarlige?
– Epidemiology is used in the resolution of infectious disease outbreaks and to find the sources of infection and transmission routes, and to understand relationships.
– Epidemiologi brukes til å oppklare sykdomsutbrudd og avdekke smittekilder og smitteveier, og forstå sammenhenger.
We can identify which strains of bacteria cause diseases, detect new pathogens and identify patterns of antibiotic resistance.
Vi kan få vite hvilke bakteriestammer som gir sykdom, påvisning av nye patogener, og kartlegging av antibiotikaresistens.
All through genomic data, says Fagerlund.
Alt gjennom genom-data, sier Fagerlund.
She compares the development of the technology to a train that moves faster and faster.
Utviklingen av teknologien beskriver hun som et tog som bare ruller fortere og fortere.
A number of international research communities have already come a long way.
Flere utenlandske forskningsmiljø er langt framme.
– Nofima just managed to board the train before it left without us.
– I Nofima rakk vi akkurat å kaste oss på toget før det gikk fra oss.
Now, we need to stay on board, Annette Fagerlund adds.
Nå må vi bli værende om bord, slår Annette Fagerlund fast.
She believes that a national initiative will help Norway play an active role in the routine application of WGS analysis, and will generate new knowledge and be an effective use of resources, in contributing to increased food safety.
En nasjonal satsing mener hun vil bidra til at Norge kan ha en aktiv rolle innen rutinemessig anvendelse av WGS-analyse og ny kunnskap og effektiv ressursutnyttelse for å bidra til økt mattrygghet.
Much better by far
Suverent mye bedre
Even though we are talking about something as unpleasant as potentially deadly bacteria, the dedicated scientist can’t hide the fact that she is delighted with the new knowledge and the new technology that will bring an end to the listeria scourge.
Selv om det dreier seg om noe så lite hyggelig som potensielt dødelige bakterier, klarer ikke den engasjerte forskeren å legge skjul på at hun fryder seg over ny kunnskap og ny teknologi for å komme listeriaplagen til livs.
– This new technology is going to plough on, for it is, so far, much better than what we have had up to the present time.
– Den nye teknologien kommer til å brøyte seg fram, for den er så suverent mye bedre enn det som har vært til nå.
And it is going to be so much fun!
Og det blir så gøy!
If we now bring about cooperation at a national level, we can suddenly take a massive step forward, says Annette Fagerlund.
Klarer vi nå også å få til et samarbeid på nasjonalt nivå, kan vi plutselig være et langt stykke på vei, sier Annette Fagerlund.
With respect to research in general, and in particular in the use of sequencing technology, in the battle against listeria, it may, however in this context be appropriate to quote the legendary words of Sir Winston Churchill:
I forbindelse med forskning generelt, og bruk av sekvenseringsteknologi i kampen mot listeria spesielt, kan det imidlertid i den sammenheng være passende å gjøre Sir Winston Churchills legendariske ord til sine:
“Now this is not the end.
«Dette er ikke slutten.
It is not even the beginning of the end.
Det er ikke engang begynnelsen på slutten.
But it is, perhaps, the end of the beginning.”
Men det kan muligens være slutten på begynnelsen».
Food Micro Control
FoodMicroControl
Control of microorganisms is a major challenge for food producers.
Kontroll med mikroorganismer er en stor utfordring for matprodusenter.
Nofima’s strategic programme, Food Micro Control, provides new knowledge and skills for understanding the growth, survival, activity and function of microorganisms in food and food production environments, and is one of ten strategic research programmes in the Food Division.
Nofimas strategiske program FoodMicroControl gir ny kunnskap og kompetanse for å forstå vekst, overlevelse, aktivitet og funksjon til mikroorganismer i mat og matproduksjonsmiljøer, og er et av ti strategiske forskningsprogram i divisjon Mat.
The programmes underpin our long-term knowledge building and are vital if Nofima is to be a leading international business-oriented food research institute
Programmene sikrer vår langsiktige kompetansebygging og er avgjørende for at Nofima skal være et internasjonalt ledende næringsrettet matforskningsinstitutt.
Through this programme, we develop and sustain our microbiological competence in the fields of food safety, ford quality, health and analysis methodology.
Gjennom programmet utvikler og opprettholder vi vår mikrobiologiske kompetanse innenfor områdene mattrygghet, matkvalitet, helse og analysemetodikk.
The programme, in close cooperation with other participants in the food chain, gives Nofima the basic know-how needed to solve the challenges that the food industry faces
Programmet gir Nofima grunnleggende kompetanse for å løse næringens utfordringer i tett samarbeid med aktører i matkjeden.
The programme has research activities in three principle areas:
Programmet har forskningsaktiviteter innen tre hovedområder:
1) Bacteria in food
1) Bakterier i mat
2) Bacteria in the production environment
2) Bakterier i produksjonsmiljø
3) Method platform for molecular analyses of microorganisms
3) Metodeplattform for molekylære analyser av mikroorganismer
Annette Fagerlund works on biofilm and sequenced listeria strains in a three-year project funded by Research Funding for Agriculture and the Food Industry (FJM formerly FFL), the Technical Committee for Industrial Detergents and Disinfectants and Bama Gruppen AS.
Annette Fagerlund jobber med biofilm og sekvenserte Listeria-stammer i et treårig prosjekt finansiert av Forskningsmidlene for jordbruk og matindustri (FJM – tidligere FFL), TKVDN og Bama.
In this work, bacteria strains from two terminated projects financed by FJM and the Fisheries and Aquaculture Research Fund are used.
I dette arbeidet brukes bakteriestammer fra to avsluttede prosjekter finansiert av FJM og Fiskeri- og havbruksnæringens forskningsfond (FHF).
Listeria monocytogenes:
Listeria monocytogenes:
L. monocytogenes is an environmental bacterium that is found “all over the place” – in soil, water, fish, meat, fruit and vegetables.
L. monocytogenes er en miljøbakterie som finnes «over alt» – i jord, vann, fisk, kjøtt, frukt og grønt.
The bacterium can cause listeriosis; an extremely serious disease with a 20-30 per cent mortality rate.
Bakterien kan forårsake listeriose; en svært alvorlig sykdom med 20-30 prosent dødelighet.
The risk groups are, in particular, people with impaired immune systems, elderly over the age of 65 and pregnant women.
Risikogrupper er spesielt personer med nedsatt immunforsvar, eldre over 65 år og gravide.
Almost 100 per cent of human cases of the disease are caused by food that is contaminated with L. monocytogenes.
Nær 100 prosent av humane sykdomstilfeller skyldes mat som er smittet med L. monocytogenes.
Risk products include long shelf-life, cold stored products where listeria can grow.
Risikoprodukter er langtidsholdbare, kjølelagrede produkter hvor listeria kan vokse.
A large amount of resources is used to control and to combat the bacterium.
Store ressurser brukes for å kontrollere og bekjempe bakterien.
L. monocytogenes have significant health-related, social and financial consequences.
L. monocytogenes har store helsemessige, sosiale og økonomiske konsekvenser.
Source: Norwegian Institute of Public Health, the Norwegian Veterinary institute and Nofima
Kilde: Folkehelseinstituttet, Veterinærinstituttet og Nofima
Whole genomes sequencing (WGS)
Helgenomsekvensering (WGS)
By way of sequencing, one gets access to the genetic code in a genome.
Gjennom sekvensering skaffer man seg tilgang til den genetiske koden i et genom.
The composition of the genome determines the microbes’ identities and characteristics.
Sammensetning av genomet bestemmer mikrobenes identitet og egenskaper.
Whole genomes sequencing provides fast and cost-effective generation of large quantities of sequence data.
Helgenomsekvensering gir rask og kostnadseffektiv generering av store mengder sekvensdata
Large quantities of data results in the need for analysis methods and analysis competence.
Store datamengder gir stort behov for analysemetoder og analysekompetanse
food safety genomseleksjon listeria
genomseleksjon listeria mattrygghet
Smarter measuring instruments will improve control and lead to less waste.
Smartere måleinstrumenter vil gi bedre kontroll og mindre svinn.
The goal of the new innovation project SmartSensor is to develop measuring instruments that can be used for the on-line measurement of food products.
I det nye innovasjonsprosjektet SmartSensor er målet å utvikle måleinstrument som kan brukes til on-line målinger på matvarer.
The technology used by the instrument is based on near-infrared light, and thus it is known as an “NIR instrument”.
Teknologien i instrumentet vil være basert på bruk av nærinfrarødt lys, altså et såkalt NIR-instrument.
The instrument is to be able to measure quality parameters that currently used instruments cannot measure.
Instrumentet skal kunne måle kvalitetsegenskaper som ingen av dagens instrumenter klarer å måle.
“We are concentrating on three different areas of application: the measurement of fat in whole salmon, the measurement of dry matter in whole potatoes, and the measurement of core temperature in heat-treated products such as sausages.
– Vi skal konsentrerer oss om tre ulike anvendelser: Fettmåling i hel laks, tørrstoffmåling i hele poteter og måling av kjernetemperatur i varmebehandlede produkter som pølser.
The principal challenge is the high speed at which the measurement must be made, and the depth into the product at which it must be taken,” says Jens Petter Wold, Senior Scientist at Nofima and scientific project manager of the SmartSensor project.
Hovedutfordringene er at målingene skal gå meget fort og at vi må måle dypt inn i produktene, forteller Jens Petter Wold, seniorforsker i Nofima og faglig prosjektleder for SmartSensor.
Making deep measurements rapidly
Må kunne nå raskt inn i dypet
The scientists are to develop a prototype of a measuring instrument that can carry out measurements at the production line without direct contact with the food product.
Forskerne skal utvikle en prototype av et måleinstrument som kan måle direkte på produksjonslinja uten at instrumentet er i direkte kontakt med matvarene.
In order to be able to map the core temperature in heat-treated products, the dry matter content in whole potatoes and the fat content of whole salmon, is it necessary that the instrument can measure deep inside the products.
For å kunne kartlegge så vel kjernetemperatur i varmebehandlede produkter, tørrstoffinnholdet i hele poteter og fettinnholdet i hel laks, er det nødvendig at instrumentet klarer å måle dypt inni produktene.
And if the instrument is to be used at the production line, it must be able to carry out the analyses extremely rapidly.
Og for å kunne bruke instrumentet på produksjonslinja er det nødt til å kunne foreta ekstremt raske analyser.
This means that the NIR instrument must comprise a powerful light source and sensors.
Prosjektdeltakerne samlet på kick-off i SmartSensor, utenfor Nortura i Tønsberg.
These properties can only be developed by scientists with solid knowledge of the chemical composition of the products, and expertise in the calibration and use of optical instruments.
For å få dette til trenger forskerne solid kunnskap om produktenes kjemiske sammensetning, kalibrering og om optisk instrumentering.
The greatest challenge in the use of NIR light will be to obtain sufficiently reliable optical signals from the interior of the samples, since the light must be able to penetrate the outer layers of skin or shell.
Den største utfordringen ved bruk av NIR vil være å få tilstrekkelig gode optiske signaler fra det indre av prøvene, fordi lyset må klare å trenge gjennom de ytre lagene av skinn eller skall.
– Online measurement of the core temperature of products will open new possibilities to optimise processing on our production lines.
– Online måling av produktets kjernetemperatur vil kunne gi nye muligheter for prosessoptimalisering av våre linjer.
Nortura has previously collaborated closely with Tomra and contributed to the development of online equipment for the measurement of fat content in meat, so this project will be exciting and we have high expectations, says Per Berg, head of R&D in Nortura.
Nortura har tidligere samarbeidet tett med Tomra og bidratt til utvikling av online utstyr for måling av fettinnhold i kjøttsorteringer, så dette prosjektet blir spennende og vi har store forventninger, sier Per Berg, FoU-direktør i Nortura.
Better sorting gives higher value creation
Bedre sortering øker verdiskapingen
It will also make it possible to regulate the heat-treatment process to ensure that the core temperature is optimal, relative to the final quality.
Det vil også gi muligheten til å regulere varmebehandlingsprosessen for å sikre at kjernetemperaturen blir optimal i forhold til sluttkvalitet.
Scientists at Nofima have worked in several projects to discover the best methods of measuring the dry matter content of potatoes.
Forskere i Nofima har i flere prosjekter jobbet med å finne frem til de beste måtene å måle tørrstoffinnholdet i poteter.
They have concluded that an NIR instrument can provide completely new possibilities that ensure that each individual raw potato is used precisely for its most suitable end use.
Konklusjonen er at et NIR-instrument kan gi helt nye muligheter som sørger for at hver enkelt rå potet blir brukt til akkurat det den egner seg best til.
The overall objective is to save saltwater and freshwater fisheries and aquaculture for the future.
Det store målet er å berge fiskerier og oppdrett i både i hav og fersk vann for framtiden.
21 research institutions from Europe, Vietnam, Chile and Canada met recently in Tromsø, Norway, to work with the EU-funded research project ClimeFish.
21 forskningsinstitusjoner i Europa, Vietnam, Chile og Canada var samlet i Tromsø to dager i mai, for å arbeide med det EU-finansierte forskningsprosjektet ClimeFish.
In four years’ time, more specifically in March 2020, the project will be completed.
Om fire år, nærmere bestemt i mars 2020, skal prosjektet være ferdig.
ClimeFish is being led by the University of Tromsø – The Arctic University of Norway, with the food research institute Nofima and The Institute of Marine Research in Norway playing key roles.
ClimeFish ledes av Universitetet i Tromsø – Norges arktiske universitet, med matforskningsinstituttet Nofima og Havforskningsinstituttet i sentrale roller.
The aim of this research is to identify the consequences of climate change for fisheries and aquaculture – both saltwater and freshwater.
Målet med forskningsarbeidet er å kartlegge hvilke konsekvenser klimaendringene har for fiskeri og havbruk – både i saltvann og ferskvann.
Through the development of effective forecasting and new tools, the ClimeFish research project will contribute to the fisheries and aquaculture sector and the authorities being better equipped to adapt to climate change.
Gjennom utvikling av effektive prognoser og nye verktøy skal forskningsprosjektet ClimeFish bidra til at fiskeri- og havbruksnæringen og myndigheter står bedre rustet til å tilpasse seg klimaendringene.
Temperature increases, increased salinity of ocean waters, acidification, eutrophication and erosion, as well as new species that migrate into European waters, are among the changes to be studied.
Temperaturøkninger, økt saltinnhold i havet, forsuring, eutrofiering og erosjon samt nye arter som vandrer inn i farvann i Europa, er blant endringene som skal undersøkes.
ClimeFish will study 25 fish and shellfish species in both saltwater and freshwater.
ClimeFish skal studere 25 fisk og skalldyrarter i både saltvann og ferskvann.
The ClimeFish project will:
Dette er målene for ClimeFish:
Help ensure that the increase in seafood production comes in areas and species where there is a potential for sustainable growth, given the expected developments in the climate.
Bidra til at økningen i sjømatproduksjon kommer i områder, og for arter, der det er potensial for bærekraftig vekst sett i forhold til den forventede utviklingen i klima.
Contribute to a precautionary approach to management of the fisheries.
Bidra til en føre var-tilnærming til forvaltning av fiskeriene
Contribute to robust employment and sustainable development of rural and coastal communities.
Bidra til robust sysselsetting og bærekraftig utvikling på landsbygda og i kystsamfunnene i Europa
These countries are engaged in ClimeFish:
Disse landene er engasjert i ClimeFish:
The Czech Republic, Denmark, France, Germany, Greece, Hungary, Italy, Spain, Sweden, Great Britain, Norway, Iceland, The Faroe Islands, Canada, Chile and Vietnam.
Tsjekkia, Danmark, Frankrike, Tyskland, Hellas, Ungarn, Italia, Spania, Sverige, Storbritannia, Norge, Island, Færøyene, Canada, Chile og Vietnam.
Key players in the project say this about the importance of ClimeFish:
Dette sier sentrale aktører i prosjektet om viktigheten av ClimeFish:
Cassandra De Young – FAO, Fisheries and Aquaculture Division, Italy:
Cassandra DeYoung – FAO, fiskeri- og akvakulturdivisjonen, Italia:
Michaela Aschan – Project manager for ClimeFish, UiT Norway’s Arctic university
Michaela Aschan – Prosjektleder for ClimeFish, UiT Norges arktiske universitet:
The capacity to produce food from aquatic systems needs to be further developed.
Kapasiteten til å produsere mat fra akvatiske systemer må utvikles videre.
As Europe is situated in the northern hemisphere and partly on the Arctic the climate warming introduces new challenges, but also opportunities, when it comes to fish and shellfish production.
Denne temperaturstigningen byr på nye utfordringer, men også muligheter når det gjelder fisk- og skalldyrproduksjon.
This is what I expect will come out of it:
– Jeg forventer at ClimeFish skal resultere i:
Unique datasets collected, harmonized and made available
Unike data samlet inn, tilpasset og gjort tilgjengelige.
Decision Support Framework (DSF) including software tools, best practices, guidelines and standards, allowing stakeholders to anticipate, prepare and adapt to different CC scenarios
Beslutningsstøtteverktøy som setter aktører og interessenter i stand til å forutse, forberede og tilpasse seg ulike scenarier skapt av kommende klimaendringer.
A European voluntary standard (CWA) for how to make climate-enabled management plans related to seafood Production
En europeisk frivillig standard (CWA) for hvordan man lager klimaaktiverte forvaltningsplaner knyttet til sjømatproduksjon
Nofima’s scientists, experts in the field of gastronomy and consumers believe that the answer is “yes”.
Ja, mener både Nofimas forskere, eksperter innen gastronomi, og forbrukere.
Low temperature and long time (LTLT) is the solution for many meat products.
Lav Temperatur i Lang Tid – LTLT – er løsningen for mange kjøttprodukter.