natgillin/translations-raw huggingface dataset:
Calculate the average specific growth rate over the entire test duration (normally days 0-3), using the nominally inoculated biomass as the starting value rather than a measured starting value, because in this way greater precision is normally obtained.
Lehetőség van arra, hogy a hatásadatok – például probit-, logit- vagy Weibull-modell (8) szerinti – linearizációs transzformálását követően súlyozott lineáris regressziót végezzünk, de előnyösebb inkább nemlineáris regressziót alkalmazni, mert ez jobban kezeli az adatok elkerülhetetlen irregularitását és a sima eloszlástól való eltérést.
If the equipment used for biomass measurement allows sufficiently precise determination of the low inoculum biomass (e.g. flow cytometer) then the measured initial biomass concentration can be used.
A nulla és a teljes gátlás környezetében az irregularitást a transzformáció felnagyíthatja, ami a számítás szempontjából előnytelen (8).
Assess also the section-by-section growth rate, calculated as the specific growth rates for each day during the course of the test (days 0-1, 1-2 and 2-3) and examine whether the control growth rate remains constant (see validity criteria, paragraph 11).
Meg kell jegyezni, hogy a transzformációval kapott probit, logit vagy Weibull egységeket használó szabványos elemzési módszerek kvantált adatok (pl. halálozás vagy túlélés) használatára vannak tervezve, és a szaporodási adatokkal vagy az élőanyagra vonatkozó adatokkal való alkalmazásukhoz módosítani kell őket.
While a lag phase can be minimised and practically eliminated in control cultures by proper propagation of the pre-culture, a lag phase in exposed cultures may indicate recovery after initial toxic stress or reduced exposure due to loss of test chemical (including sorption onto the algal biomass) after initial exposure.
A nem lineáris regresszió használatáról a 5. függelékben található részletesebb információ.
Hence the section-by-section growth rate may be assessed in order to evaluate effects of the test chemical occurring during the exposure period.
Az ECx értékek pontbecsléseinek kiszámításához a koncentráció-válasz összefüggést kell használni minden elemzendő hatásváltozóra.
Substantial differences between the section-by-section growth rate and the average growth rate indicate deviation from constant exponential growth and that close examination of the growth curves is warranted.
Ha lehetséges, meg kell határozni az egyes becslések 95 %-os konfidenciahatárát.
Calculate the percent inhibition of growth rate for each treatment replicate from equation [2]:
A hatásadatok regressziós modellhez illeszkedésének jóságát grafikus vagy statisztikai módszerrel kell megállapítani.
%I r
A regressziószámítást az egyes vizsgálati edényeken nyert értékekkel, nem pedig a vizsgálati csoportok középértékével kell elvégezni.
percent inhibition in average specific growth rate;
Ha azonban a nem lineáris görbeillesztés bonyolult vagy nem sikerül az adatok túl nagy szórása miatt, a problémát meg lehet kerülni a csoportátlagok regresszióanalízésével, ami egy gyakorlati mód a feltehető érvénytelen adatpontok hatásának csökkentésére.
mean value for average specific growth rate (μ) in the control group;
Ennek a lehetőségnek a használatát a szokásos eljárástól való eltérésként fel kell tüntetni a mérési jegyzőkönyvben, hivatkozva arra, hogy a görbeillesztések az egyedi ismétléseknél kapott adatokkal nem adtak jó eredményt.
average specific growth rate for the treatment replicate.
Ha a rendelkezésre álló regressziós modellek/módszerek nem alkalmasak a konkrét adatok elemzésére, az EC50-re vonatkozó becsléseket és a konfidenciahatárokat »bootstrap« technikával együtt alkalmazott lineáris interpolációval (13) is előállíthatjuk.
When solvents are used to prepare the test solutions, the solvent controls rather than the controls without solvents should be used in calculation of percent inhibition.
Az LOEC és ennélfogva az NOEC becsléséhez is, illetve a vizsgált vegyi anyag által a szaporodási sebességre gyakorolt hatásnak a becsléséhez szórásnégyzet-elemzési (ANOVA) eljárások segítségével össze kell hasonlítani a kezelt csoport átlagait.
Yield is calculated as the biomass at the end of the test minus the starting biomass for each single vessel of controls and treatments.
Az egyes koncentrációkhoz tartozó középértékeket ezután alkalmasan megválasztott többszörös összehasonlító módszerrel vagy trendpróbával a kontrollcsoporton nyert középértékhez hasonlítjuk.
For each test concentration and control, calculate a mean value for yield along with variance estimates.
A Dunnett- vagy a Williams-féle módszer használható lehet erre a célra (12)(14)(15)(16)(17).
The percent inhibition in yield ( %Iy) may be calculated for each treatment replicate as follows:
Lényeges ellenőrizni, hogy fennáll-e az ANOVA-nak a szórásnégyzetek homogenitására vonatkozó feltevése.
%I y
Ezt az ellenőrzést grafikusan vagy formális próbával (17) végezhetjük.
percent inhibition of yield;
A Levene- és Bartlett-féle próbák megfelelőek ehhez.
Plotting concentration response curve
Az NOEC meghatározásához további útmutatást ad a (11) irodalom.
Plot the percentage of inhibition against the logarithm of the test chemical concentration and examine the plot closely, disregarding any such data point that was singled out as an outlier in the first phase.
Az újabb keletű tudományos eredmények az NOEC-koncepció elhagyásának ajánlásához és az ECx regresszión alapuló pontbecsléssel történő meghatározásával való helyettesítéséhez vezettek.
Fit a smooth line through the data points by eye or by computerised interpolation to get a first impression of the concentration-response relationship, and then proceed with a more detailed method, preferably a computerised statistical method.
Ehhez az algavizsgálathoz még nem állapítottak meg megfelelő x értéket.
Depending on the intended usage of data;
A 10–20 %-os tartomány azonban megfelelőnek tűnik (a választott hatásváltozótól függően), és célszerű mind az EC10-et, mind az EC20-at megadni a mérési jegyzőkönyvben.
the quality (precision) and amount of data as well as the availability of data analysis tools, it may be decided (and sometimes well justified) to stop the data analysis at this stage and simply read the key figures EC50 and EC10 (and/or EC20) from the eye fitted curve (see also section below on stimulatory effects).
Szaporodásstimuláció
Valid reasons for not using a statistical method may include:
Kis koncentrációk mellett néha szaporodásstimuláció (negatív gátlás) figyelhető meg.
Data are not appropriate for computerised methods to produce any more reliable results than can be obtained by expert judgement — in such situations some computer programs may even fail to produce a reliable solution (iterations may not converge etc.)
Ezt vagy a hormesis (kétfázisú reagálás) jelensége (»toxikus anyag által kiváltott stimuláció«), vagy a vizsgált anyaggal együtt az alkalmazott ásványi sókat tartalmazó tápoldatba került szaporodásserkentő tényezők okozhatják.
Stimulatory growth responses cannot be handled adequately using available computer programs (see below).
Megjegyzendő, hogy a szervetlen tápanyagok hozzáadásának nem lehet semmilyen közvetlen hatása, mert a kísérleti oldatnak a kísérlet folyamán végig feleslegben kell tartalmaznia a tápanyagot.
Statistical procedures
Kis dózisú stimuláció gyakran figyelmen kívül hagyható az EC50 kiszámítása során, hacsak mértéke nem rendkívül nagy.
The aim is to obtain a quantitative concentration-response relationship by regression analysis.
Ha azonban rendkívül nagy mértékű, vagy pedig kis x értékre kell ECx-et számítani, akkor speciális eljárásokra lehet szükség.
It is possible to use a weighted linear regression after having performed a linearising transformation of the response data — for instance into probit or logit or Weibull units (8), but non-linear regression procedures are preferred techniques that better handle unavoidable data irregularities and deviations from smooth distributions.
Lehetőség szerint kerülni kell a stimulációs hatások törlését az adatelemzésből, és ha a rendelkezésre álló görbeillesztő szoftver nem képes kezelni a kisebb mértékű stimulációkat, akkor visszatevéses mintavétellel (»bootstrap« módszer) együtt alkalmazott lineáris interpoláció használható.
Approaching either zero or total inhibition, such irregularities may be magnified by the transformation, interfering with the analysis (8).
Ha a stimuláció rendkívül nagy, akkor mérlegelni lehet hormesismodell alkalmazását (18).
It should be noted that standard methods of analysis using probit, logit, or Weibull transforms are intended for use on quantal (e.g. mortality or survival) data, and must be modified to accommodate growth or biomass data.
Nem toxikus növekedésgátlás
Specific procedures for determination of ECx values from continuous data can be found in (9) (10) and (11).
A fényt abszorbeáló anyagok a szaporodási sebesség csökkenését okozhatják, hiszen az árnyékolás csökkenti a kapott fény mennyiségét.
The use of non-linear regression analysis is further detailed in Appendix 5.
Az ilyen jellegű fizikai hatásokat a kísérleti körülmények módosításával el kell választani a toxikus hatásoktól, és az előbbit külön kell dokumentálni.
For each response variable to be analysed, use the concentration-response relationship to calculate point estimates of ECx values.
Útmutatás a (2) és (3) szakirodalmi hivatkozásban található.
When possible, the 95 % confidence limits for each estimate should be determined.
VIZSGÁLATI JEGYZŐKÖNYV
Goodness of fit of the response data to the regression model should be assessed either graphically or statistically.
A vizsgálati jegyzőkönyvnek a következőket kell tartalmaznia:
Regression analysis should be performed using individual replicate responses, not treatment group means.
Vizsgált vegyi anyag:
If, however nonlinear curve fitting is difficult or fails because of too great scatter in the data, the problem may be circumvented by performing the regression on group means as a practical way of reducing the influence of suspected outliers.
fizikai jelleg és a vonatkozó fizikai és kémiai tulajdonságok, beleértve a vízoldhatósági határértéket is,
Use of this option should be identified in the test report as a deviation from normal procedure because curve fits with individual replicates did not produce a good result.
kémiai azonosító adatok (pl. CAS-szám), tisztaság (szennyeződések).
estimates and confidence limits may also be obtained using linear interpolation with bootstrapping (13), if available regression models/methods are unsuitable for the data.
A vizsgálathoz felhasznált faj:
For estimation of the LOEC and hence the NOEC, for effects of the test chemical on growth rate, it is necessary to compare treatment means using analysis of variance (ANOVA) techniques.
a törzs, a szállító vagy az eredet, és az alkalmazott tenyésztési körülmények.
The mean for each concentration must then be compared with the control mean using an appropriate multiple comparison or trend test method.
Vizsgálati feltételek:
Dunnett's or Williams' test may be useful (12)(14)(15)(16)(17).
a vizsgálat megkezdésének időpontja és időtartama;
It is necessary to assess whether the ANOVA assumption of homogeneity of variance holds.
a kísérlet kivitelezésének leírása:
This assessment may be performed graphically or by a formal test (17).
kísérleti eszközök, a tenyészetek mennyisége, az élőanyag sűrűsége a vizsgálat kezdetén;
Suitable tests are Levene's or Bartlett's.
a tápoldat összetétele;
Failure to meet the assumption of homogeneity of variances can sometimes be corrected by logarithmic transformation of the data.
kísérleti koncentrációk és ismétlések (pl. ismétlések száma, kísérleti koncentrációk száma és az alkalmazott mértani sor);
If heterogeneity of variance is extreme and cannot be corrected by transformation, analysis by methods such as step-down Jonkheere trend tests should be considered.
a kísérleti oldatok készítésének leírása, beleértve az oldószerek használatát stb.
Additional guidance on determining the NOEC can be found in (11).
tenyésztőkészülék;
Recent scientific developments have led to a recommendation of abandoning the concept of NOEC and replacing it with regression based point estimates ECx.
fényerő és -minőség (fényforrás, homogenitás);
An appropriate value for x has not been established for this algal test.
hőmérséklet;
A range of 10 to 20 % appears to be appropriate (depending on the response variable chosen), and preferably both the EC10 and EC20 should be reported.
kísérleti koncentrációk:
Growth stimulation
a névleges kísérleti koncentrációk és a lombikokban lévő vizsgált vegyi anyag koncentrációjának meghatározására szolgáló analízisek eredménye.
Growth stimulation (negative inhibition) at low concentrations is sometimes observed.
A vizsgálati mátrixra vonatkozóan a mérési jegyzőkönyvben fel kell tüntetni a módszer visszanyerési hatékonyságát és a mennyiségi meghatározás határértékét;
This can result from either hormesis (“toxic stimulation”) or from addition of stimulating growth factors with the test material to the minimal medium used.
minden eltérés ettől a vizsgálati módszertől;
Note that the addition of inorganic nutrients should not have any direct effect because the test medium should maintain a surplus of nutrients throughout the test.
az élőanyag tömegének meghatározási módszere, valamint a mért paraméter és a száraz tömeg közötti korreláció bizonyítéka;
Low dose stimulation can usually be ignored in EC50 calculations unless it is extreme.
Eredmények:
However, if it is extreme, or an ECx value for low x is to be calculated, special procedures may be needed.
pH-értékek minden kezelés kezdetén és végén;
Deletion of stimulatory responses from the data analysis should be avoided if possible, and if available curve fitting software cannot accept minor stimulation, linear interpolation with bootstrapping can be used.
az élőanyag tömege minden lombikban és minden mérési pontban, valamint az élőanyag mérésének módszere;
If stimulation is extreme, use of a hormesis model may be considered (18).
szaporodási görbék (az élőanyag mennyiségének ábrázolása az idő függvényében);
Non toxic growth inhibition
hatásváltozók számított értéke kezelési ismétlésenként, továbbá ismétlésenként a középérték és a szórásnégyzet;
Light absorbing test materials may give rise to a growth rate reduction because shading reduces the amount of available light.
a koncentráció-válasz összefüggés grafikus ábrázolása;
Such physical types of effects should be separated from toxic effects by modifying the test conditions and the former should be reported separately.
toxicitásbecslés a hatásváltozókra, pl. EC50, EC10, EC20 és a kapcsolódó konfidenciaintervallumok.
Guidance may be found in (2) and (3).
Az LOEC és az NOEC, ha ezek kiszámítása megtörtént, és a meghatározásukhoz használt statisztikai módszerek;
TEST REPORT
ANOVA alkalmazása esetén a hatás kimutatásának mérethatára (például a legkisebb szignifikáns különbség);
The test report must include the following:
a vizsgálatok során észlelt esetleges növekedésserkentés;
Test chemical:
bármilyen más észlelt hatás, például az algák morfológiai változása;
physical nature and relevant physical-chemical properties, including water solubility limit;
az eredmények szöveges elemzése, beleértve az e vizsgálati módszertől való eltéréseknek a vizsgálat kimenetelére gyakorolt hatását.
chemical identification data (e.g., CAS Number), including purity (impurities).
1. függelék
Test species:
Fogalommeghatározások
the strain, supplier or source and the culture conditions used.
E vizsgálati módszerben az alábbi definíciók és rövidítések használatosak: Élőanyag
Test conditions:
egy populációban jelen lévő élő anyag száraz tömege egy adott mennyiségben kifejezve;
date of start of the test and its duration;
pl. mg alga/liter vizsgálati oldat.
description of test design:
Általában az »élőanyag« tömegként van definiálva, de ebben a vizsgálatban a szó »tömeg/térfogat«-ot jelent.
test vessels, culture volumes, biomass density at the beginning of the test;
Szintén ebben a vizsgálatban az élőanyag tömege helyett jellemzően sejtszám, fluoreszcencia stb. mérése történik, és az »élőanyag« kifejezés használata így ezekre a helyettesítő mérőszámokra is utal.
composition of the medium;
Vegyi anyag
test concentrations and replicates (e.g., number of replicates, number of test concentrations and geometric progression used);
anyag vagy keverék.
description of the preparation of test solutions, including use of solvents etc.
Variációs együttható (CV)
culturing apparatus;
egy paraméter változékonyságának dimenzió nélküli mérőszáma; definíció szerint a szórás és az átlag aránya.
light intensity and quality (source, homogeneity);
Ezt százalékos formában is ki lehet fejezni.
temperature;
A kontroll ismétlésekben az átlagos fajlagos szaporodási sebesség átlagos variációs együtthatóját az alábbiak szerint lehet kiszámítani:
concentrations tested:
Ki kell számítani az átlagos fajlagos szaporodási sebesség %-os variációs együtthatóját a naponkénti/szakaszonkénti szaporodási sebességekből a megfelelő ismétlésekre;
the nominal test concentrations and any results of analyses to determine the concentration of the test chemical in the test vessels.
Ki kell számítani az 1. pontban kiszámított összes érték átlagát, ami megadja a kontroll ismétlésekben a naponkénti/szakaszonkénti átlagos fajlagos szaporodási sebesség átlagos variációs együtthatóját.
The recovery efficiency of the method and the limit of quantification in the test matrix should be reported;
ECx
all deviations from this test method;
a vizsgálati oldatban oldott vizsgált vegyi anyag olyan koncentrációja, ami meghatározott expozíciós idő alatt (ha eltér a teljes vagy szokásos kísérleti időtartamtól, akkor pontosan meg kell adni) a vizsgált organizmus x %-os (pl. 50 %) szaporodásgátlását eredményezi.
method for determination of biomass and evidence of correlation between the measured parameter and dry weight;
Hogy egyértelmű legyen, hogy az EC értékét a növekedési sebességből vagy a szaporulatból nyertük-e, növekedési sebesség esetén »ErC«-t, szaporulat esetén pedig »EyC«-t írunk.
Results:
Tápoldat
pH values at the beginning and at the end of the test at all treatments;
az a teljes mesterséges tenyésztő közeg, amelyben a vizsgált algák a vizsgált vegyi anyag jelenlétében szaporodnak.
biomass for each flask at each measuring point and method for measuring biomass;
A vizsgált vegyi anyag általában oldott formában van jelen a vizsgálati oldatban.
growth curves (plot of biomass versus time);
A vizsgált vegyi anyag általában oldott formában van jelen a vizsgálati oldatban.
calculated response variables for each treatment replicate, with mean values and coefficient of variation for replicates;
az élőanyagtömeg logaritmikus növekedése az expozíciós idő alatt.
graphical presentation of the concentration/effect relationship;
Észlelhető hatást okozó legkisebb koncentráció (LOEC)
estimates of toxicity for response variables e.g., EC50, EC10, EC20 and associated confidence intervals.
az a legkisebb vizsgált koncentráció, amely mellett adott expozíciós idő alatt a vegyi anyag statisztikailag szignifikáns mértékben (p < 0,05) csökkenti a növekedést a kontrolltenyészethez képest.
any stimulation of growth found in any treatment;
Mérési változók
any other observed effects, e.g. morphological changes of the algae;
Észlelhető hatást még nem okozó koncentráció (NOEC) az a vizsgált koncentráció, amely közvetlenül az LOEC alatt helyezkedik el.
discussion of the results, including any influence on the outcome of the test resulting from deviations from this test method.
a toxikus hatás becslésére használt változó, amely különböző számítási módokkal az élőanyag leírására szolgáló bármelyik mért paraméterből levezethető.
OECD (2006).
Ebben a vizsgálati módszerben a hatásváltozók a szaporodási sebesség, illetve a szaporulat, amelyek közvetlenül az élőanyag mérésével, vagy pedig az említett helyettesítő mérőszámok valamelyikének mérésével kaphatók meg.
J. Amer.
Fajlagos szaporodási sebesség egy mérési paraméter (ebben a vizsgálati módszerben az élőanyag mennyiségének változása) természetes alapú logaritmusainak különbségéből és a változáshoz tartozó időtartamból képzett hányadosként definiált hatásváltozó.
Appendix 1
Vizsgált vegyi anyag: az e vizsgálati módszerrel vizsgált bármely anyag vagy keverék.
Definitions
az élőanyag vizsgálat alatti mennyiségi növekedésének a kifejezésére használt mérési változó értéke; az expozíciós idő végén mért változóérték mínusz az expozíciós idő kezdetén mért változóérték.
The following definitions and abbreviations are used for the purposes of this test method:
2. függelék
Biomass is the dry weight of living matter present in a population expressed in terms of a given volume;
A vizsgálathoz bizonyítottan alkalmas törzsek
e.g., mg algae/litre test solution.
Zöldalgák
Usually “biomass” is defined as a mass, but in this test this word is used to refer to mass per volume.
Pseudokirchneriella subcapitata, (régebbi elnevezéssel Selenastrum capricornutum), ATCC 22662, CCAP 278/4, 61.81 SAG
Also in this test, surrogates for biomass, such as cell counts, fluorescence, etc. are typically measured and the use of the term “biomass” thus refers to these surrogate measures as well.
Desmodesmus subspicatus (régebbi elnevezéssel Scenedesmus subspicatus) 86.81 SAG
Chemical means a substance or mixture
Kovamoszatok
Coefficient of variation is a dimensionless measure of the variability of a parameter, defined as the ratio of the standard deviation to the mean.
Cianobaktériumok
This can also be expressed as a percent value.
A törzsek eredete
Mean coefficient of variation of average specific growth rate in replicate control cultures should be calculated as follows:
Az ajánlott törzsek egyfajú algatenyészetként beszerezhetőek az alábbi törzsgyűjteményekből (ábécésorrendben):
Calculate % CV of average specific growth rate out of the daily/section by section growth rates for the respective replicate;
A javasolt fajok fenotípusa és jellemzői
Calculate the mean value out of all values calculated under point 1 to get the mean coefficient of variation of the daily/section by section specific growth rate in replicate control cultures.
Jellemzők
ECx is the concentration of the test chemical dissolved in test medium that results in an x % (e.g. 50 %) reduction in growth of the test organism within a stated exposure period (to be mentioned explicitly if deviating from full or normal test duration).
Hajlott, csavart egyedi sejtek
To unambiguously denote an EC value deriving from growth rate or yield the symbol “ErC” is used for growth rate and “EyC” is used for yield.
Ovális, főként egyedi sejtek
Growth medium is the complete synthetic culture medium in which test algae grow when exposed to the test chemical.
Pálcák
The test chemical will normally be dissolved in the test medium.
Ovális sejtekből álló fonalak
Growth rate (average specific growth rate) is the logarithmic increase in biomass during the exposure period.
Méret (hossz x szélesség) μm
Lowest Observed Effect Concentration (LOEC) is the lowest tested concentration at which the chemical is observed to have a statistically significant reducing effect on growth (at p < 0,05) when compared with the control, within a given exposure time.
Sejttérfogat (μm3/sejt)
However, all test concentrations above the LOEC must have a harmful effect equal to or greater than those observed at the LOEC.
Sejt száraz tömege (mg/sejt)
When these two conditions cannot be satisfied, a full explanation must be given for how the LOEC (and hence the NOEC) has been selected.
2 – 3 × 10– 8
No Observed Effect Concentration (NOEC) is the test concentration immediately below the LOEC.
3 – 4 × 10– 8
Response variable is a variable for the estimation of toxicity derived from any measured parameters describing biomass by different methods of calculation.
1 – 2 × 10– 8
For this test method growth rates and yield are response variables derived from measuring biomass directly or any of the surrogates mentioned.
2 – 3 × 10– 9
Specific growth rate is a response variable defined as quotient of the difference of the natural logarithms of a parameter of observation (in this test method, biomass) and the respective time period
Szaporodási sebesség [3] (nap– 1)