natgillin/translations-raw huggingface dataset:
When a laboratory examination is required for the purpose of confirmation of the presence of or to rule out the suspicion of KHVD in accordance with Article 57(b) of Directive 2006/88/EC, using the diagnostic methods set out in Section III of Part 2 of Annex I, the detailed diagnostic methods and procedures set out in points I.1 – I.2 of this Part shall apply.
Az e pontban ismertetett, a KHV timidin-kináz (TK) génjére irányuló próba alkalmazandó.
Preparation of samples from fish
Az itt ismertetett PCR-módszer helyett azonban igazoltan hasonló érzékenységű és specificitású egyéb PCR-rendszerek is alkalmazhatók.
For diagnostic purposes the fish (sent alive or killed and packed separately in sealed aseptic containers) or alternatively frozen organs or organ pieces preserved in 80 % to absolute ethanol or viral transport medium (to be processed within 48 hours after collection) may be used for testing with conventional PCR or qPCR based methods.
Reverz primer (KHV-TKr): 5′-CACCCAGTAGATTA TGC-3′.
For the detection of KHV, gill and kidney shall be collected; in addition spleen, encephalon and intestine may be included in an additional separated sample.
Ciklusparaméterek: 1 ciklus 95 °C-on 5 percig, azt követően 35 ciklus 95 °C-on 30 másodpercig, 52 °C-on 30 másodpercig, 72 °C-on 1 percig és 1 ciklus 72 °C-on 10 percig.
In acute cases, tissue material of up to five fish may be pooled.
A termék méretének 409 bp-nak kell lennie.
Furthermore, non-lethal samples such as blood, gill swabs, gill biopsy, mucus scrape may be used in certain cases (namely very valuable fish may be used in the case of the suspicion of the presence of KHV).
Ezenfelül fals primerkötődés vagy kontamináció miatt előfordulhatnak fals pozitív eredmények.
DNA extraction
Ehelyett más, igazoltan hasonló hatékonyságú PCR-változatok is alkalmazhatók.
DNA shall be extracted in accordance with standard procedures.
Egy adott területen belüli első kimutatást szekvenálással kell megerősíteni, vagy egy nemzeti referencialaboratóriumba vagy a 2006/88/EK irányelv VI. mellékletében említett, halbetegségekkel foglalkozó uniós referencialaboratóriumba kell küldeni.
The commercially available DNA extraction kits that produce high quality DNA suitable for use with the PCR protocols referred to in point I.2 may be used.
A KHVD felügyeletére szolgáló részletes diagnosztikai módszerek és eljárások
Agent detection and identification by Polymerase chain reaction (PCR) based methods
A KHVD-re vonatkozó bizonyos egészségügyi státusoknak az I. melléklet 2. része I. szakaszában meghatározott megszerzése vagy fenntartása céljából – az említett melléklet 2. részének II. vagy III. szakaszában foglalt diagnosztikai módszerekkel – végzett mintavétel és laboratóriumi vizsgálat során az e rész alábbi II.1. és II.2. pontjában meghatározott részletes diagnosztikai módszerek és eljárások alkalmazandók.
For qPCR detection of KHV, the following qPCR assay shall be used:
Amennyiben lehetséges, a KHV kimutathatóságának javítása érdekében a mintákat a vírushordozó státusú halakban a vírus reaktiválását esetlegesen kiváltó gazdálkodási gyakorlatokat, például a háló kivetését vagy a szállítást követő 24 órán belül, de legkésőbb 72 órán belül kell gyűjteni.
Forward primer (KHV-86f): 5′- GACGCCGGAGACCTTGTG -3′;
A KHVD felügyelete céljából a halak elküldhetők élve vagy leölve, lezárt aszeptikus tárolóedényekbe külön-külön csomagolva, illetve alternatív megoldásként 80–100 %-os alkoholban vagy vírusszállító tápfolyadékban tartósított (a begyűjtést követően 48 órán belül feldolgozandó) fagyasztott szervek vagy szervdarabok is felhasználhatók a hagyományos PCR-alapú módszerekkel végzett vizsgálathoz.
Reverse primer (KHV-163r): 5′- CGGGTTCTTATTTTTGTCCTTGTT -3′;
A KHVD felügyeletéhez kopoltyú- és veseszövetet kell gyűjteni.
and probe (KHV-109p): 5′-FAM- CTTCCTCTGCTCGGCGAGCACG -3′.
A KHVD felügyelete céljából a minták összevonása lehetőleg kerülendő.
Cycling conditions: one cycle of 95 °C at 15 minutes, followed by 40 cycles of 94 °C at 15 seconds and 60 °C for 60 seconds.
Ha szükséges az összevonás, legfeljebb két halból származó szövetminta vonható össze.
However, other qPCR versions of proven similar efficacy may be used instead.
A nagyobb mintákat mozsárban mozsártörővel vagy Stomacher készülékkel kell homogenizálni, a részmintákat pedig a derítés előtt ki kell nyerni a DNS-kimutatáshoz.
Conventional PCR for KHV detection
Alternatív megoldásként a mintába felvett és feltáró csőbe (líziscsőbe) helyezett szövetek mindegyikéből gyűjthető részminta.
The assay described in this point targeting the Thymine kinase (TK) gene of KHV shall be used.
A II.2. pontban meghatározott PCR-protokollokkal való felhasználásra alkalmas kiváló minőségű DNS-t előállító, kereskedelmi forgalomban kapható DNS-kivonási készletek használata megengedett.
However, other PCR assays with demonstrated similar sensitivities and specificities to the described assay may be used instead.
Az elfogadható szövet/tápfolyadék arány 1:9 w/v.
Forward primer (KHV-TKf): 5′-GGGTTACCTGTAC GAG-3′;
A vizsgálatokhoz 20–25 mg szövetmintát kell felhasználni.
Reverse primer (KHV-TKr): 5′-CACCCAGTAGATTA TGC-3′.
A KHVD PCR-alapú módszerekkel végzett felügyelete
Cycling conditions: one cycle of 95 °C for 5 minutes followed by 35 cycles of 95 °C for 30 seconds, 52 °C for 30 seconds, 72 °C for one minute and one cycle of 72 °C for 10 minutes.
A KHV felügyeletéhez qPCR alkalmazandó.
Product size should be 409 bp.
Ha korábban pozitívként nem megerősített területen pozitív minták jelennek meg, a vizsgálati eredményeket az alábbiak valamelyikével kell megerősíteni:
Furthermore, false-positive results may occur because of false primer annealing or contamination.
a mintákból származó PCR-termék vagy fészek PCR-termék szekvenálásával.
However, other PCR versions of proven similar efficacy may be used instead.
A létrejött tiszta konszenzusszekvenciának (legalább 98 %-ban) illeszkednie kell ezekhez a referenciaszekvenciákhoz;
The first detection in an area shall be confirmed by sequencing or sent to a to a national reference laboratory or to the EU reference laboratory for fish diseases referred to in Annex VI to Directive 2006/88/EC, for immediate identification.
vagy a minták megerősítés céljából nemzeti referencialaboratóriumba is küldhetők.
Detailed diagnostic methods and procedures for the surveillance of KHVD
KHV-kimutatásra szolgáló qPCR
When sampling and laboratory examination for the purpose of obtaining or maintaining certain health statuses with regard to KHVD as set out in Section I of Part 2 of Annex I are carried out using the diagnostic methods set out in Sections II or III of Part 2 of that Annex, the detailed diagnostic methods and procedures set out in the following points II.1 and II.2 of this Part shall apply.
Az alábbiakban ismertetett qPCR alkalmazandó:
If possible, fish that have been kept for a prolonged time period at the virus permissive temperature range (namely, 2 to 3 weeks at 15 °C to 26 °C) shall be sampled.
Ciklusparaméterek: 1 ciklus 95 °C-on 15 percig, azt követően 50 ciklus 94 °C-on 15 másodpercig és 60 °C-on 60 másodpercig.
If possible, samples shall be collected 24 hours but not later than 72 hours after management practices that may reactivate the virus in fish with a carrier status, such as netting or transport, in order to enhance the chance of KHV detection.
A qPCR eredményei a műveletek elvégzésének körülményeitől függően változhatnak, azaz a használt PCR-készüléktől függően előfordulhat, hogy a hőmérsékleti protokollok optimalizálásra szorulnak.
For the purpose of the surveillance of KHVD, the fish may be sent alive or killed and packed separately in sealed aseptic containers or alternatively frozen organs or organ pieces preserved in 80 % to 100 % alcohol or viral transport medium (to be processed within 48 hours after collection) may be used for testing PCR based methods.
A KHV kimutatásának megerősítésére szolgáló hagyományos PCR
For the surveillance of KHVD, gill and kidney tissue shall be collected.
A KHV-fertőzés jelenlétének megerősítéséhez az alábbi 2.1. táblázatban ismertetett generikus fészek-PCR, majd az amplifikált termék szekvenálása alkalmazandó.
For the purpose of surveillance of KHVD, pooling shall be avoided where possible.
táblázat
If pooling is necessary, tissue material from a maximum of two fish may be pooled.
Primerek, valamint az összes cyprinid-herpeszvírusra (CyHV-1, CyHV-2 és CyHV-3) irányuló fészek PCR-próba feltételei
Larger samples shall be homogenised in mortar and pestle or stomacher, and subsamples retrieved for DNA extraction before clarification.
Primer neve
Alternatively, subsamples may be collected from each tissue included in the sample and placed in ‘lysis-tubes’.
Szekvencia
Commercially available DNA extraction kits that produce high quality DNA suitable for use with the PCR protocols set out in point II.2 may be used.
Ciklusparaméterek
The acceptable tissue medium ratio shall be 1:9 w/v.
Termék mérete
20 to 25 mg tissue material shall be included in the tests.
PCR első köre
Surveillance of KHVD by PCR based methods
1 ciklus:
For the surveillance of KHV, a qPCR shall be used.
95 °C-on 2 percig
If positive samples appear in an area not previously confirmed positive, the test results shall be confirmed either:
40 ciklus:
by sequencing of a PCR or nested PCR product from the samples.
95 °C-on 30 másodpercig
The obtained clean consensus sequence shall match (by at least 98 %) with these reference sequences.
55 °C-on 30 másodpercig
or alternatively, samples may be sent to a national reference laboratory for confirmation.
72 °C-on 45 másodpercig
qPCR for KHV detection
72 °C-on 10 percig
The qPCR described as follows shall be used:
CyHVpol-reverz
The results of the qPCR may vary depending on the conditions under which it is performed, namely the thermal protocols might need optimisation, depending on the thermal cycler in use.
PCR második köre
Conventional PCR for confirmation of KHV detection
95 °C-on 2 percig
For confirmation of the presence of infection with KHV, the generic nested PCR described in the following Table 2.1 shall be used followed by sequencing of the amplified product.
CyHVpol-belső reverz
Table 2.1
Ehelyett igazoltan hasonló hatékonyságú qPCR-változatok is alkalmazhatók.
Primers and conditions for the nested PCR assay targeting all cyprinid herpesviruses (CyHV-1, CyHV-2 and CyHV-3)
A szekvenálást a laboratórium vagy szekvenálásra szakosodott külső cégek végezhetik el.
Primer name
A szekvenálás eredményeit a szekvenciák ismert KHV-referenciaszekvenciákhoz (Gen Bank hozzáférési számok: AP008984, DQ657948 és DQ177346) illesztésével kell elemezni.
Sequence
A létrejött tiszta konszenzusszekvenciának legalább 98 %-ban egyeznie kell ezekkel a referenciaszekvenciákkal.
Cycling conditions
A LAZACOK FERTŐZŐ VÉRSZEGÉNYSÉGÉNEK (ISA) FELÜGYELETÉRE ÉS MEGERŐSÍTÉSÉRE SZOLGÁLÓ RÉSZLETES DIAGNOSZTIKAI MÓDSZEREK ÉS ELJÁRÁSOK
Product size
I. Az ISA felügyeletére és az ellene való védekezésre szolgáló mintavételi eljárások
CyHVpol-forward
A mintavétel és a laboratóriumi vizsgálat során az I. melléklet 3. részében meghatározott felügyeleti vagy felszámolási programokhoz, illetve az ISA jelenlétének a 2006/88/EK irányelv 57. cikke b) pontja szerinti megerősítéséhez vagy kizárásához az e szakasz I.1., I.2 és I.3. pontjában meghatározott részletes diagnosztikai módszerek és eljárások alkalmazandók.
First round PCR
Az ISA jelenlétének laboratóriumi vizsgálatához a halminták összevonása lehetőség szerint kerülendő.
1 cycle:
Az ISA felügyelete céljából azonban 2–5 halból származó minta összevonása elfogadható.
95 °C 2 minutes
A mintául szolgáló összes halból szövetet kell venni a fordított transzkripciós polimeráz láncreakcióval (RT-PCR) végzendő elemzéshez.
40 cycles:
Steril eszközt használva egy darabot ki kell venni a halak középveséjéből és 1 ml igazolt hatékonyságú RNS-stabilizáló oldatot tartalmazó mikrocentrifuga-csőbe kell helyezni.
95 °C for 30 seconds
Egy szállítóoldatot tartalmazó csőbe legfeljebb öt halból származó szövet gyűjthető, amely így egy összevont mintát alkot.
55 °C for 30 seconds
Egy mintában a szövetek tömegének 0,5 g-nak kell lennie.
72 °C for 45 seconds
Ha a halak az előírt tömegű minta vételéhez túl kicsik, vese-, szív-, lép-, máj- vagy pyloric caeca-darabok vehetők – ilyen sorrendben – a 0,5 g eléréséig.
72 °C for 10 minutes
A szövettani vizsgálatra szánt minták csak az ISA jelenlétére utaló klinikai tüneteket vagy kórbonctani elváltozásokat mutató, szabályos alkatú, frissen leölt halakból vehetők.
CyHVpol-reverse
Mintát kell venni bármilyen külső vagy belső sérülésből, valamint szike segítségével minden esetben mintát kell venni az egyes halak középveséjéből, szívéből, májából, hasnyálmirigyéből, beleiből, kopoltyúiból és lépéből, amelyet 8–10 térfogat-százalékos pufferolt formalinos sóoldatba kell helyezni.
CyHVpol-internal forward
A fixáló szövethez viszonyított arányának a szövet kielégítő tartósításának biztosítása érdekében legalább 20:1-nek kell lennie.
Second round PCR
Az immunhisztokémiai (IHC-) vizsgálathoz a középveséből és a szívből kell mintát venni.
95 °C 2 minutes,
A mintául szolgáló összes halból szövetet kell venni sejttenyészeten végzett virológiai vizsgálathoz.
CyHVpol-internal reverse
Steril eszközt használva darabokat kell venni a halak májából, elő- vagy középveséjéből, szívéből és lépéből, és ezeket 9 ml szállító tápfolyadékot tartalmazó műanyag csövekbe kell helyezni.
PCR versions of proven similar efficacy may be used instead.
Egy szállítóoldatot tartalmazó csőbe legfeljebb 5 halból vett szövet tehető, amely így egy összevont mintát alkot.
Sequencing may be performed by the laboratory or at external specialised sequencing companies.
Egy mintában a szövetek tömegének 1,0 ± 0,5 g-nak kell lennie.
Sequencing results shall be analysed by aligning the sequences to the known reference sequences of KHV (Gen Bank accession numbers AP008984, DQ657948 and DQ177346).
A halakból származó minták szállítása
The obtained clean consensus sequence must match at least to 98 % with those reference sequences.
Egész halak is szállíthatók a laboratóriumba, ha az e szakasz 3. pontjában ismertetett hőmérsékleti követelmények a szállítás során teljesíthetők.
DETAILED DIAGNOSTIC METHODS AND PROCEDURES FOR THE SURVEILLANCE AND CONFIRMATION OF INFECTIOUS SALMON ANEMIA (ISA)
Az egész halakat nedvszívó papírba kell csomagolni, és műanyag tasakban, az említett pontban foglaltaknak megfelelően hűtve kell szállítani.
I. Sampling procedures for the surveillance and control of ISA
Élő halak is szállíthatók, de csak a halbetegségekkel foglalkozó nemzeti referencialaboratórium felügyelete mellett és az élő halak szállításakor felmerülő további fertőtlenítési és biológiai biztonsági szempontok figyelembevételével.
When sampling and laboratory examination are carried out, for the purpose of the surveillance or eradication programmes set out in Part 3 of Annex I or to confirm or rule out the presence of ISA in accordance with Article 57(b) of Directive 2006/88/EC, the detailed methods and procedures set out in points I.1, I.2 and I.3 of this Section shall apply.
A vérmintákat és a halak virológiai vizsgálatra vagy RT-PCR-elemzésre szánt szöveteit tartalmazó csöveket szigetelt tartályokba, például vastag falú polisztirol-dobozokba kell helyezni, elegendő jéggel vagy jégakkuval ahhoz, hogy a laboratóriumig történő szállítás során a minták hűtése biztosítható legyen.
For the purpose of laboratory examination for the presence of ISA, fish samples shall not be pooled where possible.
A fagyasztás kerülendő, és átvételkor a szállítódobozban még lennie kell jégnek, illetve egy vagy több jégakkunak részben vagy egészen továbbra is fagyottnak kell lennie.
However, for the purpose of surveillance for ISA, the pooling of 2 to be 5 fish is accepted.
Kivételes körülmények között az RT-PCR elemzésre szánt minták és a virológiai vizsgálatra szánt minták gyorsfagyaszthatók, és – 20 °C vagy az alatti hőmérsékleten is a laboratóriumba szállíthatók.
Samples for Reverse Transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) analysis shall be taken from all of the fish sampled.
Az RT-PCR-elemzéshez RNAlater oldatban tartósított szövetek esetében az RNS kivonását a minták tárolási hőmérsékletétől függően az alábbi időn belül el kell végezni:
A piece of mid-kidney shall be removed from the fish using a sterile instrument and transferred to a microfuge tube containing one ml RNA preservative solution of proven efficacy.
20 °C-on tárolt minták: határozatlan idő.
Tissue from up to five fish may be collected in one tube of transport solution and shall represent one pooled sample.
Ha a halszöveteket fixálóban szállítják szövettani vizsgálatra, azokat ütésálló tartályokba helyezett szivárgásmentes csövekben kell szállítani.
The weight of tissue in one sample shall be 0,5 g.
E minták fagyasztása kerülendő.
When the fish are too small to obtain a sample of the required weight, pieces of kidney, heart, spleen, liver or pyloric caeca may be taken, in that order of preference, to make up 0,5 g.
A diagnosztikai laboratórium beleegyezésével kiegészítő vizsgálatok céljára az I.1. pontban említettől eltérő halszöveteket is lehet gyűjteni és elő lehet készíteni.
Tissue for histological examination shall only be taken from freshly killed fish with a normal constitution, exhibiting clinical signs or post-mortem findings consistent with the presence of ISA.
Az ISA felügyeletére, valamint jelenlétének megerősítésére vagy gyanújának kizárására szolgáló részletes diagnosztikai módszerek és eljárások
Any external or internal lesions shall be sampled and in any case samples of mid-kidney, heart, liver, pancreas, gut, gills and spleen shall be removed from individual fish using a scalpel and transferred to 8 % to 10 % (vol:vol) buffered formol saline.
Az ISA-ra vonatkozó bizonyos egészségügyi státusoknak az I. melléklet 3. része I. szakaszában meghatározott megszerzése vagy fenntartása céljából, illetve az ISA jelenlétének megerősítése vagy gyanújának kizárása céljából a 2006/88/EK irányelv 57. cikke b) pontja szerint – az I. melléklet 3. részének II. szakaszában foglalt diagnosztikai módszerekkel – végzett laboratóriumi vizsgálat során a II.1–II.5. pontban meghatározott részletes diagnosztikai módszerek és eljárások alkalmazandók.
The ratio of fixative to tissue shall be at least 20:1 to ensure satisfactory preservation of the tissues.
A minták vizsgálata RT-PCR módszerrel
For immunohistochemistry (IHC), samples from mid-kidney and heart shall be taken.
Az ISAV kiszűréséhez alkalmazandó diagnosztikai módszer az RT-qPCR.
Tissues for virological examination on cell culture shall be taken from all of the fish sampled.
Mivel az RT-qPCR eredményei a művelet elvégzésének körülményeitől függően változhatnak, a kétségek elkerülése érdekében megfelelő pozitív és negatív kontrollokat és amplikonokat is figyelembe kell venni.
Pieces of the liver, anterior or mid-kidney, heart and spleen shall be removed from the fish using a sterile instrument and transferred to plastic tubes containing 9 ml transport medium.
Az összes RNS kivonása
Tissues from up to five fish may be collected in one tube containing transport solution and represent one pooled sample.
Az összes RNS-t – a gyártó útmutatása szerint – a fenol-kloroform módszerrel vagy RNS-affinitásoszlopok segítségével kell kivonni.
The weight of tissue in one sample shall be 1,0 ± 0,5 g.
A tisztított RNS-t RNáz-mentes desztillált vízben (0,1 % dietil-pirokarbonáttal kezelt vízben) újra kell szuszpendálni.
Shipment of samples from fish
A kivont RNS koncentrációját és tisztaságát az optikai sűrűség 260 nm-en és 280 nm-en végzett mérésével kell megbecsülni.
Whole fish may be transported to the laboratory if the temperature requirements during transportation, as described in paragraph 3 of this point can be fulfilled.
Alternatív módszerként a II.1.3. pontban foglaltaknak megfelelően a vírusgenomot célzó belső kontrollok is alkalmazhatók.
Whole fish shall be wrapped in absorbent paper and shipped in a plastic bag, chilled as described in that paragraph.
Az ISAV kimutatására szolgáló RT-PCR
Live fish may also be shipped, but only under the supervision of the National reference laboratory for fish diseases and taking into account the additional disinfection and biosecurity issues when transporting live fish.
Az ISAV-genom amplifikálásához különféle RT-PCR módszerek alkalmazhatók.
Blood samples and tubes containing fish tissues for virological examination or RT-PCR analysis shall be placed in insulated containers, such as thick-walled polystyrene boxes, together with sufficient ice or freeze blocks to ensure chilling of the samples during transportation to the laboratory.
Végezhető kétlépcsős RT-PCR, amelynek során a reverz transzkriptáz és a polimeráz láncreakció lépcsőinek lefuttatása két különálló csőben történik.
Freezing shall be avoided and ice must still be present in the transport box at receipt of the shipment or one or more of the ‘freeze blocks’ must still be partly or completely frozen.
Végezhető azonban egylépcsős reakció is, amelynek során a két reakció lefuttatása egy csőben történik.
In exceptional circumstances, RT-PCR samples and samples for virological examination may be snap-frozen and transported to the laboratory at – 20 °C or below.
Lehetőség szerint az egylépcsős módszert kell alkalmazni, mivel az egycsöves próba minimálisra csökkenti a keresztfertőződés kockázatát, mivel a csövek tartalmát nem kell áthelyezni; ez a módszer ugyanolyan érzékenységűnek tekintendő, mint a kétlépcsős módszer.
For RT-PCR analysis of tissues preserved in Ribonucleic acid(RNA)later, RNA extraction shall be carried out within the following time frames depending on the temperature the samples are stored at:
Az e pontban ismertetett primereket és próbát, azaz a 8. szegmenst célzó, valamint az ISAV kitörésekor és a kórokozó-hordozó halakban történő kimutatására alkalmasnak talált ILA1, illetve ILA2 primerpárt kell alkalmazni.
samples stored at – 20 °C: indefinitely.
Az ILA2 reverz primer nem egyezik az észak-amerikai izolátumokkal; azokban az esetekben alternatív primerkészletet kell alkalmazni.
If fish tissues are transported in fixative for histological examination, they shall be shipped in leak proof tubes in impact-resistant containers.
reverz primer (ILA2): 5′-GCCAAGTGTAAGTAGCACTCC-3′.
Freezing of those samples shall be avoided.
Ciklusparaméterek: 1 ciklus 50 °C-on 30 percig, 1 ciklus 94 °C-on 15 percig, 40 ciklus 94 °C-on 30 másodpercig, 55 °C-on 30 másodpercig, 72 °C-on 60 másodpercig, 1 ciklus 72 °C-on 5 percig.
Subject to the approval of the diagnostic laboratory, fish tissues other than those referred to in point I.1 may be collected and prepared for supplementary examination.
A termék mérete 155 bp.
Detailed diagnostic methods and procedures for the surveillance and for the confirmation of the presence of or to rule out the suspicion of ISA
Ehelyett más, igazoltan hasonló hatékonyságú RT-PCR-változatok is alkalmazhatók.
When laboratory examination for the purpose of obtaining or maintaining a certain health status with regard to ISA as set out in Section I of Part 3 of Annex I, or for the purpose of the confirmation of the presence of or to rule out a suspicion of ISA in accordance with Article 57(b) of Directive 2006/88/EC, are carried out, using the diagnostic methods set out in Section II of Part 3 of Annex I, the detailed methods and procedures set out in the following points II.1 to II.5 shall apply.
Az ISAV kimutatására szolgáló RT-qPCR
Examination of samples by RT-PCR
Az RT-qPCR alkalmazása javíthatja a specifikusságot és adott esetben az érzékenységet is.
The diagnostic method to be used for the screening for ISAV shall be RT-qPCR.
E módszerrel a művelet gyorsabban elvégezhető, mivel nincs szükség gélelektroforézises lépésre, és a módszer csökkenti a keresztfertőződés kockázatát, mivel megbecsülhető a mintatartó csőben lévő vírusgenom-RNS mennyisége.
As the results of the RT-qPCR can vary depending on the conditions under which it is performed, adequate positive and negative controls and amplicons shall be included to avoid any doubts.
Az RT-qPCR próba hátránya, hogy az amplifikált termékek gyakran nem szekvenálhatók.