natgillin/translations-raw huggingface dataset:
Since cell viability is affected during freeze-drying, these are not suitable as standard controls for isolation or bioassay tests.
Mivel a sejtek életképességére hatással van a fagyasztásos szárítás, ezek nem alkalmasak standard kontrollnak az izolálási és a biológiai vizsgálatokhoz.
Formalin-fixed suspensions of R. solanacearum biovar 2 (strain NCPPB 4156 = PD 2762 = CFBP 3857) at 106 cells per ml as positive controls for serological tests.
A 2. biovariánsba tartozó R. solanacearum sejtek (NCPPB 4156 = PD 2762 = CFBP 3857 törzs) formalinnal fixált szuszpenziója 106 sejt/ml koncentrációban pozitív kontrollnak a szerológiai vizsgálatokhoz.
Preparation of positive and negative controls for the core screening tests PCR/IF and FISH
Pozitív és negatív kontrollok készítése az alapvető szűrővizsgálatokhoz: a PCR/IF- és a FISH-próbához
Produce a 48 hour culture of a virulent strain of R. solanacearum race3/biovar2 (e.g. strain NCPPB 4156 = PD 2762 = CFBP 3857) on basal SMSA medium and suspend in 10 mM phosphate buffer to obtain a cell density of approximately 2 × 108 cfu per ml.
Készítsünk 48 órás tenyészetet az R. solanacearum 3. rasszba/2. biovariánsba tartozó virulens törzséből (pl. NCPPB 4156 = PD 2762 = CFBP 3857 törzs) alap SMSA táptalajon, és szuszpendáljuk 10 mM fosztát-pufferben, hogy hozzávetőleg 2 × 108 cfu/ml sejtsűrűséget kapjunk.
This is usually obtained by a faintly turbid suspension equivalent to an optical density of 0,15 at 600 nm.
Ezt rendszerint kissé zavaros szuszpenzióval érjük el, amely 0,15-os optikai sűrűségnek felel meg 600 nm-nél.
Remove the heel end cores of 200 tubers taken from a white skin variety production known to be free from R. solanacearum.
Távolítsuk el a köldökrész egy darabját 200 burgonyagumóból, melyek egy fehér héjú fajta termesztéséből származnak, és ismeretes, hogy mentesek az R. solanacearum-tól.
Process the heel ends as usual and resuspend the pellet in 10 ml.
Dolgozzuk fel a köldökrészeket a szokásos módon, és szuszpendáljuk újra a pelletet 10 ml-ben.
Prepare 10 sterile 1,5 ml microvials with 900 µl of the resuspended pellet.
Készítsünk 10 steril 1,5 ml-es mikrocsövet 900 µl újraszuszpendált pellettel.
Transfer 100 µl of the suspension of R. solanacearum to the first microvial.
Vigyünk 100 µl R. solanacearum szuszpenziót az első mikrocsőbe.
Vortex.
Vortex-szel keverjük össze.
Establish decimal levels of contamination by further diluting in the next five microvials.
Hozzuk létre a fertőzés tizedes szintjeit további hígítással a következő öt mikrocsőben.
The six contaminated microvials will be used as positive controls.
A hat fertőzött mikrocsövet pozitív kontrollként fogjuk használni.
The four non-contaminated microvials will be used as negative controls.
A négy nem fertőzött mikrocsövet negatív kontrollként fogjuk használni.
Label the microvials accordingly.
Ennek megfelelően címkézzük meg a mikrocsöveket.
Prepare aliquots of 100 µl in sterile 1,5 ml microvials thus obtaining nine replicas of each control sample.
Készítsünk 100 µl aliquot térfogatokat steril 1,5 ml-es mikrocsövekben, így 9 ismétlést alakítva ki mindegyik kontrollmintából.
Store at –16 to –24 °C until use.
Tároljuk –16 és –24 °C között a felhasználásig.
The presence and quantification of R. solanacearum in the control samples should be first confirmed by IF.
Az R. solanacearum jelenlétét és kvantifikálását a kontrollmintákban először IF-próbával kell megerősíteni.
For the PCR test perform DNA extraction from positive and negative control samples with each series of test samples.
A PCR-próbához végezzünk DNS-kivonást a pozitív és a negatív kontrollmintákból minden egyes vizsgálatiminta-sorozat esetében.
For IF and FISH tests perform assays on positive and negative control samples with each series of test samples.
Az IF- és a FISH-próbákhoz végezzünk vizsgálatokat a pozitív és a negatív kontrollmintákon minden egyes vizsgálatiminta-sorozat.
For IF, FISH and PCR assays R. solanacearum must be detected in at least the 106 and 104 cells/ml of the positive controls and not in any of the negative controls.
Az IF-, a FISH- és a PCR-vizsgálatokhoz az R. solanacearum-ot legalább 106–104 sejt/ml koncentrációban kell kimutatni a pozitív kontrollokban, és a negatív kontrollok egyikében sem szabad, hogy kimutatható legyen.
Use as standard reference strain of R. solanacearum biovar 2 (race 3).
Használjuk az R. solanacearum 2. biovariánsba/3. rasszba tartozó referencia törzseként.
Potential cross-reacting strain in serological tests (IF and/or ELISA) with polyclonal antisera.
A szerológiai vizsgálatokban (IF és/vagy ELISA) a poliklonális antiszérummal potenciálisan keresztreakciót mutató törzs.
Strain from which PCR product can be amplified in some laboratories of a similar size to that expected using specific primers OLI-1 and Y-2 (see Appendix 6).
Olyan törzs, amelyből PCR-terméket lehet felerősíteni néhány laboratóriumban, melynek mérete hasonló az OLI-1 és Y-2 specifikus primerek használata esetén várhatóhoz (lásd a 6. függeléket).
Likely to cross-react in most tests but known to occur only on banana in Indonesia.
Valószínű, hogy a legtöbb vizsgálatban keresztreakciót mutat, de ismereteink szerint csak Indonéziában és csak banánon fordul elő.
General: Unopened sterilised buffers can be stored for up to one year
ÁLTALÁNOS: A felbontatlan sterilizált puffereket egy évig lehet tárolni.
Buffers for extraction procedure
Pufferek a kivonási eljáráshoz
Extraction buffer (50 mM phosphate buffer, pH 7,0)
Kivonó-puffer (50 mM foszfát-puffer, pH 7,0)
This buffer is used for extraction of the bacterium from plant tissues by homogenisation or shaking.
Ez a puffer szolgál a baktériumnak a növényi szövetekből homogenizálás vagy rázás útján történő kivonására.
(anhydrous)
(vízmentes)
Dissolve ingredients, check pH and sterilise by autoclaving at 121 °C for 15 min.
Oldjuk fel az összetevőket, ellenőrizzük a pH-t és sterilizáljuk autoklávban 121 °C-on 15 percig.
Additional components may be useful as follows:
Az alábbi kiegészítő összetevők hasznosak lehetnek:
Purpose
Rendeltetés
Quantity (per l)
Mennyiség (literenként)
Lubrol flakes
Lubrol-pelyhek
Deflocculant [501]
Diszpergálószer [501]
DC silicone antifoam
DC Silicone habzásgátló
Anti-foam agent [501]
Habzásgátló anyag [501]
Anti-oxidant
Antioxidáns
Binding of PCR inhibitors
PCR inhibitorok megkötése
Pellet buffer (10 mM phosphate buffer, pH 7,2)
Pellet-puffer (10 mM foszfát-puffer, pH 7,2)
This buffer is used for resuspension and dilution of potato tuber heel-end core extracts following concentration to a pellet by centrifugation.
Ez a puffer a burgonyagumók köldökrészéből vett darabok kivonatainak újraszuszpendálására és hígítására szolgál a pellet centrifugálással végzett koncentrálása után.
Dissolve ingredients, check pH and sterilise by autoclaving at 121 °C for 15 minutes.
Oldjuk fel az összetevőket, ellenőrizzük a pH-t, és sterilizáljuk autoklávban 121 °C-on 15 percig.
Buffers for the IF test
Pufferek az IF-próbához
IF-Buffer (10 mM phosphate buffered saline (PBS), pH 7.2)
IF-puffer (10 mM foszfát-pufferes sóoldat (PBS), pH 7,2)
This buffer is used for dilution of antibodies
Ez a puffer az ellenanyagok hígítására szolgál.
IF-buffer-Tween
IF-puffer-Tween
This buffer is used to wash slides.
Ez a puffer a lemezek mosására szolgál.
Add 0,1 % Tween 20 to the IF buffer.
Adjunk 0,1 % Tween 20-at az IF-pufferhez.
Phosphate buffered glycerol, pH 7,6
Foszfát-pufferes glicerin, pH 7,6
This buffer is used as a mountant fluid on the windows of IF slides to enhance fluorescence.
Ez a puffer »ragasztó« folyadékként szolgál az IF-lemezek ablakain a fluoreszcencia megnöveléséhez.
Anti-fading mountant solutions are commercially available e.g. Vectashield® (Vector Laboratories) or Citifluor® (Leica).
Az elhalványulás elleni »ragasztó« oldatok kereskedelmi forgalomban kaphatók pl. Vectashield® (Vector Laboratories) vagy Citifluor® (Leica).
Buffers for the Indirect ELISA test
Pufferek a közvetett ELISA-próbához
Double strength coating buffer, pH 9,6.
Kétszeres erősségű bevonó-puffer, pH 9,6.
Sodium sulphite (0.2 %) may be added as antioxidant if required to prevent build up of oxidised aromatic compounds.
Szükség esetén nátrium-szulfit (0,2 %) adható hozzá antioxidánsként az oxidált aromás vegyületek kialakulásának megakadályozására.
Phosphate buffered saline (PBS), pH 7,4
Foszfát-pufferes sóoldat (PBS), pH 7,4
Blocking (antibody) buffer (must be freshly prepared).
Blokkoló (ellenanyag) puffer (frissen kell készíteni)
Polyvinylpyrrolidone-44000 (PVP-44)
Polivinilpirolidon-44000 (PVP-44)
make up to 100 ml
egészítsük ki 100 ml-re
Alkaline phosphatase substrate solution, pH 9,8
Alkalikus foszfatáz szubsztrát oldat, pH 9,8
Diethanolamine
Dietanol-amin
Mix and adjust to pH 9,8 with concentrated HCl.
Keverjük össze, és állítsuk be pH 9,8-ra tömény HCl-lel.
Make up to 1 L with distilled water.
Egészítsük ki 1 literre desztillált vízzel.
Add 0,2 g MgCl2.
Adjunk hozzá 0,2 g MgCl2-ot.
Dissolve 2 phosphatase substrate 5 mg tablets (Sigma) per 15 ml of solution.
Oldjunk fel két 5 mg-os foszfatáz szubsztrát tablettát (Sigma) 15 ml oldathoz.
Buffers for DASI ELISA test
Pufferek a DASI ELISA-próbához
Coating buffer, pH 9,6
Bevonópuffer, pH 9,6
Dissolve ingredients and check pH 9,6
Oldjuk fel az összetevőket, és állítsuk be pH 9,6-ra.
Phosphate saline buffer(PBS) pH 7,2 to 7,4
Foszfát-sóoldat puffer (PBS) pH 7,2–7,4
Substrate buffer, pH 9,8
Szubsztrát-puffer, pH 9,8
For use with homogenisation extraction method
A homogenizálással végzett kivonási módszerhez.
Count the mean number of typical fluorescent cells per field of view (c).
Állapítsuk meg a jellemzően fluoreszkáló sejtek számának középértékét látómezőnként (c).
Calculate the number of typical fluorescent cells per microscope slide window (C).
Számítsuk ki a jellemzően fluoreszkáló sejtek számát mikroszkóplemez ablakonként (C).
surface area of window of multispot slide
az ablak területe a több mintahelyes lemezen
surface area of objective field
a tárgylencse látómezőjének területe
field coefficient (varies from 8 to 24 depending upon ocular type)
látómező koefficiens (az okulár típusától függően 8-24 között változik)
tube coefficient (1 or 1,25)
cső koefficiens (1 vagy 1,25)
magnification of objective (100 ×, 40 × etc.).
a tárgylencse nagyítása (100x, 40x stb.)
Calculate the number of typical fluorescent cells per ml of re-suspended pellet (N).
Számítsuk ki a jellemzően fluoreszkáló sejtek számát 1 ml újraszuszpendált pelletben (N).
volume of re-suspended pellet on each window
az újraszuszpendált pellet térfogata az egyes ablakokban
dilution factor of re-suspended pellet.
az újraszuszpendált pellet hígítási-tényezője
Preliminary testing should permit reproducible detection of 103 to 104 cells of R. solanacearum per ml of sample extract.
Megjegyzés:Az előzetes vizsgálatnak lehetővé kell tennie 103–104/ml R. solanacearum sejt reprodukálható kimutatását a mintakivonatban.
Preliminary testing should also show no false positive results with a panel of selected bacterial strains (see Appendix 3).
Az előzetes vizsgálat nem mutathat hamis pozitív eredményeket a kiválasztott baktériumtörzsek esetében (lásd a 3. függeléket).
PCR protocol of Seal et al.
Seal et al.
Oligonucleotide primers
Oligonukleotid primerek:
Forward primer OLI-1
OLI-1 előre haladó primer
Reverse primer Y-2
Y-2 fordított primer
Expected amplicon size from R. solanacearum template DNA = 288 bp
Várható fragmentum méret az R. solanacearum DNS templátból = 288 bp.
PCR reaction mix
PCR reakcióelegy
Quantity per reaction
Mennyiség reakciónként
Sterile UPW
Steril UPW
PCR buffer [701] (15 mM MgCl2)
PCR-puffer [701] (15 mM MgCl2)
dNTP mix (20 mM)
dNTP elegy (20 mM)
Taq polymerase (5U/µl) [701]
Taq polimeráz (5 U/µl) [701]
Sample volume
A minta térfogata
Total volume
Össztérfogat:
PCR reaction conditions
A PCR-reakció feltételei
Run the following programme:
Futtassuk a következő programot:
1 cycle of:
1 ciklusban:
2 minutes at 96 °C (denaturation of template DNA)
2 percig 96 °C-on (DNS templát denaturálása)
35 cycles of:
35 ciklusban:
20 seconds at 94 °C (denaturation of template DNA)
20 másodpercig 94 °C-on (DNS templát denaturálása)
20 seconds at 68 °C (annealing of primers)
20 másodpercig 68 °C-on (primerek temperálása)
30 seconds at 72 °C (extension of copy)
30 másodpercig 72 °C-on (másolat meghosszabbítása)
10 minutes at 72 °C (final extension)
10 percig 72 °C-on (végső meghosszabbítás)
hold at 4 °C.
tartsuk 4 °C-on.
This programme was optimised for use with a Perkin Elmer 9600 thermal cycler.
Megjegyzés: Ezt a programot a Perkin Elmer 9600 thermal cycler-re optimalizálták.
Modification of the duration steps of cycles (ii), (iii) and (iv) may be required for use with other models.
Más modellek használata szükségessé teheti a ii), iii) és iv) cikluslépések időtartamának megváltoztatását.
Restriction enzyme analysis of amplicon.
A fragmentum restrikciós enzim elemzése
PCR products amplified from R. solanacearum DNA produce a distinctive restriction fragment length polymorphism with enzyme Ava II after incubation at 37 °C.
Az R. solanacearum DNS-ből felerősített PCR-termékek jellegzetes restrikciós fragmentumhossz polimorfizmust mutatnak Ava II enzimmel 37 °C-on végzett inkubálás után.
PCR protocol of Pastrik and Maiss (2000)
Pastrik és Maiss (2000) PCR-protokolja
Forward primer Ps-1
Ps-1 előre haladó primer
Reverse primer Ps-2
Ps-2 fordított primer
Expected amplicon size from R. solanacearum template DNA = 553 bp.
Várható fragmentum méret az R. solanacearum DNS templátból = 553 bp.
Originally optimised for MJ Research PTC 200 thermocycler with Gibco Taq Polymerase.
Megjegyzés: Eredetileg MJ Research PTC 200 thermocycler-re optimalizálták Gibco Taq polimerázzal.
Perkin Elmer AmpliTaq and buffer can also be used at the same concentrations.
A Perkin Elmer AmpliTaq és a puffer alkalmazható azonos koncentrációban.
PCR buffer [702]
PCR puffer [702]
BSA (fraction V) (10 %)
BSA (V. frakció) (10 %)
d-nTP mix (20 mM)
d-nTP elegy (20 mM)
Taq polymerase (5U/µl) [702]
Taq polimeráz (5U/µl) [702]
Total volume:
Össztérfogat:
5 minutes at 95 °C (denaturation of template DNA)
5 percig 95 °C-on (DNS templát denaturálása)
30 seconds at 95 °C (denaturation of template DNA)
30 másodpercig 95 °C-on (DNS templát denaturálása)
30 seconds at 68 °C (annealing of primers)
30 másodpercig 68 °C-on (primerek temperálása)
45 seconds at 72 °C (extension of copy)
45 másodpercig 72 °C-on (másolat meghosszabbítása)
5 minutes at 72 °C (final extension)
5 percig 72 °C-on (végső meghosszabbítás)
This programme is optimised for use with an MJ Research PTC 200 thermal cycler.
Megjegyzés: Ezt a programot MJ Research PTC 200 thermal cycler-re optimalizálták.
PCR products amplified from R. solanacearum DNA produce a distinctive restriction fragment length polymorphism with enzyme Taq I after incubation at 65 °C for 30 minutes.
Az R. solanacearum DNS-ből felerősített PCR-termékek jellegzetes restrikciós fragmentumhossz polimorfizmust mutatnak Taq I enzimmel 65 °C-on 30 percig végzett inkubálás után.
The restriction fragments obtained from R. solanacearum-specific fragment are 457 bp and 96 bp in size.
Az R. solanacearum-specifikus fragmentumból nyert restrikciós fragmentumok mérete 457 bp és 96 bp.
Multiplex PCR protocol with internal PCR control (Pastrik et al., 2002)
Multiplex PCR-protokoll belső PCR-ellenőrzéssel (Pastrik et al., 2002)
Forward primer RS-1-F
RS-1-F előre haladó primer
Reverse primer RS-1-R
RS-1-R fordított primer
Forward primer NS-5-F
NS-5-F előre haladó primer
Reverse primer NS-6-R
NS-6-R fordított primer
Expected amplicon size from R. solanacearum template DNA = 718 bp (RS-primer set)
Várható fragmentum méret az R. solanacearum DNS templátból = 718 bp (RS-primer készlet).
Expected amplicon size from the 18S rRNA internal PCR control = 310 bp (NS-primer set).
Várható fragmentum méret a 18S rRNS belső PCR ellenőrzésből = 310 bp (NS-primer készlet).
PCR buffer [703] (15 mM MgCl2)
PCR-puffer [703] (15 mM MgCl2)
Primer RS-1-F (10 µM)
RS-1-F primer (10 µM)
Primer RS-1-R (10 µM)
RS-1-R primer (10 µM)
Primer NS-5-F (10 µM) [704]
NS-5-F primer (10 µM) [704]
Primer NS-6-R (10 µM) [704]
NS-6-R primer (10 µM) [704]
Taq polymerase (5 U/µl) [703]
Taq polimeráz (5 U/µl) [703]
30 seconds at 58 °C (annealing of primers)
30 másodpercig 58 °C-on (primerek temperálása)
PCR products amplified from R. solanacearum DNA produce a distinctive restriction fragment length polymorphism with enzyme Bsm I or an Isoschizomere (e.g. Mva 1269 I) after incubation at 65 °C for 30 minutes.
Az R. solanacearum DNS-ből felerősített PCR-termékek jellegzetes restrikciós fragmentumhossz polimorfizmust mutatnak Bsm I enzimmel vagy egy izoschizomerrel (pl. Mva 1269 I) 65 °C-on 30 percig végzett inkubálás után.
solanacearum biovar-specific PCR protocol (Pastrik et al., 2001)
solanacearum-biovariáns-specifikus PCR-protokoll (Pastrik et al, 2001)
Forward primer Rs-1-F
Rs-1-F előre haladó primer
Reverse primer Rs-1-R
Rs-1-R fordított primer
Reverse primer Rs-3-R
Rs-3-R fordított primer
Expected amplicon size from R. solanacearum template DNA:
A várható fragmentum méret az R. solanacearum DNS templátból:
with Rs-1-F/Rs-1-R = 718 bp
Rs-1-F/Rs-1-R esetén = 718 bp
with Rs-1-F/Rs-3-R = 716 bp.
Rs-1-F/Rs-3-R esetén = 716 bp
Biovar 1/2-specific PCR
1./2. biovariánsra specifikus PCR
PCR Buffer [705]
PCR-puffer [705]
d-NTP mix (20mM)
d-NTP elegy (20mM)
Taq polymerase (5U/µl) [705]
Taq polimeráz (5 U/µl) [705]
Biovar 3/4/5-specific PCR
3./4./5. biovariánsra specifikus PCR
PCR Buffer [706]
PCR-puffer [706]
Taq polymerase (5 U/µl) [706]
Taq polimeráz (5 U/µl) [706]
Run the following programme for both biovar 1/2- and biovar 3/4/5-specific reactions:
Futtassuk a következő programot az 1./2. biovariánsra- és a 3./4./5. biovariánsra specifikus reakcióknál egyaránt:
This programme was optimised for use with an MJ Research PTC 200 thermal cycler.
Megjegyzés: Ezt a programot az MJ Research PTC 200 thermal cycler-re optimalizálták.
PCR products amplified from R. solanacearum DNA using primers Rs-1-F and Rs-1-R produce a distinctive restriction fragment length polymorphism with enzyme Bsm I or an Isoschizomere (e.g. Mva 1269 I) after incubation at 65 °C for 30 minutes.
Az R. solanacearum DNS-ből Rs-1-F és Rs-1-R primerek felhasználásával felerősített PCR-termékek jellegzetes restrikciós fragmentumhossz polimorfizmust mutatnak Bsm I enzimmel vagy egy izoschizomerrel (pl. Mva 1269 I) 65 °C-on 30 percig végzett inkubálás után.
PCR products amplified from R. solanacearum DNA using primers Rs-1-F and Rs-3-R have no restriction sites.
Az R. solanacearum DNS-ből Rs-1-F és Rs-3-R primerek felhasználásával felerősített PCR-termékek nem rendelkeznek restrikciós helyekkel.
Preparation of the loading buffer
A betöltő puffer elkészítés
Bromphenol blue (10 %-stock solution)
Brómfenol kék (10 %-os törzsoldat)
Bromphenol blue
Brómfenol kék
Distilled water (bidest)
Desztillált víz (bidest)
Loading buffer
Betöltő puffer
Bromphenol blue (5,1)
Brómfenol kék (5.1)
Distilled Water (bidest)
Desztillált víz (bidest)
Tris Acetate EDTA (TAE) buffer, pH 8.0
Tris-acetát-EDTA (TAE) puffer, pH 8,0
Tris buffer
Tris puffer
Glacial acetic acid
Jégecet
Dilute to 1X before use.
Hígítsuk 1x-re használat előtt.
Also commercially available (e.g. Invitrogen or equivalent).
Kereskedelmi forgalomban is kapható (pl. Invitrogen vagy azzal egyenértékű).
Method was validated using Taq polymerase from Perkin Elmer (AmpliTaq) and Gibco BRL.
A módszer validálását Taq polimeráz felhasználásával végezték (Perkin Elmer (AmpliTaq) és Gibco BRL).
Methods were validated using Taq polymerase from Perkin Elmer (AmpliTaq) and Gibco BRL.
A módszereket Taq polimeráz felhasználásával validálták (Perkin Elmer (AmpliTaq) és Gibco BRL).
Concentration of primers NS-5-F and NS-6-R were optimised for potato heel end core extraction using the homogenisation method and DNA purification according to Pastrik (2000) (see Section VI.A.6.1.a.).
Az NS-5-F és az NS-6-R primerek koncentrációját a burgonyagumó köldökrészéből vett darab homogenizációs módszerrel végzett extrakciójára és a Pastrik-féle DNS-tisztításra (2000) optimalizálták (lásd a VI.A.6.1.a. szakaszt).
Re-optimisation of reagent concentrations will be required if extraction by shaking or other DNA isolation methods are used.
A reagens koncentrációk újraoptimalizálására lesz szükség rázással végzett extrakció vagy eltérő DNS-izolálási módszerek használata esetén.
Methods have been validated using Taq polymerase from Perkin Elmer (AmpliTaq) and Gibco BRL.
A módszereket Taq polimeráz felhasználásával validálták (Perkin Elmer (AmpliTaq) és Gibco BRL).
Oligo-probes
Oligo-szondák
solanacearum-specific probe OLI-1-CY3: 5′-ggc agg tag caa gct acc ccc-3′
OLI-1-CY3 R. solanacearum-specifikus szonda: 5′-ggc agg tag caa gct acc ccc-3′
Non-specific eubacterial probe EUB-338-FITC: 5′-gct gcc tcc cgt agg agt-3′
EUB-338-FITC nem-specifikus eubaktérium szonda: 5′-gct gcc tcc cgt agg agt-3′
Fixative solution
Fixáló oldat
WEAR GLOVES AND DO NOT INHALE.
HASZNÁLJON KESZTYŰT, ÉS NE LÉLEGEZZE BE.
IT IS ADVISABLE TO WORK IN A FUME CUPBOARD.)
TANÁCSOS VEGYIFÜLKÉBEN DOLGOZNI.]
Heat 9 ml molecular grade water (e.g. Ultra pure water (UPW)) to about 60 °C and add 0,4 g paraformaldehyde.
i. Melegítsünk 9 ml molekuláris fokozatú vizet (pl. Ultra tiszta vizet (UPW)) körülbelül 60 °C-ra, és adjunk hozzá 0,4 g paraformaldehidet.
Paraformaldehyde dissolves after adding 5 drops of 1N NaOH and stirring with a magnetic stirrer.
A paraformaldehid feloldódik 5 csepp 1N NaOH hozzáadása és mágneses keverőbottal végzett keverés után.
Adjust pH to 7.0 by addition of 1ml of 0,1M phosphate buffer (PB; pH 7,0) and 5 drops of 1N HCl.
Állítsuk be a pH-t 7,0-ra 1ml 0,1M foszfát-puffer (PB; pH 7,0) és 5 csepp 1N HCl hozzáadásával.
Check pH with indicator strips and adjust if necessary with HCl or NaOH.
Ellenőrizzük a pH-t indikátorpapírral, és szükség esetén állítsuk be HCl-lel vagy NaOH-val.
Filter the solution through a 0,22 µm membrane filter and keep dust-free at 4 °C until further use.
Szűrjük át az oldatot 0,22 µm membránszűrőn, és pormentesen 4 °C-on a további használatig.
EDTA (filter sterilised and autoclaved)
EDTA (szűréssel sterilizált és autoklávozott)
Dilute to 1X as required.
Hígítsuk 1x-re szükség szerint.
Hybridisation solution
Hibridizációs oldat
Sodium dodecyl sulphate (SDS)
Nátrium-dodecil szulfát (SDS)
Formamide
Formamid
probe EUB 338
EUB 338 szonda
probe OLI-1 or OLI-2
OLI-1 vagy OLI-2 szonda
Prepare quantities of hybridisation solution according to the calculations in Table 1.
Készítsünk nagyobb mennyiséget a hibridizációs oldatból az 1. táblázatban megadott értékek szerint.
For each slide (containing 2 different samples in duplicate) 90 μl hybridisation solution is required.
Mindegyik lemezhez (melyek 2 különböző mintát tartalmaznak, és azok másolatait) 90 μl hibridizációs oldatra van szükség.
IMPORTANT: FORMAMIDE IS VERY TOXIC SO WEAR GLOVES AND TAKE NECESSARY SAFETY PRECAUTIONS!
FONTOS: A FORMAMID NAGYON MÉRGEZŐ, EZÉRT VISELJEN KESZTYŰT, ÉS TEGYE MEG A SZÜKSÉGES ÓVINTÉZKEDÉSEKET!
Table 1 Suggested quantities for preparation of hybridisation mix
táblázat A hibridizációs elegy elkészítéséhez javasolt mennyiségek
Store all solutions containing light sensitive oligo-probes in the dark at –20 °C.
Megjegyzés: A fényérzékeny oligo-szondákat tartalmazó oldatokat tároljuk sötétben –20 °C-on.
Protect from direct sunlight or electric light during use.
Óvjuk a közvetlen napfénytől és a mesterséges fénytől a használat során.
Number of slides:
A lemezek száma:
Probe EUB 338 (100 ng/μl)
EUB 338 szonda (100 ng/μl)
Probe OLI-1 or OLI-2 (100 ng/μl)
OLI-1 vagy OLI-2 szonda (100 ng/μl)
Total volume (μl)
Össztérfogat (μl)
0,1M Phosphate buffer, pH 7,0
0,1 M Foszfát-puffer, pH 7,0
Eggplant and tomato culture
A padlizsán és a paradicsom termesztése
Sow seeds of tomato (Lycopersicon esculentum) or eggplant (Solanum melongena) in pasteurised seed compost.
Vessünk el paradicsom (Lycopersicon esculentum) vagy padlizsán (Solanum melongena) vetőmagját pasztörizált vetőmag elvetésénél használt komposztba.
Transplant seedlings with fully expanded cotyledons (10 to 14 days) into pasteurised potting compost.
Ültessük át a teljesen szétnyílt sziklevelekkel rendelkező palántákat (10–14 nap) pasztörizált tenyészedénybe való ültetésnél használt komposztba.