natgillin/translations-raw huggingface dataset:
the increase is dose-related when evaluated with an appropriate trend test,
Povećanje broja stanica s endoredupliciranim kromosomima može značiti da ispitivana kemikalije može inhibirati progresiju staničnog ciklusa (53. i 54.) (vidjeti stavak 2.).
any of the results are outside the distribution of the historical negative control data (e.g. Poisson-based 95 % control limits; see paragraph 39).
Stoga bi pojavnost poliploidnih stanica i stanica s endoredupliciranim kromosomima trebalo bilježiti odvojeno.
When all of these criteria are met, the test chemical is then considered able to induce chromosomal aberrations in cultured mammalian cells in this test system.
izvor, broj serije, rok uporabe, ako su dostupni,
Recommendations for the most appropriate statistical methods can be found in the literature (49) (50) (51).
stabilnost ispitivane kemikalije, ako je poznata,
Providing that all acceptability criteria are fulfilled, a test chemical is considered clearly negative if, in all experimental conditions examined (see paragraph 28):
topljivost i stabilnost ispitivane kemikalije u otapalu ako su poznate,
none of the test concentrations exhibits a statistically significant increase compared with the concurrent negative control,
ako je to potrebno, mjerenja pH vrijednosti, osmolalnosti i taloga u hranjivoj podlozi za uzgoj kultura kojoj je dodana ispitivana kemikalija.
there is no concentration-related increase when evaluated with an appropriate trend test,
tvar s jednim sastojkom:
all results are inside the distribution of the historical negative control data (e.g. Poisson-based 95 % control limits; see paragraph 39).
fizički izgled, topljivost u vodi i druga relevantna fizikalno-kemijska svojstva,
The test chemical is then considered unable to induce chromosomal aberrations in cultured mammalian cells in this test system.
podaci za kemijsku identifikaciju tvari, kao što su IUPAC ili CAS naziv, CAS broj, oznaka SMILES ili InChI, strukturna formula, čistoća, kemijski identitet nečistoća prema potrebi i ako je praktički izvedivo itd.,
There is no requirement for verification of a clearly positive or negative response.
tvar s više sastojaka, tvar nepoznatog ili promjenjivog sastava, složeni reakcijski proizvod ili biološki materijal (UVCB tvar) ili smjesa:
In case the response is neither clearly negative nor clearly positive as described above or in order to assist in establishing the biological relevance of a result, the data should be evaluated by expert judgement and/or further investigations.
opis (koliko je to moguće) kemijskog identiteta (vidjeti gore), kvantitativni udio i relevantna fizikalno-kemijska svojstva sastojaka.
Scoring additional cells (where appropriate) or performing a repeat experiment possibly using modified experimental conditions (e.g. concentration spacing, other metabolic activation conditions (i.e. S9 concentration or S9 origin)) could be useful.
Otapalo:
In rare cases, even after further investigations, the data set will preclude making a conclusion of positive or negative results, and therefore the test chemical response will be concluded to be equivocal.
opravdanost izbora otapala,
An increase in the number of polyploid cells may indicate that the test chemicals have the potential to inhibit mitotic processes and to induce numerical chromosomal aberrations (52).
trebalo bi navesti i postotak otapala u konačnoj hranjivoj podlozi za uzgoj kultura.
An increase in the number of cells with endoreduplicated chromosomes may indicate that the test chemicals have the potential to inhibit cell cycle progress (53) (54) (see paragraph 2).
Stanice:
Therefore, incidence of polyploid cells and cells with endoreduplicated chromosomes should be recorded separately.
vrsta i izvor stanica,
source, lot number, limit date for use, if available
kariotipna svojstva i prikladnost upotrijebljene vrste stanica,
stability of the test chemical itself, if known;
nepostojanje mikoplazme u slučaju staničnih linija,
solubility and stability of the test chemical in solvent, if known.
za stanične linije, informacije o trajanju staničnog ciklusa, vremenu udvostručavanja ili indeksu proliferacije,
measurement of pH, osmolality and precipitate in the culture medium to which the test chemical was added, as appropriate.
spol donora krvi, dob donora i sve relevantne informacije o donoru, puna krv ili izdvojeni limfociti, upotrijebljeni mitogen,
Mono-constituent substance:
ako je dostupan, broj pasaža za stanične linije,
physical appearance, water solubility, and additional relevant physicochemical properties;
metode održavanja staničnih kultura za stanične linije,
chemical identification, such as IUPAC or CAS name, CAS number, SMILES or InChI code, structural formula, purity, chemical identity of impurities as appropriate and practically feasible, etc.
modalni broj kromosoma za stanične linije.
Multi-constituent substance, UVCBs and mixtures:
Ispitni uvjeti:
characterised as far as possible by chemical identity (see above), quantitative occurrence and relevant physicochemical properties of the constituents.
identitet kemikalije za zaustavljanje metafaze, njezina koncentracija i trajanje izlaganja stanica,
Solvent:
koncentracija ispitivane kemikalije izražena kao konačna koncentracija u hranjivoj podlozi za uzgoj kultura (npr. μg ili mg/mL ili mM podloge za uzgoj kultura),
justification for choice of solvent.
obrazloženje za odabir koncentracija i broja kultura, uključujući npr. podatke o citotoksičnosti i granice topljivosti,
percentage of solvent in the final culture medium should also be indicated.
sastav podloge, koncentracija CO2 ako je to primjenjivo, razina vlažnosti,
Cells:
koncentracija (i/ili volumen) otapala i ispitivane kemikalije koji su dodani hranjivoj podlozi za uzgoj kultura,
type and source of cells
temperatura inkubacije,
karyotype features and suitability of the cell type used;
vrijeme inkubacije,
absence of mycoplasma, for cell lines;
trajanje tretiranja,
for cell lines, information on cell cycle length, doubling time or proliferation index;
izdvajanje nakon tretiranja,
sex of blood donors, age and any relevant information on the donor, whole blood or separated lymphocytes, mitogen used;
gustoća stanica kod nasađivanja, ako je to primjenjivo,
number of passages, if available, for cell lines;
vrsta i sastav sustava metaboličke aktivacije (izvor S9, metoda pripreme S9 smjese, koncentracija ili volumen S9 smjese i S9 u konačnoj hranjivoj podlozi za uzgoj kultura, kontrole kvalitete S9),
methods for maintenance of cell cultures, for cell lines;
kemikalije pozitivne i negativne kontrole, konačne koncentracije za svaki od uvjeta tretiranja,
modal number of chromosomes, for cell lines.
metode pripreme predmetnih stakalaca i upotrijebljene tehnike bojenja,
Test conditions:
kriteriji prihvatljivosti analiza,
identity of the metaphase-arresting chemical, its concentration and duration of cell exposure;
kriteriji vrednovanja aberacija,
concentration of test chemical expressed as final concentration in the culture medium (e.g. μg or mg/mL or mM of culture medium).
broj analiziranih metafaza,
rationale for selection of concentrations and number of cultures including, e.g. cytotoxicity data and solubility limitations;
metode mjerenja citotoksičnosti,
composition of media, CO2 concentration if applicable, humidity level;
sve dodatne informacije koje se odnose na citotoksičnost i upotrijebljenu metodu,
concentration (and/or volume) of solvent and test chemical added in the culture medium;
kriteriji prema kojima se istraživanje smatra pozitivnim, negativnim ili dvosmislenim,
incubation temperature;
metode upotrijebljene za određivanje pH-vrijednosti, osmolalnosti i taloženja.
incubation time;
broj tretiranih stanica i broj izdvojenih stanica za svaku kulturu ako se upotrebljavaju stanične linije,
duration of treatment;
mjerenja citotoksičnosti, npr.
harvest time after treatment;
RPD, RICC, mitotski indeks, druga potencijalna zapažanja,
cell density at seeding, if appropriate;
informacije o trajanju staničnog ciklusa, vremenu udvostručavanja ili indeksu proliferacije u slučaju staničnih linija,
type and composition of metabolic activation system (source of S9, method of preparation of the S9 mix, the concentration or volume of S9 mix and S9 in the final culture medium, quality controls of S9);
znakovi taloženja i vrijeme utvrđivanja,
positive and negative control chemicals, final concentrations for each conditions of treatment;
definicija aberacija, uključujući kromosomske prekide,
methods of slide preparation and staining technique used;
broj pregledanih stanica, broj stanica s kromosomskim aberacijama i tip kromosomskih aberacija navedeni odvojeno za svaku tretiranu i kontrolnu kulturu, uključujući i isključujući prekide,
criteria for acceptability of assays;
promjene ploidije (poliploidne stanice i stanice s endoredupliciranim kromosomima navedene odvojeno), ako je zapažena,
criteria for scoring aberrations;
odnos koncentracije i odgovora, ako je moguće,
number of metaphases analysed;
podaci o istodobnim negativnim kontrolama (otapalo) i pozitivnim kontrolama (koncentracije i otapala),
methods for the measurements of cytotoxicity;
podaci o prijašnjim negativnim (otapalo) i pozitivnim kontrolama s rasponima, srednjim izmjerenim vrijednostima i standardnim odstupanjima te kontrolnim granicama od 95 % za distribuciju, kao i broj podataka,
any supplementary information relevant to cytotoxicity and method used;
statističke analize, potencijalne p-vrijednosti.
criteria for considering studies as positive, negative or equivocal;
Rasprava o rezultatima.
methods used to determine pH, osmolality and precipitation.
Zaključci.
the number of cells treated and the number of cells harvested for each culture when cell lines are used
Overview of the set of OECD Genetic Toxicology Test Guidelines and updates performed in 2014-2015.
cytotoxicity measurements, e.g. RPD, RICC, MI, other observations if any;
ENV Publications.
information on cell cycle length, doubling time or proliferation index in case of cell lines;
Series on Testing and Assessment, No.
signs of precipitation and time of the determination;
234, OECD, Paris.
definition for aberrations, including gaps;
, ‚Cytological Methods for Detecting Chemical Mutagens’, u Chemical Mutagens, Principles and Methods for their Detection, Vol.
Number of cells scored, number of cells with chromosomal aberrations and type of chromosomal aberrations given separately for each treated and control culture, including and excluding gaps;
4, Hollaender, A. (ed.), Plenum Press, New York and London, str. 1. – 29.
changes in ploidy (polyploid cells and cells with endoreduplicated chromosomes, given separately) if seen;
Ishidate, M. Jr., T. Sofuni (1985), ‚The in vitro Chromosomal Aberration Test Using Chinese Hamster Lung (CHL) Fibroblast Cells in Culture’ u Progress in Mutation Research, Vol.
concentration-response relationship, where possible;
5, Ashby, J. et al. (eds.), Elsevier Science Publishers, Amsterdam – New York – Oxford, str. 427.
statistical analyses, p-values if any.
McCooey (1982), ‚CHO/HGPRT Mutation Assay: Evaluation of Gases and Volatile Liquids’, u Genotoxic Effects of Airborne Agents, Tice, R.R., D.L.
Overview of the set of OECD Genetic Toxicology Test Guidelines and updates performed in 2014-2015.
U: Statistical Evaluation of Mutagenicity Test Data, Kirkland, D.J.
ENV Publications.
(ed.)
, “Cytological Methods for Detecting Chemical Mutagens”, in Chemical Mutagens, Principles and Methods for their Detection, Vol.
Dostupno na zahtjev.
4, Hollaender, A. (ed.), Plenum Press, New York and London, pp. 1-29
Dostupno na: https://federalregister.gov/a/2012-13774.
Ishidate, M. Jr., T. Sofuni (1985), “The in vitro Chromosomal Aberration Test Using Chinese Hamster Lung (CHL) Fibroblast Cells in Culture” in Progress in Mutation Research, Vol.
OECD (2014), ‚Statistical analysis supporting the revision of the genotoxicity Test Guidelines, OECD Environment, Health and Safety Publications (EHS)’, Series on Testing and Assessment, No. 198, OECD Publishing, Paris.
5, Ashby, J. et al.
(ed.), Cambridge University Press, Cambridge, str. 62. – 86.
(eds.), Elsevier Science Publishers, Amsterdam-New York- Oxford, pp. 427-432.
(ed.), Cambridge University Press, Cambridge, str. 141. – 154.
, “Improving dose selection and identification of aneugens in the in vitro chromosome aberration test by integration of flow cytometry-based methods”, Environmental and Molecular Mutagenesis, Vol.
Dodatak 1.
Chapter B.49 of this Annex: In Vitro Mammalian Cell Micronucleus Test.
Aneuploidija
(eds.), Elsevier, North-Holland, pp. 85-88.
Apoptoza
Available at: http://www.pops.int/.
programirana smrt stanice koju obilježava niz koraka koji vode do razgradnje stanica u čestice vezane na membranu koje se potom eliminiraju fagocitozom ili rasipanjem.
McCooey (1982), “CHO/HGPRT Mutation Assay: Evaluation of Gases and Volatile Liquids”, in Genotoxic Effects of Airborne Agents, Tice, R.R., D.L.
Proliferacija stanica
Costa, K.M.
povećanje broja stanica kao posljedica mitotske diobe stanice.
Schaich (eds.), Plenum, New York, pp. 91-103.
tvar ili smjesa.
In: Statistical Evaluation of Mutagenicity Test Data, Kirkland, D.J.
Kromatidni lom
(ed.)
prestanak pojedinačne kromatide u kojoj postoji jasan otklon jedne od kromatida.
Cambridge University Press, Cambridge, pp. 141-154.
Kromatidni prekid
Available upon request.
neobojeno područje (akromatska lezija) jedne kromatide u kojoj postoji minimalan otklon kromatide.
Available at: https://federalregister.gov/a/2012-13774.
Aberacija kromatidnog tipa
OECD (2014), “Statistical analysis supporting the revision of the genotoxicity Test Guidelines, OECD Environment, Health and Safety Publications (EHS)”, Series on Testing and Assessment, No. 198, OECD Publishing, Paris.
strukturno oštećenje kromosoma izraženo kao lom pojedinačnih kromatida ili lom i ponovno spajanje kromatida.
, “Metaphase chromosome aberration assays in vitro”, in Basic Mutagenicity Tests: UKEMS Recommended Procedures, Kirkland, D.J.
Aberacija kromosomskog tipa
(ed.), Cambridge University Press, Cambridge, pp. 62-86.
strukturno oštećenje kromosoma izraženo kao lom ili lom i ponovno spajanje obiju kromatida na istom mjestu.
, “Analysis of Data from In Vitro Cytogenetic Assays”, in Statistical Evaluation of Mutagenicity Test Data, Kirkland, D.J.
Klastogen
(ed.), Cambridge University Press, Cambridge, pp. 141-154.
svaka kemikalija koja uzrokuje strukturne kromosomske aberacije u populacijama stanica ili eukariotskih organizama.
Appendix 1
Koncentracije
DEFINITIONS
odnosi se na konačne koncentracije ispitivane kemikalije u hranjivoj podlozi za uzgoj kultura.
Aneuploidy
Citotoksičnost
any deviation from the normal diploid (or haploid) number of chromosomes by a single chromosome or more than one, but not by entire set(s) of chromosomes (polyploidy).
Endoreduplikacija
Apoptosis
proces kod kojeg nakon S-faze replikacije DNK ne slijedi mitoza jezgre, nego započinje druga S-faza.
programmed cell death characterised by a series of steps leading to a disintegration of cells into membrane-bound particles that are then eliminated by phagocytosis or by shedding.
Rezultat su kromosomi s 4, 8, 16... kromatida.
Cell proliferation
Genotoksičnost
increase in cell number as a result of mitotic cell division.
opći izraz kojim su obuhvaćene sve vrste oštećenja DNK ili kromosoma uključujući lomove, delecije, adukte, modifikacije i povezivanje nukleotida, premještanja, genske mutacije, aberacije kromosoma i aneuploidiju.
Chromatid break
Mitotski indeks
discontinuity of a single chromatid in which there is a clear misalignment of one of the chromatids.
omjer stanica u metafazi podijeljen s ukupnim brojem stanica zapaženih u populaciji stanica; pokazatelj stupnja proliferacije te populacije.
Chromatid gap
Mitoza
non-staining region (achromatic lesion) of a single chromatid in which there is minimal misalignment of the chromatid.
dioba stanične jezgre koja je obično podijeljena na profazu, prometafazu, metafazu, anafazu i telofazu.
Chromatid-type aberration
Mutagen
structural chromosome damage expressed as breakage of single chromatids or breakage and reunion between chromatids.
uzrokuje nasljednu promjenu slijeda (slijedova) parova baza DNK u genima ili strukture kromosoma (kromosomske aberacije).
Chromosome-type aberration
Numerička aberacija
structural chromosome damage expressed as breakage, or breakage and reunion, of both chromatids at an identical site.
promjena broja kromosoma u odnosu na uobičajeni broj svojstven upotrijebljenim stanicama.
Clastogen
Poliploidija
any chemical which causes structural chromosomal aberrations in populations of cells or eukaryotic organisms.
numeričke aberacije kromosoma u stanicama ili organizmima koje zahvaćaju cijeli skup kromosoma, a ne jedan ili više pojedinačnih kromosoma (aneuploidija).
Concentrations
Status proteina p53
refer to final concentrations of the test chemical in the culture medium.
protein p53 sudjeluje u regulaciji staničnog ciklusa, apoptozi i popravku DNK.
Cytotoxicity
Stanice kojima nedostaje funkcionalan protein p53, koje nisu u mogućnosti zaustaviti stanični ciklus ili ukloniti oštećene stanice putem apoptoze ili drugih mehanizama (npr. indukcijom popravka DNK) povezanih s funkcijama proteina p53 kao odgovorima na oštećenje DNK, teoretski bi trebale biti podložnije genskim mutacijama ili kromosomskim aberacijama.
For the assays covered in this test method using cell lines, cytotoxicity is identified as a reduction in relative population doubling (RPD) or relative increase in cell count (RICC) of the treated cells as compared to the negative control (see paragraph 17 and Appendix 2).
Relativno povećanje broja stanica (RICC)
For the assays covered in this test method using primary cultures of lymphocytes, cytotoxicity is identified as a reduction in mitotic index (MI) of the treated cells as compared to the negative control (see paragraph 18 and Appendix 2).
povećanje broja stanica u kulturama izloženima kemikaliji u odnosu na povećanje u netretiranim kulturama, omjer izražen kao postotak.
Endoreduplication
Relativno udvostručenje populacije (RPD)
a process in which after an S period of DNA replication, the nucleus does not go into mitosis but starts another S period.
povećanje broja udvostručenja populacije u kulturama izloženima kemikaliji u odnosu na povećanje u netretiranim kulturama, omjer izražen kao postotak.
The result is chromosomes with 4, 8, 16…, chromatids.
Frakcija jetre S9
Genotoxic
supernatant homogenata jetre centrifugiran na 9000 g, tj. sirovi ekstrakt jetre.
a general term encompassing all types of DNA or chromosome damage, including breaks, deletions, adducts, nucleotides modifications and linkages, rearrangements, gene mutations, chromosome aberrations, and aneuploidy.
Mješavina S9
Not all types of genotoxic effects result in mutations or stable chromosome damage.
smjesa frakcije jetre S9 i kofaktora potrebnih za djelovanje metaboličkih enzima.
Mitotic index (MI)
Kontrola s otapalom
the ratio of cells in metaphase divided by the total number of cells observed in a population of cells; an indication of the degree of proliferation of that population.
opći izraz za označivanje kontrolnih kultura kojima je dodano jedino otapalo koje je upotrijebljeno za otapanje ispitivane kemikalije.
Mitosis
Strukturna aberacija
division of the cell nucleus usually divided into prophase, prometaphase, metaphase, anaphase and telophase.
promjena u strukturi kromosoma koja se može otkriti mikroskopskim pregledom diobe stanica u metafazi, zapažena kao brisanja ili fragmenti, intrakromosomske promjene ili interkromosomske promjene.
Mutagenic
Ispitivana kemikalija
produces a heritable change of DNA base-pair sequences(s) in genes or of the structure of chromosomes (chromosome aberrations).
Netretirane kulture
Numerical aberration
kulture koje nisu ničim tretirane (tj. ni ispitivanom kemikalijom ni otapalom), ali se obrađuju istodobno i na isti način kao i kulture tretirane ispitivanom kemikalijom.
a change in the number of chromosomes from the normal number characteristic of the cells utilised.
Dodatak 2.
Polyploidy
FORMULE ZA OCJENJIVANJE CITOTOKSIČNOSTI
numerical chromosomal aberrations in cells or organisms involving entire set(s) of chromosomes, as opposed to an individual chromosome or chromosomes (aneuploidy).
Mitotski indeks:
p53 status
Broj mitotskih stanica
p53 protein is involved in cell cycle regulation, apoptosis and DNA repair.
Ukupni broj pregledanih stanica
Cells deficient in functional p53 protein, unable to arrest cell cycle or to eliminate damaged cells via apoptosis or other mechanisms (e.g. induction of DNA repair) related to p53 functions in response to DNA damage, should be theoretically more prone to gene mutations or chromosomal aberrations.
Preporučuju se relativno povećanje broja stanica (RICC) ili relativno udvostručenje populacije (RPD) budući da se u obje metode u obzir uzima udio populacije stanica koje su se podijelile.
Relative Increase in Cell Counts (RICC)
povećanje broja stanica u tretiranim kulturamakonačno-početno
the increase in the number of cells in chemically-exposed cultures versus increase in non-treated cultures, a ratio expressed as a percentage.
povećanje broja stanica u kontrolnim kulturamakonačno-početno
Relative Population Doubling (RPD)
br. udvostručenja populacije u tretiranim kulturama
the increase in the number of population doublings in chemically-exposed cultures versus increase in non-treated cultures, a ratio expressed as a percentage.
br. udvostručenja populacije u kontrolnim kulturama
S9 liver fraction
pri čemu je:
supernatant of liver homogenate after 9000 g centrifugation, i.e. raw liver extract.
udvostručenje populacije = [log (broj stanica nakon tretiranja ÷ početni broj stanica)] ÷ log 2
S9 mix
Na primjer, RICC ili RPD od 53 % ukazuje na citotoksičnost/citostazu od 47 %, dok citotoksičnost/citostaza od 55 %, mjerena mitotskim indeksom, znači da je stvarni mitotski indeks 45 % kontrole.
mix of the S9 liver fraction and cofactors necessary for metabolic enzymes activity.
U svakom slučaju, trebalo bi mjeriti broj stanica prije tretiranja jednako za tretirane i negativne kontrolne kulture.
Solvent control
Iako se RCC (odnosno broj stranica u tretiranim kulturama / broj stanica u kontrolnim kulturama) u prošlosti upotrebljavao kao parametar citotoksičnosti, on se više ne preporučuje jer kod te metode citotoksičnost može biti podcijenjena.
General term to define the control cultures receiving the solvent alone used to dissolve the test chemical.
U negativnim kontrolnim kulturama udvostručenje populacije trebalo bi biti u skladu sa zahtjevom uzrokovanja stanica poslije tretiranja po isteku vremena koje odgovara trajanju približno 1,5 uobičajenog staničnog ciklusa i mitotski bi indeks trebao biti dovoljno visok za dobivanje dostatnog broja stanica u mitozi i pouzdano izračunavanje smanjenja od 50 %.
Structural aberration
U dijelu B poglavlje B.11. zamjenjuje se sljedećim:
a change in chromosome structure detectable by microscopic examination of the metaphase stage of cell division, observed as deletions and fragments, intrachanges or interchanges.
Ispitivanje kromosomskih aberacija u koštanoj srži sisavaca
Test chemical
Ova ispitna metoda odgovara Smjernici OECD-a za ispitivanje 475 (2016.).
Untreated controls
In vivo ispitivanje kromosomskih aberacija u koštanoj srži sisavaca posebno je relevantno za ocjenu genotoksičnosti jer, iako se mogu razlikovati među vrstama, faktori metabolizma, farmakokinetike i procesa popravka DNK in vivoaktivni su i pridonose odgovorima.
cultures that receive no treatment (i.e. no test chemical nor solvent) but are processed concurrently in the same way as the cultures receiving the test chemical.
In vivo test koristan je i za daljnje istraživanje genotoksičnosti otkrivene nekim in vitro sustavom.
Appendix 2
In vivo ispitivanje kromosomskih aberacija sisavaca primjenjuje se za otkrivanje strukturnih kromosomskih aberacija u stanicama koštane srži životinja, obično glodavaca, uzrokovanih ispitivanim kemikalijama (2., 3., 4. i 5.).
FORMULAS FOR CYTOTOXICITY ASSESSMENT
Razlikujemo dva tipa strukturnih kromosomskih aberacija: kromosomski i kromatidni.
Mitotic index (MI):
Iako je većina aberacija izazvanih genotoksičnim kemikalijama kromatidnog tipa, pojavljuju se i aberacije kromosomskog tipa.