natgillin/translations-raw huggingface dataset:
Bone marrow and chromosome preparations
istodobnim pozitivnim kontrolama ili kontrolama vrednovanja trebalo bi izazvati odgovore koji su u skladu s onima generiranima u bazi podataka o prijašnjim pozitivnim kontrolama i dovesti do statistički značajnog povećanja u odnosu na negativnu kontrolu (vidjeti stavke 20. – 21.);
Immediately after humane euthanasia, bone marrow cells are obtained from the femurs or tibias of the animals, exposed to hypotonic solution and fixed.
analiziran je prikladan broj doza i stanica;
The metaphase cells are then spread on slides and stained using established methods (see (3) (12)).
kriteriji za odabir najviše doze u skladu su s kriterijima opisanima u stavcima 25. – 28.
All slides, including those of positive and negative controls, should be independently coded before analysis and should be randomised so the scorer is unaware of the treatment condition.
Ocjenjivanje i tumačenje rezultata
The mitotic index should be determined as a measure of cytotoxicity in at least 1000 cells per animal for all treated animals (including positive controls), untreated or vehicle/solvent negative control animals.
Pod uvjetom da su ispunjeni svi kriteriji prihvatljivosti, ispitivana kemikalija smatra se jasno pozitivnom:
At least 200 metaphases should be analysed for each animal for structural chromosomal aberrations including and excluding gaps (6).
ako je najmanje u jednoj tretiranoj skupini zapaženo statistički značajno povećanje učestalosti stanica sa strukturnim kromosomskim aberacijama (isključujući kromosomske prekide) u odnosu na istodobnu negativnu kontrolu;
However, if the historical negative control database indicates the mean background structural chromosomal aberration frequency is < 1 % in the testing laboratory, consideration should be given to scoring additional cells.
b. odgovarajući test trenda pokazuje da je u najmanje jednom vremenu uzorkovanja to povećanje povezano s dozom te
Chromatid and chromosome-type aberrations should be recorded separately and classified by sub-types (breaks, exchanges).
c. ako bilo koji od tih rezultata nije uključen u distribuciju podataka o prijašnjim negativnim kontrolama (npr. kontrolne granice od 95 % prema Poissonovoj distribuciji).
Recognising that slide preparation procedures often result in the breakage of a proportion of metaphases with a resulting loss of chromosomes, the cells scored should, therefore, contain a number of centromeres not less than 2n ± 2, where n is the haploid number of chromosomes for that species.
Ako se u određeno vrijeme uzorkovanja ispituje samo najviša doza, ispitivana kemikalija smatra se jasno pozitivnom ako postoji statistički značajno povećanje u odnosu na istodobnu negativnu kontrolu i ako rezultati nisu uključeni u distribuciju povijesnih podataka o negativnim kontrolama (npr. kontrolne granice od 95 % prema Poissonovoj distribuciji).
Treatment of Results
Preporuke za prikladne statističke metode nalaze se u literaturi (13.).
Individual animal data should be presented in tabular form.
Pri analizi odgovora na dozu trebalo bi analizirati najmanje tri skupine tretirane dozom.
The mitotic index, the number of metaphase cells scored, the number of aberrations per metaphase cell and the percentage of cells with structural chromosomal aberration(s) should be evaluated for each animal.
U statističkim ispitivanjima trebalo bi upotrebljavati životinju kao pokusnu jedinicu.
Different types of structural chromosomal aberrations should be listed with their numbers and frequencies for treated and control groups.
Pozitivnim rezultatima ispitivanja kromosomskih aberacija dokazuje se da ispitivana kemikalija izaziva strukturne kromosomske aberacije u koštanoj srži ispitne vrste.
Gaps, as well as polyploid cells and cells with endoreduplicated chromosomes are recorded separately.
Pod uvjetom da su ispunjeni svi kriteriji prihvatljivosti, ispitivana kemikalija smatra se jasno negativnom ako u svim ispitanim pokusnim uvjetima:
The frequency of gaps is reported but generally not included in the analysis of the total structural aberration frequency.
ni kod jedne tretirane skupine nije zapaženo statistički značajno povećanje učestalosti stanica sa strukturnim kromosomskim aberacijama (isključujući kromosomske prekide) u odnosu na istodobnu negativnu kontrolu;
If there is no evidence for a difference in response between the sexes, the data may be combined for statistical analysis.
b. odgovarajući test trenda pokazuje da nema povećanja povezanog s dozom ni u jednom vremenu uzorkovanja;
Data on animal toxicity and clinical signs should also be reported.
c. svi su rezultati u okviru distribucije podataka o prijašnjim negativnim kontrolama (npr. kontrolne granice od 95 % prema Poissonovoj distribuciji) te
The following criteria determine the acceptability of the test:
d. došlo je do izlaganja koštane srži ispitivanoj kemikaliji.
The concurrent negative control data are considered acceptable for addition to the laboratory historical control database (see paragraphs 11-14);
Preporuke za najprikladnije statističke metode nalaze se u literaturi (13.).
The concurrent positive controls or scoring controls should induce responses that are compatible with those generated in the historical positive control database and produce a statistically significant increase compared with the negative control (see paragraphs 20-21);
Dokaz o izlaganju koštane srži ispitivanoj kemikaliji može uključivati smanjenje mitotskog indeksa ili mjerenje razina plazme ili krvi ispitivane kemikalije.
The appropriate number of doses and cells has been analysed;
U slučaju intravenozne primjene nije potreban dokaz o izlaganju.
The criteria for the selection of highest dose are consistent with those described in paragraphs 25-28.
Negativnim rezultatima dokazuju se da u ispitnim uvjetima ispitivana kemikalija ne izaziva strukturne kromosomske aberacije koštane srži ispitnih vrsta.
Evaluation and Interpretation of Results
Jasan pozitivan ili negativan odgovor nije potrebno provjeriti.
Providing that all acceptability criteria are fulfilled, a test chemical is considered clearly positive if:
Ako odgovor nije jasno negativan ili pozitivan i kako bi se pridonijelo utvrđivanju biološke relevantnosti rezultata (npr. blago ili granično povećanje), podatke bi trebalo ocjenjivati na temelju stručne prosudbe i/ili daljnjih istraživanja postojećih završenih pokusa.
Any of these results are outside the distribution of the historical negative control data (e.g. Poisson-based 95 % control limits).
Učestalost poliploidnih i endoredupliciranih metafaza među ukupnim metafazama trebalo bi zabilježiti odvojeno.
If only the highest dose is examined at a particular sampling time, a test chemical is considered clearly positive if there is a statistically significant increase compared with the concurrent negative control and the results are outside the distribution of the historical negative control data (e.g. Poisson-based 95 % control limits).
Povećanje broja poliploidnih/endoredupliciranih stanica može značiti da ispitivana kemikalija može inhibirati mitotske procese ili progresiju staničnog ciklusa (vidjeti stavak 3.).
Recommendations for appropriate statistical methods can be found in the literature (13).
Izvješće o ispitivanju
When conducting a dose-response analysis, at least three treated dose groups should be analysed.
Sažetak
Statistical tests should use the animal as the experimental unit.
izvor, broj serije, rok uporabe, ako su dostupni,
Positive results in the chromosomal aberration test indicate that a test chemical induces structural chromosomal aberrations in the bone marrow of the species tested.
stabilnost ispitivane kemikalije, ako je poznata.
Providing that all acceptability criteria are fulfilled, a test chemical is considered clearly negative if in all experimental conditions examined:
Priprema ispitivane kemikalije:
None of the treatment groups exhibits a statistically significant increase in the frequency of cells with structural chromosomal aberrations (excluding gaps) compared with the concurrent negative control,
opravdanost odabira nosača,
There is no dose-related increase at any sampling time when evaluated by an appropriate trend test,
topljivost i stabilnost ispitivane kemikalije u otapalu/nosaču, ako su poznate,
All results are inside the distribution of the historical negative control data (e.g. Poisson-based 95 % control limits), and
priprema prehrambenih pripravaka, vode za piće ili inhalacijskih pripravaka,
Bone marrow exposure to the test chemical(s) occurred.
analitička određivanja pripravaka (tj. stabilnost, homogenost, nominalne koncentracije), ako se provode.
Recommendations for the most appropriate statistical methods can be found in the literature (13).
vrsta/soj te obrazloženje njihove uporabe,
Evidence of exposure of the bone marrow to a test chemical may include a depression of the mitotic index or measurement of the plasma or blood levels of the test chemical(s).
broj, starost i spol životinja,
In the case of intravenous administration, evidence of exposure is not needed.
podrijetlo, uvjeti smještaja, prehrana itd.,
Alternatively, ADME data, obtained in an independent study using the same route and same species can be used to demonstrate bone marrow exposure.
metoda jedinstvenog identificiranja životinja,
Negative results indicate that, under the test conditions, the test chemical does not induce structural chromosomal aberrations in the bone marrow of the species tested.
pozitivne i negativne kontrole (s nosačem/otapalom),
There is no requirement for verification of a clear positive or clear negative response.
podaci iz istraživanja o utvrđivanju raspona, ako je provedeno,
In cases where the response is not clearly negative or positive and in order to assist in establishing the biological relevance of a result (e.g. a weak or borderline increase), the data should be evaluated by expert judgement and/or further investigations of the existing experiments completed.
obrazloženje odabira visine doze,
In some cases, analysing more cells or performing a repeat experiment using modified experimental conditions could be useful.
pojedinosti o pripremi ispitivane kemikalije,
In rare cases, even after further investigations, the data will preclude making a conclusion that the test chemical produces either positive or negative results, and the study will therefore be concluded as equivocal.
pojedinosti o primjeni ispitivane kemikalije,
An increase in the number of polyploid/endoreduplicated cells may indicate that the test chemical has the potential to inhibit mitotic processes or cell cycle progression (see paragraph 3).
metode kojima se provjerava je li ispitivana kemikalija dospjela u krvotok ili koštanu srž,
Test Report
stvarna doza (mg/kg tjelesne mase/dan) izračunata na temelju koncentracije ispitivane kemikalije u hrani / vodi za piće (ppm) i potrošnje, ako je primjenjivo,
Summary
pojedinosti o kvaliteti hrane i vode,
source, lot number, limit date for use if available;
metoda eutanazije,
stability of the test chemical, if known.
metoda analgezije (ako se primjenjuje),
Test chemical preparation:
detaljan opis rasporeda tretiranja i uzorkovanja te opravdanje za odabire,
justification for choice of vehicle;
metode pripreme predmetnih stakalaca,
solubility and stability of the test chemical in solvent/vehicle, if known;
metode mjerenja toksičnosti,
preparation of dietary, drinking water or inhalation formulations;
identitet kemikalije za zaustavljanje metafaze, njezina koncentracija, doza i vrijeme primjene prije uzorkovanja,
analytical determinations on formulations (e.g. stability, homogeneity, nominal concentrations), when conducted.
postupak izdvajanja i očuvanja uzoraka,
species/strain used and justification for use;
broj analiziranih metafaznih stanica po životinji i broj analiziranih stanica za utvrđivanje mitotskog indeksa,
number, age and sex of animals;
kriteriji prihvatljivosti istraživanja,
source, housing conditions, diet, etc.;
kriteriji na temelju kojih se istraživanja smatraju pozitivnima, negativnima ili dvosmislenima.
method for uniquely identifying the animals;
stanje životinje prije i tijekom razdoblja ispitivanja, uključujući i znakove toksičnosti,
for short-term studies: individual weight of the animals at the start and end of the test; for studies longer than one week: individual body weights during the study and food consumption.
mitotski indeks navodi se odvojeno za svaku životinju,
Body weight range, mean and standard deviation for each group should be included.
tip i broj aberacija i atipičnih stanica navodi se odvojeno za svaku životinju,
positive and negative (vehicle/solvent) controls;
ukupan broj aberacija po skupini sa srednjim izmjerenim vrijednostima i standardnim odstupanjima,
data from range-finding study, if conducted;
broj stanica s aberacijama po skupini sa srednjim izmjerenim vrijednostima i standardnim odstupanjima,
rationale for dose level selection;
promjene ploidije ako su zapažene, uključujući učestalost poliploidnih i/ili endoredupliciranih stanica,
details of test chemical preparation;
odnos doze i odgovora, ako je to moguće,
details of the administration of the test chemical;
primijenjene statističke analize i metode,
rationale for route and duration of administration;
podaci kojima se potvrđuje da je došlo do izlaganja koštane srži,
methods for verifying that the test chemical(s) reached the general circulation or bone marrow;
podaci o istodobnim negativnim i pozitivnim kontrolama s rasponima, srednjim izmjerenim vrijednostima i standardnim odstupanjima,
actual dose (mg/kg body weight/day) calculated from diet/drinking water test chemical concentration (ppm) and consumption, if applicable;
podaci o prijašnjim negativnim i pozitivnim kontrolama s rasponima, srednjim izmjerenim vrijednostima, standardnim odstupanjima te kontrolnim granicama od 95 % za distribuciju, kao i obuhvaćeno razdoblje te broj zapažanja,
details of food and water quality;
ispunjeni kriteriji u pogledu pozitivnog ili negativnog odgovora.
method of euthanasia;
Zaključak.
method of analgesia (where used);
Literatura.
detailed description of treatment and sampling schedules and justifications for the choices;
, ‚Cytogenetic Tests in Mammals’, u Mutagenicity Testing: A Practical Approach, Venittand, S., J.M.
methods of slide preparation;
Parry (eds.), IRL Press, Washington, DC, str. 275. – 306.
methods for measurement of toxicity;
(ed.), Cambridge University Press, Cambridge, str. 115. – 141.
identity of metaphase arresting chemical, its concentration, dose and time of administration before sampling;
OECD (2000), ‚Guidance Document on the Recognition, Assessment and Use of Clinical Signs as Humane Endpoints for Experimental Animals Used in Safety Evaluation’, OECD Environment, Health and Safety Publications (EHS), Series on Testing and Assessment, No19, OECD Publishing, Paris.
procedures for isolating and preserving samples;
(ed.), Cambridge University Press, Cambridge, str. 184. – 232.
number of metaphase cells analysed per animal and the number of cells analysed for mitotic index determination;
svako odstupanje od uobičajenog diploidnog (ili haploidnog) broja kromosoma za jedan kromosom ili više njih, ali ne za više kromosoma u cijelom skupu ili skupovima kromosoma (usp. poliploidija).
criteria for acceptability of the study;
Centromera
criteria for considering studies as positive, negative or inconclusive.
područje ili područja kromosoma s kojima su tijekom stanične diobe povezane niti diobenog vretena, čime se omogućuje uredno kretanje kromosoma kćeri prema polovima stanica kćeri.
type and number of aberrations and of aberrant cells, given separately for each animal;
proces kod kojeg nakon S-faze replikacije DNK ne slijedi mitoza jezgre, nego započinje druga S-faza.
total number of aberrations per group with means and standard deviations;
Rezultat su kromosomi s 4, 8, 16… kromatida.
dose-response relationship, where possible;
Mitotski indeks
statistical analyses and method applied;
omjer broja stanica u mitozi i ukupnog broja stanica u populaciji, koji je mjerilo statusa proliferacije te populacije stanica.
data supporting that exposure of the bone marrow occurred;
promjena broja kromosoma u odnosu na uobičajeni broj svojstven upotrijebljenim životinjama (aneuploidija).
concurrent negative control and positive control data with ranges, means and standard deviations;
numerička aberacija kromosoma koja uključuje promjenu broja cjelokupnog skupa kromosoma za razliku od numeričke promjene dijela skupa kromosoma (vidjeti aneuploidiju).
historical negative and positive control data with ranges, means, standard deviations, and 95 % control limits for the distribution, as well as the time period covered and number of observations;
Strukturna kromosomska aberacija
criteria met for a positive or negative response.
promjena u strukturi kromosoma koja se može otkriti mikroskopskim pregledom diobe stanica u metafazi, zapažena kao brisanja i fragmenti, intrakromosomske promjene ili interkromosomske promjene.
Conclusion.
FAKTORSKI MODEL ZA UTVRĐIVANJE RAZLIKA MEĐU SPOLOVIMA U IN VIVO ANALIZI KROMOSOMSKIH ABERACIJA
References.
Faktorski model i njegova analiza
, “Cytogenetic Tests in Mammals”, in Mutagenicity Testing: A Practical Approach, Venittand, S., J.M.
U okviru faktorskog modela ispituje se minimalno pet mužjaka i pet ženki pri svakoj razini koncentracije, a posljedica je model s minimalno 40 životinja (20 mužjaka i 20 ženki plus relevantne pozitivne kontrole).
Parry (eds.), IRL Press, Washington, DC, pp. 275-306.
Model, koji je jedan od jednostavnijih faktorskih modela, istovjetan je dvosmjernoj analizi varijance (ANOVA) sa spolom i razinom koncentracije kao glavnim učincima.
, “In Vivo Cytogenetics Assays”, in Basic Mutagenicity Tests, UKEMS Recommended Procedures.
Podaci se mogu analizirati primjenom mnogih standardnih statističkih softverskih paketa kao što su SPSS, SAS, STATA i Genstat, kao i primjenom softvera R.
Part I revised, Kirkland, D.J.
Analizom se varijabilnost skupa podataka razdjeljuje na varijabilnost između spolova, varijabilnost među koncentracijama i varijabilnost koja je povezana s interakcijom između spolova i koncentracija.
(ed.), Cambridge University Press, Cambridge, pp. 115-141.
Svaka od vrijednosti ispituje se u odnosu na procijenjenu varijabilnost među životinjama iz skupina životinja istog spola kojima je dana jednaka koncentracija.
OECD (2000), “Guidance Document on the Recognition, Assessment and Use of Clinical Signs as Humane Endpoints for Experimental Animals Used in Safety Evaluation”, OECD Environment, Health and Safety Publications (EHS), Series on Testing and Assessment, No19, OECD Publishing, Paris.
Potpuni podaci o osnovnoj metodologiji dostupni su u brojnim standardnim statističkim priručnicima (vidjeti literaturu) i sadržajima za pomoć osiguranima u okviru statističkih paketa.
, “Statistical Analysis of in vivo Cytogenetic Assays”, in Statistical Evaluation of Mutagenicity Test Data.
U analizi se nakon toga ispituje vrijednost interakcije spol x koncentracija u tablici ANOVA [1].
UKEMS SubCommittee on Guidelines for Mutagenicity Testing, Report, Part III, Kirkland, D.J.
Ako je prisutna značajna interakcija spol x koncentracija, ta se vrijednost jednako tako može razdijeliti na linearne kontraste interakcije x spol i kvadratne kontraste interakcije x spol.
(ed.), Cambridge University Press, Cambridge, pp. 184-232.
Na temelju tih vrijednosti provode se ispitivanja kojima se utvrđuje jesu li odgovori na koncentraciju paralelni za oba spola odnosno postoji li razlika u odgovoru između dvaju spolova.
Any deviation from the normal diploid (or haploid) number of chromosomes by one or more chromosomes, but not by multiples of entire set(s) of chromosomes (cf. polyploidy).
Procijenjena varijabilnost, koja je objedinjena unutar skupine, može se upotrijebiti za provedbu testova parova za utvrđivanje razlike između srednjih izmjerenih vrijednosti.
Centromere
Usporedbe se mogu napraviti između srednjih izmjerenih vrijednosti za oba spola i među srednjim izmjerenim vrijednostima za različite razine koncentracije, na primjer za usporedbe s razinama negativnih kontrola.
Region(s) of a chromosome with which spindle fibers are associated during cell division, allowing orderly movement of daughter chromosomes to the poles of the daughter cells.
U slučajevima značajne interakcije može se napraviti usporedba među srednjim izmjerenim vrijednostima za različite koncentracije unutar spola ili između srednjih izmjerenih vrijednosti za spolove pri jednakoj koncentraciji.
Structural chromosome damage expressed as breakage of single chromatids or breakage and reunion between chromatids.
Literatura
Structural chromosome damage expressed as breakage, or breakage and reunion, of both chromatids at an identical site.
Mnogo je statističkih priručnika u kojima se raspravlja o teoriji, planiranju, metodologiji, analizi i tumačenju faktorskih modela, od najjednostavnijih analiza s dva čimbenika do složenijih oblika koji se primjenjuju u metodologiji planiranja pokusa.
A process in which after an S period of DNA replication, the nucleus does not go into mitosis but starts another S period.
U nastavku se nalazi nepotpuni popis.
The result is chromosomes with 4,8,16…chromatids.
U nekim priručnicima navedeni su razrađeni primjeri usporedivih modela, u određenim slučajevima s kodom za provedbu analiza uz primjenu različitih softverskih paketa.
Gap
Statističari koji primjenjuju model poput općih linearnih modela (GLM – General Linear Models) mogu provoditi analizu na drukčiji, ali usporediv način, no rezultat neće nužno biti tradicionalna tablica ANOVA koja datira iz vremena algoritamskih pristupa statističkim izračunima razvijenih u predinformatičko doba.
The ratio between the number of cells in mitosis and the total number of cells in a population, which is a measure of the proliferation status of that cell population.
Ova ispitna metoda odgovara Smjernici OECD-a za ispitivanje 474 (2016.).
A change in the number of chromosomes from the normal number characteristic of the animals utilised (aneuploidy).
In vivo mikronukleus-test na sisavcima posebno je relevantan za ocjenu genotoksičnosti jer, iako se mogu razlikovati među vrstama, faktori metabolizma, farmakokinetika i procesi popravka DNK in vivo aktivni su i pridonose odgovorima.
A numerical chromosomal aberration involving a change in the number of the entire set of chromosomes, as opposed to a numerical change in part of the chromosome set (cf. aneuploidy).
In vivo mikronukleus-test na sisavcima primjenjuje se za otkrivanje oštećenja kromosoma ili oštećenja mitotskog aparata eritroblasta izazvanih ispitivanom kemikalijom.
Structural chromosomal aberration
Ispitivanjem se ocjenjuje nastajanje mikronukleusa u eritrocitima uzorkovanih iz stanica koštane srži ili periferne krvi životinja, uobičajeno glodavaca.
A change in chromosome structure detectable by microscopic examination of the metaphase stage of cell division, observed as deletions and fragments, intrachanges or interchanges.
Svrha mikronukleus-testa jest utvrđivanje kemikalija koje izazivaju citogenetska oštećenja zbog kojih dolazi do nastajanja mikronukleusa koji sadržavaju zaostale fragmente kromosoma ili čitave kromosome.
THE FACTORIAL DESIGN FOR IDENTIFYING SEX DIFFERENCES IN THE IN VIVO CHROMOSOMAL ABERRATION ASSAY
Kada se eritroblast koštane srži razvije u nezreli eritrocit (koji se ponekad naziva i polikromatski eritrocit ili retikulocit), dolazi do istiskivanja glavnog nukleusa; bilo koji nastali mikronukleus može zaostati u citoplazmi.
The factorial design and its analysis
Vidljivost ili otkrivanje mikronukleusa u tim je stanicama olakšano jer im nedostaje glavni nukleus.
In this design, a minimum of 5 males and 5 females are tested at each concentration level resulting in a design using a minimum of 40 animals (20 males and 20 females, plus relevant positive controls).
Povećanje učestalosti nezrelih eritrocita s mikronukleusima kod tretiranih životinja pokazatelj je izazvanih strukturnih ili numeričkih kromosomskih aberacija.