Joidenkin aikaisemmassa kohdassa mainittujen tarkistusten lisäksi yhteiseen kantaan sisällytetään myös seuraavat Euroopan parlamentin ensimmäisessä käsittelyssä tehdyt ehdotukset: tarve panna täytäntöön myös muita sitovia politiikkoja ja toimia direktiivin soveltamisalan ulkopuolisilla aloilla (tarkistus 10), direktiivillä on myötävaikutettava siihen, että Kioton pöytäkirjan sitoumukset saavutetaan aiheuttamalla työllisyydelle ja taloudelle mahdollisimman vähän haittaa (tarkistus 15), rekisteröintijärjestelmä on tehtävä mahdollisimman avoimeksi päästöoikeuksien omistuksen, siirron ja peruutusten suhteen (tarkistus 35), tietojen lähettäminen toimivaltaisille viranomaisille kunkin laitoksen päästöistä voidaan toteuttaa kunkin vuoden päätyttyä (eikä aikaisemmin) (tarkistus 39), velvollisuus julkistaa rikkomistilanteessa olevat toimijat (tarkistus 40), noudattamatta jättämistä koskeville seuraamuksille määrätään kiinteä arvo – 40 euroa ensimmäisessä vaiheessa ja 100 euroa toisessa vaiheessa (tarkistukset 41 ja 42), yleisön ympäristötietojen saatavuus prosessoidaan uuden lainsäädännön mukaisesti 2003/4/EY (tarkistus 46), yhteisön päästökaupan järjestelmä voidaan rinnastaa järjestelmiin ainoastaan kolmansissa maissa, jotka ovat ratifioineet Kioton pöytäkirjan (tarkistukset 51 ja 103), päästökauppaa ja energian verotusta on pidettävä täydentävinä välineinä (tarkistukset 9 ja 69), komission on annettava kertomus direktiivin täytäntöönpanosta ja otettava huomioon direktiivin suhde kansainvälisen päästökaupan järjestelmään, jonka on suunniteltu alkavan vuonna 2008 sekä tarve harmonisoida päästöoikeuksien jakomenetelmä, järjestelmä on sovitettava laajentuneeseen Euroopan unioniin (tarkistukset 55, 56, 57 ja 59), kansallisessa jakosuunnitelmassa on ilmoitettava täydellinen luettelo direktiivin kattavista laitoksista sekä vastaava jaettava päästöoikeuksien määrä (tarkistus 73), yritysten aikaisemmin toteuttamat päästövähennykset on tunnustettava (tarkistus 96) ja sidosryhmät on tarpeen ottaa mukaan kasvihuonekaasupäästöjen harmonisoitujen valvontamenetelmien kehittämiseen (tarkistus 74).
Apart from some of the amendments referred to in the previous point the common position also incorporates the following proposals made by Parliament at first reading: the need to implement other policies and measures, likewise binding, for the sectors not covered by the Directive (amendment 10); the Directive should contribute towards ensuring compliance with the Kyoto Protocol, while causing as little damage as possible to employment and the economy (amendment 15); the registration system should be more transparent as regards the ownership, transfer and cancellation of emission allowances (amendment 35);information regarding emissions from each installation should be forwarded after (and not before) the end of the relevant year (amendment 39); the names of operators who have failed to comply with their obligations should be published (amendment 40); sanctions for non-compliance should be a fixed sum – EUR 40 in the first period and EUR 100 in the second (amendments 41 and 42); public access to environmental information should be processed in accordance with the new law 2003/4/EC (amendment 46); the European emission trading scheme can only be linked to schemes in third countries which have ratified the Kyoto Protocol (amendments 51 and 103); emission trading and energy taxation must be seen as complementary instruments (amendments 9 and 69); the Commission will have to produce a report on the implementation of the Directive, bearing in mind its relationship with the international emission trading due to start in 2008, the need to harmonise the method for allocating emission allowances; the adaptation of the scheme to an enlarged Europe (amendments 55, 56, 57 and 59); the national allocation plan should contain a complete list of the installations covered by the Directive and the quantity of emission allowances to be allocated (amendment 73); the emission reductions carried out previously by businesses should be recognised (amendment 96); stakeholders should be involved in the process of developing harmonised methods for monitoring greenhouse gas emissions (amendment 74).