natgillin/translations-raw huggingface dataset:
If it is obvious that procedural mistakes can be identified and/or considered highly likely, the specific data point is marked as an outlier and not included in subsequent statistical analysis.
biomassa hetkellä i
(A zero algal concentration in one out of two or three replicate vessels may indicate the vessel was not inoculated correctly, or was improperly cleaned).
biomassa hetkellä j.
State reasons for rejection of a data point as an outlier clearly in the test report.
Kullekin testiryhmälle ja kontrolliryhmälle lasketaan kasvunopeuden keskiarvo varianssiestimaatteineen.
Accepted reasons are only (rare) procedural mistakes and not just bad precision.
Keskimääräinen spesifinen kasvunopeus lasketaan koko testin ajalta (yleensä päivästä 0 päivään 3) käyttämällä lähtöarvona siirrostetun biomassan nimellisarvoa mitatun lähtöarvon sijasta, koska näin saadaan yleensä parempi tarkkuus.
Statistical procedures for outlier identification are of limited use for this type of problem and cannot replace expert judgement.
Biomassan mitattua alkupitoisuutta voidaan käyttää, jos inokulaatin pieni biomassa voidaan määrittää riittävän tarkasti biomassan mittauslaitteella (esimerkiksi virtaussytometrilla).
Outliers (marked as such) should preferably be retained among the data points shown in any subsequent graphical or tabular data presentation.
Lisäksi määritetään jaksoittainen kasvunopeus, joka saadaan laskemalla spesifiset kasvunopeudet kultakin päivältä testin aikana (päivät 0–1, 1–2 ja 2–3), ja tutkitaan, pysyykö kontrolliryhmän kasvunopeus vakiona (ks. validiteettivaatimukset, 11 kohta).
Response variables
Jos spesifinen kasvunopeus on huomattavasti pienempi ensimmäisenä päivänä kuin spesifisten kasvunopeuksien keskiarvo, se voi olla merkki viivevaiheesta.
The purpose of the test is to determine the effects of the test chemical on the growth of algae.
Vaikka viivevaihe voidaan minimoida ja poistaa käytännössä kokonaan kontrolliviljelmistä esiviljelmän asianmukaisella lisäyksellä, testiaineelle altistetuissa viljelmissä viivevaihe voi osoittaa toipumista toksisuuden aiheuttamasta alkustressistä tai vähentynyttä altistumista, joka johtuu testikemikaalin häviämisestä (esimerkiksi sorptiosta levämassaan) alkuvaiheen altistumisen jälkeen.
This test method describes two response variables, as different jurisdictions have different preferences and regulatory needs.
Tällöin voidaan tarkastella jaksoittaista kasvunopeutta, jonka avulla voidaan arvioida testikemikaalin vaikutuksia altistusaikana.
In order for the test results to be acceptable in all jurisdictions, the effects should be evaluated using both response variables (a) and (b) described below.
Merkittävät erot jaksoittaisen kasvunopeuden ja keskimääräisen kasvunopeuden välillä osoittavat, että kasvu poikkeaa jatkuvasta eksponentiaalisesta kasvusta, jolloin kasvukäyriä on syytä tarkastella lähemmin.
Average specific growth rate
Kasvunopeuden prosentuaalinen estyminen kussakin käsitellyssä toistossa lasketaan seuraavan kaavan [2] avulla:
this response variable is calculated on the basis of the logarithmic increase of biomass during the test period, expressed per day
keskimääräisen spesifisen kasvunopeuden prosentuaalinen estyminen
Yield
keskimääräisen spesifisen kasvunopeuden (μ) keskiarvo kontrolliryhmässä
this response variable is the biomass at the end of the test minus the starting biomass.
keskimääräinen spesifinen kasvunopeus käsitellyssä toistossa.
It should be noted that toxicity values calculated by using these two response variables are not comparable and this difference must be recognised when using the results of the test.
Jos testiliuosten valmistamisessa käytetään liuottimia, kasvunopeuden prosentuaalinen estyminen on laskettava liuottimia sisältävistä kontrolliviljelmistä eikä niistä kontrolliviljelmistä, joissa ei ole liuottimia.
ECx values based upon average specific growth rate (ErCx) will generally be higher than results based upon yield (EyCx) if the test conditions of this test method are adhered to, due to the mathematical basis of the respective approaches.
Tuotos lasketaan vähentämällä testin lopussa mitatusta biomassasta testin alussa mitattu biomassa kontrolli- ja käsittelyryhmän kunkin astian osalta.
This should not be interpreted as a difference in sensitivity between the two response variables, simply that the values are different mathematically.
Kullekin testipitoisuudelle ja kontrollille lasketaan tuotoksen keskiarvo varianssiestimaatteineen.
The concept of average specific growth rate is based on the general exponential growth pattern of algae in non-limited cultures, where toxicity is estimated on the basis of the effects on the growth rate, without being dependent on the absolute level of the specific growth rate of the control, slope of the concentration-response curve or on test duration.
Tuotoksen prosentuaalinen estyminen ( % Iy) voidaan laskea kutakin käsiteltyä toistoa varten seuraavasti:
In contrast, results based upon the yield response variable are dependent upon all these other variables.
% I y
EyCx is dependent on the specific growth rate of the algal species used in each test and on the maximum specific growth rate that can vary between species and even different algal strains.
tuotoksen prosentuaalinen estyminen
This response variable should not be used for comparing the sensitivity to toxicants among algal species or even different strains.
tuotoksen keskiarvo kontrolliryhmässä
Average growth rate
Pitoisuus-vastekäyrän piirtäminen
The average specific growth rate for a specific period is calculated as the logarithmic increase in the biomass from the equation for each single vessel of controls and treatments [1]:
Prosentuaalinen estyminen merkitään graafisesti suhteessa testikemikaalin pitoisuuden logaritmiin.
day
Näin saatuja pisteitä tarkastellaan huolellisesti ottamatta huomioon datapisteitä, joita pidettiin ensimmäisessä vaiheessa vieraina havaintoina.
where:
Datapisteiden kautta vedetään tasaisesti muuttuva viiva joko silmämääräisesti tai interpoloimalla tietokoneen avulla, jotta pitoisuuden ja vasteen suhteesta saataisiin alustava käsitys.
μi-j
Tämän jälkeen käytetään tarkempaa menetelmää, mieluimmin tietokonepohjaista tilastomenetelmää.
is the average specific growth rate from time i to j;
Päteviä syitä olla käyttämättä tilastomenetelmää ovat muun muassa seuraavat syyt:
is the biomass at time i;
Vaikka tietoja käsiteltäisiin tietokoneistetulla menetelmällä, tulokset eivät olisi sen luotettavampia kuin jos tiedot olisi annettu asiantuntijan arvioitaviksi.
is the biomass at time j
Tällaisissa tapauksissa on jopa mahdollista, että eräillä tietokoneohjelmilla ei saada minkäänlaista luotettavaa tulosta (esimerkiksi sen vuoksi, että iteraatiot eivät konvergoidu).
For each treatment group and control group, calculate a mean value for growth rate along with variance estimates.
Tietokoneohjelmilla ei pystytä käsittelemään kunnolla stimuloinnin aiheuttamia kasvuvasteita (ks. jäljempänä).
Calculate the average specific growth rate over the entire test duration (normally days 0-3), using the nominally inoculated biomass as the starting value rather than a measured starting value, because in this way greater precision is normally obtained.
Tilastomenetelmät
If the equipment used for biomass measurement allows sufficiently precise determination of the low inoculum biomass (e.g. flow cytometer) then the measured initial biomass concentration can be used.
Tavoitteena on saada kvantitatiivinen pitoisuus-vastesuhde regressioanalyysin avulla.
Assess also the section-by-section growth rate, calculated as the specific growth rates for each day during the course of the test (days 0-1, 1-2 and 2-3) and examine whether the control growth rate remains constant (see validity criteria, paragraph 11).
Painotettua lineaarista regressiota voidaan käyttää sen jälkeen, kun vastetiedoille on tehty linearisoiva muunnos – esimerkiksi probitti-, logitti- tai Weibull-yksiköiksi (8) – mutta suositeltavampaa on käyttää epälineaarisia regressiomenetelmiä, joilla voidaan paremmin käsitellä tiedoissa väistämättä esiintyviä epäsäännöllisyyksiä sekä poikkeamia tasaisista jakaumista.
While a lag phase can be minimised and practically eliminated in control cultures by proper propagation of the pre-culture, a lag phase in exposed cultures may indicate recovery after initial toxic stress or reduced exposure due to loss of test chemical (including sorption onto the algal biomass) after initial exposure.
On syytä huomata, että standardianalyysimenetelmät, joissa käytetään probitti-, logitti- tai Weibull-muunnoksia, on tarkoitettu dikotomisia tietoja varten (kun vasteita on kaksi, esimerkiksi kuolleisuus tai eloonjääminen), minkä vuoksi niitä on mukautettava, jos niitä aiotaan käyttää kasvu- tai tuotostietojen analysointiin.
Hence the section-by-section growth rate may be assessed in order to evaluate effects of the test chemical occurring during the exposure period.
Kirjallisuusviitteissä (9), (10) ja (11) kuvataan erityismenetelmiä, joilla ECx-arvot voidaan määrittää jatkuvista tiedoista.
Substantial differences between the section-by-section growth rate and the average growth rate indicate deviation from constant exponential growth and that close examination of the growth curves is warranted.
Epälineaarisen regressioanalyysin käyttöä käsitellään tarkemmin lisäyksessä 5.
Calculate the percent inhibition of growth rate for each treatment replicate from equation [2]:
Kunkin vastemuuttujan analysoimiseksi käytetään pitoisuus-vastesuhdetta, jonka avulla lasketaan ECx-arvojen piste-estimaatit.
%I r
Jokaiselle estimaatille on määritettävä 95 prosentin luottamusväli, jos se on mahdollista.
percent inhibition in average specific growth rate;
Vastetietojen ja regressiomallin välinen yhteensopivuuden aste on arvioitava joko graafisesti tai tilastollisesti.
mean value for average specific growth rate (μ) in the control group;
Regressionanalyysi on tehtävä käyttämällä yksittäisiä toistojen vasteita eikä käsittelyryhmien keskiarvoja.
average specific growth rate for the treatment replicate.
Jos epälineaariseen käyrän sovitus on vaikeaa tai mahdotonta, koska tiedot ovat liian hajallaan, ongelma voidaan kiertää tekemällä regressio ryhmien keskiarvoille, mikä on käytännöllinen tapa vähentää mahdollisten vieraiden havaintojen vaikutusta.
When solvents are used to prepare the test solutions, the solvent controls rather than the controls without solvents should be used in calculation of percent inhibition.
Tämän vaihtoehdon käyttö on mainittava testiraportissa tavanomaisesta menetelmästä poikkeavana keinona, jota on käytetty sen vuoksi, että käyrän sovittaminen yksittäisiin toistoihin ei antanut hyvää tulosta.
Yield is calculated as the biomass at the end of the test minus the starting biomass for each single vessel of controls and treatments.
estimaatit ja luottamusvälit voidaan saada myös käyttämällä lineaarista interpolointia bootstrap-menetelmän kanssa (13), jos käytettävissä olevat regressiomallit tai -menetelmät eivät sovellu kyseisten tietojen käsittelyyn.
For each test concentration and control, calculate a mean value for yield along with variance estimates.
Jotta voidaan arvioida LOEC-pitoisuus ja siten myös NOEC-pitoisuus sekä testikemikaalin vaikutukset kasvunopeuteen, käsiteltyjen liuosten keskiarvoja on verrattava varianssianalyysitekniikoiden avulla (ANOVA).
The percent inhibition in yield ( %Iy) may be calculated for each treatment replicate as follows:
Sen jälkeen on verrattava kunkin pitoisuuden keskiarvoa kontrolliryhmän keskiarvoon käyttämällä sopivaa moniulotteista vertailumenetelmää tai trenditestimenetelmää.
%I y
Dunnettin tai Williamsin testi voi olla käyttökelpoinen (12), (14), (15), (16), (17).
percent inhibition of yield;
Lisäksi on arvioitava, pitääkö ANOVA-oletus varianssin homogeenisuudesta paikkansa.
Plotting concentration response curve
Jos oletus varianssin homogeenisuudesta ei pidä paikkaansa, tilanne on joskus korjattavissa tietojen logaritmimuunnoksella.
Plot the percentage of inhibition against the logarithm of the test chemical concentration and examine the plot closely, disregarding any such data point that was singled out as an outlier in the first phase.
Jos varianssin heterogeenisuus on erittäin suuri eikä se ole korjattavissa muunnoksella, on harkittava analysointia sellaisilla menetelmillä kuin Jonckheeren alaspäin askeltava trenditesti.
Fit a smooth line through the data points by eye or by computerised interpolation to get a first impression of the concentration-response relationship, and then proceed with a more detailed method, preferably a computerised statistical method.
Kirjallisuusviitteessä (11) annetaan lisäohjeita NOEC-arvon määrittämisestä.
Depending on the intended usage of data;
Tieteen viimeaikaisen kehityksen perusteella on suositeltu, että NOEC-käsitteestä luovuttaisiin ja se korvattaisiin regressioanalyysiin perustuvilla ECx:n piste-estimaateilla.
the quality (precision) and amount of data as well as the availability of data analysis tools, it may be decided (and sometimes well justified) to stop the data analysis at this stage and simply read the key figures EC50 and EC10 (and/or EC20) from the eye fitted curve (see also section below on stimulatory effects).
Sopivaa x:n arvoa ei ole vielä vahvistettu tätä levätestiä varten.
Valid reasons for not using a statistical method may include:
Sopivalta vaikuttaisi väli 10–20 prosenttia (valitun vastemuuttujan mukaan), ja suositeltavaa on ilmoittaa sekä EC10- että EC20-arvo.
Data are not appropriate for computerised methods to produce any more reliable results than can be obtained by expert judgement — in such situations some computer programs may even fail to produce a reliable solution (iterations may not converge etc.)
Kasvun edistyminen
Stimulatory growth responses cannot be handled adequately using available computer programs (see below).
Pienissä pitoisuuksissa havaitaan joskus kasvun edistymistä (negatiivista estymistä).
Statistical procedures
Tämä voi johtua joko hormesis-vaikutuksesta (’toksisuudesta johtuva kasvun edistyminen’) tai stimuloivien kasvutekijöiden lisäämisestä testiaineen kanssa testissä käytettyyn minimaaliseen viljelyaineeseen.
The aim is to obtain a quantitative concentration-response relationship by regression analysis.
On muistettava, että epäorgaanisten ravinteiden lisäämisellä ei pitäisi olla suoranaista vaikutusta, koska testiliuoksessa on oltava ravinteita ylimäärin koko testin ajan.
It is possible to use a weighted linear regression after having performed a linearising transformation of the response data — for instance into probit or logit or Weibull units (8), but non-linear regression procedures are preferred techniques that better handle unavoidable data irregularities and deviations from smooth distributions.
Pieniannoksinen stimulointi voidaan yleensä jättää huomioimatta EC50-arvon laskemisessa, jollei se ole hyvin merkittävää.
Approaching either zero or total inhibition, such irregularities may be magnified by the transformation, interfering with the analysis (8).
Jos se on merkittävää tai jos ECx-arvo on laskettava pientä x:n arvoa varten, voi olla tarpeen käyttää erityismenetelmiä.
It should be noted that standard methods of analysis using probit, logit, or Weibull transforms are intended for use on quantal (e.g. mortality or survival) data, and must be modified to accommodate growth or biomass data.
Stimuloinnin aiheuttamien vasteiden poistamista tietojen analysoinnista olisi vältettävä mahdollisuuksien mukaan, ja jos käytettävissä oleva käyränsovitusohjelmisto ei pysty käsittelemään vähäistä stimulointia, voidaan käyttää lineaarista interpolointia yhdessä bootstrap-menetelmän kanssa.
Specific procedures for determination of ECx values from continuous data can be found in (9) (10) and (11).
Jos stimulointi on hyvin merkittävää, voidaan harkita hormesis-mallin käyttöä (18).
The use of non-linear regression analysis is further detailed in Appendix 5.
Muusta kuin toksisuudesta johtuva kasvun estyminen
For each response variable to be analysed, use the concentration-response relationship to calculate point estimates of ECx values.
Valoa absorboivat testimateriaalit voivat hidastaa kasvunopeutta, koska varjostus vähentää käytettävissä olevan valon määrää.
When possible, the 95 % confidence limits for each estimate should be determined.
Tällaiset fysikaaliset vaikutukset olisi erotettava myrkkyvaikutuksista muuttamalla testiolosuhteita, ja fysikaalisista vaikutuksista olisi raportoitava erikseen.
Goodness of fit of the response data to the regression model should be assessed either graphically or statistically.
Tästä annetaan ohjeita kirjallisuusviitteissä (2) ja (3).
Regression analysis should be performed using individual replicate responses, not treatment group means.
TESTIRAPORTTI
If, however nonlinear curve fitting is difficult or fails because of too great scatter in the data, the problem may be circumvented by performing the regression on group means as a practical way of reducing the influence of suspected outliers.
Testiraportissa on esitettävä seuraavat tiedot:
Use of this option should be identified in the test report as a deviation from normal procedure because curve fits with individual replicates did not produce a good result.
Testikemikaali:
estimates and confidence limits may also be obtained using linear interpolation with bootstrapping (13), if available regression models/methods are unsuitable for the data.
fysikaalinen olomuoto ja fysikaalis-kemialliset ominaisuudet, joilla on merkitystä, muun muassa vesiliukoisuuden raja-arvo,
For estimation of the LOEC and hence the NOEC, for effects of the test chemical on growth rate, it is necessary to compare treatment means using analysis of variance (ANOVA) techniques.
kemialliset tunnistetiedot (esimerkiksi CAS-numero), mukaan luettuna puhtaus (epäpuhtaudet).
The mean for each concentration must then be compared with the control mean using an appropriate multiple comparison or trend test method.
Testilajit:
Dunnett's or Williams' test may be useful (12)(14)(15)(16)(17).
kanta, sen toimittaja tai lähde ja viljelyolosuhteet.
It is necessary to assess whether the ANOVA assumption of homogeneity of variance holds.
Testiolosuhteet:
This assessment may be performed graphically or by a formal test (17).
testin alkamispäivä ja kesto,
Suitable tests are Levene's or Bartlett's.
koejärjestelyn kuvaus:
Failure to meet the assumption of homogeneity of variances can sometimes be corrected by logarithmic transformation of the data.
koeastiat, viljelmien tilavuudet ja biomassan tiheys testin alussa,
If heterogeneity of variance is extreme and cannot be corrected by transformation, analysis by methods such as step-down Jonkheere trend tests should be considered.
viljelyaineen koostumus,
Additional guidance on determining the NOEC can be found in (11).
testipitoisuudet ja toistot (esimerkiksi toistojen määrä, testipitoisuuksien määrä ja testissä käytetty geometrinen porrastus),
Recent scientific developments have led to a recommendation of abandoning the concept of NOEC and replacing it with regression based point estimates ECx.
kuvaus testiliuosten valmistamisesta, muun muassa liuottimien käyttö,
An appropriate value for x has not been established for this algal test.
viljelylaite,
A range of 10 to 20 % appears to be appropriate (depending on the response variable chosen), and preferably both the EC10 and EC20 should be reported.
valon voimakkuus ja laatu (lähde, homogeenisuus),
Growth stimulation
lämpötila,
Growth stimulation (negative inhibition) at low concentrations is sometimes observed.
testatut pitoisuudet:
This can result from either hormesis (“toxic stimulation”) or from addition of stimulating growth factors with the test material to the minimal medium used.
nimelliset testipitoisuudet ja mahdolliset tulokset analyyseistä, joilla on määritetty testikemikaalin pitoisuus koeastioissa.
Note that the addition of inorganic nutrients should not have any direct effect because the test medium should maintain a surplus of nutrients throughout the test.
Menetelmän saantoteho ja määritysraja testimatriisissa on ilmoitettava,
Low dose stimulation can usually be ignored in EC50 calculations unless it is extreme.
kaikki poikkeamat tästä testimenetelmästä,
However, if it is extreme, or an ECx value for low x is to be calculated, special procedures may be needed.
biomassan määritysmenetelmä sekä näyttö mitatun parametrin ja kuivapainon korrelaatiosta.
Deletion of stimulatory responses from the data analysis should be avoided if possible, and if available curve fitting software cannot accept minor stimulation, linear interpolation with bootstrapping can be used.
Tulokset:
If stimulation is extreme, use of a hormesis model may be considered (18).
pH-arvot kokeen alussa ja lopussa kaikista käsittelyistä,
Non toxic growth inhibition
kussakin pullossa oleva biomassa kunakin mittausajankohtana sekä biomassan mittausmenetelmä,
Light absorbing test materials may give rise to a growth rate reduction because shading reduces the amount of available light.
kasvukäyrät (biomassa ajan funktiona),
Such physical types of effects should be separated from toxic effects by modifying the test conditions and the former should be reported separately.
kunkin käsitellyn toiston lasketut vastemuuttujat sekä toistojen keskiarvot ja variaatiokerroin,
Guidance may be found in (2) and (3).
pitoisuuden ja vaikutuksen suhteen graafinen esitys,
TEST REPORT
myrkyllisyyden arvioinnit vastemuuttujien osalta, esimerkiksi EC50, EC10 ja EC20, ja vastaavat luottamusvälit;
The test report must include the following:
LOEC- ja NOEC-pitoisuudet, jos ne on laskettu, ja niiden määrityksessä käytetyt tilastomenetelmät,
Test chemical:
jos on käytetty ANOVA-analyysiä, havaittavissa olevan vaikutuksen suuruus (esimerkiksi vähiten merkitsevä erotus),
physical nature and relevant physical-chemical properties, including water solubility limit;
mahdollinen kasvun edistyminen käsitellyissä liuoksissa,
chemical identification data (e.g., CAS Number), including purity (impurities).
muut havaitut vaikutukset, esimerkiksi levien morfologiset muutokset,
Test species:
tulosten pohdinta, mukaan luettuna mahdolliset vaikutukset, joita tästä testimenetelmästä poikkeamisella on ollut testin tuloksiin.
the strain, supplier or source and the culture conditions used.
Lisäys 1
Test conditions:
Määritelmät
date of start of the test and its duration;
Tässä testimenetelmässä käytetään seuraavia määritelmiä ja lyhenteitä: Biomassa
description of test design:
Kemikaali aine tai seos.
test vessels, culture volumes, biomass density at the beginning of the test;
Variaatiokerroin Parametrin vaihtelua ilmaiseva dimensioton suure, joka määritellään keskihajonnan ja keskiarvon suhteeksi.
composition of the medium;
Se voidaan ilmaista myös prosenttiarvona.
test concentrations and replicates (e.g., number of replicates, number of test concentrations and geometric progression used);
Rinnakkaisten kontrolliviljelmien keskimääräisen spesifisen kasvunopeuden keskimääräinen variaatiokerroin lasketaan seuraavasti:
description of the preparation of test solutions, including use of solvents etc.
Keskimääräisen spesifisen kasvunopeuden variaatiokerroin lasketaan (prosentteina) kunkin rinnakkaisviljelmän päivittäisistä tai jaksoittaisista kasvunopeuksista.
culturing apparatus;
Lasketaan kaikkien kohdassa 1 laskettujen arvojen keskiarvo, jotta saadaan rinnakkaisten kontrolliviljelmien päivittäisen tai jaksoittaisen spesifisen kasvunopeuden keskimääräinen variaatiokerroin.
light intensity and quality (source, homogeneity);
Ecx
temperature;
Testiviljelyaineeseen liuenneen testikemikaalin pitoisuus, jossa testattavan eliön kasvu vähenee x prosenttia (esimerkiksi 50 prosenttia) määrätyn altistusajan kuluessa (altistusaika on mainittava erikseen, jos se poikkeaa testin kokonaiskestosta tai normaalista kestosta).
concentrations tested:
Jotta kasvunopeudesta ja tuotoksesta johdetut EC-arvot erottuisivat selvästi toisistaan, edellisestä käytetään symbolia ’ErC’ ja jälkimmäisestä symbolia ’EyC’.
the nominal test concentrations and any results of analyses to determine the concentration of the test chemical in the test vessels.
Viljelyaine Täydellinen synteettinen ravinneliuos, jossa testilevät kasvavat, kun ne altistetaan testikemikaalille.