natgillin/translations-raw huggingface dataset:
Unless prior information such as information on solubility limits or cytotoxicity provides a basis for selecting test concentrations, it is recommended that the test concentrations for the initial run be spaced at log10 intervals with 10–3 M being the maximum concentration.
Vahvista [26]
If the chemical is soluble, and not cytotoxic at any of the tested concentrations, and the first run was negative for all concentrations, then it is to be confirmed in one more run using the same conditions as the first run was conducted (Table 7).
Lopeta
If the results of the first run are equivocal (i.e. the fold-change is statistically significant from the SC at only one concentration) or positive (i.e. the fold change at two or more adjacent concentrations is statistically significant), the test should be repeated as indicated in Table 7 by refining the selected test concentrations.
Tarkenna [27]
Test concentrations in runs two and three (if applicable) should be adjusted on the basis of the results of the initial run bracketing concentrations that elicited an effect using 1/2-log concentration spacing (e.g. if the original run of 0,001, 0,01, 0,1, 1, 10, 100, 1000 μM resulted in inductions at 1 and 10 μM, the concentrations tested in the second run should be 0,1, 0,3, 1, 3, 10, 30, 100 μM), unless lower concentrations need to be employed to achieve a LOEC.
Epäselvä [28] Tarkenna [27] Positiivinen X Positiivinen
In the latter case, at least five concentrations below the lowest concentration tested in the first run should be used in the second run using a 1/2-log scale.
Laadunvalvonta testilevyllä
If the second run does not confirm the first run (i.e. statistical significance does not occur at the previously positively tested Live/Deadconcentration ± 1 concentration-increment), a third experiment is to be conducted using the original testing conditions.
Sen lisäksi, että laadunvalvontalevyn kriteerit täyttyvät, muut laadunvalvontakriteerit, jotka koskevat hyväksyttävää vaihtelua rinnakkaisten levyjen välillä, rinnakkaisia kokeita, hormonien mittausjärjestelmien lineaarisuutta ja herkkyyttä, samaa näytettä koskevien rinnakkaisten hormonien mittausten vaihtelua ja hormonilisäyksien talteenottoprosenttia kasvatusliuoksen uuttamisen jälkeen (jos tämä tehdään, katso 30 kohta uuttamista koskevista vaatimuksista), olisi täytettävä, ja ne esitetään taulukossa 8.
Equivocal results in the first run are considered negative if the observed effect could not be confirmed in any of the two subsequent runs.
Tietojen pitäisi sopia hyväksyttäviin vertailuväleihin, jotka määritellään kutakin sellaista parametria kohden, jota tarkastellaan täydentävää arviointia varten.
Equivocal results are considered as positive responses (effect) when the response can be confirmed in at least one more run within a ± 1 concentration increment (see section 55 for the Data Interpretation Procedure).
Jos nämä kriteerit eivät täyty, taulukossa olisi todettava, että kyseinen näyte ei täytä laadunvalvontakriteerejä, ja näytettä olisi analysoitava uudelleen tai se olisi poistettava tietokokonaisuudesta.
Table 7
Taulukko 8
Decision matrix for possible outcome scenarios
Hyväksyttävät vertailuvälit ja/tai vaihtelu (%) H295R-testin testilevyn parametreja varten.
Run 1
LOQ: hormonien mittausjärjestelmän määritysraja.
Run 2
CV:
Run 3
variaatiokerroin;
Decision
hajoaminen minuuttia kohti (disintegration per minute) Vertailu välillä T E2
Scenario
Hormonin perustuotanto liuotinkontrollissa Kertaväli suurempi kuin LOQ
Positive
≥ 5-kertainen
Confirm [26]
≥ 2,5-kertainen
Stop
Altistuskokeet — levyllä, variaatiokerroin liuotinkontrolleja varten (rinnakkaiset levyt)
Refine [27]
Absoluuttiset pitoisuudet
Equivocal [28]
Altistuskokeet — levyjen välillä, variaatiokerroin liuotinkontrolleja varten (toistetut kokeet)
Quality Control of the Test Plate
Kerrannaismuutos
In addition to meeting the criteria for the QC plate, other quality criteria that pertain to acceptable variation between replicate wells, replicate experiments, linearity and sensitivity of hormone measurement systems, variability between replicate hormone measures of the same sample, and percentage recovery of hormone spikes after extraction of medium (if applicable; see Paragraph 30 regarding extraction requirements) should be met and are provided in Table 8.
Hormonien mittausmenetelmän herkkyys
Data should fall within the acceptable ranges defined for each parameter to be considered for further evaluation.
Liuotinkontrolliin liittyvä havaittavissa oleva kertavähennys
Table 8
Kasvatusliuoksen uuttaminen — sisäisen 3H-standardin uudelleenkäyttö (jos sovelletaan)
Acceptable ranges and/or variation (%) for H295R assay test plate parameters.
≥ 65 % nimellinen
(LOQ: Limit of Quantification of the hormone measurement system.
TIETOJEN ANALYSOINTI JA RAPORTOINTI
CV: Coefficient of variation; SC: Solvent Control; DPM: Disintegrations per minute)
Tietojen analysointi
Comparison Between
Kemiallisesti muunnetun hormonintuotannon suhteellisen lisäyksen/vähennyksen arvioimiseksi tuloksia olisi normalisoitava kunkin testilevyn liuotinkontrollin keskiarvoon nähden, ja tulokset olisi ilmaistava muutoksena suhteessa liuotinkontrolliin kullakin testilevyllä.
Basal hormone production in SCs
Kaikki tiedot ilmaistaan keskimääräisenä ± 1 keskihajontana.
Fold-greater than LOQ
Ainoastaan hormonitiedot kuopista, joissa sytotoksisuus on alle 20 %, pitäisi sisällyttää tietojen analysointiin.
≥ 5-fold
Suhteelliset muutokset lasketaan seuraavasti:
≥ 2,5-fold
Suhteellinen muutos = (hormonien pitoisuus kussakin kuopassa) ÷ (keskimääräinen hormonipitoisuus kaikissa liuotinkontrollin kuopissa).
Exposure Experiments — Within Plate CV for SCs (Replicate Wells)
Jos kuopan silmämääräinen tutkimus tai 42 kohdassa kuvattu elinkykyä/sytotoksisuutta koskeva testi osoittaa, että solujen määrä on nähtävästi lisääntynyt, tämä on tarkistettava.
Absolute Concentrations
Ennen tilastoanalyysien tekoa oletuksia normaalisuudesta ja varianssien homogeenisuudesta olisi arvioitava.
Exposure Experiments — Between Plate CV for SCs (Replicate Experiments)
Normaalisuutta olisi arvioitava käyttämällä tavallisia todennäköisyyskuvioita tai muita asianmukaisia tilastotieteellisiä menetelmiä (kuten Shapiron-Wilkin testi).
Detectable fold-decrease relative to SC
Tilastollisia arviointeja tehdään kunkin kuopan keskimääräisten arvojen perusteella.
Hormone Measurement System — Replicate Measure CV for SCs [29]
Ne edustavat riippumattomia kaksoismääritettyjä datapisteitä.
Medium Extraction — Recovery of Internal 3H Standard (If Applicable)
On odotettavissa, että ensimmäisen testiajon annosten suuren välin (log10-asteikko) vuoksi monissa tapauksissa ei ole mahdollista määritellä selvää pitoisuus-vaste-suhdetta, jossa kaksi suurinta annosta on sigmoidikäyrän lineaarisessa osassa.
DPM
Tästä syystä ensimmäisessä testiajossa tai kaikissa muissa tietojen kartoitustoimissa, missä tämä olosuhde esiintyy (eli missä ei voida arvioida suurinta tehokkuutta), sovelletaan edellä mainitut tyypin 1 kiinteitä muuttujia koskevia tilastotietoja.
≥ 65 % Nominal
Jos enemmän kuin kaksi datapistettä on käyrän lineaarisessa osassa ja jos suurin tehokkuus voidaan laskea — kuten on odotettavissa joissakin toisissa testiajoissa, jotka suoritetaan käyttäen puolen login pitoisuusvälejä — todellisten pitoisuuksien laskentaan olisi käytettävä probitti- tai logittimallia taikka muuta asiaankuuluvaa regressiomallia (kuten EC50 ja EC20).
To evaluate the relative increase/decrease in chemically altered hormone production, the results should be normalised to the mean SC value of each test plate, and results expressed as changes relative to the SC in each test plate.
Kuva 3
All data are to be expressed as mean ± 1 standard deviation (SD).
Esimerkki H295R-testin suorittamisen aikana saatujen tietojen esittämisestä ja arvioinnista graafisessa ja taulukkomuodossa.
Only hormone data from wells where cytotoxicity was less than 20 % should be included in the data analysis.
Asteriskit osoittavat tilastollisesti merkittävät erot liuotinkontrolliin nähden (p < 0,05).
Relative changes should be calculated as follows:
alhaisin havaittavan vaikutuksen aiheuttava pitoisuus;
Relative Change = (Hormone concentration in each well) ÷ (Mean hormone concentration in all solvent control well).
Maksimimuutos:
If by visual inspection of the well or as demonstrated by the viability/cytotoxicity assay described in paragraph 42 there appears to be an increase in cell number, the apparent increase needs to be verified.
missä tahansa pitoisuudessa havaitun vasteen suurin vahvuus verrattuna keskimääräiseen liuotinkontrollin vasteeseen (= 1)
Prior to conducting statistical analyses, the assumptions of normality and variance homogeneity should be evaluated.
Kolesteroli
Normality should be evaluated using standard probability plots or other appropriate statistical method (e.g. Shapiro-Wilk's test).
Pregnenoloni
If the data (fold changes) are not normally distributed, transformation of the data should be attempted to approximate a normal distribution.
lfa-hydroksipregnenoloni
If the data are normally distributed or approximate a normal distribution, differences between chemical concentration groups and SCs should be analysed using a parametric test (e.g. Dunnett's Test) with concentration being the independent, and response (fold-change) being the dependent variable.
Progesteroni
If data are not normally distributed, an appropriate non-parametric test should be used (e.g. Kruskal Wallis, Steel's Many-one rank test).
lfa-hydroksiprogesteroni
Differences are considered significant at p ≤ 0,05.
Androstenedioni
Statistical evaluations are done based on average values for each well that represent independent replicate data points.
Testosteroni