natgillin/translations-raw huggingface dataset:
Functional profiling studies, such as those involving the detection of protein interaction networks or the effects of perturbations with small molecules or siRNAs on cellular phenotypes, offer a complementary approach for the identification of molecular vulnerabilities that can be exploited in the development of new treatment strategies.
Funktionaaliset profiloinnit, jotka perustuvat proteiinimolekyylien välisiin vuorovaikutussuhteisiin tai geenien ilmenemisen hiljentämiseen joko RNA-interferenssi-tekniikalla tai lääkemolekyylien avulla mahdollistavat vaihtoehtoisen tavan etsiä uusia kohdemolekyylejä sairauksien kohdennettuun hoitoon.
The goal of this thesis was to develop computational systems biology methods for supporting such functional endeavors, and through their application use cases, to elucidate novel disease driver signals in cancer and Alzheimer’s disease networks.
Tämän väitöskirjatyön tavoitteena oli kehittää laskennallisia, systeemibiologian menetelmiä, joiden avulla funktionaalisten profilointien tuloksia voidaan paremmin käyttää etsittäessä eri syöpämuotojen sekä Alzheimer-taudin mekanismeja sekä niihin kohdennettuja hoitokeinoja.
However, the molecular driver signals for many complex diseases cannot be easily derived from genome sequencing.
On kuitenkin useita sairauksia, sekä myös syövän eri alimuotoja, joiden syntymekanismit eivät ilmene tai ole helposti löydettävissä genomisekvenssin tasolla.
Genomics-based drug discovery utilizing sequencing data for elucidation of candidate targets has led to the development of a number of successful treatments in the last decades.
Genomisekvenssointiin perustuva lääkeainekehitys missä lähdetään liikkeelle potentiaalisista tautigeeneistä on tuottanut uudensukupolven kohdennettuja hoitomuotoja eri sairauksiin, etenkin syöpäsairauksiin, joiden kehitys pohjaa tunnettuihin syöpägeeneihin.
The resulting minimization problem is solved using the iterative soft thresholding algorithm (ISTA).
Se johtaa minimisaatio-ongelmaan, joka ratkaistaan iteratiivisella pehmeää kynnystystä käyttävällä algoritmilla (iterative soft thresholding algorithm eli ISTA).
X-ray computed tomography is an imaging method where the inner structure of an object is reconstructed from X-ray images taken from multiple directions around the object.
Röntgentomografia on kuvantamismenetelmä, jolla pyritään selvittämään objektin sisärakenne eri suunnista otettujen röntgenkuvien perusteella.
This is achieved using variants of proportional-integral-derivative (PID) controllers.
Tätä varten käytämme variaatioita proportional-integral-derivative-säätimestä (PID-säädin).
Adaptive variants are very end user friendly, avoiding the manual tuning of parameters.
Adaptiiviset säätimet ovat hyvin käyttäjäystävällisiä, koska ne eivät vaadi manuaalista parametrien säätöä.
When measurements from only a few measurement directions are available, the problem becomes severely ill-posed and requires regularization.
Kun käytettävissä on kuvia vain hyvin pienestä määrästä suuntia, tomografiaongelma on äärimmäisen huonosti asetettu ja sen ratkaisu vaatii regularisointia.
The PID control allows the regularization parameter to be selected during the iteration, thus making the overall reconstruction process relatively fast.
PID-säätimet mahdollistavat regularisointiparametrin valinnan algoritmin suorituksen aikana, tehden näin koko rekonstruktioprosessista verrattain nopean.
The results indicate that variants of the PID controllers are effective for sparsity based regularization parameter selection.
Tulokset osoittavat että eri PID-säädinvariantit voivat toimia regularisointiparametrin valinnassa.
The two adaptive methods are compared to each other, and additionally the adaptive integral controlled ISTA is compared to two classical reconstruction methods: filtered back projection and Tikhonov regularization.
Lopuksi vielä vertaamme adaptiivisella integraalisäätimellä säädettyä ISTA:a kahteen klassiseen rekonstruktioalgoritmiin: suodatettuun takaisinprojektioon (filtered back projection, FBP) ja Tikhonov regularisointiin.
The adaptive integral controlled ISTA also outperforms the classical reconstruction methods both in terms of relative error and visual inspection when only a few measurement directions are available.
Adaptiivisella integraalisäätimellä säädetty ISTA myös päihitti molemmat klassiset menetelmät sekä suhteellisen virheen että visuaalisen arvioinnin suhteen harvan datan tapauksessa.
Computations are performed using both real and simulated X-ray data, with varying amounts of available measurement directions.
Kokeissa käytetään sekä aitoa että simuloitua röntgendataa sekä verrattain tiheällä että harvemmalla mittauskulmien jakaumalla.
The integral control is shown to be crucial for the regularization parameter selection while the proportional and derivative terms can be of use if additional control is required.
Integraalisäätö on osoitettiin tärkeäksi regularisointiparametrin valinnassa, kun taas kahta muuta termiä voidaan hyödyntää tarpeen vaatiessa.
Of the two adaptive variants, the adaptive integral control performs better with respect to all measured figures of merit.
Adaptiivisista säätimistä adaptiivinen integraalisäädin osoittautui kaikin kriteerein paremmaksi.
This involves choosing a regularizer with desirable properties, as well as a value for the regularization parameter.
Regularisointi koostuu sopivan regularisoijan ja regularisointiparametrin arvon valinnasta.
In this thesis, sparsity promoting regularization with respect to the Haar wavelet basis is considered.
Tämä tutkielma käsittelee tapausta, jossa halutaan regularisoida rekonstruktion harvuutta Haarin aallokekannan suhteen.
We study how different tunings affect the reconstruction process, and experiment with two adaptive variants of PID controllers: an adaptive integral controller, and a neural network based PID controller.
Vertailemme näitä kahta varianttia, adaptiivista integraalisäädintä ja neuroverkkoihin perustuva PID-säädintä, toisiinsa.
The regularization parameter is then varied on each iteration of the algorithm so that the resulting reconstruction has the desired level of sparsity.
Regularisointiparametri valitaan olettamalla että käytettävissä on a priori tunnettu harvuustaso, eli luku joka kertoo kuinka suuri osuus objektia kuvaavista aallokekertoimista on erisuuria kuin nolla, ja säätämällä regularisointiparametria iteraation aikana niin, että rekonstruktion harvuus saavuttaa kyseisen tason.
PID controllers require tuning to guarantee that the desired sparsity level is achieved.
Jotta haluttu harvuustaso saavutetaan tulee säädin virittää sopivasti.
This makes it easier to use sparsity promoting regularization in real life applications.
Lisäksi säätimet ovat verrattain yksinkertaisia, joten niiden soveltaminen eri tilanteissa on helppoa.
The thesis has two parts.
Tutkielma koostuu kahdesta osasta.
Our result is new and gives a family of Bonnesen type inequalities depending on the parameter s>1.
Tulos on uusi ja se antaa perheen Bonnesenin epäyhtälöitä, jotka riippuvat parametrista s>1.
We show that the methods that have been applied to John domains in the literature, suitably modified, can be applied to s-John domains.
Artikkelissa osoitetaan, että menetelmät, joita on kirjallisuudessa sovellettu John alueille, voidaan käyttää myös s-John alueiden tapauksessa.
In the second chapter we discuss some known quantitative isoperimetric inequalities as well as their proofs.
Toisessa luvussa tutustutaan joihinkin tunnettuihin kvantitatiivisiin isoperimetrisiin epäyhtälöihin sekä niiden todistuksiin.
The goal of this thesis is to introduce the isoperimetric inequality and various quantitative isoperimetric inequalities.
Tämän tutkielman tavoitteena on esitellä isoperimetrinen epäyhtälö ja joitakin kvantitatiivisia isoperimetrisiä epäyhtälöitä.
In this paper we prove a Bonnnesen type inequality for so called s-John domains, s>1, in R^n.
Tutkielman toinen osa on tätä tutkielmaa varten kirjoitettu artikkeli, jossa todistetaan Bonnesenin epäyhtälö niin kutsutuille s-John alueille, s>1, avaruudessa R^n.
The first one is an overview of the isoperimetric inequality in R^n and some of the known quantitative isoperimetric inequalities.
Ensimmäinen osa on yleiskatsaus isoperimetriseen epäyhtälöön avaruudessa R^n ja joihinkin tunnettuihin kvantitatiivisiin isoperimetrisiin epäyhtälöihin.
In the first chapter we introduce the isoperimetric inequality and show some possible methods of proving the isoperimetric inequality in R^n for both n=2 and n≥3.
Ensimmäisessä luvussa esitellään isoperimetrinen epäyhtälö ja joitakin todistusmenetelmiä sekä tasossa että korkeammissa ulottuvuuksissa.
Examples of the application of the developed imaging technology to dental intra oral and panoramic and to real time X-ray imaging are given.
Antureiden rakenne ja toiminta selostetaan seikkaperäisesti ja niiden soveltamisesta hammaskuvaukseen ja reaaliaikaiseen videoröntgenkuvantamiseen annetaan esimerkkejä.
The structure and operation of CdTe, CdZnTe and Si pixel detectors based on crystalline semiconductors, bump bonding and CMOS technology and developed mainly at Oy Simage Ltd. And Oy Ajat Ltd., Finland for X- and gamma ray imaging are presented.
Työssä esitellään Suomessa kehitettyjä uudentyyppisiä digitaalisia röntgen- ja gammakuvausantureita, jotka perustuvat pii- ja CdTe-puolijohdeteknologiaan.
Radiation hardness issues related to gamma and X-ray imaging detectors are discussed.
Työssä esitellään myös fotonilaskentaan perustuvan CdTe gammakuvausanturin toiminta simuloinnein ja mittauksin sekä käsitellään antureiden säteilynkestoon liittyviä kysymyksiä.
The total cross-section will be measured with the luminosity independent method that requires the simultaneous measurements of the total inelastic rate and the elastic proton scattering down to four-momentum transfers of a few 10^-3 GeV^2, corresponding to leading protons scattered in angles of microradians from the interaction point.
Protoni ja neutroni, joista koko meitä ympäröivä stabiili aine koostuu, rakentuvat kvarkeista ja niitä sitovista voimahiukkasista, gluoneista.
This will be achieved using silicon microstrip detectors, which offer attractive properties such as good spatial resolution (<20 um), fast response (O(10ns)) to particles and radiation hardness up to 10^14 "n"/cm^2.
Tutkimusta varten rakennettujen hiukkaskiihdyttimien avulla on kyetty selvittämään atomin ydinhiukkasten, protonien ja neutronien, hienorakennetta.
Planar Edgeless Detectors for the TOTEM Experiment at the LHC
Toinen esimerkki CERN:in tuottamasta teknologiasta on World Wide Web.
This work reports about the development of an innovative structure at the detector edge reducing the conventional dead width of 0.5-1 mm to 50-60 um, compatible with the requirements of the experiment.
Kokeellisen hiukkasfysiikan tutkimus on haastavaa ja vaikka aineen rakenteen tuntemus on huomattavasti edistynyt muutamassa vuosikymmenessä, jokainen saavutettu tulos herättää uusia kysymyksiä.
They were also imaged with the DEI technique.
Näytteet kuvattiin myös DEI-tekniikalla.
Several breast tissue samples were studied by SAXS technique in the European Synchrotron Radiation Facility (ESRF) in Grenoble, France.
Useita rintasyöpänäytteitä tutkittiin SAXS-menetelmällä yhteiseurooppalaisessa synkrotronisäteilylaitoksessa (European Synchrotron Radiation Facility, ESRF) Ranskan Grenoblessa.
This technique is of especial interest in the cases were the densities of the tissues are very similar (like in mammography) and the absorption images do not offer enough contrast.
Tämä menetelmä on erityisen kiinnostava sellaisissa tilanteissa, joissa tutkittavien kudosten tiheydet ovat hyvin lähellä toisiaan (kuten mammografiassa) ja vaimenemiseen pohjautuvat kuvat eivät täten tarjoa riittävä kontrastia.
The phenomenon of scattering is a nuisance to radiography in general, and to mammography in particular, because it reduces the quality of the images.
Sironta on radiografian, ja erityisesti mammografian, kannalta haitallista koska se huonontaa kuvien laatua.
Some pathologies, like breast cancer, produce alterations to the structures of the tissues, being especially evident in collagen-rich tissues.
Joihinkin sairauksiin, kuten esimerkiksi rintasyöpään, liittyy kudosten rakenteessa tapahtuvia muutoksia, jotka ovat erityisen hyvin nähtävissä kollageenia sisältävillä alueilla.
The thesis demonstrates that the x-ray scattering signal can be used to characterize tissues and that it carries important information about the pathological state of the breast tissues, thus showing the potential of the SAXS technique as a possible diagnostic tool for breast cancer.
Tämä väitöskirja osoittaa, että röntgensirontaa voidaan käyttää kudosten karakterisoimiseen ja että sironta sisältää tärkeää tietoa rintakudoksen patologisesta tilasta, osoittaen näin että SAXS-menetelmän potentiaalin rintasyövän diagnostiikassa.
However, scattered x-rays bear very useful information about the structure of the tissues at the supra-molecular level.
Sironneet röntgensäteet sisältävät kuitenkin erittäin käyttökelpoista tietoa kudosten rakenteesta supramolekulaarisella tasolla.
The diffraction enhanced imaging (DEI) technique uses a perfect crystal to convert the angular deviations of the x-rays into intensity variations, which can be recorded as images.
diffraction enhanced imaging, DEI) on menetelmä, jossa röngtensäteen suunnanmuutokset muutetaan täydellisen kiteen avulla intensiteetinmuutoksiksi, joista voidaan muodostaa kuva.
It was found that the collagen fibrils in invaded tumours were thinner and had a d-spacing length 0,7% longer that fibrils from healthy tumours.
Syöpäkasvaimessa olevien kollageenisäikeiden havaittiin olevan ohuempia, ja niihin liittyvän säikeen suuntaisen jaksollisuuden havaittiin olevan 0.7% suurempi kuin terveessä kudoksessa.
On the other hand, the change of direction due to refraction of the x-rays on the tissue boundaries can be mapped.
Toisaalta, röntgensäteiden suunnanmuutokset kudosten rajapinnoilla voidaan kartoittaa.
Clinical radiography is based on the absorption of the x-rays when passing right through the human body and gives information about the densities of the tissues.
Kliininen radiografia pohjautuu röntgensäteiden vaimenemiseen kehon läpäisemisen yhteydessä antaen tietoa kudosten tiheydestä.
The scattering signals from the breast tissues were compared with the histology by building colour-coded maps across the samples.
Rintakudoksesta tulevaa sirontasignaalia verrattiin histologisiin tutkimuksiin käyttämällä tutkittavasta näytteestä tehtyjä värikoodattuja karttoja.
It includes several scattering peaks and scattering features that carry information about the size and the spacing of the collagen fibrils in the tissues.
Sirontakuvio kollageenista sisältää tunnuksenomaisina piirteinä useita sirontapiikkejä ja piirteitä, jotka kertovat kollageenisäikeiden koosta ja säikeiden välimatkasta.
There was a total agreement between the scattering maps, the morphological features seen in the images and the information of the histo- pathological examination.
Sironnasta tehtyjen karttojen, kuvissa näkyvien morfologisten piirteiden ja histopatologisten tutkimusten välillä oli hyvä yhteensopivuus.
The scattering signals from adipose tissue (fat), connective tissue (collagen) and necrotic tissue were identified.
Rasvakudoksesta, sidekudoksesta (kollageeni) ja kuolioituneesta kudoksesta tulevat sirontakuviot tunnistettiin.
Besides being absorbed, x-rays may change their direction within the tissues due to elastic scattering or even to refraction.
Vaimenemisen lisäksi röntgensäteiden etenemissuunta voi muuttua kudoksen läpi kulkiessaan sironnan tai taittumisen ansiosta.
Scattering patterns of the different tissues of the breast were acquired and compared with the histology of the samples.
Rinnan eri kudostyyppien sirontakuviot mitattiin ja näitä verrattiin näytteistä tehtyihin histologisiin tutkimuksiin.
This thesis explores the structural differences existing in healthy and pathological collagen in breast tissue samples by the small-angle x-ray scattering (SAXS) technique and compares these differences with the morphological information found in the DEI images and the histo-pathology of the same samples.
Tässä väitöskirjassa tutkitaan terveessä ja sairaassa rintakudoksessa olevan kollageenin rakenteellisia eroja pienille kulmille tapahtuvan röngensironnan (engl.
This thesis is a study of the x-ray scattering properties of tissues and tumours of the breast.
Rintakudosnäytteiden tutkiminen röntgensironnan ja diffraktiotehosteisen kuvantamisen avulla Tässä väitöskirjassa tarkastellaan rinnan kudosten ja kasvainten aiheuttamaa röntgensirontaa.
Moreover, a clear distinction could be done between the scattering signals from healthy collagen and from collagen from an invasive tumour.
Terveestä ja syöpäkasvaimessa olevasta kollageenista tulevat sirontakuviot pystyttiin selvästi erottamaan toisistaan.
X-ray scattering and diffraction enhanced imaging studies of in vitro breast tissues
Rintakudosnäytteiden tutkiminen röntgensironnan ja diffraktiotehosteisen kuvantamisen avulla
Reconnection in Earth's magnetosphere
Rekonnektio Maan magnetosfäärissä
In particular, near the High Frequency band (High Frequency, 3 MHz to 30 MHz), ordinary shortwave radios can, in principle, be used as detectors.
Erityisesti HF-taajuusalueella (High Frequency, 3 MHz - 30 MHz) voidaan periaatteessa käyttää tavallista lyhytaaltoradiota.
The dissertation analyzes the conditions under which this integrated energy can be used to estimate the distance to the flash.
Tutkimuksessa selvitetään, millä edellytyksillä tätä kokonaisenergiaa voidaan käyttää salaman etäisyyden arviointiin.
Flashes can, in principle, be detected at distances of more than 100 km, but since the ground conductivity can vary, ranging accuracy drops dramatically at distances larger than 20 km.
Salamaniskuja voidaan periaatteessa havaita yli sadan kilometrin etäisyydeltä, mutta maanpinnan johtavuuserojen takia etäisyysarvion tarkkuus heikkenee huomattavasti, kun etäisyys on yli 20 kilometriä.
Thus, if the radiation is measured at a single narrow frequency band, it is difficult to identify the sub-processes, and some sub-processes can be missed altogether.
Jos säteilyä siis mitataan yhdellä kapealla taajuuskaistalla, yksittäisiä aliprosesseja on vaikea tunnistaa, ja jotkin aliprosessit saattavat jäädä kokonaan havaitsematta.
Electromagnetic signatures of lightning near the HF frequency band
Salamaprosessien sähkömagneettinen säteily HF-taajuusalueella
Nevertheless, simple statistical corrections are developed, which enable an accurate estimate of the distance to the closest edge of an active storm cell, as well as the approach speed.
Tutkimuksessa kehitetään kuitenkin yksinkertainen tilastollinen menetelmä, jolla voidaan riittävän tarkasti arvioida etäisyys myrskysolun lähimpään reunaan.
It is shown that multiple sub-processes radiate strongly near the HF band.
Tutkimuksessa osoitetaan, että useat aliprosessit aiheuttavat voimakasta säteilyä HF-taajuuksilla.
The results of the dissertation could therefore have practical applications in real-time short-range lightning detection and warning systems.
Tutkimuksessa havaittuja tuloksia voidaan soveltaa aktiivisten ukkosmyrskyjen reaaliaikaiseen havaitsemiseen ja niistä varoittamiseen.
However, narrowband detectors are simple to design and miniaturize.
Kapeakaistaisia mittauksia voidaan kuitenkin tehdä yksinkertaisilla ja pienikokoisilla laitteilla.
The dissertation deals with remote narrowband measurements of the electromagnetic radiation emitted by lightning flashes.
Tässä tutkimuksessa tarkastellaan salamoiden aiheuttaman sähkömagneettisen säteilyn etämittauksia.
The return stroke usually radiates intensely, but it cannot be reliably identified from the time-domain signal alone.
Pääsalaman säteily on erityisen voimakasta, mutta pääsalama on vaikea tunnistaa pelkän aikasignaalin pohjalta.
These sub-processes can last for tens to hundreds of milliseconds, many orders of magnitude longer than the return stroke.
Näiden aliprosessien kesto voi olla kymmeniä tai satoja millisekunteja, eli satoja kertoja pidempi kuin pääsalaman, ja kukin säteilee voimakkaimmin eri taajuuksilla.
This dissertation utilizes a prototype detector which is essentially a handheld AM radio receiver.
Työssä on käytetty prototyyppilaitetta, joka perustuu AM-radion toimintaperiaatteisiin.
It is shown that flash-by-flash variations are large, but the integrated energy is very sensitive to changes in the distance, dropping as approximately the inverse cube root of the distance.
Iskujen välillä on suuria eroja, mutta salamaniskujen kokonaisenergia muuttuu nopeasti etäisyyden funktiona.
The return stroke, which transfers electrical charge from the thundercloud to to the ground, is electromagnetically an impulsive wideband process; that is, it emits radiation at most frequencies in the electromagnetic spectrum, but its duration is only some tens of microseconds.
Se säteilee lähes kaikilla sähkömagneettisen spektrin taajuuksilla, mutta sen kesto on vain kymmeniä mikrosekunteja.
Measurements were made in Scandinavia, and several independent data sources were used to identify lightning sub-processes, as well as the distance to each individual flash.
Mittauksia suoritettiin Skandinaviassa, käyttäen useita riippumattomia vertailumittauksia.
These limitations mean that individual flashes cannot be ranged accurately using a single narrowband detector, and the useful range is limited to 30 kilometers at the most.
Näiden rajoitteiden perusteella voidaan todeta, että yhdellä kapeakaistaisella vastaanottimella ei voida realistisesti arvioida yksittäisten salamaniskujen etäisyyttä.
Each sub-process causes radiation with specific time-domain characteristics, having maxima at different frequencies.
Salama koostuu useista aliprosesseista, joilla kaikilla on erilaiset säteilyominaisuudet.
This means that a narrowband measurement is best used to characterize the energy of the radiation integrated over the whole flash, without attempting to identify individual processes.
Käytännössä kapeakaistaisesta signaalista voidaan arvioida salaman säteilemä kokonaisenergia koko salamaniskun ajalta.
Before and after the return stroke, multiple sub-processes redistribute electrical charges within the thundercloud.
Varaukset siirtyvät ukkospilven sisällä myös ennen ja jälkeen pääsalaman, ja nämä aliprosessit aiheuttavat pitkäkestoisempaa säteilyä.
This thesis first presents the conclusions of the first systematic analysis of the expected precision measurement of the leading proton momentum and the accuracy of the reconstructed missing mass.
Tällä hetkellä parhaiten alkeishiukkasia ja niiden välisiä vuorovaikutuksia kuvaava teoria on niin sanottu hiukkasfysiikan standardimalli , joka määrittää alkeishiukkasten massan ja vuorovaikutusvoimakkuuden hyvin tarkasti.
The main focus of the thesis is in developing the necessary radiation hard precision detector technology for coping with the extremely demanding experimental environment of the LHC.
Työssä osoitetaan, että nämä anturit soveltuvat LHC-kiihdyttimen asettamaan hankalaan toimintaympäristöön.
This process augments - in a model independent way - the standard methods for new particle searches at the Large Hadron Collider (LHC) and will allow detailed analyses of the produced central system, such as the spin-parity properties of the Higgs boson.
Väitöstyössä tarkastellaan LHC:n kykyä havaita uusia hiukkasia, kuten Higgs:in bosoni, vahvan vuorovaikutusvoiman välittäjähiukkasten, gluonien, törmäyksissä.
This work reports on the development of a novel semi-3D detector design that simplifies the 3D fabrication process, but conserves the necessary properties of the 3D detector design required in the LHC and in other imaging applications.
Väitöstyön painopiste on piipuolijohdeteknologiaan perustuvissa niin sanottujen 3D-antureiden suunnittelussa ja valmistuksessa.