natgillin/translations-raw huggingface dataset:
Detecting DNA modifications and adducts from nanopore sequencing data with deep learning methods
DNA:n muunnosemästen ja adduktien tunnistaminen nanopore-sekvensointidatasta syväoppimismenetelmillä
This signal can be used to detect epigenetic features such as DNA modifications, and potentially DNA adducts, without the need for separate study protocols.
Tätä signaalia voidaan hyödyntää myös emäsmuunnosten tunnistamiseen, ja mahdollisesti myös adduktien tunnistamiseen, ilman tarvetta erikoistuneille koeasetelmille.
Nanopore sequencing is a third-generation sequencing method that provides rich signal information along with basecall information.
Nanopore-sekvensointi on kolmannen sukupolven sekvensointimenetelmiin kuuluva teknologia, joka tuottaa emässekvenssin lisäksi signaalimittauksia, joiden avulla emästen tunnistaminen tehdään.
In this thesis, I studied deep learning methods for the detection of DNA modifications and adducts from nanopore sequencing data.
Diplomityössäni tutkin syväoppimismenetelmiä DNA:n muunnosemästen sekä adduktien tunnistamiseen nanopore-sekvensointidatasta.
However, detecting DNA modifications, such as 5-methylcytosine (5mC) methylations, using NGS-methods requires specific study protocols.
Näillä menetelmillä DNA:n muunnosemästen, kuten 5-metyylisytosiinin, tunnistaminen vaatii erikoistuneita koeasetelmia, kuten bisulfiittisekvensointia.
The methylation detection model performs comparably to the state-of-the-art methods but the training time of the model is drastically lower due to the model architecture.
Tämä metylaatioiden tunnistamiseen tehdyn mallin tarkkuus on verrattavissa alan lippulaivamalleihin, mutta neuroverkkoarkkitehtuurinsa vuoksi sen kouluttaminen on huomattavasti nopeampaa kuin kirjallisuudessa esitetyn syväoppimismallin, johon vertasin malliani.
In this work, I propose a novel neural network architecture that can detect 5mC-methylations at high accuracy.
Esitän tässä diplomityössä uuden syväoppimismallin, joka pystyy tunnistamaan 5-metyylisytosiinin nanopore-sekvensointidatasta korkealla tarkkuudella.
The most popular methods for DNA sequencing are the next-generation sequencing (NGS) methods such as Illumina sequencing.
Nykyisin käytetyimmät menetelmät DNA:n sekvensointiin hyödyntävät nopeaa suurtehosekvensointia, kuten Illumina-sekvensointi.
Molecular dynamics simulations of radiation damage in amorphous metals
Säteilyvaurioiden tietokonesimulaatioita amorfisissa metalleissa
Project based enquiries of procurements are made at different stages of the design process and, in some cases, with very incomplete designs.
Projektikohtaisesti hankintakyselyt tehdään suunnitteluprosessin eri vaiheissa ja joissain tapauksissa hyvin keskeneräisillä suunnitelmilla.
Errors made by the modeler could have been avoided with careful and logical modeling according to the BEC instructions.
Mallintajan tekemät virheet olivat vältettävissä huolellisella ja johdonmukaisella BEC-mallinnusohjeiden mukaisella mallinnustavalla.
If the bills of quantities produced by the structural engineer are to be used as binding information in offers during the procurement process in the future, also verifying the correctness of the required accuracy level of the quantities should be included as part of the quality-ensuring process performed by the structural engineer.
Jos tulevaisuudessa hankintaprosessissa tullaan käyttämään rakennesuunnittelijan tuottamia määräluetteloita tarjousten sitovina määrätietoina, tulisi tällöin tarjousvaiheen määrien vaaditun tarkkuustason oikeellisuuden tarkastaminen kuulua rakennesuunnittelijan tekemään laadunvarmistusprosessiin.
The errors in the bill layout functionality could be repaired or the faulty functions could be replaced by better performing ones.
Luettelopohjien toiminnallisuuksien virheet olivat korjattavissa tai muutettavissa paremmin toimiviin toimintoihin.
This study also discusses suggestions for further development in order to eliminate the sources of error and improve the usability of the tools.
Tutkimustyössä pohdittiin myös jatkokehitysideoita määrätietojen virhelähteiden korjaamiseksi ja työ-kalujen hankalien käyttöominaisuuksien parantamiseksi.
The research identified several sources of error in the quantity information produced by BEC bills of quantities: errors made by the modeler or caused by the accuracy level of the information model, errors in the environment in which the modeling software was used, in the bill layout features or in the delivery of the information model, and software errors.
Tutkimuksessa selvinneitä tarjousvaiheen BEC-määräluetteloiden tuottamien määrätietojen virhelähteitä olivat: mallintajan tekemä tai tietomallin tarkkuustasosta johtuva virhe, virhe mallinnusohjelmiston käyttöympäristössä, luettelopohjan toiminnoissa tai tietomallitoimituksessa ja ohjelmistovirhe.
The use of building information models in construction projects is becoming increasingly commonplace; however, quantity take-off is still done by measuring from blueprints and calculating manually.
Tietomallien käyttö rakennushankkeissa yleistyy jatkuvasti, mutta edelleen määrälaskentatyö tehdään piirustuksista mitaten ja käsin laskemalla.
The subject is approached from the viewpoint of a structural engineer, using Tekla Structures 19.1 for the research.
Tutkimuksessa käytettiin Tekla Structures -mallinnusohjelmiston 19.1-versiota.
Some of the errors were reported to the software provider or other parties responsible for the updating of bill layouts.
Osa virheistä raportoitiin tutkimuksen edetessä ohjelmistotoimittajalle tai luettelopohjien päivittämisestä vastaavalle taholle.
The figures in the bill of quantities produced from the structure model are compared to the manually calculated quantities, the quantity information from the IFC model, as well as the quantities provided by the precast concrete factory.
Rakennemallista tuotettujen määräluetteloiden antamia määriä verrattiin tietomallista mitattuihin ja käsin laskettuihin määriin sekä IFC-mallista saatuihin määrätietoihin ja elementtitehtaan antamiin arvoihin.
This information is subsequently used for evaluating the reliability of the functionalities based on the bill layout.
Näiden tietojen avulla arvioitiin luettelopohjiin määritettyjen toiminnallisuuksien luotettavuutta.
This master’s thesis is an empirical study aiming to test the reliability of tendering stage building information model based bills of quantities of precast concretes produced in a BEC development project.
Tämä diplomityö on empiirinen tutkimus, jonka tavoitteena on testata BEC-kehityshankkeessa tuotettujen betonielementtien tarjousvaiheen tietomallipohjaisten määräluetteloiden luotettavuutta.
The functionality of the bill layout is examined through a case study of an example project model created according to instructions produced in the BEC development project.
Luettelopohjien toimivuuden tutkiminen toteutettiin tapaustutkimuksena BEC-kehityshankkeessa tuotettujen mallinnusohjeiden mukaan mallinnetun esimerkkikohteen mallin pohjalta.
This is a result from the unreliability of bills of quantities based on building information models.
Tämä johtuu siitä, että tietomallipohjaisiin määräluetteloihin ei ole uskallettu luottaa.
Reliability of building information model’s BEC bills of quantities produced by a structural engineer in the quantity take-off of precast concrete building during the tendering stage
Rakennesuunnittelijan tuottaman tietomallin BEC-määräluetteloiden luotettavuus betonielementtirakennuksen tarjousvaiheen määrälaskennassa
Due to this phenomenon, the tendering stage of construction projects frequently involves great quantities of overlapping work.
Tämän vuoksi rakennushankkeen tarjousvaiheessa tehdään paljon päällekkäistä työtä.
The thesis is divided into three parts: research project, implementation and summary.
Diplomityö on jaettu kolmeen osaan: tutkimusprojektiin, toteutukseen ja yhteenvetoon.
Design and Development of a Dynamic Object Model
Dynaamisen oliomallin suunnittelu ja toteutus
This thesis focuses on the dynamic object model and its usage for developing a software platform.
Tämä diplomityö keskittyy dynaamiseen oliomalliin ja sen hyödyntämiseen ohjelmistoalustaa kehitettäessä.
In the implementation part the knowledge inquired in the research project is put into practice by implementing a dynamic object model -based software platform.
Toteutusosiossa käytetään hyväksi tutkimusprojektin tietoja ja toteutetaan oma dynaamiseen oliomalliin perustuva konfiguroitava ohjelmistoalusta.
The thesis examines design patterns introduced in literature and scientific publications and tries to employ them in the development of a software platform.
Diplomityö tutkii dynaamista oliomallia kirjallisuudessa ja tieteellisissä julkaisuissa esitettyjen suunnittelun ratkaisumallien avulla ja pyrkii soveltamaan näitä ratkaisumalleja ohjelmistoalustan toteutukseen.
The research project focuses on finding out the techniques described in literature and scientific publications which make it possible to implement a dynamic object model -based configurable system.
Tutkimusprojektiosiossa tutustutaan kirjallisuuteen ja olemassa oleviin tekniikoihin, joiden avulla saavutetaan dynaamisen oliomallin kaltainen konfiguroitava järjestelmä.
The summary part focuses on evaluating the thesis and comparing the implementation of the dynamic object model to the solutions described in literature.
Yhteenvedossa arvioidaan diplomityön onnistumista ja verrataan toteutusta kirjallisuudessa esitettyihin ratkaisuihin sekä esitetään eriävyydet ja mahdolliset parannukset näihin ratkaisuihin.
The Simulation package is consisted of batch process simulator SuperPro Designer® and scheduling software SchedulePro®.
Simulointiohjelmisto koostuu SuperPro Designer®-prosessisimulaattorista ja SchedulePro®-aikataulutusohjelmasta.
Their conceptual design involves sizing of the main process by solving the mass and energy balances, batch scheduling, clean utility system quantification and plant investment cost evaluation.
Bio- ja lääkeaineprosessien konseptisuunnittelu sisältää yleensä pääprosessin mitoituksen aine ja energiataseen perusteella, prosessin eräaikataulun luomisen, käyttöhyödykejärjestelmien kapasiteetin selvittämisen ja laitoksen investointikustannuksen arvioinnin.
Bio and pharmaceutical processes are oftentimes batch processes.
Bio- ja lääkeaineprosessit ovat usein eräprosesseja, jonka vuoksi prosessia joudutaan tarkastelemaan dynaamisesti.
The simulated case processes are fractionation of human blood plasma and an industrial enzyme manufacturing process.
Esimerkkiprosessit ovat veriplasman fraktiointi Cohnin prosessilla ja teollisuusentsyymien valmistusprosessi.
The aim of the thesis is to examine can a commercial batch process simulator be used for the conceptual process design of bio and pharmaceutical processes.
Diplomityön tavoitteena on selvittää voiko kaupallista simulointiohjelmaa hyödyntää bio- ja lää-keaineprosessien konseptisuunnittelussa.
Utilization of commercial batch process simulator for the process design of bio and pharmaceutical processes
Kaupallisen eräsimulointiohjelman hyödyntäminen bio- ja lääkeaineprosessien prosessisuunnittelussa
A commercial batch process simulation package provided by Intelligen Inc. is evaluated by simulating two conceptual processes in the thesis.
Diplomityössä arvioidaan kaupallisen simulointiohjelmiston toimintaa simuloimalla kaksi esimerkkiprosessia.
As the result, the software package can be recommended for further testing and commissioning for the conceptual design of bio and pharmaceutical processes.
Simuloinnin perusteella voidaan todeta, että ohjelmisto soveltuu bio- ja lääkeprosessien suunnitteluun konseptisuunnitteluvaiheen tarkkuudella.
Collaborative information sharing in industrial projects
Jaettuun informaatioon perustuva kommunikointi ja yhteistyö
The investment of Machining Center in production of health care equipment
Koneistuskeskusinvestointi terveydenhuollon laitteiden valmistukseen
The text includes an edited discussion with the visual artist Antti Laitinen, which was held at Cafe Delivo on January 23, 2018.
Teksti pitää sisällään editoidun keskustelun kuvataiteilija Antti Laitisen kanssa, joka on käyty Cafe Delivossa 23. tammikuuta, 2018.
Portfolio presents my artistic concept in the exhibition context.
Portfolio esittelee taiteellisen konseptini näyttelykontekstissa.
I strive to reflect great environmental themes through my own personal research.
Pyrin töissäni heijastamaan suuria ympäristöaiheisia teemoja omien henkilökohtaisten tutkielmieni kautta.
I try to open my concept entirely from individual works to wall-hung installations.
Pyrin avaamaan konseptiani kokonaisuudessaan yksittäisistä teoksista seinälle ripustettaviin installaatioihin saakka.
In my artwork I study how to visualize the absurdity of owning a piece of nature through photography.
Tutkin taiteellisessa opinnäytteessäni sitä, miten visualisoida luonnon omistamisen absurdiutta valokuvan avulla.
I open my work through the golden age of Finnish painting, landscape photography tradition, performativity in photography and land art.
Avaan työskentelyäni Suomen maalaustaiteen kultakauden, maisemavalokuvauksen tradition, performatiivisen valokuvan ja maataiteen avulla.
The written part contains my reflections on my artistic work and work, related main themes and artistic references that have influenced to my artistic work.
Kirjallinen osio sisältää omia pohdintojani taiteellisesta työskentelystäni ja teoskokonaisuudesta, siihen liittyvistä pääteemoista ja taiteelliseen työhöni vaikuttaneista taiteellisista viittauksista.
My artistic work is called 100 Hectares of Understanding and it deals with 100 hectares of woodland that I have inherited in 1997.
Taiteellinen opinnäytteeni on nimeltään 100 Hectares of Understanding ja se käsittelee vuonna 1997 perimääni 100 hehtaarin metsäpalstaa.
The reason why the conversation is part of my thesis is that I see similarities between his work and mine.
Syy miksi keskustelu on osana kirjallista opinnäytetyötäni, on se, että näen Antin työskentelytavassa ja hänen töissään samankaltaisuutta omaan työskentelyyni.
My master's thesis consists of a photographic work named 100 Hectares of Understanding and a written section in which I open the background of my work.
Maisterin opinnäytetyöni koostuu taiteellisesta ja valokuvallisesta teoskokonaisuudesta 100 Hectares of Understanding sekä kirjallisesta osiosta, jossa avaan työskentelyni taustoja.
Portfoliobox works as a visual part of the work.
Työn visuaalisena osiona toimii portfoliolaatikko.
The written part of my thesis is about my work 100 Hectares of Understanding.
Taiteen maisterini kirjallinen osio on läpileikkaus teoskokonaisuudestani 100 Hectares of Understanding.
I also write about things that have inspired me to make art and the reasons and motives for making art. 100 Hectares of Understanding is my artistic concept, which starting point is to try to understand the inherited forest area, from both mental and physical point of view.
100 Hectares Of Understanding on taiteellinen konseptini, jonka lähtökohta on pyrkiä ymmärtämään perimääni metsäpalstaa, niin henkisistä kuin fyysisistä näkökulmista.
Currently the variety of these systems and technologies, however, is vast, so it is difficult to form a complete view of the field without extensive research into the literature on the topic.
Tällä hetkellä näiden järjestelmien ja -teknologioiden tarjonta on kuitenkin varsin hajanainen ja laaja, eikä siitä ole helppo muodostaa yhtenäistä kokonaiskuvaa ilman syvällistä perehtymistä alan kirjallisuuteen.
The evaluation was carried out by examining the advantages and disadvantages from several implementation perspectives.
Arvioinnissa tarkasteltiin sekä hyötyjä että haittoja erilaisista toteutusnäkökulmista.
The weaknesses were heavily centered on the general complexity and difficulty of both use and implementation of current systems while the strengths were narrower topics like directory services.
Heikkoudet keskittyivät nykyisten järjestelmien yleisen monimutkaisuuden sekä niiden hankalan toteuttamisen ja käytön ympärille siinä missä vahvuudet olivat yksittäisempiä aiheita kuten hakemistopalvelut.
The work also presents a generic architecture for an identity management system and provides comparisons between a few of the widely known identity management products.
Lisäksi työssä kuvataan identiteetinhallintajärjestelmän yleistetty arkkitehtuuri ja vertaillaan keskenään muutamia tunnettuja identiteetinhallintatuotteita.
Managing digital identities is almost a necessity for modern organizations and as the number of both identities and the rights and authorizations attached to them grows an automatic identity management system is needed to perform the task.
Digitaalisten identiteettien hallinta on nykypäivän organisaatioiden toiminnan kannalta lähes välttämättömyys ja identiteettien sekä niihin sidottujen oikeuksien ja valtuuksien määrän kasvaessa tarvitaan tähän tehtävään automatisoituja identiteetinhallintajärjestelmiä.
A State of the Art Review of Identity Management Technologies and Their Future Trends
Katsaus identiteetinhallinnan teknologioihin ja niiden tulevaisuuden näkymiin
The results allowed the identification of a few statistically significant weaknesses and strengths of the current identity management technology.
Kyselyn tuloksien pohjalta saatiin kartoitettua muutamia tilastollisesti merkittäviä heikkouksia ja vahvuuksia nykyteknologiassa.
In the final parts of the theory section there is a short introduction to cloud technology and an evaluation of its impact on identity management.
Teoriaosuuden loppuosassa esitellään vielä lyhyesti pilviteknologiaa ja arvioidaan sen vaikutusta identiteetinhallintajärjestelmiin.
The results also provided an insight into the relevance of future trends that are likely to shape identity and access management technology such as cloud computing and mobile devices.
Tuloksista saatiin myös kuvaa identiteetin- ja pääsynhallintateknologioihin tulevaisuudessa vaikuttavien trendien, kuten pilvipalvelujen ja mobiililaitteiden, merkityksellisyyksistä.
This thesis work showcases the most central terminology and functionalities of identity and access management, as wells the protocols and standards used.
Tässä diplomityössä esitellään tiivistetysti keskeisimmät identiteetin- ja pääsynhallinnassa käytettävät käsitteet ja toiminnallisuudet sekä niihin soveltuvat protokollat ja standardit.
The research part of the work consists of an online survey aimed at identity and access management experts to provide an expert view on the current state and future trends of identity and access management.
Työn tutkimusosuus koostuu asiantuntijakyselytutkimuksesta, jossa selvitettiin asiantuntijoiden näkökulmaa identiteetinhallintateknologian nykytilaan ja sen tulevaisuuden näkymiin.
Microfluidic phenomena, components and simulation
Mikrofluidistiikan ilmiöt, komponentit ja simulointi
Fouling prevention of stainless steel surfaces in paper machines by catalytic methods
Paperikoneen ruostumattomien teräspintojen likaantumisen estäminen katalyyttisin menetelmin
Why and how do institutional investors operationalize corporate (ir)responsibility?
Miksi ja miten institutionaaliset sijoittajat operationalisoivat yritysvastuu(ttomuut)ta?
Responsible investing has been extensively studied in management literature.
Johtamiskirjallisuudessa on tutkittu laajasti vastuullista sijoittamista.
Moreover, existing literature has mostly seen corporate responsibility as a linear business problem and is, from the perspectives of sustainability and systems sciences, quite detached from the most important issues in ecological sustainability and the long-term wellbeing and equality of the humankind.
Lisäksi olemassa oleva kirjallisuus on pääosin nähnyt yritysvastuun lineaarisena liiketoimintaongelmana, mikä kestävyys- ja systeemitieteiden näkökulmasta tarkoittaa, ettei ekologisen kestävyyden ja ihmiskunnan pitkäaikaisen hyvinvoinnin ja tasa-arvon kysymyksiä ole kunnolla huomioitu.
For managers and policymakers, the study provides a new systemic and paradoxical framing of responsible investing and discusses how transforming responsible investing towards strong sustainability depends on wide system-level reforms.
Yritysten ja yhteiskunnan päättäjille tutkimus tarjoaa uuden systeemisen ja paradoksaalisen viitekehyksen vastuullisen sijoittamisen tarkasteluun ja esittää, että vastuullisen sijoittamisen muuttaminen vahvan kestävyyden suuntaan riippuu laajoista järjestelmätason uudistuksista.
To address this gap, this study aims at answering why and how Nordic institutional investors operationalize responsible investing and which perspectives on different corporate responsibilities this reflects.
Tässä opinnäytetyössä tutkitaan miksi ja miten pohjoismaiset institutionaaliset sijoittajat operationalisoivat vastuullista sijoittamista sekä millaisia näkemyksiä erilaisista yritysvastuista tämä heijastaa.
The study has important implications for literatures concerning the socially constructed, systemic, wicked and (un)sustainable nature of responsible investing, and institutional isomorphism among responsible investors.
Tutkimuksella on tärkeitä implikaatiota tutkimuskirjallisuuteen, joka liittyy vastuullisen sijoittamisen sosiaalisesti konstruoituun, systeemiseen, visaiseen ja ei-kestävään luonteeseen, sekä institutionaaliseen isomorfismiin vastuullisten sijoittajien keskuudessa.
The study proposes a systemic framework in which the identified motives, practices and contextual antecedents of Nordic institutional responsible investing are interconnected through six key mechanisms.
Johtopäätöksenään tutkimus esittää systeemitason mallin, jossa pohjoismaisen vastuullisen sijoittamisen tunnistetut motiivit, käytännöt ja kontekstuaaliset taustasyyt yhdistyvät kuuden mekanismin kautta toisiinsa.
Many studies have identified investors’ responsible investing motives and practices, but few have analyzed responsible investing from a systemic perspective.
Kirjallisuus on tunnistanut sijoittajien motiiveja sijoittaa vastuullisesti sekä vastuullisen sijoittamisen käytäntöjä, mutta harvat tutkimukset ovat tarkastelleet vastuullista sijoittamista systeemisenä ilmiönä.
The study applies an inductive grounded approach utilizing an interdisciplinary review of literature and an empirical sample of 18 semi-structured interviews of Nordic asset owners and managers.
Tutkimuksessa sovelletaan induktiivista, ankkuroitua (grounded) lähestymistapaa hyödyntäen poikkitieteellistä kirjallisuuskatsausta ja 18:ta pohjoismaisen loppusijoittajan ja varainhoitajan teemahaastattelua.
Moreover, the study discusses how the current form of Nordic institutional responsible investing reflects five identified archetypes of corporate responsibility perspectives, concluding that the Weberian "iron cage" of fiduciary duty is the main constraint for strong sustainability-compatible corporate responsibility to emerge.
Lisäksi tutkimus pohtii, miten nykyinen pohjoismainen institutionaalinen vastuullinen sijoittaminen heijastaa viittä tunnistettua yritysvastuunäkökulman arkkityyppiä.
Additional methods should be used for gathering more input.
Täydentäviä metodeja tulisi käyttää keräämään lisää syötettä.
The goal of the case study was to research the user needs for the new module which helps users in designing necessary configurations for the automation.
Tapaustutkimuksen tavoitteena oli selvittää käyttäjätarpeet uudelle moduulille, joka auttaa käyttäjiä suunnittelemaan tarpeelliset konfiguraatiot automaatioon.
Constructing the model for this case showed that the JTBD theory does not provide much appropriate guidance on how to apply it in practice.
Mallin laatiminen tähän tapaukseen osoitti, ettei JTBD-teoria tarjoa juurikaan sopivaa ohjeistusta sen soveltamiseen käytännössä.
According to the JTBD approach, people buy products and services because they have a job that they need to get done, and they hire products and services to do that job.
JTBD on lähestysmistapa, jonka mukaan ihmiset ostavat tuotteita ja palveluita, koska heillä on jokin asia, job, joka heidän tarvitsee saada tehdyksi, ja he "palkkaavat" tuotteita ja palveluita hoitamaan tämän jobin.