natgillin/translations-raw huggingface dataset:
Report infected decubitus ulcers as DECU
Infitseerunud lamatised registreeritakse kui DECU.
Report infected burns as BURN
Infitseerunud põletused registreeritakse kui BURN.
Report breast abscesses or mastitis as BRST
Rinnaabstsessid või mastiit registreeritakse kui BRST.
SST-ST: Soft tissue (necrotizing fascitis, infectious gangrene, necrotizing cellulitis, infectious myositis, lymphadenitis, or lymphangitis)
SST-ST: pehmete kudede infektsioon (nekrootiline fastsiit, infektsioosne gangreen, nekrootiline tselluliit, infektsioosne müosiit, lümfadeniit või lümfangiit)
Soft tissue infections must meet at least 1 of the following criteria:
Pehmete kudede infektsioonid peavad vastama vähemalt ühele järgmisele kriteeriumile:
Patient has organisms cultured from tissue or drainage from affected site
patsiendil on tabandunud paikmest võetud koest või eritisest välja külvatud haigustekitajad
Patient has purulent drainage at affected site
patsiendil esineb tabandunud paikmest mädast eritist
Patient has at least 2 of the following signs or symptoms at the affected site with no other recognized cause: localized pain or tenderness, redness, swelling, or heat
patsiendil on tabandunud paikmes vähemalt kaks järgmist haigustunnust või sümptomit, millel ei ole muud teadaolevat põhjust: paikne valu või valulikkus, punetus, turse või kuumenemine
positive antigen test performed on blood or urine (for example, Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitidis, Group B Streptococcus, Candida spp.)
vere või uriini positiivne antigeenitest (nt Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitidis, B-grupi Streptococcus, Candida spp.)
Report infection of deep pelvic tissues as OREP
Vaagna süvakudede infektsioon registreeritakse kui OREP.
SST-DECU: Decubitus ulcer, including both superficial and deep infections
SST-DECU: lamatise infektsioon (nii pindmised kui ka süvainfektsioonid)
Decubitus ulcer infections must meet the following criterion:
Lamatise infektsioonid peavad vastama järgmisele kriteeriumile:
Patient has at least 2 of the following signs or symptoms with no other recognized cause: redness, tenderness, or swelling of decubitus wound edges
patsiendil on vähemalt kaks järgmist haigusnähtu või sümptomit, millel ei ole muud teadaolevat põhjust: lamatishaavandi servade punetus, valulikkus või turse
organisms cultured from properly collected fluid or tissue
nõuetekohaselt võetud vedelikust või koest on välja külvatud haigustekitajad
SST-BURN: Burn
SST-BURN: põletusinfektsioon
Burn infections must meet at least 1 of the following criteria:
Põletusinfektsioonid peavad vastama vähemalt ühele järgmisele kriteeriumile:
Patient has a change in burn wound appearance or character, such as rapid eschar separation, or dark brown, black, or violaceous discoloration of the eschar, or edema at wound margin
patsiendil tekib põletushaava välimuse või laadi muutumine, näiteks põletusraia kiire irdumine või selle muutumine tumepruuniks, mustaks või violetseks või turse haavandi servas,
and histologic examination of burn biopsy shows invasion of organisms into adjacent viable tissue
JA põletushaava biopsiamaterjali histoloogilisel uuringul sedastatakse haigustekitajate invasioon ümbritsevasse eluskoesse
organisms cultured from blood in the absence of other identifiable infection
verekülvis haigustekitajad ning muud infektsiooni ei ole tuvastatud
isolation of herpes simplex virus, histologic identification of inclusions by light or electron microscopy, or visualization of viral particles by electron microscopy in biopsies or lesion scrapings
Herpes simplex'i viiruse isoleerimine, histoloogiliselt on valgus- või elektronmikroskoopial sedastatud inklusioonid või on koeproovides või lesioonikaabetes elektronmikroskoobi abil visualiseeritud viiruspartiklid
Patient with a burn has at least two of the following signs or symptoms with no other recognized cause: fever (> 38 °C) or hypothermia (< 36 °C), hypotension, oliguria (< 20 cc/hr), hyperglycemia at previously tolerated level of dietary carbohydrate, or mental confusion
põletusega patsiendil on vähemalt kaks järgmist haigusnähtu või sümptomit, millel ei ole muud teadaolevat põhjust: palavik (> 38 °C) või hüpotermia (< 36 °C), hüpotoonia, oligouuria (< 20 ml/h), hüperglükeemia teke varem talutava süsivesikute koguse juures või segasusseisund
histologic examination of burn biopsy shows invasion of organisms into adjacent viable tissue
põletushaava biopsiamaterjali histoloogilisel uuringul sedastatakse haigustekitajate invasioon ümbritsevasse eluskoesse
SST-BRST: Breast abscess or mastitis
SST-BRST: rinnaabstsess või mastiit
A breast abscess or mastitis must meet at least one of the following criteria:
Rinnaabstsess või mastiit peab vastama vähemalt ühele järgmisele kriteeriumile:
Patient has a positive culture of affected breast tissue or fluid obtained by incision and drainage or needle aspiration
intsisiooni ja dreeni abil või nõelaspiratsiooniga vastavast rinnast võetud koe või vedeliku külv on positiivne
Patient has a breast abscess or other evidence of infection seen during a surgical operation or histopathologic examination
patsiendil on kirurgilise menetluse ajal või histopatoloogilise uuringu tulemusel sedastatud rinnaabstsess või muu infektsioonileid
Patient has fever (> 38 °C) and local inflammation of the breast
patsiendil on palavik (> 38 °C) ja paikne rinnapõletik
AND physician diagnosis of breast abscess
JA arst on diagnoosinud rinnaabstsessi
SYS: Systemic infection
SYS: süsteemne infektsioon
SYS-DI: Disseminated infection
SYS-DI: dissemineerunud infektsioon
Disseminated infection is infection involving multiple organs or systems, without an apparent single site of infection, usually of viral origin, and with signs or symptoms with no other recognized cause and compatible with infectious involvement of multiple organs or systems
Dissemineerunud infektsioon on mitut elundit või elundisüsteemi haarav infektsioon, millel puudub üks ilmne infektsioonikolle ja mis on enamasti viiruslikku päritolu ning mille haigusnähtudel ja sümptomitel ei ole muud teadaolevat põhjust ja mis sobib kokku mitme elundi või elundisüsteemi infektsioosse haaratusega.
Use this code for viral infections involving multiple organ systems (for example, measles, mumps, rubella, varicella, erythema infectiosum).
Seda koodi kasutatakse mitut elundisüsteemi haaravate viiruslike infektsioonide puhul (nt leetrid, mumps, punetised, tuulerõuged, nakkuserüteem).
These infections often can be identified by clinical criteria alone.
Neid nakkusi saab sageli kindlaks määrata üksnes kliiniliste kriteeriumide põhjal.
Do not use this code for healthcare-associated infections with multiple metastatic sites, such as with bacterial endocarditis; only the primary site of these infections should be reported
Seda koodi ei kasutata mitme siirdekoldega haiglanakkuste, näiteks bakteriaalse endokardiidi puhul; selliste nakkuste puhul tuleks registreerida ainult esmane kolle.
Do not report fever of unknown origin (FUO) as DI
Tundmatu päritolu palavikku (FUO) ei registreerita dissemineerunud infektsioonina (DI).
Report viral exanthems or rash illness as DI
Viiruseksanteemid või lööve registreeritakse kui DI.
SYS-CSEP: treated unidentified severe infection
SYS-CSEP: ravitud identifitseerimata raske infektsioon
Patient has at least one of the following
Patisendil on vähemalt üks järgmisest:
clinical signs or symptoms with no other recognized cause
kliinilised nähud või sümptomid, millel ei ole muud teadaolevat põhjust:
fever (> 38 °C)
palavik (> 38 °C)
hypotension (systolic pressure < 90 mm/Hg)
hüpotoonia (süstoolne vererõhk < 90 mm/Hg)
or oliguria (20 cm3 (ml)/hr)
või oligouuria (20 cm3 (ml)/h)
And no apparent infection at another site
ja puudub ilmne infektsioon muus paikmes
And physician institutes treatment for sepsis
ja arst alustab sepsise ravi Teatamisjuhised
Do not use this code unless absolutely needed
Vastsündinute CSEP puhul kasutatakse NEO-CSEP haigusjuhu määratlust (vt allpool).
For CSEP in neonates, use NEO-CSEP case definition (see below)
UTI: kuseteede infektsioon
UTI: Urinary tract infection
UTI-A: mikrobioloogiliselt kinnitatud sümptomaatiline kuseteede infektsioon
UTI-A: microbiologically confirmed symptomatic UTI
Patsiendil on vähemalt üks järgmine haigusnäht või sümptom, millel ei ole muud teadaolevat põhjust: palavik (> 38 °C), kusepakitsus, sagekusesus, düsuuria või suprapubikaalne valulikkus
Patient has at least one of the following signs or symptoms with no other recognized cause: fever (> 38 °C), urgency, frequency, dysuria, or suprapubic tenderness
uriinikülv on positiivne, st ≥ 105 haigustekitajat ühe ml uurini kohta, milles ei ole rohkem kui kaht liiki mikroorganisme
patient has a positive urine culture, that is, ≥ 105 microorganisms per ml of urine with no more than two species of microorganisms.
UTI-B: mikrobioloogiliselt kinnitamata sümptomaatiline kuseteede infektsioon
UTI-B: not microbiologically confirmed symptomatic UTI
Patsiendil on vähemalt kaks järgmist haigusnähtu või sümptomit, millel ei ole muud teadaolevat põhjust: palavik (> 38 °C), kusepakitsus, sagekusesus, düsuuria või suprapubikaalne valulikkus
Patient has at least two of the following with no other recognized cause: fever (> 38 °C), urgency, frequency, dysuria, or suprapubic tenderness
vähemalt üks järgmisest:
at least one of the following:
positiivne uriini ribaanalüüs leukotsüütide esteraasi ja/või nitritite suhtes
Positive dipstick for leukocyte esterase and/or nitrate
püuuria uriiniproovis (≥ 104 WBC/ml või tugeval suurendusel ≥ 3 WBC/vaateväli tsentrifuugimata uriinis)
Pyuria urine specimen with ≥ 104 WBC/ml or ≥ 3 WBC/high-power field of unspun urine
Grami järgi värvitud tsentrifuugimata uriinis on sedastatud haigustekitajad
Organisms seen on Gram stain of unspun urine
vähemalt kahest uriinikülvist isoleeritakse korduvalt sama uropatogeen (gramnegatiivsed bakterid või Staphylococcus saprophyticus) kasv ≥ 102 koloonia/ml kateeteruriinis või põiepunktsiooniuriinis
At least two urine cultures with repeated isolation of the same uropathogen (Gram-negative bacteria or Staphylococcus saprophyticus) with ≥ 102 colonies/ml urine in nonvoided specimens
üheainsa uropatogeeni (gramnegatiivsed bakterid või Staphylococcus saprophyticus) kasv ≤ 105 koloonia/ml uriinis patsiendil, kes saab kuseteede nakkuse vastast antimikroobikumiravi
≤ 105 colonies/ml of a single uropathogen (Gram-negative bacteria or Staphylococcus saprophyticus) in a patient being treated with effective antimicrobial agent for a urinary infection
arsti diagnoositud kuseteede infektsioon
Physician diagnosis of a urinary tract infection
arst alustab kuseteede nakkuse asjakohase raviga
Physician institutes appropriate therapy for a urinary infection
Asümptomaatilist bakteriuuriat ei tuleks registreerita, kuid asümptomaatilise bakteriuuria põhjustatud vereringenakkus registreeritakse kui BSI, mille allikas (tekkepõhjus) on S-UTI.
Asymptomatic bacteriuria should not be reported, but bloodstream infections secondary to asymptomatic bacteriuria are reported as BSI with source (origin) S-UTI
Kuseteede infektsioon määratletakse kateetriga seotud nakkusena, kui 7 päeva jooksul enne infektsiooni tekkimist oli paigaldatud püsikateeter (ka ajutiselt).
A urinary tract infection is defined as catheter-associated if an indwelling urinary catheter was present (even intermittently) in the 7 days preceding the onset of infection
TEATAVATE PATOGEENIDE PÕHJUSTATUD VERERINGEINFEKTSIOONI ÜLDINE HAIGUSJUHUMÄÄRATLUS
GENERAL CASE DEFINITION OF BLOOD STREAM INFECTION DUE TO SPECIFIC PATHOGENS
Kliinilised kriteeriumid
Clinical criteria
Laboratoorsed kriteeriumid
Laboratory criteria
Vähemalt üks positiivne verekülv Staphylococcus aureus'e või Klebsiella pneumoniae või Escherichia coli või Enterococcus faecium'i või Enterococcus faecalis'e või Pseudomonas aeruginosa või Acinetobacter'i liikide või Streptococcus pneumoniae suhtes
At least one blood culture positive for Staphylococcus aureus or Klebsiella pneumoniae or Escherichia coli or Enterococcus faecium or Enterococcus faecalis or Pseudomonas aeruginosa or Acinetobacter species or Streptococcus pneumoniae.
Haigusjuhu klassifikatsioon
Case classification
Antimikroobikumitundlikkuse testide tulemused tuleb teatada kooskõlas ECDC ja liikmesriikide poolt kokku lepitud meetodite ja kriteeriumidega, nagu need on määratletud ECDC antimikroobikumiresistentsuse seire üleeuroopalise võrgustiku poolt (EARS-Net), ning konkreetselt järgmiselt:
The results of antimicrobial susceptibility tests must be reported according to the methods and criteria agreed between ECDC and Member States as specified by ECDC's European Antimicrobial Resistance Surveillance Network (EARS-Net), and in particular:
Staphylococcus aureus'e puhul: tundlikkus metitsilliini ja muude stafülokokivastaste beetalaktaamide suhtes;
for Staphylococcus aureus: susceptibility to meticillin and other anti-staphylococcal beta-lactams;
Enterococcus faecium'i ja Enterococcus faecalis'e puhul: tundlikkus glükopeptiitide suhtes;
for Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis: susceptibility to glycopeptides;
Klebsiella pneumoniae ja Escherichia coli puhul: tundlikkus karbapeneemide suhtes ja karbapeneem-resistentsetes isolaatide tundlikkus kolistiini suhtes;
for Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli: susceptibility to carbapenems, and susceptibility to colistin in carbapenem-resistant isolates;
Pseudomonas aeruginosa ja Acinetobacter'i liikide puhul: tundlikkus karbapeneemide suhtes.
for Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter species: susceptibility to carbapenems.
ANTIMIKROOBIKUMIRESISTENTSUSE ÜLDINE HAIGUSJUHUMÄÄRATLUS
GENERIC CASE DEFINITION AND CLASSIFICATION OF ANTIMICROBIAL REISTANCE TO ANTIMICROBIAL AGENTS
Kliiniline antimikroobikumiresistentsus
Clinical resistance to antimicrobial agents
Määratlus
Definition
Mikroorganism klassifitseeritakse antimikroobikumi suhtes kliiniliselt tundlikuks, kliiniliselt mõõduka tundlikkusega või kliiniliselt resistentseks, kasutades asjakohaseid EUCAST-i kliinilisi piirväärtusi ja standardmeetodit (või meetodit, mis on kalibreeritud standardmeetodi suhtes), st kliinilise minimaalse inhibeeriva kontsentratsiooni (MIC) piirväärtusi ja neile vastavaid inhibitsioonitsooni läbimõõdu väärtusi.
A micro-organism is classified as clinically susceptible, clinically intermediate, or clinically resistant to an antimicrobial agent by applying the appropriate EUCAST clinical breakpoints in a standardized methodology (or a methodology calibrated to a standardized methodology), i.e. clinical minimum inhibitory concentration (MIC) breakpoints and their inhibition zone diameter correlates.
Piirväärtusi võib muuta, kui tekivad olukorra põhjendatud muutused.
Breakpoints may be altered with legitimate changes in circumstances.
Klassifikatsioon
Classification
Kliiniliselt tundlik (S)
Clinically Susceptible (S)
mikroorganism määratletakse tundlikuks (S), kui antimikroobikumiga kokkupuute tase on selline, et ravitoime saavutamine on suure tõenäosusega.
a micro-organism is defined as susceptible (S) by a level of antimicrobial exposure associated with a high likelihood of therapeutic success.
Kliiniliselt mõõduka tundlikkusega (I)
Clinically Intermediate (I)
mikroorganism määratletakse mõõdukalt tundlikuks (I), kui antimikroobikumiga kokkupuute tase on selline, et ravitoime saavutamine on ebakindel.
a micro-organism is defined as intermediate (I) by a level of antimicrobial agent activity associated with uncertain therapeutic effect.
See tähendab, et isolaadi põhjustatud nakkust võib asjakohaselt ravida keha paikmetes, kuhu ravim füüsiliselt kontsentreerub, või kui on võimalik kasutada ravimi annustamise skeemi, millega saavutatakse suurem kokkupuude; samuti määrab see puhvervööndi, millega peaks ära hoidma suured erinevused tõlgendamistes, mis on tingitud väikestest kontrollimatutest tehnilistest teguritest.
It implies that an infection due to the isolate may be appropriately treated in body sites where the drugs are physically concentrated or when a dosage regimen of drug producing higher exposure can be used; it also indicates a buffer zone that should prevent small, uncontrolled, technical factors from causing major discrepancies in interpretations.
Kliiniliselt resistentne (R)
Clinically Resistant (R)
mikroorganism määratletakse resistentseks, kui antimikroobikumiga kokkupuute tase on selline, mida seostatakse ravi ebaõnnestumise suure tõenäosusega.
a micro-organism is defined as resistant (R) by a level of antimicrobial exposure associated with a high likelihood of therapeutic failure.
Kliinilised piirväärtusedhttp://www.eucast.org/clinical_breakpoints/.
Clinical breakpointshttp://www.eucast.org/clinical_breakpoints/.
MIC-meetodi või diski difusioonimeetodi asemel võib kasutada samaväärseid kvantitatiivseid antimikroobikumitundlikkuse testimise meetodeid, kui EUCAST on need heaks kiitnud.
Equivalent quantitative antimicrobial susceptibility testing (AST) methods may be used instead of MIC or disk diffusion if endorsed by EUCAST.
esitatakse järgmiselt:
are presented as:
S: MIC ≤ x mg/l; diskdifusioonimeetodil inhibitsioonitsooni läbimõõt ≥ σ mm
S: MIC ≤ x mg/L; disk diffusion zone diameter ≥ σ mm
I: MIC > x, ≤ y mg/l; diskdifusioonimeetodil inhibitsioonitsooni läbimõõt ≥ ρ mm, < σ mm
I: MIC > x, ≤ y mg/L; disk diffusion zone diameter ≥ ρ mm, < σ mm
R: MIC > y mg/l; diskdifusioonimeetodil inhibitsioonitsooni läbimõõt < ρ mm
R: MIC > y mg/L; disk diffusion zone diameter < ρ mm
Panresistentne (PDR)
Pandrug-resistant (PDR)
Staphylococcus aureus'e, Enterococcus'e liikide, Enterobacteriaceae, k.a Klebsiella pneumoniae ja Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa ja Acinetobacter'i liikide puhul määratletakse isolaat panresistentsena (PDR), kui see on resistentne kõigile antimikroobikumidele, nagu määratletud omandatud resistentsuse ajutisi standardmääratlusi käsitlevas rahvusvaheliste ekspertide ettepanekus
for Staphylococcus aureus, Enterococcus species, Enterobacteriaceae including Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter species, an isolate is defined as pandrug-resistant (PDR) based on the fact that it is resistant to all antimicrobial agents, as in the international expert proposal for interim standard definitions for acquired resistance
isolaat määratletakse kinnitatud panresistentse isolaadina, kui see ei ole tundlik (st keskmise tundlikkusega I, või resistentne – R) ühegi toimeaine suhtes kõigis antimikroobikumide rühmades, mis on kinnitatud referentlabori või muu kliinilise mikrobioloogia labori poolt, kus kasutatakse lisaks rutiinsetele antimikroobikumitundlikkuse määramise testidele lisapaneeli, vastavalt mikroorganismi määratlusele omandatud resistentsuse ajutisi standardmääratlusi käsitlevas rahvusvaheliste ekspertide ettepanekus
an isolate is defined as confirmed PDR when it is non-susceptible (i.e. intermediate — I, or resistant — R) to all agents in all antimicrobial categories, confirmed by a reference or other clinical microbiology laboratory testing a supplemental panel of antimicrobial agents beyond those routinely tested, in accordance with the definitions by microorganism in the international expert proposal for interim standard definitions for acquired resistance
isolaat määratletakse kui võimalik panresistentne isolaat, kui see ei ole tundlik (st keskmise tundlikkusega I, või resistentne – R) ühegi laboris testitud antimikroobikumi suhtes
an isolate is defined as possibly PDR when it is non-susceptible (i.e. intermediate — I, or resistant — R) to all the antimicrobial agents tested in the laboratory
isolaat määratletakse kui mittepanresistentne isolaat, kui see on tundlik vähemalt ühe testitud antimikroobikumi suhtes
an isolate is defined as not PDR when it is susceptible to at least one of the tested antimicrobial agents
Mikrobioloogiline antimikroobikumiresistentsus
Microbiological resistance to antimicrobial agents
Fenotüübi määratlus
Phenotypic definition
Mikroorganism klassifitseeritakse vastavalt EUCAST-i epidemioloogilistele läviväärtustele (ECOFF) liigi piires metsiktüübi või mitte metsiktüübi fenotüübiga mikroorganismiks, kasutades standarditud meetodit (või meetodit, mis on kalibreeritud standardmeetodi suhtes), liigispetsiifiliste MIC-väärtuste jaotuste ja neile vastavate inhibitsioonitsooni läbimõõtude alusel.
A microorganism is classified as having a wild-type phenotype or a non-wild-type phenotype for a species according to the EUCAST epidemiological cut-off concentrations (ECOFFs) in a standardized methodology (or a methodology calibrated to a standardized methodology) based on species-specific MIC distributions and their inhibition zone diameter correlates.
Fenotüüpide klassifikatsioon
Phenotypic classification
Metsiktüübi (WT) fenotüüp
Wild-type (WT) phenotype
mikroorganism määratletakse liigi või liikide rühma piires metsiktüübi (WT) organismina, kui tal puudub fenotüüpiliselt määratav omandatud resistentsuse mehhanism.
a micro-organism is defined as wild-type (WT) for a species or species complex when it is devoid of phenotypically-detectable acquired resistance mechanism
Muu kui metsiktüübi (NWT) fenotüüp
Non-wild-type (NWT) phenotype
mikroorganism kirjeldatakse liigi piires muu kui metsiktüübi (NWT) organismina, kui tal avaldub vähemalt üks fenotüübiliselt määratav omandatud resistentsuse mehhanism.
a micro-organism is defined as non-wild-type (NWT) for a species when it expresses at least one phenotypically-detectable acquired resistance mechanism
Epidemioloogiliste läviväärtused esitatakse, nagu kirjeldatudhttp://www.eucast.org/mic_distributions_and_ecoffs/ :
ECOFFs are presented ashttp://www.eucast.org/mic_distributions_and_ecoffs/
WT: ECOFF ≤ x mg/l; diskdifusioonimeetodil inhibitsioonitsooni läbimõõt ≥ σ mm
WT: ECOFF ≤ x mg/L; disk diffusion zone diameter ≥ σ mm
NWT: ECOFF > x mg/l; diskdifusioonimeetodil inhibitsioonitsooni läbimõõt < σ mm
NWT: ECOFF > x mg/L; disk diffusion diameter < σ mm
Omandatud antimikroobikumiresistentsuse mehhanismi määramine (näiteks, ravimit inaktiveeriv ensüüm, ravimi sihtvalgu tüübi modifikatsioon, väljapumpamine)
Identification of an acquired antimicrobial resistance mechanism (for example, drug inactivating enzyme, modification of drug target protein type, efflux pump)
Omandatud antimikroobikumiresistentsuse mehhanismi avaldumist mikroorganismil saab määrata in vitro ja mehhanismi tüübi saab kindlaks teha, kasutades standarditud metoodikat vastavalt EUCAST-i suunistele resistentsuse mehhanismide ning teatavate kliiniliselt ja/või epidemioloogiliselt tähtsate resistentsuste määramise kohta.
Expression of an acquired antimicrobial resistance mechanism by a micro-organism can be determined in vitro and the type of mechanism identified using standardized methodology according to the EUCAST guidelines for detection of resistance mechanisms and specific resistances of clinical and/or epidemiological importance
Genotüübi määratlus
Genotypic definition
Mikroorganism klassifitseeritakse kas organismiks, kellel on selline geneetiline determinant või determinantide kombinatsioon, mis tagab muu kui metsiktüüpi fenotüübi antimikroobikumi suhtes (ülekantava geeni või põhigeeni mutatsioon) või organismiks, kellel see puudub.
A microorganism is classified as harbouring or lacking a genetic determinant or combination of determinants conferring to it a non-wild type susceptibility phenotype in relation to antimicrobial agent (transferable gene or core gene mutation).
Geneetiline determinandi või determinantide kombinatsiooni olemasolu, mis tagab muu kui metsiktüüpi fenotüübi antimikroobikumi suhtes, saab osutada määrates ja identifitseerides bakteriaalses genoomi vastava nukleiinhappe järjestuse (vastavad nukleiinhapete järjestused).
The presence of a genetic determinant or combination of determinants conferring to it a non-wild type susceptibility phenotype in relation to one or several antimicrobial agents can be shown by detecting and identifying the corresponding nucleic acid sequence(s) in a bacterial genome.
Genotüüpide klassifikatsioon
Genotypic classification
Genotüübid vastatakse järgmiselt:
Genotypes are reported as:
positiivne: [resitentsusgeeni või peamise geenimutatsiooni nimetus] esinemine