natgillin/translations-raw huggingface dataset:
As a consequence, the actual exposure concentrations may be difficult to define, especially for adsorbing chemicals tested at low concentrations.
Keskmise kasvu erikiiruse määratlus põhineb vetikate üldisel piiramatul eksponentsiaalsel kasvul kultuuris, kusjuures mürgisust hinnatakse kasvukiirusele avalduva mõju alusel ja see ei olene kontrollkultuuri absoluutsest kasvu erikiirusest, kontsentratsiooni ja mõju vahelise sõltuvuse kõvera tõusust ega katse kestusest.
In such cases, disappearance of the test chemical from solution by adsorption to the increasing algal biomass does not mean that it is lost from the test system.
Kui uuritav muutuja on aga saagis, sõltuvad tulemused kõikidest eespool nimetatud lisamuutujatest.
When the result of the test is analysed, it should be checked whether a decrease in concentration of the test chemical in the course of the test is accompanied by a decrease in growth inhibition.
EyCx väärtus sõltub katses kasutatud vetikaliigi kasvu erikiirusest ja maksimaalsest kasvu erikiirusest, mis võib eri vetikaliikidel ja isegi sama liigi eri tüvedel olla erinev.
If this is the case, application of a suitable model describing the decline of the concentration of the test chemical (7) may be considered.
Seda uuritavat muutujat ei tohiks kasutada, kui võrreldakse vetikaliikide või -tüvede tundlikkust mürgiste kemikaalide suhtes.
If not, it may be appropriate to base the analysis of the results on the initial (nominal or measured) concentrations.
Ehkki keskmise kasvu erikiiruse kasutamine mürgisuse hindamiseks on teaduslikult paremini põhjendatud, käsitletakse käesolevas katsemeetodis mõnes riigis kehtivate regulatiivsete nõuete järgimise võimaldamiseks ka saagisel põhinevat mürgisuse hindamist.
Other observations
Keskmine kasvukiirus
Microscopic observation should be performed to verify a normal and healthy appearance of the inoculum culture and to observe any abnormal appearance of the algae (as may be caused by the exposure to the test chemical) at the end of the test.
Keskmine kasvu erikiirus teataval ajavahemikul arvutatakse kontrollrühma ja katserühmade iga nõu puhul biomassi juurdekasvu logaritmitud väärtuse põhjal vastavalt järgmisele võrrandile:
Limit test
ööpäevas
Under some circumstances, e.g. when a preliminary test indicates that the test chemical has no toxic effects at concentrations up to 100 mg/l or up to its limit of solubility in the test medium (whichever is the lower), a limit test involving a comparison of responses in a control group and one treatment group (100 mg/l or a concentration equal to the limit of solubility), may be undertaken.
kus:
It is strongly recommended that this be supported by analysis of the exposure concentration.
μ i–j
All previously described test conditions and validity criteria apply to a limit test, with the exception that the number of treatment replicates should be at least six.
on keskmine kasvu erikiirus ajavahemikul i–j,
The response variables in the control and treatment group may be analysed using a statistical test to compare means, e.g. a Student's t-test.
on biomass ajahetkel i ja
If variances of the two groups are unequal, a t-test adjusted for unequal variances should be performed
on biomass ajahetkel j.
Plotting growth curves
Kontrollrühma ja iga katserühma puhul arvutatakse kasvukiiruse keskmine väärtus ja tulemuste hajuvus.
The biomass in the test vessels may be expressed in units of the surrogate parameter used for measurement (e.g. cell number, fluorescence).
Arvutatakse keskmine kasvu erikiirus kogu katseaja (tavaliselt päevad 0–3) jooksul, võttes aluseks inokuleerimiseks kasutatud biomassi nominaalväärtuse, mitte mõõdetud algväärtuse, sest tavaliselt saadakse sel viisil täpsem tulemus.
Tabulate the estimated biomass concentration in test cultures and controls together with the concentrations of test material and the times of measurement, recorded with a resolution of at least whole hours, to produce plots of growth curves.
Biomassi mõõdetud algsisaldust võib siiski kasutada juhul, kui biomassi mõõtmise seade (nt läbivoolutsütomeeter) võimaldab määrata inokulumi biomassi piisavalt täpselt.
Both logarithmic scales and linear scales can be useful at this first stage, but logarithmic scales are mandatory and generally give a better presentation of variations in growth pattern during the test period.
Kasvu erikiiruse hindamiseks ajavahemike kaupa arvutatakse see katse vältel iga ööpäeva kohta (katsepäevad 0–1, 1–2 ja 2–3) ja kontrollitakse, kas kontrollkultuuri kasvukiirus püsib muutumatuna (vt nõuetele vastavuse kriteeriumid punktis 11).
Examine all data points and the appearance of the graphs critically and check raw data and procedures for possible errors.
Seega võib kasvukiiruse hindamist ajavahemike kaupa kasutada uuritava kemikaali mõju jälgimiseks kokkupuuteaja jooksul.
Check in particular any data point that seems to deviate by a systematic error.
Ajavahemike kaupa arvutatud kasvukiiruste ja keskmise kasvukiiruse vahelised olulised erinevused osutavad pidevast eksponentsiaalsest kasvust kõrvalekaldumisele ning sel juhul on vaja kasvukõveraid üksikasjalikult uurida.
If it is obvious that procedural mistakes can be identified and/or considered highly likely, the specific data point is marked as an outlier and not included in subsequent statistical analysis.
Uuritavat kemikaali sisaldava iga paralleelkultuuri puhul arvutatakse kasvukiiruse pidurdumise määr protsentides järgmise võrrandi abil:
(A zero algal concentration in one out of two or three replicate vessels may indicate the vessel was not inoculated correctly, or was improperly cleaned).
on keskmise kasvu erikiiruse pidurdumise määr protsentides,
State reasons for rejection of a data point as an outlier clearly in the test report.
on keskmise kasvu erikiiruse (μ) keskväärtus kontrollrühmas ja
Accepted reasons are only (rare) procedural mistakes and not just bad precision.
on keskmine kasvu erikiirus uuritava kemikaaliga paralleelkultuuris.
Statistical procedures for outlier identification are of limited use for this type of problem and cannot replace expert judgement.
Kui katselahuste valmistamiseks kasutatakse lahusteid, tuleks pidurdumise määr arvutada lahustit sisaldavate, mitte lahustivabade kontrollkultuuride põhjal.
Outliers (marked as such) should preferably be retained among the data points shown in any subsequent graphical or tabular data presentation.
Saagis arvutatakse kontrollrühma ja katserühmade iga nõu kohta, lahutades katse lõpus määratud biomassi kogusest biomassi algkoguse.
Response variables
Kontrollrühmas ja uuritava kemikaali iga kontsentratsiooni puhul arvutatakse keskmine saagis ning tulemuste hajuvus.
The purpose of the test is to determine the effects of the test chemical on the growth of algae.
Saagise vähenemise määra protsentides ( % Iy) võib uuritavat kemikaali sisaldava iga paralleelkultuuri puhul arvutada järgmiselt:
This test method describes two response variables, as different jurisdictions have different preferences and regulatory needs.
on saagise vähenemise määr protsentides,
In order for the test results to be acceptable in all jurisdictions, the effects should be evaluated using both response variables (a) and (b) described below.
on keskmine saagis kontrollrühmas ja
Average specific growth rate
on saagis uuritava kemikaaliga paralleelkultuuris.
this response variable is calculated on the basis of the logarithmic increase of biomass during the test period, expressed per day
Kontsentratsiooni ja mõju vahelise sõltuvuse kõvera koostamine
Yield
Koostatakse graafik, mis väljendab kasvukiiruse pidurdumise või saagise vähenemise protsentuaalse määra sõltuvust uuritava kemikaali kontsentratsiooni logaritmitud väärtusest; graafikut uuritakse üksikasjalikult, jättes kõrvale kõik esimeses etapis võõrväärtustena välja jäetud andmepunktid.
this response variable is the biomass at the end of the test minus the starting biomass.
Läbi punktide tõmmatakse käsitsi või arvutipõhise interpoleerimise abil sujuv kõver, mis annab esmapildi kontsentratsiooni ja mõju vahelisest seosest, ning seejärel rakendatakse üksikasjalikumat lähenemisviisi, soovitatavalt mõnda arvutipõhist statistilist meetodit.
It should be noted that toxicity values calculated by using these two response variables are not comparable and this difference must be recognised when using the results of the test.
Mõjuvad põhjused statistiliste meetodite kasutamisest loobumiseks võivad olla näiteks järgmised:
ECx values based upon average specific growth rate (ErCx) will generally be higher than results based upon yield (EyCx) if the test conditions of this test method are adhered to, due to the mathematical basis of the respective approaches.
andmed ei võimalda saada arvutipõhiste meetoditega usaldusväärsemaid tulemusi kui eksperdihinnangu alusel saadud tulemused – sellisel juhul ei pruugi mõned arvutiprogrammid üldse anda usaldusväärseid lahendeid (iteratsioonid ei pruugi koonduda jne);
This should not be interpreted as a difference in sensitivity between the two response variables, simply that the values are different mathematically.
olemasolevad arvutiprogrammid ei võimalda piisavalt hästi hinnata stimuleerivat mõju kasvule (vt allpool).
The concept of average specific growth rate is based on the general exponential growth pattern of algae in non-limited cultures, where toxicity is estimated on the basis of the effects on the growth rate, without being dependent on the absolute level of the specific growth rate of the control, slope of the concentration-response curve or on test duration.
Statistilised meetodid
In contrast, results based upon the yield response variable are dependent upon all these other variables.
Eesmärk on leida regressioonanalüüsi abil kvantitatiivne seos kontsentratsiooni ja mõju vahel.
EyCx is dependent on the specific growth rate of the algal species used in each test and on the maximum specific growth rate that can vary between species and even different algal strains.
On võimalik kasutada kaalutud lineaarset regressiooni pärast mõjuandmete lineariseerivat teisendamist näiteks probit-, logit- või Weibulli jaotuse kujule (8), kuid tuleks siiski eelistada mittelineaarse regressiooni meetodeid, mis sobivad paremini vältimatute andmevigade ja sujuvast jaotusest kõrvalekallete puhul.
This response variable should not be used for comparing the sensitivity to toxicants among algal species or even different strains.
Kasvu täielikule pidurdumisele või pidurdumise täielikule puudumisele lähedases olukorras võib kõnealune teisendamine andmevigu võimendada ja analüüsi segada (8).
While the use of average specific growth rate for estimating toxicity is scientifically preferred, toxicity estimates based on yield are also included in this test method to satisfy current regulatory requirements in some countries.
Tuleks silmas pidada, et probit-, logit- või Weibulli teisendusel põhinevad standardsed analüüsimeetodid on ette nähtud binaarsete tunnuste (nt suremus või elulemus) analüüsimiseks ning neid tuleb kasvu- või biomassiandmete analüüsimiseks kohandada.
Average growth rate
Konkreetsed meetodid ECx väärtuste leidmiseks pidevate andmete alusel on esitatud allikates 9, 10 ja 11.
The average specific growth rate for a specific period is calculated as the logarithmic increase in the biomass from the equation for each single vessel of controls and treatments [1]:
Mittelineaarse regressiooni kasutamist on üksikasjalikult käsitletud 5. liites.
day
Kummagi uuritava muutuja puhul arvutatakse kontsentratsiooni ja mõju vahelise sõltuvuse kõvera põhjal ECx hinnangulised väärtused.
where:
Võimaluse korral tuleks määrata iga hinnangulise väärtuse usalduspiirid usaldusnivool 95 %.
μi-j
Mõjuandmete sobivust regressioonimudeliga tuleks hinnata graafiliselt või statistiliselt.
is the average specific growth rate from time i to j;
Regressioonanalüüsi tegemisel tuleks kasutada mitte katserühmade andmete keskväärtusi, vaid igas üksikus paralleelkultuuris saadud väärtusi.
is the biomass at time i;
Kui andmete suure hajuvuse tõttu on kõvera mittelineaarne lähendamine raske või võimatu, võib probleemi lahendamiseks kasutada regressioonanalüüsi puhul siiski rühmade keskväärtusi – selle praktilise lähenemisviisiga vähendatakse eeldatavate võõrväärtuste mõju.
is the biomass at time j
Sellise võimaluse kasutamise korral tuleks katseprotokolli lisada märkus, et tavapärasest analüüsimeetodist kalduti kõrvale, kuna iga üksiku paralleelkultuuri andmetest lähtuv kõvera lähendamine ei andnud head tulemust.
For each treatment group and control group, calculate a mean value for growth rate along with variance estimates.
Kui olemasolevad regressioonimudelid ja -meetodid ei ole katseandmete jaoks sobivad, võib EC50 hinnangulise väärtuse ja usalduspiiride leidmiseks kasutada ka lineaarset interpoleerimist koos andmete usaldusväärsuse iteratiivse kontrollimisega (bootstrapping) (13).
Calculate the average specific growth rate over the entire test duration (normally days 0-3), using the nominally inoculated biomass as the starting value rather than a measured starting value, because in this way greater precision is normally obtained.
Et teha kasvukiiruse puhul kindlaks uuritava kemikaali vähim täheldatavat toimet avaldav kontsentratsioon (LOEC) ja selle alusel ka täheldatavat toimet mitteavaldav kontsentratsioon (NOEC), on vaja võrrelda katserühmade keskväärtusi dispersioonanalüüsi (ANOVA) meetoditega.
If the equipment used for biomass measurement allows sufficiently precise determination of the low inoculum biomass (e.g. flow cytometer) then the measured initial biomass concentration can be used.
Iga kontsentratsiooni puhul leitud keskväärtust võrreldakse seejärel kontrollrühmas saadud keskväärtusega, kasutades sobivat mitmese võrdluse või trenditesti meetodit.
Assess also the section-by-section growth rate, calculated as the specific growth rates for each day during the course of the test (days 0-1, 1-2 and 2-3) and examine whether the control growth rate remains constant (see validity criteria, paragraph 11).
Selleks võib sobida Dunnetti või Williamsi test (12, 14, 15, 16, 17).
While a lag phase can be minimised and practically eliminated in control cultures by proper propagation of the pre-culture, a lag phase in exposed cultures may indicate recovery after initial toxic stress or reduced exposure due to loss of test chemical (including sorption onto the algal biomass) after initial exposure.
Kui hajuvuse homogeensuse eeldus ei kehti, võib mõnikord homogeensuse saavutada andmete logaritmilise teisendamisega.
Hence the section-by-section growth rate may be assessed in order to evaluate effects of the test chemical occurring during the exposure period.
Kui hajuvuse heterogeensus on väga suur ja seda ei saa teisendamisega korrigeerida, tuleks kaaluda mõne muu meetodi, näiteks muutujate sammuviisilise elimineerimisega Jonckheere'i trenditesti kasutamist.
Substantial differences between the section-by-section growth rate and the average growth rate indicate deviation from constant exponential growth and that close examination of the growth curves is warranted.
Lisajuhised NOEC väärtuse määramiseks on esitatud allikas 11.
Calculate the percent inhibition of growth rate for each treatment replicate from equation [2]:
Uute teadussaavutuste põhjal on soovitatud loobuda NOEC mõistest ja asendada see regressiooni teel leitud hinnangulise näitajaga ECx.
%I r
Kõnealuse vetikatega tehtava katse jaoks ei ole sobivat x väärtust veel kindlaks määratud.
percent inhibition in average specific growth rate;
Sobiv väärtuste vahemik näib olevat 10–20 % (olenevalt uuritavast muutujast) ning soovitatavalt tuleks esitada nii EC10 kui ka EC20.
mean value for average specific growth rate (μ) in the control group;
Stimuleeriv mõju kasvule
When solvents are used to prepare the test solutions, the solvent controls rather than the controls without solvents should be used in calculation of percent inhibition.
Selle põhjuseks võib olla hormees (mürgise kemikaali stimuleeriv mõju) või kasutatavasse minimaalsöötmesse stimuleeriva kasvufaktori lisamine koos uuritava kemikaaliga.
Yield is calculated as the biomass at the end of the test minus the starting biomass for each single vessel of controls and treatments.
Tuleb silmas pidada, et anorgaaniliste toitainete lisamine ei tohiks avaldada otsest mõju, sest katsesöötmes peaks kogu katse vältel olema tagatud toitainete liig.
For each test concentration and control, calculate a mean value for yield along with variance estimates.
Tavaliselt võib EC50 arvutamisel väikeste koguste stimuleeriva mõju arvestamata jätta, kui see mõju ei ole väga suur.
The percent inhibition in yield ( %Iy) may be calculated for each treatment replicate as follows:
Kui stimuleeriv mõju on väga suur või on vaja leida ECx, mille puhul x väärtus on väike, võib olla vaja kasutada erimeetodeid.
%I y
Võimaluse korral tuleks hoiduda stimuleerivat mõju kajastavate tulemuste väljajätmisest andmeanalüüsil; kui olemasolev kõvera lähendamise tarkvara ei võimalda nõrka stimuleerivat mõju arvesse võtta, võib kasutada lineaarset interpoleerimist koos andmete usaldusväärsuse iteratiivse kontrollimisega.
percent inhibition of yield;
Kui stimuleeriv mõju on väga tugev, võib kaaluda hormeesimudeli kasutamist (18).
Plotting concentration response curve
Seda tüüpi füüsikalist mõju tuleks katsetingimuste muutmisega mürgisest mõjust lahus hoida ja eraldi kirjeldada.
Plot the percentage of inhibition against the logarithm of the test chemical concentration and examine the plot closely, disregarding any such data point that was singled out as an outlier in the first phase.
Asjaomased juhised on esitatud allikates 2 ja 3.
Fit a smooth line through the data points by eye or by computerised interpolation to get a first impression of the concentration-response relationship, and then proceed with a more detailed method, preferably a computerised statistical method.
KATSEPROTOKOLL
Depending on the intended usage of data;
Katseprotokollis esitatakse järgmine teave.
the quality (precision) and amount of data as well as the availability of data analysis tools, it may be decided (and sometimes well justified) to stop the data analysis at this stage and simply read the key figures EC50 and EC10 (and/or EC20) from the eye fitted curve (see also section below on stimulatory effects).
Uuritav kemikaal:
Valid reasons for not using a statistical method may include:
füüsikaline iseloomustus ja asjakohased füüsikalis-keemilised omadused, sealhulgas vees lahustuvuse piirkontsentratsioon;
Data are not appropriate for computerised methods to produce any more reliable results than can be obtained by expert judgement — in such situations some computer programs may even fail to produce a reliable solution (iterations may not converge etc.)
kemikaali identifitseerimisandmed (nt CASi number) ja puhtus (lisandid).
Stimulatory growth responses cannot be handled adequately using available computer programs (see below).
Katseliik:
Statistical procedures
tüvi, tarnija või päritolu ja kasutatud kultiveerimistingimused.
The aim is to obtain a quantitative concentration-response relationship by regression analysis.
Katsetingimused:
It is possible to use a weighted linear regression after having performed a linearising transformation of the response data — for instance into probit or logit or Weibull units (8), but non-linear regression procedures are preferred techniques that better handle unavoidable data irregularities and deviations from smooth distributions.
katse alustamise kuupäev ja kestus;
Approaching either zero or total inhibition, such irregularities may be magnified by the transformation, interfering with the analysis (8).
katseplaani kirjeldus:
It should be noted that standard methods of analysis using probit, logit, or Weibull transforms are intended for use on quantal (e.g. mortality or survival) data, and must be modified to accommodate growth or biomass data.
katsenõud, kultuuride maht, biomassi tihedus katse alguses;
Specific procedures for determination of ECx values from continuous data can be found in (9) (10) and (11).
söötme koostis;
The use of non-linear regression analysis is further detailed in Appendix 5.
kasutatud kontsentratsioonid ja paralleelkultuurid (paralleelkultuuride arv, kasutatud kontsentratsioonide arv ja geomeetrilise jada tegur);
For each response variable to be analysed, use the concentration-response relationship to calculate point estimates of ECx values.
katselahuste valmistamise, sealhulgas lahustite jms kasutamise kirjeldus;
When possible, the 95 % confidence limits for each estimate should be determined.
kultiveerimisseade;
Goodness of fit of the response data to the regression model should be assessed either graphically or statistically.
valgustustihedus ja valguse kvaliteet (valgusallikas, valguse ühtlus);
Regression analysis should be performed using individual replicate responses, not treatment group means.
temperatuur;
If, however nonlinear curve fitting is difficult or fails because of too great scatter in the data, the problem may be circumvented by performing the regression on group means as a practical way of reducing the influence of suspected outliers.
kasutatud kontsentratsioonid:
Use of this option should be identified in the test report as a deviation from normal procedure because curve fits with individual replicates did not produce a good result.
nominaalne sisaldus ja katsenõudes oleva uuritava kemikaali sisalduse määramise tulemused;
The mean for each concentration must then be compared with the control mean using an appropriate multiple comparison or trend test method.
biomassi määramise meetod ning tõendid mõõdetava parameetri ja kuivmassi vahelise korrelatsiooni kohta.
Dunnett's or Williams' test may be useful (12)(14)(15)(16)(17).
Tulemused:
It is necessary to assess whether the ANOVA assumption of homogeneity of variance holds.
pH väärtused katse alguses ja lõpus igal uuritava kemikaali kontsentratsioonil;
This assessment may be performed graphically or by a formal test (17).
biomass igas kolvis igas ajapunktis ning biomassi mõõtmise meetod;
Suitable tests are Levene's or Bartlett's.
kasvukõverad (biomassi ajas muutumise graafikud);
Failure to meet the assumption of homogeneity of variances can sometimes be corrected by logarithmic transformation of the data.
uuritavate muutujate arvutatud väärtused igas uuritava kemikaaliga paralleelkultuuris ning paralleelkultuuride andmete keskväärtused ja variatsioonikordajad;
If heterogeneity of variance is extreme and cannot be corrected by transformation, analysis by methods such as step-down Jonkheere trend tests should be considered.
kontsentratsiooni ja mõju vahelise sõltuvuse graafik;
Additional guidance on determining the NOEC can be found in (11).
uuritavate muutujate kaudu määratud mürgisuse näitajad – nt EC50, EC10, EC20 – ja vastavad usaldusvahemikud;
Recent scientific developments have led to a recommendation of abandoning the concept of NOEC and replacing it with regression based point estimates ECx.
asjaomaste andmete olemasolu korral LOEC ja NOEC ning nende määramiseks kasutatud statistilised meetodid;
An appropriate value for x has not been established for this algal test.
dispersioonanalüüsi (ANOVA) kasutamise korral mõju määr, mida on võimalik tuvastada (nt väikseim oluline erinevus);
A range of 10 to 20 % appears to be appropriate (depending on the response variable chosen), and preferably both the EC10 and EC20 should be reported.
katserühma mis tahes kultuuris täheldatud stimuleeriv mõju kasvule;
Growth stimulation
mis tahes muu täheldatud mõju, nt vetikate morfoloogilised muutused;
Growth stimulation (negative inhibition) at low concentrations is sometimes observed.
tulemuste arutelu, kaasa arvatud käesolevast metoodikast kõrvalekaldumise võimalik mõju katsetulemustele.
This can result from either hormesis (“toxic stimulation”) or from addition of stimulating growth factors with the test material to the minimal medium used.
OECD (2006).
Note that the addition of inorganic nutrients should not have any direct effect because the test medium should maintain a surplus of nutrients throughout the test.
Current Approaches in the Statistical Analysis of Ecotoxicity Data:
Low dose stimulation can usually be ignored in EC50 calculations unless it is extreme.
liide