natgillin/translations-raw huggingface dataset:
Enrichment of the samples before using ELISA may be useful in order to increase the sensitivity of the test, but it can fail due to competition by other organisms in the sample.
Proovide rikastamine enne ELISA-analüüsi võib olla analüüsi tundlikkuse tõstmiseks kasulik, kuid see võib ebaõnnestuda teiste võistlevate organismide tõttu proovis.
Note: Use an validated source of antibodies to R. solanacearum (see web site http://forum.europa.eu.int/Public/irc/sanco/Home/main) It is recommended that the titre is determined for each new batch of antibodies.
Märkus: kasutatakse R. solanacearum'i antikehade valideeritud allikat (vt veebileht http://forum.europa.eu.int/Public/irc/sanco/Home/main). On soovitav määrata iga uue antikehapartii tiiter.
The titre is defined as the highest dilution at which optimum reaction occurs when testing a suspension containing 105 to 106 cells per ml of the homologous strain of R. solanacearum and using appropriate secondary antibody conjugates according to the manufacturer’s recommendations.
Tiiter on kõrgeima kontsentratsiooniga lahus, mille juures toimub optimaalne reaktsioon, kui tehakse analüüsi suspensiooniga, mis sisaldab 105 kuni 106 bakteri R. solanacearum homoloogse tüve rakku milliliitris, ja kasutatakse kohast sekundaarse antikeha konjugaati vastavalt tootja soovitustele.
During testing, the antibodies should be used at a working dilution close to or at the titre of the commercial formulation.
Analüüside käigus tuleks kasutada antikehade lahjendusi, mis on kaubandusliku valmistise tiitri lähedal või sellega võrdsed.
Determine the titre of the antibodies on a suspension of 105 to 106 cells per ml of the homologous strain of R. solanacearum.
Määratakse antikehade tiiter, kasutades R. solanacearum’i homoloogse tüve suspensiooni sisaldusega 105 kuni 106 rakku milliliitri kohta.
Include a sample extract that previously tested negative for R. solanacearum and a suspension of a non-cross reacting bacterium in phosphate buffered saline (PBS) as negative controls.
Negatiivsete kontrollidena kasutatakse prooviekstrakti, mis andis varem bakteri R. solanacearum osas negatiivse tulemuse, ja ristuvalt mittereageeriva bakteri suspensiooni fosfaatpuhvri lisandiga keedusoolalahuses (PBS).
As positive control use aliquots of sample extract, that previously tested negative, mixed with 103 to 104 cells per ml of R. solanacearum biovar 2 (e.g. strain NCPPB 4156 = PD 2762 = CFBP 3857, see Appendix 2 A and B).
Positiivse kontrollina kasutatakse sama proovi alikvoote, mis andsid varem negatiivse tulemuse segatuna bakteri R. solanacearum biotüübi 2 tüvedega 103 kuni 104 rakku milliliitris (näiteks tüvi NCPPB 4156 või PD 2762 või CFBP 3857, vt 2. liite punktid A ja B).
For comparison of results on each plate use a standard suspension of 105 to 106 cells per ml in PBS of R. solanacearum.
Tulemuste võrdlemiseks kasutatakse kõigil söötmeplaatidel R. solanacearum’i standardlahust 105 kuni 106 rakku milliliitris fosfaatpuhvri lisandiga keedusoolalahuses (PBS).
Ensure positive controls are well separated on the microtitre plate from the sample(s) under test.
Positiivsed kontrollid peavad olema mikrotiiterplaadil kindlalt eraldatud analüüsitavast proovist (analüüsitavatest proovidest).
Standardised positive and negative control materials available for use with this test are listed in Appendix 3 A.
Positiivne ja negatiivne standardiseeritud kontrollmaterjal, mida saab kasutada nende analüüside puhul on loetletud 3. liite punktis A.
Two ELISA protocols have been validated.
Valideeritud on kaks ELISA protokolli.
Indirect ELISA (Robinson Smith et al., 1995)
Kaudne ELISA (Robinson-Smith et al., 1995)
Use 100 to 200 µl aliquots of sample extract.
Võetakse 100–200 µl prooviekstrakti alikvooti.
(Heating at 100 °C for four minutes in a waterbath or heating block may reduce non-specific results in some cases).
(Kuumutamine 4 minuti jooksul temperatuuril 100 °C vesivannis või kuumutusplokil võib mõnel juhul vähendada mittespetsiifilisi tulemusi.)
Add an equal volume of double strength coating buffer (Appendix 4) and vortex.
Lisatakse samaväärne kogus kahekordset kattepuhvrit (4. liide) ja loksutatakse vorteksil.
Apply 100 µl aliquots to each of at least two wells of a microtitre plate (e.g. Nunc-Polysorp or equivalent) and incubate for one hour at 37 °C or overnight at 4 °C.
Igast proovist mõõdetakse vähemalt 100 µl kahte mikrotiiterplaadi auku (nt Nunc-Polysorp või samaväärne) ja inkubeeritakse üks tund 37 °C juures või öö jooksul 4 °C juures.
Flick out the extracts from the wells.
Järsu löögiga raputatakse ekstrakt plaadiaukudest välja.
Wash the wells three times with PBS-Tween (Appendix 4), leaving the last washing solution in the wells for at least five minutes.
Auke pestakse kolm korda PBS-Tweeniga (4. liide), jättes viimase pesukorra lahuse vähemalt viieks minutiks plaadiaukudesse.
Prepare the appropriate dilution of antibodies against-R. solanacearum in blocking buffer (Appendix 4).
Valmistatakse R. solanacearum’i antikehade sobiv lahjendus blokeerimispuhvrisse (4. liide).
For validated commercial antibodies, use the recommended dilutions (usually twice as concentrated as the titre).
Valideeritud, müügil olevate antikehade puhul kasutatakse soovitatud lahjendust (tavaliselt kaks korda kontsentreeritum kui tiiter).
Add 100 µl to each well and incubate for one hour at 37 °C.
Lisatakse 100 µl igasse auku ja inkubeeritakse üks tund 37 °C juures.
Flick out the antibody solution from the wells and wash as before (4).
Järsu löögiga raputatakse antikehalahus plaadiaukudest välja, auke pestakse, nagu on eespool kirjeldatud (alapunkt 4).
Prepare the appropriate dilution of secondary antibody-alkaline phosphatase conjugate in blocking buffer.
Valmistatakse sekundaarse antikeha leeliselise fosfataaskonjugaadi sobiv lahjendus blokeerimispuhvrisse.
Flick out conjugated antibody from wells and wash as before (4).
Järsu löögiga raputatakse konjugeeritud antikeha plaadiaukudest välja, auke pestakse, nagu on eespool kirjeldatud (alapunkt 4).
Add 100 µl alkaline phosphatase substrate solution (Appendix 4) to each well.
Lisatakse 100 µl leeliselise fosfataassubstraadi lahust (4. liide) igasse auku.
Incubate in the dark at ambient temperature and read absorbance at 405 nm at regular intervals within 90 minutes.
Inkubeeritakse pimedas toatemperatuuril ja mõõdetakse neeldumist lainepikkusel 405 nm korrapäraste ajavahemike järel 90 minuti jooksul.
Prepare the appropriate dilution of anti-R. solanacearum polyclonal immunoglobulins in coating buffer pH 9.6 (Appendix 4).
Valmistatakse R. solanacearum’i määramiseks polükloonsete antikehade sobiv lahjendus kattepuhvris pH 9,6 (4. liide).
Add 200 µl to each well.
Igasse auku lisatakse 200 µl.
Incubate at 37 °C for four to five hours or at 4 °C for 16 hours.
Inkubeeritakse 4–5 tundi 37 °C juures või 16 tundi 4 °C juures.
Wash the wells three times with PBS-Tween (Appendix 4).
Auke pestakse kolm korda PBS-Tweeniga (4. liide).
Add 190 µl of sample extract to at least two wells.
Lisatakse 190 µl prooviekstrakti vähemalt kahte auku.
Also add positive and negative controls in two wells each per plate.
Positiivseid ja negatiivseid kontrolle lisatakse kumbagi kahte auku igal plaadil.
Incubate for 16 hr at 4 °C.
Inkubeeritakse 16 tundi 4 °C juures.
Prepare an appropriate dilution of R. solanacearum-specific monoclonal antibodies in PBS (Appendix 4) also containing 0,5 % bovine serum albumin (BSA) and add 190 µl to each well.
Valmistatakse R. solanacearum’i määramiseks spetsiifiliste monokloonsete antikehade sobiv lahjendus fosfaatpuhvri lisandiga keedusoolalahuses (PBS) (4. liide), mis sisaldab ka 0,5 % veise albumiinseerumit (BSA), ja lisatakse 190 µl igasse auku.
Incubate at 37 °C for two hours.
Inkubeeritakse 2 tundi 37 °C juures.
Prepare an appropriate dilution of anti-mouse immunoglobulins conjugated with alkaline phosphatase in PBS.
Valmistatakse hiirevastase immunoglobuliini sobiv lahus, mis on konjugeeritud leeliselise fosfataassubstraadiga fosfaatpuhvri lisandiga keedusoolalahuses (PBS).
Prepare an alkaline phosphatase substrate solution containing 1 mg p-nitrophenyl phosphate per ml of substrate buffer (Appendix 4).
Valmistatakse leeliseline fosfataassubstraadilahus, mis sisaldab 1 mg p-nitrofenüülfosfaati substraatpuhvri milliliitri kohta (4. liide).
Incubate in the dark at ambient temperature and read absorbance at 40 nm at regular intervals within 90 minutes.
Inkubeeritakse pimedas toatemperatuuril ja mõõdetakse neeldumist lainepikkusel 40 nm korrapäraste ajavahemike järel 90 minuti jooksul.
Interpretation of ELISA test results:
ELISA-analüüsi tulemuste tõlgendamine
The ELISA test is negative if the average optical density (OD) reading from duplicate sample wells is < 2x OD of that in the negative sample extract control well, providing the OD for the positive controls are all above 1,0 (after 90 minutes incubation with the substrate) and are greater than twice the OD obtained for negative sample extracts.
ELISA-analüüs on negatiivne, kui kahe proovi augu arvutatud keskmine optiline tihedus on väiksem kui negatiivse kontrolli prooviekstrakti augu kahekordse optilise tiheduse väärtus, tingimusel et kõigi positiivsete kontrollide optiline tihedus on üle 1,0 (pärast 90minutilist inkubatsiooni substraadis) ning see on suurem kui negatiivsete prooviekstraktide kahekordne optiline tihedus.
The ELISA test is positive if the average OD readings from duplicate sample wells is > 2x OD in the negative sample extract well provided that OD readings in all negative control wells are < 2x those in the positive control wells.
ELISA-analüüs on positiivne, kui kahe proovi augu arvutatud keskmine optiline tihedus on suurem kui negatiivse kontrolli prooviekstrakti augu kahekordse optilise tiheduse väärtus, tingimusel et kõigi negatiivse kontolli aukude optiline tihedus on väiksem kui positiivse kontrolli aukude kahekordne optiline tihedus.
Negative ELISA readings in positive control wells indicate that the test has not been performed correctly or that it has been inhibited.
ELISA-analüüsi positiivse kontrolli aukude negatiivsed näidud osutavad, et analüüs ei ole korrektselt läbi viidud või seda on inhibeeritud.
Positive ELISA readings in negative control wells indicate that cross-contamination or non-specific antibody binding has occurred.
ELISA-analüüsi negatiivse kontrolli aukude positiivsed näidud osutavad, et on toimunud ristsaastumine või mittespetsiifiline antikehade sidumine.
Note: Preliminary testing with this method should permit reproducible detection of 103 to 104 colony-forming units of R. solanacearum per ml added to sample extracts that previously tested negative (preparation see Appendix 3).
Märkus: eelanalüüsid sellel meetodil peaksid võimaldama reprodutseeritavalt avastada varem negatiivse tulemuse andnud prooviekstraktidele lisatud 103 kuni 104 bakteri R. solanacearum kolooniaid moodustavat üksust milliliitris (valmistamist vt 2. liites).
The following protocol is based upon Janse (1988):
Järgneva protokolli aluseks on Janse (1988).
Use 10 test plants of a susceptible tomato cultivar (e.g. Moneymaker or cultivar with equivalent susceptibility as determined by the testing laboratory) at the third true leaf stage for each sample.
Iga proovi kohta võetakse kümme tundliku tomatisordi (nt “Moneymaker” või sort, mille tundlikkuse on testlabor määranud olevat samaväärse) testtaime, millel on välja kasvanud 3. pärisleht.
Symptoms have been show to be less severe and to develop more slowly in eggplant.
On ilmnenud, et baklažaanil on sümptomid vähem tõsised ja arenevad aeglasemalt.
Where possible, it is therefore recommended to use tomato seedlings.
Seetõttu soovitatakse võimaluse korral kasutada tomatiseemikuid.
Distribute 100 µl of sample extract between the test plants.
100 µl prooviekstrakti jagatakse testtaimede vahel.
Inoculate the plant stems just above the cotyledons using a syringe fitted with a hypodermic needle (not less than 23G).
Taimede varsi inokuleeritakse idulehtede kohal hüpodermilise nõelaga süstlaga (vähemalt 23G).
Distribute the sample between the test plants.
Proov jaotatakse testtaimede vahel.
Holding the plant between two fingers, pipette a drop (approximately 5 - 10 µl) of the suspended pellet on the stem between the cotyledons and the first leaf.
Taime kahe sõrme vahel hoides pipetitakse suspendeeritud bakterisademe tilk (ligikaudu 5–10 µl) varrele idulehtede ja esimese lehe vahele.
Using a sterile scalpel, make a diagonal slit, about 1.0 cm long and approximately 2/3 of the stem thickness deep, starting the cut from the pellet drop.
Steriilse skalpelliga tehakse 1 cm pikkune diagonaalne sisselõige, mille sügavus on ligikaudu 2/3 varre paksusest, alustades sisselõiget bakterisademe tilga kohast.
Inoculate by the same technique, five seedlings with an aqueous suspension of 105 to 106 cells per ml prepared from a 48 hr culture of a virulent biovar 2 strain of R. solanacearum as a positive control and with pellet buffer (Appendix 4) as negative control.
Samal viisil nakatatakse viis taime 48tunnise virulentse R. solanacearum biotüübi 2 vesisuspensiooniga 105 kuni 106 rakku milliliitri kohta, mis on positiivseks kontrolliks, ning negatiivseks kontrolliks nakatatakse taimi bakterisademe puhvriga (4. liide).
Separate positive and negative control plants from the other plants to avoid cross-contamination.
Positiivsed ja negatiivsed kontrolltaimed tuleb teistest taimedest isoleerida, et vältida ristnakatumist.
Grow the test plants in quarantine facilities for up to four weeks at 25 to 30 °C and high relative humidity with appropriate watering to prevent waterlogging or wilting through water deficiency.
Testtaimi kasvatatakse karantiiniruumides kuni neli nädalat 25–30 °C ja kõrge suhtelise niiskuse juures ja neid kastetakse nii, et ei tekiks ülekastmist või taimede närbumist veepuuduse tõttu.
To avoid contamination incubate positive control and negative control plants on clearly separated benches in a glasshouse or growth chamber or, in case space is limited, ensure strict separation between treatments.
Saastumise vältimiseks inkubeeritakse positiivseid ja negatiivseid kontrolltaimi selgelt eraldatud lavadel kasvuhoones või kasvukambris või, kui ruumi on vähe, tagatakse rangelt eristatus töötlemiste vahel.
Observe for symptoms of wilting, epinasty, chlorosis and/or stunting.
Jälgitakse närbumise, lehtede keerdumise, kloroosi ja/või kängumise tundemärke.
Isolate from infected plants (Section II.3.) and identify purified cultures of presumptive R. solanacearum (Section VI.B.).
Isoleeritakse haigestunud taimedest (II jao punkt 3) ja identifitseeritakse eeldatavad R. solanacearum’i puhastatud kultuurid (VI jao punkt B).
If no symptoms are observed after three weeks perform IF/PCR/Isolation on a composite sample of 1 cm stem sections of each test plant taken above the inoculation site.
Kui kolme nädala möödumisel sümptomeid ei ilmne, tehakse IF/PCR/isolatsioonianalüüsid liitproovist, mis koosneb igalt katsetaimelt ülalpool inokulatsioonikohta võetud 1 cm varreosadest.
If the test is positive perform dilution plating (section 4.1).
Kui analüüsid on positiivsed, valmistatakse lahjendused ja tehakse väljakülvid söötmeplaatidele (punkt 4.1).
Identify any purified cultures of presumptive R. solanacearum (Section VI.B.).
Määratakse kindlaks bakteri R. solanacearum eeldatavad puhastatud kultuurid.
Interpretation of the bioassay test results
Biotesti tulemuste tõlgendamine
Valid Bioassay test results are obtained when plants of the positive control show typical symptoms, the bacteria can be reisolated from these plants and no symptoms are found on the negative controls.
Valiidsed biotesti tulemused saadakse siis, kui positiivsetel kontrolltaimedel on tüüpilised sümptomid, nendest taimedest saab uuesti isoleerida bakterid ja negatiivsetel kontrollidel ei leita sümptomeid.
The bioassay test is negative if test plants are not infected by R. solanacearum, and provided that R. solanacearum is detected in positive controls.
Biotesti tulemus on negatiivne, kui testtaimed ei ole saastunud R. solanacearum’i kultuuriga, tingimusel et R. solanacearum on avastatud positiivsetes kontrolltaimedes.
The bioassay test is positive if the test plants are infected by R. solanacearum.
Biotest on positiivne, kui testtaimed on R. solanacearum’i kultuuriga saastunud.
IDENTIFICATION TESTS
IDENTIFITSEERIMISANALÜÜSID
Identify pure cultures of presumptive R. solanacearum isolates using at least two of the following tests based on different biological principles.
Bakteri R. solanacearum eeldatavad puhaskultuurid määratakse kindlaks, kasutades vähemalt kaht järgmistest analüüsidest, mis põhinevad erinevatel bioloogilistel põhimõtetel.
Include known reference strains where appropriate for each test performed (see Appendix 3).
Igasse tehtavasse analüüsi kaasatakse tuntud referenttüved, kui see on asjakohane (vt 3. liide).
Fluorescent pigment production
Fluorestseeruv pigment
Poly-ß-hydroxybutyrate inclusions
Polü-β-hüdroksübutüraadi esinemine
Oxidation/fermentation (O/F) test
Oksüdatsiooni/fermentatsioonianalüüs (O/F-analüüs)
Kovac’s oxidase test
Kovaci oksüdaasianalüüs
Reduction of nitrate
Nitraatide redutseerimine
Utilisation of citrate
Tsitraadi kasutamine
Growth at 40 °C
Kasv 40 °C juures
Growth in 1 % NaCl
Kasv 1 % NaCl-s
Growth in 2 % NaCl
Kasv 2 % NaCl-s
Arginine dihydrolase activity
Arginiini dihüdrolaas
Gelatine liquefaction
Želatiini veeldamine
Aesculin hydrolysis
Aesuliini hüdrolüüs
Levan production
Levani tootmine
Prepare a suspension of approximately 106 cells per ml in IF buffer (Appendix 4).
Valmistatakse suspensioon, milles on umbes 106 rakku milliliitris IF-puhvris (4. liide).
Prepare a twofold dilution series of an appropriate antiserum (see website http://forum.europa.eu.int/Public/irc/sanco/Home/main).
Valmistatakse kohase antiseerumi kahekordsete lahjenduste rida (vt veebileht http://forum.europa.eu.int/Public/irc/sanco/Home/main).
Apply the IF procedure (Section VI.A.5.).
Tehakse IF-analüüs (VI jao punkt A.5).
Note: If performing only 2 identification tests, do not use another serological test in addition to this method.
Märkus: kui kasutatakse vaid kaht määramisanalüüsi, ei tohi lisaks sellele meetodile kasutada teist seroloogilist analüüsi.
Prepare a suspension of approximately 108 cells per ml in 1X PBS (Appendix 4).
Valmistatakse suspensioon, milles on umbes 108 rakku milliliitris 1X PBS-puhvris (4. liide).
Perform an appropriate ELISA procedure with a specific monoclonal antibody to R. solanacearum.
Tehakse sobiv ELISA-analüüs R. solanacearum’i spetsiifilise monoklonaalse antikehaga.
A positive ELISA test is achieved if the ELISA reading obtained from the culture is at least half that obtained for the positive control.
ELISA-analüüs on positiivne, kui kultuuri ELISA-analüüsi tulemus on vähemalt pool positiivse kontrolli tulemusest.
Prepare a suspension of approximately 106 cells per ml in molecular grade sterile water.
Valmistatakse suspensioon, milles on umbes 106 rakku milliliitris molekulaarbioloogias kasutatava puhtusastmega steriilses vees.
A positive identification of R. solanacearum is achieved if the PCR amplicons are the same size and have the same restriction fragment length polymorphisms as for the positive control strain.
Bakterit R. solanacearum saab positiivselt kindlaks määrata siis, kui PCR-amplikonidel on positiivse kontrolli tüvega sama suurus ja neil esineb sama pikkusega restriktsioonifragmentide polümorfism.
Apply the FISH procedure (Section VI.A.7.) with at least 2 R. solanacearum-specific oligo-probes (Appendix 7).
Tehakse FISH-analüüs (VI jao punkt A.7) vähemalt kahe R. solanacearum-spetsiifilise oligoprooviga (7. liide).
Grow the culture on trypticase soy agar (Oxoid) for 48 hours at 28 °C.
Kultuuri kasvatatakse trüptikaas-sojaagaril (Oxoid) 48 tundi temperatuuril 28 °C.
The presence of characteristic fatty acids are 14:0 3OH, 16:0 2OH, 16:1 2OH and 18:1 2OH and absence of 16:0 3OH is highly indicative of a Ralstonia sp.
Tüüpiline rasvhapete esinemine on järgmine: 14:0 3OH, 16:0 2OH, 16:1 2OH ja 18:1 2OH ning tüüpiline on 16:0 3OH puudumine. Selline profiil osutab suure tõenäosusega bakterile Ralstonia sp.
Strain characterisation using one of the following methods is recommended for each new case of isolation of R. solanacearum.
solanacearum’i iga uue isoleerimisjuhtumi puhul on soovitav kasutada üht järgmistest tüve iseloomustamise meetoditest.
solanacearum is separated into biovars on the basis of the ability to utilise and/or oxidise three disaccharides and three hexose alcohols (Hayward, 1964 and Hayward et al., 1990).
solanacearum jagatakse biotüüpidesse selle põhjal, kuidas see suudab kasutada ja/või oksüdeerida kolme disahhariidi ja kolme heksoosalkoholi (Hayward, 1964 ja Hayward et al., 1990).
Growth media for the biovar test is described in Appendix 2.
Biotüübi kasvusöödet kirjeldatakse 2. liites.
The test can be successfully performed by stab inoculating the media with pure cultures of R. solanacearum isolates and incubating at 28 °C.
Analüüsi saab edukalt teha, inokuleerides söödet R. solanacearum’i puhaskultuuridega ja inkubeerides 28 °C juures.
If the media are dispensed into sterile 96 well cell culture plates (200 µl per well) colour change from olive green to yellow can be observed within 72 hours, indicating a positive test result.
Kui steriilsele 96 auguga rakukultuuri söötmeplaadile (200 µl augu kohta) jaotatud sööde muutub 72 tunni jooksul oliivrohelisest kollaseks, on analüüsi tulemus positiivne.
Utilisation of:
Järgmiste ainete kasutamine:
Maltose
maltoos
Lactose
laktoos
D (+) Cellobiose
D (+) tsellobioos
Additional tests differentiate biovar 2 sub-phenotypes
Lisaanalüüsidega eristatakse biotüübi 2 alamfenotüüpe
(Worldwide distribution)
(Levinud üle maailma)
(Found in Chile and Colombia)
(Leitud Tšiilis ja Kolumbias)
(Found in tropical areas)
(Leitud troopilistel aladel)
Utilisation of trehalose
Trehhaloosi kasutamine
Utilisation of meso-inositol
Meso-inositooli kasutamine
Utilisation of D ribose
D-riboosi kasutamine
Pectolytic activity [101]
Pektolüütiline aktiivsus [101]
low
madal
high
kõrge
Molecular differentiation of strains in the R. solanacearum complex can be achieved using several techniques, including:
Haigusetekitaja R. solanacearum liittüvede molekulaarseks eristamiseks võib kasutada erinevaid meetodeid, sealhulgas järgmised.
Restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis (Cook et al., 1989).
Restriktsioonifragmentide pikkuse polümorfismi (RFLP) analüüs (Cook et al., 1989).
Repetitive sequence PCR using REP, BOX and ERIC primers (Louws et al., 1995; Smith et al., 1995).
Korduvjärjestusega PCR, kasutades REP, BOX ja ERIC praimereid (Louws et al., 1995; Smith et al., 1995).
Amplified fragment length polymorphism (AFLP) analysis (Van der Wolf et al., 1998).
Amplifitseeritud fragmentide pikkuse polümorfismi (AFLP) analüüs (Van der Wolf et al., 1998).
Specific PCR primers (Pastrik et al, 2002; see Appendix 6) can be used to differentiate strains belonging to division 1 (biovars 3, 4 and 5) and division 2 (biovars 1, 2A and 2T) of R. solanacearum, as originally defined by RFLP analysis (Cook et al., 1989) and 16S rDNA sequencing (Taghavi et al., 1996).
Eristamaks tüvesid, mis kuuluvad RFLP analüüsi (Cook et al., 1989) ja 16S rDNA järjestuse määramise (Taghavi et al., 1996) kohaselt R. solanacearum’i 1. (biotüübid 3, 4 ja 5) ja 2. rühma (biotüübid 1, 2A ja 2T), võib kasutada spetsiifilisi PCR-praimerid (Pastrik et al, 2002; vt 6. liide).
The pathogenicity test must be performed as final confirmation of a diagnosis of R. solanacearum and for assessment of virulence of cultures identified as R. solanacearum.
solanacearum’i diagnoosi lõplikuks kinnitamiseks ning R. solanacearum’ina identifitseeritud bakterkultuuri virulentsuse hindamiseks tuleb teha patogeensusanalüüs.
Prepare an inoculum of approximately 106 cells per ml from a 24 to 48 hour culture of the isolate to be tested and an appropriate positive control strain of R. solanacearum (e.g. NCPPB 4156 = PD 2762 = CFBP 3857; see Appendix 3).
Analüüsitava isolaadi 24–28 tunni vanusest isolaadist ja bakteri R. solanacearum kohasest positiivse kontrolli tüvest (nt NCPPB 4156 või PD 2762 või CFBP 3857; vt 3. liide) tehakse inokulaat, milles on umbes 106 rakku milliliitris.