natgillin/translations-raw huggingface dataset:
We summarized all genes in a pathway as node and the edges represented the relationships between the pathways.
Me summeerime kõik geenid rajas graafi punktina ja servad väljendavad radade vahelisi ühendusi.
The tools can also provide network visualization on gene interactions from pathway analysis.
Tööriistad pakuvad ka võrgustiku visualiseerimist geenide baasil, radade analüüsist.
The current available tools can query a gene list on a pathway database and will result in a table showing genes associated to different pathways.
Hetke tööriistad, mis pärivad geenijärjendeid radade andmebaasist, näitavad tabeleid geenide seostest radadega.
The goal of the thesis was to create a database, which would enable developing an application that would allow effective searching of relevant court documents and analyzing the results.
Töö eesmärgiks on luua andmebaas, mille põhjal saaks arendada tarkvara, mis võimaldaks efektiivselt relevantseid kohtulahendeid otsida ning otsingute tulemusi analüüsida.
Pattern based information extraction from Estonian court documents
Mustripõhine informatsiooni eraldamine Eesti kohtulahenditest
This thesis describes how pattern based information extraction methods were applied to Estonian court documents, which is an Estonian language resource that until now has remained mostly unused.
Käesolevas töös rakendatakse mustripõhise informatsiooni eraldamise meetodeid Eesti kohtulahenditele, mis on senimaani vähekasutatud eestikeelne ressurss.
The database enables analyzing decisions written down in the court documents, for example based on counties and the different Estonian courts.
Töö käigus loodud andmebaasis on kohtulahenditest eraldatud huvipakkuvat informatsiooni sisaldavad tekstiosad, mille põhjal on kohtuotsuste tulemusi võimalik analüüsida näiteks maakondade ja kohtute lõikes.
In addition, we wanted to know which kind of biochemical changes accompany Wfs1 deficiency in neurotransmitter systems (dopamine, serotonin, noradrenaline, GABA) strongly implicated in psychiatric disorders.
Lisaks soovisime teada, millised biokeemilised muutused toimuvad peamistes psühhiaatriliste haigustega seotud virgatsainesüsteemides (dopamiin, serotoniin, noradrenaliin ja GABA) hiire ajus.
Although WS is characterized by multiple different symptoms like diabetes, optic nerve atrophy and deafness, WS patients also have a higher likelihood of depression, anxiety and psychoses.
Kuigi WS-i iseloomustavad paljud eri sümptomid nagu diabeet, nägemisnärvi kärbumine ja kurtus, on intrigeeriv, et WS-i patsientidel esineb lisaks oluliselt tihemini depressiooni, ärevust ja psühhoose.
Homozygous mutations of WFS1 gene cause Wolfram syndrome (WS), a rare and severe disease.
WFS1 geeni homosügootsed mutatsioonid põhjustavad Wolframi sündroomi (WS), mis on üliharuldane ja väga raske kuluga haigus.
Mutations in some human genes are associated with a higher incidence of these disorders.
Mõnedes inimese geenides esinevate mutatsioonide puhul ilmneb neid häireid oluliselt sagedamini.
Pharmacological and behavioral characterization of the monoaminergic and GABA-ergic systems of Wfs1-deficient mice
Wfs1 geeni puudulikkusega hiire monoamiinergilise ja GABA-ergilise süsteemi farmakoloogiline ja käitumuslik iseloomustus
In addition, heterozygous carriers of WFS1 mutations display elevated chance of being hospitalized with depression.
Lisaks, ka WFS1 heterosügootsetel isikutel on leitud palju suurem risk sattuda haiglasse raske depressiooniga.
Thirdly, we detected behavioral and genetic alterations to the GABA system, owing to Wfs1 gene deficiency, which indicate changes to mechanisms important in the etiology of anxiety.
Kolmandaks leidsime nii käitumuslikke kui geneetilisi muutusi GABA süsteemis, mis võib näidata ärevuse tekkes oluliste mehhanismide kõrvalekaldeid tulenevalt Wfs1 geeni puudulikkusest.
Because WFS1 mutations are closely related to debilitating psychiatric disorders, we decided to study the behavioral and biochemical phenotype caused by changes in this gene using a Wfs1-deficient mouse line.
Tulenevalt sellest, et WFS1 geeni mutatsioonid on tihedalt seotud raskete vaimsete häirete tekkega, otsustasime uurida selle geeni puudulikkusest tulenevaid käitumuslikke ja kesknärvisüsteemi muutusi hiiremudelis, millel eelnevalt tekitasime vastavad mutatsioonid Wfs1 geeni.
The aim was to see if the behavior and biochemical profile of these mutant mice reflects characteristics of human psychiatric disorders and would allow for this mouse model to be used when screening anxiolytic and antidepressant drugs in the field of translational medicine.
Eesmärk oli vaadata, kas nende mutanthiirte käitumine spetsiaalsetes katseseadmetes peegeldab vaimsete häirete tunnusjooni, mis võimaldaks seda loommudelit kasutada ärevus- ja depressiooniravimite siirdemeditsiinilistes uuringutes näiteks WS-i puhul.
By contrast, serotonin levels do rise in wild-type animals which is a known response.
Seevastu mutatsioonita hiirtel serotoniini tasemed tõusevad, mis on üldiselt tavapärane.
Mood and anxiety disorders are prevalent and debilitating psychiatric disorders.
Meeleolu- ja ärevushäired on laialt levinud väga rasked psühhiaatrilised haigused.
At the same time, brain serotonin levels do not rise in Wfs1-deficient animals in response to exposure to a stress-inducing environment.
Samas ei tõuse Wfs1-puudulike hiirte serotoniini tasemed ajus vastusena ärevust tekitavale keskkonnale (nt ereda valgusega avaral väljal); pigem isegi langevad.
Secondly, the dopaminergic system is impaired in many aspects in Wfs1 mutants.
Esiteks ilmnes, et dopamiini süsteem oli neil hiirtel oluliselt pidurdatud mitmes aspektis.
We first found that these mice had alterations to serotonin metabolism and an elevated reaction to serotonergic antidepressants in behavioral despair experiments.
Teiseks ilmnes, et nendel hiirtel on häirunud serotoniini talitlus ja need hiired on tundlikumad laialt levinud serotonergilistele ja noradrenergilistele antidepressantidele (paroksetiin ja imipramiin) depressiooni-laadset seisundit peegeldavates testides.
The benefits of biosensors are their low cost, simplicity and possibility for rapid real-time analysis.
Biosensorite eeliseks on nende lihtsus, suhteline odavus ning kiirus, mis võimaldab nende kasutamist kiireteks analüüsideks reaalajas.
Biosensing penicillins’ residues in milk flows
Penitsilliinide jääkide määramine piimas läbivoolulise biosensorsüsteemi abil
Glucose concentration in their milk decreased significantly compared to glucose levels in high quality milk, enabling to use glucose concentration as an indicator of the presence of penicillin residues in milk.
Töö tulemusena leidsime, et glükoosi tase piimas on heaks indikaatoriks penitsilliini jääkide määramiseks toorpiimas.
The system can be further modified by attaching additional biosensors to build up a more robust biosensor array, where the signals of individual biosensors form a typical pattern of milk sample, which changes in the presence of different antibiotics.
Kasutatud biosensorsüsteemi on erinevate antibiotikumide jääkide määramiseks toorpiimas võimalik tulevikus modifitseerida täiendavate biosensorite lisamisega.
The application of biosensors for the detection of antibiotic residues in milk is a good alternative to traditional methods.
Üheks võimalikuks alternatiiviks traditsioonilistele analüüsimeetoditele on biosensorite kasutamine.
The main goal of the present work was to propose a rapid method for real-time detection of penicillins’ residues in milk, to propose a simple but sufficiently accurate model to describe the quick response of biosensor and to test this biosensorsystem.
Käesoleva doktoritöö eesmärgiks oli välja töötada ning testida biosensorsüsteem penitsilliinide jääkide kiireks määramiseks toorpiimas.
The studied biosensor set-up has high potential to serve as a system for real-time automatic control of the quality of raw milk in the milk production farms.
Kiire lüpstava piima analüüs võimaldaks mittekvaliteetse piima õigeaegset eraldamist kvaliteetsest toodangust ning kogu toodetava piima kvaliteedi tõstmist.
The biosensor was applied to detect the penicillins in the milk of cows with mastitis.
Seega, kasutatud biosensorsüsteem on rakendatav kiireks penitsillinide jääkide määramiseks toorpiimas piimafarmides.
Antibiotic residues in food are commonly determined with the help of chromatography and special tests.
Tavaliselt kasutatakse antibiootikumide jääkide määramiseks piimas mitmesuguseid kromatograafial põhinevaid meetodeid ning erinevaid mikroobse inhibeerimise ja immuunoretseptor teste.
The use of antibiotics for the treatment of food-producing animals generates the risk to human health due to the transmission of the residues and metabolites of these compounds into food chain.
Penitsilliini ja teiste antibiootikumide jäägid piimas tekitavad inimestel allergilisi reaktsioone ning soodustavad resistentsete mikroobitüvede teket, mistõttu on antibiootikumide jääkide lubatud sisaldus toidus rangelt reguleeritud.
The application of the model allowed to predict optimal biosensor parameters for obtaining maximal sensitivity and high stability on one hand, and to obtain fast results from the initial phase of the reaction on the other hand.
Selleks, et kiirendada eksperimentaalsete andmete analüüsi, me pakkusime välja matemaatiline mudel biosensori kalibratsiooniparameetrite arvutamiseks ning uurisime võimalusi biosensorites toimuvate äratundmisreaktsioonide kiirendamiseks.
In addition, scientists and health experts also fear that wide application of antimicrobial agents, including the first discovered penicillin antibiotics, is contributing to the rise and spread of antibiotic-resistant bacteria.
Penitsilliinid on beetalaktaamide hulka kuuluvad antibiootikumid, mida kasutatakse peamiselt Gram-positiivsete bakterite poolt tekitatud haiguste raviks.
Estonian Ministry of the Interior 90: Estonian Ministry of the Interior and its ministers through 90 years
Siseministeerium 90: Eesti Vabariigi Siseministeerium ja ministrid läbi 90 aasta
Dialect Translation Methods
Murdkeele kirjakeelestamise metoodikad
Thesis gives an overview of Estonian dialects, describes how created translation methods work, analyses gathered translation results and suggests aspects that could be improved or fixed.
Töös antakse ülevaade Eesti murrete taustast, kirjeldatakse loodud tõlkelahenduste tööpõhimõtet, analüüsitakse saadud tõlketulemusi ning tuuakse välja aspekte, mida lahenduste puhul annaks parandada või edasi arendada.
There are three different solutions implemented in this thesis: translation of lemmas using a dialect corpus, transformation on words with regular expressions and statistical machine translation method.
Katsetatud lahendusi oli kolm: murdekorpuse abil lemmade tõlkimine, regulaaravaldiste abil sõnade teisendamine ning statistiline masintõlge.
This Bachelor’s thesis focuses on different solutions for translating texts in dialects to Estonian written language so that it would make materials in dialects more easily processable.
Bakalaureusetöös keskenduti erinevatele võimalustele, kuidas saaks murdekeelseid tekste tõlkida eesti kirjakeele vormi.
The building of new residential areas and the development of spatial planning practice: the case of Harju county
Uuselamuehitus ja planeerimispraktika areng Harjumaa näitel
Results and conclusions.
Tulemused ja järeldused.
Neonates were included in the study (n=278) if they were younger than 72 hours, needed early empiric antibiotic treatment on clinical suspicion and/or due to risk factors of infection and were expected to stay in the unit for >24 hours.
Uuringusse kaasati 278 vastsündinut, kes olid osakonda saabudes nooremad kui 72 tundi, vajasid sepsise kahtluse või riskifaktorite olemasolu tõttu empiirilist antibakteriaalset ravi ning viibisid osakonnas vähemalt 24 tundi.
Prior mucosal colonization with Gram-negative opportunistic micro-organisms and MRSA may lead to invasive disease.
Eelnev limaskestade kolonisatsioon Gram-negatiivsete oportunistlike mikroobide ja MRSA-ga võib olla aluseks invasiivse infektsiooni väljakujunemisele.
Host-related factors like the degree of prematurity should also be considered.
Samuti tuleks arvestada enneaegsust ja muid lapsest sõltuvaid faktoreid.
The mucosal colonisation by E. coli, K. oxytoca and C. albicans is mainly influenced by maternal and early perinatal factors, while K. pneumoniae, E. cloacae, MRSA and non-albicans Candida spp.
Selgus, et limaskestade kolonisatsiooni E. coli, K. oxytoca ja C. albicans’ga mõjutasid peamiselt emapoolsed ja perinataalsed faktorid, kusjuures kolonisatsioon K. pneumoniae, E. cloaceae, MRSA ja mitte-albicans-Candida’ga oli peamiselt tingitud haigla keskkonnast ja lapse enneaegsusest.
The prospective open label two centre cluster randomised study was conducted between August 2, 2006 and November 30, 2007 in NICUs of Tartu University Hospital and Tallinn Children’s Hospital.
Prospektivine, kahekeskuseline, klaster-randomiseeritud avatud uuring viidi läbi Tallinna Lastehaigla ja Tartu Ülikooli Kliinikumi laste- ja vastsündinute intensiivravi osakondades 02.08.2006 kuni 30.11.2007.
They may offer an opportunity to improve infection control measures, to cohort patients and to select the most appropriate empiric antibiotic regimen.
See aitaks parandada infektsioonikontrolli meetmeid ja oleks abiks empiirilise ravi valikul.
Rectal (n=1250) and NP (n=1153) specimens were collected on admission and then twice a week until discharge or Day 60 whichever occurred first.
Limaskestade kolonisatsiooni hindamiseks koguti nina-neelu materjal (n=1153) ja rektaalkaabe (n=1250) patsiendi osakonda saabumisel ja edaspidi kaks korda nädalas kuni osakonnas viibimise lõpuni või kuni 60-da ravipäevani.
The molecular analysis was performed for detection relatedness of mucosal and invasive strains.
Molekulaarseid uuringuid kasutati limaskestade ja invasiivsete tüvede klonaalsuse selgitamiseks.
The first colonizers in neonates admitted to NICU with risk factors of EOS were Gram-positive bacteria, among which coagulase negative staphylococci clearly predominated.
Esmased seedetrakti koloniseerijad olid Gram-positiivsed bakterid, milledest ülekaalukalt domineerisid koagulaas negatiivsed stafülokokid.
Early mucosal colonisation and its role in prediction of invasive infection in neonates at risk of early onset sepsis
Varase sepsise riskiga vastsündinute limaskestade kolonisatsioon ja selle osatähtsus invasiivse infektsiooni prognoosimisel
Normally sterile body fluids (n=554) were cultured preferably before administration of antibiotics on admission and then if clinical condition deteriorated and symptoms suggestive of neonatal sepsis.
Uuringumaterjalid steriilsetest kehavedelikest (n=554) võeti patsiendi osakonda saabumisel enne antibakteriaalse ravi alustamist ja edaspidi vastavalt kliinilisele vajadusele.
Risk factors (e.g. duration of NICU stay, unit, gestation age, route of delivery) influencing NP and rectal colonisation including AR strains are similar and species-specific and are closely inter-related making extrapolations from one site to the other feasible.
Riskifaktorite mõju (näiteks haiglas viibimise aeg, osakond, gestatsiooni vanus, sünniviis) sooletrakti ja nina-neelu kolonisatsioonile nii antibiootikum-tundlike kui ka ravimresistentsete tüvede osas oli sarnane, omavahel tihedalt seotud ja mikroobispetsiifiline ning seetõttu on neid võimalik üldistada mõlemale piirkonnale.
Besides it, the aims were also addressed to identify independent perinatal, neonatal, and environmental factors influencing the colonisation process; to identify the relatedness of microorganisms isolated from NP and rectum to isolates form sterile sites and thus characterize their potential for causing invasive disease; and to define the value of twice a week collected surveillance cultures in predicting Gram-negative late onset sepsis (LOS) in high risk neonates admitted to NICU.
Lisaks sellele hinnati perinataalsete, neonataalsete ja keskkonna faktoreite osa limaskestade kolonisatsiooni tekkes; seost kolonisatsiooni ja infektsioone põhjustavate mikroobitüvede vahel; ning kaks korda nädalas kogutud järelevalvekülvide olulisust sepsise prognoosimisel.
The general aim of the study was to compare how antibiotics commonly used for empiric therapy of EOS (ampicillin or penicillin both combined with gentamicin) influence the development of gut and nasopharyngeal (NP) microbiota and to define which of the abovementioned regimens should be preferred in terms of mucosal colonisation.
Uurimistöö peamiseks eesmärgiks oli selgitada vastsündinute varase sepsise empiiriliseks raviks kasutatavate ravirežiimide (ampitsilliin ja penitsilliin kombinatsioonis gentamütsiiniga) mõju vastsündinute rektaalse ja ninaleelu kolonisatsioonile oportunistlike mikroobidega.
The association between colonization by different microbes and a total of 22 maternal or neonatal predefined risk factors was assessed by using univariate and multiple logistic regression analyses.
Nii emapoolsete kui ka keskkonnast ja lapsest sõltuvate kolonisatsiooni riskifaktorite (n=22) selgitamiseks kasutati ühest ja mitmest logistilist regressiooni.
In patients with risk factors for EOS the impact of ampicillin (a broader spectrum antibacterial agent compared with penicillin) on mucosal colonisation with Gram-negative microorganisms including AR strains may have been over-estimated.
Võrreldes ampitsilliini, kui laiema toimespektriga antibiootikumi mõju penitsilliiniga, võib väita, et esmamainitu toimet Gram-negatiivsele mikrofloorale ja ravimresistentsete tüvede tekkele on ilmselt ülehinnatud.
All samples were also plated onto MacConkey agar with 16 μg/ml of ampicillin for the detection of Gram-negative ampicillin-resistant (AR) strains.
Materjal mikrobioloogilisteks uuringuteks külvati veri-, MacConkey ja Sabouraud agarile ning ampitsilliin-resistentsete tüvede selgitamiseks MacConkey agarile, kuhu oli lisatud 16 µg/ml ampitsilliini.
We suggest that the selection should be made mainly according to the local distribution of EOS causing microorganisms and their antibiotic susceptibility.
Seega peaks ravimrežiimi eelistus baseeruma lokaalsel olukorral; st millised on vastava osakonna sagedasemad infektsioonitekitajad ja nende ravimtundlikkus.
The sensitivity, specificity, negative and positive predictive values of surveillance cultures of 2108 mucosal and corresponding invasive culture pairs were calculated in predicting Gram-negative late-onset sepsis.
Järelevalvekülvide väärtuse hindamiseks sepsise prognoosimisel arvutati eraldi sensitiivsus, spetsiifilisus ning positiivne (PPV) ja negatiivne prognostiline väärtus iga võetud külvi kui ka patsiendi kohta.
However, the sensitivity, specificity and PPVs of mucosal surveillance samples in predicting invasive disease is moderate for Enterobacteriaceae and suboptimal for non-fermentative micro-organisms.
Siiski on järelevalvekülvide sensitiivsus, spetsiifilisus ja PPV invasiivse infektsiooni tekke prognoosimiseks madalad (väärtused vastavalt 27%, 66% ja 4%) ja seega on nad väheefektiivsed.
The frequent opportunistic colonizers were also frequent causative agents of LOS.
Samuti on nende kogumine küllalt kulukas ja aeganõudev.
Colonization by Gram-negatives in NP and rectal area were similar.
Kuigi antud kahe piirkonna mikroobne kooslus oli sarnane, esines siiski ka piirkonna valikulist mõju.
but more often colonised with S. haemolyticus and S. hominis than those treated with penicillin.
Näiteks koloniseeruti ampitsilliinravi korral võrreldes penitsilliiniga rohkem S. haemolyticus´e (erinevus +0,7; p=0,039) ja S. hominis´ga (+1,9, p=0,003), kuid vähem S. aureus’e (-1,9; p=0,006) ja enterokokkidega (-1,2; p<0,001).
From patients receiving artificial lung ventilation tracheal aspirate (n=60) instead of NP swab was collected.
Näiteks oli rektaalselt võrreldes nina-neeluga 1,5-2,5 korda suurem šanss kolonisatsiooniks enterobakteritega ja väiksem šanss (OR=0,52; 95% CI 0,30-0,89) Acinetobacter spp-ga.
Combining Support Vector Machines to Predict Novel Angiogenesis Genes
Tugivektormasinate kombineerimine angiogeneesiga seotud geenide ennustamiseks
We also determined that our method gave significantly more stable results than the second best approach.
Lisaks näidatakse, et Comb-SVM ennustused on oluliselt stabiilsemad väikeste muudatuste suhtes treeningandmetes kui paremuselt teise algoritmi tulemused.
In this work, we proposed a new Comb-SVM machine learning method to predict new members to the positive class, that does not require a clearly defined negative examples.
Töö teises osas pakutakse välja uudne Comb-SVM meetod kandidaatgeenide ennustamiseks.
We applied this method to 341 known angiogenesis genes.
Lisaks on meie koostööpartnerid koostanud nimekirja 341-st veresoonte loomega seotud geenist.
The idea is to train multiple Support Vector Machines (SVMs) using known genes as positive samples and various randomly selected sets of genes as negative examples.
Kõigepealt kasutatakse juba tuntud angiogeneesi geene ning juhuslikult valitud negatiivseid geene, et treenida paralleelselt mitu tugivektormasinal (ingl k Support Vector Machine) põhinevat klassifitseerijat.
It is part of normal bodily functions like wound healing, but it also plays an important role in cancer development.
Küll on aga teada, et vähi arengus on olulisel kohal angiogenees, mille käigus vähk paneb enda ümber asuvad veresooned hargnema ja kasvama.
Finally, we verified the biological relevance of the predicted genes by searching the literature and Gene Ontology.
Kõige lõpuks kasu- tatakse teaduskirjandust ning Gene Ontology andmebaasi veendumaks, et uued ennustatud geenid on tõpoolest seotud angiogeneesiga.
According to cross-validation experiments, our method outperformed most of the existing methods when looking at areas under Receiver Operator Characteristic and Precision-Recall curves.
Töö lõpus näidatakse, et 10-kordse ristvalideerimise põhjal on Comb-SVM täpsem kui enamik olemasolevaid meetodeid.
The multiple SVMs are then used to separately classify all remaining human genes and the results are finally aggregated using a rank aggregation algorithm.
Kõigi nende meetodite puhul kasutatakse sisendiks võimalikult sarnaseid andmeid ning mõõdetakse siis 10-kordse ristvalideerimise abil, kui edukad need on juba tuntud angiogeneesi geenide ülesleidmisel.
Early vocabulary and later language skills
Varane sõnavara ja hilisemad lingvistilised võimed
Immobilizable Bisubstrate-Analogue Inhibitors of Basophilic Protein Kinases: Development and Application in Biosensors
Immobiliseeritavad basofiilsete proteiinkinaaside bisubstraat-analooginhibiitorid: arendus ja rakendamine biosensorites
Estonian people's beliefs and attitudes toward mental disorders
Eestis levivad uskumused psüühikahäirete kohta
Adaptive changes of myosin isoforms in response to long-term strength training in skeletal muscle of middle-aged persons
Pikaajalise jõutreeningu mõjul toimuvad adaptatiivsed muutused müosiini isovormilises kompositsioonis keskealiste inimeste skeletilihases
Political Awareness and Substantial Change in the Left-Right Orientations in Post-Communist Society: Estonia 1991-2007
Poliitiline teadlikkus ja vasak- ja parempoolsuse sisu areng postkommunistlikus ühiskonnas: Eesti 1991-2007
However, this hypothesis has not been tested in the context of University of Tartu's admission process.
Seda hüpoteesi pole aga Tartu Ülikooli vastuvõtmisprotsessi kontekstis testitud.
In this thesis, we evaluate the efficiency of the admission score and produce more accurate and reliable student’s academic performance prediction model by analysing the application documents using data mining techniques.
Selles lõputöös hinnatakse sisseastumispunktide efektiivsust ning koostatakse täpsem ja usaldusväärsem tudengite akadeemiliste tulemuste prognoosimismudel, analüüsides sisseastumisdokumente andmekaevandamise metoodikate abil.
Predicting Academic Performance From Admission Scores and Application Data – A Case Study
Akadeemiliste tulemuste ennustamine sisseastumispunktide ja -avalduste põhjal - juhtumiuuring