natgillin/translations-raw huggingface dataset:
Οι κώνοι ομοιογενοποιούνται με επαρκή όγκο (περίπου 40 ml) ρυθμιστικού διαλύματος εξαγωγής (προσάρτημα 4), είτε σε αναμείκτη (π.χ. Waring ή Ultra Thurax) είτε με σύνθλιψη σε σφραγισμένο σάκο διαβροχής μίας χρήσης (π.χ. Stomacher ή Bioreba strong guage polythene, 150 mm x 250 mm· αποστειρωμένο διά ακτινοβολίας) χρησιμοποιώντας λαστιχένια ματσόλα ή τον κατάλληλο εξοπλισμό σύνθλιψης (π.χ. Homex).
Homogenise the cores with sufficient volume (approximately 40 ml) of extraction buffer (Appendix 4), either in a blender (e.g. Waring or Ultra Thurax) or by crushing in a sealed disposable maceration bag (e.g. Stomacher or Bioreba strong guage polythene, 150 mm × 250 mm; radiation sterilised) using a rubber mallet or suitable grinding apparatus (e.g. Homex).
Σημείωση: Ο κίνδυνος επιμόλυνσης των δειγμάτων είναι υψηλός όταν τα δείγματα έχουν ομοιογενοποιηθεί με τη χρήση αναμείκτη.
Note: The risk of cross-contamination of samples is high when samples are homogenized using a blender.
Πρέπει να εξασφαλισθεί ότι για κάθε δείγμα οι λεπίδες και τα δοχεία του αναμεικτήρα αποστειρώνονται λίγο πριν από την έναρξη της διαδικασίας.
Ensure that freshly sterilised blender blades and vessels are used for each sample.
Στις περιπτώσεις που πρόκειται να χρησιμοποιηθεί η PCR, συνιστάται η σύνθλιψη σε σάκους μίας χρήσης καθώς και η χρήση σωλήνων μίας χρήσης.
Crushing in disposable bags and use of disposable tubes is recommended where PCR is to be used.
Εάν το υγρό εμφανίζεται υπερβολικά θολό, καθίσταται διαυγές είτε με φυγοκέντριση σε χαμηλή ταχύτητα (όχι περισσότερο από 180 g για 10 λεπτά σε θερμοκρασία 4-10 °C) είτε με διήθηση (40-100 µm) με αντλία κενού, πλένοντας το φίλτρο με πρόσθετο (10 ml) ρυθμιστικό διάλυμα εξαγωγής.
If excessively cloudy, clarify either by slow speed centrifugation (at not more than 180 g for 10 minutes at a temperature between 4 to 10 °C) or by vacuum filtration (40 to 100 µm), washing the filter with additional (approximately 10 ml) extraction buffer.
Το ίζημα αναδιαλύεται σε 1,5 ml ρυθμιστικού διαλύματος ιζήματος (προσάρτημα 4).
Resuspend the pellet in 1.5 ml pellet buffer (Appendix 4).
Χρησιμοποιούνται 500 µl για το R. solanacearum, 500 µl για το Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus και 500 µl για σκοπούς αναφοράς.
Use 500 µl to test for R. solanacearum, 500 µl for Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus and 500 µl for reference purposes.
Προστίθεται αποστειρωμένη γλυκερίνη σε τελική συγκέντρωση 10-25 % (v/v) στα 500 µl της κατάλληλης ποσότητας αναφοράς και στην εναπομείνασα κατάλληλη ποσότητα δοκιμής, ανακατεύουμε με στροβιλισμό (vortex) και αποθηκεύουμε στους –16 έως –24 °C (εβδομάδες) ή στους –68 έως –86 °C (μήνες).
Add sterile glycerol to final concentration of 10 to 25 % (v/v) to the 500 µl of the reference aliquot and to the remaining test aliquot, vortex and store at –16 to –24 °C (weeks) or at –68 to –86 °C (months).
Είναι επιτακτικό όπως όλοι οι θετικοί μάρτυρες του R. solanacearum και τα δείγματα κατεργάζονται χωριστά, ώστε να αποφεύγεται η επιμόλυνση.
It is imperative that all R. solanacearum positive controls and samples are treated separately to avoid contamination.
Βλ. το διάγραμμα ροής και την περιγραφή των δοκιμών και των βελτιστοποιημένων πρωτοκόλλων στα σχετικά προσαρτήματα:
See Flow chart and description of the tests and optimised protocols in the relevant appendices:
Εκλεκτική απομόνωση (βλ. ενότητα VI.A.4.)
Selective isolation (see Section VI.A.4.)
Δοκιμή IF (βλ. ενότητα VI.A.5)
IF test (see Section VI.A.5.)
Δοκιμές PCR (βλ. ενότητα VI.A.6.)
PCR tests (see Section VI.A.6.)
Δοκιμή FISH (βλ. ενότητα VI.A.7.)
FISH test (see Section VI.A.7.)
Δοκιμές ELISA (βλ. ενότητα VI.A.8.)
ELISA tests (see Section VI.A.8.)
Βιοδοκιμή (βλ. ενότητα VI.A.9.)
Bioassay (see Section VI.A.9.)
Λεπτομερείς μέθοδοι για την ανίχνευση και ταυτοποίηση του R. solanacearum σε δείγματα ασυμπτωματικών φυτών πατάτας, τομάτας ή άλλων φυτών ξενιστών
Detailed methods for detection and identification of R. solanacearum in samples of asymptomatic potato, tomato or other host plants
Σημείωση: Για την ανίχνευση των λανθανόντων πληθυσμών του R. solanacearum συνιστάται ο έλεγχος σύνθετων δειγμάτων.
Note: For detection of latent R. solanacearum populations it is advised to test composite samples.
Εάν πραγματοποιούνται επισκοπήσεις, αυτές πρέπει να βασίζονται σε στατιστικά αντιπροσωπευτικό δείγμα του πληθυσμού φυτών υπό εξέταση.
Where surveys are performed they should be based on a statistically representative sample of the plant population under investigation.
Τα τμήματα στελεχών 1-2 cm συλλέγονται σε κλειστό αποστειρωμένο περιέκτη σύμφωνα με τις ακόλουθες διαδικασίες δειγματοληψίας:
Collect 1 to 2 cm stem segments in a closed sterile container according to the following sampling procedures:
Άλλοι ξενιστές: Με ένα καθαρό και απολυμασμένο μαχαίρι ή κλαδευτική ψαλίδα, αφαιρείται τμήμα 1 cm από τη βάση κάθε στελέχους, πάνω ακριβώς από το έδαφος.
Other hosts: With a clean disinfected knife or pruning shears, remove a 1 cm segment from the base of each stem, just above the soil level.
Η ανίχνευση του παθογόνου είναι περισσότερο αξιόπιστη κατά τα τέλη της άνοιξης, το καλοκαίρι και το φθινόπωρο, αν και οι φυσικές μολύνσεις είναι δυνατόν να ανιχνευθούν καθ’ όλη τη διάρκεια του έτους στο πολυετές Solanum dulcamara που αναπτύσσεται στα υδατορεύματα.
Pathogen detection will be most reliable during late spring, summer and autumn seasons, although natural infections can be detected all year round in the perennial Solanum dulcamara growing in watercourses.
Γνωστοί ξενιστές είναι τα αυτοφυή φυτά πατάτας (groundkeepers – παραμένοντα στο έδαφος), Solanum dulcamara, S. nigrum, Datura stramonium και άλλα μέλη της οικογένειας των σολανωδών (Solanaceae).
Known hosts include volunteer potato plants (groundkeepers), Solanum dulcamara, S. nigrum, Datura stramonium and other members of the family Solanaceae.
Άλλοι ξενιστές είναι το Pelargonium spp. και το Portulaca oleracea.
Further hosts are Pelargonium spp. and Portulaca oleracea.
Ορισμένα ευρωπαϊκά είδη ζιζανίων, τα οποία δύνανται ενδεχομένως να φιλοξενούν πληθυσμούς R. solanacearum βιοποικιλίας 2, φυλής 3 στις ρίζες ή/και τις ριζόσφαιρες υπό ειδικές περιβαλλοντικές συνθήκες είναι τα Atriplex hastata, Bidens pilosa, Cerastium glomeratum, Chenopodium album, Eupatorium cannabinum, Galinsoga parviflora, Ranunculus scleratus, Rorippa spp, Rumex spp., Silene alba, S. nutans., Tussilago farfarra και Urtica dioica.
Some European weed spp. which may potentially harbour R. solanacearum biovar 2/Race 3 populations in roots and/or rhizospheres under specific environmental conditions include Atriplex hastata, Bidens pilosa, Cerastium glomeratum, Chenopodium album, Eupatorium cannabinum, Galinsoga parviflora, Ranunculus scleratus, Rorippa spp, Rumex spp., Silene alba, S. nutans., Tussilago farfarra and Urtica dioica.
Σημείωση: Στο στάδιο αυτό μπορεί να γίνει μακροσκοπική εξέταση για εσωτερικά συμπτώματα (χρώση του αγγειώδους ιστού ή βακτηριακό εξίδρωμα).
Note: Visual examination for internal symptoms (vascular staining or bacterial ooze) can be done at this stage.
Αφήνουμε παράμερα όλα τα τμήματα στελεχών που παρουσιάζουν συμπτώματα και τα εξετάζουμε ξεχωριστά (βλ. ενότητα ΙΙ).
Set aside any stem segments with symptoms and test separately (See Section II).
Τα τμήματα καλύπτονται με επαρκή όγκο (περίπου 40 ml) ρυθμιστικού διαλύματος εξαγωγής (προσάρτημα 4) και αναταρράσσονται σε περιστροφικό αναδευτήρα (50-100 rpm) για 4 ώρες σε θερμοκρασία χαμηλότερη των 24 °C ή για 16-24 ώρες στο ψυγείο ή
Cover the segments with sufficient volume (approximately 40 ml) of extraction buffer (Appendix 4) and agitate on a rotary shaker (50 to 100 rpm) for four hours below 24 °C or for 16 to 24 hours refrigerated, or
Υποβάλλονται σε κατεργασία αμέσως με σύνθλιψη των τμημάτων εντός ανθεκτικού σάκκου διαβροχής (π.χ. Stomacher ή Bioreba) με τον κατάλληλο όγκο ρυθμιστικού διαλύματος εξαγωγής (προσάρτημα 4) χρησιμοποιώντας λαστιχένια ματσόλα ή τον κατάλληλο εξοπλισμό σύνθλιψης (π.χ. Homex).
Process immediately by crushing the segments in a strong maceration bag (e.g. Stomacher or Bioreba) with an appropriate volume of extraction buffer (Appendix 4) using a rubber mallet or appropriate grinding apparatus (e.g. Homex).
Περαιτέρω διαύγαση του εκχυλίσματος ή της συγκέντρωσης του βακτηριακού κλάσματος δεν απαιτείται συνήθως αλλά είναι δυνατόν να επιτευχθεί με διήθηση ή/και φυγοκέντριση όπως περιγράφεται στην ενότητα III.1.1.3-1.1.5.
Further clarification of the extract or concentration of the bacterial fraction are not usually required but may be achieved by filtration and/or centrifugation as described in Section III.1.1.3 – 1.1.5.
Το αδιάλυτο ή συγκεντρωμένο εκχύλισμα δείγματος χωρίζεται σε 2 ίσα μέρη.
Divide the neat or concentrated sample extract into two equal parts.
Το ήμισυ διατηρείται σε 4-10 °C κατά τη διεξαγωγή της δοκιμής και το άλλο μισό φυλάσσεται με 10-25 % (v/v) αποστειρωμένη γλυκερίνη σε θερμοκρασία –16 έως –24 °C (εβδομάδες) ή σε θερμοκρασία –68 έως –86 °C (μήνες) για την περίπτωση που χρειασθεί η διενέργεια περαιτέρω δοκιμών.
Maintain one half at 4 to 10 °C during testing and store the other half with 10 to 25 % (v/v) sterile glycerol at –16 to –24 °C (weeks) or at –68 to –86 °C (month) in case further testing is required.
ΕΝΟΤΗΤΑ IV
SECTION IV
Δείγμα ύδατος (1)
Sample of water (1)
Συγκέντρωση του παθογόνου (2)
Concentration of the pathogen (2)
ΒΑΣΙΚΗ ΔΟΚΙΜΗ ΔΙΑΛΟΓΗΣ
CORE SCREENING TEST
Εκλεκτική απομόνωση (3)
Selective isolation (3)
Προαιρετικές συμπληρωματικές δοκιμές: βιοδοκιμή (4) / PCR εμπλουτισμού (5) / ELISA εμπλουτισμού (6)
optional auxiliary tests: bioassay (4) / enrichment PCR (5) / enrichment ELISA (6)
Αποικίες με τυπική μορφολογία (7) μετά την απομόνωση
Colonies with typical morphology (7) after isolation
δείγμα μη προσβεβλημένο από το
sample not contaminated by
ΔΟΚΙΜΕΣ ΤΑΥΤΟΠΟΙΗΣΗΣ (9)
IDENTIFICATION TESTS (9)
ΔΟΚΙΜΗ ΠΑΘΟΓΕΝΕΙΑΣ (10)
PATHOGENICITY TEST (10)
Δείγμα μη προσβεβλημένο από το
Sample not contaminated by
Δείγμα προσβεβλημένο από το
Sample contaminated by
Βλ. ενότητα IV.2.1. για τις συνιστώμενες διαδικασίες δειγματοληψίας.
See Section IV.2.1. for recommended sampling procedures.
Οι μέθοδοι συγκέντρωσης του παθογόνου περιγράφονται στην ενότητα IV.2.1.
Pathogen concentration methods are described in Section IV.2.1.
Η συγκέντρωση έχει ως αποτέλεσμα την αύξηση των πληθυσμών τόσο του παθογόνου όσο και των ανταγωνιστικών σαπροφυτικών βακτηρίων και συνιστάται μόνον εάν δεν οδηγεί στην παρεμπόδιση της δοκιμής απομόνωσης.
Concentration increases populations of both pathogen and competing saprophytic bacteria and is recommended only if it does not result in inhibition of the isolation test.
Η βιοδοκιμή περιγράφεται στην ενότητα VI.A.9.
The bioassay test is described in Section VI.A.9.
Οι μέθοδοι εμπλουτισμού PCR περιγράφονται στις ενότητες VI.A.4.2 και VI.A.6.
Enrichment PCR methods are described in Section VI.A.4.2 and Section VI.A.6.
Οι μέθοδοι εμπλουτισμού ELISA περιγράφονται στις ενότητες VI.A.4.2 και VI.A.8.
Enrichment ELISA methods are described in Section VI.A.4.2 and Section VI.A.8.
Η καλλιέργεια είναι δυνατόν να αποτύχει λόγω ανταγωνισμού ή παρεμπόδισης από σαπροφυτικά βακτήρια.
Culturing can fail due to competition or inhibition by saprophytic bacteria.
Εάν υπάρχουν υπόνοιες ότι υψηλοί πληθυσμοί σαπροφύτων επηρεάζουν την αξιοπιστία της απομόνωσης, επαναλαμβάνονται οι δοκιμές απομόνωσης με την αραίωση του δείγματος σε αποστειρωμένο νερό.
If high saprophyte populations are suspected to affect the reliability of the isolation, then repeat the isolation tests after dilution of the sample in sterile water.
Το επικυρωμένο σχήμα ανίχνευσης που περιγράφεται στην ενότητα αυτή, εφαρμόζεται για την ανίχνευση του παθογόνου σε δείγματα επιφανειακών υδάτων και μπορεί επίσης να εφαρμοσθεί για την εξέταση δειγμάτων λυμάτων κατεργασίας πατάτας ή ακάθαρτων υδάτων.
The validated detection scheme, described in this section, is applicable for pathogen detection in samples of surface water and can also be applied for testing samples of potato processing or sewage effluents.
Είναι σημαντικό, ωστόσο, να σημειωθεί ότι η αναμενόμενη ευαισθησία της ανίχνευσης θα ποικίλλει ανάλογα με το υπόστρωμα.
However, it is important to note that the expected sensitivity of detection will vary with the substrate.
Η ευαισθησία της δοκιμής απομόνωσης επηρεάζεται από τους πληθυσμούς των ανταγωνιστικών σαπροφυτικών βακτηρίων που είναι συνήθως κατά πολύ περισσότεροι στα λύματα κατεργασίας πατάτας και ακάθαρτων υδάτων απ’ ό,τι στα επιφανειακά ύδατα.
Sensitivity of the isolation test is affected by populations of competing saprophytic bacteria which are generally much higher in potato processing and sewage effluents than in surface water.
Ενώ το σχήμα που ακολουθεί αναμένεται να ανιχνεύσει τόσο λίγα όσο 103 κύτταρα ανά λίτρο σε επιφανειακά ύδατα, η ευαισθησία ανίχνευσης σε λύματα κατεργασίας πατάτας ή ακάθαρτων υδάτων είναι πιθανόν να είναι κατά πολύ μικρότερη.
Whereas the scheme below is expected to detect as few as 103 cells per litre in surface water the sensitivity of detection in potato processing or sewage effluents is likely to be significantly lower.
Για το λόγο αυτό, συνιστάται η εξέταση λυμάτων ύστερα από κάθε εργασία καθαρισμού (π.χ. καθίζηση ή διήθηση) κατά την οποία μειώνονται οι πληθυσμοί των σαπροφυτικών βακτηρίων.
For this reason, it is recommended to test effluents after any purification treatments (e.g. sedimentation or filtration) during which saprophytic bacterial populations are reduced.
Οι περιορισμοί όσον αφορά την ευαισθησία του σχήματος δοκιμών πρέπει να λαμβάνονται υπόψη κατά την αξιολόγηση της αξιοπιστίας οιωνδήποτε αρνητικών αποτελεσμάτων.
The limitations in sensitivity of the test scheme should be considered when assessing the reliability of any negative results obtained.
Παρά το γεγονός ότι το εν λόγω σχήμα έχει χρησιμοποιηθεί με επιτυχία σε εργασίες επισκόπησης για τον προσδιορισμό της παρουσίας ή απουσίας του παθογόνου σε επιφανειακά ύδατα, οι περιορισμοί που το συνοδεύουν πρέπει να λαμβάνονται υπόψη όταν χρησιμοποιείται σε παρόμοιες επισκοπήσεις λυμάτων κατεργασίας πατάτας ή ακάθαρτων υδάτων.
Whereas this scheme has been successfully used in survey work to determine presence or absence of the pathogen in surface water, its limitations should be realised when used in similar surveys of potato processing or sewage effluents.
Η ανίχνευση του R. solanacearum σε επιφανειακά ύδατα είναι πιο αξιόπιστη κατά τα τέλη της άνοιξης, το καλοκαίρι και το φθινόπωρο όταν η θερμοκρασία του ύδατος υπερβαίνει τους 15 °C.
Detection of R. solanacearum in surface water is most reliable during late spring, summer and autumn seasons when water temperatures exceed 15 °C.
Η επαναλαμβανόμενη δειγματοληψία σε διαφορετικές χρονικές στιγμές κατά την προαναφερθείσα χρονική περίοδο σε προσδιορισθέντα σημεία δειγματοληψίας θα ενισχύσει την αξιοπιστία της ανίχνευσης μειώνοντας τις επιδράσεις των κλιματικών μεταβολών.
Repeated sampling at different times in the above mentioned period at designated sampling points will increase the reliability of detection by reducing the effects of climatic variation.
Πρέπει να λαμβάνονται υπόψη οι επιδράσεις των ισχυρών βροχοπτώσεων και της γεωγραφίας των υδάτινων ρευμάτων έτσι ώστε να αποφεύγονται τα αποτελέσματα μεγάλης αραιώσεως που ενδέχεται να καταστήσουν ασαφή την παρουσία του παθογόνου.
Take into account the effects of heavy rainfall and the geography of the watercourse to avoid extensive dilution effects that may obscure presence of the pathogen.
Πρέπει να λαμβάνονται δείγματα επιφανειακών υδάτων που βρίσκονται κοντά σε φυτά ξενιστές εάν τα εν λόγω φυτά υπάρχουν.
Take surface water samples in the vicinity of host plants if these hosts are present.
Σε επιλεγμένα σημεία δειγματοληψίας, συλλέγουμε δείγματα νερού γεμίζοντας αποστειρωμένους σωλήνες ή φιάλες μίας χρήσεως, εάν είναι δυνατόν, σε βάθος κάτω των 30 cm και εντός αποστάσεως 2 m από την όχθη.
At selected sampling points, collect water samples by filling disposable sterile tubes or bottles at a depth if possible below 30 cm and within 2 m from the bank.
Όσον αφορά τα λύματα κατεργασίας και ακάθαρτων υδάτων, συλλέγουμε δείγματα από το σημείο εκροής των λυμάτων.
For processing and sewage effluents, collect samples from the point of effluent discharge.
Συνιστώνται μεγέθη δειγμάτων έως 500 ml ανά σημείο δειγματοληψίας.
Sample sizes up to 500 ml per sampling point are recommended.
Εάν προτιμώνται μικρότερα δείγματα, συνιστάται η λήψη δειγμάτων σε τουλάχιστον 3 περιπτώσεις ανά σημείο δειγματοληψίας, και κάθε δείγμα να αποτελείται από 2 επαναληπτικά υπο-δείγματα τουλάχιστον των 30 ml.
If smaller samples are preferred, it is advisable to take samples on at least three occasions per sampling point, each sample consisting of two replicated sub-samples of at least 30 ml.
Για εντατική εργασία επισκόπισης, επιλέγουμε τουλάχιστον 3 σημεία δειγματοληψίας ανά 3 χλμ υδάτινου ρεύματος και εξασφαλίζουμε ότι διενεργείται δειγματοληψία και στους παραπόταμους που εισέρχονται στο υδάτινο ρεύμα.
For intensive survey work, select at least three sampling points per 3 km of watercourse and ensure that tributaries entering the watercourse are also sampled.
Τα δείγματα μεταφέρονται σε συνθήκες ψύχους και σκότους (4-10 °C) και εξετάζονται εντός 24 ωρών.
Transport samples in cool dark conditions (4 to 10 °C) and test within 24 hours.
Εάν είναι απαραίτητο, το βακτηριακό κλάσμα μπορεί να συγκεντρωθεί χρησιμοποιώντας μία από τις ακόλουθες μεθόδους:
If required, the bacterial fraction may be concentrated using one of the following methods:
Τα υπο-δείγματα των 30-50 ml φυγοκεντρούνται σε 10000 g για 10 λεπτά (ή 7000 g για 15 λεπτά) κατά προτίμηση στους 4-10 °C, απορρίπτεται το υπερκείμενο υγρό και το ίζημα αναδιαλύεται σε 1 ml ρυθμιστικού διαλύματος ιζήματος (προσάρτημα 4).
Centrifuge 30 to 50 ml sub-samples at 10000 g for 10 minutes (or 7000 g for 15 minutes) preferably at 4 to 10 °C, discard the supernatant and resuspend the pellet in 1 ml pellet buffer (Appendix 4).
Διήθηση από μεμβράνη (ελάχιστο μέγεθος πόρων 0,45 µm) ακολουθούμενη από πλύση του φίλτρου σε 5-10 ml ρυθμιστικού διαλύματος ιζήματος και παρακράτηση των εκπλυμάτων.
Membrane filtration (minimum pore size 0,45 µm) followed by washing the filter in 5 to 10 ml pellet buffer and retention of the washings.
Η μέθοδος αυτή ενδείκνυται για μεγαλύτερους όγκους νερού που περιέχουν μικρότερους αριθμούς σαπροφύτων.
This method is suitable for larger volumes of water containing low numbers of saprophytes.
Η συγκέντρωση δεν συνιστάται συνήθως για δείγματα λυμάτων κατεργασίας πατάτας ή ακάθαρτων υδάτων καθώς αυξημένοι πληθυσμοί ανταγωνιστικών σαπροφυτικών βακτηρίων θα παρεμποδίζουν την ανίχνευση του Ralstonia solanacearum.
Concentration is usually not advisable for samples of potato processing or sewage effluent since increased populations of competing saprophytic bacteria will inhibit detection of Ralstonia solanacearum.
Βλ. το διάγραμμα ροής και την περιγραφή των δοκιμών στα σχετικά προσαρτήματα.
See flow chart and description of the tests in the relevant appendices.
ΕΝΟΤΗΤΑ V
SECTION V
Σχήμα για την ανίχνευση και ταυτοποίηση του R. solanacearum στο έδαφος
Scheme for detection and identification of R. solanacearum in soil
Δείγμα εδάφους (1)
Soil sample (1)
Εξαγωγή του παθογόνου
Extraction of the pathogen
Εκλεκτική απομόνωση (2)
selective isolation (2)
Προαιρετική συμπληρωματική δοκιμή: PCR (3) εμπλουτισμού / βιοδοκιμή (4)
optional auxiliary test: enrichment PCR (3) / bioassay (4)
Αποικίες με τυπική μορφολογία (5) μετά την απομόνωση
Colonies with typical morphology (5) after isolation
ΔΟΚΙΜΕΣ ΤΑΥΤΟΠΟΙΗΣΗΣ (7)
IDENTIFICATION TESTS (7)
ΔΟΚΙΜΗ ΠΑΘΟΓΕΝΕΙΑΣ (8)
PATHOGENICITY TEST (8)
Δείγμα μη προσβεβλημένο από το
Sample not contaminted by
Βλ. ενότητα V.2.1. για τις συνιστώμενες διαδικασίες δειγματοληψίας.
See Section V.2.1. for recommended sampling procedures.
Εάν υπάρχουν υπόνοιες ότι μεγάλοι πληθυσμοί σαπροφύτων επηρεάζουν την αξιοπιστία της απομόνωσης, επαναλαμβάνονται οι δοκιμές απομόνωσης μετά την περαιτέρω αραίωση του δείγματος.
If high saprophyte populations are suspected to affect the reliability of the isolation, then repeat the isolation tests after further dilution of the sample.
Το επικυρωμένο σχήμα ανίχνευσης που περιγράφεται στην ενότητα αυτή ισχύει για την ανίχνευση του παθογόνου σε δείγματα εδάφους αλλά μπορεί να χρησιμοποιηθεί επίσης για τη δοκιμή δειγμάτων στερεών αποβλήτων κατεργασίας πατάτας ή ιλύος επεξεργασίας λυμάτων.
The validated detection scheme, described in this section, is applicable for pathogen detection in soil samples but can also be used to test samples of solid potato processing waste or sewage sludge.
Θα πρέπει, ωστόσο, να σημειωθεί ότι οι εν λόγω μέθοδοι δεν διαθέτουν επαρκή ευαισθησία έτσι ώστε να εγγυηθούν την ανίχνευση χαμηλώνή/και ακανόνιστα διασκορπισμένων πληθυσμών του Ralstonia solanacearum που είναι δυνατόν να υπάρχουν σε φυσικώς μολυσμένα δείγματα των εν λόγω υποστρωμάτων.
However, it should be noted that these methods are insufficiently sensitive to guarantee detection of low and/or irregularly dispersed populations of Ralstonia solanacearum that may occur in naturally infested samples of these substrates.
Οι περιορισμοί του εν λόγω σχήματος δοκιμής όσον αφορά την ευαισθησία πρέπει να λαμβάνονται υπόψη κατά την αξιολόγηση της αξιοπιστίας τυχόν αρνητικών αποτελεσμάτων καθώς επίσης και όταν χρησιμοποιούνται σε επισκοπήσεις για τον προσδιορισμό της παρουσίας ή απουσίας του παθογόνου στο έδαφος ή την ιλύ.
The limitations in sensitivity of this test scheme should be considered when assessing the reliability of any negative results obtained and also when used in surveys to determine presence or absence of the pathogen in soils or sludges.
Η πιο αξιόπιστη δοκιμή για την ανίχνευση της παρουσίας του παθογόνου στο έδαφος ενός αγρού είναι η φύτευση ευπαθούς ξενιστή και η παρακολούθησή του όσον αφορά το ενδεχόμενο μόλυνσης, αλλά ακόμη και με τη μέθοδο αυτή τα χαμηλά επίπεδα μόλυνσης θα διαφύγουν την ανίχνευση.
The most reliable test for presence of the pathogen in a field soil is to plant a susceptible host and monitor it for infection, but even with this method low levels of contamination will escape detection.
Η διενέργεια δειγματοληψίας σε έδαφος αγρού πρέπει να τηρεί τις τυποποιημένες αρχές της δειγματοληψίας για ανίχνευση νηματωδών.
Sampling of field soil should follow standard principals used for nematode sampling.
Συλλέγουμε 0,5-1 kg εδάφους ανά δείγμα από 60 τοποθεσίες ανά 0,3 ha από βάθος 10-20 cm (ή σε επιφάνεια 7x7 μέτρων). Εάν υπάρχουν υπόνοιες για την παρουσία του παθογόνου, αυξάνουμε τον αριθμό σημείων συλλογής σε 120 ανά 0,3 ha.
Collect 0,5 to 1 kg of soil per sample from 60 sites per 0,3 ha from a depth of 10 to 20 cm (or in a grid of 7 x 7 metres) If the pathogen is suspected to be present, increase the number of collection points to 120 per 0,3 ha.
Φυλάσσουμε τα δείγματα στους 12-15 °C πριν από τη διενέργεια των δοκιμών.
Maintain samples at 12 to 15 °C prior to testing.
Η δειγματοληψία ιλύος κατεργασίας πατάτας ή λυμάτων πραγματοποιείται με τη συλλογή συνολικά 1 kg από τοποθεσίες που αντιστοιχούν στο συνολικό όγκο της ιλύος προς εξέταση.
Sample potato processing and sewage sludges by collecting a total of 1 kg from sites representing the total volume of sludge to be tested.
Αναμειγνύουμε καλά κάθε δείγμα πριν από τη διενέργεια δοκιμής.
Mix each sample well before testing.
Διασκορπίζουμε υπο-δείγματα των 10-25 g εδάφους ή ιλύος με περιστροφική ανάδευση (250 rpm) σε 60-150 ml ρυθμιστικού διαλύματος εξαγωγής (προσάρτημα 4) για μέγιστο χρονικό διάστημα 2 ωρών.
Disperse sub-samples of 10 to 25 g of soil or sludge by rotary shaking (250 rpm) in 60 to 150 ml extraction buffer (Appendix 4) for up to two hours.
Εάν είναι απαραίτητο, η προσθήκη 0,02 % αποστειρωμένου Tween-20 και 10-20 g αποστειρωμένου σκύρου μπορεί να ενισχύσει το διασκορπισμό.
If required, addition of 0,02 % sterile Tween-20 and 10 to 20 g sterile gravel may assist dispersion.
Το αιώρημα διατηρείται στους 4 °C κατά τη διάρκεια της διεξαγωγής της δοκιμής.
Maintain the suspension at 4 °C during testing.
ΕΝΟΤΗΤΑ VI
SECTION VI
ΒΕΛΤΙΣΤΟΠΟΙΗΜΕΝΑ ΠΡΩΤΟΚΟΛΛΑ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΝΙΧΝΕΥΣΗ ΚΑΙ ΤΑΥΤΟΠΟΙΗΣΗ ΤΟΥ R. SOLANACEARUM
OPTIMISED PROTOCOLS FOR DETECTION AND IDENTIFICATION OF R. SOLANACEARUM
ΔΟΚΙΜΕΣ ΔΙΑΓΝΩΣΗΣ ΚΑΙ ΑΝΙΧΝΕΥΣΗΣ
DIAGNOSTIC AND DETECTION TESTS