Meget almindelige bivirkninger (kan forekomme hos mere end 1 ud af 10 personer) - øget modtagelighed for infektioner - betændelsestilstand i hele kroppen (sepsis) - nedsat antal hvide blodlegemer, blodplader og røde blodlegemer (anæmi) - de transplanterede celler angriber din krop (graft versus host-sygdom) - svimmelhed, hovedpine, sløret syn - ukontrolleret rysten (krampe) - snurren, prikken eller følelsesløshed i huden (paræstesi) - delvist tab af bevægelsesevne - hjertestop - kvalme, opkastning, diarré - betændelse i slimhinderne i munden (mucositis) - irriteret mave, spiserør og mave-tarm-kanal - tyktarmsbetændelse - anoreksi, nedsat appetit - højt blodsukkerniveau - hududslæt, -kløe og -afskalning - ændret hudfarve (må ikke forveksles med gulsot - se nedenfor) - rødme i huden (erytem) - hårtab - ryg- og mavesmerter, smerter - muskel- og ledsmerter - abnorme elektriske impulser i hjertet (arytmi) - betændelse i lungevæv - forstørret lever - ændret organfunktion - blokering af levervene (veno-occlusiv sygdom, VOD) - gulnen af hud og øjne (gulsot) - høreskade - lymfeobstruktion - højt blodtryk - øgede niveauer af lever-, nyre- og fordøjelsesenzymer - abnorme blodelektrolytter - øget vægt - feber, generel svækkelse, kuldegysninger - blødninger - næseblod - generelle hævelser på grund af væskeophobning (ødemer) - smerter eller betændelse ved injektionsstedet - øjenbetændelse (konjunktivitis) - nedsat sædcelletal - vaginal blødning - udeblivende menstruation (amenoré) - hukommelsestab - forsinket vægt- og højdeøgning - blæresvigt - underproduktion af testosteron - utilstrækkelig produktion af tyreoideahormon - utilstrækkelig aktivitet i hypofyse - konfusionstilstand 
- increased susceptibility to infection - whole-body inflammatory state (sepsis) - decreased counts of white blood cells, platelets and red blood cells (anaemia) - the transplanted cells attack your body (graft versus host disease) - dizziness, headache, blurred vision - uncontrolled shaking of the body (convulsion) - sensation of tingling, pricking or numbness (paraesthesia) - partial loss of movement - cardiac arrest - nausea, vomiting, diarrhoea - inflammation of the mucosa of the mouth (mucositis) - irritated stomach, gullet, intestine - inflammation of the colon - anorexia, decreased appetite - high glucose in the blood - skin rash, itching, shedding - skin colour disorder (do not confuse with jaundice - see below) - redness of the skin (erythema) - hair loss - back and abdominal pain, pain - muscle and joint pain - abnormal electrical activity in the heart (arrhythmia) - inflammation of lung tissue - enlarged liver - altered organ function - blocking of a liver vein (Veno-Occlusive Disease, VOD) - yellowing of the skin and eyes (jaundice) - hearing impaired - lymphatic obstruction - high blood pressure - increased liver, renal and digestive enzymes - abnormal blood electrolytes - weight gain - fever, general weakness, chills - bleeding (haemorrhage) - nasal bleeding - general swelling due to fluid retention (oedema) - pain or inflammation at the injection site - eye infection (conjunctivitis) - decreased sperm cell count - vaginal bleeding - absence of menstrual periods (amenorrhea) - memory loss - delaying in weight and height increase - bladder disfunction - underproduction of testosterone - insufficient production of thyroid hormone - deficient activity of the pituitary gland - confusional state