natgillin/translations-raw huggingface dataset:
Testproceduren er beregnet til kartoffelknolde og -planter med symptomer, der er typiske for ringbakteriose eller giver mistanke om ringbakteriose.
The testing procedure is intended for potato tubers and plants with symptoms typical or suspect of ring rot.
der giver mistanke om ringbakteriose (1)
suspect of ring rot (1)
HURTIG DIAGNOSETEST (2)
RAPID DIAGNOSTIC TESTS (2)
PRINCIPIEL ISOLATIONSTEST (3)
CORE ISOLATION TEST (3)
Kolonier med typisk morfologi (4)
colonies with typical morphology (4)
Rendyrkning
purify by subculturing
IDENTIFIKATIONSTEST (6)
IDENTIFICATION TESTS (6)
PATOGENITETSTEST (7)
PATHOGENICITY TEST (7)
Begge test bekræfter renkulturen som C.m. subsp. sepedonicus
both tests confirm pure culture as C.m. subsp. sepedonicus
Prøven er ikke inficeret med
sample not infected by
Prøven er inficeret med
sample infected by
Symptomerne er beskrevet i afsnit 2.
Description of symptoms is provided in section 2.
Egnede test er:
Appropriate tests are:
IF-test (afsnit 4),
IF-test (section 4),
PCR-test (afsnit 6),
PCR test (section 6),
FISH-test (afsnit 5).
FISH test (section 5).
Skønt isolering af patogenet fra plantemateriale med typiske symptomer ved pladespredning af forskellige fortyndinger er ligetil, kan dyrkningen dog slå fejl på fremskredne infektionsstadier.
Although isolation of the pathogen from plant material with typical symptoms by dilution plating is straightforward, culturing may fail from advanced stages of infection.
Blødrådsbakterier, der vokser på sygt væv, kan vokse stærkere end eller hæmme patogenet på dyrkningsmediet.
Saprophytic bacteria which grow on diseased tissue may outgrow or inhibit the pathogen on the isolation medium.
Det anbefales derfor at anvende såvel non-selektive som selektive medier, helst MTNA (afsnit 8) eller biotest (afsnit 7).
Therefore it is recommended to use both non selective and selective media, preferably MTNA (section 8) or Bioassay test (section 7).
Den typiske kolonimorfologi er beskrevet i afsnit 8.
Description of typical colony morphology is provided in section 8.
Hvis isoleringstesten er negativ, men sygdomssymptomerne typiske, skal isoleringen gentages.
If the isolation test is negative, but disease symptoms are typical, then isolation must be repeated.
Pålidelig identifikation af en renkultur af C. m. subsp. sepedonicus opnås ved anvendelse af de test, der er angivet i afsnit 9.
Reliable identification of a pure culture of C. m. subsp. sepedonicus is achieved by using the tests listed in section 9.
Patogenitetstesten er beskrevet i afsnit 10.
The pathogenicity test is described in section 10.
Protokol til påvisning og identifikation af Clavibacter michiganensis ssp. sepedonicus i prøver af symptomfrie kartoffelknolde
Scheme for detection and identification of Clavibacter michiganensis ssp. sepedonicus in samples of asymptomatic potato tubers
Testproceduren er beregnet til påvisning af latente infektioner i kartoffelknolde.
The testing procedure is intended for detection of latent infections in potato tubers.
Et positivt resultat fra mindst to screeningtest baseret på forskellige biologiske principper skal suppleres med isolering af patogenet med efterfølgende bekræftelse af en renkultur som C. m. subsp. sepedonicus, hvis der er tale om isolering af typiske kolonier.
A positive result from at least two screening tests, based on different biological principles, must be complemented by the isolation of the pathogen; followed by, in case of isolation of typical colonies, confirmation of a pure culture as C. m. subsp. sepedonicus.
Et positivt resultat fra kun én af screeningtestene er ikke tilstrækkeligt til, at prøven kan anses for at være under mistanke.
A positive result from only one of the screening tests is not sufficient to consider the sample suspect.
Screeningtest og isolationstest skal muliggøre påvisning af 103 til 104 celler/ml resuspenderet pellet, der er medtaget som positive kontroller i hver testserie.
Screening tests and isolation tests must permit a detection threshold of 103 to 104 cells/ml resuspended pellet, included as positive controls in each series of tests.
Prøve af kartoffelknolde (1)
sample of potato tubers (1)
Ekstraktion og opkoncentrering af patogenet (2)
extraction and concentration of the pathogen (2)
PRINCIPIEL SCREENINGTEST (3)
CORE SCREENING TESTS (3)
Første screeningtest (3)
first screening test (3)
subsp. sepedonicus ikke påvist
subsp. sepedonicus not detected
negativ
negative
positiv
positive
Anden screeningtest (3)
second screening test (3)
Selektiv isolering (7) og biotest (8)
selective isolation (7) and bioassay (8)
Kolonier med typisk morfologi (9)
colonies with typical morphology (9)
Rendyrkning med subkultur
purify by subculture
IDENTIFIKATIONSTEST (11)
IDENTIFICATION TESTS (11)
PATOGENITETSTEST (12)
PATHOGENICITY TEST (12)
Begge test bekræfter renkulturen som
both tests confirm pure culture as
Standardprøvestørrelse er 200 knolde, dog kan proceduren tillige anvendes med mindre prøver, hvis der ikke er 200 knolde til rådighed.
The standard sample size is 200 tubers although the procedure can be used with smaller samples if 200 tubers are not available.
Metoder til patogenekstraktion og -opkoncentrering er beskrevet i afsnit 3.1.
Pathogen extraction and concentration methods are described in section 3.1.
Hvis mindst to test baseret på forskellige biologiske principper er positive, skal der foretages isolering og bekræftelse.
If at least two tests based on different biological principles are positive, isolation and confirmation have to be done.
Der udføres mindst én screeningtest.
Perform at least one screening test.
Hvis denne test er negativ, anses prøven for at være negativ. Hvis testen er positiv, gennemføres der endnu en screeningtest, eller flere, baseret på forskellige biologiske principper for at verificere det første positive resultat.
When this test is negative the sample is considered to be negative In case this test is positive a second or more screening tests based on different biological principles are required to verify the first positive result.
Hvis den anden eller de øvrige test er negative, anses prøven for negativ.
If the second or other tests are negative the sample is considered negative.
Det er ikke nødvendigt med yderligere test.
Further tests are not necessary.
Immunofluorescenstest (IF-test).
Immunofluorescence (IF) test.
Der skal altid anvendes et polyklonalt antistof til IF-screening; supplerende monoklonale antistoffer kan øge specificiteten (jf. afsnit 4).
Always use a polyclonal antibody for IF screening, additional monoclonal antibodies may provide more specifity (see section 4).
Der skal anvendes korrekt validerede PCR-reagenser og protokoller (jf. afsnit 6).
Use appropriately validated PCR reagents and protocols (see section 6).
Der skal anvendes validerede reagenser og protokoller (jf. afsnit 5).
Use validated reagents and protocols (see section 5).
Selektiv isolering.
Selective isolation.
MTNA-mediet eller NCP-88-mediet og en 1/100 opløsning af den resuspenderede pellet er i mange tilfælde en egnet metode til direkte isolering af C. m. subsp. sepedonicus.
With the MTNA medium or NCP-88 medium and a 1/100 dilution of the resuspended pellet, this is in many cases a suitable method for direct isolation of C. m. subsp. sepedonicus.
Der kan opnås typiske kolonier 3-10 dage efter udsæd.
Typical colonies can be obtained 3 to10 days after planting.
Derefter kan patogenet rendyrkes og identificeres.
The pathogen then can be purified and identified.
For at testens potentiale kan udnyttes fuldt ud, kræves omhyggelig forberedelse af kerner fra navleender for at eliminere sekundære bakterier forbundet med kartoffelknolde, som er konkurrenter til C. m. subsp. sepedonicus på mediet og kan overvokse patogenet.
For full exploitation of its potential, the test requires careful preparation of heel end cores to avoid secondary bacteria associated with the potato tuber which are competitors with C. m. subsp. sepedonicus on the medium and may overgrow the pathogen.
Hvis pladetesten ikke lykkes, skal der foretages isolering fra planter, der anvendes til biotesten (jf. afsnit 8).
If the plate test fails isolation must be done from plants used for the bio assay (see section 8).
Biotesten bruges til isolering af C. m. subsp. sepedonicus fra kartoffelekstraktpellet ved selektiv berigelse i ægplanter (aubergine) (Solanum melongena).
The bioassay test is used for isolation of C. m. subsp. sepedonicus from potato extract pellets by selective enrichment in eggplants (Solanum melongena).
Testen kræver optimale inkuberingsbetingelser som beskrevet i denne metode.
The test requires optimal incubation conditions as specified in this method.
Bakterier, der er inhibitorer af C. m. subsp. sepedonicus på MTNA- eller NCP-88-mediet, vil sandsynligvis ikke virke forstyrrende i denne test (jf. afsnit 7).
Bacteria inhibitory to C. m. subsp. sepedonicus on the MTNA or NCP-88 medium will most likely not interfere in this test (see section 7).
Den typiske kolonimorfologi er beskrevet i afsnit 8.
Typical colony morphology is described in section 8.
Dyrkning eller biotest kan mislykkes som følge af konkurrence eller hæmning forårsaget af blødrådsbakterier.
Culturing or bioassays can fail due to competition or inhibition by saprophytic bacteria.
Hvis screeningtest giver positive resultater, men isolationstestene er negative, gentages isolationstestene fra samme pellet eller ved at tage ekstra karvæv nær navleenden fra overskårne knolde fra samme prøve, og om nødvendigt testes supplerende prøver.
If positive results are obtained in screening tests, but the isolation tests are negative, then repeat the isolation tests from the same pellet or by taking additional vascular tissue near the heel end from cut tubers of the same sample and, if necessary, test additional samples.
i afsnit 9.
Reliable identification of pure presumptive C. m. subsp. sepedonicus cultures is achieved using the tests described in section 9.
Protokol til påvisning og identifikation af Clavibacter michiganensis ssp. sepedonicus i prøver af symptomfrie kartoffelplanter
Scheme for detection and identification of Clavibacter michiganensis ssp. sepedonicus in samples of asymptomatic potato plants
Prøve af stængelstykker (1)
sample of stem segments (1)
selektiv isolering (4)/IF-test (5)/PCR-test (6)/FISH-test (7)
selective isolation (4)/IF test (5)/PCR test (6)/FISH test (7)
valgfri hjælpetest: biotest (8)
optional auxiliary test: bioassay (8)
Kolonier med typisk morfologi (4) efter isolering
colonies with typical morphology (4) after isolation
Alle test er negative
all tests done negative
IDENTIFIKATIONSTEST (10)
IDENTIFICATION TESTS (10)
PATOGENITETSTEST (11)
PATHOGENICITY TEST (11)
Anbefalede prøvestørrelser er angivet i afsnit 3.2.
See section 3.2 for recommended sample sizes.
Metoder til patogenekstraktion og -opkoncentrering er beskrevet i afsnit 3.2.
Pathogen extraction and concentration methods are described in section 3.2.
Hvis denne test er negativ, anses prøven for at være negativ.
When this test is negative the sample is considered to be negative.
Hvis testen er positiv, gennemføres der endnu en screeningtest, eller flere, baseret på forskellige biologiske principper for at verificere det første positive resultat.
In case this test is positive a second or more screening tests based on different biological principles are required to verify the first positive result.
Den selektive isolationstest og den typiske kolonimorfologi er beskrevet i afsnit 8.
The selective isolation test and typical colony morphology are described in section 8.
IF-testen er beskrevet i afsnit 4.
The IF test is described in section 4.
PCR-testen er beskrevet i afsnit 6.
PCR tests are described in section 6.
FISH-testen er beskrevet i afsnit 5.
The FISH test is described in section 5.
Biotesten er beskrevet i afsnit 7.
The bioassay is described in section 7.
Hvis screeningtest giver positive resultater, men isolationstestene er negative, gentages isolationstestene, og om nødvendigt testes supplerende prøver.
If positive results are obtained in screening tests, but the isolation tests are negative, then repeat the isolation tests and, if necessary, test additional samples.
VISUEL UNDERSØGELSE FOR SYMPTOMER PÅ RINGBAKTERIOSE
VISUAL EXAMINATION FOR RING ROT SYMPTOMS
Kartoffelplanter
Potato plants
Under europæiske klimaforhold findes der sjældent symptomer i marken og ofte kun mod sæsonens slutning.
Under European climatic conditions symptoms are rarely found in the field and often only at the end of the season.
Endvidere sløres eller forveksles symptomerne ofte af eller med andre sygdomme, ældning eller mekaniske skader.
Moreover the symptoms are frequently masked or confused by/with other diseases, senescence or mechanical damages.
Symptomer kan derfor let overses ved markinspektioner.
Therefore it may be easy to miss symptoms in field inspections.
Visnesymptomerne er meget forskellige fra symptomer på brunbakteriose. Nedvisning foregår normalt langsomt og er i begyndelsen begrænset til bladrandene.
Wilting symptoms are very different from those of brown rot; wilting is usually slow and initially limited to the leaf margins.
Unge inficerede blade fortsætter ofte væksten, om end i mindre omfang i de inficerede områder.
Young infected leaves often continue to expand although, less so in the infected zones.
Dermed får bladene en mærkelig form.
This creates odd shaped leaves.
Blade, der er påvirket af blokering af karvæv længere nede i stænglen, udvikler ofte klorotiske, gule til orange områder mellem ribberne.
Leaves affected by blocking of the vascular tissues further down the stem often develop chlorotic, yellow to orange, intercostal areas.
Inficerede småblade, blade og endda stængler kan til sidst dø.
Infected leaflets, leaves and even stems may eventually die.
Blade og knolde er ofte blot mindre.
Often leaves and tubers are simply reduced in size.
Det forekommer, at planter viser væksthæmning.
Occasionally plants are stunted.
Der findes farvebilleder af en række symptomer på Kommissionens websted: (http://forum.europa.eu.int/Public/irc/sanco/Home/main).
Coloured pictures of a range of symptoms can be found on the web site http://forum.europa.eu.int/Public/irc/sanco/Home/main
Kartoffelknolde
Potato tubers
De tidligste symptomer er en svag glasagtighed eller gennemsigtighed i plantevævet rundt om ledningsvævet, der ikke må vise tegn på råd, især tæt ved navleenden.
The earliest symptoms are a slight glassiness or translucence of the tissue without softening around the vascular system, particularly near the heel end.
Ledningsvævet ved navleenden kan være lidt mørkere i farven end normalt.
The vascular ring at the heel end may be slightly darker in colour than normal.
Det første letgenkendelige symptom viser sig ved, at karvævsringen har en gullig farve, og at der, når knolden presses svagt, kommer strenge af ostelignende materiale ud fra ledningsvævet.
The first readily identifiable symptom is one whereby the vascular ring has a yellowish coloration and when the tuber is gently squeezed, pillars of cheese-like material emerge from the vessels.
Denne udsondring indeholder millioner af bakterier.
This exudation contains millions of bacteria.
Der kan i dette stadium udvikle sig brunfarvning af ledningsvævet, og knoldsymptomerne i denne fase ligner symptomerne på brunbakteriose forårsaget af Ralstonia solanacearum.
Browning of the vascular tissue may develop and tuber symptoms at this stage are similar to those of brown rot caused by Ralstonia solanacearum.
I begyndelsen kan disse symptomer være begrænset til en del af ledningsvævet, der ikke nødvendigvis er tæt ved navleenden, og de kan gradvis brede sig til hele ringen.
At first, these symptoms may be restricted to one part of the ring, not necessarily close to the heel end and may gradually extend to the whole ring.
Efterhånden som infektionen skrider frem, ødelægges karvævet; den ydre cortex kan blive adskilt fra den indre cortex.
As the infection progresses, destruction of the vascular tissue occurs; the outer cortex may become separated from the inner cortex.
På fremskredne stadier af infektionen opstår revner på knoldens overflade, som ofte er rødligt-brune ved randene.
In advanced stages of infection, cracks appear on the surface of the tuber, which are often reddish-brown at their margins.
Der har i den seneste tid været adskillige tilfælde i Europa, hvor den indre cortex rådner samtidig med ledningsvævet med resulterende sekundært angreb, der forårsager indre hulhed og nekrose.
Recently in Europe several cases have occurred where the central cortex rots at the same time as the vascular ring resulting in secondary invasion with internal hollowing and necrosis.
Sekundære svampe- eller bakterieangreb kan sløre symptomerne, og det kan være vanskeligt, ja umuligt, at skelne fremskredne ringbakteriosesymptomer fra andre bakterioser i knoldene.
Secondary fungal or bacterial invasion may mask the symptoms and it may be difficult, if not impossible, to distinguish advanced ring rot symptoms from other tuber rots.
Der kan forekomme atypiske symptomer.
Atypical symptoms may be possible.
FORBEREDEDELSE AF PRØVERNE
SAMPLE PREPARATION
Standardprøvestørrelsen er 200 knolde pr. test.
The standard sample size is 200 tubers per test.
Mere intensiv prøveudtagning kræver flere test af prøver på denne størrelse.
More intensive sampling requires more tests on samples of this size.
Et større antal knolde i prøven vil medføre, at resultater ikke eller kun vanskeligt kan fortolkes.
Larger numbers of tubers in the sample will lead to inhibition or difficult interpretation of the results.
Proceduren kan dog tillige anvendes med prøver på under 200 knolde, hvis der kun er færre knolde til rådighed.
However, the procedure can be conveniently applied for samples with less than 200 tubers where fewer tubers are available.
Validering af alle nedenfor beskrevne metoder er baseret på test af prøver bestående af 200 knolde.
Validation of all detection methods described below is based on testing of samples of 200 tubers.
Det nedenfor beskrevne kartoffelekstrakt kan desuden anvendes til påvisning af Ralstonia solanacearum, der forårsager kartoflens brunbakteriose.
The potato extract described below can also be used for detection of the potato brown rot bacterium, Ralstonia solanacearum.
Valgfri forbehandling forud for prøveforberededelse.
Optional pre-treatment in advance to sample preparation:
Knoldene vaskes.
Wash the tubers.
Der anvendes passende desinfektionsmidler (chlorforbindelser, når der skal anvendes PCR-test, for at fjerne eventuelt dna fra patogenet) og rengøringsmidler mellem hver prøve.
Use appropriate disinfectants (chlorine compounds when PCR-test is to be used in order to remove eventual pathogen DNA) and detergents between each sample.
Knoldene lufttørres.
Air dry the tubers.
Denne vaskning er især nyttig, men ikke obligatorisk, for prøver med for meget jord, og hvis der skal gennemføres en PCR-test eller direkte isolering.
This washing procedure is particularly useful (but not required) for samples with excess soil and if a PCR-test or direct isolation procedure is to be performed.
Med en ren, desinficeret skalpel eller grøntsagskniv fjernes huden fra de enkelte knoldes navleende, således at ledningsvævet bliver synligt.
Remove with a clean and disinfected scalpel or vegetable knife the skin at the heel end of each tuber so that the vascular tissue becomes visible.
Et lille stykke ledningsvæv (kartoffelprop) fra navleenden udskæres omhyggeligt, idet mængden af andet plantevæv begrænses til et minimum (jf. webstedet http://forum.europa.eu.int/Public/irc/sanco/Home/main).
Carefully cut out a small core of vascular tissue at the heel end and keep the amount of non-vascular tissue to a minimum (see web site: http://forum.europa.eu.int/Public/irc/sanco/Home/main)
Eventuelle knolde med symptomer på ringbakteriose anbringes og undersøges for sig.
Set aside any tubers with suspected ring rot symptoms and test separately.
Hvis der under fjernelsen af kartoffelproppen fra navleenden observeres mistænkelige symptomer på ringbakteriose, undersøges knolden visuelt, efter at den er overskåret tæt ved navleenden.
If during removal of the heel end core suspect symptoms of ring rot are observed, the tuber should be visually inspected after cutting near the heel end.
Overskårne knolde med mistænkelige symptomer bør forkorkes ved stuetemperatur i 2 dage og derefter opbevares de ved 4-10 °C under karantænebetingelser, indtil samtlige test er gennemført.
Any cut tuber with suspected symptoms should be suberised at room temperature for two days and stored under quarantine (at 4 to 10 °C) until all tests have been completed.
Alle prøver af knolde, herunder prøver med mistænkelige symptomer, bør opbevares i overensstemmelse med bilag II.
All tubers in the sample (including those with suspicious symptoms) should be kept according to Annex II.
Hvis dette ikke er muligt, opbevares de i beholderen uden tilsætning af buffer i højst 72 timer på køl eller højst 24 timer ved stuetemperatur.
If this is not possible, store them in the container, without addition of buffer, refrigerated for not longer than 72 hours or for not longer than 24 hours at room temperature.
Tørring og forkorkning af kartoffelpropper og saprofytvækst under opbevaringen kan hindre påvisning af den bakterie, der forårsager ringbakteriose.
Drying and suberisation of cores, and growth of saprophytes during storage may hinder detection of the ring rot bacterium.
Navleenderne behandles på en af nedenstående måder:
Process the heel end cores by one of the following procedures: either,
Navleenderne homogeniseres med en tilstrækkelig mængde (ca. 40 ml) ekstraktionsbuffer (tillæg 3) enten i en blender (f.eks. Waring eller Ultra Thurax) eller ved knusning i en forseglet engangspose til udblødning (f.eks. Stomacher- eller Bioreba-pose af polyethylen med stor trækstyrke, 150 mm × 250 mm; steriliseret ved bestråling) ved hjælp af en gummihammer eller egnet formalingsudstyr (f.eks. Homex).
homogenise the cores with sufficient volume (approximately 40 ml) of extraction buffer (Appendix 3), either in a blender (e.g. Waring or Ultra Thurax) or by crushing in a sealed disposable maceration bag (e.g. Stomacher or Bioreba strong guage polythene, 150 mm × 250 mm; radiation sterilised) using a rubber mallet or suitable grinding apparatus (e.g. Homex).
Der er stor risiko for krydskontaminering af prøver, når prøverne homogeniseres ved hjælp af en blender.
The risk of cross-contamination of samples is high when samples are homogenized using a blender.
Der skal tages forholdsregler for at undgå aerosoldannelse eller udflydning under ekstraktionsprocessen.
Take precautions to avoid aerosol generation or spillage during the extraction process.
Det skal sikres, at der for hver enkelt prøve anvendes nysteriliserede blenderknive og -glas.
Ensure that freshly sterilised blender blades and vessels are used for each sample.
Hvis PCR-testen skal anvendes, skal man undgå dna-rester på beholdere og formalingsudstyr.
If the PCR test is to be used, avoid carry-over of DNA on containers or grinding apparatus.
Når der anvendes PCR, anbefales det, at knusning foregår i engangsposer, og at der anvendes engangsrør.
Crushing in disposable bags and use of disposable tubes is recommended where PCR is to be used.
Supernatanten dekanteres fra.
Decant the supernatant.
Hvis den er for uklar, klares den enten ved langsom centrifugering (højst 180 g i 10 min. ved en temperatur på 4-10 °C) eller ved vakuumfiltrering (40-100 µm), idet filteret vaskes med ekstra (ca. 10 ml) ekstraktionsbuffer (tillæg 3).
If excessively cloudy, clarify either by slow speed centrifugation (at not more than 180 g for 10 minutes at a temperature between 4 to 10 °C) or by vacuum filtration (40 to 100 µm), washing the filter with additional (10 ml) extraction buffer (Appendix 3).
Bakteriefraktionen opkoncentreres ved centrifugering ved 7000 g i 15 min. (eller 10000 g i 10 min.) ved en temperatur på 4-10 °C og supernatanten kasseres, idet det undgås at forstyrre pelleten.
Concentrate the bacterial fraction by centrifugation at 7000 g for 15 minutes (or 10000 g for 10 minutes) at a temperature between 4 to 10 °C and discard the supernatant without disturbing the pellet.