natgillin/translations-raw huggingface dataset:
98,24 % < procentuální úbytek Cys ≤ 100 %
The percent peptide depletion is determined in each sample by measuring the peak area and dividing it by the mean peak area of the relevant reference controls C (see Appendix 3) according to the formula described below.
Mohly by se vyskytnout jiné případy, kdy se retenční čas zkoušené chemické látky a retenční čas některého z peptidů zcela nepřekrývá.
Percent peptide depletion
V takových případech lze hodnoty procentuálního úbytku peptidu odhadnout a použít je v predikčním modelu cystein 1:10 / lysin 1:50, avšak zařazení zkoušené chemické látky do třídy reaktivity nelze provést s přesností.
Peptide peak area in replicate injection
Jediná analýza HPLC pro hodnocení cysteinových i lysinových peptidů by měla být pro zkoušenou chemickou látku dostačující, pokud je výsledek jednoznačný.
ean peptide peak area in reference controls C
Avšak v případě výsledků přibližujících se prahové hodnotě použité pro rozlišení mezi pozitivními a negativními výsledky (tj. hraničních výsledků) může být nezbytné další zkoušení.
Acceptance criteria
V situacích, kdy se střední hodnota procentuálního úbytku nachází v rozmezí 3 % až 10 % v predikčním modelu cystein 1:10 / lysin 1:50 nebo kdy se procentuální úbytek cysteinu nachází v rozmezí 9 % až 17 % v predikčním modelu cystein 1:10, by mělo být zváženo druhé provedení a v případě nesouhlasných výsledků prvního a druhého provedení by mělo být zváženo třetí provedení.
The following criteria should be met for a run to be considered valid:
Závěrečná zpráva by měla obsahovat následující informace:
the standard calibration curve should have an r2 > 0,99,
Jednosložková látka
the mean percent peptide depletion value of the three replicates for the positive control cinnamic aldehyde should be between 60,8 % and 100 % for the cysteine peptide and between 40,2 % and 69,0 % for the lysine peptide and the maximum standard deviation (SD) for the positive control replicates should be < 14,9 % for the percent cysteine depletion and < 11,6 % for the percent lysine depletion, and
chemická identifikace, např. název (názvy) IUPAC nebo CAS, číslo (čísla) CAS, kód SMILES nebo InChI, strukturní vzorec a/nebo jiné identifikátory,
the mean peptide concentration of reference controls A should be 0,50 ± 0,05 mM and the coefficient of variation (CV) of peptide peak areas for the nine reference controls B and C in acetonitrile should be < 15,0 %.
fyzický vzhled, rozpustnost ve vodě, molekulová hmotnost a další důležité fyzikálně-chemické vlastnosti, v rozsahu, v jakém jsou tyto informace dostupné,
If one or more of these criteria is not met the run should be repeated.
čistota, případně chemická identita nečistot, je-li to prakticky proveditelné atd.,
The following criteria should be met for a test chemical's results to be considered valid:
případné ošetření před zkoušením (např. zahřívání, mletí),
the maximum standard deviation for the test chemical replicates should be < 14,9 % for the percent cysteine depletion and < 11,6 % for the percent lysine depletion,
zkušební koncentrace,
the mean peptide concentration of the three reference controls C in the appropriate solvent should be 0,50 ± 0,05 mM.
podmínky skladování a stabilita, v rozsahu, v jakém jsou tyto informace dostupné.
If these criteria are not met the data should be rejected and the run should be repeated for that specific test chemical.
Vícesložková látka, UVCB a směs:
Prediction model
charakterizovaná v co možná největší míře např. chemickou identitou (viz výše), čistotou, kvantitativním výskytem a důležitými fyzikálně-chemickými vlastnostmi (viz výše) složek, v rozsahu, v jakém jsou tyto informace dostupné,
The mean percent cysteine and percent lysine depletion value is calculated for each test chemical.
fyzický vzhled, rozpustnost ve vodě a další důležité fyzikálně-chemické vlastnosti, v rozsahu, v jakém jsou tyto informace dostupné,
Negative depletion is considered as “0” when calculating the mean.
molekulová hmotnost nebo zdánlivá molekulová hmotnost v případě směsí/polymerů se známým složením nebo jiné informace důležité pro provedení studie,
By using the cysteine 1:10/lysine 1:50 prediction model shown in Table 1, the threshold of 6,38 % average peptide depletion should be used to support the discrimination between skin sensitisers and non-sensitisers in the framework of an IATA.
podmínky skladování a stabilita, v rozsahu, v jakém jsou tyto informace dostupné,
Application of the prediction model for assigning a test chemical to a reactivity class (i.e. low, moderate and high reactivity) may perhaps prove useful to inform potency assessment within the framework of an IATA.
odkaz na případné dosavadní výsledky pozitivních kontrol prokazující vhodnost kritérií přijatelnosti provedení.
Cysteine 1:10/lysine 1:50 prediction model [14]
použité rozpouštědlo/vehikulum a případně poměr jeho složek,
Mean of cysteine and lysine % depletion
chemická identifikace, např. název (názvy) IUPAC nebo CAS, číslo (čísla) CAS a/nebo jiné identifikátory,
Reactivity Class
fyzický vzhled, molekulová hmotnost a další důležité fyzikálně-chemické vlastnosti v případě použití jiných rozpouštědel/vehikul než rozpouštědel/vehikul uvedených v této zkušební metodě, a to v rozsahu, v jakém jsou tyto informace dostupné,
DPRA Prediction [15]
zdůvodnění volby rozpouštědla pro každou zkoušenou chemickou látku,
0 % ≤ mean % depletion ≤ 6,38 %
u acetonitrilu výsledky zkoušky dopadu na stabilitu peptidů.
No or minimal reactivity
Příprava peptidů, pozitivní kontroly a zkoušené chemické látky
Negative
charakterizace roztoku peptidů (dodavatel, šarže, přesná hmotnost peptidu, objem přidaný do zásobního roztoku),
6,38 % < mean % depletion ≤ 22,62 %
charakterizace roztoku pozitivní kontroly (přesná hmotnost pozitivní kontrolní látky, objem přidaný do zkušebního roztoku),
Low reactivity
charakterizace roztoků zkoušené chemické látky (přesná hmotnost zkoušené chemické látky, objem přidaný do zkušebního roztoku).
Positive
HPLC – nastavení přístrojů a analýza
22,62 % < mean % depletion ≤ 42,47 %
druh analyzátoru HPLC, kolon HPLC a předkolon, detektoru, automatického dávkovače,
Moderate reactivity
důležité parametry pro analýzu HPLC, jako např. teplota v kolonách, objem nástřiku, průtok a gradient.
42,47 % < mean % depletion ≤ 100 %
Zkoušená chemická látka
High reactivity
plocha píku peptidů při 220 nm v každém standardu a v každé replice referenční kontroly A,
There might be cases where the test chemical (the substance or one or several of the components of a multi-constituent substance or a mixture) absorbs significantly at 220 nm and has the same retention time of the peptide (co-elution).
lineární kalibrační křivka v grafickém vyjádření a udaná hodnota r2,
Co-elution may be resolved by slightly adjusting the HPLC set-up in order to further separate the elution time of the test chemical and the peptide.
koncentrace peptidů v každé replice referenční kontroly A,
If an alternative HPLC set-up is used to try to resolve co-elution, its equivalence to the validated set-up should be demonstrated (e.g. by testing the proficiency substances in Appendix 2).
střední hodnota koncentrace peptidu (v mM) ve třech referenčních kontrolách A, směrodatná odchylka a variační koeficient,
When co-elution occurs the peak of the peptide cannot be integrated and the calculation of the percent peptide depletion is not possible.
koncentrace peptidu v referenčních kontrolách A a C.
If co-elution of such test chemicals occurs with both the cysteine and the lysine peptides then the analysis should be reported as “inconclusive”.
Série analýzy
In cases where co-elution occurs only with the lysine peptide, then the cysteine 1:10 prediction model reported in Table 2 can be used.
U referenčních kontrol:
Cysteine 1:10 prediction model [16]
plocha píku peptidů při 220 nm v každé replice B a C,
Cysteine (Cys) % depletion
střední hodnota plochy píku peptidů při 220 nm v devíti referenčních kontrolách B a C v acetonitrilu, směrodatná odchylka a variační koeficient (pro zajištění stability referenčních kontrol po celou dobu analýzy),
Reactivity class
pro každé použité rozpouštědlo střední hodnota plochy píku peptidů při 220 nm ve třech vhodných referenčních kontrolách C (pro výpočet procentuálního úbytku peptidů),
DPRA prediction [17]
u každého použitého rozpouštědla koncentrace peptidů (v mM) ve třech vhodných referenčních kontrolách C,
0 % ≤ Cys % depletion ≤ 13,89 %
u každého použitého rozpouštědla střední hodnota koncentrace peptidů (v mM) ve třech vhodných referenčních kontrolách C, směrodatná odchylka a variační koeficient.
13,89 % < Cys % depletion ≤ 23,09 %
Ohledně pozitivní kontroly:
23,09 % < Cys % depletion ≤ 98,24 %
plocha píku peptidů při 220 nm v každé replice,
98,24 % < Cys % depletion ≤ 100 %
procentuální úbytek peptidů v každé replice,
There might be other cases where the overlap in retention time between the test chemical and either of the peptides is incomplete.
střední hodnota procentuálního úbytku peptidů ve třech replikách, směrodatná odchylka a variační koeficient.
In such cases percent peptide depletion values can be estimated and used in the cysteine 1:10/lysine 1:50 prediction model, however assignment of the test chemical to a reactivity class cannot be made with accuracy.
U každé zkoušené chemické látky:
A single HPLC analysis for both the cysteine and the lysine peptide should be sufficient for a test chemical when the result is unequivocal.
přítomnost koeluce,
However, in cases of results close to the threshold used to discriminate between positive and negative results (i.e. borderline results), additional testing may be necessary.
případně popis jakýchkoli jiných důležitých zjištění z pozorování,
If situations where the mean percent depletion falls in the range of 3 % to 10 % for the cysteine 1:10/lysine 1:50 prediction model or the cysteine percent depletion falls in the range of 9 % to 17 % for the cysteine 1:10 prediction model, a second run should be considered, as well as a third one in case of discordant results between the first two runs.
střední hodnota procentuálního úbytku peptidů ve třech replikách, směrodatná odchylka a variační koeficient,
The test report should include the following information
střední hodnota procentuálního úbytku cysteinu a procentuálního úbytku lysinu,
Mono-constituent substance
použitý predikční model a předpověď DPRA.
Chemical identification, such as IUPAC or CAS name(s), CAS number(s), SMILES or InChI code, structural formula, and/or other identifiers;
Zkoušení způsobilosti
Physical appearance, water solubility, molecular weight, and additional relevant physicochemical properties, to the extent available;
Případný postup použitý k prokázání způsobilosti laboratoře k provádění této zkušební metody (např. zkoušením látek pro prokázání způsobilosti) nebo k prokázání reprodukovatelného provedení této zkušební metody v průběhu doby.
Purity, chemical identity of impurities as appropriate and practically feasible, etc;
diskuse o výsledcích zkušební metody v rámci IATA, jsou-li k dispozici jiné příslušné informace.
Storage conditions and stability to the extent available.
Dostupné na: http://www.unece.org/trans/danger/publi/ghs/ghs_rev05/05files_e.html
Multi-constituent substance, UVCB and mixture:
Part 1: Scientific Evidence.
Characterisation as far as possible by e.g. chemical identity (see above), purity, quantitative occurrence and relevant physicochemical properties (see above) of the constituents, to the extent available;
Series on Testing and Assessment No.
Physical appearance, water solubility and additional relevant physicochemical properties, to the extent available;
168, OECD, Paris.
Molecular weight or apparent molecular weight in case of mixtures/polymers of known compositions or other information relevant for the conduct of the study;
Kapitola B.6 této přílohy: Senzibilizace kůže.
Storage conditions and stability to the extent available;
Kapitola B.42 této přílohy: Zkouška s vyšetřením lokálních lymfatických uzlin.
Reference to historical positive control results demonstrating suitable run acceptance criteria, if applicable.
Kapitola B.50 této přílohy: Senzibilizace kůže: zkouška s vyšetřením lokálních lymfatických uzlin: DA.
Solvent/vehicle used and ratio of its constituents, if applicable;
Kapitola B.51 této přílohy: Senzibilizace kůže: zkouška s vyšetřením lokálních lymfatických uzlin: BrdU-ELISA.
Chemical identification(s), such as IUPAC or CAS name(s), CAS number(s), and/or other identifiers;
Dostupné na: https://eurl-ecvam.jrc.ec.europa.eu/eurl-ecvam-recommendations/eurl-ecvam-recommendation-on-the-direct-peptide-reactivity-assay-dpra
Physical appearance, molecular weight, and additional relevant physicochemical properties in the case other solvents / vehicles than those mentioned in the test method are used and to the extent available;
Dostupné na: http://ihcp.jrc.ec.europa.eu/our_labs/eurl-ecvam/eurl-ecvam-recommendations/eurl-ecvam-recommendation-on-the-direct-peptide-reactivity-assay-dpra
Justification for choice of solvent for each test chemical;
Dostupné na: http://ecvam-dbalm.jrc.ec.europa.eu/
For acetonitrile, results of test of impact on peptide stability.
OECD Series on Testing and Assessment, No.
Preparation of peptides, positive control and test chemical
Organisation for Economic Cooperation and Development, Paris, France.
Characterisation of peptide solutions (supplier, lot, exact weight of peptide, volume added for the stock solution);
Dostupné na: www.fda.gov/downloads/drugs/guidancecomplianceregulatoryinformation/guidance/ucm070107.pdf – 138
Characterisation of positive control solution (exact weight of positive control substance, volume added for the test solution);
Tento výraz se často používá namísto výrazu „soulad“ a rozumí se jím podíl správných výsledků zkušební metody (21).
Characterisation of test chemical solutions (exact weight of test chemical, volume added for the test solution).
AOP (mechanismy nežádoucích účinků)
HPLC instrument setting and analysis
Sled událostí od chemické struktury cílové chemické látky nebo skupiny podobných chemických látek přes molekulární iniciační událost po účinek in vivo, který je předmětem zájmu (2).
Type of HPLC instrument, HPLC and guard columns, detector, autosampler;
Kalibrační křivka
Parameters relevant for the HPLC analysis such as column temperature, injection volumes, flow rate and gradient.
Vztah mezi hodnotou experimentální odpovědi a analytickou koncentrací (rovněž nazývaná standardní křivka) známé látky.
System suitability
Variační koeficient
Peptide peak area at 220 nm of each standard and reference control A replicate;
Míra variability, která se vypočítává pro skupinu údajů z replik tak, že se směrodatná odchylka vydělí průměrem.
Linear calibration curve graphically represented and the r2 reported;
Lze ho vynásobit 100 za účelem vyjádření v procentech.
Peptide concentration of each reference control A replicate;
IATA (integrovaný přístup ke zkoušení a posuzování)
Mean peptide concentration (mM) of the three reference controls A, SD and CV;
Strukturovaný přístup používaný pro zjišťování nebezpečnosti (potenciál), charakterizaci rizik (potence) a/nebo posouzení bezpečnosti (potenciál/potence a expozice) chemické látky nebo skupiny chemických látek, jenž strategicky integruje a váží všechny důležité údaje s cílem poskytnout informace pro přijetí regulačního rozhodnutí, které se týká potenciální nebezpečnosti a/nebo rizika a/nebo potřeby dalšího cíleného, a tudíž minimálního zkoušení.
Peptide concentration of reference controls A and C.
Molekulární iniciační událost
Analysis sequence
Narušení biologického systému na molekulární úrovni vyvolané chemickou látkou, jež bylo identifikováno jako počáteční událost v mechanismu nepříznivých účinků.
For reference controls:
Směs nebo roztok tvořený dvěma nebo více látkami, které v něm nereagují (1).
Peptide peak area at 220 nm of each B and C replicate;
Látka definovaná svým kvantitativním složením, v níž je přítomna jedna hlavní složka v míře alespoň 80 % hmot.
Mean peptide peak area at 220 nm of the nine reference controls B and C in acetonitrile, SD an CV (for stability of reference controls over analysis time);
Vícesložková látka
For each solvent used, the mean peptide peak area at 220 nm of the three appropriate reference controls C (for the calculation of percent peptide depletion);
Látka definovaná svým kvantitativním složením, v níž je přítomna více než jedna hlavní složka v koncentraci ≥ 10 % hmot. a < 80 % hmot.
For each solvent used, the peptide concentration (mM) of the three appropriate reference controls C;
Vícesložková látka je výsledkem výrobního procesu.
For each solvent used, the mean peptide concentration (mM) of the three appropriate reference controls C, SD and CV.
Rozdíl mezi směsí a vícesložkovou látkou spočívá v tom, že směs se získá smísením dvou nebo více látek bez chemické reakce.
For positive control:
Vícesložková látka je výsledkem chemické reakce.
Peptide peak area at 220 nm of each replicate;
Replika obsahující všechny složky zkušebního systému a látku, o níž je známo, že způsobuje pozitivní reakci.
Percent peptide depletion of each replicate;
Referenční kontrola
Mean percent peptide depletion of the three replicates, SD and CV.
Neexponovaný vzorek obsahující všechny složky zkušebního systému, včetně rozpouštědla nebo vehikula, který se zpracovává s exponovanými zkoušenými chemickými látkami a jinými kontrolními vzorky, aby se zjistila základní reakce vzorků zkoušených se zkoušenou chemickou látkou rozpuštěnou ve stejném rozpouštědle nebo vehikulu.
For each test chemical:
Když se použije souběžně s negativní kontrolou, ukazuje také, zda rozpouštědlo nebo vehikul vzájemně reaguje se zkušebním systémem.
Appearance of precipitate in the reaction mixture at the end of the incubation time, if observed.
Relevantnost
If precipitate was re-solubilised or centrifuged;
Specifičnost
Presence of co-elution;
Vyjadřuje, do jaké míry zkouška správně měří nebo predikuje biologický účinek, který je předmětem zájmu.
Description of any other relevant observations, if applicable;
Shoda mezi výsledky získanými při zkoušení téže chemické látky za použití stejného zkušebního protokolu (viz spolehlivost) (21).
Mean of percent peptide depletion of the three replicate, SD and CV;
Citlivost
Mean of percent cysteine and percent lysine depletion values;
Reprodukovatelnost
Prediction model used and DPRA prediction.
Je měřítkem přesnosti zkušební metody, která poskytuje kategorické výsledky, a je důležitým prvkem při hodnocení relevantnosti zkušební metody (21).
Proficiency testing
Podíl všech negativních/neaktivních chemických látek, které jsou na základě zkušební metody správně zatříděny.
If applicable, the procedure used to demonstrate proficiency of the laboratory in performing the test method (e.g. by testing of proficiency substances) or to demonstrate reproducible performance of the test method over time.
Je měřítkem přesnosti zkušební metody, která poskytuje kategorické výsledky, a je důležitým prvkem při hodnocení relevantnosti zkušební metody (21).
Discussion of the results
Chemické prvky nebo jejich sloučeniny v přírodním stavu nebo získané výrobním procesem včetně všech přídatných látek nutných k uchování stability výrobku a všech nečistot vznikajících v použitém procesu, ale s vyloučením všech rozpouštědel, která je možno oddělit bez ovlivnění stability látky nebo změny jejího složení (1).
Discussion of the results obtained with the DPRA test method;
Systém navrhující klasifikaci látek a směsí podle standardizovaných typů a úrovní fyzikálních, zdravotních a environmentálních nebezpečí a řešící příslušné komunikační prvky, jako jsou piktogramy, signální slova, výroky o nebezpečí, výroky o bezpečnostních opatřeních a bezpečnostní datové listy, které obsahují informace o jejich nežádoucích účincích s ohledem na ochranu lidí (včetně zaměstnavatelů, dělníků, přepravců, spotřebitelů a osob reagujících na havárie) a životního prostředí (1).
Available at: http://www.unece.org/trans/danger/publi/ghs/ghs_rev05/05files_e.html
látky s neznámým nebo proměnlivým složením, komplexní reakční produkty nebo biologický materiál.
Part 1: Scientific Evidence.
Validovaná zkušební metoda
Series on Testing and Assessment No. 168, OECD, Paris.
Zkušební metoda, u níž se má za to, že je dostatečně relevantní a spolehlivá pro určitý účel, a která je založena na vědecky spolehlivých zásadách.
Chapter B.6 of this Annex: Skin Sensitisation.
Zkušební metoda není nikdy validovaná v absolutním smyslu, ale pouze pro určitý konkrétní účel (21).
Chapter B.42 of this Annex: The Local Lymph Node Assay
Dříve než začnou laboratoře běžně používat tuto zkušební metodu, měly by prokázat odbornou způsobilost správným získáním předpokládané předpovědi DPRA u 10 vhodných látek doporučených v tabulce 1 a získáním hodnot úbytku cysteinu a lysinu, které spadají do příslušného referenčního rozpětí, u 8 z 10 vhodných látek pro každý peptid.
Available at: https://eurl-ecvam.jrc.ec.europa.eu/eurl-ecvam-recommendations/eurl-ecvam-recommendation-on-the-direct-peptide-reactivity-assay-dpra
Dalšími kritérii výběru bylo, aby byly komerčně dostupné, aby k nim byly k dispozici vysoce kvalitní referenční údaje získané in vivo a vysoce kvalitní údaje získané zkouškou DPRA in vitro a aby byly použity ve validační studii provedené za koordinace EURL ECVAM k prokázání úspěšného provedení této zkušební metody v laboratořích, které se na studii podílely.
Accessible at: http://ecvam-dbalm.jrc.ec.europa.eu/
Doporučené látky k prokázání odborné způsobilosti k provádění zkoušky přímé reaktivity peptidů
OECD Series on Testing and Assessment, No. 34.
Látky pro zkoušení způsobilosti
Organisation for Economic Cooperation and Development, Paris, France.
Skupenství
Accessible at: www.fda.gov/downloads/drugs/guidancecomplianceregulatoryinformation/guidance/ucm070107.pdf - 138
Předpověď in vivo [1]
The term is often used interchangeably with “concordance”, to mean the proportion of correct outcomes of a test method (21).
Předpověď DPRA [2]
AOP (Adverse Outcome Pathway)
Rozpětí [3] procentuálního úbytku cysteinových peptidů
Sequence of events from the chemical structure of a target chemical or group of similar chemicals through the molecular initiating event to an in vivo outcome of interest (2).
Rozpětí [3] procentuálního úbytku lysinových peptidů
Calibration curve
2,4-dinitrochlorbenzen
The relationship between the experimental response value and the analytical concentration (also called standard curve) of a known substance.
Senzibilizující
Coefficient of variation
(extrémně)
A measure of variability that is calculated for a group of replicate data by dividing the standard deviation by the mean.
Oxazolon
It can be multiplied by 100 for expression as a percentage.
Formaldehyd
IATA (Integrated Approach to Testing and Assessment)
(silně)
A structured approach used for hazard identification (potential), hazard characterisation (potency) and/or safety assessment (potential/potency and exposure) of a chemical or group of chemicals, which strategically integrates and weights all relevant data to inform regulatory decision regarding potential hazard and/or risk and/or the need for further targeted and therefore minimal testing.
Benzylidenaceton
Molecular Initiating Event
(středně silně)
Chemical-induced perturbation of a biological system at the molecular level identified to be the starting event in the adverse outcome pathway.
(slabě)
A mixture or a solution composed of two or more substances in which they do not react (1).
Butanedion
A substance, defined by its quantitative composition, in which one main constituent is present to at least 80 % (w/w).
Butan-1-ol
Multi-constituent substance
Nesenzibilizující
A substance, defined by its quantitative composition, in which more than one main constituent is present in a concentration ≥ 10 % (w/w) and < 80 % (w/w).
ethylkumarin
A multi-constituent substance is the result of a manufacturing process.
Kyselina mléčná
The difference between mixture and multi-constituent substance is that a mixture is obtained by blending of two or more substances without chemical reaction.
ethoxyacetofenon
A multi-constituent substance is the result of a chemical reaction.