natgillin/translations-raw huggingface dataset:
Stimulace růstu
Fit a smooth line through the data points by eye or by computerised interpolation to get a first impression of the concentration-response relationship, and then proceed with a more detailed method, preferably a computerised statistical method.
Při nízkých koncentracích bývá někdy pozorována stimulace růstu (negativní inhibice).
Depending on the intended usage of data;
To může být důsledkem buď hormese (‚toxická stimulace‘), nebo přidání stimulujících růstových faktorů se zkušebním materiálem k minimálnímu použitému médiu.
the quality (precision) and amount of data as well as the availability of data analysis tools, it may be decided (and sometimes well justified) to stop the data analysis at this stage and simply read the key figures EC50 and EC10 (and/or EC20) from the eye fitted curve (see also section below on stimulatory effects).
Nezapomeňte, že přidání anorganických živin by nemělo mít žádný přímý účinek, protože zkušební médium by mělo po celou dobu zkoušky udržovat přebytek živin.
Valid reasons for not using a statistical method may include:
Stimulaci nízkými dávkami lze ve výpočtech EC50 obvykle ignorovat, pokud není extrémní.
Data are not appropriate for computerised methods to produce any more reliable results than can be obtained by expert judgement — in such situations some computer programs may even fail to produce a reliable solution (iterations may not converge etc.)
Je-li však extrémní nebo má-li být vypočtena hodnota ECx pro nízké x, mohou být zapotřebí speciální postupy.
Stimulatory growth responses cannot be handled adequately using available computer programs (see below).
K vymazání stimulačních odezev z analýzy dat by nemělo pokud možno dojít, a pokud dostupný software pro stanovení křivky nemůže drobnou stimulaci přijmout, lze použít lineární interpolaci s bootstrapem.
Statistical procedures
Jestliže je stimulace extrémní, lze zvážit použití modelu předpokládajícího hormesi (18).
The aim is to obtain a quantitative concentration-response relationship by regression analysis.
Netoxická inhibice růstu
It is possible to use a weighted linear regression after having performed a linearising transformation of the response data — for instance into probit or logit or Weibull units (8), but non-linear regression procedures are preferred techniques that better handle unavoidable data irregularities and deviations from smooth distributions.
Zkušební materiály absorbující světlo mohou způsobit snížení růstové rychlosti, protože stínění snižuje množství dostupného světla.
Approaching either zero or total inhibition, such irregularities may be magnified by the transformation, interfering with the analysis (8).
Takové účinky fyzikální povahy je zapotřebí oddělit od toxických účinků, a to úpravou zkušebních podmínek, přičemž takové fyzikální účinky je nutno uvádět v závěrečné zprávě samostatně.
It should be noted that standard methods of analysis using probit, logit, or Weibull transforms are intended for use on quantal (e.g. mortality or survival) data, and must be modified to accommodate growth or biomass data.
Pokyny lze nalézt v literatuře (2 a 3).
Specific procedures for determination of ECx values from continuous data can be found in (9) (10) and (11).
ZÁVĚREČNÁ ZPRÁVA
The use of non-linear regression analysis is further detailed in Appendix 5.
V závěrečné zprávě musí být uvedeny tyto údaje:
For each response variable to be analysed, use the concentration-response relationship to calculate point estimates of ECx values.
Zkoušená chemická látka:
When possible, the 95 % confidence limits for each estimate should be determined.
fyzikální povaha a relevantní fyzikálně-chemické vlastnosti, včetně meze rozpustnosti ve vodě,
Goodness of fit of the response data to the regression model should be assessed either graphically or statistically.
údaje o chemické identifikaci (např. číslo CAS), včetně čistoty.
Regression analysis should be performed using individual replicate responses, not treatment group means.
Testovaný druh:
If, however nonlinear curve fitting is difficult or fails because of too great scatter in the data, the problem may be circumvented by performing the regression on group means as a practical way of reducing the influence of suspected outliers.
kmen, dodavatel nebo zdroj a použité podmínky kultivace.
Use of this option should be identified in the test report as a deviation from normal procedure because curve fits with individual replicates did not produce a good result.
Zkušební podmínky:
estimates and confidence limits may also be obtained using linear interpolation with bootstrapping (13), if available regression models/methods are unsuitable for the data.
datum zahájení zkoušky a délka jejího trvání,
For estimation of the LOEC and hence the NOEC, for effects of the test chemical on growth rate, it is necessary to compare treatment means using analysis of variance (ANOVA) techniques.
popis uspořádání zkoušky:
The mean for each concentration must then be compared with the control mean using an appropriate multiple comparison or trend test method.
zkušební nádoby, objemy kultur, hustota biomasy na počátku zkoušky,
Dunnett's or Williams' test may be useful (12)(14)(15)(16)(17).
složení média,
It is necessary to assess whether the ANOVA assumption of homogeneity of variance holds.
zkušební koncentrace a opakování (například počet opakování, počet zkušebních koncentrací a použitá geometrická progrese),
This assessment may be performed graphically or by a formal test (17).
popis přípravy zkušebních roztoků včetně použití rozpouštědel atd.,
Suitable tests are Levene's or Bartlett's.
kultivační zařízení,
Failure to meet the assumption of homogeneity of variances can sometimes be corrected by logarithmic transformation of the data.
intenzita a kvalita světla (zdroj, homogenita),
If heterogeneity of variance is extreme and cannot be corrected by transformation, analysis by methods such as step-down Jonkheere trend tests should be considered.
teplota,
Additional guidance on determining the NOEC can be found in (11).
zkušební koncentrace:
Recent scientific developments have led to a recommendation of abandoning the concept of NOEC and replacing it with regression based point estimates ECx.
nominální zkušební koncentrace a jakékoliv výsledky analýz pro stanovení koncentrace zkoušené chemické látky v zkušebních nádobách.
An appropriate value for x has not been established for this algal test.
V závěrečné zprávě je třeba uvést výtěžnost metody a mez kvantifikace ve zkušební matrici,
A range of 10 to 20 % appears to be appropriate (depending on the response variable chosen), and preferably both the EC10 and EC20 should be reported.
všechny odchylky od této zkušební metody,
Growth stimulation
metoda stanovení biomasy a důkaz o korelaci mezi naměřeným parametrem a hmotností sušiny.
Growth stimulation (negative inhibition) at low concentrations is sometimes observed.
Výsledky:
This can result from either hormesis (“toxic stimulation”) or from addition of stimulating growth factors with the test material to the minimal medium used.
hodnoty pH na počátku a konci zkoušky u všech expozic,
Note that the addition of inorganic nutrients should not have any direct effect because the test medium should maintain a surplus of nutrients throughout the test.
biomasa pro každou baňku v každém měřicím bodě a metoda měření biomasy,
Low dose stimulation can usually be ignored in EC50 calculations unless it is extreme.
růstové křivky (vynášení biomasy vůči času),
However, if it is extreme, or an ECx value for low x is to be calculated, special procedures may be needed.
vypočítané proměnné odezvy pro všechna opakování s exponovanými vzorky, spolu se středními hodnotami a variačními koeficienty pro opakování,
Deletion of stimulatory responses from the data analysis should be avoided if possible, and if available curve fitting software cannot accept minor stimulation, linear interpolation with bootstrapping can be used.
grafické znázornění vztahu koncentrace/odezva,
If stimulation is extreme, use of a hormesis model may be considered (18).
odhady toxicity pro proměnné odezvy, např. EC50, EC10, EC20, a související intervaly spolehlivosti.
Non toxic growth inhibition
Jestliže se počítají LOEC a NOEC, uvedou se jejich hodnoty a statistické metody použité k jejich stanovení,
Light absorbing test materials may give rise to a growth rate reduction because shading reduces the amount of available light.
jestliže byla použita ANOVA, uvede se velikost účinku, který lze detekovat (např. nejmenší významný rozdíl),
Such physical types of effects should be separated from toxic effects by modifying the test conditions and the former should be reported separately.
jakákoliv stimulace růstu zjištěná v jakémkoli exponovaném vzorku,
Guidance may be found in (2) and (3).
jakékoliv jiné pozorované účinky, např. morfologické změny řas,
TEST REPORT
diskuse o výsledcích včetně případného ovlivnění výsledku zkoušky v důsledku odchylek od této zkušební metody.
The test report must include the following:
OECD (2006).
Test chemical:
Dodatek 1
physical nature and relevant physical-chemical properties, including water solubility limit;
Definice
chemical identification data (e.g., CAS Number), including purity (impurities).
Pro účely této zkušební metody se používají následující definice a zkratky:
Test species:
Biomasa je hmotnost sušiny živé hmoty přítomné v populaci vyjádřená ve vztahu k danému objemu;
the strain, supplier or source and the culture conditions used.
např. mg řas/litr zkušebního roztoku.
Test conditions:
‚Biomasa‘ je obvykle definována jako hmota, ale v rámci této zkoušky se toto slovo používá pro hmotu vztaženou na objem.
date of start of the test and its duration;
V této zkoušce se obvykle měří náhrady biomasy, například počet buněk, fluorescence atd., a používání termínu ‚biomasa‘ tedy rovněž odkazuje na tyto náhradní míry.
description of test design:
Chemická látka je látka nebo směs.
test vessels, culture volumes, biomass density at the beginning of the test;
Variační koeficient je bezrozměrná veličina proměnlivosti parametru definovaná jako poměr směrodatné odchylky a střední hodnoty.
composition of the medium;
Lze jej rovněž vyjádřit jako procentuální údaj.
test concentrations and replicates (e.g., number of replicates, number of test concentrations and geometric progression used);
Střední variační koeficient průměrné specifické růstové rychlosti v kontrolních kulturách použitých k opakování se počítá následovně:
description of the preparation of test solutions, including use of solvents etc.
vypočítejte % variační koeficient průměrné specifické růstové rychlosti z denních růstových rychlostí nebo růstových rychlostí po jednotlivých časových úsecích pro příslušnou repliku;
culturing apparatus;
vypočítejte střední hodnotu ze všech hodnot vypočítaných v bodě 1 pro získání středního variačního koeficientu denní specifické růstové rychlosti nebo specifické růstové rychlosti po jednotlivých časových úsecích v opakovaných kontrolních kulturách.
light intensity and quality (source, homogeneity);
ECx je koncentrace zkoušené chemické látky rozpuštěné ve zkušebním médiu, která pro danou expoziční dobu vede k x % (např. 50 %) snížení růstu zkušebního organismu (musí se výslovně uvést, pokud se odchyluje od plné či normální doby trvání zkoušky).
temperature;
Pro jednoznačné označení hodnoty EC odvozené z růstové rychlosti nebo výtěžku se symbol ‚ErC‘ používá pro růstovou rychlost a ‚EyC‘ pro výtěžek.
concentrations tested:
Růstové médium je úplné syntetické kultivační médium, v němž rostou zkušební řasy při expozici zkoušené chemické látce.
the nominal test concentrations and any results of analyses to determine the concentration of the test chemical in the test vessels.
Zkoušená chemická látka bude za normálních podmínek v zkušebním médiu rozpuštěna.
The recovery efficiency of the method and the limit of quantification in the test matrix should be reported;
Růstová rychlost (průměrná specifická růstová rychlost) je logaritmický nárůst biomasy během období expozice.
all deviations from this test method;
Nejnižší koncentrace s pozorovaným účinkem (LOEC) je nejnižší zkušební koncentrace, při níž je pro danou expoziční dobu pozorován statisticky významný účinek chemické látky na snížení růstu (na hladině spolehlivosti p < 0,05) ve srovnání s kontrolou.
method for determination of biomass and evidence of correlation between the measured parameter and dry weight;
Všechny zkušební koncentrace vyšší než LOEC musí však mít stejné nebo závažnější škodlivé účinky, než jsou účinky pozorované při koncentraci LOEC.
Results:
Nelze-li tyto dvě podmínky splnit, musí být podrobně vysvětleno, jak byla LOEC (a tedy i NOEC) zvolena.
pH values at the beginning and at the end of the test at all treatments;
Koncentrace bez pozorovaných účinků (NOEC) je zkušební koncentrace bezprostředně nižší než LOEC.
biomass for each flask at each measuring point and method for measuring biomass;
Proměnná odezvy je proměnná pro odhad toxicity odvozená z jakýchkoliv naměřených parametrů, jež popisují biomasu, různými metodami výpočtu.
growth curves (plot of biomass versus time);
U této metody jsou proměnnými odezvy růstová rychlost a výtěžek, které se odvozují přímo z měření biomasy nebo jakékoliv z uvedených náhrad.
calculated response variables for each treatment replicate, with mean values and coefficient of variation for replicates;
Specifická růstová rychlost je proměnná odezvy definovaná jako podíl rozdílu přirozených logaritmů sledovaného parametru (v této zkušební metodě je jím biomasa) a příslušného časového období.
graphical presentation of the concentration/effect relationship;
Zkoušenou chemickou látkou se rozumí jakákoli látka nebo směs zkoušená pomocí této zkušební metody.
estimates of toxicity for response variables e.g., EC50, EC10, EC20 and associated confidence intervals.
Výtěžek je hodnota proměnné měření na konci expoziční doby minus hodnota proměnné měření na počátku expoziční doby, která vyjadřuje nárůst biomasy během zkoušky.
If calculated, LOEC and NOEC and the statistical methods used for their determination;
Kmeny, u nichž byla prokázána vhodnost pro zkoušku
any stimulation of growth found in any treatment;
Zelené řasy
any other observed effects, e.g. morphological changes of the algae;
Pseudokirchneriella subcapitata (dříve známá jako Selenastrum capricornutum), ATCC 22662, CCAP 278/4, 61.81 SAG
discussion of the results, including any influence on the outcome of the test resulting from deviations from this test method.
Desmodesmus subspicatus (dříve známá jako Scenedesmus subspicatus), 86.81 SAG
OECD (2006).
Rozsivky
J. Amer.
Sinice
Appendix 1
Zdroje kmenů
Definitions
Doporučené kmeny jsou dispozici v jednodruhových kulturách z následujících sbírek (v abecedním pořadí):
The following definitions and abbreviations are used for the purposes of this test method:
Vzhled a charakteristiky doporučených druhů
Biomass is the dry weight of living matter present in a population expressed in terms of a given volume;
Vzhled
e.g., mg algae/litre test solution.
zakřivené, zkroucené jednotlivé buňky
Usually “biomass” is defined as a mass, but in this test this word is used to refer to mass per volume.
oválné, většinou jednotlivé buňky
Also in this test, surrogates for biomass, such as cell counts, fluorescence, etc. are typically measured and the use of the term “biomass” thus refers to these surrogate measures as well.
tyčinky
Chemical means a substance or mixture
řetězce oválných buněk
Coefficient of variation is a dimensionless measure of the variability of a parameter, defined as the ratio of the standard deviation to the mean.
Velikost (d × š) μm
This can also be expressed as a percent value.
Buněčný objem (μm3/buňka)
Mean coefficient of variation of average specific growth rate in replicate control cultures should be calculated as follows:
Hmotnost buněčné sušiny (mg/buňku)
Calculate % CV of average specific growth rate out of the daily/section by section growth rates for the respective replicate;
2–3 × 10– 8
Calculate the mean value out of all values calculated under point 1 to get the mean coefficient of variation of the daily/section by section specific growth rate in replicate control cultures.
3–4 × 10– 8
ECx is the concentration of the test chemical dissolved in test medium that results in an x % (e.g. 50 %) reduction in growth of the test organism within a stated exposure period (to be mentioned explicitly if deviating from full or normal test duration).
1–2 × 10– 8
To unambiguously denote an EC value deriving from growth rate or yield the symbol “ErC” is used for growth rate and “EyC” is used for yield.
2–3 × 10– 9
Growth medium is the complete synthetic culture medium in which test algae grow when exposed to the test chemical.
Růstová rychlost [3] (den– 1)
The test chemical will normally be dissolved in the test medium.
1,5–1,7
Growth rate (average specific growth rate) is the logarithmic increase in biomass during the exposure period.
Specifická doporučení pro kultivaci doporučených zkušebních druhů a nakládání s nimi
Lowest Observed Effect Concentration (LOEC) is the lowest tested concentration at which the chemical is observed to have a statistically significant reducing effect on growth (at p < 0,05) when compared with the control, within a given exposure time.
Pseudokirchneriella subcapitata a Desmodesmus subspicatus
However, all test concentrations above the LOEC must have a harmful effect equal to or greater than those observed at the LOEC.
Tyto zelené řasy se obecně snadno udržují v různých kultivačních médiích.
When these two conditions cannot be satisfied, a full explanation must be given for how the LOEC (and hence the NOEC) has been selected.
Informace o vhodných médiích lze získat ze sbírek kultur.
No Observed Effect Concentration (NOEC) is the test concentration immediately below the LOEC.
Buňky jsou normálně osamocené a měření hustoty buněk lze snadno provádět použitím elektronického počítače částic nebo mikroskopu.
Response variable is a variable for the estimation of toxicity derived from any measured parameters describing biomass by different methods of calculation.
Pro uchování zásobní kultury lze použít různá růstová média.
For this test method growth rates and yield are response variables derived from measuring biomass directly or any of the surrogates mentioned.
Zejména je důležité zabránit tomu, aby vsázková kultura překročila při obnově fázi logaritmického růstu; zpětné získání je v tomto bodě obtížné.
Specific growth rate is a response variable defined as quotient of the difference of the natural logarithms of a parameter of observation (in this test method, biomass) and the respective time period
Anabaena flos-aquae vytváří shluky vnořených řetězců buněk.
Test chemical means any substance or mixture tested using this test method.
Velikost těchto shluků se může měnit s podmínkami kultivace.
Yield is the value of a measurement variable at the end of the exposure period minus the measurement variable's value at the start of the exposure period to express biomass increase during the test.
Může vzniknout potřeba tyto shluky rozrušit, pokud se ke stanovení biomasy použije počítání pod mikroskopem nebo elektronický počítač částic.
Appendix 2
Pro snížení variability počtu mohou být v dílčích vzorcích použity k rozrušení řetězců ultrazvukové vlny (tzv. sonikace).
Strains Shown to be Suitable for the Test
Delší aplikace ultrazvuku, než je zapotřebí pro rozrušení řetězců na kratší úseky, může buňky zničit.
Green algae
Intenzita a délka aplikace musí být stejná pro každé zpracování.
Pseudokirchneriella subcapitata (formerly known as Selenastrum capricornutum), ATCC 22662, CCAP 278/4, 61.81 SAG
Tím se zvýší spolehlivost mikroskopického stanovení hustoty.
Diatoms
Pro stanovení celkového buněčného objemu sinic rodu Anabaena po rozrušení řetězců buněk opatrnou sonikací lze použít elektronický počítač částic.
Cyanobacteria
Energii ultrazvuku je třeba nastavit tak, aby se předešlo narušení buněk.
Sources of Strains
Použijte vířivou míchačku nebo podobnou odpovídající metodu, abyste zajistili, že suspenze řas použitá pro inokulaci zkušebních nádob bude dobře promíchaná a homogenní.
The strains recommended are available in unialgal cultures from the following collections (in alphabetical order):
Zkušební nádoby je nutno umístit na desku orbitální nebo reciproké třepačky při přibližně 150 otáčkách za minutu.
37073 Göttingen
Případně je možné použít občasné promíchávání pro snížení sklonu sinic rodu Anabaena vytvářet shluky.
Appearance and characteristics of recommended species
Jestliže ke shlukování dojde, je třeba věnotvat péči tomu, abyste získali reprezentativní vzorky pro měření biomasy.
Appearance
Před odběrem vzorků může být nezbytné intenzívní třepání pro rozrušení shluků sinic.
Curved, twisted single cells
Synechococcus leopoliensis vyrůstají jako jednotlivé buňky tyčinkovitého tvaru.
Oval, mostly single cells
Buňky jsou velmi malé, což komplikuje použití počítání pod mikroskopem pro měření biomasy.
Rods
Užitečné jsou elektronické počítače částic vybavené pro počítání částic až do velikosti přibližně 1 μm.
Chains of oval cells
Rovněž jsou využitelná fluorimetrická měření in vitro.
Size (L × W) μm
Je třeba mít na paměti, že v médiu musí být přítomen křemičitan.
Cell volume (μm3/cell)
Za určitých růstových podmínek může Navicula pelliculosa vytvářet shluky.
Cell dry weight (mg/cell)
Kvůli produkci lipidů mají buňky řas někdy tendenci se shlukovat v povrchovém filmu.
2-3 × 10- 8
Za těchto okolností se musí přijmout zvláštní opatření při odběru dílčích vzorků pro stanovení biomasy, aby se získaly reprezentativní vzorky.
3-4 × 10- 8
Patrně bude třeba intenzívní protřepávání, např. použitím vířivé míchačky.
1-2 × 10- 8
Měřeno pomocí elektronického počítače částic
2-3 × 10- 9
Vypočítáno z velikosti
Growth rate [3] (day- 1)
Nejčastěji pozorovaná růstová rychlost v médiu OECD při intenzitě světla přibližně 70 μE m– 2 s– 1 a 21 °C
1,5 -1,7
Dodatek 3
Specific Recommendations on Culturing and Handling of Recommended Test Species
Růstová média
Pseudokirchneriella subcapitata and Desmodesmus subspicatus
Lze použít jedno z následujících dvou růstových médií:
These green algae are generally easy to maintain in various culture media.
Médium OECD:
Information on suitable media is available from the culture collections.
původní médium podle Pokynu OECD pro zkoušení 201, rovněž podle normy ISO 8692.
The cells are normally solitary, and cell density measurements can easily be performed using an electronic particle counter or microscope.
EPA AAP rovněž podle ASTM.
Various growth media may be used for keeping a stock culture.
Při přípravě těchto médií je třeba používat chemicky čisté nebo analyticky čisté látky a deionizovanou vodu.
It is particularly important to avoid allowing the batch culture to go past log phase growth when renewing, recovery is difficult at this point.
Složení média AAP (US.
Anabaena flos-aquae develops aggregates of nested chains of cells.
EPA) a média podle Pokynu OECD pro zkoušení 201.
The size of these aggregates may vary with culturing conditions.
Složka
It may be necessary to break up these aggregates when microscope counting or an electronic particle counter is used for determination of biomass.
MgCl2 · 6(H2O)
Sonication of sub-samples may be used to break up chains to reduce count variability.
CaCl2 · 2(H2O)
Longer sonication than required for breaking up chains into shorter lengths may destroy the cells.
MgSO4 · 7(H2O)
Sonication intensity and duration must be identical for each treatment.
FeCl3 · 6(H2O)
Count enough fields on the hemocytometer (at least 400 cells) to help compensate for variability.
EDTA · 2(H2O)
This will improve reliability of microscopic density determinations.
MnCl2 · 4(H2O)
An electronic particle counter can be used for determination of total cell volume of Anabaena after breaking up the cell chains by careful sonification.
CoCl2 · 6(H2O)
The sonification energy has to be adjusted to avoid disruption of the cells.
MoO4 · 2(H2O)
Use a vortex mixer or similar appropriate method to make sure the algae suspension used to inoculate test vessels is well mixed and homogeneous.
CuCl2 · 2(H2O)
Test vessels should be placed on an orbital or reciprocate shaker table at about 150 revolutions per minute.