natgillin/translations-raw huggingface dataset:
inkubační doba,
measurement of pH, osmolality and precipitate in the culture medium to which the test chemical was added, as appropriate.
trvání expozice,
Mono-constituent substance:
doba od expozice do odběru buněk k vyhodnocení,
physical appearance, water solubility, and additional relevant physicochemical properties;
případně hustota buněk při nasazení,
chemical identification, such as IUPAC or CAS name, CAS number, SMILES or InChI code, structural formula, purity, chemical identity of impurities as appropriate and practically feasible, etc.
typ a složení použitého metabolického aktivačního systému (zdroj S9, metoda přípravy směsi S9, koncentrace nebo objem směsi S9 a S9 v konečném kultivačním médiu, kontroly jakosti S9),
Multi-constituent substance, UVCBs and mixtures:
chemické látky použité v pozitivních a negativních kontrolách, konečné koncentrace pro jednotlivé podmínky expozice,
characterised as far as possible by chemical identity (see above), quantitative occurrence and relevant physicochemical properties of the constituents.
metody přípravy preparátů a použitý postup barvení,
Solvent:
kritéria přijatelnosti zkoušek,
justification for choice of solvent.
kritéria hodnocení aberací,
percentage of solvent in the final culture medium should also be indicated.
počet analyzovaných metafází,
Cells:
metody měření cytotoxicity,
type and source of cells
jakékoli doplňkové informace týkající se cytotoxicity a použité metody,
karyotype features and suitability of the cell type used;
kritéria klasifikace studie na pozitivní, negativní nebo dvojznačnou,
absence of mycoplasma, for cell lines;
metody použité ke stanovení pH, osmolality a sraženiny.
for cell lines, information on cell cycle length, doubling time or proliferation index;
počet exponovaných buněk a počet sklizených buněk v každé kultuře, jestliže byly použity buněčné linie,
sex of blood donors, age and any relevant information on the donor, whole blood or separated lymphocytes, mitogen used;
měření cytotoxicity, např. RPD, RICC, MI, případná další pozorování, existují-li,
number of passages, if available, for cell lines;
v případě buněčných linií informace o délce buněčného cyklu, době zdvojnásobení nebo proliferační index,
methods for maintenance of cell cultures, for cell lines;
známky srážení a čas jejich stanovení,
modal number of chromosomes, for cell lines.
definice aberací, včetně gapů,
Test conditions:
počet hodnocených buněk, počet buněk s chromozómovými aberacemi a typy chromozómových aberací zvlášť pro každou exponovanou a kontrolní kulturu, včetně gapů a s vyloučením gapů,
identity of the metaphase-arresting chemical, its concentration and duration of cell exposure;
změny ploidie (polyploidní buňky a buňky s endoreduplikovanými chromozómy, uvedené odděleně), byly-li pozorovány,
concentration of test chemical expressed as final concentration in the culture medium (e.g. μg or mg/mL or mM of culture medium).
závislost účinku na koncentraci, pokud je to možné,
rationale for selection of concentrations and number of cultures including, e.g. cytotoxicity data and solubility limitations;
údaje o souběžných negativních kontrolách (rozpouštědlo) a pozitivních kontrolách (koncentrace a rozpouštědla),
composition of media, CO2 concentration if applicable, humidity level;
historické údaje o negativních (rozpouštědlo) a pozitivních kontrolách, s rozpětími, středními hodnotami a směrodatnými odchylkami a 95 % rozpětím distribuci, stejně jako počet údajů,
concentration (and/or volume) of solvent and test chemical added in the culture medium;
statistické analýzy, případné p hodnoty.
incubation temperature;
Diskuse o výsledcích.
incubation time;
Závěry.
duration of treatment;
Overview of the set of OECD Genetic Toxicology Test Guidelines and updates performed in 2014-2015.
harvest time after treatment;
ENV Publications.
cell density at seeding, if appropriate;
Series on Testing and Assessment, No.
type and composition of metabolic activation system (source of S9, method of preparation of the S9 mix, the concentration or volume of S9 mix and S9 in the final culture medium, quality controls of S9);
234, OECD, Paris.
positive and negative control chemicals, final concentrations for each conditions of treatment;
, „Cytological Methods for Detecting Chemical Mutagens“, in Chemical Mutagens, Principles and Methods for their Detection, Vol.
methods of slide preparation and staining technique used;
4, Hollaender, A. (ed.), Plenum Press, New York and London, s. 1-29.
criteria for acceptability of assays;
Ishidate, M.
criteria for scoring aberrations;
Jr., T.
number of metaphases analysed;
Sofuni (1985), „The in vitro Chromosomal Aberration Test Using Chinese Hamster Lung (CHL) Fibroblast Cells in Culture“ in Progress in Mutation Research, Vol.
methods for the measurements of cytotoxicity;
5, Ashby, J. et al.
any supplementary information relevant to cytotoxicity and method used;
(eds.), Elsevier Science Publishers, Amsterdam-New York- Oxford, s. 427-432.
criteria for considering studies as positive, negative or equivocal;
, „Improving dose selection and identification of aneugens in the in vitro chromosome aberration test by integration of flow cytometry-based methods“, Environmental and Molecular Mutagenesis, Vol.
methods used to determine pH, osmolality and precipitation.
49/4, s. 318-327.
the number of cells treated and the number of cells harvested for each culture when cell lines are used
Kapitola B.49 této přílohy: Zkouška na přítomnost mikrojader v buňkách savců in vitro.
cytotoxicity measurements, e.g. RPD, RICC, MI, other observations if any;
, „A Safe Substitute for Polychlorinated Biphenyls as an Inducer of Metabolic Activation Systems“, in In Vitro Metabolic Activation in Mutagenesis Testing, de Serres, F.J. et al.
information on cell cycle length, doubling time or proliferation index in case of cell lines;
(eds.), Elsevier, North-Holland, s. 85-88.
signs of precipitation and time of the determination;
K dispozici na: http://www.pops.int/.
definition for aberrations, including gaps;
McCooey (1982), „CHO/HGPRT Mutation Assay: Evaluation of Gases and Volatile Liquids“, in Genotoxic Effects of Airborne Agents, Tice, R.R., D.L.
Number of cells scored, number of cells with chromosomal aberrations and type of chromosomal aberrations given separately for each treated and control culture, including and excluding gaps;
Schaich (eds.), Plenum, New York, s. 91-103.
changes in ploidy (polyploid cells and cells with endoreduplicated chromosomes, given separately) if seen;
(ed.)
concentration-response relationship, where possible;
Cambridge University Press, Cambridge, s. 141-154.
concurrent negative (solvent) and positive control data (concentrations and solvents);
K dispozici na vyžádání.
historical negative (solvent) and positive control data, with ranges, means and standard deviations and 95 % control limits for the distribution, as well as the number of data;
K dispozici na adrese: https://federalregister.gov/a/2012-13774.
statistical analyses, p-values if any.
OECD (2014), „Statistical analysis supporting the revision of the genotoxicity Test Guidelines, OECD Environment, Health and Safety Publications (EHS)“, Series on Testing and Assessment, No.
Discussion of the results.
198, OECD Publishing, Paris.
Conclusions.
, „Metaphase chromosome aberration assays in vitro“, in Basic Mutagenicity Tests: UKEMS Recommended Procedures, Kirkland, D.J.
Overview of the set of OECD Genetic Toxicology Test Guidelines and updates performed in 2014-2015.
(ed.), Cambridge University Press, Cambridge, s. 62-86.
ENV Publications.
(ed.), Cambridge University Press, Cambridge, s. 141-154.
, “Cytological Methods for Detecting Chemical Mutagens”, in Chemical Mutagens, Principles and Methods for their Detection, Vol.
DEFINICE
Ishidate, M. Jr., T. Sofuni (1985), “The in vitro Chromosomal Aberration Test Using Chinese Hamster Lung (CHL) Fibroblast Cells in Culture” in Progress in Mutation Research, Vol.
Aneuploidie
5, Ashby, J. et al.
jakákoli odchylka od normálního diploidního (nebo haploidního) počtu chromozomů o jeden nebo více chromozomů, avšak nikoli o celou sadu (nebo více sad) chromozomů (polyploidie).
(eds.), Elsevier Science Publishers, Amsterdam-New York- Oxford, pp. 427-432.
Apoptóza
, “Improving dose selection and identification of aneugens in the in vitro chromosome aberration test by integration of flow cytometry-based methods”, Environmental and Molecular Mutagenesis, Vol.
programovaná buněčná smrt, která se vyznačuje řadou kroků vedoucích k rozpadu buněk na membránově vázané části, které jsou poté odstraněny fagocytózou nebo rozkladem.
49/4, pp. 318-327.
Buněčná proliferace
Chapter B.49 of this Annex: In Vitro Mammalian Cell Micronucleus Test.
zvyšování počtu buněk v důsledku jejich mitotického dělení.
, “A Safe Substitute for Polychlorinated Biphenyls as an Inducer of Metabolic Activation Systems”, in In Vitro Metabolic Activation in Mutagenesis Testing, de Serres, F.J. et al.
chemická substance nebo směs.
(eds.), Elsevier, North-Holland, pp. 85-88.
Chromatidový zlom
Available at: http://www.pops.int/.
přerušení jedné chromatidy, při kterém dojde k jasnému odchýlení jedné z chromatid.
McCooey (1982), “CHO/HGPRT Mutation Assay: Evaluation of Gases and Volatile Liquids”, in Genotoxic Effects of Airborne Agents, Tice, R.R., D.L.
Chromatidový gap
Costa, K.M.
oblast bez zabarvení (achromatická léze) jedné chromatidy, ve které existuje minimální přerušení chromatidy.
Schaich (eds.), Plenum, New York, pp. 91-103.
Chromatidová aberace
In: Statistical Evaluation of Mutagenicity Test Data, Kirkland, D.J.
strukturní poškození chromozómu v podobě zlomu jedné chromatidy nebo zlomu a opětného spojení chromatid.
(ed.)
Chromozómová aberace
Cambridge University Press, Cambridge, pp. 141-154.
strukturní poškození chromozómu v podobě zlomu nebo zlomu a spojení obou chromatid v tomtéž místě.
Available upon request.
Klastogen
Available at: https://federalregister.gov/a/2012-13774.
jakákoli chemická látka, která způsobuje strukturní chromozómové aberace v populacích buněk nebo eukaryotických organismů.
OECD (2014), “Statistical analysis supporting the revision of the genotoxicity Test Guidelines, OECD Environment, Health and Safety Publications (EHS)”, Series on Testing and Assessment, No. 198, OECD Publishing, Paris.
Koncentrace
, “Metaphase chromosome aberration assays in vitro”, in Basic Mutagenicity Tests: UKEMS Recommended Procedures, Kirkland, D.J.
odkazuje na konečné koncentrace zkoušené chemické látky v kultivačním médiu.
(ed.), Cambridge University Press, Cambridge, pp. 62-86.
Cytotoxicita
, “Analysis of Data from In Vitro Cytogenetic Assays”, in Statistical Evaluation of Mutagenicity Test Data, Kirkland, D.J.
Endoreduplikace
(ed.), Cambridge University Press, Cambridge, pp. 141-154.
proces, při kterém v jádře po S-fázi replikace DNA nedojde k mitóze, nýbrž následuje další S-fáze.
Appendix 1
Výsledkem jsou chromozómy se 4, 8, 16 … chromatidami.
DEFINITIONS
Genotoxický
Aneuploidy
obecný termín zahrnující všechny typy poškození DNA nebo chromozomů včetně jejich rozlámání, delecí, aduktů, modifikací a propojení nukleotidů, přestavby, genových mutací, chromozomových aberací a aneuploidie.
any deviation from the normal diploid (or haploid) number of chromosomes by a single chromosome or more than one, but not by entire set(s) of chromosomes (polyploidy).
Ne všechny druhy genotoxických účinků způsobují mutace nebo stálé poškození chromozomů.
Apoptosis
Mitotický index (MI)
programmed cell death characterised by a series of steps leading to a disintegration of cells into membrane-bound particles that are then eliminated by phagocytosis or by shedding.
podíl buněk, které se nacházejí v metafázi, z celkového počtu buněk v populaci; udává stupeň proliferace této populace.
Cell proliferation
Mitóza
increase in cell number as a result of mitotic cell division.
Mutagenní
Chromatid break
produkující dědičné změny sekvence (sekvencí) párů bází DNA v genech nebo struktury chromozomů (chromozomové aberace).
discontinuity of a single chromatid in which there is a clear misalignment of one of the chromatids.
Numerická aberace
Chromatid gap
odchylka počtu chromozómů od normálního počtu obvyklého u použitého typu buněk.
non-staining region (achromatic lesion) of a single chromatid in which there is minimal misalignment of the chromatid.
Polyploidie
Chromatid-type aberration
numerické chromozómové aberace v buňkách nebo organismech, které se týkají celé sady (celých sad) chromozómů, na rozdíl od jednoho chromozómu nebo jednotlivých chromozómů (aneuploidie).
structural chromosome damage expressed as breakage of single chromatids or breakage and reunion between chromatids.
Stav p53
Chromosome-type aberration
protein p53 se podílí na regulaci buněčného cyklu, apoptóze a reparaci DNA.
structural chromosome damage expressed as breakage, or breakage and reunion, of both chromatids at an identical site.
Buňky, jež mají nedostatek funkčního proteinu p53, nejsou schopny zastavovat buněčný cyklus nebo odstraňovat poškozené buňky prostřednictvím apoptózy nebo jiných mechanismů (např. indukcí reparace DNA) souvisejících s funkcemi p53 v reakci na poškození DNA, by teoreticky měly být náchylnější ke genové mutaci nebo chromozómovým aberacím.
Clastogen
Relativní nárůst počtu buněk (RICC)
any chemical which causes structural chromosomal aberrations in populations of cells or eukaryotic organisms.
zvýšení počtu buněk v chemicky ošetřených kulturách oproti zvýšení v neexponovaných kulturách, poměr vyjádřený v procentech.
Concentrations
Relativní zdvojnásobení populace (RPD)
refer to final concentrations of the test chemical in the culture medium.
zvýšení počtu pozorovaných zdvojnásobení populace v chemicky ošetřených kulturách oproti zvýšení v neexponovaných kulturách, poměr vyjádřený v procentech.
Cytotoxicity
S9 jaterní frakce
For the assays covered in this test method using cell lines, cytotoxicity is identified as a reduction in relative population doubling (RPD) or relative increase in cell count (RICC) of the treated cells as compared to the negative control (see paragraph 17 and Appendix 2).
supernatant homogenátu jater po odstředění při 9000 g, tj. surový jaterní extrakt.
For the assays covered in this test method using primary cultures of lymphocytes, cytotoxicity is identified as a reduction in mitotic index (MI) of the treated cells as compared to the negative control (see paragraph 18 and Appendix 2).
Směs S9
Endoreduplication
směs S9 jaterní frakce a kofaktorů nezbytných pro metabolickou aktivitu enzymů.
a process in which after an S period of DNA replication, the nucleus does not go into mitosis but starts another S period.
Kontrola s rozpouštědlem
The result is chromosomes with 4, 8, 16…, chromatids.
obecný termín k označení kontrolních kultur, ke kterým se přidává pouze rozpouštědlo používané k rozpuštění zkoušené chemické látky.
Genotoxic
Strukturní aberace
a general term encompassing all types of DNA or chromosome damage, including breaks, deletions, adducts, nucleotides modifications and linkages, rearrangements, gene mutations, chromosome aberrations, and aneuploidy.
mikroskopicky pozorovatelné změny struktury chromozómů při buněčném dělení ve stadiu metafáze; jeví se jako delece a fragmenty, intrachromozómální nebo interchromozómální změny.
Not all types of genotoxic effects result in mutations or stable chromosome damage.
Zkoušená chemická látka
Mitotic index (MI)
Neexponované kontroly
the ratio of cells in metaphase divided by the total number of cells observed in a population of cells; an indication of the degree of proliferation of that population.
kultury, které se neexponují (tj. ani chemické látce, ani rozpouštědlu), ale zpracovávají se souběžně stejným způsobem jako kultury, k nimž se se přidává zkoušená chemická látka.
Mitosis
Dodatek 2
division of the cell nucleus usually divided into prophase, prometaphase, metaphase, anaphase and telophase.
VZORCE PRO HODNOCENÍ CYTOTOXICITY
Mutagenic
Mitotický index (MI):
produces a heritable change of DNA base-pair sequences(s) in genes or of the structure of chromosomes (chromosome aberrations).
Počet mitotických buněk
Numerical aberration
Celkový počet vyšetřených buněk
a change in the number of chromosomes from the normal number characteristic of the cells utilised.
Doporučuje se použít relativní nárůst počtu buněk (RICC = Relative Increase in Cell Counts) nebo relativní zdvojnásobení populace (RPD = Relative Population Doubling), jelikož oba tyto ukazatele zohledňují poměr buněčné populace, která se rozdělila.
Polyploidy
Nárůst počtu buněk v exponovaných kulturáchkonečný-počáteční
numerical chromosomal aberrations in cells or organisms involving entire set(s) of chromosomes, as opposed to an individual chromosome or chromosomes (aneuploidy).
Nárůst počtu buněk v kontrolních kulturáchkonečný-počáteční
p53 status
Počet zdvojnásobení populace v exponovaných kulturách
p53 protein is involved in cell cycle regulation, apoptosis and DNA repair.
Počet zdvojnásobení populace v kontrolních kulturách
Cells deficient in functional p53 protein, unable to arrest cell cycle or to eliminate damaged cells via apoptosis or other mechanisms (e.g. induction of DNA repair) related to p53 functions in response to DNA damage, should be theoretically more prone to gene mutations or chromosomal aberrations.
kde:
Relative Increase in Cell Counts (RICC)
Zdvojnásobení populace = [log (počet buněk po ošetření ÷ počáteční počet buněk)] ÷ log 2
the increase in the number of cells in chemically-exposed cultures versus increase in non-treated cultures, a ratio expressed as a percentage.
Například hodnota 53 % RICC nebo RPD označuje 47 % cytotoxicity/cytostáze a 55 % cytotoxicity/cytostáze měřené pomocí MI znamená, že skutečný MI je 45 % kontroly.
Relative Population Doubling (RPD)
V každém případě by měl být změřen počet buněk před expozicí a počet buněk v exponované kultuře a v negativní kontrolní kultuře.
the increase in the number of population doublings in chemically-exposed cultures versus increase in non-treated cultures, a ratio expressed as a percentage.
V minulosti byl jako parametr cytotoxicity užíván RCC (tj. počet buněk v exponovaných kulturách / počet buněk v kontrolních kulturách), nyní se již nedoporučuje, protože může cytotoxicitu podhodnotit.
S9 liver fraction
V negativních kontrolních kulturách by mělo být zdvojnásobení populace slučitelné s požadavkem na odběr buněk po takové době od aplikace, která odpovídá 1,5násobku normální délky buněčného cyklu, a mitotický index by měl být natolik vyšší, aby se získal dostatečný počet buněk v mitóze a aby bylo možné spolehlivě vypočítat snížení o 50 %.
supernatant of liver homogenate after 9000 g centrifugation, i.e. raw liver extract.
V části B se kapitola B.11 nahrazuje tímto:
S9 mix
Zkouška na chromozómové aberace v buňkách kostní dřeně savců
mix of the S9 liver fraction and cofactors necessary for metabolic enzymes activity.
Tato zkušební metoda je rovnocenná Pokynu OECD pro zkoušení (TG) č. 475 (2016).
Solvent control
Zkouška na chromozómové aberace v buňkách kostní dřeně savců in vivo je zvláště významná k posouzení genotoxicity, neboť zde probíhá aktivní metabolismus in vivo, farmakokinetika a procesy reparace DNA, které přispívají k účinku testované látky, jakkoli mohou být různé u různých druhů.
General term to define the control cultures receiving the solvent alone used to dissolve the test chemical.
Zkouška in vivo je rovněž užitečná pro další výzkum genotoxicity zjištěné v systémech in vitro.
Structural aberration
Zkouška na chromozómové aberace u savců in vivo je používána pro detekci strukturních chromozómových aberací indukovaných zkoušenou chemickou látkou v buňkách kostní dřeně savců, obvykle hlodavců (2) (3) (4) (5).
a change in chromosome structure detectable by microscopic examination of the metaphase stage of cell division, observed as deletions and fragments, intrachanges or interchanges.
Rozlišují se dva typy strukturních aberací – chromozómové a chromatidové.
Test chemical
U většiny genotoxických chemických látek jsou indukované aberace chromatidového typu, avšak chromozómové aberace se rovněž vyskytují.
Untreated controls
Poškození chromozómů a související jevy jsou příčinou mnoha geneticky podmíněných chorob u člověka a existuje mnoho důkazů o tom, že pokud tyto léze a související jevy způsobují změny v onkogenech a v tumor-supresorových genech, mají podíl na indukci rakoviny u člověka a v experimentálních systémech.
cultures that receive no treatment (i.e. no test chemical nor solvent) but are processed concurrently in the same way as the cultures receiving the test chemical.
Při zkouškách na chromozómové aberace in vivo mohou vznikat polyploidie (včetně endoreduplikací).
Appendix 2
Z nárůstu polyploidie samotné však nevyplývá aneugenický potenciál a může prostě ukazovat na narušení buněčného cyklu nebo na cytotoxicitu.
FORMULAS FOR CYTOTOXICITY ASSESSMENT
Pro detekci aneuploidie in vivo a in vitro lze doporučit mikronukleus test v savčích erytrocytech in vivo (kapitola B.12 této přílohy) nebo zkoušku in vitro na přítomnost mikrojader v buňkách savců (kapitola B.49 této přílohy).
Mitotic index (MI):
Definice použitých termínů jsou uvedeny v dodatku 1.
Number of mitotic cells
Při této zkoušce jsou běžně používáni hlodavci, avšak v některých případech, je-li to vědecky zdůvodněno, mohou být vhodné i jiné druhy.
Total number of Cells scored
Cílovou tkání je v této zkoušce kostní dřeň, poněvadž je vysoce vaskularizovanou tkání a obsahuje populaci buněk s rychlým cyklem, které se snadno izolují a zpracovávají.
Relative Increase in Cell Counts (RICC) or Relative Population Doubling (RPD) is recommended, as both take into account the proportion of the cell population which has divided.
Vědecké zdůvodnění použití jiných druhů než potkanů a myší by mělo být uvedeno ve zprávě.
Increase in number of cells in treated culturesfinal-starting
Jsou-li použity jiné druhy než hlodavci, doporučuje se detekci chromozómových aberací v buňkách kostní dřeně začlenit do jiné vhodné zkoušky toxicity.
Increase in numbers of cells in control culturesfinal-starting
Jestliže existuje důkaz o tom, že se zkoušená chemická látka (chemické látky) nebo reaktivní metabolit (metabolity) nedostanou do cílové tkáně, není vhodné tuto zkoušku použít.
No.of Population doublings in treated cultures
PRINCIP ZKUŠEBNÍ METODY
No.of population doublings in control cultures
Zvířata se vhodným způsobem vystaví zkoušené chemické látce a ve vhodném okamžiku po expozici se humánně utratí.
where:
Před utracením se zvířatům podá látka zastavující metafázi (např. kolchicin nebo colcemid).
Population Doubling = [log (Post-treatment cell number ÷ Initial cell number)] ÷ log 2
Z buněk kostní dřeně se poté připraví preparáty chromozómů, obarví se a analyzují se chromozómové aberace buněk v metafázi.
For example, a RICC, or a RPD of 53 % indicates 47 % cytotoxicity/cytostasis and 55 % cytotoxicity/cytostasis measured by MI means that the actual MI is 45 % of control.
OVĚŘENÍ ODBORNÉ ZPŮSOBILOSTI LABORATOŘE
In any case, the number of cells before treatment should be measured and the same for treated and negative control cultures.
Experimenty pro ověření způsobilosti
While RCC (i.e. Number of cells in treated cultures/Number of cells in control cultures) had been used as cytotoxicity parameter in the past, is no longer recommended because it can underestimate cytotoxicity
Aby bylo možné před zahájením rutinního zkoušení zjistit, zda laboratoř má s danou zkouškou dostatečné zkušenosti, měla by prokázat schopnost reprodukovat očekávané výsledky z publikovaných údajů (např. (6)), pokud jde o četnost chromozómových aberací, nejméně se dvěma pozitivními kontrolními chemickými látkami (včetně slabých reakcí indukovaných nízkými dávkami u pozitivních kontrol), např. látkami uvedenými v tabulce 1, a s kontrolami s kompatibilním vehikulem/rozpouštědlem (viz odstavec 22).
In the negative control cultures, population doubling should be compatible with the requirement to sample cells after treatment at a time equivalent to about 1,5 normal cell cycle length and mitotic index should be higher enough to get a sufficient number of cells in mitosis and to reliably calculate a 50 % reduction.