natgillin/translations-raw huggingface dataset:
V každém vybraném chovném i produkčním hospodářství budou namátkově vybrány kotce, výběhy nebo skupiny chovných prasat starších 6 měsíců, u nichž se provede vzorkování.
In each selected breeding herd and production herd the pens, yards or groups of breeding pigs over six months of age to be sampled will be randomly selected.
Počet kotců, výběhů nebo skupin, u nichž se vzorkování provede, musí být rozvržen poměrně podle počtu chovných prasat v různých stupních produkce (březí, nebřezí a jiné kategorie chovných prasat).
The number of pens, yards, or groups to be sampled must be proportionally allocated according to the numbers of breeding pigs in the different stages of production (pregnant, non-pregnant, and other categories of breeding pigs).
Chovná prasata, která přibyla do stáda nedávno a jsou držena v karanténě, nebudou do průzkumů salmonel a MRSA zahrnuta.
Breeding pigs that have arrived recently to the herd and are held in quarantine shall not be included in the Salmonella and MRSA surveys.
Rozsah primárního odběru vzorků bude počet chovných hospodářství, u kterých se provede vzorkování, a počet produkčních hospodářství, u kterých se provede vzorkování, v každém členském státě a bude určen s přihlédnutím k následujícím kritériím za předpokladu jednoduchého namátkového vzorkování:
The primary sample size shall be the number of breeding holdings to be sampled and the number of production holdings to be sampled in each Member State and it shall be determined taking into account the following criteria, assuming simple random sampling:
celkový počet chovných hospodářství (chovná hospodářství, 1. část průzkumů salmonel a MRSA);
the total number of breeding holdings (breeding holdings, Part 1 of the Salmonella and MRSA surveys);
celkový počet produkčních hospodářství (produkční hospodářství, 2. část průzkumů salmonel a MRSA);
the total number of production holdings (production holdings, Part 2 of the Salmonella and MRSA surveys);
předpokládaný roční výskyt (p): 50 %;
annual expected prevalence (p): 50 %;
použití těchto hodnot a vzorce:
using these values and the formula:
Pro oba případy jsou hodnoty uvedené v bodech c) až e) stejné.
In each case, the assumptions in steps c-e above are the same.
Pro praktické účely, pokud existuje 100000 nebo více hospodářství buď v rámci odběru vzorků z chovných hospodářství, nebo v rámci odběru vzorků z produkčních hospodářství, může být tato populace považována za nekonečnou a počet hospodářství, která budou z onoho rámce odběru vzorků namátkově vybrána, bude 171 (viz tabulka 1).
For practical purposes, if there are 100000 or more holdings in either the breeding herds sampling frame or the production herds sampling frame then that population can be considered to be infinite and the number of holdings to be randomly selected from that sampling frame is 171 (see Table 1).
Pokud je počet chovných hospodářství nebo produkčních hospodářství nižší než 100000, použije se opravný koeficient pro konečnou populaci a vzorkování může být provedeno u nižšího počtu hospodářství, jak je uvedeno v tabulce 1.
Where the number of breeding herds or production herds is less than 100000 a finite population correction factor is applied and fewer holdings need to be sampled as shown in Table 1.
Počet hospodářství s chovnými prasaty, u kterých bude provedeno vzorkování v obou částech průzkumů salmonel a MRSA, v závislosti na konečné velikosti populace (celkový počet hospodářství s chovnými prasaty v členských státech)
Number of holdings with breeding pigs to sample in either part of the Salmonella and MRSA surveys as a function of the finite population size (total number of holdings with breeding pigs in the Member States)
Z důvodu očekávané míry nepoužitelnosti vzorků se může rozsah odběru vzorků zvýšit o 10 % v každé skupině.
Non-response shall be anticipated e.g. by increasing the sample size in each group by 10 %.
Jakékoli nevyhovující hospodářství bude v průběhu průzkumů salmonel a MRSA nahrazeno (viz bod 2.2.1).
Any unsuitable holding shall be replaced in the process of the Salmonella and MRSA surveys (see Section 2.2.1).
V případě, že není před začátkem průzkumu možné odhadnout počet „chovných hospodářství“, bude pro vzorkování vybrán počet hospodářství podle tabulky 1 na základě celkového počtu hospodářství s prasnicemi (X hospodářství).
In case an estimation of the number of ‘breeding holdings’ is not possible prior to the start of the survey, a number of holdings shall be selected for sampling as in Table 1 based on the total number of holdings with sows (X holdings).
V každém vybraném hospodářství budou odebrány vzorky z 10 namátkově vybraných kotců, výběhů nebo skupin chovných prasat.
In each selected holding samples shall be collected from 10 randomly chosen pens, yards, or groups of breeding pigs.
V případě nutnosti (např. v porodních kotcích, nebo pokud jsou prasnice chovány ve skupinách menších než 10 jedinců) může skupina zahrnovat více než jeden kotec.
If necessary (for example, in farrowing accommodation or where sows are kept in small groups of less than 10 individuals), a group can consist of more than one pen.
Každý běžný vzorek salmonel by měl pocházet od nejméně 10 jedinců chovných prasat.
At least 10 individual breeding pigs should contribute to each routine Salmonella sample.
Pokud je ovšem v malých hospodářstvích nebo v hospodářstvích s velkým počtem chovných prasat držených ve venkovních výbězích počet kotců, výběhů nebo skupin nižší než 10, vyžaduje se provést vzorkování téhož kotce, výběhu nebo skupiny tak, aby bylo předloženo 10 běžných vzorků salmonel.
However, where on smallholdings or holdings with large numbers of breeding pigs kept outdoors in paddocks, the number of pens, yards or groups is less than 10, sampling of the same pen, yard, or group shall be required so that a total of 10 routine Salmonella samples are submitted.
Část B: Odběr a vyšetření vzorků při průzkumu salmonel
Part B: Sample collection and analysis for the Salmonella survey
Odběr vzorků ve stádech
Sample collection in the herds
Typ a vlastnosti běžného vzorku
Type and detail of the routine sample
Jelikož každé hospodářství je jedinečné, bude před zahájením vzorkování rozhodnuto, z kterých kotců, výběhů nebo skupin v rámci hospodářství bude vzorek odebrán.
Since every holding is unique, it shall be decided, before starting the sampling, which pens, yards, or groups within the holding are sampled.
Odebraný vzorek bude uložen do zvláštní nádoby zabraňující křížové kontaminaci a bude odeslán do laboratoře.
The sample collected shall be placed in a separate container avoiding cross-contamination and sent to the laboratory.
Každý směsný vzorek bude mít celkovou hmotnost nejméně 25 g a pro shromáždění těchto směsných vzorků trusu mohou být použity dva postupy:
Each pooled sample shall total at least 25 g and two approaches may be employed to collect these pooled faeces samples:
To může být provedeno například tak, že tamponem bude pohybováno klikatě po dráze dvou metrů tak, aby byl dostatečně pokryt trusovým materiálem.
This may be achieved by for example, moving the swab along a 2-metre zig-zag path such that it is well coated with faecal material.
V případě nutnosti, např. v horkém počasí nebo na roštových podlahách, může být tampon zvlhčen vhodnou tekutinou, např. pitnou vodou.
If necessary, for example due to hot weather or on slatted flooring, then the swab may be moistened with an appropriate liquid such as drinking water.
Pokud není trus takto nahromaděn, např. na poli, ve velkém výběhu, v porodním přístřešku nebo v kotcích nebo v jiných zařízeních s malým počtem prasat ve skupině, pak může být odebráno malé množství z čerstvého trusu nebo míst pokrytých čerstvým trusem jednotlivě tak, aby celkový vzorek o objemu nejméně 25 g pocházel nejméně od 10 jedinců. Místa, ze kterých jsou tato malá množství odebírána, by měla být rozmístěna reprezentativním způsobem po celé ploše.
where there is no such accumulation, for example in a field, large yard, in a farrowing house, or pens or other accommodation with low numbers of pigs per group, then individual pinches shall be selected from individual fresh faecal masses or places so that a minimum of 10 individuals, contribute to a total sample volume of at least 25 g. The sites from which these pinches are collected should be distributed in a representative manner across the area concerned.
Dodatečné vzorkování pro zkoumání výskytu v rámci hospodářství
Additional sampling for the within-holding prevalence study
V těchto hospodářstvích bude odebráno 10 běžných vzorků způsobem popsaným výše (část A bod 2.1).
On these holdings 10 routine samples shall be collected in the same manner as described previously (Section 2.1 of Part A).
Navíc bude odebráno 10 individuálních vzorků o hmotnosti nejméně 30 g v každém vybraném kotci a budou označeny tak, že těchto 10 individuálních vzorků lze přiřadit k běžnému vzorku z tohoto kotce.
In addition, 10 individual samples of at least 30 g shall be collected in each selected pen and shall be identified in such a manner that these 10 individual samples can be associated with the routine sample from that pen.
Zpracování těchto vzorků je popsáno v bodě 2.3.1.
The processing of these samples is described in Section 2.3.1.
Toto vzorkování by mělo být provedeno v České republice, Dánsku, Rumunsku, Slovinsku, Švédsku a ve Spojeném království.
This sampling should be applied in Czech Republic, Denmark, Romania, Slovenia, Sweden and the United Kingdom.
Veškeré dostupné příslušné informace o vzorku musejí být zaznamenány do formuláře pro vzorkování, který vypracuje příslušný orgán za účelem splnění požadavků na údaje uvedených v části D.
All relevant information available from the sample shall be recorded on a sampling form produced by the competent authority to enable the data requirements in Part D to be fulfilled.
Vzorky se pokud možno udržují při teplotě + 2 až + 8 °C a během přepravy nesmí dojít k vnější kontaminaci.
Samples shall be preferably kept between + 2 and + 8 °C and free of external contamination during transportation.
Vzorky se odešlou do laboratoře co nejrychleji do 36 hodin jako expresní zásilka poštou nebo kurýrem a do laboratoře se dostanou nejpozději do 72 hodin po odběru vzorku.
The samples shall be sent to the laboratory as quick as possible within 36 hours by fast mail or courier and shall reach the laboratory no later than 72 hours after sampling.
Laboratorní a analytické metody
Laboratory analytical methods
V případě, že národní referenční laboratoř nemá kapacitu k provedení všech vyšetření nebo není laboratoří, která provádí detekci rutinně, mohou příslušné orgány rozhodnout o určení omezeného počtu jiných laboratoří, které se účastní úřední kontroly výskytu salmonel, aby vyšetření provedly.
Where the NRL does not have the capacity to perform all analyses or if it is not the laboratory that performs detection routinely, the competent authorities may decide to designate a limited number of other laboratories involved in official control of Salmonella to perform the analyses.
Tyto laboratoře by měly mít prokázané zkušenosti s používáním požadované metody detekce a systém zajištění kvality v souladu s normou ISO 17025 a měly by být pod dohledem národní referenční laboratoře.
These laboratories shall have proven experience of using the required detection method and have a quality assurance system complying with ISO 17025 and be submitted to the supervision of the NRL.
V laboratoři jsou běžné vzorky pečlivě a důkladně promíchány a pak se odebere 25 g na vyšetření.
In the laboratory, routine samples shall be mixed carefully and thoroughly, before 25 g is collected for analysis.
Pro vyhodnocení výskytu v rámci hospodářství podle bodu 1.2 musí být každý z individuálně odebraných vzorků (30 g) rozdělen na dvě části.
For evaluation of the within-holding prevalence in accordance with paragraph 1.2, each of the individual collected samples (30 g) needs to be divided into two parts.
Jedna část o hmotnosti nejméně 25 g je pečlivě a důkladně promíchána a následně kultivována samostatně.
One part, weighing at least 25 g shall be mixed carefully and thoroughly and subsequently cultured individually.
Tato příprava bude provedena tak, že smísením 10 × 2,5 g z individuálních vzorků vznikne jeden umělý směsný vzorek o hmotnosti 25 g. Umělé směsné vzorky jsou před vyšetřením pečlivě a důkladně promíchány.
This latter part shall be prepared by adding 10 times 2,5 g of the individual samples to create an artificially pooled sample of 25 g. The artificially pooled samples are mixed carefully and thoroughly before analysis.
Celkem bude vyšetřeno 10 běžných vzorků, 10 umělých směsných vzorků a 100 individuálních vzorků z každého z 10 hospodářství vybraných pro odhad výskytu v rámci hospodářství.
In total, 10 routine samples, 10 artificially pooled sample and 100 individual samples shall be analysed from each of the 10 holdings selected for the estimation of the within-holding prevalence.
Detekce salmonel
Detection of Salmonella
Použije se metoda doporučená referenční laboratoří Společenství pro salmonely v Bilthovenu v Nizozemsku.
The method recommended by the Community Reference Laboratory (CRL) for Salmonella in Bilthoven, the Netherlands, shall be used.
Sérotypizace salmonel
Serotyping of Salmonella
U všech izolovaných kmenů potvrzených jako Salmonella spp. se provede sérotypizace podle systému Kaufmann-White v národní referenční laboratoři pro salmonely.
All strains isolated and confirmed as Salmonella spp. shall be serotyped according to the Kaufmann-White scheme, by the NRL for Salmonella.
Pro zajištění kvality se 16 kmenů, u kterých lze stanovit sérotyp, a 16 izolátů, u kterých nelze stanovit sérotyp, zašle do referenční laboratoře Společenství pro salmonely.
For quality assurance, 16 typable strains and 16 non-typable isolates shall be sent to the CRL for Salmonella.
Poměrná část těchto izolátů bude referenční laboratoři Společenství zasílána čtvrtletně.
A proportion of these isolates shall be sent to the CRL on a quarterly basis.
Pokud se izolovalo méně kmenů, odešlou se všechny.
If fewer strains have been isolated, all shall be sent.
Fagotypizace salmonel
Phage typing of Salmonella
V případě, že jsou izoláty Salmonella enteritidis a Salmonella typhimurium podrobeny fagotypizaci (nepovinné), použijí se metody popsané referenčním centrem WHO pro fagotypizaci salmonel Agentury pro ochranu zdraví (Health Protection Agency – HPA) sídlící v Colindale v Londýně.
In case isolates of Salmonella Enteritidis and Salmonella Typhimurium are phage typed (optional), the methods described by the WHO reference centre for phage typing of Salmonella of the Health Protection Agency (HPA) Colindale, London, shall be used.
Část C: Odběr a vyšetření vzorků při průzkumu MRSA
Part C: Sample collection and analysis for the MRSA survey
Typ a vlastnosti vzorku
Type and detail of sample
Odebírá se pět vzorků prachu pomocí pěti suchých sterilních tamponů o velikosti zhruba 500 cm2 v pěti z deseti kotců vybraných pro vzorkování podle části A. Těchto 5 kotců se vybere tak, aby zahrnovaly chovná prasata v různých stupních produkce.
Five dust samples shall be gathered using five dry sterile swabs of about 500 cm2 each from five of the 10 pens selected for sampling under part A. These five pens shall be chosen in a way that breeding pigs in different production stages are included.
V každém kotci se provede stěr ze svrchních ploch jednotlivých přepážek.
For each pen dorsal surfaces of pen partition walls shall be swabbed.
Není-li k dispozici dostatečné množství prachu, odeberou se dodatečné vzorky z ventilace atd. Použitý tampon se uloží do sterilního plastového sáčku.
In case there is not enough dust present, then ventilator ducts etc. shall be sampled in addition. After use, the soiled swab shall be placed in a sterile plastic bag.
Během vzorkování je třeba zabránit tvorbě aerosolu v budově.
The creation of aerosol in the building shall be avoided during sampling.
Každý vzorek s příslušným formulářem pro vzorkování musí být označen jedinečným číslem, které se musí používat od odběru vzorku po vyšetření.
Each sample and its sample form shall be labelled with a unique number which shall be used from sampling to testing.
Příslušný orgán zajistí vydání a používání systému jedinečného číslování.
The competent authority shall arrange for the issue and use of a unique numbering system.
Vzorky se udržují při stálé teplotě + 2 až + 25 °C (pokojová teplota) a během jejich uchování a přepravy nesmí dojít k vnější kontaminaci.
Samples shall be kept at constant temperature between + 2 °C and 25 °C (room temperature) and free of external contamination during storage and transportation.
Vzorky se odešlou do laboratoře co nejrychleji a do laboratoře se dostanou nejpozději do 10 dnů po odběru vzorku.
The samples shall be sent to the laboratory as quickly as possible and reach the laboratory no later than 10 days after sampling.
Vyšetření a subtypizace MRSA se provádí v laboratořích s dostatečnými zkušenostmi.
Analysis and subtyping of MRSA shall take place in experienced laboratories.
Mělo by se pokud možno jednat o národní referenční laboratoře (NRL) pro Staphylococcus aureus a/nebo pro antimikrobiální rezistenci v členských státech.
This shall preferably be the National Reference Laboratories (NRL’s) for Staphylococcus aureus and/or antimicrobial resistance in the Member States.
V případě, že národní referenční laboratoř nemá dostatečnou kapacitu nebo zkušenosti pro provedení vyšetření nebo není laboratoří, která provádí detekci rutinně, rozhodne příslušný orgán o určení jiných laboratoří s dostatečnými zkušenostmi nebo národní referenční laboratoře v jiném členském státě za účelem provedení vyšetření.
In case the NRL does not have the capacity or experience to perform the analyses or if it is not the laboratory that performs detection routinely, the competent authority shall decide to designate other experienced laboratories or a NRL in another Member State to perform the analyses.
Tyto laboratoře by měly mít prokázané zkušenosti s používáním požadovaných metod a používat systém akreditace v souladu s normou ISO 17025.
These laboratories shall have proven experience of using the required methods and have an accreditation system in place according to ISO 17025.
Aktualizovaný seznam schválených laboratoří lze nalézt na internetových stránkách referenční laboratoře Společenství pro antimikrobiální rezistenci v Kodani v Dánsku.
An up-to-date list of authorised laboratories can be consulted on the website of the Community Reference Laboratory for antimicrobial resistance (CRL-AR) in Copenhagen, Denmark.
Vzorky, které jsou přijaty 10 dnů po jejich odběru, se vyřadí, s výjimkou případů, kdy lze zahájit bakteriologické vyšetření do 13 dnů po odběru.
Samples arriving 10 days after sampling shall be discarded unless bacteriological examination can be started within 13 days.
V laboratoři budou vzorky uchovány při stálé teplotě od 2 °C do 25 °C až do bakteriologického vyšetření, které musí být provedeno do 13 dnů po odběru vzorku.
At the laboratory, samples shall be kept at a constant temperature between + 2 °C and 25 °C until bacteriological examination, which shall be carried out within 13 days after sampling.
Selektivní obohacování
Selective enrichment
V laboratoři se všech pět tamponů s odebraným prachem ponoří do 100 ml Mueller-Hinton bujonu s obsahem 6,5 % NaCl a inkubují se při teplotě 37 °C po dobu 16 až 20 hodin. Jeden mililitr této kultury se poté naočkuje do 9 ml Trypton sojového bujonu + 3,5 mg/l cefoxitinu a 75 mg aztreonamu a inkubuje se při teplotě 37 °C dalších 16 až 20 hodin.
In the laboratory the five dust swabs shall be pooled in a 100 ml of Mueller-Hinton broth supplemented with 6,5 % NaCl and incubated at 37 °C for 16-20 h. One millilitre of this shall then be inoculated into 9 ml Tryptone Soy Broth + 3,5 mg/l cefoxitin and 75 mg aztreonam and shall be incubated for a further 16-20 h at 37 °C.
Obsah jedné očkovací kličky se poté nanese na chromogenní agar selektivní pro MRSA a inkubuje při teplotě 37 °C po dobu 24 až 48 hodin.
One loop-full of this shall then be spread onto a chromogenic agar selective for MRSA and incubated for 24-48 h at 37 °C.
Použije se specifický agar doporučený referenční laboratoří Společenství pro antimikrobiální rezistenci.
The specific agar recommended by the CRL-AR shall be used.
Tento agar je popsán na internetových stránkách referenční laboratoře Společenství pro antimikrobiální rezistenci.
This agar is described in the CRL-AR website.
Na základě morfologie a barvy kolonií se provede subkultivace nejvýše pěti kolonií, které poukazují na MRSA, na krevním agaru.
Based on colony morphology and colour, up to five colonies indicative for being MRSA shall be subcultivated on blood agar.
Podezřelé izoláty Staphylococcus aureus (S. aureus) se v této etapě buď uchovají za vhodných podmínek (– 80 °C) pro pozdější identifikaci a charakterizaci, nebo jsou zpracovány ihned.
Presumptive Staphylococcus aureus (S. aureus) shall at this stage either be stored under appropriate conditions (– 80 °C) for later identification and characterisation or processed immediately.
Identifikace MRSA
Identification of MRSA
Podezřelé izoláty S. aureus se identifikují jako S. aureus a MRSA metodou PCR.
Presumptive S. aureus shall be identified as S. aureus and MRSA by PCR.
Identifikace se provede za použití vícenásobné PCR se současnou identifikací mecA genu, nebo se uskuteční dvě různé PCR.
The identification shall be performed using a multiplex PCR with simultaneous identification of the mecA-gene or two different PCR shall be performed.
S cílem omezit objem práce se nejdříve identifikuje pouze jeden z pěti podezřelých izolátů S. aureus.
To limit the amount of work only one of the five presumptive S. aureus isolates shall initially be identified.
Je-li tento izolát identifikován jako MRSA, musí být uchován.
If this isolate is identified as MRSA, it shall be stored.
V případě, že je první izolát identifikován jako MRSA, nepožaduje se další vyšetření zbývajících čtyř izolátů, které tak mohou být vyřazeny.
No further testing of the remaining four isolates is required if the first isolate is identified as MRSA and they can be discarded.
Není-li první izolát identifikován jako MRSA, vyšetří se další z počátečních pěti izolátů.
If the first isolate is not identified as MRSA, the next of the initial five isolates shall be tested.
Tento proces pokračuje, dokud není identifikován jeden izolát MRSA nebo dokud není vyšetřeno všech pět izolátů.
This process shall continue until one MRSA has been identified or all five isolates have been tested.
Jinou možností je provést nejdříve identifikaci metodou PCR u skupiny všech pěti podezřelých kolonií ze vzorku.
Alternatively, identification by PCR as a first step can be done on a pool of the five presumptive colonies from a sample.
V případě pozitivní PCR se vyšetření opakuje u jednotlivých kolonií s cílem identifikovat pozitivní kolonii.
In case of a positive PCR, the analysis shall be repeated on individual colonies to identify a positive colony.
Pro zajištění kvality se 16 podezřelých izolátů S. aureus, které nebyly identifikovány jako MRSA, a 16 kmenů MRSA, jejichž vzorky byly odebrány v průběhu celého roku 2008, zašlou do referenční laboratoře Společenství pro antimikrobiální rezistenci.
For quality assurance, 16 presumptive S. aureus isolates which were not identified as MRSA, as well as 16 MRSA strains, sampled over the whole year 2008 shall be sent to the CRL-AR.
Poměrná část těchto izolátů bude referenční laboratoři Společenství pro antimikrobiální rezistenci zasílána čtvrtletně.
A proportion of these isolates shall be sent to the CRL-AR on a quarterly basis.
Pokud bylo identifikováno méně než 16 izolátů jako MRSA, odešlou se všechny tyto izoláty.
In case less than 16 isolates were verified as MRSA all these isolates shall be sent.
Subtypizace pro stanovení možné souvislosti s lidskými izoláty
Subtyping for possible link to human isolates
Pozitivní MRSA se vyšetří na stafylokoka typu A (typizace spa).
Positive MRSA’s shall be tested for Staphylococcus type A (Spa-typing).