natgillin/translations-raw huggingface dataset:
Současná definice HPAI umožňuje molekulární identifikaci faktorů virulence a potvrzuje použití molekulárních technik v diagnóze influenzy ptáků.
The current definition of HPAI, allows the molecular identification of virulence factors and confirms the use of molecular techniques in the diagnosis of AI.
V poslední době došlo k posunu v jejich aplikaci při odhalování a charakterizaci viru influenzy ptáků přímo z klinických vzorků odebraných z infikovaných ptáků.
Recently there have been developments in their application for detection and characterisation of AI virus directly from clinical specimens from infected birds.
Konvenční RT-PCR techniky u klinických vzorků by při správně definovaných primerech mohly vést k rychlé detekci a identifikaci podtypu (přinejmenším H5 a H7), a PCR amplicon produkt by se mohl použít při sekvencování nukleotidů – také se již prokázal význam jeho aplikace při rychlé identifikaci následných ohnisek, jakmile se odhalí primárně infikované prostory a virus je charakterizován.
Conventional RT-PCR techniques on clinical specimens could, with the correctly defined primers, result in rapid detection and subtype (at least of H5 and H7) identification, plus a PCR amplicon product that could be used for nucleotide sequencing and have been demonstrated to have an important application by rapidly identifying subsequent outbreaks once the primary infected premises has been detected and the virus characterised.
Test RT-PCR spočívající v jednom kroku a uskutečnitelný v „reálném čase“, při němž se používá systémů primeru/fluorogenní zkoušky (test rRT-PCR), umožňuje dokonce ještě rychlejší a citlivější diagnózu s detekcí virů influenzy ptáků a stanovením podtypů H5 nebo H7 v klinických vzorcích.
‘Real time’ single-step RT-PCR using primer/fluorogenic probe systems (rRT-PCR) allow even more rapid and sensitive diagnosis with detection of AI viruses and determination of subtype H5 or H7 in clinical samples.
Nemalým problémem je v případě systémů RT-PCR a rRT-PCR okolnost, že až dosud byly v různých laboratořích vyvinuty odlišné systémy, které přesto, že jsou zcela legitimní, nebyly validovány ani podrobeny testům s velkým počtem vzorků v různých laboratořích.
An important problem with RT-PCR and rRT-PCR systems is that, to date, different laboratories have developed different systems, which, although perfectly legitimate, have not been validated or subjected to tests with large numbers of samples in different laboratories.
Referenční laboratoř Společenství a specifikované národní referenční laboratoře tento problém řeší jako součást projektu financovaného Společenstvím (EU AVIFLU), sledujícího vypracování ratifikovaných protokolů pro konvenční testy RT-PCR a rRT-PCR, které by ostatní národní referenční laboratoře mohly přijmout.
The Community reference laboratory and specified national reference laboratories have been addressing this problem as part of an Community-funded project (EU AVIFLU) to produce ratified protocols for conventional RT-PCR and rRT-PCR that could be adopted by other national reference laboratories.
Jestliže se parametry testu, jako jsou doby cyklování a časového sledu, budou odchylovat od parametrů doporučených ve specifikovaných protokolech, musí se ještě před použitím v souladu s odstavcem 6 kapitoly I této diagnostické příručky prokázat, že jsou pro daný účel vhodné.
If test parameters, such as cycling and ramp times, are varied from those recommended in the specified protocols they must be demonstrated as fit for purpose prior to use in accordance with point 6 of Chapter I of this diagnostic manual.
Standardní protokoly pro tyto molekulární testy a jejich vyhodnocování, používané referenční laboratoří Společenství, jsou dostupné na této internetové stránce:
The standard protocols for those molecular tests and their evaluation as applied by the Community reference laboratory can be found on the following website:
http://www.defra.gov.uk/corporate/vla/science/science-viral-ai-reflab.htm.
http://www.defra.gov.uk/corporate/vla/science/science-viral-ai-reflab.htm
In vivo test patogenity a vyhodnocení výsledků
In vivo pathogenicity test and the evaluation of results
Virulenci virů influenzy typu A pro kuřata, izolovaných z ptáků, je třeba stanovit s použitím testu ukazatele intravenózní patogenity (IVPI), který se musí provést takto:
The virulence for chickens of influenza A viruses isolated from birds must be estimated using the intravenous pathogenicity index (IVPI) test which must be carried out as follows:
Čerstvě infikovaná alantoidní tekutina s HA titrem > 1/16 (> 24 nebo > log2 4, vyjádří-li se jako převrácená hodnota) z nejnižší dostupné úrovně pasáže, přednostně z původní izolace bez jakéhokoli výběru, je zředěna v poměru 1/10 ve sterilním izotonickém fyziologickém roztoku.
Fresh infective allantoic fluid with a HA titre >1/16 (>24 or >log2 4 when expressed as the reciprocal) from the lowest passage level available, preferably from the initial isolation without any selection is diluted 1/10 in sterile isotonic saline.
0,1 ml virové suspenze se nitrožilně podá deseti šestitýdenním SPF nebo SAN kuřatům.
0,1 ml of the diluted virus is injected intravenously into each of ten six-week-old SPF or SAN chickens.
Pokusná kuřata se kontrolují každých 24 hodin po dobu deseti dnů.
Birds are examined at 24-hour intervals for 10 days.
Při každé kontrole se každému kuřeti přidělí jedno z následujících skóre: 0 = normální, 1 = nemocné, 2 = vážně nemocné, 3 = mrtvé.
At each observation, each bird is scored 0 if normal, 1 if sick, 2 if severely sick, 3 if dead.
Označení kuřete za nemocné a vážně nemocné je subjektivním klinickým hodnocením.
The judgement of sick and severely sick birds is a subjective clinical assessment.
Za normálních okolností vykazují „nemocná“ kuřata jeden z následujících příznaků a „závažně nemocná“ kuřata více než jeden z následujících příznaků: postižení dýchacího ústrojí, otupělost, průjmy, cyanózu exponované kůže nebo lalůčku, edém obličejové části a/nebo hlavy, neurologické příznaky.
Normally, ‘sick’ birds show one of the following signs and ‘severely sick’ more than one of the following signs: respiratory involvement, depression, diarrhoea, cyanosis of the exposed skin or wattles, oedema of the face and/or head, nervous signs.
Mrtvým ptákům se musí přidělit skóre 3 při každém ze zbývajících každodenních pozorování po úhynu.
Dead birds must be scored as 3 at each of the remaining daily observations after death.
Z důvodů dobrých životních podmínek zvířat je třeba kuřata nemocná natolik, že nemohou přijímat potravu nebo vodu, šetrně utratit a při další kontrole je hodnotit jako mrtvá, protože bez zásahu uhynou do 24 hodin.
On welfare grounds when birds are too sick to eat or drink, they must be killed humanely and scored as dead at the next observation since they will die within 24 hours without intervention.
Tento přístup je pro akreditační orgány přijatelný.
This approach is acceptable to accreditation authorities.
IVPI je průměrné skóre na pokusné kuře a na jedno pozorování za období 10 dnů.
The IVPI is the mean score per bird per observation over the 10-day period.
Ukazatel 3,00 znamená, že všechna kuřata uhynula do 24 hodin, a ukazatel 0,00 zase vyjadřuje, že u žádného kuřete se v průběhu desetidenního pozorování neprojevily žádné klinické příznaky.
An index of 3,00 means that all birds died within 24 hours, and an index of 0,00 means that no bird showed any clinical sign during the 10-day observation period.
V níže uvedeném příkladu je znázorněna jednoduchá metoda evidence výsledků a výpočtu ukazatelů:
A simple method for recording results and calculating indices is shown in the following example:
Klinické příznaky
Clinical signs
Den po inokulaci
Day after inoculation
Nemocné
Sick
Vážně nemocné
Severely sick
Mrtvé
Dead
Celkem = 246
Total = 246
10 kuřat pozorováno po dobu deseti dnů = 100 pozorování
10 birds observed for 10 days = 100 observations
Ukazatel = průměrné skóre na pokusné kuře a na jedno pozorování = 246/100 = 2,46
Index = mean score per bird per observation = 246/100 = 2,46
Kterýkoli virus influenzy typu A bez ohledu na jeho podtyp, vykazující při testu IVPI hodnotu větší než 1,2, je považován za HPAI virus.
Any influenza A virus, regardless of subtype, giving a value of greater than 1,2 in an IVPI test is considered to be a HPAI virus.
Sérologické testy a vyhodnocení výsledků
Serological tests and evaluation of results
Při prokazování přítomnosti viru influenzy typu A se upřednostňuje metoda, která dokazuje, že nukleová kyselina a bílkovina nebo matrixové antigeny jsou společné všem virům influenzy typu A.
The preferred method used to show the presence of influenza A virus is to demonstrate the possession of the nucleoprotein or matrix antigens which are shared by all influenza A viruses.
Lze ji použít při dvojitých imunodifúzních testech, zahrnujících buď koncentrované virové suspenze nebo extrakty z infikovaných chorioalantoidních membrán.
It may be done in immunodoublediffusion tests involving either concentrated virus preparations or extracts from infected chorioallantoic membranes.
Upřednostňovanými metodami používanými při sérologických testech na protilátky viru influenzy ptáků jsou hemaglutinační test (HA) a hemaglutinačně inhibiční test (HI).
The preferred methods used for serological tests for AI virus antibodies are haemagglutination (HA) and haemagglutination inhibition (Hl) tests.
Kapitola 2.7.12 Příručky norem pro diagnostické testy a očkovací látky pro suchozemská zvířata Světové organizace pro zdraví zvířat (OIE) obsahuje podrobné informace o laboratorních technikách a hodnocení výsledků.
Chapter 2.7.12 of the Manual of Diagnostic Tests and Vaccines for Terrestrial Animals of the World Organisation for Animal Health (OIE) contains detailed information on the laboratory techniques and the evaluation of the results.
Standardní protokoly pro sérologické testy a hodnocení jejich výsledků, používané referenční laboratoří Společenství, jsou dostupné na této internetové stránce:
The standard protocols for serological tests and the evaluation of their results as applied by the Community reference laboratory can be found on the following website:
Monitorovací systémy spojené s očkováním
Monitoring systems associated with vaccination
Oddíly 2 a 3 kapitoly IX směrnice 2005/94/ES umožňují za určitých podmínek použití nouzového a preventivního očkování.
Sections 2 and 3 of Chapter IX, of Directive 2005/94/EC allow the use of emergency and preventive vaccination under certain conditions.
Jednou z těchto podmínek je, že se musí použít strategie DIVA (odlišení infikovaného zvířete od očkovaného).
One of those conditions is that a ‘DIVA’ (Differentiating Infected from Vaccinated Animals) strategy is employed.
Očkování se musí zaměřit na prevenci infekce a následného šíření viru mezi hejny.
Vaccination must be aimed at preventing the infection and subsequent spreading of virus between flocks.
Existuje nepopiratelný důkaz, že očkováním se zvyšuje množství viru potřebného k nakažení ptáků a naopak snižuje množství vylučovaného viru.
There is indisputable evidence to show vaccination increases the amount of virus needed to infect birds and decreases the amount of virus excreted.
Přestože očkovaní ptáci již dále nevykazují klinické příznaky, mohou při setkání s nákazou virus dále šířit.
However, although vaccinated birds do no longer develop clinical signs they can still spread virus when challenged.
HPAI viry podtypů H5 a H7 by mohly nepozorovaně po určitou dobu cirkulovat v hejnu se suboptimální imunitou stejným způsobem, jakým by mohly cirkulovat LPAI viry v neočkovaném hejnu.
Thus HPAI viruses of H5 and H7 subtypes could circulate unnoticed for some time in a flock with suboptimal levels of immunity in the same way that LPAI viruses could do in an unvaccinated flock.
Proto je nezbytné umět identifikovat očkovaná hejna pozitivní na virus, která se infikovala volně se vyskytujícím virem, aby se mohla zavést jiná kontrolní opatření, jako je například eradikace.
There is therefore a need to be able to identify virus positive vaccinated flocks that have become infected with field virus so that other control measures, such as stamping out, can be implemented.
Použití sentinelových ptáků pro monitorování infekce
Use of sentinels for monitoring infection
Na úrovni hejna je jednoduchou metodou pravidelné monitorování sentinelových ptáků ponechaných bez očkování v každém očkovaném hejnu, tento přístup však naráží na některé problémy s řízením, zejména při identifikaci sentinelových ptáků, obzvlášť ve velkých hejnech.
At the flock level, a simple method is to regularly monitor sentinel birds left unvaccinated in each vaccinated flock, but this approach does have some management problems, particularly in identifying the sentinels especially in large flocks.
Musí být zajištěn kontakt mezi sentinelovými a očkovanými ptáky.
The contact between the sentinels and the vaccinated birds must be ensured.
Laboratorní test DIVA pro účely monitorování infekce
DIVA laboratory test for monitoring infection
Alternativou nebo rozšířením testování na přirozenou expozici mohou být laboratorní testy DIVA prováděné u očkovaných ptáků.
As an alternative or in addition, testing for field exposure may be performed on the vaccinated birds itself by using DIVA laboratory tests.
V posledních letech bylo vyvinuto několik systémů testování, které rovněž umožňují detekci expozice očkovaných ptáků volně se vyskytujícímu viru.
Several test systems have been developed in recent years that also allow the detection of field challenge of vaccinated birds.
Jednou z metod, která se osvědčila jako proveditelná, je použití očkovací látky obsahující virus téhož podtypu hemaglutininu (H) jako u převažujícího volně se vyskytujícího viru, avšak s odlišnou neuraminidázou (N).
One method that has proved workable is the use of a vaccine containing a virus of the same haemagglutinin (H) subtype but a different neuraminidase (N) from the prevailing field virus.
Protilátky proti N volně se vyskytujícího viru sehrávají roli přirozených markerů infekce.
Antibodies to the N of the field virus act as natural markers of infection.
Tohoto systému se použilo v Itálii po znovuobjevení viru LPAI H7N1 v roce 2000.
That system was used in Italy following the re-emergence of a LPAI H7N1 virus in 2000.
Jako doplněk přímých opatření pro tlumení byla zavedena strategie DIVA s použitím očkovací látky obsahující H7N3 k potírání infekce volně se vyskytujícím virem H7N1.
In order to supplement direct control measures, a DIVA strategy was implemented using a vaccine containing H7N3 to combat an H7N1 field infection.
Očkovaní ptáci a ptáci exponovaní volně se vyskytujícímu viru se rozlišovali s použitím sérologického testu na detekci specifických anti-N1 protilátek.
Vaccinated and field exposed birds were differentiated using a serological test to detect specific anti-N1 antibodies.
Stejné strategie se použilo pro tlumení LPAI, vyvolané v Itálii v letech 2002–2003 virem H7N3, v tomto případě pomocí vakcíny obsahující H7N1 a sérologického testu detekujícího specificky protilátky proti N3.
The same strategy was used to control LPAI caused by H7N3 in Italy in 2002 to 2003, in this case with an H7N1 vaccine and a serological test detecting antibodies against N3 specifically.
V obou případech očkování spolu s vymýcením za použití této strategie DIVA mělo za následek eradikaci volně se vyskytujícího viru.
In both cases vaccination with stamping out using this DIVA strategy resulted in eradication of the field virus.
Problémy s tímto systémem nastanou v případě, že se objeví volně se vyskytující virus, který má stejný N antigen jako existující volně se vyskytující virus, avšak je jiného H podtypu než H5 nebo H7, anebo v případě, že podtypy se stejnými N antigeny již volně cirkulují.
Problems with that system arise if a field virus emerges that has the same N antigen as the existing field virus but are of another H subtype than H5 or H7 or if subtypes with the same N antigens are already circulating in the field.
Známými přenašeči více než jednoho podtypu jsou zejména kachny.
Particularly ducks are known to be carriers of more than one subtype.
Vyvstala rovněž potřeba vyvinout vhodný test, kterým by se umožnilo rutinní monitorování hejn na přítomnost protilátek proti neuraminidáze.
There was also a need to develop a suitable test that would allow the routine monitoring of flocks for anti-neuraminidase antibodies.
V Itálii byl vyvinut a používal se ad hoc sérologický test, založený na nepřímém testu fluorescenční protilátky, s použitím N proteinů exprimovaných rekombinanty baculoviru jako antigenu.
In Italy an ‘ad hoc’ serological test based on an indirect fluorescent antibody assay, using as an antigen N proteins expressed by baculovirus recombinants was developed and used.
V případě, že se vyvine ELISA test, může mít tento test širší a jednodušší použití.
That may have wider and easier application when an ELISA test is developed.
Použitím vakcín obsahujících pouze HA, jako jsou rekombinantní vektorové vakcíny, se umožňují klasické AGID nebo ELISA testy, založené na nukleové kyselině a proteinu, nestrukturálním proteinu nebo matrixových bílkovinách, pro odhalování infekce u očkovaných ptáků.
The use of vaccines containing only HA, such as recombinant vector vaccines, allows classical AGID tests or ELISA tests based on nucleoprotein, non-structural protein or matrix proteins to be used to detect infection in vaccinated birds.
Pokud jde o inaktivované vakcíny, je popsán test, kterým se odhalují protilátky proti nestrukturální virové bílkovině, tvořící se během přirozené infekce.
For inactivated vaccines, a test that detects antibodies to the non-structural virus protein that are only produced during natural infection has been described.
Takový systém se v praxi musí ještě validovat, je však omezen tím, že přirozená infekce hejna jakýmkoli chřipkovým virem vede bez ohledu na podtyp k tvorbě protilátek namířených proti nestrukturální bílkovině.
Such a system is yet to be validated in the field, but has the limitation that natural infection of a flock with any influenza virus, irrespective of subtype results in the production of antibodies directed against the non-structural protein.
Vývoj rychlých a citlivých metod k odhalování viru, zejména těch, které lze automatizovat, jako je test RT-PCR v reálném čase, dává tušit, že by se jich mohlo využít k jednoduchému širokému a pravidelnému testování očkovaných ptáků na přítomnost volně se vyskytujícího viru.
The development of rapid and sensitive virus-detection methods, especially those that can be automated, such as real time RT-PCR, means that these could be used for simple widespread and regular testing of vaccinated birds for the presence of field virus.
Detekce původce však bude v akutní fázi infekce velice omezena a nelze z ní odvodit, že hejno v minulosti nebylo viru exponováno.
Agent detection, however, will be limited to a short window in the acute phase of the infection and cannot be used to conclude that a flock was not exposed to the virus in the past.
Tento přístup je vhodnější pro testování očkovaných ptáků ještě před jejich pohybem, aby se prokázalo, že jsou prosti aktivní infekce.
This approach is most appropriate to the testing of vaccinated birds prior to movement to demonstrate freedom from active infection.
Počtem vzorků, které se mají testovat pomocí systémů volby, se musí umožnit, aby se v hejnu s 95 % úrovní spolehlivosti vyloučila prevalence infekce virem influenzy ptáků, přesahující 15 %.
The number of samples to be tested by the systems of choice must enable the exclusion of a prevalence of AI virus infection in a flock of more than 15 % with confidence level of 95 %.
Strategie diagnostiky influenzy ptáků
Strategies in the diagnosis of AI
Jak je uvedeno v příloze IV směrnice 2005/94/ES, rozhodnutí o použití opatření ve specifických oblastech nebo kontaktních hospodářstvích a závažnost těchto opatření se mohou velice lišit v závislosti na míře rizika.
As set out in Annex IV to Directive 2005/94/EC, decisions to apply measures in specific areas or contact holdings and the severity of those measures may vary greatly with the magnitude of the risk.
Obdobně i požadované diagnostické potvrzení nemoci musí být asi vyváženo podle převažující situace, velikosti nebezpečí a stupně rizika.
Similarly, the required diagnostic confirmation of disease is likely to be balanced against the prevailing situation, the magnitude of the hazard and the degree of risk.
Veterinární orgány musí přijímat taková rozhodnutí o diagnostickém důkazu, jež navozují určitou vyváženost mezi rychlým tlumením a eradikací nemoci na straně jedné a potenciálními dopady mylné diagnózy na straně druhé.
Veterinary authorities need to make decisions on diagnostic evidence that balance the rapid control and eradication of disease against the potential impact of misdiagnosis.
Taková rozhodnutí je třeba přijímat na pozadí řady faktorů až v daném okamžiku, určité situace však lze předvídat.
Such judgements have to be made against the background of many factors at the time, but certain situations can be predicted.
Stav onemocnění
Disease situation
Potenciální problém
Potential problem
Diagnostická kritéria
Diagnostic criteria
Žádné zvláštní příznaky, žádné oficiální podezření
Non specific signs, no official suspicion
Izolované hospodářství
Isolated holding
Provést rychlé odhalení na základě testu M genu RT-PCR.
Carry out rapid detection based on M gene RT-PCR.
Diferenciální diagnóza podle potřeby.
Differential diagnosis as required
Primární podezřelé ohnisko
Primary suspected outbreak
Provést úplné diagnostické testování, izolaci a charakterizaci viru.
Carry out full diagnostic testing, virus isolation and characterisation
Hospodářství v hustě osídlené drůbežářské oblasti
Holding in densely populated poultry area
Provést úplné diagnostické testování, izolaci a charakterizaci viru, zaměřit se však na metody rychlé detekce a charakterizace, zejména na ty, jež jsou založeny na testu RT-PCR a sekvencování [1].
Carry out full diagnostic testing, virus isolation and characterisation, but concentrate on rapid detection and characterisation methods especially those based on RT-PCR and sequencing [1].
Druhá a následná podezřelá ohniska
Second and subsequent suspected outbreaks
Izolovaná hospodářství, epidemiologicky propojená s primárním podezřelým ohniskem
Isolated holdings, epidemiologically linked to primary suspected outbreak
Zaměřit se na metody rychlého odhalení a charakterizace, zejména na ty, jež jsou založeny na testu RT-PCR a sekvencování [1].
Concentrate on rapid detection and characterisation methods especially those based on RT-PCR and sequencing [1].
Hospodářství v hustě osídlené drůbežářské oblasti nebo s mnoha epidemiologickými vazbami
Holdings in densely populated poultry area or with many epidemiological links
Spoléhat na metody rychlého odhalení, jež vedou k nejrychlejšímu průkazu přítomnosti kteréhokoli viru influenzy ptáků [1].
Rely on rapid detection methods that give the earliest evidence of the presence of any AI virus [1].
Vícenásobná podezřelá ohniska nebo rychle se šířící onemocnění včetně dozoru
Multiple suspected outbreaks or disease spreading rapidly including surveillance
Šíření bude bez rychlého zásahu nekontrolovatelné
Spread will become uncontrollable without rapid intervention
Spoléhat na metody rychlého odhalení, jež vedou k nejrychlejšímu průkazu přítomnosti kteréhokoli viru influenzy ptáků nebo spoléhat na klinické příznaky [1].
Rely on rapid detection methods that give the earliest evidence of the presence of any AI virus or rely on clinical signs [1].
Diagnóza infekce viry influenzy ptáků u prasat a ostatních savců
Diagnosis of infection with AI viruses in pigs and other mammals
Influenza ptáků u prasat
AI in pigs
Viry influenzy ptáků snadno infikují prasata a i když je jejich replikace ve většině případů relativně omezena, existuje pravděpodobnost přenosu nákazy z infikovaných prasat na drůbež a jiná vnímavá zvířata.
AI viruses readily infect pigs and although replication is in most cases relatively restricted, there is a potential that infected pigs could transmit the disease to poultry and other susceptible animals.