கேள்வி: நொதி இயக்கவியல் - நொதி மதிப்பீடுகள் பற்றி தகவல் சொல்.
பதில்: படிமம்:Enzyme progress curve.svg நொதி மதிப்பீடுகள் என்பது நொதி வினைகளின் விகிதத்தை மதிப்பிடும் பரிசோதனைக்கூட செயல்முறைகளாகும். நொதிகள் தாம் வினையூக்கப்படுத்தும் வினைகளால் நுகரப்படாததால், வினையின் விகிதத்தை அளவிடுவதற்கு நொதி மதிப்பீடுகள் வழக்கமாக அடி மூலக்கூறு அல்லது ஆக்கப்பொருட்களின் செறிவுகளில் ஏற்படும் மாற்றங்களைக் கண்காணிக்கின்றன. அளவிடுவதற்குப் பல்வேறு வழிமுறைகள் இருக்கின்றன. அலைமாலை ஒளிஅளவியல் மதிப்பீடுகள் ஆக்கப்பொருட்கள் மற்றும் வினைபொருட்களுக்கிடையில் ஏற்படும் ஒளியின் அகத்துறிஞ்சல்வலுவின் மாற்றத்தைக் கண்காணிக்கின்றன; கதிர் வீச்சளவியல் மதிப்பீடுகள், காலப்போக்கில் செய்யப்பட்ட ஆக்கப்பொருளை அளவிடுவதற்கான கதிரியக்கத்தின் சேர்க்கை அல்லது வெளியிடலை உட்படுத்தியிருக்கிறது. அலைமாலை ஒளிஅளவியல் மதிப்பீடுகள் தான் மிகவும் வசதியானவை ஏனெனில் வினையின் விகிதத்தைத் தொடர்ச்சியாக அளவிட அது அனுமதிக்கிறது. கதிர் வீச்சளவியல் மதிப்பீடுகளுக்கு மாதிரிகளை (அதாவது அவை தொடராத மதிப்பீடுகளாகும்) நீக்கவும் எண்ணவும் வேண்டிய தேவை இருந்தபோதிலும் அவை வழக்கமாக மிகவும் உணர்ச்சிமிக்கவை மற்றும் நொதி செயல்பாட்டின் மிகக் குறைந்த நிலைகளையே அளவிடமுடியும். அடி மூலக்கூறு ஒரு ஆக்கப்பொருளாக மாற்றம் செய்யும்போது நிலைபெற்ற ஓரிடத்தான்களின் சேர்க்கை அல்லது வெளியிடுதலைக் கண்காணிப்பதற்குச் செயலொத்த அணுகுமுறையாக இருப்பது பரவலான நிறமாலையியலைப் பயன்படுத்துவதாகும். தங்கள் வினைகளை வினையூக்கியாக்கும் ஒற்றை நொதி மூலக்கூற்றில் ஏற்படும் மாற்றங்களைக் கண்காணிப்பதற்கு மிகவும் உணர்ச்சிமிக்க நொதி மதிப்பீடுகள் ஒரு நுண் பெருக்கிக் கண்ணாடி மூலம் குவிமையப்படுத்தப்பட்ட சீரொளிகளைப் பயன்படுத்துகின்றன. வினையூக்கியின் போது ஏற்படும் அசைவுகளைத் தெரிவிப்பதற்காக இந்த அளவீடுகள் நொதியின் வினைபுரியும் இயக்கமுறையின் போது சார்புக்காரணிகளின் உடனொளிர்வு (fluorescence) களில் ஏற்படும் மாற்றங்களை அல்லது புரதம் குறிப்பிட்ட தலங்களில் சேர்க்கப்பட்டும் உடனொளிர்சாயங்களைப் பயன்படுத்துகின்றன. இந்த ஆய்வுகள், இயக்கவியல் மற்றும் ஒற்றை நொதியின் இயங்கியலைப் பற்றி ஒரு புதிய கண்ணோட்டத்தை வழங்குகிறது, இது பாரம்பரியமிக்க நொதி இயக்கவியலுக்கு எதிரானது, அங்கு மில்லியன் கணக்கிலான நொதி மூலக்கூற்று தொகைகளின் சராசரி நடத்தையைப் பற்றிக் கண்காணிக்கின்றன. நொதி மதிப்பீடுக்கான முன்னேற்ற வளைவின் ஒரு எடுத்துக்காட்டு மேலே காட்டப்பட்டுள்ளது. வினை தொடங்கிய பின்னர் ஒரு குறுகிய காலத்துக்குக் கிட்டத்தட்ட நேராக இருக்கும் துவக்க விகிதத்திலேயே நொதியானது ஆக்கப்பொருட்களைத் தயாரிக்கிறது. வினை தொடர்ந்திருக்க அடி மூலக்கூறு நுகரப்படும்போதே, விகிதாச்சாரம் தொடர்ச்சியாக குறைகிறது (அடி மூலக்கூறு இன்னமும் நிரம்புமட்டத்திலேயே இருக்கும் வரையில்). தொடக்க (மற்றும் பெருமதிப்பு) விகிதத்தை அளவிடுவதற்கு, மொத்த நிறைவேற்றலில் வினை வெறும் சில சதவிகிதமே முன்னேற்றம் கண்ட நிலையிலேயே நொதி மதிப்பீடுகள் மேற்கொள்ளப்படுகின்றன. தொடக்க விகித காலம், மதிப்பீடு நிலைமைகளைச் சார்ந்திருக்கிறது மற்றும் அவை கணப்பொழுதிலிருந்து பல மணிநேரங்கள் வரையில் நீட்டிக்கலாம். எனினும், திரவங்களை அதிவேகமாக கலப்பதற்கான சாதனங்கள், ஒரு வினாடிக்கும் குறைவான தொடக்க விகிதங்களின் மீது வேகமான இயக்கவியல் அளவீடுகளை அனுமதிக்கிறது. முன்னரே நிலையான நிலையில் இருக்கும் இயக்கவியலை அளவிடுவதற்கு இந்த மிக விரைவான மதிப்பீடுகள் அத்தியாவசமாக இருக்கிறது, இவை கீழே விவாதிக்கப்பட்டுள்ளது. பெரும்பாலான நொதி இயக்கவியல் ஆய்வுகள் இந்த ஆரம்பகட்ட, நொதி வினைகளின் தோராயமான நேரான பாகம் மீது கவனம் செலுத்துகிறது. எனினும், முழுமையான வினை வளைவை அளவிடுவதும் இந்தத் தரவை ஒரு நேரற்ற விகித சமன்பாட்டில் பொருத்துவதும் சாத்தியமானதே. நொதி வினையை இந்த வகையில் அளவிடுவதற்கு முன்னேற்ற-வளைவு பகுப்பாய்வு என்று பெயர். தொடக்க விகிதம் துல்லியமாக அளவிடப்படமுடியாமல் மிக விரைவாக இருக்கும்போது இந்த அணுகுமுறை விரைவு இயக்கவியலுக்கு ஒரு மாற்றாக மிகவும் பயனுடையதாக இருக்கும்.
கேள்வி: நொதி இயக்கவியல் - வினையூக்கிகளின் இயக்கமுறைகள் பற்றி விளக்கவும்.
பதில்: படிமம்:Activation2 updated.svg நொதி–அடி மூலக்கூறு இடைவினைக்கான பிரபல மாதிரியாக இருப்பது தூண்டிய பொருத்த மாதிரி. நொதி மற்றும் அடி மூலக்கூறுக்கிடையிலான ஆரம்பகட்ட இடைவினை ஒப்பீட்டளவில் மிகவும் பலவீனமாக இருப்பதாக இந்த உருமாதிரி பரிந்துரைக்கிறது, ஆனால் இந்தப் பலவீன இடைவினைகள் பிணைப்பைப் பலப்படுத்தும் நொதியில் இருக்கும் வெளிவடிவ அமைப்பு மாற்றங்களை விரைவிலேயே தூண்டிவிடுகின்றன. இந்த வெளிவடிவ அமைப்பு மாற்றங்கள், வினையால் மாற்றியமைக்கப்படும் அடி மூலக்கூறுகளில் இருக்கும் வேதியியல் பிணைப்புகளைச் செயல்படும் இடங்களில் இருக்கும் வினையூக்க எச்சங்களின் அருகிலும் கொண்டுவருகின்றன. வெளிவடிவ அமைப்பு மாற்றங்கள், வட்டமுறையிருநிறங்காட்டுந்தன்மை அல்லது இரட்டை முனைவாக்கம் தலையீட்டுமானியைப் பயன்படுத்தி அளவிடப்படலாம். பிணைப்பு ஏற்பட்ட பின்னர், வினைக்கு ஒரு மாற்று வேதியியல் வழிப்பாதையை வழங்குவதன் மூலம் வினையின் தன்மைமாறு நிலையின் ஆற்றலை வினையூக்கியின் ஒன்று அல்லது கூடுதல் இயக்கமுறைகள் குறைக்கின்றன. வினையூக்கியின் இயக்கமுறைகளில் உள்ளடங்குபவை, பிணைப்பு இறுக்கம் மூலமான வினையூக்கி; அண்மை மற்றும் திசை அமைவு மூலம்; வினைபுரி இடத்து புரோட்டான் வழங்கி அல்லது ஏற்பிகள் மூலம்; சகஇணைப்பு வினையூக்கிகள் மற்றும் குவாண்ட்டம் டன்னலிங் மூலமான வினையூக்கி. ஒரு நொதியால் எம்முறையிலான வினையூக்கி பயன்படுத்தப்படுகிறது என்பதை நொதி இயக்கவியலால் நிரூபிக்கமுடியாது. எனினும், சில இயக்கவியல் தரவுகள் இதர தொழில்நுட்பங்களால் ஆராயப்படும் இயலும்தன்மைகளைப் பரிந்துரைக்க முடியும். உதாரணத்திற்கு, வெடிப்பு-கட்டம் முன்னரே-நிலைத்த-நிலையிலான இயக்கவியலுடன் கூடிய பிங்-பாங் இயக்கமுறை இந்த நொதியின் இயக்கமுறையில் சகஇணைப்பு வினையூக்கி முக்கியமானதாக இருக்கலாம் என பரிந்துரைக்கக்கூடும். இதற்கு மாற்றாக, ''K'' m மீதல்லாமல் ''V'' max மீதான திடமான pH விளைவு கண்டறிதல், வினையூக்கி ஏற்படுவதற்கு வினைபுரி இடத்திலிருக்கும் எச்சம் ஒரு குறிப்பிட்ட அயனியாகும் நிலையில் இருக்கவேண்டும் என்பதைக் குறிக்கலாம்.