muhamparlak/turkish-law-bge-m3-embeddings huggingface dataset:
Danıştay — Esas No: 2023/3084, Karar No: 2024/4043, Tarih: 12.06.2024

DAVALI ... VERGİ DAİRESİ MÜDÜRLÜĞÜ'NÜN SAVUNMASI : 
Ar-Ge faaliyetlerine çok yüksek tutarlı ve hacimli vergisel teşvikler uygulandığı, teşvik kapsamına alınan Ar-Ge harcamalarının neler olduğu konusunda belirleme yapan Yönetmelikle, harcamaların kapsamının daraltılmadığı gibi aksine Ar-Ge faaliyetiyle bağı olan tüm harcamaların indirim kapsamına alındığı, Ar-Ge indiriminden faydalanma yönteminin kanun ve yönetmelikte aynı şekilde düzenlendiği, personel giderlerine yönelik gelir vergisi stopaj teşviki kapsamında, Ar-Ge personel ücretinin ne kadarlık kısmının Ar-Ge faaliyetine ve dolayısıyla Ar-Ge indirimine ilişkin olduğunun tespiti gerektiği, sözü edilen uygulamanın Ar-Ge faaliyetiyle bağlantısı olmaksızın haksız şekilde vergi matrahının aşındırılmasına izin verilmemesi için önem arz ettiği, 5746 sayılı Kanun'un 3. maddesinin ikinci fıkrasında; Ar-Ge merkezi dışında geçirilen ve stopaj teşviki kapsamında olan sürelere yer verildiği dolayısıyla dışarıda geçirilmesine rağmen bazı çalışma sürelerinin teşvik kapsamına alındığı, öte yandan 7244 sayılı Kanun ile de Ar-Ge merkezinde geçirilmemesine rağmen bazı çalışma sürelerinin teşvik kapsamına alındığı, diğer bir ifadeyle Yönetmelikte yer alan ve iptali istenilen ibareler sayesinde ''gelir vergisi stopaj teşviki'' kapsamında kabul edilen çalışma saatlerinin Ar-Ge indirimi kapsamına alınmasının davacının lehine bir durum olduğu, Yönetmelik hükümlerinin yanlış anlaşıldığı ve yorumlandığı, konuyla ilgili olarak davacı tarafından özelge talebinde bulunulmadığı gibi ihtirazi kayıtla verilen dilekçede de, dava dilekçesinde ileri sürülen hususların izâh edilmediği, dava dilekçesindeki ilâve Ar-Ge indirimiyle ilgili açıklamaların dava konusu olayla bağlantısız ve haksız olduğu savunulmuştur. 
DANIŞTAY	TETKİK	HÂKİMİ	: ...
DÜŞÜNCESİ	 : Ar-Ge indirimine konu edilecek personel harcamalarının, Ar-Ge merkezinde çalışan personelin Ar-Ge faaliyetiyle ilgili ücretlerinden oluştuğu, Ar-Ge faaliyetiyle ilgisi olmayan çalışma sürelerinin ise Ar-Ge harcaması olarak kurumlar vergisi indirimi kapsamında değerlendirilmesine hukuken imkân bulunmadığı, Yönetmelikte yer alan ''gelir vergisi stopajı teşviki'' ibaresi ile de Ar-Ge faaliyetine ilişkin olmak koşuluyla Ar-Ge merkezinde fiili olarak geçirilmeyen bazı sürelerin kapsama alınmasının ise davacının lehine bir durum olduğu dolayısıyla Yönetmelik hükmünün Kanun'un kapsamını daralttığı iddiasının yerinde olmadığı anlaşıldığından davanın reddi gerektiği düşünülmektedir.
DANIŞTAY	SAVCISI	: ...

DANIŞTAY	SAVCISI	: ...
DÜŞÜNCESİ	 : Uyuşmazlık, davacı şirket tarafından 2020 takvim yılı için ihtirazi kayıtla verilen kurumlar vergisi beyannamesi üzerinden tahakkuk ettirilen kurumlar vergisinin  7.424.583,35 TL tutarındaki kısmının ve 10/08/2016 tarih ve 29797 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan Araştırma Geliştirme ve Tasarım Faaliyetlerinin Desteklenmesine İlişkin Uygulama ve Denetim  Yönetmeliğinin "Ar-Ge yenilik ve tasarım harcamalarının kapsamı" başlıklı  7'nci  maddesinin "personel giderleri" başlıklı "c"  bendinin (1) işaretli alt bendinin ilk cümlesinde yer alan "...ve gelir stopajı teşviki uygulama kapsamında bulunan ..." ifadesi ile ikinci cümlesinde yer alan ""... ve Bakanlar Kurulunca belirlenen sınırlar dahilinde gelir stopajı teşviki kapsamında değerlendirilen..." ibaresinin iptali istemine ilişkin bulunmaktadır.
T.C. Anayasasının 73'üncü maddesinde yer verilen "vergilerin kanuniliği" ilkesi ile vergi, resim ve harçlar ve benzeri mali yükümlülüklerin ancak kanunla konulabileceği, dolayısıyla vergilere ilişkin düzenlemelerin gerek şekli ve gerek maddi anlamda kanunla yapılmasının zorunlu olduğu, dolayısıyla idarenin keyfi ve takdiri uygulamaları önlenerek bireyin hak ve özgürlüklerinin korunmasının sağlanması amaçlanmıştır. Öte yandan, Anayasanın 123'üncü maddesinde yer alan "idarenin kanuniliği" ilkesi nedeniyle idare, kuruluş ve görevleriyle bir bütün olup kanunla düzenlenir, kanunla kendisine verilmemiş hiçbir yetkiyi kullanamaz. Bir alanın kanunla düzenlenmiş olması, idarenin düzenleme yetkisini kullanabilmesinin ön koşuludur. Kanunla düzenlenmiş bir hususta normlar hiyerarşisi içerisinde üst norma aykırı olmayan ve uygulanmasına açıklık getiren yönetmelik, tebliğ ve genelgeler idarenin takdir yetkisinin objektifleştirilmesine hizmet eder. Dolayısıyla yürütülen kamu hizmetinin ve tesis edilen işlemlerin nesnelleştirilmesiyle ilgililerine hukuki güvence sağlayan yönetmeliklerin uygulanacağı tabiidir.

5746 sayılı Araştırma Geliştirme ve Tasarım Faaliyetlerinin Desteklenmesi Hakkında Kanunun "indirim, istisna, destek ve teşvik unsurları" başlıklı 3'üncü maddesinin 1'inci bendinde, teknoloji merkezi işletmelerinde, Ar-Ge merkezlerinde, kamu kurum ve kuruluşları ile kanunla kurulan veya teknoloji geliştirme projesi anlaşmaları kapsamında uluslararası kurumlardan ya da kamu kurum ve kuruluşlarından Ar-Ge projelerini desteklemek amacıyla fon veya kredi kullanan vakıflar tarafından veya uluslararası fonlarca desteklenen Ar-Ge ve yenilik projelerinde, rekabet öncesi işbirliği projelerinde ve teknogirişim sermaye desteklerinden yararlananlarca gerçekleştirilen Ar-Ge ve yenilik harcamalarının tamamı ile bu Kanun kapsamında yukarıda sayılan kurum ve kuruluşlar tarafından desteklenen tasarım projelerinde ve tasarım merkezlerinde gerçekleştirilen münhasıran tasarım harcamalarının tamamının 13/6/2006 tarihli ve 5520 sayılı Kurumlar Vergisi Kanununun 10'uncu maddesine göre kurum kazancının ve 31/12/1960 tarihli ve 193 sayılı Gelir Vergisi Kanununun 89' uncu maddesi uyarınca ticari kazancın tespitinde indirim konusu yapılacağı; Bakanlar Kurulunca belirlenen kriterleri haiz Ar-Ge merkezlerinde ayrıca o yıl yapılan Ar-Ge ve yenilik harcamalarının bir önceki yıla göre artışının yüzde ellisine kadarının, yukarıdaki esaslar dâhilinde indirim konusu yapılabilleceği; belirlenen kriterlere göre kanuni hadler içerisinde oranları ayrı ayrı veya birlikte farklılaştırmaya Bakanlar Kurulunun yetkili olduğu; ayrıca bu harcamaların, 4/1/1961 tarihli ve 213 sayılı Vergi Usul Kanununa göre aktifleştirilmek suretiyle amortisman yoluyla itfa edilleceği, bir iktisadi kıymet oluşmaması halinde ise doğrudan gider yazılacağı, kazancın yetersiz olması nedeniyle ilgili hesap döneminde indirim konusu yapılamayan tutarın, sonraki hesap dönemlerine devredileceği, devredilen tutarların, takip eden yıllarda 213 sayılı Kanuna göre her yıl belirlenen yeniden değerleme oranında artırılarak dikkate alınacağı kurala bağlanmıştır

. Aynı maddenin " Gelir  vergisi stopajı" başlıklı 2'nci bendinde, kamu personeli hariç olmak üzere teknoloji merkezi işletmelerinde, Ar-Ge merkezlerinde, kamu kurum ve kuruluşları ile kanunla kurulan veya teknoloji geliştirme projesi anlaşmaları kapsamında uluslararası kurumlardan ya da kamu kurum ve kuruluşlarından Ar-Ge projelerini desteklemek amacıyla fon veya kredi kullanan vakıflar tarafından veya uluslararası fonlarca desteklenen ya da TÜBİTAK tarafından yürütülen Ar-Ge ve yenilik projelerinde, teknogirişim sermaye desteklerinden yararlanan işletmelerde ve rekabet öncesi işbirliği projelerinde çalışan Ar-Ge ve destek personeli ile bu Kanun kapsamında yukarıda sayılan kurum ve kuruluşlar tarafından desteklenen tasarım projelerinde ve tasarım merkezlerinde çalışan tasarım ve destek personelinin; bu çalışmaları karşılığında elde ettikleri ücretleri üzerinden asgari geçim indirimi uygulandıktan sonra hesaplanan gelir vergisinin; doktoralı olanlar ile desteklenecek program alanlarından birinde en az yüksek lisans derecesine sahip olanlar için yüzde doksan beşi, yüksek lisanslı olanlar ile desteklenecek program alanlarından birinde lisans derecesine sahip olanlar için yüzde doksanı ve diğerleri için yüzde sekseni, verilecek muhtasar beyanname üzerinden tahakkuk eden vergiden indirilmek suretiyle terkin edileceği; hak kazanılmış hafta tatili ve yıllık ücretli izin süreleri ile 17/3/1981 tarihli ve 2429 sayılı Ulusal Bayram ve Genel Tatiller Hakkında Kanunda belirtilen tatil günlerine isabet eden ücretlerin de bu teşvik kapsamında olduğu, haftalık kırk beş saatin üzerindeki ve ek çalışma sürelerine ilişkin ücretlerin bu teşvikten faydalanamayacağı, Ar-Ge veya tasarım merkezlerinde çalışan Ar-Ge veya tasarım personelinin bu merkezlerde yürüttüğü projelerle doğrudan ilgili olmak şartıyla, proje kapsamındaki faaliyetlerin bir kısmının Ar-Ge veya tasarım merkezi dışında yürütülmesinin zorunlu olduğu durumlarda, Ar-Ge veya tasarım merkezi yönetiminin onayının alınması ve  Sanayi ve Teknoloji Bakanlığının bilgilendirilmesi kaydıyla, merkez dışındaki bu faaliyetlere ilişkin ücretlerin yüzde yüzünü aşmamak şartıyla Bakanlar Kurulunca ayrı ayrı veya birlikte belirlenecek kısmı ile Ar-Ge veya tasarım merkezlerinde çalışan Ar-Ge veya tasarım personelinin yüksek lisans yapanlar için bir buçuk yılı, doktora yapanlar için iki yılı geçmemek üzere merkez dışında geçirdiği sürelere ilişkin ücretlerin yüzde yüzünü aşmamak şartıyla Bakanlar Kurulunca  ayrı ayrı veya birlikte belirlenecek kısmının gelir vergisi stopajı teşviki kapsamında değerlendirileceği, aynı Yasanın 7'nci maddesinde ise bu Kanun hükümlerinin Bakanlar Kurulunca yürütüleceği hüküm altına alınmıştır.

5746 sayılı Kanun ile verilen yetkiye dayanılarak T.C. Bilim Sanayi ve Teknoloji  Bakanlığınca 10/08/2016  tarih ve 29797 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan Araştırma Geliştirme ve Tasarım Faaliyetlerinin Desteklenmesine İlişkin Uygulama ve Denetim Yönetmeliğinin "Ar-Ge, yenilik ve tasarım harcamalarının kapsamı"  başlıklı 7''nci maddesinin 1'inci bendinde, personel giderlerinin, Ar-Ge, yenilik veya tasarım faaliyetlerinin yürütülmesi amacıyla çalıştırılan Ar-Ge veya tasarım personeliyle ilgili olarak tahakkuk ettirilen ve gelir vergisi stopajı teşviki uygulaması kapsamında bulunan ücretler ile bu mahiyetteki giderler olduğu, Ar-Ge veya tasarım merkezleri alanı dışında geçirilen süreye isabet eden ve Bakanlar Kurulunca belirlenen sınırlar dâhilinde gelir vergisi stopajı teşviki kapsamında değerlendirilen ücretlerin de Ar-Ge ve tasarım indirimine konu edileceği düzenlenmiş ;Yönetmeliğin Ar-Ge ve tasarım indirimi uygulama esasları" başlıklı  8'inci maddesinin 1'inci bendinde, teknoloji merkezi işletmelerinde, Ar-Ge merkezlerinde, kamu kurum ve kuruluşları ile kanunla kurulan veya teknoloji geliştirme projesi anlaşmaları kapsamında uluslararası kurumlardan ya da kamu kurum ve kuruluşlarından Ar-Ge projelerini desteklemek amacıyla fon veya kredi kullanan vakıflar tarafından veya uluslararası fonlarca desteklenen Ar-Ge ve yenilik projelerinde, rekabet öncesi işbirliği projelerinde ve teknogirişim sermaye desteklerinden yararlananlarca gerçekleştirilen Ar-Ge ve yenilik harcamalarının tamamı ile Kanun kapsamında yukarıda sayılan kurum ve kuruluşlar tarafından desteklenen tasarım projelerinde ve tasarım merkezlerinde gerçekleştirilen münhasıran tasarım harcamalarının tamamının 13/6/2006 tarihli ve 5520 sayılı Kurumlar Vergisi Kanununun 10' uncu maddesine göre kurum kazancının ve 31/12/1960 tarihli ve 193 sayılı Gelir Vergisi Kanununun 89' uncu maddesi uyarınca ticari kazancın tespitinde indirim konusu yapılacağı; 2'nci bendinde, Bakanlar Kurulunca belirlenen kriterleri haiz Ar-Ge veya tasarım merkezlerinde ayrıca o yıl yapılan Ar-Ge ve yenilik veya tasarım harcamalarının bir önceki yıla göre artışının yüzde ellisine kadarının yukarıdaki esaslar dâhilinde indirim konusu yapılabileceği; 3'üncü bendinde ise, kazancın yetersiz olması nedeniyle ilgili hesap döneminde indirim konusu yapılamayan tutarın, sonraki hesap dönemlerine devredileceği, devredilen tutarların, takip eden yıllarda Vergi Usul Kanununa göre her yıl belirlenen yeniden değerleme oranında artırılarak dikkate alınacağı öngörülmüştür.

5746 sayılı Kanun ile Kanunun uygulama esaslarının gösterilmesi amacıyla yayımlanan Yönetmeliğin yukarıda yer verilen düzenlemelerinin incelenmesinden, Yönetmeliğin, 5746 Sayılı Kanunda çerçevesi çizilen kurallarda yer verilen esasların açıklamasına ilişkin düzenlemeler içerdiği, 7'nci  maddesinin "c" bendinin (1) işaretli alt bendinin ilk cümlesinde yer alan "...ve gelir stopajı teşviki uygulama kapsamında bulunan ..." ifadesi ile ikinci cümlesinde yer alan ""... ve Bakanlar Kurulunca belirlenen sınırlar dahilinde gelir stopajı teşviki kapsamında değerlendirilen..." ibaresinin Kanunda belirlenen esaslara  paralel biçimde açıklamalar içerdiği; davaya konu düzenleme hükümleri ile yararlanılması için gerekli koşulların Kanunla kurala bağlanan indirim ve teşvik uygulamasının özüne dokunulmadığı; Yasa hükümlerinde yer alan esasların daraltılması ya da teşvik ve indirim uygulaması ile ilgili kısıtlama getirildiğinden söz edilemeyeceği anlaşılmaktadır. Bu itibarla, Yönetmeliğin davaya konu yapılan kısımlarında üst hukuk normlarına  aykırılık görülmemiştir.
Öte yandan, davacı şirket adına, Yönetmeliğin davaya konu kısımlarının uygulanması ve ayrıca Covid 19 salgını nedeniyle personelin zorunlu olarak Ar-Ge Merkezi dışında geçirdiği sürelere isabet eden ücret ödemelerinin tümünün Yönetmelik hükümleri nedeniyle kurum kazancından indirilemediği, bu nedenle de Bakanlar Kurulu Kararında öngörülen yüzde elli oranındaki ilave kurumlar vergisi indiriminden faydalanılamadığı ihtirazi kaydıyla 2020 takvim yılı için verilen kurumlar vergisi beyannamesi üzerinden tahakkuk ettirilen kurumlar vergisinin 7.424.583,35 TL tutarındaki kısmının kaldırılması istenmektedir.

16/04/2020 tarih ve 31102 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan 7244 sayılı Yeni Koronavirüs (Covid 19) Salgınının Ekonomik Hayata Etkilerinin Azaltılması Hakkında Kanunun İle Bazı Kanunlarda Değişiklik Yapılmasına Dair Kanunun "Süre uzatımı, toplantı erteleme ve uzaktan çalışma" başlıklı 2'nci maddesinin (ğ) işaretli bendinde, 28/2/2008 tarihli ve 5746 sayılı Araştırma, Geliştirme ve Tasarım Faaliyetlerinin Desteklenmesi Hakkında Kanun kapsamında Ar-Ge ve tasarım merkezlerinde yürütülen faaliyetlerin Ar-Ge ve tasarım merkezleri dışında da yapılmasına; 11/3/2020 tarihinden itibaren 4 ay süreyle sınırlı olmak üzere, Sanayi ve Teknoloji Bakanı tarafından izin verilebileceği, bu sürenin, bitiminden itibaren Sanayi ve Teknoloji Bakanınca 3 aya kadar uzatılabileceği, izin verilmesi durumunda,Sanayi ve Teknoloji Bakanlığının bilgilendirilmesi kaydıyla, 5746 sayılı Kanun  kapsamındaki indirim, istisna, destek ve teşviklerden yararlanmaya devam edileceği kurala bağlanmıştır. Bu durumda, salgın nedeniyle  Ar-Ge ve tasarım merkezleri dışında geçirilen sürelerde de 7244 sayılı Kanunda kurala bağlanan koşullarda 5746 sayılı Kanun kapsamındaki indirim ve teşviklerden yararlanılacağı tabiidir. Davacı tarafından salgın sürecinde şirketin Ar-Ge harcamalarının, Yönetmelik hükümleri gereğince Ar-Ge personelinin gelir vergisi stopajı teşvikine tabi ücretleri ile ilişkilendirilmesinden dolayı kurumlar vergisi teşvikinden yararlanılamadığı ileri sürülmüş ise de, davacı şirketin gerek 5746 sayılı Kanun gerekse 7244 sayılı Kanunda öngörülen kurallar kapsamında indirim ve teşviklerden yararlanmasına engel bulunmadığı gibi,şirket tarafından 7244 sayılı Kanunda düzenlenen koşullara uyulup uyulmadığı, hangi sayıda personel için ve ne suretle gelir vergisi teşvikinden yararlanılamadığı somut olarak ortaya konulamadığı da görüldüğünden Yönetmeliğe yönelik soyut iddialarla davaya konu yapılan kurumlar vergisinde de hukuka aykırılık bulunmadığı sonucuna varılmıştır.
Açıklanan nedenlerle davanın reddine karar verilmesi gerektiği düşünülmüştür.	
TÜRK MİLLETİ ADINA
	Karar veren Danıştay Üçüncü Dairesince, Tetkik Hâkiminin açıklamaları dinlendikten ve dosyadaki belgeler incelendikten sonra gereği görüşüldü:
İNCELEME VE GEREKÇE:
	MADDİ OLAY:

Açıklanan nedenlerle davanın reddine karar verilmesi gerektiği düşünülmüştür.	
TÜRK MİLLETİ ADINA
	Karar veren Danıştay Üçüncü Dairesince, Tetkik Hâkiminin açıklamaları dinlendikten ve dosyadaki belgeler incelendikten sonra gereği görüşüldü:
İNCELEME VE GEREKÇE:
	MADDİ OLAY:
Davacı tarafından, 10/08/2016 tarih ve 29797 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan Araştırma Geliştirme ve Tasarım Faaliyetlerinin Desteklenmesine İlişkin Uygulama ve Denetim Yönetmeliğinin "Ar-Ge yenilik ve tasarım harcamalarının kapsamı" başlıklı 7. maddesinin "personel giderleri" başlıklı "c"  bendinin (1) işaretli alt bendinin ilk cümlesinde yer alan "...ve gelir stopajı teşviki uygulama kapsamında bulunan ..." ifadesi ile ikinci cümlesinde yer alan "... ve Cumhurbaşkanınca belirlenen sınırlar dahilinde gelir stopajı teşviki kapsamında değerlendirilen..." ibaresinin iptali istenilmiş ve 2020 yılına ait kurumlar vergisi beyannamesi; yürütülen araştırma ve geliştirme faaliyetlerine ilişkin olarak belirli düzenlemeler içeren, destek ve teşvikler öngören 5746 sayılı Araştırma, Geliştirme ve Tasarım Faaliyetlerinin Desteklenmesi Hakkında Kanun'un "İndirim, istisna, destek ve teşvik unsurları” başlıklı 3. maddesinin birinci fıkrası gereğince; Ar-Ge merkezi dışında geçen sürelere isabet eden personel ücret giderlerinin tamamının Ar-Ge harcaması olarak kurumlar vergisi indiriminde dikkate alınamadığı, ayrıca 2020 yılına ilişkin Ar-Ge harcama tutarının, sadece gelir vergisi stopaj teşviki uygulaması kapsamında bulunan ücretler dikkate alındığında, 2019 yılı Ar-Ge harcama tutarının altında kalması sebebiyle, fiili durumda Ar-Ge harcamaları bir önceki yıla göre artış göstermesine rağmen, Bakanlar Kurulu Kararı'nda yer alan yüzde elli oranındaki ilave kurumlar vergisi indiriminden faydalanılamadığı yolunda ihtirazi kayıtla verilmiştir.
İLGİLİ MEVZUAT:
2709 sayılı Türkiye Cumhuriyeti Anayasası'nın "Vergi Ödevi" başlıklı 73. maddesinin üçüncü fıkrasında "Vergi, resim, harç ve benzeri mali yükümlülükler kanunla konulur, değiştirilir veya kaldırılır." hükmüne yer verildikten sonra "Yönetmelikler" başlıklı 124. maddesinde "Cumhurbaşkanı, bakanlıklar ve kamu tüzelkişileri, kendi görev alanlarını ilgilendiren kanunların ve Cumhurbaşkanlığı kararnamelerinin uygulanmasını sağlamak üzere ve bunlara aykırı olmamak şartıyla, yönetmelikler çıkarabilirler." düzenlemesi hüküm altına alınmıştır.
2575 sayılı Danıştay Kanunu'nun "İlk derece mahkemesi olarak Danıştayda görülecek davalar" başlıklı 24. maddesinin birinci fıkrasının (c) bendinde, Bakanlıklar ile kamu kuruluşları veya kamu kurumu niteliğindeki meslek kuruluşlarınca çıkarılan ve ülke çapında uygulanacak düzenleyici işlemlere karşı açılacak iptal ve tam yargı davalarının ilk derece mahkemesi olarak Danıştay tarafından karara bağlanacağı kuralına yer verilmiştir.

12/03/2008 tarih ve 26814 sayılı Resmi Gazete'de yayımlanan 5746 sayılı Araştırma, Geliştirme Ve Tasarım Faaliyetlerinin Desteklenmesi Hakkında Kanun'un 3. maddesinde; ''Ar-Ge ve tasarım indirimi: Teknoloji merkezi işletmelerinde, Ar-Ge merkezlerinde, kamu kurum ve kuruluşları ile kanunla kurulan veya teknoloji geliştirme projesi anlaşmaları kapsamında uluslararası kurumlardan ya da kamu kurum ve kuruluşlarından Ar-Ge projelerini desteklemek amacıyla fon veya kredi kullanan vakıflar tarafından veya uluslararası fonlarca desteklenen Ar-Ge ve yenilik projelerinde, rekabet öncesi işbirliği projelerinde ve teknogirişim sermaye desteklerinden yararlananlarca gerçekleştirilen Ar-Ge ve yenilik harcamalarının tamamı ile bu Kanun kapsamında yukarıda sayılan kurum ve kuruluşlar tarafından desteklenen tasarım projelerinde ve tasarım merkezlerinde gerçekleştirilen münhasıran tasarım harcamalarının tamamı, 13/6/2006 tarihli ve 5520 sayılı Kurumlar Vergisi Kanunu'nun 10. maddesine göre kurum kazancının ve 31/12/1960 tarihli ve 193 sayılı Gelir Vergisi Kanunu'nun 89. maddesi uyarınca ticari kazancın tespitinde indirim konusu yapılır. Cumhurbaşkanınca belirlenen kriterleri haiz Ar-Ge merkezlerinde ayrıca o yıl yapılan Ar-Ge ve yenilik harcamalarının bir önceki yıla göre artışının yüzde ellisine kadarı; Cumhurbaşkanınca belirlenen kriterleri haiz tasarım merkezlerinde ayrıca o yıl yapılan tasarım harcamalarının bir önceki yıla göre artışının yüzde ellisine kadarı yukarıdaki esaslar dâhilinde indirim konusu yapılabilir.'', ikinci fıkrasında; ''Gelir vergisi stopajı teşviki: Kamu personeli hariç olmak üzere teknoloji merkezi işletmelerinde, Ar-Ge merkezlerinde, kamu kurum ve kuruluşları ile kanunla kurulan veya teknoloji geliştirme projesi anlaşmaları kapsamında uluslararası kurumlardan ya da kamu kurum ve kuruluşlarından Ar-Ge projelerini desteklemek amacıyla fon veya kredi kullanan vakıflar tarafından veya uluslararası fonlarca desteklenen ya da TÜBİTAK tarafından yürütülen Ar-Ge ve yenilik projelerinde, teknogirişim sermaye desteklerinden yararlanan işletmelerde ve rekabet öncesi işbirliği projelerinde çalışan Ar-Ge ve destek personeli ile bu Kanun kapsamında yukarıda sayılan kurum ve kuruluşlar tarafından desteklenen tasarım projelerinde ve tasarım merkezlerinde çalışan tasarım ve destek personelinin; bu çalışmaları karşılığında elde ettikleri ücretleri üzerinden asgari geçim indirimi uygulandıktan sonra hesaplanan gelir vergisinin; doktoralı olanlar ile desteklenecek program alanlarından birinde en az yüksek lisans derecesine sahip olanlar için yüzde doksan beşi, yüksek lisanslı olanlar ile desteklenecek program alanlarından birinde lisans derecesine sahip olanlar için yüzde doksanı ve diğerleri için yüzde sekseni, verilecek muhtasar beyanname üzerinden tahakkuk eden vergiden indirilmek suretiyle terkin edilir. ....

. ..... Ar-Ge veya tasarım merkezlerinde çalışan Ar-Ge veya tasarım personelinin bu merkezlerde yürüttüğü projelerle doğrudan ilgili olmak şartıyla, proje kapsamındaki faaliyetlerin bir kısmının Ar-Ge veya tasarım merkezi dışında yürütülmesinin zorunlu olduğu durumlarda, Ar-Ge veya tasarım merkezi yönetiminin onayının alınması ve Sanayi ve Teknoloji Bakanlığının bilgilendirilmesi kaydıyla, merkez dışındaki bu faaliyetlere ilişkin ücretlerin yüzde yüzünü aşmamak şartıyla Cumhurbaşkanınca ayrı ayrı veya birlikte belirlenecek kısmı ile Ar-Ge veya tasarım merkezlerinde çalışan Ar-Ge veya tasarım personelinin yüksek lisans yapanlar için bir buçuk yılı, doktora yapanlar için iki yılı geçmemek üzere merkez dışında geçirdiği sürelere ilişkin ücretlerin yüzde yüzünü aşmamak şartıyla Cumhurbaşkanınca ayrı ayrı veya birlikte belirlenecek kısmı gelir vergisi stopajı teşviki kapsamında değerlendirilir. Ayrıca ArGe veya tasarım merkezlerinde doktora mezunu personelin üniversitelerde Ar-Ge ve yenilik alanında ders vermesi veya Ar-Ge ve tasarım personelinin teknoloji geliştirme bölgelerinde bulunan girişimcilere mentorluk yapması durumunda haftalık 8 saati aşmamak şartıyla, bu çalışmaları gelir vergisi stopajı teşviki kapsamında değerlendirilir. Buna ilave olarak gelir vergisi stopajı teşviki kapsamında Ar-Ge veya tasarım merkezlerinde çalışan personelin toplam sayısının veya teşvike konu edilen toplam çalışma sürelerinin yüzde yirmisini aşmamak kaydıyla bu fıkrada belirtilen durumlar haricinde bu merkezler dışında geçirilen süreler de gelir vergisi stopajı teşviki kapsamında değerlendirilir. Cumhurbaşkanı, yüzde yirmi olarak belirlenen bu oranı belirleyeceği bölgesel ve/veya sektörel alanlarda ya da meslek gruplarına göre yüzde yüze kadar artırmaya veya tekrar kanuni oranına kadar indirmeye yetkilidir.'' kuralı düzenlenmiştir.