'''Trombin''' ([[EC broj|EC 3.4.21.5]], '''fibrinogenaza''', '''trombaza''',  ''trombofort'', ''trombin-C'', ''tropostazin'', ''aktivirani faktor zgrušavanja krvi II'', ''faktor zgrušavanja krvi IIa'', ''faktor IIa'', '''E-trombin''', '''beta-trombin''', '''gama-trombin''') jest [[serin-proteaza]], [[enzim]] koji je kod [[ljudi]] [[kodon|kodiran]] [[gen]]om '''F2''' sa [[hromosom 11|hromosoma 11]].<ref name="pmid3474786">{{cite journal | vauthors = Royle NJ, Irwin DM, Koschinsky ML, MacGillivray RT, Hamerton JL | title = Human genes encoding prothrombin and ceruloplasmin map to 11p11-q12 and 3q21-24, respectively | journal = Somatic Cell and Molecular Genetics | volume = 13 | issue = 3 | pages = 285–92 | date = maj 1987 | pmid = 3474786 | doi = 10.1007/BF01535211 | s2cid = 45686258 }}</ref><ref name="pmid2825773">{{cite journal | vauthors = Degen SJ, Davie EW | title = Nucleotide sequence of the gene for human prothrombin | journal = Biochemistry | volume = 26 | issue = 19 | pages = 6165–77 | date = septembar 1987 | pmid = 2825773 | doi = 10.1021/bi00393a033 }}</ref> '''Protrombin''' (faktor zgrušavanja II) se [[Proteoliza|proteolitski]] cijepa kako bi se formirao trombin u [[koagulacija|proces zgrušavanja]]. Trombin zauzvrat djeluje kao serinska [[proteaza]] koja pretvara rastvorljivi [[fibrinogen]] u netopive niti [[fibrin]]a, katalizirajući i mnoge druge reakcije povezane sa koagulacijom.
 
==Struktura==
[[slika:1nl2_opm.png|thumb|Sidrenje goveđeg protrombina na membranu kroz njegov [[Gla domen]].<ref name="pmid12923575">{{PDB|1nl2}}; {{cite journal | vauthors = Huang M, Rigby AC, Morelli X, Grant MA, Huang G, Furie B, Seaton B, Furie BC | title = Structural basis of membrane binding by Gla domains of vitamin K-dependent proteins | journal = Nature Structural Biology | volume = 10 | issue = 9 | pages = 751–6 | date = septembar 2003 | pmid = 12923575 | doi = 10.1038/nsb971 | s2cid = 7751100 }}</ref>]]
 
[[Molekulska težina]] protrombina je približno 72.000 [[jedinica atomske mase|Da]]. Katalitski domen se oslobađa iz protrombinskog fragmenta 1.2, kako bi se stvorio aktivni enzim trombin, koji ima molekulsku težinu od 36.000 Da. Strukturno, član je velikog [[PA-klan]]a [[proteaza]].
 
Protrombin se sastoji od četiri domena; [[N-kraj|N-terminal]] [[Gla domen]], dva Kringelova domen]]a i [[C-terminal]]ni [[tripsin]]u-sličan domen [[serin-proteaza]].
[[Faktor Xa]] sa [[faktor V|faktorom V]] kao kofaktorom dovodi do cijepanja Gla i dva Kringleova domena (formirajući zajedno fragment nazvan fragment 1.2) i ostavlja trombin, koji se sastoji isključivo od domen [[serin]]ske proteaze.<ref>{{cite journal | vauthors = Davie EW, Kulman JD | title = An overview of the structure and function of thrombin | journal = Seminars in Thrombosis and Hemostasis | volume = 32 Suppl 1 | pages = 3–15 | date = april 2006 | pmid = 16673262 | doi = 10.1055/s-2006-939550 }}</ref>
 
Kao što je slučaj sa svim [[serin-proteaza]]ma, [[protrombin]] se pretvara u aktivni trombin proteolizom unutrašnje [[peptidna veza|peptidne veze]], izlažući novi [[N-terminal]]ni Ile-NH3. Historijski model aktivacije serinskih proteaza uključuje inserciju ovog novoformiranog N-kraja teškog lanca u [[Beta barel|β-barelsko]] podsticanje ispravne konformacije katalitskih ostataka.<ref>{{Cite journal| vauthors = Huber R, Bode W |date=1. 3. 1978|title=Structural basis of the activation and action of trypsin|journal=Accounts of Chemical Research|volume=11|issue=3|pages=114–122|doi=10.1021/ar50123a006|issn=0001-4842}}</ref> Za razliku od [[kristalna struktura|kristalnih struktura]] aktivnog trombina, studije masene spektrometrije razmjene vodika i [[deuterij]]a pokazuju da se ovaj [[N-terminal]]ni Ile-NH3 ne ubacuje u β-barel u apo obliku trombina. Međutim, čini se da vezivanje aktivnog fragmenta [[trombomodulin]]a alosterno promoviše aktivnu konformaciju trombina insercijom ovog N-terminalnog regiona.<ref>{{cite journal | vauthors = Handley LD, Treuheit NA, Venkatesh VJ, Komives EA | title = Thrombomodulin Binding Selects the Catalytically Active Form of Thrombin | journal = Biochemistry | volume = 54 | issue = 43 | pages = 6650–8 | date = novembar 2015 | pmid = 26468766 | pmc = 4697735 | doi = 10.1021/acs.biochem.5b00825 }}</ref>
 
==Gen==
[[Gen]] za trombin (protrombin) nalazi se na  [[hromosom 11|hromosomu 11, regija p11-q12]].<ref name="pmid3474786"/>
 
Procjenjuje se da u svijetu postoji oko 30 ljudi kojima je dijagnosticiran urođeni oblik nedostatka faktora II,<ref name="pmid7792730">{{cite journal | vauthors = Degen SJ, McDowell SA, Sparks LM, Scharrer I | title = Prothrombin Frankfurt: a dysfunctional prothrombin characterized by substitution of Glu-466 by Ala | journal = Thrombosis and Haemostasis | volume = 73 | issue = 2 | pages = 203–9 | date = februar 1995 | pmid = 7792730 | doi =  10.1055/s-0038-1653751}}</ref> koji ne treba brkati sa mutacijom [[protrombin G20210A]], koja se također naziva mutacijom faktora II. Prothrombin G20210A je urođen.<ref name="pmid15262854">{{cite journal | vauthors = Varga EA, Moll S | title = Cardiology patient pages. Prothrombin 20210 mutation (factor II mutation) | journal = Circulation | volume = 110 | issue = 3 | pages = e15–8 | date = juli 2004 | pmid = 15262854 | doi = 10.1161/01.CIR.0000135582.53444.87 | doi-access = free }}</ref>
 
Protrombin G20210A obično nije praćen drugim mutacijama faktora (tj. najčešći je faktora V Leiden). Gen može biti naslijeđen [[heterozigot]]no (1 par), ili mnogo rjeđe, [[homozigot]]no (2 para), i nije povezan sa spolom ili [[krvna grupa|krvnom grupom]]. Homozigotne mutacije povećavaju rizik od tromboze više od heterozigotnih mutacija, ali relativno povećan rizik nije dobro dokumentiran. Ostali potencijalni rizici za [[tromboza|trombozu]], kao što su oralni kontraceptivi mogu biti dodatni. Prethodno prijavljeni odnos [[upalna bolest crijeva|upalne bolesti crijeva]] (tj. [[Crohnova bolest]] ili [[ulcerozni kolitis]]) i mutacije protrombina G20210A ili [[faktor V]] Leidenove mutacije je suprotstavljen istraživanjima.<ref>{{cite journal | vauthors = Bernstein CN, Sargent M, Vos HL, Rosendaal FR | title = Mutations in clotting factors and inflammatory bowel disease | url = https://archive.org/details/sim_american-journal-of-gastroenterology_2007-02_102_2/page/338 | journal = The American Journal of Gastroenterology | volume = 102 | issue = 2 | pages = 338–43 | date = februar 2007 | pmid = 17156138 | doi = 10.1111/j.1572-0241.2006.00974.x | s2cid = 19895315 }}</ref>
 
==Aminokiselinska sekvenca== 
Dužina [[polipeptid]]nog lanca je  622 [[aminokiseline]], a [[molekularna masa|molekulska težina]] 70.037 [[dalton (jedinica)|Da]].
{{legenda aminokiselina}} 
<table style="font-family:monospace;">
<tr style="text-align:right;"><th>10</th><th></th><th>20</th><th></th><th>30</th><th></th><th>40</th><th></th><th>50</th></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>MAHVRGLQLP</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>GCLALAALCS</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>LVHSQHVFLA</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>PQQARSLLQR</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>VRRANTFLEE</td></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>VRKGNLEREC</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>VEETCSYEEA</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>FEALESSTAT</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>DVFWAKYTAC</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>ETARTPRDKL</td></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>AACLEGNCAE</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>GLGTNYRGHV</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>NITRSGIECQ</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>LWRSRYPHKP</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>EINSTTHPGA</td></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>DLQENFCRNP</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>DSSTTGPWCY</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>TTDPTVRRQE</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>CSIPVCGQDQ</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>VTVAMTPRSE</td></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>GSSVNLSPPL</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>EQCVPDRGQQ</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>YQGRLAVTTH</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>GLPCLAWASA</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>QAKALSKHQD</td></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>FNSAVQLVEN</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>FCRNPDGDEE</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>GVWCYVAGKP</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>GDFGYCDLNY</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>CEEAVEEETG</td></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>DGLDEDSDRA</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>IEGRTATSEY</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>QTFFNPRTFG</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>SGEADCGLRP</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>LFEKKSLEDK</td></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>TERELLESYI</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>DGRIVEGSDA</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>EIGMSPWQVM</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>LFRKSPQELL</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>CGASLISDRW</td></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>VLTAAHCLLY</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>PPWDKNFTEN</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>DLLVRIGKHS</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>RTRYERNIEK</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>ISMLEKIYIH</td></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>PRYNWRENLD</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>RDIALMKLKK</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>PVAFSDYIHP</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>VCLPDRETAA</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>SLLQAGYKGR</td></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>VTGWGNLKET</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>WTANVGKGQP</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>SVLQVVNLPI</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>VERPVCKDST</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>RIRITDNMFC</td></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>AGYKPDEGKR</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>GDACEGDSGG</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>PFVMKSPFNN</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>RWYQMGIVSW</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>GEGCDRDGKY</td></tr>
<tr style="background-color: #eee;"><td>GFYTHVFRLK</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>KWIQKVIDQF</td><td style="background-color: #f9f9f9;"></td><td>GE</td></tr>
</table>