菜花所長出的位置大部分是在男性的龜頭、包皮、陰莖上，女性則是在大小陰唇部位；少部份會在男性的尿道及女性的陰道子宮頸，而經由口交或肛交傳染，也會長在口腔和肛門。發病時是在表皮長出一片扁平的突出物，若在陰濕的部分，如包皮內面，則可能長成一團很大的花狀物。
菜花傳染力強，潛伏期長，平均二至三個月，甚至長達半年，在初期可說是全無症狀，不痛、不癢、不潰爛、不分泌。