腸病毒適合在溼熱的環境中生長，台灣又位處亞熱帶，因此腸病毒在台灣的疫情通常在每年三月下旬開始出現，高峰期則落在五月底至六月，之後就會有慢慢降低的趨勢。然而隨著暑假的結束，九月份的開學又會掀起一波腸病毒的流行。