Taproot升級雖然為比特幣帶來了顯著的隱私性和可編程性提升，但也可能引入一些安全隱患和潛在風險。首先，Taproot的實施依賴於Schnorr簽名算法，雖然該算法在效率和隱私性上優於ECDSA，但其複雜性也可能成為潛在的攻擊面。特別是在多簽名和聚合簽名的情境下，若實現不當，可能導致簽名驗證的漏洞。
其次，Taproot的Merkelized Abstract Syntax Trees（MAST）功能雖然提高了腳本的靈活性，但也可能使得不熟悉該技術的開發者在編寫和驗證腳本時出現錯誤，從而引發安全問題。因此，社區需要持續關注Taproot的實施情況，並加強對開發者的教育和指導，以降低潛在的安全風險。
最後，隨著Taproot的廣泛應用，社區應該定期進行安全審計和代碼審查，以確保新協議和功能不會引入新的漏洞或攻擊向量。