除甲醛施工時間是根據單位面積的大小及污染物的嚴重情況去作決定。一般而言，小型500實呎單位，可於兩小時內完成除甲醛工程。但某些單位甲醛污染可能異常高於標準，六小時以上至通宵施工的亦有案例。如大型獨立屋更需要兩日一夜去處理。除甲醛公司會以「單位甲醛濃度達標」為準則，而決定適當的施工時間。