一般來說，自行申請由於申請者並非完全熟悉申請流程和中小企融資擔保計劃的重點，很多時在過程會遇上不少困難。而且由於申請者只向單一銀行申請融資，因此他們的利息住住比尋求融資顧問公司協助申請的融資計劃要高出很多。