擠奶器擠出來的乳汁需要適當的儲存和使用。儲存乳汁前應先洗净雙手和儲存容器，使用專用的乳汁儲存袋或容器標明日期和時間。乳汁可以儲存在冰箱或冷凍庫中但不建議將乳汁放在冰箱門的儲藏格，因為溫度變化較大。使用乳汁時應先用暖水或溫水浸泡儲存容器，不建議將乳汁用微波爐加熱以免破壞其中的營養成分。