變動必修課的幅度可大可小，一期計畫有些學系因應這樣的需求調整必修課的部分教學內容和方式，但課名與時間都沒有改變。因為學系核心知識(必修課)的學習與串接是本計畫的宗旨，也是新工程計畫的核心精神，不論是新開發的課程專題或是已開的選修實作課程，都是很好專業知能串聯的整合，鼓勵學系以各自教學資源與研究特色做考量來設計推動。不過，主題式課群內課程無法都是選修，也以此訂定徵件規格。