工商憑證是一個輔導公司更快進入電子化、並且節省時間、金錢的小工具，但並不是一定要申辦。但沒有工商憑證，意味著未來公司在申報營業稅申報的時候，必須自行追蹤所有廠商開給你的進項發票，而且除此之外，還要未來在申報公司營所稅時，要自已到國稅局去查調所得。 因此，簡單的說，工商憑證是一個讓企業大幅降低人力成本、同時降低稅務風險，還能證明公司網路身分的小工具。