肺炎球菌疫苗於2009年納入衛生署「香港兒童免疫接種計劃」，早年曾採用7價或10價結合疫苗。自2011年起，衛生署為本港未滿兩歲之嬰兒接種13價結合疫苗，在2、4和6個月分別接種3劑基礎針，1歲後再接種一劑加強劑。1歲或以上而從未接種肺炎球菌疫苗的兒童及成人，只需接種一劑。