服用排卵藥時，部分患者會出現乳房腫脹、腹脹、噁心嘔吐、熱潮紅等輕微副作用。另外，傳統排卵藥Clomid容易抑制子宮內膜厚度、減少子宮頸黏液等副作用，使胚胎不易著床，需配雌激素使用才能提高受孕率；Letrozole則沒有Clomid的副作用，唯此藥劑非健保給付之藥品。