只要是侵入性的手術都會有風險，子宮鏡手術屬低風險手術，併發症的發生率極低，但在子宮鏡手術前仍需由醫師評估個人身體狀況和病史，避免後遺症出現。子宮鏡手術後可能會發生的併發症或風險包括：
過敏反應
出血
感染
子宮壁穿孔
灌注液導致的電解質不平衡
水中毒
麻醉風險