過敏：有些人對食用燕窩過敏，金絲燕的唾液、金絲燕吃過的昆蟲、生活在巢中的蟎蟲以及巢的清潔方法都可能是過敏原的來源。此外，也有人會對燕窩的蛋白質過敏，第一次吃食最好注意一下是否有過敏反應。 癌症患者：因為燕窩中含有細胞分裂刺激因子，所以可能不適用於癌症患者，若為「表皮生長因子抑制劑」標靶治療之癌友，建議諮詢主治醫師，不要隨便食用燕窩。