水中有機污染物含量指標包含生化需氧量BOD、化學需氧量COD和總有機碳TOC，當水樣中鹽分或氯鹽含量偏高的時，BOD及COD之分析數均有困難，但TOC之分析則不受影響，其數據亦相對較可靠。