根據《傳染病防治法》，傳染病由中央主管機關衛福部依致死率、發生率及傳播速度等危害程度高低，區分為第一至第五類，而處置方方式也有所不同。
傳染病
通報時限
治療作為
第一類傳染病天花、鼠疫、嚴重急性呼吸道症候群（SARS）、狂犬病應於24小時內通報主管機關應於指定隔離治療的機構進行隔離治療第二類傳染病猴痘、登革熱、德國麻疹、白喉、傷寒等22種應於24小時內通報主管機關必要時得於指定隔離治療機構施行隔離治療第三類傳染病急性病毒性B型肝炎、破傷風、百日咳、破傷風、日本腦炎等20種應於一週內通報主管機關必要時得於指定隔離治療機構施行隔離治療第四類傳染病指前3類以外，經衛福部認有監視疫情發生或施行防治必要之「已知傳染病或症候群」，如水痘併發症、肉毒桿菌中毒等。若包含5月1日起從第五類調整為第四類的「嚴重特殊傳染性肺炎」，共有18種依中央主管機關公告依中央主管機關公告第五類傳染病指前4類以外，經衛福部認定其傳染流行可能對國民健康造成影響，有建立防治對策或準備計畫必要之「新興傳染病或症候群」。如新型A型流感、伊波拉病毒感染等7種依中央主管機關公告依中央主管機關公告