過敏性結膜炎主要是由過敏原或刺激物引發過敏反應所引起，常發生的部位在眼瞼與結膜，上面具有許多肥大細胞（Mast cell），當受到常見的過敏原例如：花粉、灰塵和黴菌，就會刺激肥大細胞上表面的免疫球蛋白E（IgE）引發後續一連串的免疫反應，會導致病人感受到眼睛搔癢難耐、眼瞼充血等過敏症狀。過敏性結膜炎主要可分為兩種大類型：
1.季節性過敏性結膜炎：這類型的過敏性結膜炎與季節性過敏有關，常發生在春季和夏季，少見在秋季。主因是接觸大自然的花粉、花草或其他空氣傳播的過敏原，接觸後引起急性的過敏反應，導致眼睛癢，結膜和眼皮等處也會出現水腫，因此引起過敏性結膜炎，一般多在一天內緩解。
2.常年性過敏性結膜炎：常年型全年持續存在，主要由動物皮屑、灰塵和黴菌孢子等室內過敏原所引起，有時隱形眼鏡也會導致，這類的過敏原大多長久存在，經年累月的慢性刺激因而導致過敏性結膜炎。病人多半會眼睛癢和異物感，檢查多半會有結膜充血或水腫，嚴重時結膜也會出現乳突狀凸起等較為嚴重的發炎反應
另外三種眼科疾病也是免疫相關引起的結膜問題，引起的問題更為嚴重：異位性角膜結膜炎、春季性過敏性角結膜炎和巨乳突結膜炎就有可能傷害角膜，引起較為嚴重的後遺症。過敏性結膜炎一般可以使用冰敷、人工淚液沖出過敏原，藥物或發炎物質來緩解過敏症狀。最核心的問題，仍是避免接觸過敏原。
★本文共同審稿醫師：林口長庚醫院角膜科研究醫師 潘立岩