一般來說，無論是13價還是23價疫苗，都是安全，不過有以下幾點要留意：由於接種3次或以上23價肺炎鏈球菌多醣疫苗的安全性仍未清楚，因此疫苗可預防疾病科學委員會不建議任何人接種合共多於兩劑的23價肺炎球菌多醣疫苗在許可的情況下，應在進行脾臟切除，植入人工耳蝸、癌症療程或其他會壓抑免疫功能的療程前4至6週完成肺炎球菌疫苗接種如在接種肺炎球菌疫苗後或對該疫苗的成份（包括抗原及蛋白載體）或賦形劑出現嚴重過敏反應，則不應再接種肺炎球菌疫苗肺炎球菌的威脅無時無刻都存在，為了健康著想，包括長者在內的高危人士，應及早打肺炎鏈球菌針，即可長遠又有效地預防肺炎球菌作惡。