衛福部為強化藥品穩定供應機制，成立跨部門「藥品供應通報處理中心」(網站：https://www.mohw.gov.tw/medicine)。
涵蓋西藥、中藥、罕見疾病藥品、兒童困難取得藥品、公費疫苗及傳染病用藥等供應，並整合5類用藥平台，包括食藥署「西藥供應資訊平台」、中醫藥司「中藥供應資訊平台」、醫事司「兒童困難取得之臨床必要藥品及醫材管理資訊系統」、國民健康署「罕見疾病特殊營養食品暨緊急需用藥物物流中心」及疾病管制署「公費疫苗及傳染病用藥之供應」。
除了中藥平台仍在測試力拼4月底前上線，西藥、罕病藥品、罕病特殊營養品和公費疫苗及傳染病用藥等平台已於4月11日正式上線。
民眾買不到藥品或業者如果發現可能有缺藥問題，可至通報平台查詢並回報，平台將進行案件查核，釐清是否真的缺藥，或者有可替代藥品。一旦確認有缺藥品項，也會向藥商徵求，並公告徵得藥商的聯絡方式以及供藥現況。
平台運行模式除了評估處理既有藥品通報短缺案件，也強化研擬防缺藥政策，例如推動國產學名藥政策，以提前預防藥品短缺；強化跨部門資料整合及主動監測，以早期發現缺藥事件；針對涉及跨司署之藥品短缺情事，透過跨部門合作處理，以穩定藥品供應。