三塊厝車站的地名源於明鄭時期於此開墾的王、鄭、蔡「三」個家族，早期聚落臨靠三塊厝溪而發展形成。1907年，縱貫鐵道鳳山支線開通後，隔年在三塊厝設置簡易招呼站開始營運，成為鳳山、屏東一帶物資人員進出高雄港的水陸樞紐。