在水中，二氧化氯被用于去除不愉快的味道和气味，以及杀灭能产生不良味道和气味的藻类和细菌。它也可用于一些个人卫生产品。例如，二氧化氯可以用在漱口水和牙科制品中，作为氧化杀菌剂化合物来治疗口腔异味。