將不確定性引入BMLP可以通過概率邏輯程式設計來實現，這樣可以更好地模擬代謝過程中的隨機性。具體來說，可以在BMLP的基礎上，為每個代謝反應引入概率分佈，這些分佈可以反映反應的發生概率或反應速率的變化。這樣的設計使得每個反應的結果不再是確定性的，而是根據其概率進行隨機抽樣。
例如，可以使用概率邏輯程式設計來定義每個反應的發生概率，並在BMLP的計算過程中考慮這些概率。這樣，當進行代謝網絡的模擬時，BMLP可以生成多個可能的結果，從而捕捉到代謝過程中的隨機性和不確定性。這種方法不僅提高了模型的靈活性，還能更真實地反映生物系統的複雜性，幫助研究人員更好地理解和預測代謝過程的行為。