只有約5%的患者在幹細胞注射后出現副作用。 副作用通常很小，注射后立即出現。 副作用可能包括頭痛、發燒、噁心、頭暈、嘔吐、腿部疼痛或背痛。 副作用是暫時的，在大多數情況下會迅速消失。 重要的是要注意，在大多數情況下，副作用不是由幹細胞引起的，而是由鞘內注射程式本身引起的。