除了理論上的複雜性分析，設計更有效的啟發式算法來解決實際的 MFD 問題是非常重要的。啟發式算法可以基於問題的特定結構或特性來進行優化，例如使用貪婪算法來逐步選擇最有利的路徑，或是利用局部搜索技術來改進已有的解。此外，元啟發式算法如遺傳算法、模擬退火或粒子群優化等也可以應用於 MFD 問題，這些方法能夠在大規模實例中找到近似最優解。這些啟發式算法不僅能夠提高計算效率，還能在實際應用中提供可行的解決方案，特別是在面對複雜的流網絡時。