Khi thu hoạch, quả gấc phải được xếp vào trong sọt. Dưới đáy sọt thì cứ một lớp quả lại để một lớp rơm rạ. Điều này nhằm mục đích giữ cho quả gấc không bị vỡ bẹp, có thể vận chuyển đi đường xa. Nơi bảo quản gấc cần phải khô ráo, thoáng mát, tránh ánh nắng trực tiếp. Không nên bảo quản gấc trong tủ lạnh vì nhiệt độ thấp có thể làm gấc nhanh hỏng hơn.