Yếu tố đầu tiên là do cơ địa. Những người có nồng độ melanin trong cơ thể cao, sẽ dễ bị mụn thâm hơn người bình thường. Một nguyên nhân cũng không kém phần quan trọng đó chính là việc trên da tiết ra lượng dầu dư thừa lớn. Việc này khiến lỗ chân lông người dùng dễ bị tắc nghẽn, tạo điều kiện thuận lợi hình thành các ổ mụn, và là môi trường hoàn hảo để vết thâm mụn xuất hiện.