Nguyên nhânchính xác dẫn đến hình thành hạch tuyến giáp chưa được xác định. Tuy nhiên, có những yếu tố nguy cơ có thể làm tăng khả năng phát triển các hạch tuyến giáp: Phơi nhiễm với xạ trị, đặc biệt là ở vùng đầu và cổ, có thể làm phát triển hạch tuyến giáp. Các yếu tố nguy cơ khác bao gồm tiền sử gia đình bị hạch tuyến giáp, giới tính (nữ giới dễ mắc ung thư tuyến giáp hơn nam giới) và chế độ ăn ít i-ốt. Một số rối loạn tuyến giáp do viêm, bao gồm bướu giáp (phì đại tuyến giáp), suy giáp (tuyến giáp hoạt động kém) và viêm tuyến giáp Hashimoto (các bệnh tự miễn gây ra suy giáp), có thể dẫn đến hình thành hạch tuyến giáp.