Cấu trúc bậc 2 của protein có hai dạng chính là alpha helix và beta sheet.
Cả alpha helix và beta sheet đều là những dạng cấu trúc bậc 2 phổ biến trong các protein và đóng vai trò quan trọng trong tạo ra một số tính chất của protein, bao gồm tính chất cơ học, tính chất vận chuyển, và tính chất hoạt động sinh học.