Hiện tại bệnh viện Quốc tế Mỹ có 5 chuyên khoa mũi nhọn gồm: Khoa Phụ Sản, Khoa Nhi, Khoa Ngoại tổng quát, Khoa Thận Niệu & Nam Khoa, và Khoa Tiêu hóa – Gan mật.