Khí hậu thành phố Sa Đéc cũng được chia làm hai mùa, mùa mưa và mùa khô. Mùa mưa kéo dài từ tháng 5 đến tháng 11 âm lịch, đây là thời điểm sen nở, và các loài cây trái, hoa quả đua nhau khoe sắc, trĩu quả cho vụ mùa bội thu. Đồng thời, đây cũng là dịp để du khách tìm đến tham quan, khám phá rất lý tưởng.