Bệnh kiết lỵ không điều trị kịp thời có thể dẫn đến những biến chứng nghiêm trọng như: thủng ruột, lồng ruột, viêm ruột thừa do amip, xuất huyết tiêu hóa,… Thậm chí, bệnh nhân kiết lỵ có thể bị tử vong, đặc biệt là trẻ nhỏ, người già trên 50 tuổi.