Nguyên tắc quản lý hoạt động quá cảnh hàng hóa được quy định tại Điều 45 Luật Quản lý ngoại thương năm 2017: Hàng hóa quá cảnh khi xuất khẩu đều phải là hàng hóa nhập khẩu. Tổ chức, cá nhân nước ngoài kinh doanh dịch vụ giao nhận hàng hóa hoặc tự mình quá cảnh hàng hóa qua lãnh thổ Việt Nam hoặc lôi kéo thương nhân nước ngoài quá cảnh hàng hóa qua lãnh thổ Việt Nam đều được phép thực hiện. Phù hợp với quy định của pháp luật thương mại và điều ước quốc tế mà Cộng hòa xã hội chủ nghĩa Việt Nam là thành viên; Phải tuân thủ pháp luật xuất nhập cảnh, giao thông, vận chuyển của Việt Nam. Việc quá cảnh hàng hóa bằng đường hàng không được thực hiện theo quy định của điều ước quốc tế về hàng không mà Cộng hòa xã hội chủ nghĩa Việt Nam là thành viên. Hàng hóa quá cảnh lãnh thổ Việt Nam phải chịu sự giám sát hải quan trong suốt thời gian quá cảnh, xuất nhập cảnh theo cửa khẩu quy định. Hàng hóa quá cảnh khi tiêu thụ trong nước phải tuân thủ các quy định về quản lý xuất khẩu, nhập khẩu hàng hóa của Luật Quản lý ngoại thương năm 2017 và các quy định khác của pháp luật có liên quan.