- Tên gọi này xuất phát từ đặc điểm địa hình của chùa. Gò đất nơi chùa tọa lạc cao hơn so với khu vực xung quanh, tạo nên một địa thế thoáng đãng, mát mẻ. Xung quanh gò đất này, người dân thường trồng các loại cây dây leo, trong đó có nhiều dây kén. Dây kén là một loại cây thân leo, có hoa màu trắng, khi nở thành những chùm kén trắng tinh.
- Với đặc điểm địa hình và cảnh quan xung quanh, chùa Gò Kén trở thành một địa điểm tâm linh nổi tiếng ở Tây Ninh. Tên gọi Gò Kén cũng dần dần trở thành tên gọi quen thuộc và chính thức của chùa.