Sử dụng thuốc kháng sinh liều cao và kéo dài có thể tiêu diệt cả vi khuẩn lành tính có sẵn trong đường ruột từ đó gây ra tình trạng loạn khuẩn. Lúc này, loạn khuẩn sẽ thúc đẩy vi khuẩn có hại có sẵn trong đường ruột phát triển mạnh hơn, khiến trẻ bị tiêu chảy hoặc viêm ruột do kháng sinh.