Chi phí thực hiện thủ tục hợp thửa đất (trong trường hợp không được miễn) không có một mức cố định mà phụ thuộc vào từng địa phương và từng thời điểm, phụ thuộc vào giá trị chuyển nhượng,... Nhưng nói chung lại, người thực hiện thủ tục hợp thửa đất phải thanh toán các loại phí sau: Lệ phí chứng nhận đăng ký biến động về đất đai; Lệ phí cấp đổi, cấp lại, xác nhận bổ sung vào giấy chứng nhận: đối với loại phí này thì chi phí đối với trường hợp cấp giấy chứng nhận chỉ có quyền sử dụng đất và trường hợp cấp giấy chứng nhận quyền sử dụng đất, quyền sở hữu nhà ở và tài sản gắn liền với đất là khác nhau; Phí thẩm định hồ sơ cấp Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất, quyền sở hữu nhà ở và tài sản khác gắn liền với đất. T