Thực vật dưới nước cung cấp oxy, thức ăn và nơi ở cho các loài động vật dưới nước. Ngoài ra sức khỏe của thảm thực vật dưới nước là một chỉ số môi trường quan trọng đánh giá sức khỏe tổng thể của đại dương và cửa sông. Ví dụ, cỏ biển trong các vịnh và đầm phá, rất quan trọng đối với môi trường sống của các loài cá và động vật không xương sống nhỏ.