Là tỉnh ven biển Nam Trung Bộ, Phú Yên mang kiểu khí hậu nhiệt đới gió mùa, đặc trưng là thời tiết nóng ẩm và chia làm 2 mùa nắng - mưa rõ rệt. Mùa nắng Phú Yên kéo dài từ tháng 1 đến tháng 8, chiếm 3/4 khoảng thời gian trong năm.