Nguồn nước giếng khoan là nước ngầm chảy trong các mạch nước dưới lòng đất, chính vì thế khi nước chảy qua các lớp đất đá có xu hướng ngậm những chất có trong đất đá tại tầng đất đó, chính vì thế nước giếng khoan hay bị tình trang nhiêm sắt, mangan có trong đất.