Theo Điều 5 Thông tư 40/2021/TT-BTC có quy định phương pháp kê khai áp dụng trong trường hợp hộ kinh doanh cá nhân kinh doanh quy mô lớn; và hộ kinh doanh, cá nhân kinh doanh có quy mô nhỏ nhưng lựa chọn nộp thuế theo phương pháp kê khai.
Theo điểm b khoản 3 của Điều 13 trong Thông tư 40/2021/TT-BTC, nếu hộ kinh doanh khoán bắt đầu hoạt động mới (bao gồm cả hộ chuyển từ kê khai sang khoán), chuyển từ khoán sang kê khai, hoặc thay đổi ngành nghề, hoặc quy mô trong cùng một năm, hạn chót để nộp hồ sơ khai thuế là trước ngày thứ 10 từ thời điểm bắt đầu kinh doanh, hoặc chuyển đổi phương pháp tính thuế, hoặc thay đổi ngành nghề, hoặc quy mô kinh doanh.
Dựa vào quy định này, hộ kinh doanh có quyền chọn lựa giữa việc nộp thuế theo kê khai hoặc khoán. Tuy nhiên, nếu hộ kinh doanh đạt tiêu chí là quy mô lớn, họ phải áp dụng phương pháp kê khai để nộp thuế.