Các biến chứng do thủ thuật gây ra có thể gặp:
- Chảy máu trong do chọc vào các mạch máu lớn trong ổ bụng, do làm tổn thương buồng trứng
- Nhiễm trùng do chọc hút vào ruột, đại tràng
- Chảy máu bàng quang do kim chọc vào bàng quang.
- Khi mẹ được kê đơn thuốc để kích buồng trứng, đôi khi có thể gặp hội chứng quá kích buồng trứng (OHSS) là một biến chứng của điều trị kích thích buồng trứng và của khởi động phóng noãn.