Những bất lợi của tiếp thị liên kết là bạn không kiểm soát được chương trình. Bạn không kiểm soát sự cạnh tranh của mình. Bạn không thể thiết lập cơ sở khách hàng của mình. Không có sự đảm bảo về doanh thu và công việc tự do không phải dành cho tất cả mọi người. Nhược điểm của tiếp thị liên kết là có thể chiếm đoạt các liên kết và cũng có cách tiếp cận số lượng hơn là tiếp thị chất lượng, có nghĩa là bạn chỉ đang cố gắng bán được nhiều thứ nhất có thể thay vì dành thời gian cho từng khách hàng.