Các bệnh mà bèo Nhật Bản hay mắc phải đó là: bệnh đốm trắng ở lá, mục thối rữa lá nhỏ. .. Có khá nhiều nguyên nhân làm cho cây bèo nhiễm bệnh. Có thể là trong nước đã bị ô nhiễm một số loại vi khuẩn truyền bệnh cũng như là vì cây thiếu ánh sáng. Nếu khi mắc phải tình trạng trên do quá trình trồng chăm sóc bèo các bạn nên thử thay nước hoặc cung cấp thêm ánh sáng vào bể thuỷ sinh.