AES được cá nhân, tổ chức sử dụng để bảo vệ những dữ liệu ở trạng thái nghỉ (dữ liệu lưu trữ trong kho). Ứng dụng của AES có thể kể đến như: tự mã hóa ổ đĩa, mã hóa lưu trữ, mã hóa cơ sở dữ liệu. Trong khi đó RSA lại được ứng dụng để kết nối các website trong các trình duyệt và nhiều lĩnh vực khác.
Một điểm khác biệt nữa đó là trong khi AES sử dụng key riêng tư thì RSA lại dùng key công khai. Bên cạnh đó hiệu suất hoạt động của RSA chậm hơn so với AES. Vì thế giải pháp tốt nhất để bảo vệ việc truyền dữ liệu từ ở khoảng cách xa đó là kết hợp cả mã hóa RSA với AES.