Do đặc thù Blockchain và tiền mã hóa không có lưu trữ trung tâm, số dư tiền mã hoá có thể bị mất sạch nếu như một người không may quên mất khoá riêng của mình. Tính ẩn danh của các giao dịch tiền mã hoá làm cho chúng được sử dụng trong hoạt động bất chính như rửa tiền và trốn thuế. Nhiều loại tiền mã hoá coi trọng đến tính riêng tư như Dash, ZCash hoặc Monero, khiến chúng rất khó để truy tìm dấu vết các giao dịch. Vì giá được xác định theo cung cầu, tỉ giá mà một loại tiền mã hoá được trao đổi với một loại tiền tệ khác có thể biến động rất mạnh. Ngoài ra, mối lo ngại lớn là giá trị của tiền mã hoá không được đảm bảo bởi bất kì hàng hóa vật chất nào.