Chó Appenzeller có thể bị dị ứng với nhiều thứ khác nhau, bao gồm thức ăn, phấn hoa, bụi nhà, côn trùng và sản phẩm hóa học. Để giảm thiểu nguy cơ chó bị dị ứng, bạn nên cung cấp cho chó một chế độ ăn uống lành mạnh, giữ nhà cửa sạch sẽ, vệ sinh thường xuyên và tránh sử dụng các sản phẩm hóa học.