Lưu trữ cục bộ bảo mật hơn, nhưng nó cũng có những khuyết điểm. Khi bạn đồng bộ hóa mật khẩu cục bộ, dữ liệu của bạn sẽ không bao giờ thực sự rời khỏi thiết bị của bạn — nhưng điều này cũng gây khó khăn (hoặc ít nhất là bất tiện) trong việc đồng bộ hóa mật khẩu trên tất cả mọi thiết bị của bạn. Các thương hiệu hàng đầu như 1Password cung cấp cho người dùng tùy chọn lưu trữ mật khẩu cục bộ hoặc trên các máy chủ của họ.
Trái lại, các trình quản lý mật khẩu dựa trên đám mây chẳng hạn như Dashlane sử dụng các máy chủ rất bảo mật để lưu trữ dữ liệu người dùng được mã hóa (dữ liệu được mã hóa bằng mã hóa cấp quân sự, chưa từng bị xâm phạm). Và bởi vì dữ liệu người dùng là trực tuyến, trên đám mây, các trình quản lý mật khẩu này tự động đồng bộ hóa tất cả mật khẩu của bạn, nhờ vậy bạn có thể dễ dàng và thuận tiện truy cập hầm mật khẩu của mình trên mọi thiết bị di động và máy tính bàn.