Đa số máy phát điện tại Cần Thơ được trang bị hệ thống bảo vệ an toàn như cảnh báo quá tải, quá nhiệt, quá áp và quá dòng. Ngoài ra, nhiều máy phát điện còn có chức năng tự động tắt máy khi phát hiện các vấn đề an toàn như quá tải lâu dài hoặc mức dầu giảm xuống đáy.