Tháng Bảy và Tháng Tám là những tháng ấm áp nhất tại Sankt Johann im Pongau với nhiệt độ trung bình vào khoảng 17°C. Tháng Một và Tháng Mười Hai là 2 tháng lạnh nhất trong năm với nhiệt độ trung bình khoảng 2°C. Tháng Sáu và Tháng Bảy là những tháng mưa nhiều nhất.