Thông thường, khi môi trường bị ô nhiễm, cá nuôi sẽ chậm lớn, kém ăn, kém hoạt động, nổi váng trên mặt nước, chậm lớn, hao hụt nhiều. Khi môi trường thay đổi, các thông số môi trường biến động lớn trong ngày, các thông số môi trường biến động đột ngột, bất ngờ, quá cao hoặc quá thấp, vượt ngưỡng chịu đựng của cá nuôi. Cá nuôi không kịp điều chỉnh, thích nghi nên hao hụt rất lớn, còi cọc, chậm lớn. Khi môi trường bị ô nhiễm, nước thường có màu đen, nâu hoặc trắng bạc. Nước có mùi tanh nồng, tanh, keo dính, nổi nhiều bọt trên mặt nước, chất nhờn rong, rêu. Bèo tây, bèo tây và các loại cây thủy sinh… héo dần, thối rữa.