Hệ thống Nam Việt IT được bảo mật hoàn toàn thông qua phương thức SSL AES 256 Bit, toàn bộ thông tin được bảo mật. Các thông tin thanh toán không được lưu trên hệ thống website hay bất ký hệ thống nào của Nam Việt khi khách hàng tiến hành thanh toán, tất cả thông tin sẽ được chuyển tiếp tới hệ thống thanh toán của ngân hàng, hoặc hệ thống bên thứ 3 một cách bảo mật.