Hệ thống lọc nước phân loại dựa trên nguồn nước đầu vào như hệ thống lọc nước máy, hệ thống lọc nước giếng khoan. Hoặc cũng có thể phân loại theo công nghệ lọc: hệ thống lọc nước RO, hệ thống lọc nước công nghiệp...