Đệm bông ép dễ bị xẹp khi vệ sinh và ngâm nước. Do được làm từ gòn nhân tạo nên nó rất kị nước, đặc biệt là nước tiểu và bia, các loại nước có mùi khi dính lên nệm bông ép thì có thể ám mùi, do đó cần sử dụng thêm các tấm bảo vệ nệm hoặc ga chống thấm. Ngoài ra, nệm bông ép có độ bền kém hơn nhiều loại khác, chỉ từ 4-5 năm.