Thời điểm đẹp nhất để đi Lý Sơn chính là từ tháng 3 đến tháng 8 hàng năm và cũng là mùa du lịch cao điểm. Trong khoảng thời gian này, thời tiết đẹp. Trời có nắng và gió nhẹ, mưa ít (thậm chí không có mưa), biển lặng. Các tháng còn lại của năm giá cả các dịch vụ thấp hơn nhưng nếu không may mắn, bạn rất dễ mắc kẹt trên đảo cho đến khi hết bão mới được về lại đất liền. Ngoài ra biển động mạnh sẽ không thích hợp để tắm biển.