Lương làm thêm là thu nhập khi người lao động làm việc ngoài giờ hoặc vượt quá thời gian quy định theo luật. Cách tính lương tại Nhật đặc biệt là lương làm thêm được chính phủ Nhật quy định rất rõ vì đất nước này có rất nhiều lao động nước ngoài và để tạo ra sự công bằng trong việc trả lương.
Cách tính lương làm thêm:
Tiền lương tăng ca ngày = 125% lương cơ bản.
Tiền lương làm thêm vào ngày lễ, tết = 200% lương cơ bản.
Tiền lương làm thêm vào những ngày nghỉ (như thứ 7, chủ nhật) = +35% lương cao bản hoặc nhân với hệ số từ 1,35 trở lên.
Tiền lương làm đêm 22h - 6h = + 50% lương cơ bản + phụ cấp ăn đêm hoặc = tiền  lương cơ bản nhân với hệ số 1.25 trở lên.
Tiền lương làm ngoài giờ vào buổi đêm = tiền lương nhân với hệ số 1.5 trở lên.
Làm thêm vào buổi đêm của ngày nghỉ, tiền làm thêm giờ được nhân với hệ số 1.6 trở lên.