Користь препарату сумнівів не викликає, проте у разі недотримання інструкції він здатний завдати шкоди. Так, не рекомендується приймати Фітолакс у періоди вагітності та грудного вигодовування.
Крім того, засіб може мати деякі побічні ефекти. Під час прийому Фітолаксу іноді можуть розвиватися алергічні реакції, діарея, здуття живота.