Гастроентерологи використовують Улсепан при гастриті з надмірним виробленням соляної кислоти (підвищеною кислотністю), а також супутнім рефлюкс-езофагітом. При панкреатиті пантопразол може бути призначений у складі комплексної терапії (наприклад, при супутній виразковій хворобі або гіперсекреторному стані).