Отримавши акт податкової перевірки з описом нібито допущених порушень, деякі підприємства намагаються звернутися до суду з податкової для його оскарження.
Однак, розглядаючи податкові спори, суди давно сформували правову позицію, згідно з якою не можна оскаржити акт перевірки. Суди виходять з того, що акт податкової перевірки є лише документом-носієм доказової інформації про виявлені порушення. Але висновки, які в ньому вказуються, самі по собі не породжують для платника податків негативних наслідків.  Тому, якщо подати позов до податкової про визнання неправомірним акту податкової перевірки, в такому позові буде відмовлено.
У той же час, можна ініціювати податкові спори про визнання неправомірними податкових повідомлень-рішень, винесених на підставі акту податкової перевірки.