Безпосередня наявність кіст бартолінової залози не є небезпечною ні для матері, ні для плода. Але у разі ускладнень, коли утворення збільшується та викликають болі, застосовуються засоби місцевого впливу чи вміст кісти виводиться через прокол. А хірургічне видалення кісти можна проводити тільки після пологів. Враховуючи можливі ускладнення, гінекологи рекомендують попередньо обстежитися на наявність інфекцій і пройти лікування виявлених захворювань на етапі планування вагітності.