В досудовому порядку рішення та дії чи бездіяльність митниці можуть бути оскаржені до центрального органу виконавчої влади, що реалізує державну митну політику. Таким органом є заново створена у 2019 році Державна митна служба України, шляхом реорганізації Державної фіскальної служби України на Державну податкову (ДПС) та Державну митну (ДМС) служби.