Біль у щелепному суглобі найчастіше є наслідком захворювання – дисфункції СНЩС. При дисфункції боліти можуть м'язи (через перенапруження) або зв'язки (через перерозтягнення та запалення місць кріплення). Також біль може бути пов'язаний з артрозом суглоба або з утиском нервових закінчень.