Час дезінфекції інструментів залежить від типу стерилізатора, програми дезінфекції та налаштування параметрів. Загалом процес може зайняти від 15-60 хвилин, залежно від вищенаведених факторів. Точний час повинен бути вказаний в інструкції до приладу.