Так, є обмеження щодо використання електронної черги в МРЕО. Зокрема, електронна черга може не бути доступна для певних категорій громадян, наприклад, для іноземців, які потребують візи для в'їзду в Україну. Також, для деяких послуг можуть бути встановлені обмеження щодо кількості заявок, що можуть бути зареєстровані через електронну чергу протягом дня.