Kraken дотримується строгих заходів безпеки, включаючи зберігання більшості коштів у холодних гаманцях, двофакторну аутентифікацію для користувачів та шифрування даних. Біржа також регулярно проходить аудити для підтвердження відповідності стандартам безпеки.