Стоматит не є протипоказом для очищення зубів, але сама процедура може спричинити дискомфорт через біль. Під час захворювання рекомендується приділяти більше уваги полосканням, а також змінити зубну щітку та обробляти її, щоб запобігти розповсюдженню інфекції.