Тривалість лікувального курсу становить від кількох днів до кількох місяців і залежить від форми захворювання та від ступеню тяжкості симптомів. При загостреннях генітального герпесу у чоловіків і жінок необхідно розпочати лікування впродовж доби після появи перших ознак хвороби. Часті спалахи герпесу можуть вимагати щоденного використання противірусних препаратів протягом 6-12 місяців. Дозування та частота прийому медикаментів підбираються під час консультації уролога чи гінеколога.