У лікарні діють 2 відділення: Центр трансплантології органів та біологічних тканин та Центр трансплантації кісткового мозку.
У Центрі трансплантації органів досвідчена команда хірургів проводить операції з пересадки серця, печінки, нирок, рогівки. Центр трансплантації Йєдітепе має один із найкращих показників приживання донорських органів у країні.
Центр трансплантації печінки зареєстровано у загальній Європейській базі з пересадки печінки. Успішність операцій із пересадки печінки – 80%. У Йєдітепе вперше в Туреччині провели пересадку серця, імплантацію колінної чашечки зі своїх кісткових тканин.
У Центрі трансплантації кісткового мозку проводять усі види пересадок дорослим та дітям. Процедура включає: діагностику, підбір стволових клітин, пересадку, реабілітацію.
Палати для пацієнтів після ТКМ оснащені фільтрами безпечної стерилізації повітря. Це виключає інфекційні ускладнення.
Центр забезпечений блоком інтенсивної терапії та сучасними реанімаціями на випадок відторгнення донорського кісткового мозку.