В інструкції щодо застосування крапель Протефлазід зазначено, що його можна приймати вагітним. В результаті доклінічних досліджень ембріотоксичного, тератогенного, фетотоксичного, мутагенного та канцерогенного впливу не було виявлено. Хоча спеціальні дослідження Протефлазіду і не проводилися на вагітних жінках. При клінічному застосуванні Протефлазиду у І-ІІІ триместрі вагітності негативних наслідків зафіксовано не було. Протефлазід вагітним повинен призначати лікар.