Фармакологічні препарати можуть виступати як самостійні лікарські засоби при полікістозі або якщо фолікулярні кісти, корпускулярні чи обумовлені ендометріозом. Вони сприяють нормалізації гормонального фону, пригнічують активність яєчників, зменшують біль та запалення. При ускладненнях медикаменти виступають лише як один із факторів комплексного лікування – наприклад, на додаток до хірургічної операції.