Хоча лимонний сік має численні корисні властивості для багатьох людей, але є категорії осіб, яким не рекомендується або краще уникати його вживання: люди з виразковою хворобою шлунка або дванадцятипалої кишки, люди з гастритом, люди з вираженою реакцією на кислоту, люди з алергією на цитрусові, люди з проблемами з емаллю зубів, люди які приймають певні ліки.