З внутрішніх органів при склеродермії найчастіше уражаються нирки, легені, серце. Зміни у яких призводять до зниження всіх функцій органу. Наприклад, при ураженні нирок це проявляється наростанням ниркової недостатності. В результаті розвивається загальна інтоксикація організму у поєднанні із втратою білка.