Мінімум протипоказань та мала ймовірність розвитку побічних ефектів дозволяє застосовувати оксигенотерапію дітям як у комплексі з основною терапією, так і для підвищення резервів організму у здорової дитини. При низькій сатурації (гіпоксемія) метод показаний навіть новонародженим. Після консультації дитячого невролога лікування дітей малого віку методом мікрополяризації головного мозку також призначають у поєднанні з оксигенотерапією.