Тарифи залежать від валюти, у якій здійснюється операція, та різновиду транзакції. Так, при оплаті з гаманця Payeer може зніматися комісія від 0,095% до 0,5% від суми, яка переказується. Однак, в деяких казино комісія при поповненні не знімається. Також за поповнення гаманця для подальших операцій стягується комісія до 4,99%. А за виведення грошей з Payeer на інші платіжні засоби - до 1,99%. При цьому поповнення та виведення у криптовалютах здійснюється без комісії.