Ультразвукова чистка зубів протипоказана в наступних випадках: наявність кардіостимулятора у пацієнта, бронхіальна астма. Під час вагітності не рекомендується проведення чистки ультразвуком. Допускається гігієна порожнини рота апаратом AirFlow, полірування зубів полірувальними пастами.