Основним діючим компонентом мазі є синтетичний фторований глюкокортикостероїд — флуоцинолону ацетонід. Саме дією цього компонента пояснюється ефективність медикаментозного засобу і комбінований ефект від його застосування. Усі кортикостероїдні препарати, включаючи Синафлан, є гормональними.