При діагностиці гонореї використовуються 2 основних лабораторних методи - визначення ДНК гонокока (зішкріб) і мазок на флору. Забір матеріалу для проведення аналізу проводиться в процедурному кабінеті: у представниць жіночої статі - у лікаря-гінеколога, у представників чоловічої - в уролога або венеролога. У першому випадку, пацієнтка сідає в гінекологічне крісло, лікар оглядає статеві шляхи, вводить в піхву дзеркало, прибирає слиз, зондом здійснює забір матеріалу з найбільш ураженої області. У другому, забір матеріалу здійснюється в положенні стоячи, лікар прибирає слиз і вводить в уретру одноразовий зонд на глибину близько 4 см, обережно обертає інструмент і витягує його з сечовипускального каналу.