Не зважаючи на те, що згідно положень Митного кодексу України доказами у справі про порушення митних правил можуть бути будь-які фактичні дані, на основі яких у встановлюються наявність або відсутність порушення митних правил, винність особи у його вчиненні та інші обставини, що мають значення для правильного вирішення справи, основним доказом по такій категорії справи є протокол про порушення митних правил.
Тому по даній категорії справ перш за все слід перевірити на наявність юридичних дефектів протоколу про порушення митних правил, оскільки бувають випадки, що навіть за наявності ознак порушення митних правил в діях декларанта чи іншої особи, яка переміщую товар через кордон, вдавалося в суді добитися не притягнення до відповідальності таких осіб через формальні недоліки протоколу про порушення митних правил, допущених працівниками митниці при оформленні протоколу.