До недоліків онкопластичної ламп- та квадрантектомії слід віднести:
у всіх випадках органозберігаючих операцій (традиційних та онкопластичних) при раку молочної залози необхідне проведення променевої терапії, яка може вплинути на об’єм та форму молочних залоз. В таких випадках може знадобитися пересадка власного жиру (ліпофілінг) для корекції цих дефектів;
розміри рубців після онкопластичних ламп- та квадрантектомії зазвичай більші ніж при традиційних хірургічних втручаннях, але якщо у вас немає схильності до утворення келоїдних або гіпертрофованих рубців, то з часом рубці стають малопомітними;
при онкопластичній ламп- та квадрантектомії існує менша, ніж при традиційних операціях, ймовірність недосягнення негативних за ознаками пухлинного росту країв резекції, що потребуватиме повторних резекцій або видалення всієї молочної залози (мастектомії).