Крім небезпеки переродження в злоякісну пухлину, лейкоплакія небезпечна порушенням функції сечовипускання, зменшенням функціонального об'єму сечового міхура та рефлюксом (зворотним рухом) сечі, що може спричинити пієлонефрит із можливим розвитком хронічної ниркової недостатності та навіть відмову нирок.