Тривалість МРТ залежить від того, яка частина тіла досліджується. Процедура займає, у середньому, 20-40 хвилин (для дослідження головного мозку потрібно 30-40 хвилин, одного відділу хребта - 15-20 хвилин, молочних залоз - 20-25 хвилин).