Шлях передачі стоматиту залежить від його збудника. Як правило, це контактний або повітряно-краплинний шлях передачі. Через слину та предмети побуту передається бактеріальний та кандидозний стоматит. Для герпетичного стоматиту характерний повітряно-краплинний шлях передачі. У той же час афтозний та ангулярний стоматит не передається контактним чи повітряно-краплинним шляхом.