УЗД серця новонародженим проводять трансторакальним методом. Трансторакальна ехокардіографія — це звичайне неінвазивне дослідження, при якому дитина лежить на кушетці (на спині або боці), а лікар проводить датчиком УЗ-апарату по поверхні грудної клітки в області розташування серця. Попередньо на шкіру наноситься спеціальний гель.